1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
molecule tags Complex (kinase/peptide)
source organism Homo sapiens
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
2GNCA 2J6FA 2EKHA 3NHNA 1KJWA 2KT8A 1UGVA 2L4KA 2EYVA 1FBVA 2EGCA 1HCSB 2EGAA 3REAB 1TCEA 3IMDA 5L23A 4ORZA 3VRQA 2D0NA 2IUIA 2SEMA 1R1SA 3ZNIA 1JU5A 4WCIA 3R6NA 2DLYA 3GQIB 1A81A 1UJYA 2JS2A 1UDLA 1BKMA 2YUNA 3U23A 3MAZA 1EFNA 3THKA 4EIKA 1CJ1A 1FU5A 3VROA 3RNJA 1TUDA 3NMZC 3GXXA 1QG1E 2EVRA 1ZLMA 4RTTA 4F14A 4JJCA 1A1BA 2YT6A 2D8JA 1GL5A 3CXLA 1IS0A 2YU7A 2DLZA 1SPSA 2CSIA 1JYUA 2GGRA 1HSQA 1U06A 4A63B 1ZUKA 1XOVA 2FPEA 2L3PA 3H0IA 4OMQA 1KFZA 2HBWA 3PFVA 4L1BB 2O2OA 1BFJA 1O46A 2ETZA 3C7IA 3REBB 1T0JA 3BKBA 3EACA 2BTTA 3KFVA 1B47A 1O4QA 1GHUA 2CUDA 4X1VA 5J3XA 2QDLA 4OHDA 1AWJA 4RUGA 4ESRA 1BLJA 2I0NA 2AK5A 2CI8A 1O4PA 3PVLA 2HDXA 2SHPA 2J06A 3IN7A 1X6BA 2DL5A 4HVVA 1FBZA 3OB2B 1R1PA 1X6CA 4QT7A 2EYYA 2LP5A 2AKKA 2J7IA 4OMOA 3N8MA 2V1QA 4FL2A 1A1EA 3BUWB 4F5BA 1I0CA 2KE9A 2LZ6B 1UUSA 1KSWA 1PKSA 2DVJA 4EY0A 4GL9E 1CSYA 1CSZA 1X0NA 4GPLB 2W10A 2DX1A 1YCSB 3VRNA 2GBQA 4D8DA 4ROJA 4CC3A 2LNHB 2RN8A 2DF6A 2KGTA 4CC2A 3OVEA 4LN2A 4K11A 2RQRA 1HJDA 1LUKA 1GFCA 2VKNA 1IO6A 1O49A 2BBUA 2K9GA 1RUWA 2KXDA 1K0SA 3OV1A 1O4KA 2J6KA 5BO4A 1UECA 2FO0A 4U17A 1OPKA 3C0CA 4Z88A 4JJBA 2NWMA 1SHGA 1T3SA 2K79A 2LX7A 4X6SA 4XZ1A 1AWXA 2D1XA 1UTIA 1MV3A 5EEQA 1WA7A 2L6KA 3EG2A 1JWOA 1NLOC 1O4JA 1GCPA 4Z8AA 1AOJA 4FSSA 2FG0A 1WX6A 2DM1A 2YSXA 1WYXA 3KFJA 3M0QA 1NZVA 1M3BA 1FYRA 1H8KA 2L3TA 1PNJA 1ABQA 4OMMA 1Y57A 1T0HA 1BF5A 1CKAA 2MCNA 1VYTA 1D1ZA 3CWGA 5EHPA 2RQTA 2KEAA 3S8OA 1Z3KA 2ENMA 3CQTA 1JXMA 2XMFA 2HEQA 1VYVA 3GBQA 2DLPA 4J9EA 1QADA 2LNXA 4F16A 4JZ3A 1WQUA 4E68A 2DJQA 1S1NA 4J9HA 3H41A 1E6GA 2KT1A 1LKLA 2FEIA 1IJRA 1AOUF 1AZGB 1PWTA 4CC7A 5ECAA 2EPDA 2DBKA 1J3TA 2CR4A 1Z9QA 2EYWA 2CDTA 1AWOA 1CSKA 3M7FA 2JXBA 3VRRA 4HXJA 4FBNA 2EO6A 5IBMA 1NZLA 1MILA 4J9IA 5IBSA 2ECZA 2GE9A 2KXCA 3N7YA 2KROA 1D4TA 4TZIA 4HCKA 2VVKA 4M4ZA 1ZSGA 1OOTA 2BZ8A 2J05A 4EIHA 3I5SA 2PNIA 2P4RA 5IHIA 1MW4A 2DNUA 4JGHA 4NWGA 4DEXA 3EAZA 1JQQA 1PHTA 3PE0A 4P9VA 2LNWA 2GTOA 3VS0A 2F2XA 5IH2A 2PTKA 1BB9A 3BUNB 2MK2A 1O41A 2KRNA 1FU6A 1ZBJA 4F17A 2Y1MA 1M61A 1WI7A 4R0KA 1ZX6A 4IIMA 1YN8A 1MV0B 1QLYA 1YWOA 1I3ZA 2C0IA 4J9DA 1KA7A 2B3OA 3GXWA 2PZ1A 5I22A 3M0TA 1BM2A 2EKXA 2CH4A 5HKZA 4DEYA 3VS7A 2CREA 4RTWA 2M0YA 3CBLA 2RQUA 3WA4A 2ESWA 4GWFA 1LKKA 2SRCA 2GQIA 2DA9A 1WIEA 1O43A 1AWWA 1X43A 1LUMA 1K9AA 2RMXA 1T3LA 1Z9ZA 5GJVB 1WDXA 4Z89A 2FCIA 3MXYA 1K4US 4RTUA 4K2RA 2L3SA 1QKXA 2MC1A 2EO3A 2EGEA 1KIKA 2VWFA 2BZXA 2K3BA 4WWQA 4JZ4A 1A0NB 3I5RA 1UFFA 3UYOA 1UURA 3PVQA 1JYRA 1RLQC 2DYBA 1WXUA 3OP0A 1N5ZA 1LCJA 3US4A 2EW3A 2MRKA 1QKWA 2O9VA 4OHHA 3TL0A 2CT4A 1H92A 2FRWA 4J9BA 2KYMA 4LE9A 1AYDA 3HIZB 5DF6A 1KC2A 2GTJA 1Y1UA 2K7AA 2IUHA 2EBPA 2CBLA 3LH5A 2EL8A 1ARKA 3M0RA 2DL3A 1H3HA 1X69A 2DM0A 2DL8A 2G6FX 1X6GA 3QWXX 1O4FA 1YVHA 3FJ5A 2EQIA 4RTXA 3RBBB 3HCKA 4H34A 1A08A 1SSHA 4F59A 1D4WA 5EC7A 1O4RA 1AEYA 4OHIA 2Y3AB 2DL4A 2MOXA 1GRIA 1ZUUA 5HKWA 1CKBA 2AKLA 4HVUA 2RF0A 3VRPA 1O4IA 5FWCA 3VS2A 1FMKA 1KA6A 1OO3A 3M0SA 1O44A 2C0TA 4A4CA 1NYGA 4QSYA 2YUQA 5IHNA 1M8MA 4A4BA 2DMOA 4K45A 1O47A 2OI3A 1AYBA 1YVLA 4U1PA 1JEGA 4XZ0A 4DGXA 2AOAA 3NGPA 2A36A 3TSZA 2IZVA 1NYFA 1O4EA 1NM7A 5AULA 3UA7A 2KK6A 1ZFPE 1GBQA 1BMBA 2GSBA 1QWFA 4JJDA 3VS6A 2QMSA 2AOBA 5HKYA 5GJIA 4F5AA 1B07A 2H8HA 4OMPA 3VS1A 1RLPC 1LCKA 3EG0A 5I11A 2DILA 1JO8A 2ROTA 1O4MA 2DBMA 2JM8A 2AZVA 1OV3A 2YUPA 4HVWA 3T04A 3I35A 2MRJA 2O31A 1BHHA 5IXBA 2HDVA 2K7AB 3BUOB 2A37A 1TG0A 3HHMB 2ED1A 1JXOA 4DGPA 2ABLA 1NLPC 2HMHA 1LUIA 1WFWA 4AFSC 3PSJA 2KRSA 3TSWA 2CIAA 2AUGA 1BHFA 2L2PA 1SRLA 2LQNA 3SEMA 3VS5A 1TZEE 2OAWA 2HUWA 1CWEA 2A08A 5EG3B 2DCRA 2NUZA 4AG2C 2DRKA 1SHDA 4E6RA 1HD3A 2HCKA 2RNAA 1RJAA 1WLPB 1UG1A 4J9GA 1UHFA 1Y0MA 4OHEA 2RPNA 2K79B 1SRMA 2KBTA 1AZEA 1AD5A 1NRVA 1O4OA 1O48A 3PQZA 1BBZA 4AG1C 1WXTA 1HCTB 2J6OA 1W1FA 4ZNXA 2PLEA 1M27A 3M0UA 1PICA 2C0OA 2CH4W 2JTEA 3MXCA 1K76A 2PLDA 3N84A 1CWDL 5DC0B 3EG3A 1M27C 1MUZA 4RTVA 1M3CA 5FWBA 2EYXA 1BG1A 2JMAA 1NG2A 1O4GA 2K6DA 1BFIA 3M0PA 3VRYA 2O9SA 4NWFA 4GLMA 1TUCA 2JS0A 5DC9A 5AXIA 2A28A 3ZL7C 3O5ZA 2OJ2A 3A98A 2MQIA 1O4LA 1BU1A 3IQLA 2W0ZA 2VIFA 3H0FA 1O4CA 5GJHA 1BHHB 3IN8A 2BZYA 5FW9A 2V1RA 1JU5C 1G2BA 2LJ0A 1RI9A 2YUOA 3ULRB 2JYQA 4AFQC 1OPLA 2JT4A 1YWPA 1U5SA 4H1OA 2EOBA 2FPFA 1G83A 2CT3A 2KR3A 1X27A 2HSPA 3EHRA 1SPRA 1OO4A 4P9ZA 4KRTA 1OEBA 2OZOA 5CDWA 2DL7A 2M51A 3UATA 4D8KA 3CD3A 1A1AA 4RTYA 2F2WA 4J9FA 5EHRA 3H0HA 1NEGA 2JW4A 4CC4B 1SEMA 2D8HA 1O4BA 2RQWA 3PS5A 2HDAA 2DRMA 1O4AA 1RPYA 1BKLA 1SKJA 1FYNA 3VS4A 1A09A 3BUMB 1W70A 2YDLA 4RTZA 3QWYA 2XP1A 2CRHA 2C9WA 4OHLA 2ROLA 1UE9A 2F2VA 2RVFA 3VGOA 2RORA 2E5KA 2B86A 4IIOA 3PSKA 1XA6A 1O4HA 1BLKA 2ED0A 4LNPA 1RQQC 1R1QA 4J9CA 1V1CA 3JV3A 1O42A 2IUGA 1BK2A 1F2FA 2DE0X 2MIOA 1H9OA 1JYQA 1P13A 2CI9A 2JMCA 1O4DA 3S9KA 5HCKA 1O45A 2RSYA 1F1WA 3TKZA 2AZSA 1PKTA 5DC4A 1UUEA 1I1JA 1AYCA 2PNAA 1QCFA 1LUNA 4JEGA 2Y1NA 4JE4A 2X3WD 1FHSA 3EGUA 3UF4A 2L0AA 4OMNA 4AFUC 1GFDA 5I6VA 4E93A 1SHAA 3K2MA 4K44A 1UHCA 2LCTA 1X2QA 1K0XA 2KNOA 5D0JA 4FL3A 4Y92A 1AVZC 1QWEA 1GCQA 3S8NA 1E7OA 1YP5A 1M30A 4GBQA 1VYUA 3I9QA 2YSQA 3VS3A 5IXFA 3EHQA 2CS0A 2O88A 3BUXB 1GCQC 2EYZA 3NPFA 2H5KA 3PLFB 1AB2A 1SHBA 1B3QA 1A07A 1A1CA 3PJPA 2KRMA 1GBRA 1AOTF 1ABOA 1E6HA 2FPDA 3IMJA 4OMLA 1O4NA 2KYBA 5GJWB 1AYAA 3UA6A 2LJ1A 2LMJA 2CUBA 2EU0A 2JM9A 2PNBA 2ECDA 2KNBB 4LUDA 3TVTA 2L3QA 1M3AA 1ZUYA 1NEBA 1SPKA 1YNZA 2LJ3A 4JPBW 2K2MA 1PRMC 2LQWA 2FRYA 2IIMA 3OB1B 1X2KA 1PRLC 1I07A 1SHFA 1W6XA 2CSQA 1WXBA 3VRZA 1UJ0A 5KAZA 2H46E 2OQ1A 5EELA 2RQVA 1U3OA 4LUEA 1VA7A 2RMOA 3SHWA 2LCSA 2DX0A 2X3XD 3EG1A 4AFZC 3S8LA 5IHKA 1K1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V7SA 1WQWA 3NHNA 1QVGA 1UGVA 3G71T 4L5GA 3RKXA 4FSXA 2K5IA 1TCEA 4IUTA 3IMDA 3SD4A 3VRQA 2D0NA 1VQLQ 1VQMT 1R1SA 2DLYA 2C06A 2K2VA 4FL6A 1S72A 3TQ7P 1A1BA 1ZLMA 1IRXA 4JJCA 2YT6A 1D09B 1Q7YR 2YU7A 4M7DF 3HRSA 5GAMj 4NOYA 1KFZA 3EAEA 2OTLQ 2HBWA 4BE1A 2O2OA 1BFJA 2ETZA 3J81E 1BIAA 2BTTA 2RD1A 3KFVA 2CS7A 1B47A 1O4QA 4X1VA 1G3SA 3TEEA 2P84A 2NUTA 1AWJA 4RUGA 4OHDA 3GNGA 2DXBA 1O4PA 2HDXA 3A5ZB 1X6CA 3I55A 1YI2Q 3J80E 4EY0A 4GL9E 3VU3C 1CSYA 1BCMA 2X51A 1X0NA 2W10A 2DX1A 3VRNA 1TXQA 2DF6A 2KGTA 1Q81C 3JCMh 4BI3A 4C92E 2VKNA 1IO6A 2LVMA 3X25B 2KXDA 2P0PA 1O4KA 4DOWA 4LDUA 3G6EA 3L2RA 1OPKA 4HCBA 2RHIA 1T3SA 2K79A 3CPWS 4X6SA 1OZ3A 1WA7A 3EG2A 1JWOA 3CBPA 2I2LA 2QQBA 2D9TA 2YSXA 1ACMB 1H8KA 3R6OA 3RUXA 3OW2A 1PNJA 3JB9F 1VUBA 1M9SA 1Y57A 1T0HA 5KYUA 2YRVA 1ZSZC 4RG2A 2MCNA 2KY9A 5CKEA 5EHPA 2KEAA 5CKDA 1Z3KA 1M2VA 2HEQA 3CMAT 3GBQA 5KYNA 1D0XA 1X75C 1V29B 2JN0A 4J9EA 1QADA 4F16A 1WQUA 2DJQA 2KT1A 1LKLA 1AOUF 4CC7A 3CCVQ 2VV5A 4IURA 1J3TA 5CO7A 3OW2P 1VQKA 1Z9QA 5GANj 2CDTA 1YITT 3X26B 3M7FA 2XDPA 4HXJA 4FBNA 1NZLA 2A7YA 1IREB 1KK7A 1MILA 3N7YA 2KROA 3LW5E 4C92F 4TZIA 2VVKA 4Q5WA 3CC7A 2J05A 2CZ7B 4IUQA 2JTFA 5KYYB 4JGHA 4NWGA 2F69A 4DEXA 3EAZA 2MWPA 2EKOA 1PHTA 2VYTA 2IPOB 2GTOA 2LNWA 2KGYA 2ZZDA 1MMAA 2FZCB 1BB9A 3LWHA 2ZPGB 3BUNB 1WJSA 2KRNA 1FU6A 1TH7A 1ZBJA 2Y1MA 1M61A 1RADB 1YN8A 3UPUA 5CKHA 8AT1B 5LJ5e 2C0IA 1KA7A 3A1PA 3GXWA 3L42A 2EKXA 3CCUT 5FU7C 3VS7A 2CREA 2RQUA 2ESWA 1G3YA 2GQIA 2DA9A 5FRNA 1O43A 1AWWA 2RMXA 3WVDB 2DKGA 1YJWQ 1KIKA 2X4WA 2KVQG 3CCEQ 2ZPHB 4BD3A 2NUPB 3PVQA 2R5AA 4M77E 2DYBA 1N5ZA 2JNGA 1NJIR 3OB9A 1RAEB 2EW3A 3US4A 2ZAEA 3G71Q 1DJ7B 2EQMA 1PSEA 4LE9A 3HIZB 1KC2A 2IUHA 2K7AA 4XU0A 2EBPA 4N4HA 2EL8A 2DL3A 4B6MA 1VQMQ 1H3HA 1X69A 4ATOA 3QWXX 4HA8A 2EQIA 3ASKA 3V7CA 2CZ6B 4H34A 1SSHA 1YHQT 3A8OB 4IUUA 4OHIA 2DJZA 2CZ0B 2DL4A 2DFUA 3CCMT 2EAYA 1CKBA 2CZ1B 3JCMX 4HVUA 2RJFA 1EIFA 3NTHA 1OO3A 1XQHA 1VQNA 2C0TA 4J7FA 1D1AA 1Q86R 4M78F 3MCAB 4E7HA 3G4ST 3JCMc 1O47A 1AYBA 2PUKB 2F5TX 1VQ7A 2AOAA 2FL7A 2A36A 4XTVA 4MDXA 1NYFA 2M1HA 1NM7A 3LLRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2KR3 A;  1X27 A;  2HSP A;  3EHR A;  1SPR A;  1OO4 A;  4P9Z A;  4KRT A;  1OEB A;  2OZO A;  5CDW A;  2DL7 A;  2M51 A;  3UAT A;  4D8K A;  3CD3 A;  1A1A A;  4RTY A;  2F2W A;  4J9F A;  5EHR A;  3H0H A;  1NEG A;  2JW4 A;  4CC4 B;  1SEM A;  2D8H A;  1O4B A;  2RQW A;  3PS5 A;  2HDA A;  2DRM A;  1O4A A;  1RPY A;  1BKL A;  1SKJ A;  1FYN A;  3VS4 A;  1A09 A;  3BUM B;  1W70 A;  2YDL A;  4RTZ A;  3QWY A;  2XP1 A;  2CRH A;  2C9W A;  4OHL A;  2ROL A;  1UE9 A;  2F2V A;  2RVF A;  3VGO A;  2ROR A;  2E5K A;  2B86 A;  4IIO A;  3PSK A;  1XA6 A;  1O4H A;  1BLK A;  2ED0 A;  4LNP A;  1RQQ C;  1R1Q A;  4J9C A;  1V1C A;  3JV3 A;  1O42 A;  2IUG A;  1BK2 A;  1F2F A;  2DE0 X;  2MIO A;  1H9O A;  1JYQ A;  1P13 A;  2CI9 A;  2JMC A;  1O4D A;  3S9K A;  5HCK A;  1O45 A;  2RSY A;  1F1W A;  3TKZ A;  2AZS A;  1PKT A;  5DC4 A;  1UUE A;  1I1J A;  1AYC A;  2PNA A;  1QCF A;  1LUN A;  4JEG A;  2Y1N A;  4JE4 A;  2X3W D;  1FHS A;  3EGU A;  3UF4 A;  2L0A A;  4OMN A;  4AFU C;  1GFD A;  5I6V A;  4E93 A;  1SHA A;  3K2M A;  4K44 A;  1UHC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2GNC A;  2J6F A;  2EKH A;  3NHN A;  1KJW A;  2KT8 A;  1UGV A;  2L4K A;  2EYV A;  1FBV A;  2EGC A;  1HCS B;  2EGA A;  3REA B;  1TCE A;  3IMD A;  5L23 A;  4ORZ A;  3VRQ A;  2D0N A;  2IUI A;  2SEM A;  1R1S A;  3ZNI A;  1JU5 A;  4WCI A;  3R6N A;  2DLY A;  3GQI B;  1A81 A;  1UJY A;  2JS2 A;  1UDL A;  1BKM A;  2YUN A;  3U23 A;  3MAZ A;  1EFN A;  3THK A;  4EIK A;  1CJ1 A;  1FU5 A;  3VRO A;  3RNJ A;  1TUD A;  3NMZ C;  3GXX A;  1QG1 E;  2EVR A;  1ZLM A;  4RTT A;  4F14 A;  4JJC A;  1A1B A;  2YT6 A;  2D8J A;  1GL5 A;  3CXL A;  1IS0 A;  2YU7 A;  2DLZ A;  1SPS A;  2CSI A;  1JYU A;  2GGR A;  1HSQ A;  1U06 A;  4A63 B;  1ZUK A;  1XOV A;  2FPE A;  2L3P A;  3H0I A;  4OMQ A;  1KFZ A;  2HBW A;  3PFV A;  4L1B B;  2O2O A;  1BFJ A;  1O46 A;  2ETZ A;  3C7I A;  3REB B;  1T0J A;  3BKB A;  3EAC A;  2BTT A;  3KFV A;  1B47 A;  1O4Q A;  1GHU A;  2CUD A;  4X1V A;  5J3X A;  2QDL A;  4OHD A;  1AWJ A;  4RUG A;  4ESR A;  1BLJ A;  2I0N A;  2AK5 A;  2CI8 A;  1O4P A;  3PVL A;  2HDX A;  2SHP A;  2J06 A;  3IN7 A;  1X6B A;  2DL5 A; 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