2DVJA

Phosphorylated crk-ii
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
228
structure length
227
Chain Sequence
MAGNFDSEERSSWYWGRLSRQEAVALLQGQRHGVFLVRDSSTSPGDYVLSVSENSRVSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGNQEGSHPQPLGGPEPGPAQPSVNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb
molecule keywords V-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog, isoform a
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 17
structure length 227
sequence length 228
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2dvjA02
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2dvjA01
5IBMA 2JT4A 2MC1A 1I1JA 1K76A 1AYBA 3JV3A 4Z8AA 3EG2A 1Y57A 1BFJA 2LX7A 2MIOA 1UUSA 1FHSA 3S8NA 4JE4A 1TCEA 4CC4B 2KNBB 1JO8A 2DJQA 4AG2C 1CWDL 4OMQA 1SEMA 4A4CA 2FEIA 2O9SA 1E6GA 2GE9A 3WA4A 4OMOA 2JM9A 2RQVA 1UHCA 1JYQA 1AWOA 4HXJA 4E68A 1H92A 1VA7A 1GBQA 4OHLA 3VROA 2DLYA 1FU6A 1O46A 2QMSA 1O4DA 1O4GA 3PSKA 3R6NA 2KT8A 1UE9A 3LH5A 2F2VA 4J9IA 3UATA 1WA7A 2JMCA 1S1NA 4IIMA 1GL5A 2IUHA 1PWTA 2F2WA 1G2BA 1QKXA 3RNJA 3UA7A 3GXXA 1BLKA 4FSSA 1H9OA 1OEBA 2CBLA 1MV3A 2VIFA 3GQIB 3I5RA 1QLYA 2D1XA 1T0HA 1FBVA 1O4EA 1R1SA 1JEGA 1JU5A 2DX1A 1M3AA 2K2MA 5DF6A 1LKKA 3VRRA 1KFZA 4EIKA 2EYZA 4DEXA 4D8DA 1AYAA 5AXIA 4LUDA 2MCNA 2GBQA 3EGUA 4QSYA 2LNWA 5DC9A 4X6SA 1H8KA 1W70A 2VVKA 1O4JA 3RBBB 1A07A 5IH2A 1SKJA 1ABOA 1E6HA 1PRLC 4XZ1A 1WDXA 4OMLA 1JXOA 2GQIA 2ECZA 5FWBA 2DE0X 2FPEA 1SHDA 4J9HA 1AEYA 3M0PA 2DF6A 3TSWA 2H46E 1JYUA 1NLPC 1QWEA 1M3BA 1B3QA 2EOBA 1GHUA 4LUEA 2PLEA 1LKLA 4OHIA 2IZVA 3UF4A 1NZVA 2EL8A 2E5KA 2KGTA 1UHFA 1CSYA 2BZYA 1SHGA 2ROLA 1OPKA 3N84A 3H0IA 2EBPA 5I22A 2HBWA 2J06A 4D8KA 2YUQA 1UJ0A 2ABLA 2A37A 2IUGA 2RORA 3REBB 4IIOA 2K6DA 2IUIA 1HSQA 2RPNA 2LNHB 1HCSB 1WYXA 3FJ5A 1RQQC 1MUZA 5GJHA 2JS0A 1D4WA 1D4TA 1IO6A 3PS5A 1YP5A 1EFNA 2EKHA 2RQRA 2A36A 2F2XA 4J9FA 1O4MA 3C7IA 1B47A 1Y0MA 1KSWA 3IQLA 3NHNA 1M30A 3EG3A 2O9VA 3HCKA 1O44A 1WLPB 2CI9A 1I0CA 3QWXX 1YNZA 1RLQC 4LN2A 4JJDA 2LNXA 1WIEA 3MXCA 1JU5C 5GJWB 2CREA 4H34A 3TL0A 1UUEA 2SRCA 2KXDA 2ETZA 1WX6A 4AG1C 4OMNA 2O88A 1CSKA 2DL8A 1SSHA 4A63B 1LUNA 1V1CA 2DCRA 3CWGA 2LJ1A 1LUMA 3BUWB 4JGHA 4J9DA 1AZEA 4P9VA 2CT3A 2FO0A 3C0CA 1A1EA 2H8HA 1BB9A 2CH4W 1O47A 2K3BA 1PRMC 2KEAA 2DM0A 2K7AB 3CQTA 2OAWA 1UGVA 2ENMA 4WWQA 5IHNA 1FYNA 1B07A 2GGRA 2MRKA 4OHEA 5IHIA 1AZGB 5HKZA 1BKLA 5KAZA 2DM1A 2KBTA 1GBRA 2OI3A 1O4QA 2KRNA 2RQTA 1JWOA 3BKBA 1UECA 2MOXA 1SHAA 3GXWA 5DC4A 1WI7A 5L23A 2JTEA 4JZ3A 1J3TA 5HKYA 1TUCA 2RVFA 1Z9ZA 1ZBJA 2DVJA 1BHHA 4K45A 2K79A 1HJDA 2P4RA 4K11A 2BZ8A 1W6XA 4CC7A 1QG1E 1VYTA 1D1ZA 2GNCA 3VRYA 2LQNA 3I35A 1A0NB 1O48A 1O45A 2EYVA 5GJVB 3S8LA 2LJ3A 3VS5A 2CH4A 2PNBA 2YUNA 1BFIA 3M0UA 3OVEA 2RN8A 1AOJA 2H5KA 1O4FA 5CDWA 2EYWA 2L4KA 3PQZA 5FWCA 1X2QA 5J3XA 1GCQA 1UG1A 1RPYA 1PKTA 2CT4A 2CR4A 1BMBA 1Z3KA 5IXBA 1YN8A 1ZLMA 1U3OA 2BBUA 1ZUUA 2K7AA 2KT1A 1QADA 4R0KA 2CSQA 2C0TA 3QWYA 3BUMB 2CSIA 3VS2A 2KR3A 4J9CA 3BUOB 2C9WA 1WQUA 1R1PA 5EHPA 1M27A 1BHFA 5EC7A 2DRKA 3PJPA 1M3CA 1Z9QA 1SRMA 3MXYA 4J9EA 1E7OA 4OMMA 1H3HA 5DC0B 2JMAA 1X6CA 1UTIA 1YWPA 2BZXA 3EHQA 1ABQA 1OOTA 4JJCA 4FBNA 2YUPA 4H1OA 4A4BA 4DEYA 1NEGA 2X3WD 1CKAA 3ZL7C 4E6RA 5IHKA 2SHPA 1O4CA 3BUNB 1ZUKA 2O2OA 4LE9A 1O43A 1PNJA 3VS7A 2DYBA 1W1FA 2O31A 2ROTA 1MILA 2MQIA 1NRVA 4KRTA 3PVLA 1QCFA 1LUIA 2XP1A 2CDTA 1WXBA 1O4KA 2M0YA 1TUDA 2HMHA 4F14A 2ESWA 4RTXA 2LQWA 3MAZA 2CIAA 2ED1A 1K9AA 2EU0A 1NZLA 1AOTF 2JS2A 1BKMA 2FCIA 4GPLB 2FG0A 4JPBW 1NLOC 2YDLA 1Y1UA 1HD3A 5I11A 3REAB 1YVLA 1UURA 1KA6A 1ZUYA 2GTOA 2LCSA 2AOAA 1LCJA 5AULA 1AOUF 2EO3A 2J05A 2LP5A 2KNOA 3HIZB 4FL3A 1GCQC 5EG3B 4F59A 1AVZC 2J6OA 3CD3A 1O41A 2JM8A 1WXUA 1XA6A 2RSYA 4RTZA 1WXTA 4LNPA 2EYYA 3IN8A 1TG0A 2D8HA 4U17A 2J6KA 4E93A 1K0SA 1HCTB 1NEBA 1K4US 2M51A 4F17A 2V1RA 1AYDA 4HVVA 3PFVA 1M27C 4OMPA 3UYOA 1A08A 3N7YA 1IJRA 2Y1NA 1BF5A 1RUWA 3NGPA 4Z88A 3VS6A 1A09A 1SPRA 5EELA 5D0JA 4ORZA 3VRQA 2MK2A 4JJBA 2LZ6B 1M61A 2PNAA 3M7FA 5GJIA 3GBQA 1I3ZA 1X0NA 1F1WA 2L3SA 3M0QA 3OV1A 2KRMA 2L0AA 1GFDA 1X6BA 4HCKA 2FPFA 2L3TA 1PKSA 4TZIA 4K2RA 1X2KA 1KA7A 2L3PA 2RQWA 3M0RA 1YWOA 2D0NA 1QWFA 3PLFB 2HDAA 2CUDA 1U06A 1XOVA 3BUXB 1JQQA 3EAZA 1JXMA 2BTTA 1X69A 2RNAA 2HDVA 4M4ZA 5HCKA 1UFFA 2AKLA 1IS0A 1GRIA 5BO4A 4EIHA 3VS4A 2PZ1A 1G83A 1YVHA 2PNIA 3T04A 1O4BA 4JEGA 4J9GA 2HEQA 3CXLA 1SPKA 1OV3A 2ECDA 2J7IA 1RI9A 2CRHA 1KIKA 4ESRA 1AD5A 2W0ZA 1ARKA 3US4A 3K2MA 2EGCA 2DX0A 1BU1A 3EACA 1FBZA 1SRLA 2MRJA 4OHHA 2YU7A 3IN7A 1VYUA 2XMFA 4DGPA 2C0IA 2GSBA 2VKNA 2EGEA 2YSQA 1ZFPE 4OHDA 5EHRA 1QKWA 3PE0A 2IIMA 3UA6A 3IMJA 3S9KA 1A1AA 3CBLA 3EHRA 1M8MA 2KK6A 2DBMA 2AKKA 1K1ZA 2RMOA 3H41A 2HSPA 2CS0A 2W10A 2HUWA 1O42A 2EW3A 2EYXA 1A1BA 5EEQA 2DL4A 1AYCA 5ECAA 1CWEA 1OO3A 1TZEE 2KXCA 1X27A 2EKXA 2EVRA 3NMZC 3PVQA 2NWMA 1KC2A 2AZVA 1NYFA 3NPFA 2X3XD 1O4OA 2L2PA 2QDLA 2EGAA 2Y1MA 3M0SA 4HVUA 3VRNA 1NG2A 2L6KA 4RTWA 1A1CA 3SEMA 1FU5A 4GL9E 1NM7A 2KYBA 2NUZA 2AZSA 3TVTA 2OJ2A 4RUGA 4L1BB 3ULRB 3TSZA 2JXBA 1OPLA 4NWFA 3I5SA 4F5BA 4Y92A 3KFJA 2DL7A 3I9QA 1R1QA 4RTYA 4U1PA 4AFUC 2ED0A 1O4AA 1O4HA 2AUGA 4F5AA 1O4IA 2OZOA 2HDXA 2V1QA 4XZ0A 4ROJA 3TKZA 2RF0A 1BK2A 2Y3AB 5FW9A 4AFQC 1LUKA 2KYMA 1P13A 2CUBA 4RTVA 4X1VA 2JYQA 4AFZC 2DL5A 3PSJA 2DLZA 2KRSA 4AFSC 2DILA 3KFVA 3VGOA 2FRYA 4RTUA 3VS3A 1BM2A 1CSZA 2LJ0A 2PTKA 2J6FA 4DGXA 2HCKA 1I07A 1BLJA 2AK5A 4F16A 2GTJA 1GCPA 1ZX6A 3A98A 3H0HA 3SHWA 1BBZA 3VS1A 4GLMA 5IXFA 1SPSA 1GFCA 1BG1A 1SHBA 1F2FA 1AWJA 4CC2A 2B3OA 4P9ZA 2DL3A 3EG1A 4J9BA 4NWGA 2K9GA 2L3QA 2RMXA 1MW4A 2A28A 4Z89A 4CC3A 2I0NA 2DA9A 2SEMA 2YT6A 1OO4A 3HHMB 3OB1B 1NYGA 1AWWA 2RQUA 3N8MA 2YUOA 4GBQA 1UDLA 1T3LA 1WFWA 1BHHB 1JYRA 1O4NA 2K79B 3OP0A 1LCKA 3VRZA 1O4RA 1AWXA 1A81A 5I6VA 3THKA 3H0FA 1AB2A 1UJYA 5IBSA 2FPDA 1SHFA 3OB2B 4RTTA 2JW4A 1ZSGA 4WCIA 1CKBA 2CI8A 3EG0A 1X43A 3VRPA 1O4PA 1T0JA 2C0OA 4HVWA 1N5ZA 1RLPC 2YSXA 2EO6A 4EY0A 3M0TA 2DLPA 1K0XA 1FMKA 3O5ZA 1FYRA 1KJWA 1T3SA 3VS0A 1YCSB 4QT7A 1O4LA 2EQIA 5HKWA 2KROA 1X6GA 1PHTA 2DRMA 4ZNXA 2D8JA 1VYVA 2PLDA 1MV0B 2AOBA 4FL2A 2B86A 3ZNIA 2LMJA 2DBKA 1RJAA 4K44A 2VWFA 2FRWA 1U5SA 2DMOA 2KE9A 1O49A 2OQ1A 4GWFA 2LCTA 2A08A 2DNUA 3IMDA 1PICA 2EPDA 1CJ1A 2G6FX 4JZ4A 3U23A 3S8OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GAMd 2QGFB 2JN0A 2JT4A 4C8QD 2RD1A 2V8IA 1K76A 1AYBA 1BFJA 3CPWS 5KCOA 2LX7A 3QXEB 5FRNA 3BDUA 2KNBB 4AG2C 2XK0A 4A4CA 3LYVA 3WA4A 5GAOq 3TEEA 1QMCA 1JYQA 1YITT 1Y71A 3INZA 1W2BA 1H92A 3VROA 2A0FB 1O46A 2E3IA 1JJ2S 3CCST 5HK0A 3GF5A 1QVFA 3PSKA 2WACA 2I2LA 4J9IA 3UATA 1WA7A 1S1NA 1PWTA 3GXXA 2K3XA 1K8AR 1H9OA 1OEBA 2RHUA 1MV3A 4E7SA 1VOMA 4L5GA 1QLYA 3I5RA 1O4EA 1R1SA 4C8QE 1X01A 4M7DF 3CD6T 1SF9A 1AYAA 4C92G 2L89A 4FU6A 4ZN3A 2COZA 3M59A 3PIOA 1BI0A 3RBBB 1G3TA 2EJGA 4OMLA 4ELYC 5FWBA 2DE0X 2DF6A 1VQLQ 2OTLQ 2H46E 3V8KA 1QWEA 4PJOA 2R58A 2EOBA 3JCMP 3RDVA 3RUXA 3JCMe 1YJNA 1NZVA 1KD1C 2KGTA 1CSYA 1SHGA 1BYMA 3QUIA 5I22A 2HBWA 2J06A 1VQ6T 5LJ5g 2ABLA 1YIJQ 2IUGA 4IIOA 4C8QB 1VQNQ 2QK0A 1HCSB 1RQQC 4E7LA 4HT9A 3L1AA 1D4WA 1IO6A 1EFNA 4J9FA 1O4MA 1KC8U 3G7ZA 2E65A 5KE2A 6AT1B 1RI0A 4FYWB 4Y91A 4M75G 1IZ6A 3HCKA 1WLPB 2O4XB 2KAFA 3QWXX 4C0ZA 4LN2A 2VXEA 1JU5C 4H34A 2CREA 3FRNA 3M4GA 2MYSA 1WX6A 1SSHA 1V1CA 4N4HA 3SWNB 1RAAB 1LUMA 5LJ3j 4JGHA 2Y4YA 2CT3A 1M1FA 5GANf 2FO0A 2K4YA 3F70A 1A1EA 3CCSA 1BB9A 1O47A 2PUKB 2DM0A 5IHNA 1FYNA 4BB7A 2GGRA 2MRKA 1MMDA 4DBFA 4AMCA 1AZGB 5HKZA 5GAMh 1YI2T 2DM1A 1GBRA 2KRNA 9ATCB 1JWOA 1K8AC 5FLXE 3M55A 5DC4A 5HKYA 4LDYA 2QTXA 1O75A 5KYYA 2RVFA 1NPRA 5GAMf 4QVDA 2DD4A 3WXMB 1ZBJA 2DVJA 4FW2A 4PJMA 2CKKA 2P4RA 3QJYA 3JCMV 4CI0C 4DQ2A 3OYDA 1R77A 4KUDK 2CH4A 3EFOB 2RN8A 2H5KA 5CDWA 3LWHA 3PQZA 5FWCA 3OYJA 1UG1A 2CT4A 3VKIA 2CR4A 1JRIA 1Z3KA 5IN1A 2KT1A 3OA6A 4R0KA 3URGA 1U8RA 2GFAA 4OB2B 1IB8A 2C0TA 3BUMB 2CSIA 3GP8A 3BUOB 2C9WA 1R1PA 5EC7A 3QBYA 1Z9QA 4J9EA 3EAEA 4R55A 1YWPA 1ABQA 1CKAA 1BI2A 3ZL7C 4E6RA 1O4CA 3BUNB 4QKUA 1KHIA 2MMPA 2PVDB 4KRTA 4MMKA 2CDTA 2LT1A 1Y96B 2F5KA 3BW1A 1QVGP 2EU0A 4IURA 3QDRB 1AOTF 1VQLT 2JS2A 2OTLT 4XU2A 2LQKA 2ZPFB 2JTFA 4BE0A 3REAB 1KA6A 2CP5A 2GTOA 2FB7A 1BI1A 5AULA 2EO3A 1VQOQ 4FL3A 1GCQC 4DOWA 2J6OA 2FZCB 4EMKA 2JM8A 4J6YA 1KG1A 1WXTA 4LNPA 3IN8A 2VC8A 1VQNT 3JCMb 4A4FA 2XDPA 3OYNA 3CMAA 3CCMT 4OB3B 1EIFA 4DBQA 1AYDA 4HVVA 3PFVA 3UYOA 1A08A 1WJRA 2GCXA 5GMKj 3N7YA 1BF5A 1ZHIA 2KGYA 4Z88A 5EELA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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