2ABLA

Sh3-sh2 domain fragment of human bcr-abl tyrosine kinase
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
MGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intramolecular interactions of the regulatory domains of the Bcr-Abl kinase reveal a novel control mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABL TYROSINE KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1996-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2ablA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2ablA02
2A08A 2PZ1A 2RMXA 1AYAA 2GBQA 2MK2A 1ZUYA 5FWCA 4JJDA 1S1NA 1D4TA 5EHPA 2K79A 1JU5C 1AZGB 4AFUC 5EELA 5FWBA 1WXBA 1A08A 1CSYA 2RF0A 2VWFA 2SEMA 3TVTA 1MW4A 2DF6A 2IUGA 1JXOA 2FRWA 1BK2A 5CDWA 3REBB 1JQQA 1LKKA 2EKHA 4AG1C 2JM8A 1UUEA 3GXXA 1KC2A 1A07A 3OB1B 1H3HA 1FYNA 4GPLB 3I9QA 4RTVA 4QSYA 1BB9A 5HKZA 1T3LA 1MV3A 2DCRA 1AOUF 4NWGA 2CS0A 3VRNA 1A0NB 2L4KA 1AZEA 3OV1A 3PFVA 1LUNA 4GBQA 1TZEE 2AOAA 1O45A 2KR3A 3LH5A 2CRHA 1A1AA 2O9VA 2FPDA 2LQWA 1M3CA 5GJHA 3CD3A 5HKWA 4FL3A 2FCIA 4F5AA 1QKWA 2VKNA 3EAZA 5EHRA 2KRNA 1O4PA 1O4QA 2CSIA 2GGRA 1JYUA 2SHPA 3BUWB 2EGAA 1D4WA 2O9SA 3NGPA 5IH2A 1JU5A 2KGTA 1M3BA 4FBNA 1OPLA 3IN8A 2NWMA 3BUMB 2F2XA 5FW9A 2ESWA 2CT4A 2BZYA 2KBTA 1ABOA 1FBVA 2BBUA 2LMJA 2RSYA 2Y3AB 2OJ2A 3EGUA 2GE9A 5I22A 4OHLA 2BTTA 2PTKA 1K0SA 1BHHB 1PKTA 2LQNA 1KSWA 1PWTA 4J9CA 1LCKA 4AG2C 4DGXA 1CJ1A 2CBLA 3WA4A 1X2QA 4DGPA 2AZVA 2EYXA 3PS5A 4A4CA 2RQWA 2RQTA 1MUZA 1X43A 2JMCA 1O4LA 1SHAA 3EHQA 1A1BA 3VS4A 3TKZA 1NYGA 1Y57A 2GTJA 2CH4W 2GSBA 2M0YA 1VYVA 1SEMA 1ZLMA 2OAWA 1HCTB 4HCKA 2YU7A 2PNAA 3ULRB 1AYDA 1R1QA 1T3SA 1PRMC 1FU5A 4K2RA 2LP5A 4LUEA 2CDTA 4LNPA 2IIMA 2ECDA 2QMSA 1O48A 1H92A 2RORA 2HUWA 2KNOA 2PLEA 4E93A 3S9KA 4ROJA 2KK6A 2ENMA 2B86A 3ZNIA 3EG0A 3RBBB 1AWXA 2MRJA 2JTEA 4OHDA 2MQIA 5L23A 1ABQA 1UGVA 1IS0A 1Y1UA 2KYBA 1BBZA 1HSQA 1SRMA 5BO4A 3TSWA 4U17A 4A4BA 2RPNA 1AD5A 2CUBA 5I6VA 4OMOA 3I5RA 4NWFA 5J3XA 1UJ0A 2CI8A 4HXJA 5DF6A 1O47A 2RVFA 1NG2A 1BFIA 1UURA 4E68A 2FG0A 4CC7A 3H0FA 4Z8AA 2FO0A 1BFJA 1LCJA 1O4RA 4Z89A 2GQIA 1YWPA 2A28A 3GBQA 1X6CA 1O4HA 2LJ0A 3VS2A 3PSKA 1YWOA 4OMQA 4EIHA 3VRYA 3HIZB 2D0NA 1B47A 4XZ1A 1GFCA 3UA6A 2DNUA 1J3TA 3PE0A 1A1CA 1ZUUA 1ZFPE 1UE9A 3M0UA 2DL5A 2EO6A 1X2KA 1PRLC 2L0AA 4RTWA 3EACA 1X69A 2DVJA 2AZSA 1W1FA 4JJBA 3BUNB 3VROA 2IUIA 3VRQA 4X1VA 1O4NA 4J9DA 1BLKA 1BHHA 1RUWA 3M0TA 1FHSA 1UECA 2DJQA 1G83A 1X27A 1JEGA 1O42A 3IMJA 1QCFA 1A81A 2VIFA 3N84A 2K2MA 2PNBA 1O41A 4CC3A 2DLYA 3PVQA 4IIOA 1GFDA 2X3XD 2O31A 1X6GA 2DL4A 2DX1A 1O44A 2YUOA 2KEAA 2JS0A 3BKBA 2VVKA 1IO6A 4F5BA 3H0HA 1FBZA 1AYCA 2EW3A 2FEIA 2HBWA 2JS2A 1AB2A 2E5KA 1NM7A 4FL2A 3GXWA 1NLPC 1WFWA 1WA7A 3M0SA 1RJAA 2PNIA 1XOVA 2GTOA 2K7AB 3MXYA 2W0ZA 1GBRA 2V1RA 2C0IA 4JE4A 5EG3B 3OP0A 1VA7A 1QKXA 2BZXA 3VS3A 3M0RA 2D1XA 1SHGA 1UTIA 1QWEA 3VS7A 5IXBA 4RUGA 1SSHA 1GL5A 2CSQA 1A09A 4JZ4A 1PHTA 1RPYA 4J9GA 2C9WA 2EOBA 1R1SA 4J9HA 2YSXA 1RLQC 4J9IA 2KXDA 4GL9E 2J6FA 3R6NA 4AFQC 2ED1A 1LUMA 2EKXA 2HDXA 2M51A 3NPFA 2C0OA 2KYMA 1AEYA 3PQZA 3VRPA 1JXMA 2CREA 2EYZA 1TG0A 1JWOA 1O4FA 3THKA 3S8OA 3ZL7C 3BUOB 4F16A 2FPEA 2LZ6B 2ECZA 3NMZC 2IUHA 2EVRA 1BM2A 2XP1A 3T04A 3MAZA 3VS6A 2DE0X 4OHIA 2OQ1A 3VRRA 1GBQA 2L3TA 3EG2A 1SRLA 2KXCA 2ABLA 2G6FX 1T0HA 1NEBA 1RLPC 1WXUA 5EC7A 3CXLA 4TZIA 2FRYA 2A36A 3H41A 3TSZA 1UHCA 2JXBA 2EU0A 3VS1A 5GJVB 4DEXA 2NUZA 1O46A 2GNCA 2L2PA 4P9ZA 1M3AA 4OMLA 3S8LA 1UDLA 3U23A 1T0JA 1O4IA 4AFSC 1OOTA 2L3SA 2DILA 1GHUA 1KIKA 3CBLA 2CIAA 2DM1A 2KT1A 2EL8A 2LNXA 2L6KA 1GRIA 3EG1A 1HJDA 2B3OA 1I0CA 3M0QA 5D0JA 2J7IA 1MV0B 1O4GA 3M7FA 1K1ZA 4IIMA 4R0KA 1NYFA 3S8NA 4JZ3A 1WQUA 1HD3A 1UG1A 5AULA 4KRTA 2KROA 1F1WA 4RTXA 2ETZA 5DC4A 1NRVA 3IQLA 1WX6A 1PICA 5IHKA 2K3BA 5IXFA 2MC1A 2K7AA 2K9GA 2W10A 2Y1MA 1KA7A 4P9VA 2KNBB 2EO3A 1FMKA 2HEQA 2AK5A 2F2VA 2DMOA 2XMFA 2MOXA 1K76A 1OO3A 1NEGA 1OEBA 2A37A 3KFJA 2HSPA 1FYRA 3RNJA 3IN7A 4RTUA 3NHNA 1V1CA 4M4ZA 1AVZC 1RQQC 1O4OA 2X3WD 5IBSA 2LJ1A 4X6SA 1MILA 3REAB 1UFFA 3C7IA 1TUDA 2AKKA 2H5KA 2C0TA 5DC9A 1E7OA 2SRCA 1O4JA 2RQVA 1LUIA 1GCPA 1GCQA 2J05A 2YDLA 2JW4A 1F2FA 3UATA 3EHRA 2DM0A 2RNAA 3SEMA 1H9OA 4OMNA 1O4KA 3CQTA 3HHMB 1ZSGA 2RQRA 1YVLA 3HCKA 4FSSA 2EBPA 3CWGA 4OMMA 1O4CA 4U1PA 3PJPA 2DBKA 3TL0A 2ROLA 1QADA 4J9FA 4LUDA 2J6KA 3O5ZA 2HDAA 4RTZA 1WI7A 3US4A 1XA6A 1CSKA 1CKBA 1Z9QA 4J9EA 1O49A 4JGHA 1SPKA 5I11A 1IJRA 1AWJA 2L3QA 3C0CA 3I5SA 3OB2B 1B3QA 1B07A 3A98A 5IBMA 1U5SA 2CI9A 3IMDA 3VGOA 2MCNA 3VS0A 2CUDA 2EYVA 4RTYA 4WWQA 1SHFA 3FJ5A 3PVLA 4EY0A 4K11A 3K2MA 2AKLA 2EQIA 4AFZC 1AYBA 1G2BA 4QT7A 2V1QA 1YCSB 5GJWB 2DL3A 3M0PA 1QG1E 1CWEA 1X0NA 2Y1NA 2D8JA 2EYWA 4D8KA 2QDLA 2KRSA 4OMPA 1SKJA 1BKMA 2CR4A 1SPSA 1YN8A 4JPBW 1Y0MA 4J9BA 2O88A 2MRKA 2LJ3A 5DC0B 1Z3KA 3MXCA 2DL7A 2K6DA 3BUXB 2RQUA 3H0IA 1I1JA 2LNHB 2IZVA 2JM9A 1VYTA 1JO8A 4H34A 2YT6A 1R1PA 2DRKA 1O4EA 3PSJA 1JYRA 1JYQA 1BMBA 4LE9A 1U06A 4F17A 2H46E 2EYYA 1O4MA 2RN8A 2EPDA 3I35A 1CSZA 1YVHA 1X6BA 4HVVA 3VRZA 2LCTA 1BG1A 1ZBJA 2YUPA 1O4AA 2P4RA 1CKAA 1M8MA 2YUNA 1BHFA 1WLPB 2EGEA 2EGCA 4LN2A 1O43A 1K0XA 1VYUA 1NZLA 1CWDL 4XZ0A 3UYOA 2YSQA 3UA7A 2OZOA 1LKLA 2DLPA 3QWYA 4JEGA 5ECAA 2K79B 4CC4B 4HVUA 2DBMA 1BKLA 3JV3A 4F59A 1QLYA 2L3PA 1AOJA 4HVWA 2DX0A 5AXIA 2FPFA 3QWXX 2JT4A 1PKSA 2O2OA 1FU6A 4Y92A 5EEQA 2I0NA 2RMOA 1M27C 1RI9A 4A63B 1OO4A 1W6XA 1ZUKA 2DLZA 5KAZA 1GCQC 1M61A 1HCSB 4DEYA 1WDXA 3PLFB 1BLJA 2KRMA 1LUKA 3EG3A 1M30A 4ZNXA 1NZVA 1YNZA 5IHIA 5HCKA 3OVEA 1Z9ZA 2H8HA 1A1EA 1AOTF 1E6GA 4GLMA 4H1OA 2ED0A 2AOBA 4OHEA 1I3ZA 2J06A 1ARKA 2LX7A 1SHDA 4Z88A 1W70A 2HDVA 1SPRA 2DYBA 4E6RA 2CH4A 1K4US 2ROTA 1KJWA 1BF5A 2DL8A 3GQIB 2MIOA 1E6HA 4K44A 4K45A 2F2WA 1TUCA 1AWOA 2J6OA 2KT8A 2YUQA 3KFVA 1WXTA 5GJIA 2PLDA 2DA9A 5IHNA 4WCIA 4ESRA 2KE9A 1O4DA 1M27A 1KFZA 4L1BB 1YP5A 1TCEA 1WIEA 1N5ZA 3VS5A 1O4BA 3N7YA 3N8MA 2CT3A 1NLOC 3UF4A 4ORZA 1D1ZA 1KA6A 4EIKA 1I07A 4CC2A 2LNWA 1UJYA 2BZ8A 1OPKA 2LCSA 4D8DA 4OHHA 2JMAA 1K9AA 1P13A 2D8HA 1UUSA 1OV3A 2DRMA 2AUGA 4RTTA 4JJCA 1ZX6A 2JYQA 1UHFA 1PNJA 1WYXA 1SHBA 3SHWA 1BU1A 5HKYA 2OI3A 2HCKA 1H8KA 1U3OA 4F14A 1AWWA 4GWFA 2HMHA 1QWFA 1EFNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C92C 4C8QB 1AYAA 2RI2A 1ZUYA 2M9UA 1VQOA 4JJDA 1C6VX 1S1NA 1D4TA 1JU5C 2H3EB 3CCVQ 5GAOr 4J7IA 5EELA 1WXBA 4ATOA 1VQ7Q 2DF6A 2IUGA 3H6ZA 2FRWA 2GCXA 5CDWA 2JM8A 1A07A 4GPLB 4PKCC 4QSYA 5HKZA 1BB9A 1AOUF 4BY6C 4NWGA 1QP3A 2CZ7B 5EG2A 5D6WA 1LUNA 2KR3A 1GXIE 3RR6A 4ZN3A 1QKWA 4XTYA 2KRNA 4F04B 2DAQA 3CCUQ 2GGRA 5DLOA 3NGPA 1JRIA 3CCUT 4FBNA 5GAOq 3IN8A 1QVFS 2RHXA 4KBMB 2ESWA 2CT4A 1FBVA 2LMJA 2Y3AB 2F69A 3JB9F 4OHLA 3OYEA 3QZ5B 2BTTA 5DY9A 2RD1A 5FRMA 2PTKA 2AT1B 1PWTA 4J9CA 1NPRA 3V8KA 3WA4A 1D3BB 1MGQA 2RQWA 1X43A 4XTXA 2JMCA 1SHAA 3VU3C 1Q86R 1A1BA 4F7UE 2GTJA 1PD1A 1XNIA 3OYGA 1HCTB 1FX7A 1SKUB 4PJMA 4MZTA 1WQWA 3JSCA 2LP5A 4OF1A 2D9TA 2RORA 2HUWA 2PLEA 3S9KA 4EMKB 1K8AR 3ZFJA 2ENMA 4J6WA 1IGUA 3DLMA 5FU7C 3ZNIA 5GMKh 1AWXA 3E19A 2JTEA 2RM4A 3CMEA 2EWNA 5KYUA 4Q5WA 1OX9A 1HSQA 4LXCA 4A4BA 2RPNA 1AD5A 4NWFA 5J3XA 1KD1C 2CGHA 2QA4A 1BFIA 4E68A 2FG0A 1RI0A 2FO0A 4C5GA 4M77C 1YWPA 2C06A 1X6CA 1O4HA 4OMQA 4OP0A 1VQ6A 4ANJA 1O75A 3E9GA 2Y4XA 5GMKj 1A1CA 2GF7A 1ZUUA 1UE9A 3M0UA 4CRIA 2EO6A 3OS1A 2L0AA 3X28B 4JJBA 3BUNB 3VROA 5KYXB 3VRQA 3QJ6A 1VQ8A 1I5OB 5LJ5e 4M75A 1RUWA 1UGQB 3M0TA 1FHSA 1UECA 2VC8A 3IMJA 4M7DC 2DKGA 4C92E 1A81A 3N84A 3PIPA 3OW2P 4M75G 5HY6A 3LH0A 2DFUA 2O31A 2DD5A 1X6GA 1O44A 2YUOA 5FRNA 2KEAA 4J83A 3BKBA 2VVKA 1KC8C 2OTJQ 4OVAA 2EW3A 4BE1A 2JS2A 3CPWA 3OBWA 2QQ9A 3BDUA 1M5Q1 3AT1B 1RJAA 1XOVA 2GTOA 2W0ZA 1GBRA 2V1RA 4JE4A 2OTLQ 1UGPB 4M77D 3S3NA 3MEVA 2MMPA 3M0RA 2D1XA 1EX4A 1VQOQ 5GANf 1QWEA 3VS7A 5IXBA 1GL5A 1PHTA 4M75F 1VQOT 3FEOA 2DYIA 4OB3B 1OULA 8ATCB 2XDBA 3Q1JA 1TS9A 3CCJA 4J9IA 2DPPB 2ED1A 2C0OA 2KYMA 2RJEA 2I2LA 3GPLA 1JXMA 2IG0A 1TG0A 4FYYB 4PFZA 2KVQG 1JWOA 3NTIA 2CZ0B 3ZL7C 2FPEA 2LZ6B 1YJWA 2PUKB 2IUHA 1M4ZA 2XP1A 2Y4YA 4M7DD 2CP2A 4OGCA 1SF9A 1GBQA 4EMHA 2KXCA 2G6FX 1NEBA 3MEAA 3ZBDA 3TSZA 1QVFP 2JXBA 1RAGB 2E4HA 2EU0A 5GJVB 4DEXA 2NUZA 3LW5E 1M3AA 2K57A 3SD4A 1O4IA 3OS0A 4AFSC 4MDXA 2L3SA 3M53A 3G6ET 1M1KU 2CIAA 2EL8A 5FU6C 3EG1A 1HJDA 1I0CA 5DM7R 4J6YA 4DOVA 4R0KA 5GAN5 3JB9I 4JZ3A 2KQWA 1UG1A 3L42A 1F1WA 4M77E 1D0YA 4RTXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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