1GRIA

Grb2
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
217
structure length
211
Chain Sequence
MEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNRNV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the mammalian Grb2 adaptor.
pubmed rcsb
molecule keywords GROWTH FACTOR BOUND PROTEIN 2
molecule tags Signal transduction adaptor
source organism Homo sapiens
total genus 34
structure length 211
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1griA03
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1griA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1griA02
4J9GA 1K0XA 5BO4A 2EO3A 1RJAA 1JEGA 3FJ5A 3T04A 4P9ZA 1O4GA 1GCQA 5HKWA 1AWJA 1O48A 2EYZA 4J9HA 3VS0A 1ZX6A 1JQQA 3TKZA 1BKLA 4FBNA 1O4HA 1B3QA 2D8HA 1GCPA 1O43A 1JO8A 2RQUA 1YP5A 3EHQA 1PRLC 2DRKA 1OV3A 3M0PA 3M0SA 2EU0A 1ZSGA 3VROA 4FSSA 1PICA 2ECZA 2DL3A 4JJCA 1AZGB 2DL8A 2MQIA 4F5BA 2ED0A 1WFWA 1NZLA 2LNWA 4DGPA 2XMFA 1UUEA 2L4KA 3OB2B 4CC3A 5EHPA 2DM1A 1B07A 1O4LA 4R0KA 1O4QA 3MXCA 2DE0X 2RORA 3UYOA 2DNUA 2DL4A 4J9IA 4JJBA 1TCEA 4K44A 2YSQA 3HIZB 5IBMA 4CC2A 5IBSA 2FPEA 2MIOA 2O31A 4JE4A 3PSJA 1MILA 1CJ1A 3N84A 2JMAA 1NZVA 2MOXA 2L3SA 2K79A 1SHFA 1UG1A 1OPLA 3IMJA 3H0IA 3QWXX 2GBQA 4HVUA 1J3TA 1K0SA 2O9VA 1K76A 5GJIA 1T0JA 4E68A 4F16A 1YVHA 5EG3B 4AFQC 4JEGA 4P9VA 2YT6A 2CREA 3KFVA 2F2XA 3EGUA 1X0NA 5DC0B 2JT4A 1KA7A 1JYUA 1G83A 1NLPC 4F17A 4RTZA 2KT1A 2YU7A 1VYVA 2RMXA 2L3PA 2HBWA 5FW9A 3VRZA 3IMDA 2JS2A 1HCTB 2AOBA 3EHRA 4OMPA 4DEXA 1A1CA 1Y1UA 2KROA 2EPDA 2QMSA 1AB2A 4F59A 5DC4A 2L2PA 2LJ0A 2LP5A 1S1NA 3VRRA 1E6GA 2CSQA 1Y0MA 2J6FA 1GHUA 2KGTA 2VIFA 2Y1MA 2K7AB 4FL3A 2OAWA 1YWOA 2AZSA 1AYAA 4RTXA 1W1FA 1H3HA 4L1BB 4RTUA 2GTJA 5EC7A 1F2FA 1MW4A 1AEYA 2EOBA 2ESWA 1WQUA 3H0HA 4JZ4A 4RTYA 2HCKA 2D8JA 3H0FA 4ROJA 2IUGA 2V1QA 1FBVA 1I3ZA 1SKJA 1O4IA 1D4TA 5EELA 1SRLA 2PTKA 4GLMA 1WDXA 1O4KA 4EIKA 3I35A 2OQ1A 4GPLB 5EEQA 2FCIA 4A4BA 2D0NA 1R1QA 5IHNA 2RVFA 3O5ZA 1CKAA 3PE0A 2KXDA 2MC1A 2AUGA 3BUMB 3TL0A 1E6HA 2CUBA 1A0NB 2FRWA 3U23A 4J9CA 1CSYA 5J3XA 1AYCA 2LQNA 2OJ2A 3NHNA 3PS5A 1AWXA 4AFSC 2CUDA 2HSPA 5KAZA 2IZVA 1X6BA 2K6DA 1CKBA 2LQWA 1K9AA 3UF4A 5DF6A 1BFIA 4D8DA 1PKSA 4RTVA 5IXFA 1X27A 2O9SA 1QKWA 3HCKA 2L3TA 3R6NA 1U06A 2CH4W 3QWYA 1A1BA 1AOTF 5CDWA 3ULRB 3S8OA 2BZYA 4IIOA 2A36A 3JV3A 1BK2A 2CT4A 1JXMA 3GBQA 4K11A 3N8MA 1LCKA 2YUPA 2KNOA 2CT3A 4RUGA 1I1JA 1WA7A 1LUKA 1M27A 1SPSA 1TZEE 4LN2A 4XZ0A 1Z3KA 3VRQA 4M4ZA 3WA4A 4ESRA 1I07A 2JXBA 2H46E 1ZUYA 2I0NA 4LUEA 2C0IA 3M7FA 1GRIA 1W70A 1ZUUA 2MRKA 5EHRA 2M0YA 1AVZC 1ZUKA 3BUWB 5IH2A 1Z9ZA 1SEMA 3VS3A 1M30A 3NPFA 4F14A 2FEIA 1R1PA 2ROLA 1AD5A 2E5KA 4A4CA 4RTTA 3IN7A 5IXBA 2A08A 1SHDA 1VYTA 1Y57A 4XZ1A 1QKXA 3TSWA 1PWTA 2SEMA 1PHTA 2LNXA 2JM9A 2XP1A 1QWFA 2CH4A 5DC9A 3HHMB 3UATA 4Z89A 4H34A 2H5KA 1O4OA 2C9WA 2PNIA 1BBZA 2J06A 1RQQC 1O49A 2DLPA 2LMJA 1BHHB 2HUWA 1FU6A 1M8MA 3C7IA 4DGXA 1YN8A 2EW3A 1A07A 5AXIA 3EACA 2SHPA 1YNZA 2JMCA 2KYBA 2CIAA 1JYQA 3VRYA 4JGHA 1UGVA 2L6KA 3OB1B 3NGPA 2EGCA 1AWOA 1XOVA 2J05A 2C0TA 1IJRA 4J9FA 1AZEA 2KYMA 1BU1A 1JU5C 2HMHA 1UTIA 1O4FA 1NLOC 3EG0A 2PLEA 4EY0A 1X2QA 2VVKA 4Y92A 3EAZA 3I5SA 2CR4A 1O46A 1PNJA 2EYWA 2MK2A 1RPYA 2RQRA 1M3AA 1FMKA 3BUXB 3BUNB 2B3OA 3US4A 1MUZA 1PKTA 1OPKA 2FO0A 2DLZA 1SHGA 2L0AA 1OOTA 1QCFA 1IO6A 1SRMA 3PVLA 1UUSA 1BMBA 3VRPA 2KBTA 1QLYA 1OO4A 2ROTA 3SEMA 1BKMA 3SHWA 2KRSA 3CWGA 1NG2A 1UJYA 2A28A 2DJQA 3VS6A 2B86A 2DA9A 3RBBB 3LH5A 2DBMA 1QG1E 2NUZA 1WLPB 2BZXA 2BTTA 2EL8A 4QT7A 2EO6A 1FHSA 1ZBJA 1AYDA 1F1WA 1WXTA 1WYXA 2FPDA 1M61A 1O4MA 2LNHB 3MAZA 1RLPC 1BFJA 3PLFB 1YWPA 1GCQC 3M0UA 1NYGA 1BLJA 3I9QA 4IIMA 1UHCA 2FRYA 3IQLA 4OHHA 3M0TA 2IUIA 2LJ3A 4NWGA 3TVTA 2RPNA 5ECAA 2A37A 2ENMA 5GJWB 4LE9A 5I6VA 4JZ3A 1O4BA 2W10A 3OP0A 1T3SA 1TG0A 1FBZA 1O4CA 1AOJA 1RI9A 2D1XA 1LUNA 1O45A 1H9OA 1WXUA 2DBKA 2ETZA 5AULA 1H92A 1TUDA 1X43A 1E7OA 1U5SA 2F2WA 2LJ1A 2CRHA 3BUOB 2LZ6B 1BLKA 2RMOA 1AWWA 3CD3A 2J6KA 3GQIB 5HKYA 2MCNA 1BB9A 1A09A 4GWFA 3VS5A 1O4JA 3ZNIA 4K45A 1QWEA 3GXWA 2YUOA 1UJ0A 3N7YA 5D0JA 5FWBA 1R1SA 2AOAA 3K2MA 1UFFA 1X6GA 2M51A 1D4WA 2RQVA 1ABOA 1K1ZA 2K79B 4X1VA 4OMMA 4HXJA 4F5AA 4TZIA 1YVLA 1JXOA 4AFZC 1O4DA 3REAB 5I11A 2AKKA 4ORZA 1K4US 1I0CA 2DM0A 1TUCA 2YSXA 3PJPA 4OHLA 1GFCA 2OI3A 2RN8A 3PFVA 1MV3A 3H41A 1QADA 2KE9A 2V1RA 1UURA 1HJDA 4EIHA 3GXXA 2AK5A 2LX7A 2EQIA 1B47A 4JPBW 1X69A 2F2VA 1A81A 3BKBA 3UA6A 2DX1A 2HDVA 2C0OA 1G2BA 2PLDA 2RQTA 3TSZA 5IHKA 4WWQA 1EFNA 2G6FX 1HCSB 3VS2A 4Z8AA 2IIMA 3VS7A 1O42A 1CWEA 2K7AA 3CBLA 4AG1C 3OV1A 2BZ8A 2DMOA 1JWOA 2KXCA 1NM7A 4OMOA 2K3BA 2JTEA 4OMNA 1N5ZA 2X3XD 1O44A 3A98A 2JM8A 3EG1A 4A63B 2O2OA 3REBB 1LCJA 1UHFA 1NEBA 3VGOA 1BG1A 1ZFPE 2DL7A 2DLYA 4E93A 4J9DA 4LUDA 1GBQA 4OHEA 2HEQA 3S8LA 1X2KA 4GBQA 2W0ZA 4U17A 3RNJA 2K9GA 1SHAA 1O47A 5GJVB 4OMLA 4LNPA 3EG2A 1RLQC 3KFJA 5GJHA 2HDXA 3UA7A 2IUHA 1M3BA 2ABLA 1WIEA 2GNCA 1H8KA 1OO3A 2DCRA 2GSBA 3ZL7C 1BF5A 2DF6A 4ZNXA 5L23A 4FL2A 3S8NA 2AKLA 2FG0A 3OVEA 2JW4A 1KA6A 1T3LA 1FU5A 1OEBA 4HCKA 1FYNA 2MRJA 2RF0A 4HVVA 1O4RA 2DILA 5HKZA 2Y3AB 1SSHA 4AG2C 3VRNA 2DVJA 2ECDA 1M3CA 1WX6A 1IS0A 2Y1NA 1CWDL 2EGAA 2HDAA 4J9BA 3PVQA 2EGEA 1W6XA 4WCIA 1O4EA 2JS0A 2RNAA 2CDTA 3M0QA 4OHIA 4E6RA 1ZLMA 3VS1A 1CSZA 1PRMC 1LUIA 1NYFA 2QDLA 2DL5A 4J9EA 2KRMA 4CC4B 3S9KA 3VS4A 5I22A 2CI8A 4GL9E 1UECA 2H8HA 1AYBA 5IHIA 1Z9QA 4CC7A 4U1PA 3PSKA 1NRVA 2SRCA 4JJDA 2J6OA 1NEGA 1FYRA 1JYRA 1P13A 2EKXA 1KFZA 2KRNA 4Z88A 2YUQA 2LCSA 2EYYA 1BHFA 2RSYA 2NWMA 1WI7A 1UDLA 1SPRA 4D8KA 2KEAA 2KT8A 1A1EA 2GTOA 2L3QA 2J7IA 1SHBA 1HD3A 1M27C 1VA7A 2EBPA 2GE9A 2PZ1A 1GL5A 4QSYA 2CS0A 1CSKA 2PNAA 1ARKA 3CQTA 1UE9A 3NMZC 1KC2A 1SPKA 2EYVA 3C0CA 1KSWA 1LKKA 2O88A 1ABQA 2KR3A 3IN8A 2CSIA 2K2MA 2LCTA 1VYUA 1XA6A 1A08A 4OMQA 1V1CA 3EG3A 1BHHA 1BM2A 4KRTA 1O4AA 3I5RA 4DEYA 1GFDA 3THKA 1JU5A 1MV0B 1YCSB 2EKHA 4X6SA 1U3OA 2P4RA 1WXBA 2KK6A 3CXLA 2X3WD 1GBRA 2EVRA 1LKLA 5HCKA 2PNBA 1D1ZA 2EYXA 2VKNA 1A1AA 2DX0A 4H1OA 2DYBA 2GGRA 1O4PA 3M0RA 1AOUF 3MXYA 2OZOA 2BBUA 3PQZA 1O4NA 2GQIA 2KNBB 1X6CA 4OHDA 2YDLA 2CI9A 2JYQA 4NWFA 4HVWA 2YUNA 1HSQA 1KJWA 2VWFA 2RQWA 2ED1A 1RUWA 2FPFA 4RTWA 5FWCA 1KIKA 2DRMA 2AZVA 4AFUC 1O41A 2CBLA 4K2RA 1LUMA 1T0HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K0XA 2BKDN 5KYUA 5BO4A 2EO3A 1RJAA 3T04A 4M7DD 1BIAA 1SSFA 1XQHA 5HKWA 3M56A 1O48A 1G8XA 4J9HA 1BKLA 2PUOB 2GFUA 4C92G 4FT4A 2D8HA 3VJPA 1O43A 4JUVA 1YP5A 2KMTA 3CCJA 3CCRT 3VROA 3MP8A 4FSSA 3EH1A 4JJCA 4F5BA 1VQMA 2M9UA 1NZLA 2XMFA 1WHGA 2QQSA 4CC3A 2E3HA 2DM1A 1O4LA 4R0KA 2RHXA 3I55A 1O4QA 4A4EA 4C5EA 5GMKe 4CRIA 1OI1A 3FEOA 3JRZA 2DE0X 5DM7R 3UYOA 2QTXA 5GMKi 4MDXA 4N0AA 4BDYA 2RK1A 4FW1A 3CMAT 1TCEA 2ZPEB 5IBMA 4JLIA 2COWA 5GAOl 2MIOA 3PSJA 4ZTFA 1OQKA 1D1BA 1CJ1A 3N84A 4M7AF 1NZVA 1Y07A 5LJ3j 3OYJA 3IMJA 2QXFA 2EJ9A 1Y7XA 3OYFA 3SWNA 3CD6T 1YBYA 1Y96B 1K8AC 2CREA 1N27A 3DB3A 2MK5A 1X0NA 5DC0B 1KA7A 1FMVA 4QVZA 4F17A 4RTZA 3GP8A 3MPUB 1FX7A 4NL3A 1VQ5T 4J6YA 1HCTB 2AOBA 3EHRA 4DEXA 1A1CA 2O4XA 1AHJB 1AB2A 2MWPA 4F59A 2L2PA 2LJ0A 1JJ2P 1S1NA 3G7ZA 4BD3A 3A8LB 1E6GA 1PSEA 1K8AR 4XTZA 2AZSA 4L1BB 3HPWA 2GTJA 5EC7A 5AYFA 1AEYA 1M1KC 2ESWA 1WQUA 3H0HA 3P8HA 2IUGA 5EELA 1SRLA 4GLMA 1N9SA 1BI1A 1O4KA 1BI3A 5KYNA 3A8MB 1RABB 5GANg 5CQXA 5KYXB 3O5ZA 2KXDA 4PFPA 4J9CA 1CSYA 1NE8A 1AYCA 3JCMQ 4M78A 3PS5A 1AWXA 5KAZA 1YJNQ 2BE7D 1CKBA 1WHMA 1K9AA 5DF6A 1M1KR 1PKSA 4RTVA 2NLUA 3E9GA 3DB4A 5GAN3 1BK2A 3GBQA 4K11A 2KNOA 2DTHA 2XKOC 1I1JA 1NJIU 1D0YA 3CCLQ 1TZEE 3VRQA 1M4ZA 5KE3A 2QQRA 4NOYA 3WA4A 4BE2A 4BE1A 3HRTA 3CD6A 5CO7A 1JB0E 1Q82C 3CC7T 3OMCA 3BUWB 5IH2A 2YLBA 1PSFA 3CCQT 1VYTA 1G5VA 4J6WA 5J39A 1EIFA 4E7ZA 2ZGWA 3X26B 3HHMB 4IUPA 1R77A 4C8QE 3JCMX 2OTLQ 1O4OA 5GMKm 2CZ7B 2PNIA 1BCOA 2RJEA 5DLQE 5FRNA 1O49A 1SKUB 2DLPA 2O01E 1Q82R 4DGXA 2EW3A 2XICA 1A07A 3OSVA 4B9WA 1MNDA 2JMCA 4JGHA 1UGVA 2L6KA 3RMSA 3OB1B 1AWOA 2DZCA 4FT2A 4J9FA 3G71T 3RKWA 3CCLA 2RJFA 3EG0A 3CCUQ 1W2BS 1X2QA 3JB9J 4FYXB 2CR4A 4Y28E 2XI9A 3CPWA 4OB0B 3UDCA 1FMKA 2LT4A 1QMCA 2B3OA 3QHSA 1MUZA 3CXCP 3RERA 1IO6A 3OW2A 5C6SA 3PVLA 1UUSA 1IHVA 2RHZA 4M75E 3SHWA 4PJOG 2DJQA 1M8VA 3VS6A 4GY5A 2B86A 1M90C 2R5MA 2DBMA 1YI2T 1NZ9A 2E70A 2NUZA 2BZXA 1FHSA 1F1WA 2LNHB 1RLPC 3OBYA 1GCQC 1D0ZA 1BLJA 2HBPA 3I9QA 2HAXA 3IQLA 4JS5A 2IUIA 2E1HA 3TVTA 2JOYA 4LE9A 5I6VA 3OP0A 1QQJA 4KUIA 3CBPA 4N4GA 1VQ9Q 1FBZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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