1G83A

Crystal structure of fyn sh3-sh2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSERAAGLSSRLVVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of the Src homology 3-Src homology 2 interface in the regulation of Src kinases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE FYN
total genus 39
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2000-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1g83A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1g83A02
2CSQA 2EPDA 2DX0A 1KC2A 1OPLA 1M3AA 2KE9A 1PWTA 1FBVA 3IN7A 3N8MA 4JJCA 4TZIA 1T3LA 2L3TA 3VRPA 1PHTA 2VWFA 2C0TA 1W6XA 4OHEA 1W1FA 1BFJA 2JMAA 4IIMA 5IBMA 1AVZC 4JJDA 1BFIA 2BZYA 2PZ1A 1QG1E 1PRMC 2W10A 1FHSA 2QDLA 1NM7A 2JXBA 2YU7A 2BTTA 4GLMA 1ZUUA 3S8OA 1E6GA 1GFCA 1K1ZA 1IS0A 3NGPA 1O43A 2DCRA 2KT1A 4GL9E 4RTVA 1JQQA 1UTIA 1G83A 1YVHA 3CXLA 3PFVA 1MV0B 3I35A 2MCNA 2V1QA 4AFZC 2C0OA 1FU5A 2KGTA 2PLEA 2OZOA 2D1XA 2MIOA 2JYQA 1T0JA 2BBUA 3UA7A 1O4KA 3HIZB 1BHHA 3M0QA 3MXCA 1X6BA 2L3PA 4FBNA 3S8NA 1D4WA 2PNIA 2X3WD 1WI7A 1X6CA 2EYZA 1TUDA 4A4BA 4Z89A 1IJRA 3VS3A 1GBRA 1ZX6A 3UF4A 2AK5A 2DYBA 1A0NB 2GE9A 1ZUKA 5CDWA 3M0SA 1UDLA 3A98A 4RTZA 1LUMA 1AZEA 1E7OA 1LUNA 4JZ3A 3ZNIA 2GBQA 1JXMA 2P4RA 2IUIA 3I9QA 2CUBA 3H0IA 5IBSA 2RQWA 2YSXA 2LQWA 1O4GA 2SRCA 3CWGA 2EVRA 2H8HA 4ROJA 2EQIA 2ENMA 3VRYA 1GL5A 2B3OA 3S9KA 1O47A 2EBPA 1I1JA 1ABOA 1BM2A 4A63B 1X43A 2DL4A 1A09A 4QSYA 2D0NA 3H0FA 3QWXX 3VROA 2FO0A 1I07A 1UECA 1TCEA 2AOBA 4DGXA 2E5KA 5I6VA 3TVTA 1JU5A 4JZ4A 2DA9A 1GBQA 4P9ZA 1K76A 2HSPA 3VRZA 2HCKA 4IIOA 4OMNA 4EIKA 2EYYA 1K0SA 4J9GA 2JT4A 1QCFA 5IHIA 3UATA 2CR4A 2JMCA 2KNBB 5KAZA 1XOVA 1YWOA 2GTJA 2K3BA 2RQTA 1GCPA 5FWBA 1F2FA 1CKAA 3SEMA 2DL7A 1O48A 2DMOA 1SHAA 1O42A 3IN8A 5HKYA 2IZVA 1BLJA 1O4DA 1LKLA 3OVEA 2D8HA 1YNZA 2FPDA 4OHDA 2G6FX 4GPLB 1GCQC 3JV3A 1I3ZA 4NWFA 2EYWA 2SEMA 1VYUA 3EHRA 3TKZA 2FPEA 1JXOA 2OJ2A 3US4A 3REBB 1RQQC 1HSQA 1JWOA 3N84A 5AULA 2A08A 3PLFB 3SHWA 1MW4A 4J9EA 4K45A 1CJ1A 2PNAA 1NZLA 4GWFA 2PLDA 1AB2A 3MAZA 1X2QA 2MK2A 1NRVA 1H8KA 2O9VA 5ECAA 2KRNA 2KRSA 1RJAA 4K44A 2C0IA 1UE9A 1JYQA 1O4LA 3PJPA 3C7IA 1O45A 1O4JA 1G2BA 2LCSA 1SHBA 2OQ1A 2KK6A 1QKWA 4ZNXA 5IXFA 1WQUA 1B47A 1KA6A 4AFUC 1IO6A 3THKA 1UHFA 4LN2A 2RPNA 4HXJA 3EG1A 3NHNA 1E6HA 1AOUF 3PS5A 2L2PA 2DLYA 1NLOC 1SRMA 4CC3A 1AWWA 1LKKA 3CQTA 1BLKA 4LE9A 1AOTF 3VS1A 1I0CA 2YUQA 1MILA 2EU0A 2B86A 4OHLA 1O4QA 3UYOA 1PICA 2C9WA 2MRJA 1Z3KA 4HVUA 4AFSC 3EG2A 1YCSB 5EHRA 2RQUA 1CKBA 2LMJA 1AYDA 1WFWA 2L3QA 1O4BA 1UUEA 2O9SA 2GNCA 2DLPA 3NMZC 1M27C 2H5KA 2F2VA 2DF6A 1O4CA 3BUWB 4WWQA 1UHCA 2K79B 4RTXA 1BKLA 1ZSGA 5HKWA 2CIAA 1A1EA 2EW3A 3O5ZA 2IUGA 1R1QA 4Y92A 4EY0A 3VS7A 1OPKA 1CWDL 4OHHA 4HVVA 3LH5A 1K4US 4OMMA 1D1ZA 2RQVA 4KRTA 4OMPA 1O4MA 5HCKA 2Y1NA 4X6SA 4DGPA 1WLPB 4E68A 3N7YA 4GBQA 3R6NA 4H34A 2KYBA 5J3XA 1O4RA 2HMHA 3UA6A 2EOBA 3IQLA 1WYXA 1YN8A 2EGAA 1WXTA 1Y57A 4F59A 2HBWA 2AKLA 2HDXA 2JM9A 2CT3A 1OEBA 1YWPA 2OAWA 1CSKA 4XZ1A 3VRRA 3PVLA 2CI8A 1O4AA 2XMFA 3K2MA 1H3HA 3RBBB 2MRKA 2JS2A 1OOTA 2DL8A 2HDAA 2KXCA 2L0AA 2AZSA 3PVQA 3BUXB 4XZ0A 1HCTB 2F2XA 3KFVA 1M61A 2AZVA 1UJ0A 1X2KA 1D4TA 2ETZA 3TSWA 2FEIA 2DNUA 2GSBA 1N5ZA 2DRKA 1ABQA 2LNXA 1HD3A 2YUOA 2ED0A 4J9FA 5GJWB 2CH4A 2LCTA 3TL0A 1TUCA 5GJVB 2K7AB 1BHFA 1VYTA 2IUHA 4NWGA 1F1WA 2O31A 2MC1A 2M51A 1AYAA 5I22A 1NYGA 1YVLA 4K11A 4FL2A 2CSIA 2O88A 1U3OA 3GBQA 4Z8AA 1PKTA 2W0ZA 5IHNA 1WDXA 2DBKA 2KEAA 3I5SA 2KYMA 5DF6A 5BO4A 4JGHA 5HKZA 1O4PA 1R1PA 2RORA 4HCKA 3H41A 2HEQA 3ULRB 4AFQC 3HCKA 4LUDA 2LX7A 1SHGA 2J05A 2DRMA 2YUNA 3M0UA 1PRLC 1MV3A 3M0TA 1WX6A 4DEYA 1BK2A 4RTTA 3TSZA 4F16A 2GGRA 2LJ1A 1S1NA 3IMJA 2KROA 2DBMA 1ARKA 1KA7A 1FU6A 1SSHA 3QWYA 1M8MA 1AEYA 2KBTA 1GCQA 1K0XA 1H92A 4U17A 1NG2A 1AZGB 2RQRA 1X69A 3C0CA 1SPSA 1LCKA 1QLYA 2KRMA 2SHPA 3T04A 2DM1A 2CDTA 4L1BB 1HCSB 1JYRA 1AD5A 1O4IA 2FPFA 1BB9A 4FL3A 4OMLA 2A28A 3EACA 3PSJA 2PNBA 5GJHA 1UGVA 1GRIA 2DL5A 2JM8A 1O46A 1KFZA 4JJBA 4OHIA 1EFNA 5DC4A 2A36A 2K79A 3VRNA 1X27A 2GTOA 1OO4A 2FCIA 2JW4A 2ROTA 2K9GA 3OP0A 3PSKA 2J6KA 1FYRA 2LP5A 2EYXA 1A08A 3VS5A 1O4FA 1XA6A 1SHDA 2HUWA 4LUEA 1CWEA 2FRWA 2ECDA 5FW9A 1FBZA 4RTYA 5EHPA 2EO6A 1RLPC 3IMDA 1O49A 2RVFA 1O44A 2BZXA 1AWJA 5D0JA 1AWXA 4OMQA 4ESRA 2XP1A 3M7FA 4K2RA 1NZVA 1O4OA 2J06A 1NEBA 2PTKA 2J6FA 2JTEA 1UURA 1SRLA 1AOJA 1LUKA 2CREA 1BBZA 1MUZA 1UG1A 3EG3A 2RMXA 3VGOA 1SKJA 2ROLA 3EGUA 3U23A 4D8DA 1O4HA 5IHKA 3BUMB 1M27A 2YDLA 2AOAA 2LNHB 2VKNA 3OB2B 2ESWA 4H1OA 3BUNB 1K9AA 5EELA 4EIHA 1KIKA 2CUDA 1ZUYA 4A4CA 1M3CA 4Z88A 1SPKA 4FSSA 4AG2C 1BKMA 1BU1A 2EYVA 2LNWA 4U1PA 3CD3A 1NEGA 1BF5A 2VVKA 2K7AA 3MXYA 1QKXA 3H0HA 4ORZA 2MQIA 1RPYA 1X6GA 2KNOA 5I11A 2QMSA 3OV1A 2FRYA 2FG0A 3M0PA 5EG3B 1GFDA 3VS2A 2K6DA 3FJ5A 1A07A 2L4KA 1TG0A 1Y0MA 1Z9QA 2IIMA 1A1CA 2DLZA 1WIEA 2DVJA 2CH4W 1P13A 4J9BA 4J9IA 1VYVA 2DILA 1M30A 2I0NA 1R1SA 1WA7A 4D8KA 3RNJA 4F14A 2L6KA 2V1RA 1X0NA 2J6OA 2DM0A 2CT4A 1QWEA 3NPFA 1JO8A 1CSZA 4X1VA 1SPRA 4CC4B 3REAB 3EHQA 2YT6A 3BKBA 4JEGA 1RUWA 1UFFA 4F5BA 2KXDA 5AXIA 2DX1A 1O4NA 3PQZA 4J9CA 1LUIA 4J9HA 4HVWA 1JU5C 4JPBW 3VRQA 1BHHB 4CC7A 5IH2A 1U06A 2RN8A 2MOXA 1FYNA 1O41A 1UUSA 1JEGA 1T0HA 4AG1C 1NLPC 1OV3A 3VS0A 1O4EA 2OI3A 1OO3A 1B07A 2ECZA 2DE0X 1A81A 1VA7A 1Y1UA 1AWOA 1U5SA 2DJQA 5EC7A 4F17A 3EAZA 2CBLA 2VIFA 1RLQC 3S8LA 4OMOA 4JE4A 3VS4A 1ZLMA 1LCJA 2Y3AB 1KJWA 1QWFA 2LQNA 5DC9A 3OB1B 4CC2A 2LJ0A 1A1BA 2J7IA 3VS6A 1WXUA 1QADA 2LJ3A 2YSQA 3EG0A 1W70A 4RUGA 1YP5A 3M0RA 1AYBA 2EKXA 1B3QA 2NUZA 4WCIA 2AUGA 1Z9ZA 4LNPA 4DEXA 5DC0B 2DL3A 3I5RA 2LZ6B 4J9DA 1A1AA 4F5AA 4M4ZA 1HJDA 2L3SA 3PE0A 2M0YA 2A37A 4RTUA 1FMKA 3WA4A 1NYFA 4QT7A 4P9VA 3GQIB 2BZ8A 2K2MA 2X3XD 1ZBJA 2NWMA 2RNAA 3ZL7C 2Y1MA 1GHUA 3BUOB 2EO3A 1PNJA 1CSYA 1TZEE 2AKKA 1H9OA 3CBLA 2CI9A 2KR3A 1M3BA 2ABLA 1ZFPE 2CS0A 1RI9A 2EKHA 2EGEA 4R0KA 1V1CA 4E93A 1WXBA 5IXBA 1KSWA 3GXXA 2D8JA 1UJYA 2F2WA 2JS0A 2KT8A 1SEMA 5L23A 2RF0A 2ED1A 2H46E 2EL8A 1BMBA 2RMOA 1T3SA 5GJIA 1BG1A 2YUPA 5FWCA 5EEQA 2GQIA 2EGCA 2RSYA 3GXWA 3KFJA 2CRHA 1J3TA 1SHFA 2O2OA 4E6RA 2HDVA 3HHMB 4RTWA 1AYCA 1JYUA 1PKSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1R0CB 3CC2T 1BI2A 1RAHB 1TXQA 2PUOB 3N8MA 1PHTA 2NUPB 4XTYA 3JB9H 4M7DF 1YJ9A 3CCSQ 2JMAA 2K3YA 3QHSA 4M77E 4IIMA 1PRMC 4E7HA 3TQ7P 1NM7A 4C92F 2YU7A 2X4JA 5DY9A 4KT0E 1K1ZA 1IS0A 2KT1A 4RTVA 1JQQA 3CXLA 2FZCB 3PFVA 3I35A 1WZOA 1KQ2A 4QVZA 5AT1B 3UWNA 2KGTA 3CD6T 4QVDA 3JRZA 3UA7A 3S8NA 1BHHA 3M0QA 1G3YA 4C92A 2PNIA 1D0YA 3UT1A 1Q86U 3H6ZA 3OYJA 1X6CA 1TUDA 2R58A 7AT1B 2NLUA 2RA2A 4ZN3A 1GBRA 1KQSP 3OYCA 1QVFS 4RTZA 1Q81C 2OTLT 3ZNIA 4AMCA 3JCMh 3I9QA 1Q7YU 1VQPT 3H0IA 3CC2Q 5IBSA 2RQWA 1Q95G 3P8DA 1VQLT 2SRCA 2H8HA 3EFSA 3OYIA 1NE8A 2ENMA 3M4GA 1X43A 5C0MA 1A09A 4QSYA 3M58A 4C5GA 2AOBA 2DJZA 3TVTA 1WJRA 4JZ4A 1YJ9Q 4XTUA 2QEXA 1GBQA 4M75F 4PLIA 1K76A 4IIOA 4EIKA 2EYYA 4J9GA 1QCFA 5IHIA 2CR4A 2JMCA 5KAZA 1XOVA 3HTRA 4JS5A 1YWOA 2GTJA 1O48A 2DL7A 5J39A 3JCMP 1ZQ1A 2VYTA 4F7UG 1SHAA 3F70A 1X01A 2XDBA 2D8HA 1AT1B 5GAOr 4EMKB 4RG8A 4M75A 2XDPA 1LPLA 4GPLB 1I3ZA 1VYUA 3TKZA 2FVUA 3REBB 1HSQA 3N84A 3CCMA 3PLFB 4J6XA 4PJLA 5IN1A 2CGHA 4K45A 1WJQA 5A0GA 1VQLQ 1QVGA 2COWA 1NRVA 5ECAA 4GY5A 4K44A 1WHLA 2C0IA 1UE9A 1O4LA 1O45A 3JCMJ 9ATCB 1SHBA 1QKWA 3OW2A 2GQVA 4ZTJA 1Y7XA 1IO6A 2CZ1B 4HXJA 2FZKB 3NHNA 1E6HA 2E5QA 2L2PA 1SRMA 4CRIA 1AWWA 3QDFA 1RAIB 2EU0A 2MF2A 1BYMA 3QDRB 1BI3A 3PIPA 1QVPA 1KD1C 4NL2A 2RQUA 4PFPA 4KULA 2EJ9A 4JLGA 4CI0C 1ZSGA 3HHTB 3J81E 1VQ8A 3O5ZA 1R1QA 3VS7A 4F04B 4OHHA 4HVVA 5GAMd 4KRTA 2Y1NA 3CCMQ 4OB3B 1XNIA 5FRMA 2A0FB 4GBQA 1ZA1B 4M7DC 2DTIA 4H34A 2OAUA 4FIBA 3JCMV 1NJIU 2V8KA 4LXCA 2LRQA 1Y57A 2HBWA 1LNXA 2RHIA 1OEBA 2OAWA 5I21A 4HCZA 1FWZA 1M1KU 4XZ1A 3PVLA 4GLKA 2HL5C 4N0AA 3JB9G 1UEBA 3A5ZB 1OU9A 3CMET 3GNFB 2HDAA 1HCTB 2L0AA 3BUXB 2A3LA 3KFVA 4LDXA 5HKCA 1M61A 1X2KA 3C94A 2FEIA 2DNUA 5LJ3f 2LNXA 1ABQA 4J8OA 3M55A 1HD3A 1ZA2B 2CH4A 2D9TA 5D6WA 2K7AB 3LGFA 3RKWA 1W2BS 1BHFA 1VYTA 3QBYA 5LJ3j 1KK7A 4M7DB 1AYAA 3CMAT 5I22A 1NYGA 1RACB 1YVLA 2CSIA 4LDWA 4ZN1A 1BI1A 3C4SA 2WSFE 2W0ZA 4XU1A 5IHNA 2KEAA 3M56A 5DF6A 4C5HA 1VQ8Q 4PJOE 3G71T 4HCKA 4E7JA 3EFRA 1MMNA 2KK4A 5GAMh 1YI2T 1S72A 2C06A 2LX7A 4C8QF 3M0UA 5GAN4 4QVCA 1WX6A 4DEYA 3TSZA 5GAN2 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2L4K A;  1TG0 A;  1Y0M A;  1Z9Q A;  2IIM A;  1A1C A;  2DLZ A;  1WIE A;  2DVJ A;  2CH4 W;  1P13 A;  4J9B A;  4J9I A;  1VYV A;  2DIL A;  1M30 A;  2I0N A;  1R1S A;  1WA7 A;  4D8K A;  3RNJ A;  4F14 A;  2L6K A;  2V1R A;  1X0N A;  2J6O A;  2DM0 A;  2CT4 A;  1QWE A;  3NPF A;  1JO8 A;  1CSZ A;  4X1V A;  1SPR A;  4CC4 B;  3REA B;  3EHQ A;  2YT6 A;  3BKB A;  4JEG A;  1RUW A;  1UFF A;  4F5B A;  2KXD A;  5AXI A;  2DX1 A;  1O4N A;  3PQZ A;  4J9C A;  1LUI A;  4J9H A;  4HVW A;  1JU5 C;  4JPB W;  3VRQ A;  1BHH B;  4CC7 A;  5IH2 A;  1U06 A;  2RN8 A;  2MOX A;  1FYN A;  1O41 A;  1UUS A;  1JEG A;  1T0H A;  4AG1 C;  1NLP C;  1OV3 A;  3VS0 A;  1O4E A;  2OI3 A;  1OO3 A;  1B07 A;  2ECZ A;  2DE0 X;  1A81 A;  1VA7 A;  1Y1U A;  1AWO A;  1U5S A;  2DJQ A;  5EC7 A;  4F17 A;  3EAZ A;  2CBL A;  2VIF A;  1RLQ C;  3S8L A;  4OMO A;  4JE4 A;  3VS4 A;  1ZLM A;  1LCJ A;  2Y3A B;  1KJW A;  1QWF A;  2LQN A;  5DC9 A;  3OB1 B;  4CC2 A;  2LJ0 A;  1A1B A;  2J7I A;  3VS6 A;  1WXU A;  1QAD A;  2LJ3 A;  2YSQ A;  3EG0 A;  1W70 A;  4RUG A;  1YP5 A;  3M0R A;  1AYB A;  2EKX A;  1B3Q A;  2NUZ A;  4WCI A;  2AUG A;  1Z9Z A;  4LNP A;  4DEX A;  5DC0 B;  2DL3 A;  3I5R A;  2LZ6 B;  4J9D A;  1A1A A;  4F5A A;  4M4Z A;  1HJD A;  2L3S A;  3PE0 A;  2M0Y A;  2A37 A;  4RTU A;  1FMK A;  3WA4 A;  1NYF A;  4QT7 A;  4P9V A;  3GQI B;  2BZ8 A;  2K2M A;  2X3X D;  1ZBJ A;  2NWM A;  2RNA A;  3ZL7 C;  2Y1M A;  1GHU A;  3BUO B;  2EO3 A;  1PNJ A;  1CSY A;  1TZE E;  2AKK A;  1H9O A;  3CBL A;  2CI9 A;  2KR3 A;  1M3B A;  2ABL A;  1ZFP E;  2CS0 A;  1RI9 A;  2EKH A;  2EGE A;  4R0K A;  1V1C A;  4E93 A;  1WXB A;  5IXB A;  1KSW A;  3GXX A;  2D8J A;  1UJY A;  2F2W A;  2JS0 A;  2KT8 A;  1SEM A;  5L23 A;  2RF0 A;  2ED1 A;  2H46 E;  2EL8 A;  1BMB A;  2RMO A;  1T3S A;  5GJI A;  1BG1 A;  2YUP A;  5FWC A;  5EEQ A;  2GQI A;  2EGC A;  2RSY A;  3GXW A;  3KFJ A;  2CRH A;  1J3T A;  1SHF A;  2O2O A;  4E6R A;  2HDV A;  3HHM B;  4RTW A;  1AYC A;  1JYU A;  1PKS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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