1G83A

Crystal structure of fyn sh3-sh2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSERAAGLSSRLVVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of the Src homology 3-Src homology 2 interface in the regulation of Src kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE FYN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2000-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1g83A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1g83A02
1UUSA 2HMHA 1B47A 1O48A 1ZFPE 1TZEE 4J9BA 1A1EA 3BUNB 1Y1UA 2GE9A 5J3XA 2K9GA 1U3OA 2LP5A 2YT6A 1RLQC 1QWEA 1QLYA 1HJDA 2ETZA 4U1PA 3PFVA 4Z89A 5ECAA 1SPSA 3EACA 4AG1C 1XOVA 4RTYA 3VRZA 2RQRA 3C7IA 1ZUUA 2O9SA 2KXCA 2O9VA 2RF0A 1KIKA 3I9QA 2MRJA 4K45A 2CT3A 2JW4A 1WA7A 1WXTA 1O4FA 1GFCA 3TSWA 1V1CA 2EQIA 5CDWA 1A09A 2EL8A 3BUMB 2A08A 2DL5A 4GL9E 2M0YA 1NZLA 1UE9A 3HHMB 4M4ZA 2HDAA 2BBUA 4H34A 1HCTB 2HEQA 2A36A 4LN2A 2CI8A 3OB1B 4OMMA 1O4BA 4FL3A 3CBLA 1X27A 1OOTA 1AYDA 4X6SA 2KYBA 1JYQA 1O4MA 2H46E 1PNJA 1M3CA 1O4GA 3CWGA 1OV3A 1O4AA 3PSKA 2YSXA 4AG2C 1KA6A 2K7AB 3IN8A 4ZNXA 1SHBA 2VIFA 3K2MA 2K2MA 2FG0A 1JXOA 3PSJA 1LUKA 1ZX6A 2PNBA 1O4OA 2J6FA 2MCNA 3BUXB 2FPEA 2EBPA 1A08A 3UYOA 2DBKA 2EKHA 2YUNA 3S8OA 1AVZC 2RQUA 1JU5A 1I1JA 2CH4W 2YU7A 4FL2A 2IZVA 3VS2A 1PRLC 2K79A 2LX7A 3ZL7C 1CKAA 1UHCA 1GBRA 1BHHA 1M27A 1BKLA 2ECDA 2L6KA 1TG0A 2DNUA 2EYYA 4OMQA 2YSQA 4AFSC 4DEYA 2JYQA 3PLFB 3VGOA 1JO8A 3QWXX 5EHPA 1BU1A 2KBTA 1CWDL 1NM7A 2VVKA 3WA4A 3M0PA 4CC3A 1JEGA 2XP1A 1RLPC 5IXFA 2DL7A 3S8NA 4LUDA 1FU6A 4AFZC 3M0SA 2D1XA 1A1AA 1O4JA 2DM1A 3FJ5A 1QADA 1OEBA 4JEGA 3JV3A 2DE0X 4OMLA 2SHPA 5DC4A 2MQIA 3M0RA 1M61A 1A0NB 5I11A 1UGVA 2QMSA 4RTWA 3RNJA 3GBQA 1CJ1A 3IN7A 2EGEA 5GJVB 3VRNA 2CDTA 1I07A 2FEIA 3THKA 3VS0A 2RSYA 1ABQA 1O4KA 2JM8A 2M51A 1AWWA 1QG1E 3PQZA 1MV3A 2EO6A 1X69A 1UHFA 3EG2A 4LUEA 1O49A 3UF4A 2ESWA 1FMKA 2D8HA 1YVHA 2MRKA 2X3XD 1YVLA 1M8MA 1FBVA 2A28A 5DC0B 2DJQA 2IUIA 4OHIA 2J6KA 1LUMA 4JJDA 3I5SA 2IIMA 4E6RA 1K0XA 1SHFA 1K0SA 2KK6A 2XMFA 4LE9A 4OHEA 2KR3A 3NGPA 1M3AA 2CT4A 2GGRA 1WX6A 2DLYA 2EYZA 4WWQA 2KYMA 3PE0A 2OJ2A 3M0QA 1TUCA 1ABOA 4WCIA 2CREA 1FU5A 4GLMA 1Z9ZA 2O31A 2ABLA 1QWFA 2AKLA 1GBQA 2AZSA 2ROLA 2J6OA 3BUOB 2LJ0A 4DGPA 1AYBA 2KEAA 4FSSA 2K7AA 3M0UA 3ZNIA 2CRHA 4K2RA 2FO0A 1X2QA 2DILA 3M7FA 1WXUA 1PRMC 1UFFA 5HCKA 1O41A 1R1QA 3EG0A 1BMBA 1WYXA 5DC9A 3T04A 2DA9A 3OB2B 4RUGA 4EIKA 1B07A 3IMJA 1GRIA 5EG3B 1VYTA 1H92A 2PLDA 1Y0MA 4Z88A 4D8DA 1PKSA 1YP5A 1AEYA 4F16A 1LCJA 1JYUA 4QSYA 1UURA 2DVJA 4HVUA 2EYVA 3M0TA 4CC4B 1F1WA 2YDLA 3TSZA 2V1QA 1CKBA 1GCQA 4IIMA 3EG1A 1SRMA 4XZ1A 1K4US 1R1SA 2LMJA 2CR4A 3EHQA 2AOBA 5AXIA 2RQVA 5DF6A 1A1BA 4HCKA 2DLZA 2ECZA 4F14A 1BFJA 1NG2A 4F5BA 1A1CA 4OHDA 2Y1MA 2LCSA 4GPLB 5EEQA 2KROA 1NZVA 2HCKA 4ROJA 2KXDA 1AYAA 2DF6A 2AKKA 2JXBA 2PZ1A 1U5SA 2SEMA 2LQWA 2EGAA 1ZSGA 1NYFA 2L3PA 3IQLA 4JZ4A 2JT4A 4J9IA 3EGUA 2EOBA 3I35A 1OPKA 4OHLA 2J7IA 3GQIB 2MIOA 3N84A 1HD3A 3OVEA 1O4RA 4H1OA 1YNZA 1CSZA 1O42A 2F2XA 1OPLA 2MC1A 1NRVA 1H9OA 1AOUF 2SRCA 4D8KA 1O44A 2DL8A 1X6GA 1T0HA 3N8MA 1E6GA 1BF5A 2BZXA 1AB2A 2DL4A 1QKWA 5AULA 1AZEA 1ZLMA 4GWFA 2I0NA 1TCEA 3OP0A 4LNPA 3CQTA 1KC2A 1KA7A 1BM2A 1X0NA 2KNOA 3N7YA 2B86A 1O4HA 3ULRB 2DX0A 4TZIA 2V1RA 4DEXA 5BO4A 2J06A 4OMOA 1I0CA 2EKXA 2AOAA 3TL0A 1X6CA 2IUGA 2W0ZA 5I6VA 1CSYA 1O45A 2RPNA 4ESRA 2L3SA 1UECA 1QKXA 2O88A 1R1PA 1BBZA 1ARKA 2RMOA 2AUGA 1UUEA 4A4BA 1BFIA 2KRSA 1Y57A 4Z8AA 1SEMA 3EHRA 1OO3A 1KSWA 1GL5A 2L3QA 2OQ1A 2RORA 1MILA 2ENMA 1WIEA 4JPBW 4AFQC 2EU0A 2JM9A 2DLPA 2RQTA 5EC7A 1PWTA 1YWOA 2GQIA 1NEBA 1O4EA 4L1BB 1MW4A 1O43A 5HKYA 2H5KA 1RUWA 5EHRA 2OI3A 2AK5A 2EPDA 4K11A 1FBZA 4XZ0A 4E93A 2PTKA 3UA7A 1GCQC 2DM0A 2OZOA 2E5KA 3UATA 2CUDA 4IIOA 3I5RA 3IMDA 4J9FA 1J3TA 3KFJA 3TVTA 5EELA 2KT8A 3H0IA 2YUPA 1LKLA 2PNAA 1RPYA 5IH2A 1T0JA 3LH5A 4RTZA 2EYWA 4FBNA 2P4RA 3EAZA 1RI9A 2KE9A 2H8HA 3TKZA 2DYBA 4A63B 1S1NA 1Z3KA 5L23A 3NHNA 4HVVA 3SEMA 3VS1A 2D8JA 1SHDA 2GNCA 2C9WA 1JXMA 2NUZA 2YUOA 1CSKA 3QWYA 2BZ8A 3US4A 5FWCA 1RQQC 3VS5A 3GXWA 2DL3A 2EYXA 1H8KA 1O4PA 4JJBA 1LUIA 4OMNA 2KNBB 1N5ZA 2C0IA 3UA6A 2EVRA 3VRYA 3REBB 4A4CA 1MUZA 4JJCA 5FW9A 2CUBA 2J05A 4J9CA 1BG1A 4AFUC 5D0JA 1W1FA 2NWMA 1W70A 1D1ZA 1O4LA 1SKJA 2EO3A 2MK2A 3GXXA 3C0CA 1SHAA 1ZBJA 1HCSB 3HCKA 2ROTA 3OV1A 4OHHA 2JMAA 1JQQA 2C0TA 5IBSA 4DGXA 2L3TA 2K6DA 1TUDA 2Y3AB 1O4CA 1BB9A 2JS0A 1JU5C 2DRKA 2DCRA 1A81A 3PJPA 4CC7A 4X1VA 1CWEA 1LKKA 4E68A 1M27C 4RTXA 2KRMA 3S8LA 2LJ3A 2LQNA 2F2WA 1MV0B 2PLEA 1KFZA 2EW3A 3CD3A 1E6HA 1IJRA 2L4KA 1AYCA 1X2KA 4F5AA 4ORZA 1PKTA 2HSPA 1JYRA 1SHGA 2CI9A 4F17A 2HUWA 1E7OA 2LZ6B 2IUHA 4EY0A 2L0AA 2FPDA 2MOXA 1AD5A 2RQWA 3VS6A 4HVWA 1SSHA 1NEGA 1LUNA 1O4QA 2JTEA 4QT7A 1AZGB 1AWXA 2FPFA 5FWBA 2GSBA 2ED0A 1T3LA 1ZUKA 2CIAA 1M30A 1VA7A 1X43A 3VS4A 2C0OA 4EIHA 2QDLA 1PICA 2CH4A 5KAZA 1BLJA 1LCKA 5HKZA 1VYVA 1D4TA 1FYRA 1O47A 1KJWA 1I3ZA 3VRQA 3EG3A 4RTTA 2X3WD 1EFNA 1P13A 2F2VA 2DX1A 2KT1A 1GFDA 3NPFA 2CSQA 4KRTA 1AOJA 2KRNA 2B3OA 3NMZC 4F59A 2HBWA 1W6XA 2KGTA 1RJAA 2LNXA 3MXYA 3S9KA 3RBBB 3SHWA 1U06A 3PS5A 1NLOC 3VS7A 1K76A 3REAB 2OAWA 5IHIA 2Y1NA 1O4IA 2EGCA 1UDLA 2GTOA 5IXBA 1T3SA 4J9EA 3MXCA 4NWGA 2DMOA 1F2FA 2RMXA 2LNWA 2VWFA 3BKBA 2LJ1A 4OMPA 3PVLA 1AWJA 3VRRA 3O5ZA 1SPRA 1WLPB 2JMCA 4JE4A 1VYUA 2FCIA 1B3QA 1YCSB 2RNAA 2W10A 2CSIA 1AWOA 3KFVA 4K44A 4CC2A 1M3BA 1SRLA 1WXBA 2PNIA 5GJWB 1WQUA 4J9DA 3R6NA 2AZVA 4RTUA 1FYNA 1GHUA 1PHTA 2O2OA 5GJHA 2GBQA 2BZYA 4RTVA 2D0NA 1GCPA 3VROA 1BLKA 1SPKA 1NLPC 2ED1A 2LCTA 5GJIA 1D4WA 1BHFA 1XA6A 3H0FA 2VKNA 4R0KA 1O4DA 2DRMA 3H0HA 1IO6A 4NWFA 1WDXA 2GTJA 1HSQA 2JS2A 3H41A 1AOTF 2DBMA 3A98A 2BTTA 2FRWA 1O4NA 1YWPA 1QCFA 1X6BA 2L2PA 2A37A 5I22A 1WI7A 3PVQA 4J9HA 2HDXA 2YUQA 1G83A 1WFWA 4U17A 3CXLA 1BK2A 1UG1A 5IBMA 1H3HA 2G6FX 3U23A 4P9VA 5HKWA 1A07A 1Z9QA 4HXJA 1BKMA 2CS0A 1O46A 1IS0A 1NYGA 2FRYA 2K3BA 2K79B 1BHHB 4JGHA 1OO4A 5IHKA 2RN8A 2HDVA 1UTIA 5IHNA 1UJ0A 3BUWB 2LNHB 1K1ZA 3HIZB 1FHSA 3VS3A 1JWOA 2CBLA 4Y92A 4GBQA 2RVFA 1YN8A 1G2BA 3MAZA 1UJYA 1ZUYA 4J9GA 4P9ZA 3VRPA 1K9AA 4JZ3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UUSA 2HMHA 5CO7A 1O48A 5GANg 3T9NA 1UGQB 5J3XA 2YWWA 4M7AB 3JCMV 3CMEA 3JB9J 1ZUUA 2KXCA 2O9VA 3ZFJA 4C8QE 1N8RR 3I9QA 4K45A 3PGGA 1BI2A 4PJOF 3A8MB 1O4FA 3TSWA 2EQIA 5CDWA 1A09A 1KG1A 1HK9A 2A08A 2DL5A 5A0LA 3G71T 3HPWA 4H34A 2HEQA 1VQ6Q 3CBLA 2RJEA 4UC4A 4XU1A 4RKUE 1AYDA 3CCQQ 1LPLA 3CC4Q 2KYBA 4DBRA 1PNJA 5HK0A 1Q7YU 3BDLA 1YJNA 2K7AB 3IN8A 3QO3A 1WJQA 2XHCA 3CCQA 4BE2A 2FG0A 4P5NA 2PNBA 1O4OA 2J6FA 3FIFA 4EMKA 1A08A 3V8JA 2DBKA 3CMEQ 3S8OA 2GCXA 2KI7A 3LYIA 4RCBA 3J80E 3J7AF 1WJSA 1BHHA 2ECDA 2XK0A 5KH6A 1MGQA 4M78G 3E2UA 3QZ5B 4X34A 1QVGA 3EGDA 4QQGA 1VOMA 1ZSZC 4ZTFA 3QWXX 1NM7A 4CC3A 2XP1A 3RDVA 1QVGP 3G1JA 3M0SA 2D1XA 3FJ5A 2ZPIB 1VQ9A 2KQWA 2DE0X 3JV3A 1YFNA 1UGVA 1Q86U 2QMSA 2A3LA 3GBQA 4ELYC 2EGEA 1I07A 3JSCA 5D7UA 3LX7A 2BE7D 3OYIA 3PQZA 1AWWA 4M78F 2VC8A 2Z0WA 1BCMA 3EG2A 4C8QA 2LCLA 2QAZA 4MMKA 1FX7A 2MRKA 5GANh 2A28A 1H641 2J6KA 4EMHA 3LW5E 3GF5A 1M2OA 2NUPB 1K0XA 1K0SA 4LD6A 4OHEA 3NGPA 1M3AA 2GGRA 2D6FA 4M77E 2EYZA 2KYMA 4C0DB 2CREA 2LT4A 1VQ9Q 3JB9D 1QWFA 4C5EA 3R6OA 2RJDA 1AYBA 2VXEA 4FSSA 1YJ9T 2VASA 4K2RA 2FO0A 5HCKA 4LD9K 5DC9A 3EG0A 2DETA 1WYXA 1OYXA 3V7SA 4KT0E 1B07A 1VQNT 5LJ3d 4PKCC 1H92A 2PLDA 1PKSA 3OMGA 5GANe 1TOVA 4F16A 4FM4B 5GAMg 1LCJA 5KE2A 2HMAA 2EYVA 3CCRQ 2ZPGB 1RAEB 1K4US 1VQ4T 2LQKA 2QQSA 4LDYA 1KQSA 1A1BA 4A4EA 4HCKA 2PQWA 1BFJA 2DAQA 3AT1B 2XIDA 2LCSA 5GMKj 1KQSP 5GAN2 3OSVA 4LDUA 1IGUA 1VQOT 2ATCB 4J7IA 1UEBA 4NOYA 5KYUA 5GMKh 1D09B 3CD6T 1ZSGA 1NYFA 3MP1A 3IQLA 2JT4A 3EGUA 2JNGA 1OPKA 3I35A 1RABB 4MDXA 2EYQA 1HD3A 2X4JA 2CZ6B 4BI3A 4H1OA 4MMLA 3CCLT 2MC1A 4BUGA 3A5ZB 5HKCA 2Y90A 2CS7A 1O44A 5GMKm 5I2SA 2DL8A 4M77A 1TXQA 3H8ZA 4LXCA 1E6GA 3ASKA 3MEAA 1KD1C 3C4SA 2JJ9A 1AZEA 4GWFA 2X35A 4FCYA 1M9SA 1ACMB 5GMKe 4QW2A 5C0MA 1WQ7A 2DX0A 2AHJB 2J06A 4O6JA 1B7TA 4OGCA 2RPNA 1RAIB 1QKXA 4FL6A 1VQ7T 2CGHA 1R1PA 1ARKA 1S72T 3QHSA 4Z8AA 5GAN8 2OQ1A 3JCMb 2ENMA 1WHMA 1IGQA 3BDUA 2HBPA 1PWTA 1N9SA 2JN0A 1NEBA 4OB3B 3GNFB 5GAMh 2AK5A 4J7FA 4K11A 1IZ6A 4X9DA 2DM0A 2OZOA 1Y71A 1J3TA 1TU0B 1LKLA 1RPYA 1VQKT 5IH2A 1T0JA 1BKBA 4RTZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5I21 A;  1BHF A;  2VKN A;  4R0K A;  1V76 A;  4C92 B;  1WDX A;  5CCA A;  3NTH A;  3H41 A;  3VU3 C;  2XDB A;  2DBM A;  1O4N A;  1TS9 A;  3OA6 A;  4OB1 B;  1WNL A;  4C0Z A;  4LDX A;  4R55 A;  2R5A A;  3QYG B;  2LVM A;  2NYS A;  4E7H A;  2G6F X;  3WVD B;  5HKW A;  1IS0 A;  2V8I A;  2FRY A;  2L8D A;  2K3B A;  5IHK A;  2HDV A;  1UJ0 A;  3BUW B;  3MKD A;  2LNH B;  4C0G A;  2MK5 A;  2M9U A;  3VS3 A;  4Y92 A;  1VQ6 A;  4IUP A;  4J9G A;  4PJO G;  4P9Z A;  5KYX A;  3CC4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1UUS A;  2HMH A;  1B47 A;  1O48 A;  1ZFP E;  1TZE E;  4J9B A;  1A1E A;  3BUN B;  1Y1U A;  2GE9 A;  5J3X A;  2K9G A;  1U3O A;  2LP5 A;  2YT6 A;  1RLQ C;  1QWE A;  1QLY A;  1HJD A;  2ETZ A;  4U1P A;  3PFV A;  4Z89 A;  5ECA A;  1SPS A;  3EAC A;  4AG1 C;  1XOV A;  4RTY A;  3VRZ A;  2RQR A;  3C7I A;  1ZUU A;  2O9S A;  2KXC A;  2O9V A;  2RF0 A;  1KIK A;  3I9Q A;  2MRJ A;  4K45 A;  2CT3 A;  2JW4 A;  1WA7 A;  1WXT A;  1O4F A;  1GFC A;  3TSW A;  1V1C A;  2EQI A;  5CDW A;  1A09 A;  2EL8 A;  3BUM B;  2A08 A;  2DL5 A;  4GL9 E;  2M0Y A;  1NZL A;  1UE9 A;  3HHM B;  4M4Z A;  2HDA A;  2BBU A;  4H34 A;  1HCT B;  2HEQ A;  2A36 A;  4LN2 A;  2CI8 A;  3OB1 B;  4OMM A;  1O4B A;  4FL3 A;  3CBL A;  1X27 A;  1OOT A;  1AYD A;  4X6S A;  2KYB A;  1JYQ A;  1O4M A;  2H46 E;  1PNJ A;  1M3C A;  1O4G A;  3CWG A;  1OV3 A;  1O4A A;  3PSK A;  2YSX A;  4AG2 C;  1KA6 A;  2K7A B;  3IN8 A;  4ZNX A;  1SHB A;  2VIF A;  3K2M A;  2K2M A;  2FG0 A;  1JXO A;  3PSJ A;  1LUK A;  1ZX6 A;  2PNB A;  1O4O A;  2J6F A;  2MCN A;  3BUX B;  2FPE A; 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