1G83A

Crystal structure of fyn sh3-sh2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSERAAGLSSRLVVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of the Src homology 3-Src homology 2 interface in the regulation of Src kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE FYN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2000-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1g83A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1g83A02
1O4KA 2JS0A 2RQTA 2KK6A 3LH5A 4QT7A 1T3SA 3VRPA 4OMMA 2JXBA 2CI9A 2EYWA 2O88A 2DVJA 3CBLA 1O41A 4JJCA 5IXFA 1VYUA 2EVRA 4GPLB 2EQIA 2A37A 3VRYA 3FJ5A 2RQRA 1O4IA 3MAZA 2J6FA 3VS6A 4AFSC 4HXJA 3M0TA 3EG3A 3QWYA 1A1BA 1SKJA 2DM0A 2DL4A 5EHRA 1IJRA 1O45A 2FCIA 2PNBA 3N7YA 1HJDA 2GTOA 3PJPA 3H0IA 1CKAA 2K79B 1JEGA 2Y1MA 1YCSB 1UHFA 4ZNXA 5GJWB 1E7OA 1SRMA 2KROA 1OV3A 3EAZA 5HKWA 3U23A 1LCKA 2EYZA 1JWOA 2A08A 2EL8A 2ESWA 1F2FA 2RMOA 2LZ6B 1AD5A 4OMQA 1UTIA 1RLPC 1SPKA 2DL8A 3TKZA 3CD3A 2DLPA 1NLOC 1QCFA 2MIOA 2CR4A 4XZ1A 2EGEA 2EBPA 1HSQA 2DMOA 1X6CA 5KAZA 2HSPA 2JW4A 2FPDA 1G83A 1SHAA 3RBBB 4OHEA 5IXBA 1D4TA 1A08A 1I07A 2W0ZA 1I3ZA 2RQVA 4EY0A 3PVLA 2KYBA 2XP1A 2AUGA 2ED0A 1QKXA 2YUQA 1O43A 2CT3A 1CSKA 3TL0A 5I11A 2W10A 1AOJA 1YP5A 3GXWA 1U06A 3GQIB 4AG1C 2AOAA 2YSQA 3UA6A 5IHNA 4JEGA 4ORZA 3BUOB 1TCEA 2BTTA 2HDVA 2LMJA 2C0IA 2L3QA 5FW9A 2HMHA 2L3PA 3S8OA 1JYRA 3EACA 2CBLA 2FRYA 5IHKA 1GCQA 1YVLA 3A98A 3VS4A 1K4US 4F14A 3EHRA 1K1ZA 2VVKA 1AYCA 2YT6A 2YU7A 1I0CA 2KGTA 2BZYA 4K11A 1UGVA 1WIEA 2PZ1A 1ZX6A 1UDLA 2JYQA 1A0NB 4CC3A 1MW4A 4J9EA 4FBNA 1Y0MA 2C0TA 1BKLA 3I5SA 1BM2A 1A1CA 1O4QA 2PNAA 1X27A 4HVUA 3N84A 2KNBB 1ABOA 2J05A 3REAB 1YWPA 1K9AA 1PRMC 3PVQA 4NWFA 1RUWA 2QDLA 2GSBA 2EO3A 1M27C 1S1NA 2EYXA 2RQUA 1H9OA 1IO6A 4NWGA 1UJ0A 2LNHB 3VS0A 2DCRA 2MRKA 1NEBA 3KFVA 3THKA 1U5SA 2CIAA 1BF5A 4OMNA 2YUOA 3VS3A 1FYRA 1MV0B 1XOVA 2VWFA 5EELA 4GBQA 4J9HA 4LUEA 1X6BA 1V1CA 2D0NA 2FPFA 4J9IA 5BO4A 3OVEA 3IQLA 2LNWA 1RJAA 1VA7A 3VROA 2YDLA 3OV1A 4FL2A 2EU0A 2EYYA 4F16A 4J9DA 4U17A 4A4CA 1R1QA 3NGPA 1AB2A 4RTYA 3I9QA 4RTTA 1U3OA 1JQQA 4Z89A 2H46E 2IIMA 2CREA 2L2PA 1O4JA 4RTXA 1GCQC 2LCSA 1W70A 3KFJA 1D4WA 2J7IA 1AVZC 2KRMA 1B3QA 2IUGA 3MXCA 5DC4A 2LCTA 1FU5A 1G2BA 4RTZA 1I1JA 1QG1E 4AG2C 3H41A 2PLEA 3EG2A 1PNJA 1UG1A 2RMXA 2EYVA 1Y1UA 1NEGA 1W6XA 2G6FX 2Y3AB 4FL3A 2KXDA 1O44A 1BBZA 1RQQC 4E93A 1BG1A 2C0OA 5HKZA 3EHQA 1BB9A 4IIMA 1WA7A 4DGXA 1O4DA 1O4NA 3BKBA 1UUSA 2O9VA 1ZUYA 3IN7A 2PTKA 4A63B 2ETZA 3ZL7C 2LJ0A 3BUNB 5D0JA 1M3BA 2PLDA 4TZIA 2J6KA 2DM1A 3HCKA 1AEYA 4RTWA 2O9SA 4D8KA 2H8HA 2L4KA 1KSWA 1OEBA 4DEXA 1NYGA 1SHFA 4WWQA 1M30A 2AZSA 3UATA 1UECA 3PSKA 1E6HA 2L3SA 2ECDA 2IZVA 1UE9A 3M0RA 1KFZA 4LE9A 3VRZA 5GJVB 5L23A 1B47A 2HDXA 1PHTA 4A4BA 1O48A 1ZBJA 1NYFA 4OHLA 1LUKA 3US4A 4GWFA 2DLZA 1QLYA 2D1XA 4J9FA 2ROLA 5HCKA 1O4AA 2AOBA 4L1BB 5EHPA 2J6OA 4D8DA 2DJQA 1AYAA 5J3XA 2DILA 2HBWA 2K7AA 3OB2B 2ENMA 2KE9A 2DBMA 2NWMA 1AYBA 3C0CA 2JM9A 3SHWA 4U1PA 1BKMA 1WXTA 3CWGA 1LKKA 2F2VA 1O4RA 2KNOA 1X69A 1WLPB 4ROJA 3OP0A 2C9WA 4OMLA 4JPBW 3TSWA 1O4CA 2LQNA 1CWEA 1AOUF 1YVHA 4X1VA 2F2XA 2M51A 1ARKA 4GLMA 3HHMB 3VRQA 1LUMA 4RUGA 1AWWA 2KRSA 1CSYA 1GBRA 1RI9A 1A09A 1R1SA 2O31A 2KRNA 3IMJA 4ESRA 2RN8A 1FHSA 1SRLA 1X2KA 4HVWA 3OB1B 3VGOA 1GCPA 5I6VA 1Z9QA 2JMCA 2BZXA 1WXUA 2HCKA 3VS5A 1OO3A 3IN8A 1BFIA 3H0HA 2VKNA 5EG3B 1X0NA 1PKSA 4JJDA 1SHDA 1KA7A 2SEMA 2CUBA 4P9VA 3S8LA 4F59A 3R6NA 4EIHA 3HIZB 4IIOA 2RQWA 2MK2A 3M0SA 3EG1A 1SHGA 1WYXA 3SEMA 1K0SA 4Z8AA 5HKYA 4CC7A 4P9ZA 2QMSA 1JO8A 2DE0X 5EEQA 2CH4A 2YUNA 1PICA 1SEMA 2RVFA 2OAWA 2NUZA 1AOTF 1JYQA 1GL5A 5EC7A 2F2WA 3REBB 1OPKA 1BU1A 1MILA 4DGPA 1CKBA 2B3OA 4F5AA 1LUNA 2FEIA 3WA4A 4QSYA 2GGRA 3QWXX 3PS5A 4E68A 3I5RA 1O49A 3EGUA 2CDTA 2EO6A 2MRJA 1O4MA 1GBQA 5CDWA 1A81A 1YNZA 1ZUUA 1AZEA 1BHHA 2CSIA 3ULRB 3K2MA 1RLQC 2KBTA 1EFNA 3MXYA 1CWDL 2J06A 1TZEE 1SSHA 1X2QA 2A28A 1QWFA 3GXXA 1MUZA 1T0HA 1O4HA 1P13A 1A1EA 3PQZA 1X6GA 1B07A 1GFDA 1KJWA 3IMDA 2DX1A 2DBKA 4HVVA 4R0KA 1NLPC 2DLYA 1ZSGA 1HCTB 3VS2A 1M3CA 2ED1A 3T04A 1TUCA 1F1WA 3BUMB 2ECZA 2MQIA 1QADA 5ECAA 5DC0B 2LQWA 1YN8A 2CSQA 4FSSA 1XA6A 2D8HA 1NZLA 1VYVA 3VS7A 1UUEA 3H0FA 3CXLA 4JZ3A 2GNCA 1UJYA 1Z3KA 2A36A 4JGHA 2MOXA 2LNXA 5AXIA 1UURA 1BLJA 1TUDA 1FYNA 2EPDA 4K2RA 4WCIA 2YSXA 2CT4A 1D1ZA 1E6GA 3PSJA 1KC2A 2X3WD 3BUWB 2KYMA 1NZVA 2JT4A 1FBZA 1O46A 1WQUA 1AWXA 1JXMA 2JS2A 3VS1A 1WXBA 1BMBA 3UYOA 1ZUKA 4OHHA 4CC2A 1KA6A 4DEYA 2IUHA 1KIKA 5GJIA 4OHDA 4J9CA 1OO4A 2K79A 5IBSA 2H5KA 4JE4A 2KEAA 2K2MA 2B86A 1O4EA 1WDXA 1R1PA 1K0XA 2KXCA 1H8KA 1UHCA 1IS0A 1O47A 1BLKA 4E6RA 2DYBA 1SHBA 5GJHA 4F17A 2I0NA 3PE0A 2FRWA 3VRRA 5IH2A 2DL7A 2DL5A 1HCSB 4J9BA 1O42A 1H3HA 1A1AA 2K7AB 4GL9E 1ABQA 3GBQA 2MCNA 3I35A 3S8NA 1N5ZA 1YWOA 2RNAA 1JU5A 4X6SA 1MV3A 1M27A 3PLFB 1GHUA 1VYTA 2KT1A 2V1RA 4K45A 2PNIA 1O4GA 1PKTA 2FG0A 2X3XD 2LP5A 1AZGB 4JZ4A 3UA7A 4AFUC 1NG2A 1H92A 1NM7A 2HEQA 1QKWA 5AULA 1PRLC 1AWOA 2EW3A 2KR3A 3UF4A 2LJ1A 1A07A 2SRCA 2CI8A 4LNPA 2CRHA 2FPEA 3TVTA 2GBQA 1O4LA 2LX7A 4AFZC 4H1OA 3CQTA 4HCKA 1HD3A 4RTVA 3TSZA 1AYDA 2O2OA 1PWTA 2DRKA 2RSYA 1W1FA 5I22A 1SPSA 1GRIA 4JJBA 1X43A 2MC1A 1M61A 2ABLA 2D8JA 3JV3A 4F5BA 2OI3A 1Z9ZA 1LKLA 2OQ1A 1OOTA 5FWCA 2VIFA 1WI7A 2EGCA 2E5KA 2K6DA 2DX0A 1ZFPE 2K3BA 2CUDA 3NPFA 1O4OA 1M8MA 3VRNA 4OHIA 2AKLA 1O4PA 2OZOA 2AZVA 5IHIA 4AFQC 3S9KA 2JMAA 2BZ8A 1WFWA 4OMPA 1FU6A 3C7IA 1NRVA 2BBUA 1M3AA 4Z88A 2DL3A 1LCJA 1GFCA 2YUPA 1SPRA 3BUXB 4H34A 1BFJA 2HUWA 2KT8A 2GE9A 4CC4B 4EIKA 1WX6A 5IBMA 1AWJA 1RPYA 2JTEA 4M4ZA 5FWBA 4K44A 2EKHA 1JU5C 1QWEA 1JYUA 5DF6A 4LN2A 2EOBA 2P4RA 1UFFA 2DRMA 1T3LA 3NHNA 1ZLMA 2RORA 4OMOA 2SHPA 2L0AA 2RF0A 2AK5A 2RPNA 2HDAA 2AKKA 2LJ3A 1J3TA 3M0PA 2DNUA 1CSZA 2IUIA 2EGAA 1O4FA 1JXOA 3M7FA 3PFVA 5DC9A 3M0UA 4XZ0A 2L3TA 2Y1NA 3ZNIA 2FO0A 1BHHB 1BK2A 2CH4W 2DF6A 2JM8A 1T0JA 1OPLA 2V1QA 1Y57A 3M0QA 4KRTA 1CJ1A 4LUDA 3NMZC 2DA9A 1K76A 1TG0A 2XMFA 2M0YA 1BHFA 1FBVA 2GTJA 2K9GA 1O4BA 2ROTA 3O5ZA 4RTUA 1LUIA 2EKXA 2OJ2A 4J9GA 3EG0A 2CS0A 2L6KA 3N8MA 3RNJA 4Y92A 1FMKA 2GQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KK6A 3LH5A 1T3SA 2QEXT 3NFCA 2CI9A 2MK5A 2RB6A 1Y96A 2DVJA 1XJWB 3PNWC 3CBLA 4DBHA 4JJCA 1OI1A 1OX8A 3ER0A 3UWNA 2EQIA 2LVMA 2X4WA 3MAZA 3HP9A 3CCET 1QVFP 1N8RC 2PNBA 1NBEB 1YHQT 1CKAA 2K79B 4BI4A 1YCSB 4ZNXA 3CC7A 2R5AA 1BYMA 2LZ6B 1UTIA 5LJ3d 4F7UE 3JCMf 3NTKA 3CD3A 1XNIA 3V7RA 4M7DD 2X4JA 2EGEA 1HSQA 5KAZA 4ME7A 2HSPA 4M78B 3M57A 1SHAA 1D4TA 2W0ZA 1YJWA 2RQVA 2KYBA 3AHUA 2XP1A 2JNGA 2HKNA 1V29B 1YP5A 5GANf 2MI6A 4OB3B 3GQIB 3EGXA 3D7SB 2YSQA 1VQPA 2CP6A 2BTTA 3R6OA 5GANj 4R55A 2L3QA 1SSFA 5FW9A 2HMHA 1UGQB 3EACA 5KYWA 2CBLA 1Y71A 1D09B 4J6XA 3CC2T 1K4US 5KYWB 3EHRA 2YT6A 4M7AG 2YU7A 2KGTA 3CMAQ 5AT1B 3SB2A 4CC3A 2EFIA 1MW4A 4J9EA 5GMKi 1A1CA 6AT1B 1X27A 4B6MA 2Y4YA 2J05A 1OU8A 1K73C 5FU7C 4RCBA 2DIGA 1W2BA 4NWFA 1RUWA 3WVEB 1S1NA 2RQUA 1Q86U 1IO6A 4GLKA 2Y90A 2VYTA 3V8JA 4A4KA 3WXMB 1NEBA 3CCRQ 3M4YA 3EAEA 1OULA 3BDUA 3EG9A 2YUOA 2L3RA 4OMNA 1MV0B 3VS3A 1XOVA 2VWFA 3OVEA 1VA7A 3CCMT 2EU0A 4OB2B 2EYYA 3OYJA 4J9DA 3OS2A 1JJ2S 2O4XA 3C94A 2XI9A 3NGPA 3AT1B 4RTTA 1U3OA 1JQQA 2LT4A 4C8QG 2CREA 3TCJA 3CBPA 3JB9H 1I4K1 1QG1E 2V8KA 4F7UB 4C92D 5I2SA 1JRIA 2EYVA 2NLUA 2CZ6B 5LJ5e 2XDPA 2COZA 1O44A 1BBZA 4E93A 1ZBXA 7AT1B 4ANJA 1BB9A 3S3NA 3QIIA 2VGMA 1XQHA 1O4NA 1I81A 1ZUYA 2F69A 5D0JA 1M3BA 2PLDA 2DYIA 4TZIA 4EMHA 2J6KA 4MMKA 5GAN8 4BB7A 1AEYA 4RTWA 3MEWA 4J6WA 4DEXA 3OYNA 3V8KA 2IZVA 1I5LA 1UE9A 1R0BG 4QVDA 2QQBA 1B47A 2HDXA 4OHLA 1NYFA 1B34B 5FU7B 1N9SA 3US4A 2RO0A 4GWFA 2DLZA 5HCKA 1G8XA 4FSXA 3OSSC 1IXDA 2DJQA 5J3XA 2KE9A 4BY6B 3C0CA 4BE1A 3QG1A 2JTMA 3VYGA 1JJ2P 3QDFA 2KNOA 4LXCA 1X69A 1BKBA 5LJ5h 1RAGB 3CCQT 3OP0A 4FU6A 1CWEA 2RD1A 3RESA 1YITA 4X1VA 2M51A 3VRQA 1PG5B 1IB8A 3OYFA 2QQSA 2JN0A 1CSYA 3OYYA 1LNXA 3JCMe 1K73R 4X9DA 4XTZA 1A09A 1R1SA 3HSBA 2KRNA 2RN8A 1QW1A 2OTLQ 4HCZA 5GAMf 3MCAB 4XK8E 3OY9A 4HT9A 3OYIA 4JRIA 1WXUA 1M5Q1 2HCKA 2XDBA 1BFIA 5EG3B 1PKSA 2X51A 4JJDA 4N0AC 5GAMj 2CUBA 1XTDA 3CCUA 1OQKA 5GANe 3M0SA 4M77G 4Z8AA 3CCSQ 1Q86C 5HKYA 4P9ZA 2V26A 1JO8A 5IN1A 2DXTA 2YUNA 3A1PA 5LJ5d 1AOTF 1GL5A 5KYYA 1OPKA 1MILA 3E19A 2B3OA 1VIEA 2Y4XA 1LUNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1ABQ A;  3GBQ A;  2MCN A;  3I35 A;  3S8N A;  1N5Z A;  1YWO A;  2RNA A;  1JU5 A;  4X6S A;  1MV3 A;  1M27 A;  3PLF B;  1GHU A;  1VYT A;  2KT1 A;  2V1R A;  4K45 A;  2PNI A;  1O4G A;  1PKT A;  2FG0 A;  2X3X D;  2LP5 A;  1AZG B;  4JZ4 A;  3UA7 A;  4AFU C;  1NG2 A;  1H92 A;  1NM7 A;  2HEQ A;  1QKW A;  5AUL A;  1PRL C;  1AWO A;  2EW3 A;  2KR3 A;  3UF4 A;  2LJ1 A;  1A07 A;  2SRC A;  2CI8 A;  4LNP A;  2CRH A;  2FPE A;  3TVT A;  2GBQ A;  1O4L A;  2LX7 A;  4AFZ C;  4H1O A;  3CQT A;  4HCK A;  1HD3 A;  4RTV A;  3TSZ A;  1AYD A;  2O2O A;  1PWT A;  2DRK A;  2RSY A;  1W1F A;  5I22 A;  1SPS A;  1GRI A;  4JJB A;  1X43 A;  2MC1 A;  1M61 A;  2ABL A;  2D8J A;  3JV3 A;  4F5B A;  2OI3 A;  1Z9Z A;  1LKL A;  2OQ1 A;  1OOT A;  5FWC A;  2VIF A;  1WI7 A;  2EGC A;  2E5K A;  2K6D A;  2DX0 A;  1ZFP E;  2K3B A;  2CUD A;  3NPF A;  1O4O A;  1M8M A;  3VRN A;  4OHI A;  2AKL A;  1O4P A;  2OZO A;  2AZV A;  5IHI A;  4AFQ C;  3S9K A;  2JMA A;  2BZ8 A;  1WFW A;  4OMP A;  1FU6 A;  3C7I A;  1NRV A;  2BBU A;  1M3A A;  4Z88 A;  2DL3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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