2DVJA

Phosphorylated crk-ii
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
228
structure length
227
Chain Sequence
MAGNFDSEERSSWYWGRLSRQEAVALLQGQRHGVFLVRDSSTSPGDYVLSVSENSRVSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGNQEGSHPQPLGGPEPGPAQPSVNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb
molecule keywords V-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog, isoform a
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 17
structure length 227
sequence length 228
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2dvjA02
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2dvjA01
2GBQA 1WX6A 2O88A 1ABQA 2CUBA 1X2QA 4CC7A 2EBPA 5CDWA 2DLPA 3OVEA 1VYVA 3VROA 1BG1A 1NLPC 1BHHA 1U3OA 2MK2A 1BKMA 3IQLA 2JTEA 3PVLA 3A98A 2ED0A 2XP1A 3CQTA 2DILA 4A4CA 2D0NA 1RLQC 2KYBA 5FWBA 1CWEA 1JWOA 2M51A 5GJHA 2EKXA 2KK6A 2CIAA 3JV3A 2K7AB 4RTUA 1K4US 3EHRA 2X3XD 2AOAA 3VRRA 2L6KA 1OO3A 4FBNA 2EYWA 1RUWA 2MCNA 1CSKA 2QDLA 3PJPA 1SPSA 2HEQA 2EO3A 3NPFA 2BTTA 3S8LA 1B07A 1BFJA 2YUOA 2LZ6B 2L4KA 1KA6A 4LN2A 2IUHA 2LQNA 3BUNB 2K9GA 3PVQA 1JYRA 4Z8AA 4DEYA 2A37A 4D8KA 2EQIA 1D4TA 2RPNA 1XOVA 3BUOB 4X6SA 2D8JA 1ZUUA 2ECZA 4RTXA 1JEGA 1A1EA 3VRNA 4XZ0A 1AOTF 2SRCA 1O4QA 4J9HA 4WWQA 4U17A 1E6HA 5EG3B 2DRKA 1MV3A 2LP5A 1YVLA 3LH5A 1RPYA 1UUSA 2L3QA 2MQIA 1JYUA 1GCQA 2DF6A 2JS0A 1BK2A 4AFZC 3VS3A 1PICA 2C9WA 4WCIA 3REBB 1OO4A 4FL2A 2FRYA 1X6CA 1O44A 1AWJA 2OZOA 1WDXA 4RUGA 1CJ1A 3VS4A 3M7FA 4E93A 4OMLA 1NYFA 1ZSGA 2F2XA 4NWFA 3QWYA 1BHHB 3QWXX 1LUMA 5AULA 3EAZA 3I9QA 2KRMA 2GTJA 4ZNXA 1H9OA 4E6RA 2CDTA 1QADA 1NEBA 3BUMB 2ESWA 1AZGB 2RQRA 4R0KA 2GSBA 2ED1A 1WXBA 4OHLA 1SPKA 2H5KA 5L23A 1SSHA 1TUCA 2HUWA 2O31A 2PZ1A 2YSXA 3VS6A 2OI3A 2YDLA 3MXCA 2AK5A 1AVZC 2LX7A 2ROTA 2EYVA 4RTYA 3OV1A 1GL5A 1PWTA 1AYDA 1BMBA 1VYUA 1VA7A 2AUGA 1O4KA 1JO8A 4DEXA 1UE9A 1HJDA 2LCSA 2KE9A 1AEYA 3K2MA 2KXDA 2EYXA 2RVFA 1X6GA 5I11A 2DX1A 4HXJA 1O4FA 2PLEA 2DRMA 2IUIA 1WFWA 1KSWA 2LMJA 4JZ3A 1RLPC 1W6XA 2KYMA 1I0CA 1CSYA 4LNPA 2RMOA 1J3TA 2FO0A 4CC2A 1B47A 2CT3A 1PKSA 3H0FA 2LCTA 2IUGA 1AYBA 2C0TA 1LKLA 2FEIA 2GE9A 1BLKA 1H92A 5GJIA 2ROLA 3S8OA 2LJ3A 2HMHA 1M27C 1UHCA 4LUEA 4OMMA 1HD3A 1M30A 1SHFA 2P4RA 1A1CA 1NZLA 1SKJA 1CWDL 2DM0A 2FG0A 3VS1A 3EACA 1X43A 5IHIA 3WA4A 2MC1A 1E7OA 1T0HA 1T3LA 2J05A 4IIOA 1B3QA 2AKKA 4AG1C 1K0SA 1O4MA 2KR3A 2RQVA 2A28A 1H8KA 1R1SA 4GLMA 2H46E 4JGHA 1O45A 2LNWA 1ZX6A 4KRTA 2JMAA 2JS2A 3TL0A 3FJ5A 5IBSA 3M0QA 2IIMA 2C0IA 1T3SA 1TCEA 1ZFPE 4CC4B 2D1XA 4J9IA 4GWFA 3MAZA 2DM1A 2AZSA 3EHQA 1O4JA 2DCRA 4P9VA 1NM7A 5FWCA 2YUQA 1JXOA 4J9EA 1O4IA 1A09A 1M8MA 1UHFA 2EW3A 2KNBB 2OQ1A 2KXCA 4HVVA 1K76A 2Y1NA 3H0IA 1LUNA 1X27A 1NEGA 1S1NA 1QWFA 3T04A 1I1JA 2VVKA 3EGUA 1X6BA 2LNXA 1O46A 2V1RA 1CSZA 2BZXA 1SHBA 3VGOA 1FU6A 1ABOA 3SHWA 2KRSA 1O4AA 3NHNA 1LUIA 3HCKA 1U06A 1TUDA 3HHMB 1GHUA 2EL8A 2VWFA 1AWXA 1OPLA 2VKNA 1BB9A 1W1FA 1BLJA 2BBUA 1IS0A 3UYOA 3IMJA 4J9GA 1UECA 2D8HA 1UURA 1OPKA 1SRLA 2YSQA 1QKWA 1AOJA 2JW4A 3BUXB 1WXTA 2LQWA 2W10A 2GQIA 1R1PA 2MIOA 2K3BA 4J9FA 1MW4A 1CKAA 3VRZA 2I0NA 1K9AA 3I5SA 2X3WD 2KEAA 4Z89A 2HSPA 1F2FA 1X0NA 3M0TA 4XZ1A 2DLZA 2CUDA 1Y57A 2B86A 2L3PA 1ZLMA 1WQUA 2JYQA 1AWOA 1GBRA 1O4GA 2EGAA 2CS0A 2B3OA 3OP0A 1O43A 2YT6A 1E6GA 5J3XA 2RMXA 4JZ4A 2CH4A 4U1PA 1GRIA 1HSQA 1X2KA 4OMNA 1A1AA 4FSSA 5KAZA 3IN7A 3S9KA 2RQWA 5IXBA 2J6OA 4AFQC 4QSYA 4A4BA 1YWPA 1O4BA 1RJAA 5GJWB 2DL7A 1A07A 5EHRA 4F5AA 3REAB 2EYZA 3M0PA 2EO6A 2PTKA 3CBLA 5IBMA 2J06A 2W0ZA 1KFZA 1YWOA 3UA6A 2EOBA 3RNJA 1O4DA 3IMDA 1IJRA 4F5BA 2G6FX 1U5SA 3M0SA 1HCSB 3UF4A 2DL5A 3RBBB 1O4PA 2GNCA 4K45A 2OJ2A 4OHDA 1OV3A 1ZUYA 1BFIA 5IH2A 2L0AA 2KROA 2ABLA 2DL3A 3UATA 3GBQA 1Z9ZA 1MV0B 1O4CA 5ECAA 2OAWA 1AYAA 3I35A 5D0JA 3NMZC 2ENMA 2RN8A 2FPDA 2BZ8A 1SHGA 2LJ0A 1K1ZA 4K11A 1FBZA 1R1QA 4TZIA 1Z9QA 1O4EA 1I3ZA 2DE0X 4OMQA 1MUZA 2AZVA 1F1WA 3PS5A 2DBKA 2DMOA 2PNAA 3C7IA 1FYNA 3GXXA 1G2BA 1RQQC 4DGXA 5DF6A 4Z88A 1ZUKA 4LUDA 2NUZA 1SHAA 1UUEA 1M61A 1Y1UA 2PNIA 1NLOC 3C0CA 3R6NA 4RTTA 3SEMA 1JQQA 2DA9A 1G83A 1Y0MA 2NWMA 1Z3KA 3BUWB 3PE0A 4OHIA 2RF0A 2CRHA 3O5ZA 3IN8A 2EVRA 1M3AA 2HDVA 5I6VA 1IO6A 1SHDA 2BZYA 2L2PA 4H34A 1W70A 3M0RA 3MXYA 2DLYA 1LCKA 2KNOA 2LJ1A 4E68A 5IXFA 1M3CA 3BKBA 3TVTA 2FCIA 4CC3A 2PLDA 3CD3A 2DYBA 4F17A 2IZVA 2YU7A 1D4WA 2RQUA 1JU5A 4ROJA 4EIKA 5I22A 2O2OA 1I07A 3VS7A 1A81A 2CR4A 4EIHA 3KFJA 3VRYA 1O47A 1YCSB 1X69A 1O41A 2LNHB 2XMFA 2K79A 4HVWA 3HIZB 5FW9A 4F59A 3GQIB 2EU0A 4NWGA 2RNAA 3PQZA 4F16A 1A08A 1NZVA 2SEMA 2FPFA 1GCQC 2A36A 2DJQA 2O9VA 1SRMA 2HDXA 1KJWA 5DC9A 1NG2A 2DL8A 1O4RA 1PNJA 3OB2B 4GPLB 1GCPA 1JXMA 3CWGA 2EPDA 4M4ZA 2EGEA 1PRLC 1BKLA 1MILA 2CSQA 3VRPA 2JMCA 1P13A 2V1QA 2CREA 1LCJA 2J6FA 3ZL7C 1TG0A 3PFVA 1FU5A 1GFDA 2GGRA 4JPBW 1N5ZA 1FYRA 3OB1B 2MRJA 4JJCA 3TKZA 1BBZA 3N8MA 4AG2C 2PNBA 5EHPA 3ZNIA 2QMSA 1AWWA 1WYXA 1QG1E 2CI8A 2KBTA 1AOUF 1O4LA 3UA7A 2J6KA 3KFVA 2EGCA 2JXBA 1A0NB 1QWEA 3U23A 2ECDA 4FL3A 5IHNA 1NYGA 4OMOA 1SPRA 5EELA 4IIMA 4K44A 3VS0A 1O49A 1O42A 2JT4A 1UGVA 3VRQA 1UG1A 2DVJA 4Y92A 4OMPA 1FMKA 1ZBJA 2AKLA 1GFCA 3S8NA 1GBQA 1O48A 2J7IA 1AB2A 3EG3A 4ESRA 4F14A 1FHSA 2HBWA 4P9ZA 2K79B 1BF5A 2CBLA 2CI9A 1LKKA 5DC4A 2KRNA 4J9DA 1UJYA 1YP5A 1V1CA 3H0HA 1CKBA 1WA7A 1QLYA 2DNUA 2KGTA 2Y1MA 2F2WA 1YN8A 1PRMC 1BU1A 1O4OA 5AXIA 5HKWA 2MOXA 4JJBA 2H8HA 1H3HA 2KT8A 4X1VA 1YNZA 3EG0A 5EEQA 4JJDA 2C0OA 2E5KA 3PSKA 4LE9A 4RTVA 1HCTB 1WLPB 1QKXA 3N84A 4L1BB 2M0YA 2RORA 1RI9A 2DBMA 3EG2A 2HDAA 2FPEA 2RSYA 1D1ZA 1A1BA 2YUNA 4HVUA 1KIKA 2L3TA 3VS5A 2MRKA 2F2VA 4OHEA 1PHTA 1KA7A 3US4A 2SHPA 3PSJA 1JYQA 2K6DA 3M0UA 4J9CA 2JM9A 2L3SA 3PLFB 2O9SA 4QT7A 1QCFA 1BHFA 5EC7A 3TSWA 1KC2A 3THKA 1UFFA 1WIEA 3NGPA 1M3BA 3VS2A 5HCKA 1LUKA 1PKTA 2DX0A 2K7AA 1YVHA 1BM2A 3N7YA 1JU5C 4GL9E 4AFUC 4D8DA 5BO4A 1ARKA 2JM8A 1O4NA 3ULRB 1AZEA 1SEMA 4GBQA 1AD5A 2KT1A 4J9BA 4JE4A 5GJVB 2YUPA 3CXLA 4EY0A 4RTWA 1UDLA 2VIFA 1VYTA 4HCKA 4OHHA 4DGPA 3TSZA 2CH4W 1TZEE 2EYYA 1AYCA 4H1OA 2ETZA 1XA6A 1T0JA 5IHKA 1WXUA 1UJ0A 2A08A 4K2RA 2FRWA 2EKHA 2CSIA 5HKYA 4ORZA 5DC0B 4RTZA 2AOBA 2DL4A 1OEBA 2Y3AB 1UTIA 4A63B 3H41A 1OOTA 2HCKA 1K0XA 1EFNA 1WI7A 4AFSC 3GXWA 1NRVA 2K2MA 1FBVA 1O4HA 4JEGA 3EG1A 2CT4A 5HKZA 2RQTA 1M27A 3I5RA 2GTOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X34A 2HBPA 2O88A 2CUBA 1G3WA 2GQVA 2DLPA 2QASA 1BG1A 2GCXA 1U3OA 4PJOG 4PJNA 3IQLA 3QJ6A 3A98A 1XJWB 2WSEE 3CQTA 4A4CA 3OSSC 2D0NA 1JWOA 1LPLA 1QVFS 1EIFA 1TU0B 2MK5A 1OZ3A 1K4US 3VRRA 2EYWA 2MCNA 1UGRB 3CCJQ 1B07A 2YUOA 2QAZA 2LQNA 2VXFA 3TQ7P 1JYRA 2M0OA 2QGFB 4DEYA 4D8KA 4BUGA 1D4TA 4O6JA 4YTLA 1O75A 2X4WA 4RKUE 3DB4A 3E1SA 4RTXA 1A1EA 3G6EA 4U17A 1E6HA 1KHCA 1MV3A 2DRKA 4MMLA 1MNEA 2LRAA 1UUSA 2XIDA 3H9NA 2JS0A 1WHJA 4AFZC 2EJ9A 5CQYA 5KE2A 4FL2A 1O44A 2OZOA 1CJ1A 2K3XA 4E93A 3I56A 3FIFA 3QWYA 1N9RA 3QWXX 2QK0A 1OYXA 3HSBA 3EAZA 4FBNA 2GTJA 1QADA 4E6RA 2CDTA 1OX9A 2RQRA 1WXBA 4OHLA 3SWNC 1TUCA 3C4SA 2DYIA 2DTIA 2YSXA 2OI3A 2YDLA 3MXCA 2LC4A 2DERA 1JRIA 1XQHA 5A2QE 1O4KA 1JO8A 3K2MA 3TREA 3OW2P 1O4FA 1WFWA 1KSWA 1D1BA 5GMKh 2AIRB 4P5NA 1M2VB 1I0CA 2QEXQ 1VQOQ 4FW1A 2RMOA 3E9GA 1VQ6A 2FO0A 2JTFA 4CC2A 1B47A 2CT3A 1PKSA 5DLOA 1H92A 5GJIA 4GWFA 1A1CA 1CWDL 2FG0A 1YJNA 1E7OA 4IIOA 1QVGP 1O4MA 4LDYA 1Y7XA 5FU6B 1W2BP 3ZBDA 1BIBA 1H8KA 3CPWS 4JGHA 2M02A 1O45A 2LNWA 1ZX6A 4KRTA 3C12A 3FJ5A 1T3SA 2L5QA 2E3IA 1ZFPE 1VUBA 2D1XA 3QZ9B 2DM1A 2K5LA 4TVRA 1ZBXA 4J9EA 1WJSA 1A09A 1NJIC 3OYKA 4HCZA 4A4HA 4KH0B 2CZ7B 2E3HA 5A0LA 2CP7A 1O46A 1UEBA 2XKOC 2OTLT 1G3SA 1FU6A 3VGOA 3SHWA 1IGUA 2LQ8A 1O4AA 3HCKA 3INZA 1Y96A 1VQ4Q 5FU7C 3G4ST 1ZQ1A 4JS5A 1BLJA 2BBUA 3UYOA 4J9GA 1OPKA 1QKWA 1PCXA 2EYQA 2LQWA 2RJDA 2QQRA 4M7AB 1M2VA 2K3BA 4N4IA 2DFUA 1CKAA 2I0NA 1X0NA 4XZ1A 1WNLA 2KEAA 4M75D 1Y57A 2YT6A 2DTHA 3TU4K 4XQ3A 1GRIA 4FSSA 4PJOD 3IN7A 1VQ9Q 2R57A 5GMKi 4A54A 1R8OB 2YRVA 5LJ3j 3BW1A 4JJNK 1RJAA 4F5AA 2Y4YA 3C95A 2EYZA 3M0PA 4ATOA 1S72T 2J06A 4XTZA 1KFZA 2QI2A 3MP1A 2EAYA 3RDVA 1IJRA 2E4HA 4F5BA 3CC2Q 2G6FX 1U5SA 2RK1A 1O4PA 4J7IA 3P8BB 2OJ2A 5IH2A 2L0AA 2XDBA 1Z9ZA 1AYAA 4ANJA 2RI3A 2NUPB 1BKBA 3WXMB 5KYWB 3FEOA 2HMAA 4BI3A 3S3MA 3A5ZB 4HA8A 4DOWA 1FBZA 3M55A 3QG1A 1VQMT 4NOYA 1F1WA 4OMQA 3V8KA 2DMOA 5CR2A 3CCVT 1VQLQ 4BDYA 2DTOA 4LUDA 3I55A 1W4SA 1SHAA 1Y1UA 4M7AA 3C0CA 2PVDB 2DA9A 2NWMA 1Z3KA 5GAOr 1TWBA 2FZGB 2QYZA 2RF0A 1Q7YU 3O5ZA 3EH1A 3L2QA 3CCRT 1M3AA 1OZ2A 5I6VA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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