1GRIA

Grb2
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
217
structure length
211
Chain Sequence
MEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNRNV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the mammalian Grb2 adaptor.
pubmed rcsb
molecule keywords GROWTH FACTOR BOUND PROTEIN 2
molecule tags Signal transduction adaptor
source organism Homo sapiens
total genus 34
structure length 211
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1griA03
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1griA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1griA02
2A28A 2EO6A 2DVJA 2DLPA 3M7FA 4FBNA 2K6DA 1WXTA 1SHAA 4OMNA 2B86A 2EGCA 1MW4A 2L4KA 1BK2A 1FMKA 1SSHA 1PRMC 2LQWA 1WX6A 1XOVA 2ENMA 1O4GA 1O4IA 1SHGA 2MQIA 1U06A 4HVVA 4J9HA 1O4CA 2DCRA 1HCSB 4JJDA 2ESWA 3HCKA 2JM9A 2EYVA 4RTUA 2EPDA 2PTKA 3THKA 2D8JA 2EYXA 1RUWA 2JS2A 1YVLA 2DL7A 4RUGA 1AZEA 5BO4A 1IJRA 1O4KA 1D4WA 1E6GA 1AD5A 2HCKA 1PKSA 4A63B 2ABLA 2LNXA 1WA7A 4E93A 2L3PA 1I3ZA 1JYUA 1SPKA 2BZYA 2K9GA 1O4OA 1YN8A 4J9DA 1AYDA 1GBRA 1HSQA 3VS7A 1O45A 2IUHA 2QDLA 2HMHA 2VVKA 3GXWA 1T0HA 2BBUA 1QWFA 3OVEA 1FHSA 3N7YA 2I0NA 1WXBA 3IQLA 4OHEA 2LP5A 3U23A 2HUWA 2IUGA 2JYQA 2FO0A 2RQVA 2GNCA 3I35A 1MILA 3T04A 2DYBA 4J9FA 2EBPA 1BF5A 4Z89A 1D1ZA 1BHHB 2F2XA 1A1CA 3S9KA 2RMXA 1KA7A 3VRQA 2VKNA 2IZVA 3M0UA 2EGEA 1AB2A 2FPFA 1T0JA 1ZX6A 1LUMA 2CRHA 2LNWA 5D0JA 1QCFA 4EY0A 3VRYA 4K2RA 4HVUA 4OHHA 1B3QA 1MUZA 1M27A 1TCEA 2FCIA 4FL2A 4DGPA 2HEQA 3JV3A 3NHNA 1O4EA 3BUNB 2RN8A 1YWPA 2LNHB 3EG3A 4FL3A 1RLPC 3PFVA 2YU7A 4K44A 1U5SA 2KT1A 5I22A 2KRMA 1LCKA 2M51A 5GJWB 2DBKA 3GXXA 1JXMA 2EVRA 1UURA 2RNAA 1GFCA 1RI9A 1JO8A 1ABQA 3CXLA 2NUZA 2SRCA 4LUEA 2DMOA 1QKXA 1M30A 1RPYA 1Y57A 1O4DA 2MK2A 1R1QA 3TL0A 3M0TA 1B07A 3UA6A 1SPSA 2YT6A 5AULA 2MOXA 2NWMA 1O4PA 1LUIA 3VRNA 2F2VA 1RJAA 1O4QA 4A4BA 3BUOB 1W70A 1QADA 1LUNA 1O4LA 2ECDA 2GGRA 2BZ8A 3IMDA 1V1CA 1BB9A 3O5ZA 4Z8AA 1T3LA 4R0KA 5IXBA 1XA6A 4GWFA 1FBVA 3MAZA 2Y1MA 4DGXA 2KT8A 4P9VA 1FYNA 2JW4A 4Z88A 3LH5A 3PVQA 3BKBA 4F5AA 2J7IA 2X3XD 2AZVA 1JEGA 2L3QA 2RQRA 1M61A 1SKJA 1ZLMA 1ZUKA 1I07A 4X6SA 5IHKA 1NLOC 1ZBJA 2KNOA 2EU0A 2EO3A 1UFFA 3VRPA 2LJ1A 2PNAA 3EHRA 4IIMA 4H1OA 2BZXA 1ZSGA 1OV3A 2A37A 2DL4A 2EYWA 1VA7A 2LZ6B 4U17A 4JE4A 2EKXA 1WQUA 1UG1A 4HXJA 3ZL7C 3H41A 1O4BA 1X0NA 1LUKA 2DLYA 4XZ1A 3OB1B 3QWYA 4LNPA 2VIFA 2CS0A 1JQQA 2LCTA 4XZ0A 1QG1E 4D8KA 1G2BA 4F59A 2O9SA 4F16A 4NWFA 3HIZB 3A98A 4Y92A 3EGUA 1BHHA 1SRLA 2CSIA 4OMOA 2AZSA 1F1WA 1A08A 4RTZA 1G83A 1H9OA 2D1XA 1UHFA 1AWOA 2MCNA 1W1FA 2OQ1A 2EW3A 2F2WA 1UUSA 3EACA 1WYXA 3TKZA 2CREA 5FWBA 4KRTA 2K79B 2AUGA 1ZUYA 4K45A 1SEMA 1ARKA 3I5SA 1WI7A 5IHIA 1AOTF 1FBZA 2C0TA 1O49A 2DX0A 2KYMA 5HKYA 1AYBA 2JS0A 5EC7A 2HDAA 5HKZA 1AOUF 1CKAA 2L3SA 2LCSA 2O88A 2RF0A 1UECA 5CDWA 4OHIA 4EIKA 2SEMA 4AFQC 1O42A 1Z3KA 2G6FX 2FEIA 2KEAA 2PNIA 2PLEA 1K1ZA 2KROA 1BBZA 3TSZA 3KFJA 1M3BA 1CKBA 2ROLA 2JT4A 1I0CA 5KAZA 2L0AA 5FW9A 2LJ3A 3M0PA 2KRNA 1FYRA 2K7AB 4EIHA 1OPKA 3I9QA 5ECAA 4D8DA 3N84A 2C9WA 1OO3A 2YDLA 2EL8A 4X1VA 1GCPA 2DF6A 1O4AA 3EAZA 2KRSA 1FU5A 3TVTA 5J3XA 1UJ0A 1GCQC 1GL5A 3EG1A 3IN8A 1E7OA 3M0RA 3PVLA 4OMLA 4AFSC 5GJVB 1BMBA 2CIAA 5EHRA 5DC0B 1PWTA 3BUXB 1GRIA 1VYUA 3M0QA 1KC2A 4WCIA 1SHDA 1BHFA 1X6GA 4CC4B 1WFWA 1BKMA 2JXBA 2PLDA 1CWDL 1BU1A 2JMAA 2LMJA 4K11A 4LN2A 1OO4A 1PHTA 4GBQA 5EHPA 1NM7A 1JWOA 4JJBA 2BTTA 4NWGA 1I1JA 2RORA 1AEYA 1CSKA 1OOTA 1A1AA 1KIKA 1EFNA 1BFJA 2CDTA 5EEQA 2C0OA 1UHCA 3I5RA 1HD3A 1YCSB 2YUOA 1O4RA 1ZUUA 3OB2B 1A07A 3VS5A 2DM0A 1BLKA 1PNJA 1AWJA 5DC9A 5IBSA 2IIMA 3M0SA 2EYYA 4J9EA 1X2KA 3US4A 1BG1A 1D4TA 1UE9A 5EELA 2B3OA 1KA6A 1QWEA 3S8NA 1PICA 5AXIA 1O46A 2CH4A 2GTOA 2KYBA 2KXDA 5DF6A 1B47A 4GPLB 4RTVA 2OZOA 3VS0A 1Y1UA 5EG3B 2GBQA 1GBQA 2H5KA 4JGHA 1O44A 4F17A 2J6KA 2YSQA 1AWWA 2CBLA 3NPFA 1CWEA 2J6OA 2IUIA 1QLYA 2AOBA 2FRWA 3S8OA 2SHPA 4GLMA 1KSWA 1CJ1A 2DL5A 2K79A 4DEXA 2ROTA 2J05A 4ESRA 2CI8A 1Y0MA 5HKWA 5I11A 1BM2A 1WXUA 2KBTA 5HCKA 1QKWA 2RQTA 1M8MA 1OEBA 1NEBA 1UGVA 1NZVA 3H0IA 3UF4A 2EQIA 1U3OA 3R6NA 4OMPA 2D8HA 2EYZA 2HDVA 2A36A 4AG1C 1S1NA 3GQIB 1JXOA 2KK6A 1KJWA 2YUQA 2CUDA 2V1QA 3EG2A 1SRMA 1TG0A 2K7AA 1M3AA 1JU5C 4JJCA 3PS5A 2HBWA 1OPLA 4RTWA 1WDXA 4RTTA 2D0NA 1HJDA 2XMFA 2KGTA 1O47A 2M0YA 3VGOA 1YNZA 3VROA 2JMCA 1BKLA 2O9VA 2DA9A 2PNBA 3VS4A 1WIEA 3MXYA 4QT7A 4J9BA 1JU5A 1TZEE 2C0IA 3C7IA 3IN7A 1FU6A 1TUCA 1MV0B 3BUMB 1NZLA 2GQIA 1R1PA 3UYOA 2GTJA 4E6RA 1AWXA 1X69A 2FG0A 1MV3A 2OJ2A 1CSZA 2L3TA 2ETZA 3K2MA 4A4CA 2K2MA 4F14A 1A1BA 1LCJA 2HDXA 3CBLA 1NEGA 2LX7A 1F2FA 1UUEA 3H0FA 2V1RA 3H0HA 1K9AA 4JEGA 4M4ZA 2MIOA 1KFZA 2Y3AB 1UJYA 2AKKA 3IMJA 4J9IA 3EHQA 5FWCA 1H8KA 1JYQA 2EGAA 3VRZA 4JZ4A 2ECZA 2OI3A 3VS3A 3PSKA 2FPDA 2GSBA 1H92A 1O41A 2DM1A 2L2PA 1NYGA 2J06A 2RQUA 2A08A 2O31A 2CT4A 1AYAA 2CR4A 5I6VA 4H34A 3RNJA 2K3BA 3NGPA 2GE9A 1O43A 1IS0A 2CI9A 2RVFA 2KXCA 2LJ0A 2AOAA 1PKTA 2FRYA 4IIOA 2X3WD 2Y1NA 3EG0A 2H8HA 5L23A 2ED1A 3QWXX 1NG2A 4AFUC 5GJHA 1TUDA 3REAB 4OHLA 1K0XA 3UATA 2MRJA 3UA7A 4LUDA 1O4FA 4CC7A 1M3CA 1E6HA 2CUBA 5IXFA 4CC2A 2H46E 4GL9E 1CSYA 3N8MA 3OP0A 2AK5A 1GCQA 4AFZC 1ZFPE 1AOJA 2O2OA 1M27C 2KE9A 4U1PA 2KR3A 2MRKA 3KFVA 3MXCA 1AVZC 1Z9ZA 5IHNA 4OMMA 2EKHA 4HVWA 2PZ1A 3FJ5A 2CH4W 1RLQC 3CD3A 4L1BB 3VRRA 1AYCA 3ZNIA 1BFIA 1LKKA 1PRLC 2W10A 3PQZA 1NLPC 1YP5A 4J9CA 1P13A 2J6FA 4JZ3A 1O4HA 2YSXA 4CC3A 1X2QA 2RQWA 2DBMA 2XP1A 1K76A 1NYFA 2RMOA 1IO6A 4ZNXA 2YUPA 4OHDA 1X6CA 1SHBA 2JTEA 2L6KA 2JM8A 4E68A 3C0CA 2MC1A 5IBMA 2VWFA 4QSYA 4ROJA 1A81A 2KNBB 1NRVA 2RSYA 1Z9QA 1O4MA 1O48A 2CSQA 1BLJA 3S8LA 1HCTB 4HCKA 5IH2A 1YVHA 1YWOA 2DL8A 3BUWB 3VS2A 1JYRA 1UTIA 2DE0X 1O4JA 2FPEA 1K0SA 1VYVA 3OV1A 2P4RA 4LE9A 1R1SA 2HSPA 1J3TA 3CWGA 3GBQA 4AG2C 1AZGB 3CQTA 1RQQC 1LKLA 1A09A 4OMQA 3PJPA 2EOBA 2DRKA 2DJQA 2ED0A 3PLFB 2W0ZA 1T3SA 3VS6A 3ULRB 3HHMB 3VS1A 2DILA 4F5BA 1A0NB 1H3HA 1SHFA 2DNUA 2LQNA 1UDLA 3PE0A 3SHWA 1GFDA 1SPRA 1A1EA 1K4US 2DLZA 1VYTA 3PSJA 3RBBB 1N5ZA 3NMZC 1ABOA 1X6BA 1GHUA 2CT3A 2AKLA 1O4NA 2DL3A 5GJIA 4RTYA 4DEYA 1X27A 1X43A 2YUNA 4J9GA 4RTXA 4JPBW 5DC4A 2RPNA 2QMSA 3TSWA 4TZIA 2DRMA 3REBB 4P9ZA 1WLPB 4ORZA 2DX1A 3SEMA 4FSSA 2E5KA 4WWQA 1W6XA 3WA4A 2OAWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EO6A 1WXTA 2VB6A 3P8HA 1Y71A 5A0DA 4EMKC 4M7AD 1MW4A 2VGMA 2LQWA 1PRMC 5IN1A 2E3IA 2ENMA 1VQ5T 2HAXA 1LOJA 1O4IA 1SHGA 1O75A 1QVPA 1U06A 1HCSB 4M7DG 3EFRA 3MP6A 4IKFA 1G5VA 2JTFA 2EYVA 2EPDA 2PTKA 3G71Q 2D8JA 4C0ZA 2DL7A 3PMIA 1AZEA 4XU3A 3A8MB 3HL8A 2YRCA 1E6GA 2JUFA 1AD5A 1WA7A 3OYEA 2QTXA 2NLUA 1RAEB 2L3PA 2M0OA 3X28B 1SKUB 1JYUA 2BZYA 2K9GA 4J9DA 1AYDA 5KYWA 1OU8A 3CXCS 2IUHA 5CCAA 2HMHA 3GXWA 1T0HA 2BBUA 3N7YA 2I0NA 4A53A 3GOXA 5FU7C 2RQVA 2GNCA 1TU0B 4IUUA 3CCEQ 2XKOC 2DZ9A 4C5HA 3CCRT 4ZGDB 2XG8D 4J6XA 1A1CA 2CZ0B 3BDLA 2RMXA 1N8RR 3E2UA 2EGEA 2QA4Q 2FPFA 2QASA 1LUMA 4M7DA 2CRHA 2GQVA 4EY0A 4OHHA 1B3QA 4DGPA 1O4EA 2RN8A 1RLPC 5AT1B 1G3YA 2EJ9A 4RMOA 4K44A 1U5SA 5I22A 3JCMf 1ACMB 4XAXB 2RNAA 1GFCA 1VQ6Q 1JO8A 1ABQA 2KQWA 2DMOA 1QKXA 3CCUT 1O4DA 5GAMf 1G3WA 2YT6A 1RAAB 5CKDA 1KD1U 5IT9E 5GMKe 3CD6Q 2VC8A 3CCJA 2VYTA 2FZCB 3RIRA 2YLBA 3IMDA 1BB9A 5IXBA 4GWFA 1FBVA 1YHQA 3QJ6A 2JW4A 3AHUA 3H6ZA 3LH5A 4F5AA 2KAFA 4C8QB 2OTJA 1KC8U 3FEOA 1SKJA 1H641 1R0BG 5CKHA 4M78F 3M9QA 5IHKA 2X4XA 1ZBJA 2KNOA 1VQ7Q 2LJ1A 2PNAA 2OTLA 4IIMA 5KYXB 2BZXA 3CCVT 1OV3A 2A37A 2DL4A 5DC0B 4M77D 1UG1A 4HXJA 4PJLA 1O4BA 2LVMA 3V7RA 3F70A 1X0NA 1D0XA 3OB1B 3V8KA 1KD1C 2EQMA 5HY6A 3I55Q 2KK4A 3EGUA 1I5OB 1F1WA 1M1KU 1H9OA 2AZSA 4O5VA 2XI9A 2OQ1A 1AWOA 5KH6A 4C8QG 2QGGA 5FWBA 1YJWA 4K45A 1SEMA 1ARKA 2P0QA 2HKNA 5GANh 3SDZA 1Q81U 5EC7A 1AOUF 1CKAA 1KC8C 2QEXT 4EIKA 3H8ZA 4AFQC 3JB9J 2PNIA 1FMWA 1K1ZA 3CXCA 3KFJA 1GXIE 1CKBA 2ZPGB 4ME7A 3M0PA 5ECAA 4D8DA 3CMAA 4PK4A 2LQ8A 2YRDA 4XK8E 1FU5A 3MP8A 3IN8A 1M1KC 3JCMP 3BUXB 1W2BS 3A8LB 1V76A 4Y28E 1WHGA 3EGXB 1BHFA 2FL7A 5C0MA 4IURA 2PLDA 4K11A 1YJ9Q 4A4FA 1VQ9Q 2BTTA 4NWGA 1I1JA 3HRTA 1Q81C 4C8QA 1OOTA 1A1AA 1BFJA 1EFNA 5EEQA 3CCMQ 3CCQT 1HD3A 4FT2A 1O4RA 3OB2B 5GANg 1BG1A 5KYXA 3GF5A 1MMDA 2XHCA 2B3OA 1KA6A 3QHSA 1NJIR 1AT1B 3HFOA 3FRNA 1B47A 4GPLB 3VS0A 3OS0A 2BUDA 2VXFA 1AWWA 3D7SB 4A4KA 3CCLA 3NPFA 1VUBA 3EGDA 3MKDA 2IUIA 2AOBA 2FRWA 2SHPA 4GLMA 2XIDA 4KUIA 2ROTA 4ESRA 1XTDA 2WSCE 2RK1A 4FT4A 1D0YA 1QKWA 1M8MA 1D1CA 3WXMB 4PLIA 5GAOq 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2A28 A;  2EO6 A;  2DVJ A;  2DLP A;  3M7F A;  4FBN A;  2K6D A;  1WXT A;  1SHA A;  4OMN A;  2B86 A;  2EGC A;  1MW4 A;  2L4K A;  1BK2 A;  1FMK A;  1SSH A;  1PRM C;  2LQW A;  1WX6 A;  1XOV A;  2ENM A;  1O4G A;  1O4I A;  1SHG A;  2MQI A;  1U06 A;  4HVV A;  4J9H A;  1O4C A;  2DCR A;  1HCS B;  4JJD A;  2ESW A;  3HCK A;  2JM9 A;  2EYV A;  4RTU A;  2EPD A;  2PTK A;  3THK A;  2D8J A;  2EYX A;  1RUW A;  2JS2 A;  1YVL A;  2DL7 A;  4RUG A;  1AZE A;  5BO4 A;  1IJR A;  1O4K A;  1D4W A;  1E6G A;  1AD5 A;  2HCK A;  1PKS A;  4A63 B;  2ABL A;  2LNX A;  1WA7 A;  4E93 A;  2L3P A;  1I3Z A;  1JYU A;  1SPK A;  2BZY A;  2K9G A;  1O4O A;  1YN8 A;  4J9D A;  1AYD A;  1GBR A;  1HSQ A;  3VS7 A;  1O45 A;  2IUH A;  2QDL A;  2HMH A;  2VVK A;  3GXW A;  1T0H A;  2BBU A;  1QWF A;  3OVE A;  1FHS A;  3N7Y A;  2I0N A;  1WXB A;  3IQL A;  4OHE A;  2LP5 A;  3U23 A;  2HUW A;  2IUG A;  2JYQ A;  2FO0 A;  2RQV A;  2GNC A;  3I35 A;  1MIL A;  3T04 A;  2DYB A;  4J9F A;  2EBP A;  1BF5 A;  4Z89 A;  1D1Z A;  1BHH B;  2F2X A;  1A1C A;  3S9K A; 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