2GQRA

Saicar synthetase complexed with adp-mg2+
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
MQKQAELYRGKAKTVYSTENPDLLVLEFRNDTSAGDGARIEQFDRKGMVNNKFNYFIMSKLAEAGIPTQMERLLSDTECLVKKLDMVPVECVVRNRAAGSLVKRLGIEEGIELNPPLFDLFLKNDAMHDPMVNESYCETFGWVSKENLARMKELTYKANDVLKKLFDDAGLILVDFKLEFGLYKGEVVLGDEFSPDGSRLWDKETLEKMDKDRFRQSLGGLIEAYEAVARRLGVQLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Nucleotide Complexes of Escherichia coli Phosphoribosylaminoimidazole Succinocarboxamide Synthetase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase
molecule tags Ligase
source organism Escherichia coli
total genus 71
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 6.3.2.6: Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase.
pdb deposition date 2006-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01259 SAICAR_synt SAICAR synthetase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2gqrA01
3.30.470.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1 ATP-grasp fold, B domain 2gqrA02
2JITA 3OHTA 4YTFA 1A06A 3VUGA 1FOTA 1NW1A 2R3IA 4O7NA 1AGWA 4ZHQF 1IEPA 4O7LA 5H8EA 5K5XA 2CJMA 3OUKA 3BEGA 5IEYA 4PWNA 4O86A 4FNWA 3R8VA 3NCGA 5ETAA 4I21A 3VA7A 2CPKE 3R5FA 4FFNA 4FGRA 4LGHA 4F7JA 3R1YA 5EDPA 4F0GA 2WU7A 3OT3A 4X2NA 3GQIA 4X2GA 3R9DA 1CMKE 1H25A 4QMVA 4CV9A 4G6LA 2YM8A 2IVSA 4TZRA 3V5PA 5IISA 5EQPA 5IQCA 4QYFA 2Z7SA 1XH6A 4CMUA 3MJFA 3R7UA 3SDJA 4FKVA 4OBOA 1KJ8A 4MV3A 2JBOA 3EMGA 4RIWB 1BLXA 4X3JA 2XS0A 4DFUA 3FE3A 2X1NA 1KWPA 3A99A 3C4EA 5EI2A 2GS6A 5IQAA 3E88A 2P33A 3RM6A 2VTSA 4JNWA 4O0XA 2IZUA 4F9WA 3QGYA 3IDBA 2IZRA 4AWIA 2VX3A 3II5A 3VVHA 3KN5A 4B9DA 3ZUVA 2E9NA 3AQVA 1Z5MA 5HKMA 2C3IB 4RIYB 2E9VA 4XOYA 5CAQA 4FV3A 2CMWA 2CZGA 2ZDGA 3BHTA 3OW4A 3GGFA 2WQEA 4O96A 2WMQA 5JGBA 4DFBA 3KU2A 4MH7A 2W1DA 4TV8F 3Q2JA 2IVUA 3CE3A 2RG6A 3NIEA 1ND4A 2YISA 3PSDA 2B9HA 4H05A 4IVDA 3ZLXA 4AP7A 4YZBA 5CEIA 4AZTA 3FBVA 5ACBC 3T9TA 1G8AA 1UWJA 3GU4A 4PL3A 1QPJA 2DWBA 2J0JA 2OXXA 2PE0A 4M13A 4MNFA 3QLFA 4GH2A 5CT7A 3VWAA 1PF8A 4YUQA 4P5ZA 4O2BF 4I24A 3QFFA 1JLUE 2IPXA 2C0IA 4XG9A 4QMQA 2BDJA 4RX8A 4O7TA 3IKAA 3LJ1A 3FXXA 3EQPA 4P5QA 4I22A 3GB2A 1J7IA 2XZSA 1FPUA 3DOGA 4FG8A 4G5PA 1SNXA 4QPAA 3NUXA 4DGMA 1FVVA 3M42A 3MH1A 2J7TA 1OUYA 1YVJA 4I4TF 2BAJA 3ROCA 4FZAB 4AT3A 2QLQA 2C6TA 2VN9A 5EM5A 1EHIA 3BLRA 1GAGA 4JIKA 4TN6A 2QU6A 3FHRA 1BI7A 3KMUA 3PJ3A 1PMEA 4QTDA 2OW3A 4GYGA 3U9NA 4M67A 1R78A 1U5QA 4JOAA 2UZWE 3COIA 3FQHA 2JIUA 4LMUA 3MSSA 4RMZA 1A9UA 3AMAA 3KF4A 3QC4A 2YM5A 2PVKA 4HZSA 5EI6A 1RQQA 5CSHA 5L8KA 3V5WA 4FTTA 4UZHA 4DBXA 4TXCA 2R85A 4ZJVA 3EHAA 3HV4A 4JVGA 4YJPA 4EWQA 4KRDA 4W4VA 4IC8A 4KUJA 4EHEA 1H07A 4L43A 4PX6A 2ETKA 4CT1A 4DFYA 3CR0A 1PXIA 2JC6A 3ZO3A 4TKSA 3VPBA 3W55A 5M56A 1SM2A 5K4JA 5GHVA 4BCFA 3U6JA 3FI4A 3QZGA 4U79A 4I5CA 2QOQA 3V3VA 4O84A 5IA3A 2VU3A 4U40A 5HQ0A 4XP3A 2GU8A 5FUTA 2VTMA 3R8ZA 4O0RA 3H9FA 1BNCA 1TQMA 2JIIA 4GG5A 5M53A 4YAJB 4I4EA 4MD9E 4WO5A 3LAUA 5JFVA 4XZ3B 3TUDA 3ZOSA 5AA9A 3MWEA 5FG8A 4GEOA 2R9SA 4I0SA 5CAPA 3ZS5A 4MWIA 3T8OA 5CQWA 2PL0A 4YJRA 2ZB0A 4QP4A 1EZ1A 2UVYA 3MVJA 4YAKB 2QK4A 4UWCA 3KRWA 3LFBA 5CU0A 4O6LA 3BZ3A 4MBLA 1S9IA 2WHBA 3WNZA 3ENHA 5T3QA 4C4JA 3VRZA 2NU7B 2FPIB 5HG7A 3ULIA 2V22A 2JDOA 4YNOA 3R7VA 3V01A 4TYJA 1SVHA 4E1ZA 2UZLA 3VNTA 3NNUA 3BIZA 4GYIA 2ZDHA 1E1XA 4AF3A 5HEZA 4MA0A 4ENXA 3V51A 4AA5A 4E8AA 4KRCA 5H9BA 4D28A 3IW7A 3MFSA 2QOKA 3MV5A 4FV5A 1OKYA 3AMBA 2XNNA 2GQSA 3DKCA 3TV6A 4CFMA 3SA0A 5A9UA 5AX3A 1MQ4A 3I1AA 2GHLA 5IA4A 2HELA 3NZ0A 1GZOA 3JVRA 4FL3A 2VO3A 3GC8A 1C3OA 1UVRA 3WI6A 4QQ5A 3OUZA 4YC3A 5DFPA 4QP3A 4TYIA 1SNUA 3S0OA 4ANLA 2XA4A 4FSUA 5FTGA 3ZXZA 5JSMA 4JG7A 4FIFA 3DBCA 3U87A 3ZFYA 4RJ3A 2BTRA 3BV3A 1P4OA 4O82A 2GNFA 1YXUA 3V6RA 3L1SA 4I93A 1M2QA 2GQGA 2JAVA 3OBGA 1JSTA 4J98A 4X6RA 4ZQIA 4GCJA 4K8AA 3VULA 5DR6A 3OT8A 3U4WA 5FDPA 2QO9A 4IIRA 4RZVA 3SXFA 1ZRZA 3C4XA 2P0AA 4LMNA 3NNWA 1S9JA 3JY9A 3G0EA 4M7IA 3H0ZA 3PWDA 3CKWA 2YIYA 4NH1A 3ZC5A 2UW3A 3PLAE 2R82A 3NUUA 3T3VA 1NVRA 4A9UA 3UG1A 4F9AA 5F94A 3NW7A 4V0GB 5CYIA 4EOKA 1VR2A 4R3CA 2X6EA 4FSNA 4R78A 5D7VA 1KE6A 3BLQA 1R0EA 1OIRA 3S00A 2EWAA 2G2FA 2OIDA 4YB8B 5M57A 4QOXA 5M07A 4RIYA 3QTQA 1Q8WA 3RAIA 2ZJWA 5H2UA 3R9OA 5IEVA 4NZWB 4DYMA 3ZRKA 2WTCA 4CFFA 2QOIA 2P2IA 4AU8A 4BTKA 1Q61A 2YIWA 4E73A 5JVDF 3PRFA 5HU3A 2F7ZE 2YDIA 4FKLA 4FV0A 5LVOA 1DV1A 1GOLA 1P5EA 2VTAA 3GOPA 3QQJA 5EW3A 3R9RA 4G3GA 4JR7A 4GT4A 4TNBA 4AQCA 3BWJA 4LUEA 5H80A 3AD4A 4Y8DA 4FUXA 3HMPA 3VW6A 5C8NA 3G2FA 5AUYA 4AN9A 4FZ6A 3FMHA 3ZHPC 4BGGA 2UW4A 3G33A 3QQHA 4MCVA 1W83A 4GMYA 4RLLA 2ETRA 5E8XA 5M4UA 5A54A 3AC2A 3C50A 2EB2A 2QONA 3TTJA 3V04A 4GU6A 3V5LA 3KXXA 3ZC6A 5J1WA 2NU6B 4RT7A 4APCA 3CQWA 4GT3A 3H10A 4DBNA 3AGMA 5L8JA 4ZTNA 4J8NA 1LR4A 2IO6A 4XV1A 1WMKA 4YJSA 2YDKA 2W4OA 4PDPA 3SOCA 1UKHA 2XNOA 1PXLA 3SV0A 3BELA 4ANMA 4D4VA 3OXIA 4YTCA 3NS9A 2VO0A 3F7ZA 5HG5A 4M9UA 2WU6A 4FOBA 4F9YA 4HVHA 3GC7A 5HO7A 2YITA 4CZUA 5AFVA 4KSPA 2WQOA 3LVPA 4EG0A 3COKA 3C7QA 3LXNA 5EG3A 3O17A 3MB6A 3K5IA 4DGLC 3WO1A 5KMJA 2XP2A 3I4BA 5AV1A 4ASZA 1GSOA 2VTQA 3R7OA 1W96A 4BGHA 4IHPA 3FYKX 3FY2A 4HCVA 3IW8A 3QFVA 2UW5A 2C0OA 3HECA 4BCMA 2C5OA 4JQ8A 4RX7A 5E8ZA 2Z02A 5AUXA 3TIGA 2QODA 3DKGA 3H9RA 4FV4A 3AXWA 2R64A 3FLZA 1J1BA 4DEEA 3N4UA 5BQ0A 2I40A 4CCUA 1M52A 4EH4A 4WUAA 2QOCA 1OECA 1KJIA 2JFMA 2OJIA 4A9RA 3HZTA 4YJNA 4OTFA 2R0UA 5AWMA 4I5PA 1K2PA 3E62A 3SG8A 3OCSA 3F6XA 2VAGA 1H1RA 4R7HA 4RJ5A 5LMAA 2A4LA 2PVHA 4CKRA 3TINA 4RA5A 5CA1F 2C6OA 3BHYA 3QQLA 3NDMA 3MFTA 3C9WA 4YP8A 4AE6A 4C62A 3U9SA 2CLXA 4GK4A 3GOKA 1AD5A 4QMMA 4FSMA 4HNFA 3DF7A 4MQ2A 4IB1A 2C6EA 3A7IA 2NRYA 3CJFA 3EKNA 3LE6A 4DEGA 4EH2A 2I87A 1OIUA 2JDTA 2OJJA 4XV9A 2J5FA 4YBKA 5CNOA 1YOJA 4U9AA 3BWFA 4GFGA 3LQ5A 4AZSA 2ZMCA 3FXWA 4G9RA 1E4EB 1U46A 2JDSA 3G90X 1JAMA 4GSBA 2ZDUA 3EN5A 2WMSA 4ZMFA 1H1WA 2O5KA 4AZWA 4BCJA 4E26A 4XRLA 2WTWA 3RCJA 4ANBA 2BHHA 4HYSA 2UVXA 4M0YA 2C6KA 4QMSA 4TY1A 4JLCA 4JG6A 4NFNA 3OWJA 3SRVA 4GUEA 3R8LA 5JFXA 1Q3WA 2XK7A 4CQEA 2UW8A 5FXQA 2ZDTA 2WTVA 1WR2A 2CGXA 4FIJA 2PK9A 3ALOA 3CCNA 1KE9A 2FA2A 3QHWA 4IANA 2VTPA 4W4WA 5CTPA 4YHFA 5FM3A 2G9XA 2OG8A 3EQFA 4U5JA 4A9YA 1JNKA 1PX2A 1CDKA 2PZRA 4A7CA 5CVGA 5BYYA 4CLJA 2XYNA 3OP5A 4ZLOA 1ZAOA 4IZAA 3L8VA 1KEEA 2VGPA 3KULA 5LWMA 1L3RE 3O0GA 4IAZA 1ZMWA 3DKOA 4ASDA 4DFNA 2WTKC 3GENA 4FKRA 4I0TA 3DGKA 4MF1A 1W84A 1H00A 2YCQA 3KXZA 4X6QC 3T3UA 3T9IA 1JKJB 3FV8A 4HJOA 3C4CA 4QNYA 5CI6A 5IZFA 2XK9A 4A4XA 3Q6WA 4F70A 2JBPA 4AW1A 2W1EA 3WZUA 1H1SA 5DN3A 2WQBA 4YU2A 2YACA 4PMTA 1M14A 2BIYA 1FINA 3P23A 5L6OA 3QTWA 4FKIA 3LXKA 4DLIA 2Z60A 5CEOA 4AOJA 3OOGA 4GL9A 4YBJA 4FMQA 4B0GA 2XM9A 2IW8A 2YEXA 5DR9A 3NUYA 3KMMA 5DIAA 4NSTA 3WF9A 2XIKA 2QC6A 4ALVA 4XMOA 1XH8A 1CKPA 3UIMA 1OPLA 1OIQA 2Y4IC 1UA2A 4S33A 1WBVA 4XX0B 2XMYA 5KHWA 2B7AA 4FNXA 5D9HA 4V0GA 4GVAA 2W70A 3OCGA 5LARA 3UYTA 4DGNA 3WZKA 4ALUA 5FM2A 1P14A 4BDIA 2Y4PA 4QP8A 5AAEA 4M97A 3F7WA 4WD5A 2R3OA 4CMTA 4D0XA 2DIKA 3GBZA 4YZCA 4DGOA 1L8TA 5C8KA 3ROYA 4R7IA 5T68A 4BDFA 5HVYA 1Q3DA 3K3JA 5KBRA 2ERZE 3IDCA 3LOKA 4HYHA 3AC1A 3FUPA 4C58A 4EL9A 2ZV8A 1VBHA 4EWHA 3N4TA 3TNWA 4JIAA 3ZLYA 4D4RA 2XBJA 4DH1A 3HVCA 4BCIA 4J8MA 1OZ1A 2GDOA 3F3VA 3KB7A 4LV5A 4QP9A 4Z16A 4NWMA 3AGLA 1OPJA 3ORRA 3UIXA 5I9YA 2HOGA 2ITOA 2OJGA 4F0IA 2C1BA 3RJCA 4LFIA 3FMDA 4KWPA 5CENA 3A2CA 4PP9A 4BHZA 2I80A 1Q41A 3PDTA 3LIJA 4AW0A 4HVIA 5AUTA 1M2PA 3HGKA 4RJ6A 2IVVA 3D94A 1KJJA 3BGPA 1R39A 4YLJA 2FO0A 2HY81 5FDXA 2FP4B 3E5AA 3WBLA 1CQJB 4EBVA 2HWOA 4FG7A 4I4FA 3MY5A 4BCGA 3Q3BA 4AGCA 4RA4A 3P1AA 2X9FA 3GU7A 4UXLA 5LOHA 3KCFA 1YI3A 4GW8A 3F3TA 3DCVA 3KY2A 4C38A 4YR8A 1PXOA 4LG4A 1CE8A 3G8DA 5CXHA 3I81A 3ITZA 5CB4F 2JKMA 3QCYA 2WKMA 3D14A 3V5QA 1T46A 1QPCA 4RIXA 4WSYA 3VW8A 3FYJX 2YZNA 1GY3A 5HBRB 5JT2A 5HNBA 2W1ZA 3TWJA 2BRNA 4C61A 1DAWA 2RGPA 4XV3A 5EDQA 3R83A 5L8LA 3VS2A 3QXPA 4FTUA 2XYUA 4K77A 5HO8A 3OXTA 3KXMA 1J7LA 4MNEB 2SRCA 3BLHA 3R7IA 4WIHA 4EZ7A 2QG5A 4JDHA 5AMNA 1MP8A 2IZSA 2BRBA 1UU8A 3PJ2A 4EOJA 2PBZA 2YM4A 4CMOA 2B53A 2PMOX 4ENYA 1Q24A 2X8IA 2XJ0A 4IFCA 3D0EA 4NM7A 4MA5A 2R3JA 4HYUA 2V0DA 4X2JA 2PMLX 4DEBA 4ZJIA 4K33A 4J95A 3PJ8A 3UC3A 1TVOA 1UU3A 4HCUA 3DBDA 4XRJA 2V5AA 1RDQE 3OCBA 5I9WA 2PWLA 1EUDB 2O63A 1NVQA 4EH5A 5LP6F 3QYZA 3K5UA 3ORKA 4HPUE 3ZDIA 1M0WA 4MV8A 4F6SA 3WILA 1F3MC 4PL4A 4BIEA 3EOCA 3LFCA 5CF4A 2BZHB 4IACA 3D2IA 5CX9A 3FI8A 4FV9A 3CGOA 1MUOA 4HZRA 2OXYA 3ZBFA 1OITA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2JIT A;  3OHT A;  4YTF A;  1A06 A;  3VUG A;  1FOT A;  1NW1 A;  2R3I A;  4O7N A;  1AGW A;  4ZHQ F;  1IEP A;  4O7L A;  5H8E A;  5K5X A;  2CJM A;  3OUK A;  3BEG A;  5IEY A;  4PWN A;  4O86 A;  4FNW A;  3R8V A;  3NCG A;  5ETA A;  4I21 A;  3VA7 A;  2CPK E;  3R5F A;  4FFN A;  4FGR A;  4LGH A;  4F7J A;  3R1Y A;  5EDP A;  4F0G A;  2WU7 A;  3OT3 A;  4X2N A;  3GQI A;  4X2G A;  3R9D A;  1CMK E;  1H25 A;  4QMV A;  4CV9 A;  4G6L A;  2YM8 A;  2IVS A;  4TZR A;  3V5P A;  5IIS A;  5EQP A;  5IQC A;  4QYF A;  2Z7S A;  1XH6 A;  4CMU A;  3MJF A;  3R7U A;  3SDJ A;  4FKV A;  4OBO A;  1KJ8 A;  4MV3 A;  2JBO A;  3EMG A;  4RIW B;  1BLX A;  4X3J A;  2XS0 A;  4DFU A;  3FE3 A;  2X1N A;  1KWP A;  3A99 A;  3C4E A;  5EI2 A;  2GS6 A;  5IQA A;  3E88 A;  2P33 A;  3RM6 A;  2VTS A;  4JNW A;  4O0X A;  2IZU A;  4F9W A;  3QGY A;  3IDB A;  2IZR A;  4AWI A;  2VX3 A;  3II5 A;  3VVH A;  3KN5 A;  4B9D A;  3ZUV A;  2E9N A;  3AQV A;  1Z5M A;  5HKM A;  2C3I B;  4RIY B;  2E9V A;  4XOY A;  5CAQ A;  4FV3 A;  2CMW A;  2CZG A;  2ZDG A;  3BHT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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