2ABLA

Sh3-sh2 domain fragment of human bcr-abl tyrosine kinase
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
MGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Intramolecular interactions of the regulatory domains of the Bcr-Abl kinase reveal a novel control mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords ABL TYROSINE KINASE
total genus 37
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1996-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2ablA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2ablA02
1M30A 1D4WA 3T04A 3VS5A 1HCTB 2VIFA 1I0CA 3R6NA 4RUGA 5AXIA 3QWYA 1O43A 1R1SA 2NUZA 1CKAA 1NLOC 1CKBA 2YDLA 5FWCA 2LNWA 4EIHA 1NZVA 2L2PA 1JYRA 3REAB 3UA6A 1ABOA 3M0QA 5GJVB 2C9WA 1LCKA 4NWGA 4JPBW 4J9HA 3IN8A 2EPDA 1VYTA 2K9GA 3EACA 1PICA 1NYGA 1UJ0A 1YWPA 3PSJA 5IXBA 1X6BA 1FYNA 1ZUYA 2O2OA 1O4BA 1I3ZA 1HJDA 2MK2A 2DVJA 1SHAA 3M0SA 1BHHB 2EYZA 2ROTA 2MRKA 3PS5A 5I6VA 3N8MA 4QT7A 5AULA 2YUNA 4GPLB 2DL8A 1WFWA 3VRZA 2VVKA 4K44A 2L4KA 2HDAA 1FHSA 3KFVA 2DMOA 3NPFA 4F16A 1M8MA 2FPDA 2RPNA 4J9GA 4CC4B 2A08A 1RI9A 1YN8A 4U17A 4X1VA 1WI7A 1QWEA 4OHHA 4E68A 2L6KA 2AKKA 2ROLA 2RMXA 4LNPA 1UURA 1AZEA 1BHHA 2HUWA 4OHDA 3PJPA 1O4MA 2EO3A 2HDXA 1V1CA 2CT3A 2YUOA 1WA7A 1A08A 3GXXA 4K45A 5J3XA 3H41A 1QKWA 5DF6A 3I5RA 3GBQA 1AEYA 2EYVA 5HKWA 2CSIA 3VS4A 3BKBA 1BMBA 2KNBB 2ECZA 4AFQC 1B07A 3OB1B 2A37A 2DCRA 2FO0A 4OMNA 3CQTA 5IHKA 1AWOA 1D1ZA 3VRYA 1ZUKA 1AWWA 2EKHA 3IMJA 4XZ1A 2KT8A 2KGTA 4ZNXA 4ORZA 2EO6A 2KBTA 1O49A 3MAZA 2CSQA 4U1PA 1AVZC 1KJWA 1QLYA 1M3CA 2JYQA 2IUGA 2HEQA 3VS3A 1SHBA 2ESWA 4J9BA 2AUGA 2YU7A 4F17A 4FSSA 4AG1C 3TKZA 2KE9A 1D4TA 3ULRB 3PVQA 4OMOA 1UTIA 2M51A 2FPFA 3OVEA 2DX0A 1QKXA 1X2KA 3I35A 4F5BA 2YSQA 4OMLA 2RMOA 2RORA 2YSXA 2IUHA 2BZ8A 2CRHA 2D8HA 2EGEA 5HKZA 2EYWA 1TCEA 1OEBA 4E93A 1O4CA 4GWFA 1BLJA 3EG3A 1O4EA 1O4QA 2KRMA 2LQNA 2J6OA 2D1XA 1FBVA 4JEGA 4OHEA 2C0OA 2KYMA 1Z9ZA 2AZSA 4D8DA 1A07A 3PSKA 1GBRA 3IMDA 4L1BB 1T0HA 4J9EA 4F14A 2VKNA 2PNAA 4ROJA 5EHRA 3VRRA 1NLPC 1BB9A 3SHWA 4FL2A 2H5KA 2CI8A 1BK2A 2GTJA 3CD3A 2LX7A 1WXUA 3KFJA 3VRQA 4K11A 4RTTA 3CWGA 2DE0X 4J9DA 3C0CA 1BBZA 3PQZA 1E7OA 4OHLA 2YT6A 1BKMA 2J05A 2JTEA 2AK5A 2DM1A 1JXOA 1JYQA 4HXJA 1ZFPE 1AOJA 2RVFA 2GSBA 5EEQA 4GBQA 1AYDA 2DBKA 3VRNA 1JO8A 1H8KA 2A36A 2PLDA 1TUDA 2DYBA 1FBZA 4LN2A 1M61A 4X6SA 2JM9A 2AOAA 4JJDA 4Z8AA 1Y57A 1U06A 1KC2A 3UYOA 3CXLA 2EU0A 1R1QA 1X0NA 1O4AA 2J06A 1RPYA 1PRLC 1F1WA 3BUXB 2EW3A 4RTXA 2RQUA 2EQIA 2H46E 1QCFA 3OB2B 1A81A 3QWXX 2KYBA 1A1BA 2KT1A 1VYVA 1UJYA 2CH4W 4FL3A 5EHPA 5DC0B 1YWOA 1T3LA 1NZLA 2KK6A 2EKXA 1R1PA 3VGOA 5FW9A 1PKSA 3EAZA 2B3OA 1B3QA 3H0FA 2K6DA 1WQUA 1RLQC 2EGAA 3ZL7C 2LJ3A 1ZLMA 4JJBA 5IBSA 4P9VA 1O44A 2CR4A 3HIZB 1T0JA 2RQWA 4RTZA 1Z9QA 4HVUA 1LKLA 1CSYA 1YVLA 3VS0A 1SPKA 2V1QA 2EL8A 1YCSB 2FPEA 2LCTA 1KSWA 3A98A 1NM7A 1O46A 1H9OA 3NHNA 2BZYA 1UDLA 1AYCA 1S1NA 2LNXA 1RJAA 1ZX6A 1J3TA 3BUOB 2L0AA 2DBMA 1YVHA 2SEMA 1U5SA 4AFUC 1KFZA 1AWXA 4A4BA 1X6CA 2RQVA 1HCSB 2LZ6B 3I9QA 1KA6A 1K0XA 2RQRA 2CH4A 2GQIA 2EGCA 2JXBA 2GE9A 2FRWA 1XOVA 2CT4A 4GLMA 1LUMA 4J9IA 1GL5A 3US4A 1O4HA 1SHGA 2FG0A 3N7YA 1RUWA 1WIEA 2V1RA 2X3XD 1O4GA 5BO4A 1NEGA 3UA7A 2GGRA 1CWEA 1XA6A 5HCKA 3BUWB 2W0ZA 1ZBJA 2DL3A 1WXTA 2A28A 2RQTA 3VS6A 4Z89A 1BG1A 2QDLA 1ARKA 1P13A 2MIOA 2O9SA 5IHIA 2J6FA 1O4FA 5DC9A 3GQIB 1SRMA 1AYAA 1AB2A 3PVLA 1X2QA 1GCPA 2K79B 2RSYA 4AFZC 2IIMA 3S8OA 1BHFA 4DEYA 1SPRA 1GBQA 3VROA 2DLZA 3RBBB 1G2BA 1BFJA 4HCKA 2QMSA 2LP5A 1WXBA 2LJ1A 2BZXA 2C0IA 3NMZC 1M3BA 4NWFA 4CC2A 2ENMA 1UUEA 2HSPA 3EG2A 4F59A 1UGVA 2ABLA 2BBUA 2DL7A 2XP1A 1B47A 2CI9A 5CDWA 2CBLA 1BKLA 2H8HA 2KEAA 2KRNA 1E6GA 2K79A 5IHNA 2L3TA 1BFIA 5EC7A 2L3PA 3EHQA 1Z3KA 2IZVA 2JS2A 1OV3A 2PNIA 1SPSA 4JZ4A 1BF5A 3GXWA 1UHCA 1UE9A 3M0PA 3TSWA 4ESRA 4WWQA 2RNAA 5IXFA 1K4US 1SSHA 4K2RA 3M0TA 3OP0A 1I1JA 3IQLA 4EY0A 2CIAA 3EHRA 1W1FA 4JJCA 5I22A 2RF0A 1O45A 2FRYA 2GNCA 2JMCA 1F2FA 1SEMA 1KA7A 1OO3A 5I11A 1I07A 1A0NB 1WYXA 5DC4A 2LCSA 1LUKA 4CC3A 1JEGA 2CUDA 2X3WD 1JWOA 2DLYA 2OZOA 1PHTA 2AKLA 4TZIA 1FYRA 2LJ0A 1CWDL 1K1ZA 1ZUUA 2ED0A 4DEXA 2MOXA 2K7AB 2CREA 2CS0A 1M3AA 3THKA 2L3QA 3TVTA 2Y1MA 3HHMB 2BTTA 3PLFB 5EELA 1NEBA 1QWFA 3JV3A 4R0KA 2FCIA 1O4OA 1EFNA 2KR3A 5ECAA 1LCJA 2F2WA 2K2MA 2SHPA 3MXCA 1TUCA 1WLPB 2EOBA 1FMKA 4RTYA 1A09A 2ECDA 1Y1UA 1SRLA 1X69A 2Y3AB 1HD3A 1A1CA 2L3SA 1A1AA 4Z88A 2D8JA 3EG0A 4OMMA 5GJWB 1H3HA 1SKJA 3RNJA 1NG2A 1AOTF 4H34A 1HSQA 2K7AA 1GFDA 1O4LA 1JU5A 4DGXA 2KXDA 1YNZA 4LUDA 2DRMA 3IN7A 3VS2A 2EVRA 2O31A 1AYBA 1W70A 2DJQA 4LE9A 3S8NA 2VWFA 2YUPA 3U23A 1O48A 1T3SA 2LQWA 3SEMA 2JW4A 2I0NA 1MV3A 1GCQA 2DL5A 2OI3A 2KXCA 2F2VA 4RTVA 1YP5A 2AZVA 4HVWA 1K76A 1N5ZA 1X6GA 2EYXA 1E6HA 4EIKA 3N84A 1O42A 5EG3B 1M27A 1PNJA 2O88A 1RQQC 2JS0A 4HVVA 4KRTA 4M4ZA 3M7FA 1BLKA 1O4DA 4OMQA 1FU6A 4AG2C 1LUNA 5IBMA 4AFSC 4QSYA 3H0IA 2GTOA 1IS0A 2MRJA 1WX6A 2EYYA 1OPLA 1UFFA 2LMJA 3H0HA 1LKKA 2ED1A 2M0YA 3I5SA 2E5KA 2ETZA 2W10A 3NGPA 4FBNA 1X27A 3VS7A 2F2XA 1K0SA 1PWTA 1H92A 1AD5A 1O41A 2Y1NA 2GBQA 4GL9E 1K9AA 2PNBA 1RLPC 3EGUA 3UATA 4J9FA 4A4CA 1QG1E 1CSKA 4XZ0A 3S8LA 1UECA 1LUIA 3TSZA 5D0JA 2LNHB 2HCKA 4OHIA 3MXYA 2MCNA 5GJHA 1JQQA 2DF6A 5L23A 4OMPA 1OO4A 2OQ1A 4DGPA 4JGHA 1VA7A 2O9VA 1OOTA 2DRKA 2DA9A 2JMAA 1CSZA 2OAWA 2FEIA 2OJ2A 1O4IA 1WDXA 2PTKA 1O4KA 1BM2A 2KROA 1QADA 3S9KA 2P4RA 2HMHA 4JE4A 1PKTA 1TG0A 1TZEE 3WA4A 2DLPA 1A1EA 2PLEA 2JT4A 1AOUF 4E6RA 1PRMC 2YUQA 4P9ZA 1KIKA 4IIOA 2NWMA 2DNUA 3BUMB 3M0UA 1MW4A 1SHFA 2DILA 2J7IA 4JZ3A 1IJRA 3REBB 4F5AA 2DL4A 1GRIA 2HBWA 3ZNIA 1JXMA 2CUBA 2D0NA 1ABQA 2MC1A 1O4RA 1VYUA 1UUSA 1X43A 3LH5A 4RTWA 1NYFA 2EBPA 3VS1A 4A63B 4WCIA 1NRVA 1MILA 2HDVA 2CDTA 3UF4A 1G83A 3FJ5A 1O4NA 2KRSA 2IUIA 1SHDA 1AWJA 1IO6A 1BU1A 3BUNB 1FU5A 2K3BA 5KAZA 1JU5C 2B86A 3EG1A 3OV1A 4LUEA 1O4JA 2J6KA 1AZGB 4Y92A 1MV0B 1GFCA 3HCKA 3VRPA 2KNOA 2SRCA 5FWBA 1CJ1A 4D8KA 1JYUA 3TL0A 5IH2A 1O4PA 2JM8A 2C0TA 2XMFA 2DX1A 4H1OA 1MUZA 1UG1A 2RN8A 1GCQC 1U3OA 3CBLA 3PFVA 5GJIA 1UHFA 1GHUA 2PZ1A 3M0RA 4IIMA 2AOBA 3K2MA 3PE0A 4RTUA 2MQIA 1O47A 3O5ZA 2G6FX 4CC7A 1OPKA 1Y0MA 5HKYA 3C7IA 1M27C 4J9CA 1W6XA 2DM0A 1ZSGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FDRA 1M30A 3T04A 3VS5A 1HCTB 2H3EB 4C92B 1Q86C 1OU8A 3V8LA 1O43A 1R1SA 2E6ZA 4EIHA 2LNWA 3EFRA 4ZGEB 2L2PA 3REAB 3LW5E 2EQUA 1KC8R 4J9HA 3IN8A 3TU4K 2K9GA 1VQ8T 3OYCA 2YLBA 1ZQ1A 3QUIA 3CCMA 2OTLQ 2X4XA 2E6NA 3RKYA 1SG5A 2QEXQ 1I3ZA 3DLMA 3M0SA 2EYZA 2ROTA 2YWWA 4J8OA 3AHUA 1IZ6A 2RK1A 4QT7A 3N8MA 4M78A 3H8ZA 3QG1A 1X75C 3VRZA 2XI9A 5CAIA 4K44A 1VQLT 2L4KA 3EG9B 1FHSA 2EQKA 5L8RE 3A5ZB 5GAMd 1M8MA 1YN8A 4U17A 2RM4A 4E68A 1QVGS 2CS7A 5GAOm 3CC2A 1UURA 4OHDA 1UGSB 4C5IA 5KCHA 4XQ3A 1O4MA 2K5IA 2EO3A 2HDXA 4C8QC 1V1CA 1K9MR 3HRSA 2DZ9A 1I5LA 1KC8C 2COWA 4LD6A 4E7IA 4M75A 2CZ7B 1B07A 3LYVA 1UB4A 2DCRA 3DKMA 3CQTA 8AT1B 4R56A 3CCET 2KGTA 2VGNA 1RAGB 2EAYA 4U1PA 4JRKA 3CD6Q 3JCMb 3K2TA 1M3CA 4M78G 2HEQA 5A0LA 1OYXA 2ESWA 3HRUA 4J9BA 2ATCB 2KE9A 1JJ2S 4M7AF 1VQ9T 2JN0A 1MNEA 2M51A 3CCRT 4GY5A 4F5BA 1YIJA 3G4SQ 3OW2A 4PJJA 1N8RR 1UGPB 1K9MC 2RORA 2YRCA 3CPWP 2EGEA 5HKZA 3VV0A 2EYWA 4FYXB 1BLJA 2K4YA 4C5GA 2KRMA 2LQNA 2D1XA 1FBVA 4JEGA 1PSFA 1Z9ZA 5KYUB 3IMDA 3FEOA 4J9EA 2VKNA 3VRRA 1BB9A 1JBMA 3CCSA 1XTDA 1WXUA 2P0PA 4B6MA 2VC8A 2QQ9A 2P0QA 1BBZA 4M7AG 1EZZB 2JTEA 2AK5A 2DM1A 2OAUA 1JYQA 1S72T 4QW2A 3X25B 2RVFA 1OQKA 1AYDA 2DBKA 3CC4A 2A36A 5HKCA 3PNWC 2DD5A 2DYBA 1M61A 4X6SA 1QMCA 3HL8A 3EFSA 1N8RC 4DOWA 4Z8AA 1OI1A 1WHKA 2XIDA 1KC2A 3ZFJA 2FYKA 2EU0A 1O4AA 1F1WA 3BUXB 1PCXA 2RQUA 2IVWA 4A4GA 2H46E 4C5HA 1A1BA 2KT1A 4F7UB 2VB6A 4N4IA 1VQKA 2EKXA 3JB9D 3EAZA 1B3QA 1WGSA 2HBPA 4HKEA 3JCMJ 2LJ3A 1ZLMA 4QVCA 4OMFB 4P9VA 1MGQA 1Q81R 3CMEQ 1T0JA 3HIZB 4RG2A 4J6YA 3JCMh 1DJ7B 1VQNA 2L89A 1O46A 4M7DB 1R0BG 1UDLA 1AYCA 3CXCP 1VQ7T 1J3TA 2KQWA 2L0AA 1YVHA 2QA4T 3S6WA 2LZ6B 1KA6A 1K0XA 1YI2A 2CH4A 3OYFA 3TREA 3US4A 1GL5A 1O4HA 1SHGA 2FG0A 3N7YA 2E12A 2D6FA 2X3XD 1O4GA 4C0GA 2M02A 2DXBA 3A8HB 3OYLA 2QDLA 1YJ9Q 1M2VA 2QI2A 5GANf 3CCJT 4M77C 1P13A 2DYIA 5LJ3j 3PVLA 4N0AA 1X2QA 1Q81C 1BI0A 2VV5A 3S8OA 2CP6A 1BHFA 4DEYA 3RBBB 3J7AF 1KD1R 1BFJA 4HCKA 2QMSA 2LJ1A 4M77D 2BZXA 4NWFA 1VQOT 2E70A 2HSPA 1OZ2A 2ABLA 2GFAA 3HPWA 5I2MA 4OB1B 2BE7D 2CBLA 2KEAA 3JB9I 1E6GA 1M9SA 1TTHB 2PQWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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