1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
molecule tags Complex (kinase/peptide)
source organism Homo sapiens
molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
3R6NA 1BBZA 1OOTA 2KRSA 4F17A 5D0JA 5EHRA 1O46A 1LKLA 1HCSB 1B07A 4QSYA 5EEQA 1ZSGA 4RTTA 2L3QA 3BUWB 1TCEA 2DM0A 1UUSA 2DA9A 2J6FA 2GSBA 2VKNA 1H92A 2L3PA 5DC0B 1I07A 2KXCA 3EHQA 4XZ1A 1O43A 1FYRA 1QKWA 2K79B 2RQRA 2X3XD 2Y3AB 1NRVA 2GTOA 1YVLA 3GXWA 2GGRA 4AG1C 1LCKA 4TZIA 1Y0MA 1QKXA 4J9HA 2RQUA 2AUGA 3OB1B 1JU5C 2O9SA 2OI3A 3IQLA 2JYQA 4A4BA 3K2MA 3SEMA 1K0SA 3PE0A 2ECDA 2SHPA 2RQVA 4QT7A 2AKLA 1AZEA 4J9GA 2H5KA 3S9KA 4JZ4A 1B47A 1MILA 4DGPA 1O49A 3M7FA 1VA7A 4U17A 4ROJA 2O88A 4CC7A 2OZOA 1ZUYA 2OQ1A 2KNBB 2KGTA 2Y1MA 1W70A 1O4RA 2KYMA 4ESRA 2KXDA 1AYBA 4J9CA 2JTEA 1AB2A 2JS0A 1LUMA 2FO0A 3C7IA 2RMXA 3EG1A 2EBPA 2HBWA 3T04A 4GBQA 1TUDA 2P4RA 1UJ0A 2DJQA 2H8HA 2SEMA 4JPBW 4LNPA 5ECAA 1QCFA 4F14A 1O4LA 1U3OA 3MXCA 1AOJA 2OAWA 3NPFA 5FW9A 1O4DA 1BG1A 2MRJA 4JJDA 2L3TA 1W6XA 1FBZA 3EG0A 5GJWB 1CWDL 1G2BA 5HCKA 1A09A 1LCJA 1OPLA 4OMOA 1O41A 4JZ3A 1BKLA 2AOAA 2LP5A 1T0HA 1QWFA 2JM9A 5I22A 2CRHA 1KC2A 1TG0A 4AG2C 3RNJA 4XZ0A 2JMCA 3VRPA 1WQUA 2X3WD 1HCTB 1RUWA 4LN2A 3EACA 1OO4A 4JE4A 2XP1A 5FWCA 4D8KA 2KBTA 3NGPA 1B3QA 2ESWA 2JS2A 3VRZA 2MC1A 3VRYA 3CD3A 1AYDA 2HUWA 4DEYA 1N5ZA 2CSQA 2L4KA 2EVRA 2QMSA 4H34A 3BKBA 1UG1A 2CUDA 2L2PA 2XMFA 1KA6A 4JEGA 1M27C 4X1VA 1X6GA 3PFVA 1BFIA 4FL2A 4GWFA 1AD5A 3H0HA 1KFZA 1JYUA 1Y57A 1GCQA 3IN8A 5HKWA 3VRNA 1BB9A 1M30A 2KT8A 3BUNB 2YSQA 5GJHA 4RTVA 2CR4A 3ZNIA 4FSSA 4K2RA 2PNAA 1D4WA 1SEMA 2K7AB 3VS7A 1ABOA 4RTWA 4AFSC 3M0PA 2C9WA 2AOBA 2M0YA 3PLFB 2LJ1A 1OV3A 1M3CA 2FRWA 5EC7A 2DM1A 1AOUF 4OMQA 2EL8A 2ETZA 1BHFA 4Z89A 1O4FA 1CKAA 1RQQC 1JXMA 2LJ3A 2B86A 2CT4A 1FU6A 1GFCA 2LNWA 3PS5A 1Z9QA 2K2MA 2RNAA 1A08A 1AVZC 2LCTA 1O4NA 2RSYA 1R1SA 1HSQA 3VROA 3QWYA 4FL3A 3S8LA 1LUNA 1X6CA 2LX7A 4JJCA 1AWJA 3CQTA 2JT4A 1AYCA 1IO6A 2KK6A 4LUEA 4K45A 1BF5A 4U1PA 2PLDA 1GFDA 1O48A 2ECZA 1WI7A 1BK2A 2AZSA 1NG2A 2C0OA 3EG2A 2VVKA 1O4GA 2D8HA 3H0IA 3HIZB 2IUHA 1ZFPE 1ZLMA 4HVUA 5L23A 2IZVA 3TVTA 2PZ1A 2RMOA 1Z9ZA 4J9DA 4DGXA 2O2OA 2O9VA 1E6GA 5IBMA 2DVJA 3I35A 2DF6A 3ULRB 1VYTA 4WWQA 2BTTA 2IUIA 1ZUKA 1UDLA 1OO3A 2DLYA 4OHDA 3VS2A 1SPKA 2D1XA 4J9EA 4OMNA 4ORZA 1SKJA 2A08A 1QLYA 1X2QA 5KAZA 2GE9A 1K0XA 3VS3A 2EYYA 1O4EA 4WCIA 1X0NA 5IHNA 2ROLA 2EOBA 3ZL7C 1AYAA 2L0AA 2DBMA 2LJ0A 4AFUC 2DL7A 2CSIA 3JV3A 1AZGB 2PNBA 2EGEA 2M51A 1WXBA 2FPDA 2HDXA 1LKKA 4LE9A 4GL9E 1W1FA 1HD3A 1YN8A 1SSHA 3SHWA 1UUEA 1FYNA 1O47A 1XOVA 1YWPA 1PHTA 2DNUA 2A37A 2J05A 2RQWA 3GBQA 3M0QA 2MOXA 2GQIA 1SHBA 1MV0B 1SHDA 4E68A 3VRQA 4KRTA 1LUIA 2EGAA 1VYVA 4F5AA 1T3LA 1XA6A 2DL3A 1H3HA 3US4A 4CC3A 3IN7A 4CC4B 1AWOA 2MCNA 1JYRA 1WXUA 2K79A 1SHAA 2DX1A 3MAZA 1JO8A 3VS0A 4K11A 3OVEA 3REBB 2AK5A 2G6FX 4H1OA 2YUNA 3VGOA 2ENMA 1M3AA 3UA7A 2KNOA 2MK2A 1UHFA 1X2KA 2B3OA 4AFQC 2K9GA 2FG0A 2YUOA 3M0TA 2RF0A 1O4PA 3M0UA 2GNCA 4D8DA 2DCRA 2VIFA 4P9VA 4F16A 1UECA 2A36A 1OPKA 2RQTA 2CT3A 5AULA 4E93A 1QG1E 3PSJA 2D0NA 2LCSA 2DILA 1SRLA 2CUBA 2YUQA 4RTZA 3RBBB 2YUPA 2NUZA 2AKKA 2GTJA 1O4OA 1F1WA 1V1CA 4HXJA 4FBNA 4ZNXA 1A1AA 2ROTA 1A1BA 1U06A 1I3ZA 1MUZA 2RVFA 2EYZA 1PICA 2HMHA 1D1ZA 2PTKA 1IS0A 1UE9A 2EQIA 4Z8AA 2JW4A 1O45A 1PKTA 3EAZA 3U23A 4JGHA 1AWXA 4JJBA 1SHFA 1ZX6A 1NZVA 2KR3A 4F5BA 1WA7A 1PRLC 2SRCA 1J3TA 2CH4A 2EPDA 1AEYA 1O4CA 1GRIA 3OB2B 1UFFA 2LZ6B 1JU5A 5IH2A 1BHHA 1X69A 2K3BA 3CXLA 2DYBA 1P13A 2RPNA 4K44A 2FPFA 3C0CA 2GBQA 4A4CA 4LUDA 3NMZC 4AFZC 1MW4A 1O44A 2J6OA 2FPEA 3QWXX 1GL5A 4OMPA 2FCIA 4L1BB 1BFJA 2CREA 2EYWA 4NWFA 4IIMA 3KFJA 1YCSB 1SHGA 3BUMB 3OP0A 4IIOA 1K76A 1PKSA 1H9OA 1A1CA 2BBUA 1EFNA 3EG3A 2EKXA 1T3SA 1UGVA 2DLZA 1G83A 1PNJA 1ARKA 3FJ5A 2F2XA 1O4JA 3H0FA 3N84A 1WXTA 2YSXA 2PNIA 1WDXA 1X27A 2EKHA 2DMOA 5BO4A 2I0NA 4OHHA 1M3BA 1ZUUA 3PJPA 3I5SA 1TZEE 2H46E 1GCQC 1BMBA 3HCKA 4RTXA 1NZLA 2LQNA 1FU5A 5EHPA 2K6DA 2J7IA 4OHEA 3S8NA 2MIOA 2DE0X 2L3SA 2EW3A 3PVLA 1UJYA 1I1JA 4J9IA 4DEXA 3UA6A 1CJ1A 1SPSA 3MXYA 4GLMA 2BZYA 1R1PA 5J3XA 2O31A 1KIKA 1K1ZA 1E6HA 3H41A 4R0KA 2CIAA 1UURA 1M8MA 3KFVA 5HKYA 2MRKA 2Y1NA 1NLOC 2L6KA 5EELA 5CDWA 1QADA 2C0IA 2DRMA 2DBKA 1RLQC 2K7AA 1A81A 1JYQA 1PWTA 1O4KA 2JXBA 1O42A 1GBRA 5EG3B 2KYBA 2DLPA 3UATA 2KROA 1K4US 3TL0A 4HCKA 3TSZA 4RTYA 1D4TA 1SPRA 1ABQA 1X43A 1VYUA 2F2WA 5GJVB 2HDAA 4EY0A 2BZ8A 2JMAA 4Y92A 1O4QA 5IXFA 1RJAA 2AZVA 3PQZA 1BLKA 1MV3A 2EO6A 3UF4A 1M27A 1UHCA 2DL5A 3HHMB 4OMLA 3WA4A 1A07A 3EHRA 1E7OA 2E5KA 1M61A 3PSKA 2W0ZA 1KJWA 1SRMA 3VS1A 3PVQA 4Z88A 1KSWA 2EO3A 4J9BA 5GJIA 3VS6A 1Y1UA 3IMDA 1RPYA 1X6BA 2CBLA 2YT6A 5I11A 1I0CA 1BHHB 2LQWA 1NYFA 1YWOA 2HDVA 3O5ZA 1FHSA 3N7YA 2HSPA 2BZXA 3I9QA 4A63B 1HJDA 1R1QA 2V1RA 5IHIA 1NLPC 1NYGA 3M0SA 3M0RA 3OV1A 1CSZA 1U5SA 2RORA 1H8KA 1ZBJA 3IMJA 4EIHA 3VS5A 1JWOA 2V1QA 3CWGA 1RLPC 1WLPB 2CDTA 1YNZA 2F2VA 2ABLA 5IXBA 1YP5A 1O4MA 4F59A 1QWEA 3I5RA 1WYXA 2DL4A 3TKZA 2NWMA 1K9AA 1IJRA 2QDLA 2J06A 2W10A 2C0TA 1CSKA 1JEGA 2MQIA 1YVHA 4OHIA 1WIEA 3REAB 4E6RA 1CWEA 4RTUA 1BU1A 5DF6A 2EYVA 4OMMA 3S8OA 1O4IA 1O4BA 4CC2A 2RN8A 1BKMA 2PLEA 1BLJA 2KE9A 2DRKA 3UYOA 1CKBA 2IIMA 4OHLA 2CS0A 2YDLA 2IUGA 4GPLB 1A0NB 1T0JA 1AOTF 1S1NA 2YU7A 3CBLA 5I6VA 5DC9A 2EGCA 3A98A 3VS4A 1UTIA 5IBSA 1JXOA 2D8JA 1PRMC 5HKZA 4NWGA 3BUOB 4M4ZA 2HEQA 2HCKA 2J6KA 3LH5A 2FEIA 1WX6A 1O4AA 1Z3KA 2ED1A 1FMKA 1NEGA 3THKA 3BUXB 3N8MA 2LNXA 2VWFA 1A1EA 1OEBA 1NEBA 2LMJA 3TSWA 1AWWA 2DX0A 3GQIB 1GCPA 1CSYA 1O4HA 5IHKA 2LNHB 5DC4A 4HVVA 3GXXA 2EU0A 4J9FA 5FWBA 1JQQA 1FBVA 3NHNA 1GHUA 1BM2A 2EYXA 4EIKA 2CI9A 3EGUA 2A28A 4P9ZA 5AXIA 4X6SA 3VRRA 1WFWA 2CI8A 4HVWA 4RUGA 2FRYA 1NM7A 1RI9A 2KEAA 2OJ2A 1F2FA 1LUKA 2KRNA 1GBQA 2KT1A 2DL8A 2JM8A 1KA7A 2ED0A 2KRMA 2CH4W 1TUCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O5VA 5EHRA 1VQ5T 3CCEA 3LLRA 5EEQA 4LD6A 2ZPBB 2L3QA 1UUSA 4YTLA 2F69A 2EQKA 2HL5C 5GMKm 2QQRA 3QPHA 2GTOA 3A8LB 1UEBA 3GXWA 5IAYA 4JRKA 1K8AC 2C06A 1YJWA 2AUGA 3OB1B 1N8RU 1ZHIA 4ELZC 2HKNA 2O9SA 3K2TA 3SEMA 2SHPA 2AKLA 3RDVA 5KCOA 5GAMj 3S9KA 4M75C 3CD6T 2Y90A 1MMNA 1VA7A 2KK4A 1YHQT 2QEXT 1MHNA 3CCJQ 1YJ9Q 2FO0A 2GCXA 5CKBA 3C7IA 2EBPA 2HBWA 2K5IA 2LNVA 1UJ0A 2DJQA 1N8RR 3MXCA 1QCFA 1D09B 2OAWA 2VUBA 4DOWA 3CC2Q 1O4DA 1BG1A 4KT0E 4KUDK 1G2BA 5GMKj 1A09A 2NYSA 4XTWA 1KQ2A 4LXCA 5I22A 4XTYA 3FJPA 3A8MB 4DBRA 1VQ7Q 1WQUA 1WZOA 5FWCA 3HRTA 4PLLA 4D8KA 3NGPA 3KXTA 2MC1A 3JB9F 3CD3A 3CCJA 2JOYA 1YJ9A 4EMHA 2NUPA 1G3TA 2L4KA 2COZA 3OYEA 2K3XA 3BKBA 4C5IA 5KYXA 3M53A 2XDPA 3CC2A 2MF2A 1BFIA 4GWFA 2AIRB 2X51A 4KH1B 3SFMA 2RI5A 5A0DA 2GFAA 3QDRB 5HKWA 1BB9A 2YSQA 4RTVA 2CR4A 3ZNIA 4M78D 1NJIC 4K2RA 1D4WA 3SB2A 2K7AB 5CIUA 2XHCA 2QQSA 1TTHB 2AOBA 1VQ7A 1DJ7B 3PLFB 1M3CA 2FZKB 2EL8A 1VQKQ 2DJZA 1JXMA 2CT4A 5D6WA 2XK0A 3OW2S 5KYYA 3CCUA 1A08A 3LGLA 5GAOm 4RKUE 4HCZA 5D6YA 1HSQA 5DLOA 2LX7A 2KK6A 1IO6A 1OYXA 2X4WA 1X75C 2P0PA 1BF5A 4U1PA 2PLDA 5KYWA 4PJOB 1O48A 2OAUA 1NG2A 2M1HA 3HIZB 3JCMW 1ZFPE 3OW2P 2IZVA 3TVTA 1R8OB 4BD3A 4DGXA 4ZGEB 1VQPT 1VQKA 1QVPA 2DVJA 5LJ5h 2CGHA 1WHKA 1JJ2S 4WWQA 2DIQA 2O4XA 2IUIA 4C8QD 3MEWA 1OO3A 2DZ9A 4RCBA 1M1KC 2DLYA 3CEYA 2D1XA 3JB9H 1OZ3A 1HK9A 1RAHB 2EYYA 3VS3A 4WCIA 1X0NA 4M7DE 1RADB 2DBMA 3JRZA 3BFMA 3OS2A 2DL7A 1V29B 5C0MA 2CSIA 2PNBA 2EGEA 4FW2A 1N27A 2HDXA 2X4YA 4LE9A 1NZ9A 1JJ2P 2CP3A 2L8DA 1M9SA 4Y91A 4C0DB 2DNUA 2A37A 2RQWA 4R55A 1TSFA 4DOVA 2QTVA 1SHBA 3G7ZA 1MV0B 2XDBA 3PT9A 1ZSZB 1VYVA 5CO7A 1T3LA 1WJSA 2DL3A 3ASKA 1XTDA 3US4A 2A0FB 1PC0A 4CC3A 1W2BS 4QVZA 5FU6B 1JYRA 4M75E 3M5AA 4HKEA 1JO8A 2M02A 3REBB 2AK5A 2G6FX 4H1OA 1M3AA 3UA7A 2KNOA 1I5LA 2B3OA 4AFQC 3M0TA 1Q86R 3G4SQ 4F16A 1WJQA 2CT3A 3OA6A 4E93A 4OGCA 1SRLA 1WJRA 3GPLA 2NUZA 2GTJA 4M78A 3EFSA 4NL2A 1W2BP 2ROTA 1I3ZA 1U06A 2EYZA 2PTKA 2EQIA 4Z8AA 3FRNA 1PKTA 4M7DG 3U23A 1AWXA 5CQXA 4JJBA 1ZX6A 2K4YA 1WA7A 1PRLC 2DXUA 2EYQA 4FYYB 4FU6A 1KHCA 2LTOA 5IH2A 1X69A 4DBFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3R6N A;  1BBZ A;  1OOT A;  2KRS A;  4F17 A;  5D0J A;  5EHR A;  1O46 A;  1LKL A;  1HCS B;  1B07 A;  4QSY A;  5EEQ A;  1ZSG A;  4RTT A;  2L3Q A;  3BUW B;  1TCE A;  2DM0 A;  1UUS A;  2DA9 A;  2J6F A;  2GSB A;  2VKN A;  1H92 A;  2L3P A;  5DC0 B;  1I07 A;  2KXC A;  3EHQ A;  4XZ1 A;  1O43 A;  1FYR A;  1QKW A;  2K79 B;  2RQR A;  2X3X D;  2Y3A B;  1NRV A;  2GTO A;  1YVL A;  3GXW A;  2GGR A;  4AG1 C;  1LCK A;  4TZI A;  1Y0M A;  1QKX A;  4J9H A;  2RQU A;  2AUG A;  3OB1 B;  1JU5 C;  2O9S A;  2OI3 A;  3IQL A;  2JYQ A;  4A4B A;  3K2M A;  3SEM A;  1K0S A;  3PE0 A;  2ECD A;  2SHP A;  2RQV A;  4QT7 A;  2AKL A;  1AZE A;  4J9G A;  2H5K A;  3S9K A;  4JZ4 A;  1B47 A;  1MIL A;  4DGP A;  1O49 A;  3M7F A;  1VA7 A;  4U17 A;  4ROJ A;  2O88 A;  4CC7 A;  2OZO A;  1ZUY A;  2OQ1 A;  2KNB B;  2KGT A;  2Y1M A;  1W70 A;  1O4R A;  2KYM A;  4ESR A;  2KXD A;  1AYB A;  4J9C A;  2JTE A;  1AB2 A;  2JS0 A;  1LUM A;  2FO0 A;  3C7I A;  2RMX A;  3EG1 A;  2EBP A;  2HBW A;  3T04 A;  4GBQ A;  1TUD A;  2P4R A;  1UJ0 A;  2DJQ A;  2H8H A; 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