1GRIA

Grb2
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
217
structure length
211
Chain Sequence
MEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNRNV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signal transduction adaptor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the mammalian Grb2 adaptor.
pubmed rcsb
molecule keywords GROWTH FACTOR BOUND PROTEIN 2
total genus 34
structure length 211
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1griA03
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1griA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1griA02
1JU5A 1A81A 4H1OA 1O4JA 2RN8A 2GGRA 1UE9A 1N5ZA 2OI3A 5HCKA 3M0RA 3VS6A 2KRNA 3N84A 1O4DA 1GBQA 2K79B 1TG0A 1KA6A 2MK2A 3VS4A 2MOXA 2DMOA 2AZVA 1JYQA 2O9SA 1AOJA 2EGCA 3M0UA 2DL7A 3I35A 1K4US 4E93A 2PTKA 2HUWA 3MXYA 5DC9A 2LJ3A 3OV1A 2DBKA 2KE9A 1AWOA 3VGOA 3THKA 4EIHA 4EIKA 1YWOA 2K79A 2AZSA 4LNPA 1BB9A 3EG3A 1GHUA 2EW3A 2FCIA 1BF5A 1K76A 1WFWA 3EG2A 3A98A 4ESRA 4ZNXA 1QCFA 1LKLA 2DRKA 4R0KA 2ESWA 2GNCA 2VKNA 4RTZA 3VRZA 2LNXA 4WWQA 4XZ1A 2L6KA 3QWYA 1ABOA 1O4NA 2MRJA 2ROLA 3BUXB 3GBQA 3VRQA 1W6XA 4JJBA 4IIOA 4WCIA 2RORA 3VROA 4Z8AA 5EHPA 2BBUA 2GTOA 4EY0A 1O48A 1B07A 2DILA 2RQWA 4CC3A 3TVTA 3M0TA 3PVQA 1NRVA 2VIFA 4U17A 2CI9A 1ZSGA 1O4MA 1M61A 1Y57A 5IHIA 1GRIA 1RPYA 2KT1A 2M51A 1O4LA 1O4PA 5IH2A 4OMLA 5GJWB 2EPDA 4K11A 2VVKA 2KNOA 1SHDA 2CS0A 1Z9ZA 5EC7A 1XA6A 1FYNA 4GWFA 2NWMA 4P9VA 3KFVA 1U06A 1O4AA 3PFVA 4NWFA 1QKWA 2YUQA 2O2OA 4GL9E 2DRMA 4J9IA 1X43A 1A09A 3VRNA 2HEQA 1WQUA 2M0YA 2A28A 2CUBA 3PQZA 2RMXA 3BKBA 2MC1A 4RTXA 5BO4A 1CKBA 1GFCA 1E7OA 2XMFA 3VS3A 1PNJA 2IUIA 1RUWA 2F2WA 2RMOA 3BUMB 2K9GA 2FPDA 2DLYA 4FSSA 2QDLA 1FBZA 2MQIA 1QWEA 1SPKA 1X6GA 2ED0A 1O4EA 3TKZA 2HSPA 1SSHA 4QSYA 1M30A 3NMZC 1YVHA 3NGPA 3UATA 2LJ0A 2KK6A 2XP1A 1KFZA 1X6BA 2J7IA 2B3OA 1I07A 1K0SA 1I0CA 3M0SA 3REAB 2K7AB 5KAZA 1O46A 4RUGA 2L3PA 2V1RA 2J6KA 2CIAA 1NZVA 1LCJA 3NHNA 4AG2C 4X6SA 2DLPA 1JYUA 2YUNA 1HCTB 1FMKA 4ROJA 1WIEA 2VWFA 3S8NA 5GJVB 1RI9A 3PSKA 1NYGA 2DJQA 1QKXA 4P9ZA 2L3QA 1AVZC 2K7AA 5IHNA 1FHSA 1LCKA 1ZLMA 4IIMA 2ECZA 1CJ1A 1WXUA 2CBLA 2JM8A 2HMHA 2MCNA 1RQQC 2AUGA 4A4CA 1J3TA 1IO6A 2O9VA 5EEQA 1I3ZA 2BTTA 3IQLA 2GTJA 4HVVA 1M8MA 2K3BA 1Z3KA 3H0HA 1PKSA 2FPEA 3PS5A 4F16A 2EO3A 2LP5A 2LCSA 2D8JA 1O49A 2GE9A 3VRRA 1K0XA 2DL8A 3VS1A 2EKHA 1NEGA 1JXOA 1M27A 1EFNA 2BZ8A 2LJ1A 2OAWA 3EHQA 2LQNA 2FPFA 1LUMA 3EACA 2QMSA 3RBBB 1SKJA 3REBB 1WI7A 3I5SA 4JPBW 4XZ0A 5I6VA 3H0IA 1SPRA 2HBWA 2CT3A 2NUZA 1UHCA 1R1SA 3FJ5A 2D8HA 1UUSA 5IBSA 1KJWA 1PWTA 2SHPA 3M0PA 1BLKA 1E6HA 1QLYA 1CKAA 2L3TA 5I11A 2JT4A 1F2FA 2EYXA 4HXJA 5L23A 2K2MA 1WDXA 2JXBA 1V1CA 4L1BB 5HKWA 2HDVA 4AFUC 4F59A 1T0HA 1JEGA 4TZIA 2C0IA 1YWPA 3ZL7C 2CUDA 3VS5A 1YCSB 1KIKA 1CWEA 1KC2A 2RQTA 2SRCA 3MAZA 1Z9QA 4GBQA 3EHRA 1O4FA 1AOUF 3QWXX 5EHRA 1O44A 5IBMA 2KRSA 2RVFA 2JS0A 1RLPC 4FBNA 4LE9A 1TCEA 2DA9A 3OB1B 2BZXA 2OJ2A 1LKKA 1OPKA 2ED1A 1YVLA 2O31A 3C0CA 3IMJA 1E6GA 2HDAA 4HVWA 4K45A 1H3HA 1UURA 1A07A 2YSXA 1A1AA 2YSQA 1QADA 1BHHB 3N8MA 2KXDA 4U1PA 2JMAA 1R1QA 2DLZA 2AOBA 4JEGA 2AKKA 2RQRA 1OEBA 2CREA 3UF4A 1LUNA 3S9KA 3MXCA 4J9HA 1GCQC 1O4BA 1GFDA 2H46E 2W10A 3CWGA 3OVEA 2DL4A 2DX1A 4ORZA 5EG3B 1SHAA 3TL0A 2H8HA 4J9GA 2JTEA 1ZX6A 2LMJA 3PVLA 1A0NB 1A1EA 2JYQA 2P4RA 1BHHA 1O4RA 3GQIB 1NM7A 2JW4A 3UA6A 2OQ1A 2JM9A 1X2KA 4DEYA 2ECDA 2PZ1A 5D0JA 2CT4A 1H8KA 1X2QA 1OV3A 1AWXA 3KFJA 4J9DA 2Y3AB 1H92A 2CSIA 1BHFA 4F17A 4RTYA 3BUNB 3PSJA 1BG1A 1PRLC 1FU5A 1OO3A 3C7IA 1O45A 4GPLB 5EELA 4DGXA 2DL5A 3CBLA 3N7YA 5I22A 5FWBA 4Z89A 3EG0A 1JU5C 1BLJA 4AFSC 3HIZB 2PNAA 2EYVA 3EAZA 1AWWA 2D0NA 3CD3A 1H9OA 1FBVA 5J3XA 5IXFA 2CSQA 3BUOB 2CRHA 2CDTA 1BK2A 4GLMA 5FWCA 2PNBA 2V1QA 1X0NA 3WA4A 2FRYA 4OMMA 1KSWA 1BBZA 2KR3A 4Z88A 2RF0A 4FL3A 3PLFB 3NPFA 3IN7A 2ETZA 2FEIA 1F1WA 1ZBJA 1RJAA 5IXBA 1MV3A 1HD3A 1JYRA 1AYAA 4RTTA 2F2XA 2KNBB 1VA7A 3U23A 2A36A 3K2MA 4JZ4A 2F2VA 1AB2A 1WXTA 2EQIA 3ZNIA 1M3BA 1WLPB 4AFZC 1U3OA 1OPLA 2CH4W 2IIMA 2X3WD 2IUHA 4F5AA 4JJCA 2YU7A 1M3AA 3M7FA 1O4HA 1WYXA 1SHBA 5CDWA 1YP5A 3LH5A 4HCKA 3SEMA 1CSZA 2AK5A 2L3SA 1MW4A 2L4KA 1K9AA 2DL3A 2EYWA 3EGUA 1BKMA 4J9EA 5AULA 2DM0A 1UECA 3OP0A 1Y0MA 3BUWB 1GCPA 2OZOA 2HCKA 3JV3A 2KYMA 2PNIA 1OOTA 3M0QA 2JS2A 2FG0A 2LZ6B 3VS2A 2FRWA 1VYTA 2RQUA 2CH4A 3I9QA 5ECAA 1BM2A 4JJDA 1W70A 1RLQC 1VYVA 3ULRB 2X3XD 1D1ZA 4J9BA 5DC0B 4E6RA 3HHMB 4F14A 2EYYA 2GSBA 3IMDA 2PLDA 1JO8A 1JXMA 4CC7A 1ZFPE 3VRPA 3IN8A 2YT6A 1UJYA 2YUOA 2I0NA 3S8OA 2J6OA 5AXIA 2DCRA 2EKXA 1O4GA 1X27A 4Y92A 1LUIA 1G83A 2C9WA 1G2BA 1BFIA 1Y1UA 3CQTA 2KGTA 1HCSB 3CXLA 1SRMA 2A08A 2LQWA 1BFJA 1B47A 3O5ZA 1FYRA 1SPSA 2RNAA 2YDLA 1O41A 1AZEA 2KYBA 4LN2A 4AFQC 4FL2A 5DF6A 1D4WA 2EL8A 1O43A 4OHHA 2EGEA 2DE0X 1ZUUA 2IZVA 4H34A 3S8LA 2KBTA 1TUCA 4OMQA 1PHTA 1MILA 1NYFA 3UYOA 1YN8A 2K6DA 1SRLA 2C0OA 4QT7A 5IHKA 4A4BA 4RTUA 1LUKA 1WA7A 1A08A 1NZLA 3VRYA 4X1VA 1AYCA 2LNWA 4JGHA 2AKLA 2DNUA 2LX7A 1X6CA 4NWGA 5DC4A 1BMBA 3I5RA 1R1PA 1AOTF 2IUGA 2ENMA 4RTVA 4OHDA 2PLEA 3T04A 1O4CA 1ABQA 1PRMC 4HVUA 1CSYA 1AEYA 4LUEA 1HSQA 1UHFA 2E5KA 1O47A 1QG1E 5GJHA 1SHFA 1D4TA 3SHWA 1WX6A 1AYBA 2EOBA 4E68A 1HJDA 3TSZA 2A37A 2Y1NA 2W0ZA 1MUZA 1AD5A 3VS0A 1WXBA 1U5SA 2DX0A 3HCKA 1ZUYA 1IJRA 4OMNA 2RQVA 1SHGA 4K2RA 2CI8A 1OO4A 4LUDA 2DYBA 3VS7A 2ROTA 4OHIA 1UG1A 1BU1A 1O42A 2J06A 2CR4A 4F5BA 2D1XA 1GBRA 2EU0A 2KXCA 2G6FX 1A1BA 1M3CA 2EYZA 1T3LA 1O4OA 2EVRA 1K1ZA 2J6FA 2BZYA 1I1JA 1NLPC 1T3SA 1UGVA 2GQIA 4OMPA 1UDLA 4RTWA 1O4KA 1NG2A 3R6NA 3TSWA 4JZ3A 3EG1A 1SEMA 4DEXA 2J05A 3OB2B 1QWFA 2EBPA 1AZGB 3RNJA 2AOAA 2HDXA 3PE0A 1P13A 2EGAA 4KRTA 1YNZA 1NEBA 4M4ZA 5HKZA 4DGPA 1ZUKA 3H41A 4K44A 5GJIA 1AYDA 1S1NA 1O4QA 1MV0B 2KT8A 1TZEE 1PICA 1M27C 1CSKA 1NLOC 1UUEA 2DF6A 4AG1C 2SEMA 1VYUA 1GCQA 1UTIA 1TUDA 1FU6A 2RPNA 2MRKA 3H0FA 1A1CA 3PJPA 1AWJA 1T0JA 3UA7A 2ABLA 1XOVA 1UFFA 4J9CA 1O4IA 3GXWA 2LNHB 4CC4B 2RSYA 2KEAA 2H5KA 2GBQA 4J9FA 4OMOA 5HKYA 2LCTA 2Y1MA 1ARKA 1BKLA 2O88A 1X69A 3GXXA 2YUPA 4CC2A 1UJ0A 2KRMA 1PKTA 1GL5A 4D8DA 2FO0A 3US4A 5FW9A 4JE4A 4A63B 1IS0A 2EO6A 2KROA 2L2PA 4OHEA 2MIOA 4OHLA 1W1FA 1JQQA 2B86A 1B3QA 4D8KA 1JWOA 2C0TA 2JMCA 2DBMA 2L0AA 1KA7A 2DM1A 2DVJA 1CWDL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H1OA 1A81A 3KXTA 2RN8A 1O4JA 2CS7A 3CPFA 4C92F 1M90C 3RKWA 1WHGA 1O4DA 1C1AA 3VS4A 4NS5A 3QUIA 2AZVA 2JTFA 2QGGA 2WACA 2O9SA 4DBFA 3M0UA 3G71A 3NTIA 3CMAA 4E93A 5GANg 5DC9A 1WQWA 2LJ3A 3THKA 4EIHA 1YWOA 2AZSA 4LNPA 1IRXA 3EG3A 3CCQT 4PFZA 1YJNT 2CZ7B 3OW2P 5FU7B 1BF5A 4M75E 4RG8A 2LC4A 3JCMP 1VQ5Q 1PG5B 4L5GA 4L6V5 4WWQA 2PUKB 2L6KA 3QWYA 4HCCA 2MRJA 1D1BA 2MPXC 4ZN1A 3BUXB 1YJNQ 4ATOA 5I2SA 1XTDA 3M5AA 3PMIA 4IIOA 3VROA 5C6SA 2BBUA 2GTOA 2E70A 3CPWP 5CKBA 2RQWA 2PQWA 3ZBDA 4M78E 1TOVA 3RERA 2E4HA 2VIFA 4U17A 2HQXA 4M7AC 1BI1A 2DZCA 5IHIA 3CXCA 2M51A 1V76A 4K11A 2E41A 3LYIA 1QVPA 1U06A 1O4AA 3C95A 4HCZA 2HEQA 2GCXA 2M0YA 2A28A 2RMXA 2M9UA 2MC1A 3E2UA 4RTXA 3QXEB 2DXCA 2EFIA 2IUIA 2RMOA 5GMKj 5KH6A 2H3EB 1B7TA 4R56A 3HHTB 5GANd 1M30A 1KQSA 2M02A 2RI2A 3KUFA 1WZOA 3M0SA 3REAB 2FL7A 1GXIE 2K7AB 5KAZA 4JRQA 5GAMg 4X9DA 1NPRA 3EFOB 2CIAA 1M1KR 1NZVA 1K73R 5KE3A 3NHNA 1SG5A 1JYUA 4ROJA 5GAN4 2VWFA 5CQYA 3FEOA 2QA4Q 1LCKA 3G4SA 2DTIA 3M54A 5HY6A 3CBOA 4IIMA 1JRIA 3DLLA 2HMHA 3PNWC 2BUDA 2O9VA 3ZFJA 1TU0B 2GTJA 2R58A 1ACMB 4II1A 4LXCA 4PJJA 2K3BA 4M7AF 5GMKl 1WHJA 3PS5A 4F16A 1M2VA 2LP5A 2EKOA 2DL8A 4M77D 1JXOA 1M27A 4J5YA 4RCCA 2LJ1A 1FWZA 3DKMA 3OYCA 4XZ0A 5I6VA 3JB9H 4M7DG 3FIFA 2CP5A 1VIEA 1IB8A 1PM3A 1KJWA 1FMWA 4MZPA 2JT4A 1F2FA 5L23A 5LJ3f 3LGLA 1WDXA 2JXBA 1Y71A 1PD0A 4QVZA 4N4HA 2HDVA 1TSFA 4PJMA 3CCSA 5HKWA 2F5TX 4F59A 2RHUA 1T0HA 1YWPA 2CUDA 3VS5A 2RD1A 4DBQA 2F5KA 1CWEA 4C0ZA 1KC2A 1Z9QA 4R55A 2CZ1B 5KYNA 3CC4Q 1O44A 2X4JA 1RABB 4E7SA 4FBNA 2V8IA 3NTKA 5FLXE 1VQNT 1OPKA 2ED1A 1YVLA 4XTVA 3V7CA 5GAMd 4E7IA 2YLBA 1Q86R 2DXTA 2YSQA 1VQNQ 2DLZA 2AOBA 2AKKA 2RQRA 2CREA 3RIRA 3S9KA 4J9HA 1GCQC 3I56T 2DFUA 2LVMA 2WSFE 4RMOA 2COZA 2H8HA 4J9GA 3M4GA 2LMJA 1D1AA 1A1EA 3UWNA 3HPWA 2FB7A 1BHHA 1K8AR 1NM7A 2V8JA 2ZAEA 1OQKA 2QEXT 2PZ1A 5CKEA 3I56Q 5GAOm 4PL6A 4C0DB 2Y3AB 2OTLT 1H92A 4F17A 1PRLC 1TXQA 2E65A 4XU1A 3V8KA 5EELA 4DGXA 2DL5A 3CBLA 1M9SA 3R6OA 2ZPFB 1OZ3A 1BCOA 1VQLA 4NOYA 3VU3C 2PNAA 3HIZB 5KCOA 4OGEA 2V8KA 1AWWA 2D0NA 2HKNA 3JSCA 1QVFP 1SF9A 5FRNA 2CRHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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