2ABLA

Sh3-sh2 domain fragment of human bcr-abl tyrosine kinase
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
MGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Intramolecular interactions of the regulatory domains of the Bcr-Abl kinase reveal a novel control mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABL TYROSINE KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1996-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2ablA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2ablA02
1Y0MA 2EOBA 1S1NA 2KR3A 1WDXA 1VYUA 1ABOA 2RQRA 4CC4B 1ARKA 1PKTA 4J9CA 3KFJA 1O4HA 3TKZA 4OMPA 1FYRA 1O48A 2GE9A 4AFZC 1UDLA 3UA6A 2L3PA 2O88A 5I22A 3FJ5A 5EHPA 2MC1A 2I0NA 2DLPA 1NM7A 2DNUA 3EG1A 2EYZA 1PHTA 3VROA 3EG0A 2HDXA 2DL3A 2DL7A 3CD3A 3MAZA 3T04A 4ESRA 2BZXA 3H41A 2KNBB 1IO6A 3PVLA 2JS0A 2K6DA 1Z9ZA 4JJDA 1O44A 2C9WA 2LJ1A 3VS3A 2YSXA 5D0JA 3WA4A 3GXWA 1FBZA 1I1JA 2KXDA 1NZLA 2LCTA 1NYFA 2K7AA 4X1VA 4A4CA 1SSHA 3EGUA 4P9ZA 2BZ8A 1HCTB 2AOAA 4H34A 2OQ1A 4JPBW 5DC9A 5J3XA 4JJBA 2DA9A 4FSSA 1H9OA 1O47A 2CSIA 3BUMB 1JU5C 4FL3A 4JE4A 1LUMA 3PQZA 5EEQA 2CT3A 2JXBA 4RTYA 2LZ6B 2PTKA 2ROLA 5I11A 2MOXA 3TSZA 1BBZA 2D8HA 4DGXA 2CIAA 2RQTA 1M61A 4A4BA 2EGEA 3THKA 1ZSGA 2RMOA 3VRQA 1ZUUA 2YUPA 3CQTA 5IXFA 1KA7A 1UHCA 4DEXA 2HEQA 4EIHA 1VA7A 2YUOA 2DL4A 1J3TA 1AYAA 2PNAA 3IN7A 4D8KA 4OMOA 2K79A 4R0KA 5IBMA 1ZBJA 2HSPA 1JWOA 3UA7A 4QT7A 5GJWB 2KBTA 4KRTA 1AZGB 1TG0A 2O9VA 2ED0A 1NEGA 1AEYA 1CSKA 1CSZA 1AYBA 1AD5A 3PS5A 4OHDA 1UURA 3PE0A 2DX0A 4JGHA 1NEBA 1B3QA 2VKNA 4OMQA 1UUEA 2KYBA 1HSQA 4OMNA 2L4KA 4WWQA 3RNJA 2JT4A 2XMFA 1UUSA 1A07A 5L23A 2EYXA 2J6KA 2DYBA 2CR4A 5IHNA 1AB2A 1JYUA 1UJ0A 2EYVA 2K7AB 2L3TA 2MIOA 2DRMA 2JM8A 1KC2A 3S8NA 1RI9A 2CREA 1NYGA 4F16A 2CSQA 1H92A 2BBUA 2J05A 2CT4A 4OMLA 1E7OA 2NUZA 2YUQA 3IQLA 1JYRA 2Y1MA 3M0RA 1LUIA 2EU0A 2KK6A 4L1BB 2J7IA 3VS7A 2CUDA 2GBQA 4OHLA 2VVKA 1RPYA 1AZEA 2DILA 1D4TA 1HCSB 2SRCA 2ECDA 2AKKA 1HD3A 4RTWA 1MW4A 3BUXB 3ULRB 4JZ4A 3TSWA 4D8DA 3PFVA 2YDLA 1I07A 1R1QA 1GL5A 1E6HA 2E5KA 3VS5A 1SRMA 1JXMA 1GBRA 2JTEA 2EYYA 3H0FA 1O4PA 1R1PA 2DE0X 1SHFA 3VRNA 1LCKA 1O49A 4Y92A 2EL8A 3LH5A 3GQIB 1HJDA 4GPLB 5IH2A 1LKKA 1I3ZA 1YVHA 1TZEE 2GSBA 2BZYA 3VRRA 1JU5A 1B07A 1U5SA 2H5KA 1ZLMA 2HCKA 1H3HA 4ZNXA 1AOUF 2O9SA 2SEMA 3HIZB 5EELA 1IJRA 2AKLA 2CI9A 2A37A 4J9EA 1RJAA 3VRPA 2DM0A 1KFZA 1O4EA 1UECA 2LNXA 4F14A 4OHIA 2QMSA 1MV0B 2AZVA 3A98A 1YWOA 2YU7A 2LX7A 2O2OA 4OHEA 4LE9A 5GJIA 2K9GA 2FG0A 2V1QA 5EHRA 2L6KA 2RNAA 5HKZA 3M7FA 1WXTA 1BKMA 1GHUA 1FMKA 1PWTA 5DC4A 3PSJA 3TL0A 2HDAA 5I6VA 1KJWA 5IXBA 1G2BA 2GTJA 2OI3A 3O5ZA 1PRLC 4GLMA 1AVZC 2DL5A 2D1XA 2O31A 5GJVB 3VS2A 3PSKA 2LQNA 2J6OA 1N5ZA 1R1SA 2J06A 2M51A 1GCQC 1O4BA 3N84A 4HVWA 5DF6A 2CH4W 3R6NA 2X3XD 1QWFA 2AK5A 1KA6A 1XA6A 2LP5A 3VS6A 1D1ZA 1O41A 3EAZA 1V1CA 2V1RA 4LN2A 4K44A 1MV3A 1CSYA 1SPKA 3M0SA 2RORA 2NWMA 4GWFA 1GBQA 4HCKA 2RMXA 2FEIA 1FU5A 3OB2B 2A08A 2ETZA 3PJPA 3BUWB 4WCIA 4GL9E 1NG2A 1OOTA 3EACA 3CWGA 1WQUA 2IIMA 1X27A 2GQIA 2OAWA 3PVQA 2CRHA 1A1EA 1X2KA 1SPSA 2RN8A 1OO3A 1PKSA 2DBMA 1AWWA 2KYMA 3UYOA 1WI7A 1O4LA 1AWXA 1WFWA 2ENMA 4X6SA 2FPFA 2F2XA 4IIMA 1X6BA 3N8MA 1VYVA 2KE9A 2IZVA 3K2MA 3QWYA 4XZ0A 2L0AA 3ZNIA 2KRNA 2EGAA 2M0YA 3RBBB 5AXIA 4J9FA 2K2MA 3I35A 1RQQC 2FPDA 3TVTA 4DGPA 2KNOA 2F2WA 1WIEA 2LQWA 2VWFA 1A0NB 2PNBA 1BFIA 4RTTA 2KGTA 4U17A 2KEAA 3H0HA 1GRIA 2JMCA 1O4AA 2YSQA 2IUIA 1A81A 2C0OA 3IMJA 1NRVA 1PNJA 1RUWA 1BK2A 2EKXA 1T3LA 4FL2A 1BM2A 1P13A 3BUNB 4TZIA 2C0TA 4ROJA 2FRWA 1JEGA 1WX6A 4AFUC 1D4WA 3C7IA 1FBVA 2P4RA 4J9GA 2RVFA 1BHHA 2JYQA 1PICA 4NWFA 1WLPB 1QADA 1B47A 1K9AA 4IIOA 4AG2C 2DBKA 3REAB 2H46E 4F59A 2D0NA 4E93A 5GJHA 2X3WD 3KFVA 2BTTA 1QWEA 1JO8A 3UATA 3I5SA 1Z3KA 4HVVA 4HVUA 2VIFA 2PNIA 2RF0A 2ED1A 2FRYA 1BU1A 3CXLA 1AWJA 1K76A 1YNZA 1AYCA 1UJYA 1W6XA 4Z88A 4Z89A 3GBQA 3NMZC 1M27C 5DC0B 3S8LA 2KRSA 5FW9A 2JMAA 1CJ1A 2DRKA 4NWGA 1G83A 1XOVA 1ZUYA 1O4KA 2OZOA 1QKXA 5HKYA 2YT6A 1K4US 3M0QA 1YWPA 1O46A 2HDVA 2XP1A 3EG2A 1Y57A 3VS4A 4DEYA 1QCFA 4RTVA 1JXOA 2C0IA 2A28A 4RTZA 2EO6A 5KAZA 4FBNA 1SEMA 2EQIA 1YN8A 1QG1E 1SRLA 1BB9A 2KT8A 1A09A 1NZVA 1Y1UA 2KXCA 5AULA 1BHFA 1MILA 3OVEA 4HXJA 2HUWA 4XZ1A 3US4A 2MRJA 1K0SA 1O4MA 1CWDL 1OPKA 4U1PA 4A63B 3NGPA 5FWBA 1T0HA 1SKJA 1GCPA 4K11A 2MQIA 1Z9QA 1A1AA 4QSYA 4F5BA 1EFNA 4LNPA 4K45A 2H8HA 3N7YA 1A1CA 2DM1A 1FU6A 1BHHB 1M3AA 1U3OA 1UFFA 1BFJA 1W1FA 4AFSC 2QDLA 1SHGA 2DF6A 1T0JA 4JZ3A 1YVLA 2IUGA 2FO0A 3NPFA 2DMOA 1A1BA 1RLQC 3C0CA 5EC7A 4CC3A 2PLDA 5IHKA 3MXCA 3REBB 2LJ3A 1NLPC 2EYWA 1A08A 4CC2A 1O4NA 1BLKA 1O45A 1ABQA 1X2QA 4Z8AA 1O4QA 4AFQC 3U23A 1W70A 3M0PA 2MCNA 3S9KA 1RLPC 5IHIA 1UE9A 2ABLA 1YCSB 1TUDA 2EPDA 1KSWA 1KIKA 1JQQA 3H0IA 2IUHA 1UGVA 1UG1A 1WXBA 1F2FA 1K0XA 2L3SA 1PRMC 1BKLA 3IMDA 4J9BA 1NLOC 1X6GA 4J9HA 1YP5A 1O42A 1X6CA 4OHHA 3M0UA 1GFCA 1QLYA 2AZSA 2LJ0A 4GBQA 1O4OA 2DL8A 1TUCA 3I5RA 1F1WA 1M27A 2GNCA 3VS1A 2LNHB 1BLJA 1VYTA 1LUKA 2J6FA 2JS2A 3OB1B 2RPNA 1OO4A 1O4IA 1TCEA 4JJCA 3S8OA 2B86A 2CBLA 2CS0A 1AYDA 1AWOA 3SHWA 1O4RA 2DJQA 3EHRA 2ESWA 1SHAA 5IBSA 3SEMA 1E6GA 3JV3A 2DLZA 3CBLA 3I9QA 3VRZA 1U06A 2CDTA 2KROA 1M3CA 4OMMA 4M4ZA 4RUGA 2EBPA 3VRYA 5BO4A 2EO3A 4E68A 3QWXX 2Y3AB 1FYNA 1I0CA 2DLYA 3OP0A 2RQVA 3VS0A 3EHQA 4LUEA 4E6RA 3HHMB 2AUGA 2YUNA 2F2VA 2DVJA 1O4DA 4EIKA 2PLEA 2AOBA 2A36A 2DX1A 3BKBA 1O4CA 3HCKA 1WYXA 1ZX6A 2MK2A 1OPLA 3NHNA 2LCSA 3BUOB 1X69A 2ROTA 1JYQA 1SPRA 1SHBA 1O4JA 1T3SA 1SHDA 2W10A 2L2PA 4J9DA 1M8MA 1CKBA 1CKAA 3GXXA 5FWCA 2JW4A 1CWEA 2EW3A 1MUZA 1UTIA 2CUBA 2FPEA 1ZUKA 2B3OA 1GCQA 4F5AA 3ZL7C 1IS0A 3M0TA 4EY0A 2GTOA 3PLFB 4RTXA 1M3BA 1O4GA 1OEBA 4RTUA 2L3QA 1WA7A 2SHPA 2GGRA 1BF5A 2CI8A 4ORZA 2HMHA 2HBWA 5EG3B 2D8JA 3IN8A 3EG3A 2KRMA 1GFDA 2EGCA 2ECZA 1FHSA 2RQUA 5ECAA 2PZ1A 4J9IA 1QKWA 2LMJA 2RSYA 3UF4A 1OV3A 5HCKA 1AOTF 2LNWA 1X43A 4LUDA 3VGOA 1LCJA 2OJ2A 2W0ZA 2G6FX 5HKWA 1LKLA 1ZFPE 1H8KA 2JM9A 1M30A 1LUNA 1WXUA 4F17A 1X0NA 2MRKA 4K2RA 1BG1A 1UHFA 2RQWA 1AOJA 2KT1A 4JEGA 1O43A 2DCRA 4CC7A 5CDWA 1BMBA 3OV1A 4P9VA 1O4FA 2K3BA 3MXYA 2Y1NA 4H1OA 2CH4A 2FCIA 1K1ZA 2EKHA 4AG1C 2K79B 2EVRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PJOE 1S1NA 3MP8A 3OMGA 1K9MU 2RQRA 2ZPFB 1VQNT 1PKTA 3RUXA 1O4HA 3TKZA 3RIRA 3CCJA 4OMPA 3I55A 1FYRA 2R57A 2GE9A 5KYWA 4M7AC 3AT1B 4AFZC 1UDLA 2VGMA 3G6ET 2COYA 2I0NA 2DNUA 1OZ3A 1WPYA 4FIBA 2ZCFB 1Q82C 1R8OB 3T04A 3HTRA 4QQ6A 1QW1A 1YITT 4CRIA 2C9WA 1M90C 2VYTA 2YSXA 3WA4A 1HK9A 3C12A 2YLBA 2LCTA 1NYFA 3EGUA 2BZ8A 2OQ1A 3M58A 2X4XA 2QA4T 1VQ7Q 2DA9A 1O47A 2LTOA 2CT3A 5I11A 2K5LA 2MOXA 4J6YA 4M78A 1VQMQ 2MMPA 4M75D 2EJFA 4KH1B 1ZSGA 3VRQA 5L8RE 2YUPA 4C0DB 1UHCA 4DEXA 4F7UF 3IN7A 3DB4A 2BKDN 3X28B 1N6AA 5GJWB 2PVGB 4HCCA 3CC4A 1SF9A 1VQKT 2K3XA 3V7SA 2F69A 3OYKA 4GLKA 4RG2A 1Q81U 1AYBA 2CS7A 2E5QA 2XDBA 1WHMA 3PS5A 4VUBA 1UURA 2COWA 2DX0A 4FYYB 2FZKB 2ATCB 3FIFA 4J8OA 4OMNA 2L4KA 3RNJA 3OS2A 1WJSA 2XMFA 1JJ2A 1NBEB 3A1PA 2J6KA 2CR4A 1JYUA 2GFUA 2HZYA 3M59A 1KC2A 3L42A 1RI9A 2CREA 3CCLT 2J05A 2NUZA 1JYRA 2Y1MA 2KK6A 3CBPA 2ECDA 4C8QE 1FWZA 3TSWA 1JBMA 2QGFB 2YDLA 3PFVA 4OB3B 2E12A 1R1QA 2P0PA 4PJMA 1GBRA 4MZTA 1TU0B 2HD0A 8AT1B 1R1PA 3KBGA 3VRNA 1O49A 3LH5A 5D6YA 1HJDA 4ELYC 5IH2A 2E10A 1TS9A 4IUPA 1B07A 1SSFA 2H5KA 1VQLT 3PT9A 2HAXA 2XIDA 1I8FA 2WACA 3LGLA 2A37A 3LYIA 4B6MA 4J9EA 2P4TA 3VRPA 2RA2A 4F14A 3A98A 2AZVA 1YWOA 4M7AG 3QSUA 4OHEA 2K9GA 5GMKl 3GP8A 2L6KA 2RNAA 1WXTA 4DBQA 1GHUA 3CCRT 3O5ZA 3PSKA 1WZOA 2DL5A 2CZ0B 1D1AA 3CXCP 1N5ZA 2QQBA 1M2VA 3N84A 2CH4W 1YCYA 1KA6A 2LP5A 3BDUA 1BIAA 4LN2A 4K44A 5LJ3g 1MV3A 1VQ7A 4ZTFA 3E9GA 2NWMA 3GNFB 1GBQA 2FEIA 1XQHA 2A08A 4GL9E 3VV0A 4EDUA 1YI2T 3EACA 1UEBA 1X27A 2GQIA 2EWNA 3BFMA 1K9MR 2KYMA 2VUBA 4M7DC 3MHXA 1AWXA 2ENMA 1M1KU 4X6SA 2FPFA 1VQ8T 1K73U 2KE9A 3K2MA 1VQNQ 4MDXA 3OQ5A 2L0AA 2MAMA 2EGAA 3G71T 5AXIA 1OZ2A 3G1JA 2QGGA 3A5ZB 3G6EQ 2QXFA 4OB0B 1G3SA 4E7ZA 1OX8A 2PUKB 2PNBA 1BFIA 4RTTA 2KGTA 1O4AA 2DTOA 1GRIA 2CP6A 2IUIA 2C0OA 4ZGEB 1BK2A 1O75A 1QVFP 3VUBA 1YITQ 1OX9A 4ROJA 5LJ5h 2FRWA 1JEGA 3FEOA 4M77B 3C7IA 3RESA 2P4RA 1U1SA 4J9GA 2JYQA 3BW1A 3MO8A 1PICA 2HL3A 1B47A 4C92C 2DBKA 2H46E 4XAXB 4F59A 1V76A 1PG5B 3URGA 2QK0A 4HVVA 3JCMV 2VIFA 2RF0A 3QDRB 2Y4YA 1AWJA 4LDXA 1YNZA 3JB9F 1UJYA 4Z89A 1DJ7B 1M27C 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3IMD A;  4J9B A;  1NLO C;  1X6G A;  4J9H A;  1YP5 A;  1O42 A;  1X6C A;  4OHH A;  3M0U A;  1GFC A;  1QLY A;  2AZS A;  2LJ0 A;  4GBQ A;  1O4O A;  2DL8 A;  1TUC A;  3I5R A;  1F1W A;  1M27 A;  2GNC A;  3VS1 A;  2LNH B;  1BLJ A;  1VYT A;  1LUK A;  2J6F A;  2JS2 A;  3OB1 B;  2RPN A;  1OO4 A;  1O4I A;  1TCE A;  4JJC A;  3S8O A;  2B86 A;  2CBL A;  2CS0 A;  1AYD A;  1AWO A;  3SHW A;  1O4R A;  2DJQ A;  3EHR A;  2ESW A;  1SHA A;  5IBS A;  3SEM A;  1E6G A;  3JV3 A;  2DLZ A;  3CBL A;  3I9Q A;  3VRZ A;  1U06 A;  2CDT A;  2KRO A;  1M3C A;  4OMM A;  4M4Z A;  4RUG A;  2EBP A;  3VRY A;  5BO4 A;  2EO3 A;  4E68 A;  3QWX X;  2Y3A B;  1FYN A;  1I0C A;  2DLY A;  3OP0 A;  2RQV A;  3VS0 A;  3EHQ A;  4LUE A;  4E6R A;  3HHM B;  2AUG A;  2YUN A;  2F2V A;  2DVJ A;  1O4D A;  4EIK A;  2PLE A;  2AOB A;  2A36 A;  2DX1 A;  3BKB A;  1O4C A;  3HCK A;  1WYX A;  1ZX6 A;  2MK2 A;  1OPL A;  3NHN A;  2LCS A;  3BUO B;  1X69 A;  2ROT A;  1JYQ A;  1SPR A;  1SHB A;  1O4J A;  1T3S A;  1SHD A;  2W10 A;  2L2P A;  4J9D A;  1M8M A;  1CKB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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