2LQNA

Solution structure of crkl
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAYAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Crk-like protein
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqnA01
2L3PA 1BK2A 5IHNA 1I0CA 3VRYA 5FWBA 1JU5A 2C9WA 2HEQA 2ESWA 1AB2A 2RQVA 3M0QA 2DVJA 2DCRA 2MRJA 3S9KA 1YVLA 1QLYA 2KRSA 4HVWA 2DMOA 3OVEA 1BU1A 3VS0A 4A63B 1KC2A 3JV3A 1BKLA 2FPFA 2B86A 1SRLA 3R6NA 1KA6A 1OEBA 5I6VA 2M0YA 1TUDA 2BBUA 2J06A 1Y1UA 2Y1NA 2DLZA 4OHHA 2IZVA 1O43A 4HVVA 2IUHA 1IS0A 3PFVA 2BZYA 3M0PA 1GBRA 2HCKA 1A07A 1Z9ZA 4EIKA 1ZUKA 1HJDA 4U17A 3RBBB 2LCSA 3MXYA 1RQQC 2RN8A 3VS7A 1XOVA 2EO3A 3PE0A 1LKLA 2F2VA 2JS2A 1YWOA 2PZ1A 2K2MA 3QWXX 1NEGA 1OPKA 1VYVA 2DL5A 4LN2A 1S1NA 2DA9A 2RF0A 1CWDL 1T0HA 2Y3AB 1B47A 1ZFPE 1X27A 2M51A 4U1PA 2EYZA 2YDLA 2C0OA 1GHUA 2GE9A 1O46A 4FBNA 1K9AA 4JZ4A 3PSKA 3EG1A 3M0SA 2EKHA 2GQIA 1JYQA 4OHDA 1O4DA 2LCTA 2GBQA 2RORA 1U06A 3NGPA 5I11A 5FW9A 4IIMA 4ROJA 1OV3A 2F2WA 1X2KA 3TKZA 2OJ2A 1D1ZA 3K2MA 5FWCA 2DLYA 3EG2A 4K11A 1QADA 3FJ5A 2KROA 2J6KA 3SHWA 4F16A 2FRYA 4GWFA 1G2BA 3UF4A 2DRKA 1UURA 4L1BB 4A4BA 4F5BA 1ZLMA 3VROA 2W10A 1BHHB 4RTXA 2ECDA 2LZ6B 2CH4A 2EU0A 5EELA 5HKYA 1W70A 3CQTA 1AYBA 1NG2A 4RUGA 1FBVA 1GCQA 2BZ8A 2LJ0A 4Z8AA 5DC9A 1CKBA 1JQQA 1K4US 2K79B 4FL3A 3C0CA 1YCSB 2A08A 5IH2A 1YN8A 1M3AA 4IIOA 5DC4A 4Z88A 1QWEA 2EYYA 2VKNA 2KYMA 2MRKA 2JM9A 3VS3A 1BLKA 4WCIA 2DYBA 4RTTA 2K7AA 2EYVA 1QKWA 1W1FA 5AXIA 1CSYA 5AULA 1JO8A 4RTUA 2L3SA 1KIKA 5IBSA 4AG2C 3CBLA 3EAZA 1UJ0A 1F1WA 2KRNA 5HKZA 2KK6A 1SPKA 1R1SA 2K3BA 1M3BA 2O31A 2O9VA 2KR3A 1FBZA 5D0JA 1BFIA 5IXFA 2YU7A 2CUBA 1NLPC 2YSQA 2CSQA 3S8OA 1H92A 1PWTA 4OHIA 1SKJA 1GCPA 2CSIA 3ULRB 4X6SA 3WA4A 1O4BA 2DL7A 4M4ZA 1JU5C 3A98A 4AFZC 2DBMA 3TVTA 1WXUA 3EG0A 1WQUA 3MAZA 4AFUC 2OI3A 2ETZA 2YUPA 3PVQA 3MXCA 1TCEA 4E68A 2FPEA 3EHQA 1D4TA 4AFSC 3EG3A 1O4JA 1E6HA 1O47A 1M8MA 2RMXA 3BUXB 1UUSA 3VRPA 1MV0B 3GQIB 2L6KA 3NPFA 1O4IA 1AZEA 1FU5A 1K76A 1ZX6A 1M61A 2PNIA 2DL8A 1RLPC 3TSWA 1WYXA 2ABLA 1YP5A 1CKAA 2EW3A 2CI8A 2IUGA 3BKBA 4DGPA 3VS6A 2AZSA 2MIOA 1HD3A 2IIMA 1YVHA 1BLJA 4ESRA 1N5ZA 3GBQA 3VS4A 2CT4A 4QT7A 1SPRA 4P9VA 4CC7A 1O4AA 3I5RA 4J9FA 1LUIA 4E93A 1AVZC 4HXJA 1UTIA 3I35A 2KRMA 1RI9A 2I0NA 2HDVA 2ED0A 1QWFA 3OB2B 2J7IA 2HMHA 1A09A 4OHLA 1JYRA 4XZ1A 2YUQA 1WFWA 1YNZA 1O4OA 1WXBA 1ARKA 3TL0A 1XA6A 1OPLA 2A28A 1IO6A 2FRWA 5IXBA 2EQIA 1WLPB 2RQWA 2DX1A 1B3QA 2FCIA 1LCKA 4HVUA 4AG1C 4GPLB 1CSZA 4GL9E 1BHFA 1VYUA 3VS1A 1BKMA 1UHFA 2DRMA 2BZXA 2MCNA 4OMMA 2AKLA 4DEYA 5BO4A 1WXTA 2K6DA 2DJQA 5IHKA 1AEYA 4WWQA 4HCKA 5ECAA 4GLMA 2GTOA 1BG1A 4EIHA 2ECZA 3NMZC 1Z3KA 3THKA 1FMKA 4A4CA 4CC3A 2NWMA 1RLQC 3HCKA 5DF6A 2XMFA 5HKWA 3O5ZA 2D8JA 2LQNA 1K1ZA 1K0XA 2VWFA 4JGHA 2C0TA 1PKTA 1MUZA 1AOTF 1AYDA 1JEGA 1H3HA 2HUWA 1O4KA 1D4WA 2SRCA 3N84A 4FSSA 3PVLA 1H9OA 2LJ3A 2EO6A 2FEIA 1I3ZA 4H1OA 4K2RA 1AOUF 2V1RA 1NYGA 1RUWA 3H0FA 1LUKA 1U5SA 5KAZA 5CDWA 1QCFA 1LKKA 2OQ1A 3BUNB 4JZ3A 2GGRA 2LX7A 2EGCA 2XP1A 3VRRA 1M3CA 1FHSA 1GCQC 2D1XA 4JJCA 4LUDA 2NUZA 2RVFA 2CH4W 2EGEA 1SRMA 2H46E 4F59A 4K45A 2KE9A 2MK2A 2DBKA 1AOJA 4J9IA 1ZUUA 2JXBA 1KFZA 1M27A 1GRIA 2BTTA 2HSPA 3OP0A 1HCTB 3IN7A 2KEAA 3GXXA 3M0TA 2CREA 3U23A 1IJRA 5DC0B 2K9GA 1WDXA 3H0HA 1X6GA 2QMSA 2VVKA 4RTVA 2LNHB 2A37A 1O45A 1VYTA 2GTJA 2H5KA 2YUNA 4EY0A 2JS0A 2KGTA 1X6BA 4J9EA 1O48A 1O4RA 3UA6A 2RQTA 4D8DA 1PKSA 3TSZA 1NZVA 2DNUA 1SPSA 2KNOA 3M0RA 2YT6A 1P13A 3CWGA 2KT8A 1O42A 1WA7A 5GJVB 1UE9A 1O4QA 1A1BA 1O4FA 3PJPA 3I5SA 1Z9QA 1RPYA 2CR4A 3EGUA 2EL8A 1EFNA 2MC1A 1PICA 3GXWA 2ENMA 4QSYA 2RQUA 4OHEA 4X1VA 1Y57A 3IQLA 1CWEA 1BM2A 1NLOC 3PS5A 3VRQA 1T0JA 2OAWA 3VRZA 1HSQA 1O4NA 2DE0X 2LQWA 1E7OA 2GNCA 3CXLA 4JE4A 3S8LA 2F2XA 1AYAA 2HDAA 2LMJA 1A0NB 3HHMB 2J6FA 1ZSGA 4LNPA 5IHIA 1JXOA 2YSXA 1WX6A 1ZBJA 4NWGA 1R1PA 1GFDA 1TUCA 1PHTA 2O2OA 1SHBA 4XZ0A 2EVRA 4F14A 3CD3A 2L3TA 2K7AB 1SEMA 3VS2A 1U3OA 1FYRA 1J3TA 1OO4A 2DL4A 1LCJA 1O4PA 2ED1A 1H8KA 1AD5A 3IMDA 1T3LA 1BB9A 2RSYA 2KXDA 1O4CA 2PNBA 1O4HA 2EPDA 1BF5A 1MILA 1O4EA 2RMOA 4CC4B 1A1EA 2FG0A 2AOAA 2EBPA 3PSJA 1KA7A 4DGXA 2CDTA 2DF6A 3KFJA 4Z89A 1A81A 1SHAA 4DEXA 5I22A 2FPDA 4JJDA 1NRVA 2KXCA 1F2FA 1OO3A 2LJ1A 1X6CA 3KFVA 1BMBA 2AUGA 3EHRA 1NEBA 5EEQA 3M7FA 1SHFA 2C0IA 1O4GA 3BUMB 2J05A 1UHCA 2DILA 2KBTA 1A1CA 1ZUYA 2G6FX 1NM7A 2AZVA 4LUEA 2FO0A 4ORZA 5GJWB 3IN8A 1V1CA 2DLPA 2H8HA 1LUMA 1X43A 2JM8A 2AOBA 2W0ZA 1BFJA 1CSKA 1TG0A 1UDLA 2E5KA 1O49A 4OMQA 1UJYA 2QDLA 5HCKA 1RJAA 2CI9A 1ABQA 2JW4A 3N8MA 1KSWA 2CS0A 3ZL7C 2CIAA 4OMOA 1FYNA 3REBB 1WI7A 1M27C 2KT1A 5EG3B 4ZNXA 4JEGA 4OMNA 4F17A 3US4A 2O88A 4J9GA 1LUNA 3VS5A 3UATA 1UFFA 4JJBA 1I1JA 3C7IA 3QWYA 3M0UA 1NZLA 2EKXA 2LP5A 3HIZB 1ABOA 2L0AA 1PNJA 2X3WD 1X0NA 2KYBA 2MOXA 5IBMA 2HBWA 4J9CA 1BHHA 2J6OA 2D0NA 2L2PA 3H0IA 2ROTA 1BBZA 2D8HA 1JWOA 2CBLA 2K79A 1R1QA 2CRHA 2HDXA 2PNAA 3S8NA 4TZIA 1Y0MA 1E6GA 2LNXA 2L4KA 3BUWB 2RNAA 3VRNA 1T3SA 2L3QA 4D8KA 1FU6A 2IUIA 1AWXA 1QG1E 2LNWA 1PRMC 2MQIA 1O41A 4K44A 1AZGB 4RTWA 1OOTA 4JPBW 2EOBA 3EACA 4J9DA 4FL2A 4F5AA 2JTEA 4J9BA 1UGVA 2Y1MA 2DL3A 2EGAA 3REAB 4OMLA 2V1QA 1KJWA 1QKXA 1JYUA 1TZEE 4KRTA 4Y92A 4P9ZA 4J9HA 3SEMA 1GL5A 3OB1B 4NWFA 3RNJA 3H41A 5EHRA 2AKKA 1GFCA 1GBQA 1PRLC 1UECA 2EYXA 2VIFA 1AWJA 2PTKA 4R0KA 2JMAA 2PLDA 3NHNA 2OZOA 1WIEA 1JXMA 1O4LA 2EYWA 4OMPA 2AK5A 2RQRA 3OV1A 1X69A 2DX0A 2X3XD 1UUEA 1NYFA 4RTZA 3N7YA 1AWWA 1CJ1A 3UYOA 1MW4A 1A1AA 5GJHA 1MV3A 2KNBB 2YUOA 5EC7A 1VA7A 2JMCA 2A36A 1AWOA 2B3OA 1O4MA 4H34A 2ROLA 2CUDA 1M30A 4AFQC 4GBQA 3PQZA 2GSBA 2PLEA 1SSHA 1B07A 1O44A 5EHPA 3PLFB 1A08A 5GJIA 5J3XA 1K0SA 1I07A 1X2QA 3T04A 3ZNIA 3UA7A 2O9SA 2CT3A 2SHPA 2JYQA 2JT4A 1W6XA 1SHDA 1HCSB 4CC2A 5L23A 4RTYA 1AYCA 4E6RA 3VGOA 1UG1A 1G83A 4LE9A 2SEMA 3LH5A 3I9QA 1YWPA 2DM0A 2DM1A 3IMJA 3BUOB 2P4RA 1SHGA 2RPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IHNA 3VRYA 1SF9A 2XG8D 2C9WA 4OB2B 2RQVA 4LDYA 2DVJA 3QJ6A 1KQSP 1QVFS 2CZ7B 2FVUA 1QLYA 3QBYA 2QEXQ 3OVEA 1BKLA 2B86A 3E19A 2J06A 1YITQ 2P0QA 4OHHA 1IS0A 3TEEA 3A8MB 1IHWA 2K5FA 3M0PA 1MMDA 1GBRA 2X35A 1A07A 5GAMe 4M7DB 1ZUKA 2LCSA 3MO8A 4FW2A 1MGQA 4ZGEB 2JS2A 4JRQA 1BI1A 5C6SA 2OX7A 3QWXX 4EDUA 1OPKA 1CWDL 1S1NA 2DA9A 2RI3A 5HKZA 1T0HA 1KQ2A 2EYZA 5L8RE 3GIBA 1GHUA 2HL5C 1VQPA 1H641 2MAMA 2KGYA 4JZ4A 3PSKA 1ZSZB 3EG1A 1VQ9A 3PMIA 2A3LA 4OHDA 4B9XA 3E2UA 1WHLA 3MKDA 4IIMA 3OYAA 3I55A 5GAOr 4N4HA 4ME7A 2F2WA 2C06A 2OJ2A 1D1ZA 1R0BG 1MMGA 5LJ5h 5I2SA 3FJ5A 1OZ3A 4PK4A 2KROA 1YHQA 1TH7A 1C6VX 2FRYA 1G2BA 4A4BA 3INZA 1LOJA 1BIAA 3X20B 2K3XA 4RTXA 4NS5A 1M1FA 4F04B 4Z8AA 5GAOn 1M3AA 1TU0B 4Z88A 1QWEA 2EYYA 4M78G 1BLKA 4WCIA 3KUFA 5DLQE 2K7AA 3MEUA 3CCST 1K9MU 2EYVA 1W1FA 3FDRA 1VQ7T 5AXIA 1CSYA 4RTUA 1KIKA 4QQ6A 3VRQA 2KI7A 3CCLT 1SPKA 2KK6A 2QDYB 3NTHA 5IXFA 3CCRQ 1VIFA 1PWTA 3HRTA 2OTJA 4D6WA 2NUTA 4OHIA 1GCPA 2CSIA 3CC2T 2DL7A 3OYJA 3JB9G 1MHNA 3OYNA 4WTOB 2FZKB 5FU6B 1WHJA 1OI1A 3OW2S 4B6MA 3PVQA 3OYGA 5KYXB 4E68A 4GY5A 1E6HA 1K73R 3BUXB 3FLGA 3QG1A 3GQIB 2VXEA 1FU5A 1K76A 1ZX6A 3LW5E 1FMVA 3I56T 2DL8A 1RLPC 2B8AA 3CBPA 1R8OB 1Q7YR 1QP3A 1IZ6A 2QXFA 5LL6S 1N5ZA 2XDBA 3GBQA 2QAZA 4P9VA 3G71T 1SPRA 3CC4A 4CC7A 2XDDA 1AVZC 4HXJA 2KRMA 3URGA 2O01E 4FT2A 1YIJQ 4HKEA 4C92A 4A4GA 2F5KA 1YNZA 1O4OA 1ARKA 5GMKl 1KQSS 1LCKA 4HVUA 2V26A 3V8KA 4F7UA 2CYZB 4BACA 2EWNA 3VS1A 1BKMA 2VGMA 2DIGA 2KY9A 3P8DA 1WXTA 3QZ5B 3CCSQ 1U8RA 1VQ7Q 4EIHA 3CCQA 1FMKA 1QW1A 2NWMA 1H3ZA 5DF6A 2XMFA 5HKWA 1K1ZA 4PJMA 2VWFA 2YRVA 2C0TA 1PKTA 1GXIE 4H1OA 5KYUA 1H9OA 2MWPA 1PG5B 4LDXA 3CC2Q 1AOUF 1VQKA 3H0FA 5CDWA 4AMCA 3DKMA 1M3CA 3SDZA 2EGEA 2H3EB 1IXDA 3SFMA 2LC4A 4ANJA 4K45A 2KE9A 2DBKA 3V7CA 4J9IA 1WZOA 2JXBA 3UDCA 3CD6T 2CREA 2Y4XA 2DXUA 5DC0B 2VVKA 1LJOA 4RTVA 1VYTA 2CGHA 2GTJA 2KGTA 2CP7A 1O48A 1O4RA 3UA6A 3G71Q 2FYKA 2DNUA 1SPSA 2HQHA 3M0RA 3OYMA 4XTYA 1W2BA 1UGQB 4NOYA 5HK0A 2LCLA 1UE9A 1G3SA 3SWNC 3PJPA 2CZ1B 3CMEQ 2NUPB 3I5SA 2MC1A 2EL8A 1EFNA 4QSYA 2RQUA 2RHZA 3IQLA 1D09B 1WPYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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