2LQNA

Solution structure of crkl
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAYAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Crk-like protein
total genus 52
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqnA01
1D1ZA 2ECDA 3I5SA 1O4CA 1LCKA 2JW4A 1NRVA 2PNIA 1KIKA 2BZYA 2DX1A 1ZUUA 2DILA 3N8MA 4X6SA 1A09A 5D0JA 1GRIA 2CDTA 1RQQC 3PS5A 2PNBA 5FWCA 3TSWA 3VS5A 2FPFA 5IHKA 4M4ZA 1AEYA 3HIZB 2A28A 4AFQC 4OHLA 1KFZA 1FBZA 1PICA 3CWGA 3H41A 2CRHA 1AYBA 1GBRA 3BUNB 2PTKA 1O4HA 1JXMA 2EW3A 2GNCA 2O9SA 1BKMA 3TVTA 2H5KA 1W6XA 4LE9A 4RTTA 3CBLA 3IN7A 4GLMA 2IZVA 2GBQA 1ARKA 1AOTF 1MV0B 1M30A 2LP5A 3EGUA 3CQTA 2D8HA 4A4BA 2J06A 2K9GA 4DEXA 1T0JA 2CH4A 3IMDA 1UUEA 2ROTA 3U23A 5EEQA 2LJ3A 2HDXA 3UYOA 1CSKA 1H92A 2C0OA 4Z89A 2AUGA 1QCFA 1HJDA 1FBVA 5AULA 1CSYA 4EY0A 1RLQC 1TG0A 1X69A 3M7FA 3VS2A 4FBNA 3EG3A 2VIFA 5J3XA 1P13A 2KRNA 1K4US 4JEGA 1SPKA 1R1PA 1R1QA 2X3XD 2MRKA 1WXTA 2DBMA 2SEMA 4CC7A 2FPEA 1BHHA 3NGPA 2EKXA 2IIMA 4OHDA 1O4BA 3TKZA 1UECA 2W10A 2HDAA 1IS0A 1BLJA 5HCKA 4GL9E 2J6KA 2BZXA 2L3QA 2O2OA 1PRLC 2B86A 4QSYA 1KC2A 1M27C 2KYBA 3EG0A 1X6CA 2RVFA 4XZ1A 1WA7A 2DA9A 1FMKA 2CI9A 1WFWA 2G6FX 4CC2A 4AFSC 1QLYA 3GXXA 2ETZA 1WX6A 4EIKA 2CUBA 4OHHA 1LKLA 1Z9ZA 1E6HA 3WA4A 1O4LA 5EHRA 2LQNA 1VYVA 2HEQA 2LNWA 1SRMA 2CT3A 2FO0A 2BBUA 2MK2A 2LMJA 4Y92A 3VS3A 1G83A 5I11A 4IIOA 4X1VA 1NZLA 1PNJA 3K2MA 1YNZA 2GQIA 4LN2A 1JYUA 1QKWA 2OI3A 2QDLA 4KRTA 1PWTA 1O4JA 1O4FA 2LJ0A 2VVKA 4AG1C 4H34A 4JZ3A 3EACA 2MOXA 2A08A 2ED0A 4HVUA 1BKLA 3GBQA 4P9ZA 1BFIA 1FU5A 1ZUYA 3EHRA 1I07A 2AOAA 1RPYA 1RI9A 3VRNA 5CDWA 2EL8A 4ROJA 1BF5A 5HKYA 2RMOA 2SHPA 2OAWA 2KT8A 1ZSGA 1FYRA 1JXOA 1O49A 2K79B 1GBQA 4OMMA 3OVEA 2FCIA 2DM1A 3QWXX 1JYQA 2MCNA 1O4GA 1YVHA 3VS1A 1AWJA 3PVLA 1NM7A 3UF4A 5HKWA 4EIHA 2DL8A 1ZUKA 1NYGA 1BLKA 1M3AA 2EGEA 1AD5A 1RLPC 2LZ6B 1O4IA 3RNJA 2RN8A 1FYNA 1WQUA 5BO4A 4DEYA 1A07A 2DE0X 2L4KA 4GBQA 2GE9A 1AWOA 3M0QA 5DC9A 2EGCA 1LUIA 2K7AA 1AWXA 1GFDA 3VROA 1XA6A 1MILA 3A98A 4OMOA 1UUSA 4DGXA 2ESWA 1HCSB 2KEAA 1PHTA 4F59A 2CUDA 1RJAA 3ZL7C 1OOTA 2OJ2A 2V1QA 3BUWB 3US4A 1VYUA 2J6FA 1O4NA 2OQ1A 2MQIA 3REBB 2KR3A 1M8MA 2IUGA 2HMHA 2CR4A 4RTUA 1ABQA 3PSJA 2PNAA 4WWQA 2X3WD 1JQQA 1LCJA 2GSBA 1JWOA 2O88A 1HCTB 2RQWA 3NHNA 4K44A 4K45A 1D4TA 1H3HA 3BUMB 3VRPA 1HD3A 3ULRB 4WCIA 4NWGA 1GCQC 2PLEA 2DL7A 2JT4A 1GCQA 1NEBA 1CSZA 3PQZA 1O47A 1KJWA 2JM9A 4RTXA 1JYRA 2K2MA 4NWFA 2NUZA 3PFVA 1K9AA 1PRMC 2YUPA 2KK6A 4J9CA 1BU1A 1W1FA 5GJVB 1A81A 1O45A 2YSXA 3M0SA 1VA7A 1O41A 1O4KA 3H0FA 2BZ8A 2DCRA 2AZVA 3S8OA 1HSQA 1UE9A 1F2FA 4U17A 3S8NA 2I0NA 3PLFB 4JJDA 1LKKA 3TL0A 4D8KA 2A36A 2DRMA 2LCSA 1O42A 2L3TA 2D1XA 2EO6A 3C0CA 4J9EA 4OHIA 1X2KA 1SKJA 1AWWA 2LQWA 2ROLA 2EVRA 3VS4A 3QWYA 3MXCA 4OHEA 1AZEA 1SSHA 2RF0A 3VRRA 1YWPA 1U3OA 1X6BA 3PVQA 2DL4A 2KYMA 4J9BA 2YUQA 1WXBA 1QG1E 2XMFA 1Y0MA 3FJ5A 3H0IA 3HCKA 4DGPA 4RTWA 2P4RA 3I9QA 4JJBA 2PLDA 4XZ0A 1GHUA 2F2VA 2AZSA 2PZ1A 1SHGA 1U06A 1E6GA 1IJRA 1M27A 4A4CA 2CT4A 2EKHA 1SPSA 2QMSA 2Y1NA 3KFJA 2DLPA 5IHIA 2YDLA 2K6DA 2JS0A 1UJ0A 4HVVA 2DMOA 3RBBB 1CJ1A 1Z3KA 1GCPA 2CSQA 5EG3B 5EC7A 2JXBA 3R6NA 1O46A 5IBMA 4TZIA 3H0HA 1Y1UA 2L2PA 2LNHB 1O48A 1MUZA 2EPDA 1LUNA 1K1ZA 1A1EA 2B3OA 1CWDL 2EYXA 4JE4A 1I1JA 5AXIA 4E93A 3CD3A 4F16A 2KNOA 1S1NA 3I5RA 2GTJA 2C9WA 2CIAA 2EOBA 3IN8A 1TCEA 1G2BA 3HHMB 2RQUA 3EHQA 3IMJA 2DF6A 4CC3A 3OB1B 3UATA 4ZNXA 2AOBA 2JYQA 1BHFA 1M61A 1JEGA 4Z8AA 2DJQA 1SEMA 1LUKA 3JV3A 2L3SA 1OO4A 1B3QA 4RTVA 2ENMA 4AG2C 2KXCA 3PE0A 1FU6A 3NMZC 5EHPA 2W0ZA 3N7YA 2DYBA 5GJIA 2LX7A 3S8LA 1WIEA 2VWFA 2O31A 1O4EA 1D4WA 1Z9QA 2KE9A 4J9FA 3VS7A 1BHHB 1W70A 2DBKA 4J9DA 4LUEA 1AOUF 1WDXA 1UURA 2Y1MA 5HKZA 2CS0A 1JU5C 1A1AA 3M0UA 1NLPC 1O4RA 4GWFA 1JU5A 4FL3A 1UDLA 1AYAA 2XP1A 2FG0A 2DRKA 4E68A 3PSKA 4GPLB 2L3PA 3M0TA 4R0KA 1K0XA 2D8JA 3C7IA 1BB9A 2JTEA 1I3ZA 1SPRA 1T3LA 4FL2A 1ZLMA 1YN8A 2CREA 4RTZA 2Y3AB 5IH2A 1Y57A 4JPBW 3UA6A 2EYZA 2EYYA 1PKTA 1QKXA 1ZBJA 2NWMA 2V1RA 5L23A 1AYCA 4CC4B 1F1WA 1H9OA 2SRCA 1AZGB 5IHNA 1WLPB 1O4QA 1SHFA 1ABOA 2F2WA 1YVLA 1O44A 3N84A 3SEMA 4K2RA 3OV1A 2AK5A 1KSWA 4F5AA 1KA7A 1O4OA 3M0RA 2KRMA 2KRSA 3I35A 2H46E 2K3BA 2ECZA 3PJPA 1H8KA 4RUGA 1JO8A 2FEIA 2YT6A 3O5ZA 4K11A 1WYXA 1IO6A 2DNUA 3EG1A 1SHAA 3BKBA 2RMXA 4Z88A 2AKLA 1MW4A 3VS6A 1ZX6A 1LUMA 3SHWA 1I0CA 4OMPA 1AB2A 4FSSA 2EQIA 2KXDA 2JMCA 5IBSA 3T04A 1M3BA 3VRYA 2JS2A 2EU0A 1TUCA 1A08A 2MRJA 4HXJA 2FRYA 4LNPA 4RTYA 1OEBA 1T3SA 5KAZA 2EBPA 4F5BA 2L0AA 4ESRA 1O4AA 2VKNA 2J7IA 1X6GA 2L6KA 1NLOC 2F2XA 1B47A 1QWFA 1B07A 1YP5A 4J9GA 1A1CA 3BUOB 3LH5A 2EO3A 1UFFA 1OPKA 2M51A 3NPFA 1QADA 2KROA 1O4MA 5DF6A 4D8DA 4U1PA 2J6OA 1SRLA 1X2QA 5FWBA 3TSZA 1A0NB 4F17A 2K79A 2A37A 3BUXB 1SHBA 1K0SA 2DLYA 1KA6A 4J9IA 1UG1A 2O9VA 2BTTA 4JZ4A 2IUIA 4HCKA 1O4DA 1AVZC 4E6RA 2DL3A 4F14A 1TZEE 2OZOA 2CBLA 4IIMA 1BBZA 2K7AB 1BG1A 1QWEA 1XOVA 2C0IA 2JM8A 4QT7A 5FW9A 1OO3A 2DX0A 1CKBA 2YU7A 2KT1A 5GJWB 2KBTA 2M0YA 2RQRA 2DLZA 3IQLA 5DC4A 4H1OA 1GFCA 2H8HA 1NEGA 1X27A 2C0TA 2CH4W 1A1BA 1MV3A 1YCSB 2RQTA 2HUWA 2HDVA 3ZNIA 2MC1A 1R1SA 1NG2A 2GTOA 1V1CA 2FPDA 1NYFA 1CKAA 3CXLA 3MXYA 4LUDA 1EFNA 2CSIA 1GL5A 3VRQA 2HBWA 3M0PA 4AFUC 2ABLA 5IXBA 5GJHA 1RUWA 2RQVA 1BFJA 4L1BB 1WXUA 3VGOA 2EGAA 3EG2A 3THKA 3REAB 4OMLA 3KFVA 1E7OA 2FRWA 2ED1A 4JGHA 2JMAA 2YUOA 1J3TA 2LCTA 2D0NA 1FHSA 1PKSA 2IUHA 1UHFA 5IXFA 2CI8A 2E5KA 1VYTA 4J9HA 2GGRA 4ORZA 2HSPA 1T0HA 2YUNA 2YSQA 3GXWA 5ECAA 3VS0A 1O4PA 1BM2A 1UTIA 4AFZC 5I6VA 1K76A 2RPNA 2RSYA 4OMQA 5I22A 1UJYA 3UA7A 4OMNA 2EYVA 5EELA 1AYDA 1BK2A 1CWEA 1M3CA 1UHCA 1SHDA 2DM0A 4P9VA 1OPLA 1AOJA 3GQIB 2EYWA 2DVJA 2AKKA 1N5ZA 1U5SA 1NZVA 2KGTA 3OB2B 4HVWA 2RNAA 1X43A 4JJCA 1X0NA 3S9KA 3MAZA 1TUDA 3VRZA 1ZFPE 1O43A 2MIOA 2HCKA 2J05A 2RORA 2LNXA 2LJ1A 1OV3A 1YWOA 2KNBB 2DL5A 4A63B 3EAZA 3OP0A 1BMBA 5DC0B 1WI7A 1UGVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2MAMA 2VASA 2BZYA 3JCMd 4MZPA 1EX4A 3M54A 5FWCA 3HIZB 4M4ZA 3OW2P 1PICA 1GBRA 3BUNB 2QG9B 4OF1A 2A3LA 2O9SA 3TVTA 4LE9A 4A54A 1BIAA 2EQJA 1G3YA 1K9MU 1V76A 1ARKA 3X28B 3CCLQ 1OZ2A 3PT9A 2X35A 3OS2A 2J06A 2YLCA 3DB4A 3A5ZB 3QIIA 3CCMQ 2K9GA 4DEXA 3CMEQ 2ROTA 2LJ3A 3CPWA 1WQWA 1M2VA 3C12A 1H92A 2C0OA 3CCLA 3S6WA 2B8AA 2AUGA 3AT1B 1CSYA 3JCMX 1RLQC 3CCMA 2VIFA 1IRXA 3CMEA 2PUKB 1P13A 3QUIA 2HD0A 2I2LA 2CZ6B 5LJ3g 1OX8A 1B34B 1R1QA 1SSFA 4OHDA 2EKXA 2KMTA 4LDXA 1BLJA 4A4GA 4GL9E 2L3QA 2B86A 4QSYA 1ZA1B 3EG0A 5GANg 5M9OA 3E9FA 2F5TX 2G6FX 1QLYA 5CAIA 3OYJA 3QPHA 1LKLA 2E3HA 4F7UE 3WA4A 3TCJA 4FYXB 2XD0A 1O4LA 5EHRA 1YJNQ 4PK4A 4Y92A 5I11A 3S3MA 3V7SA 1QVFP 4PNOA 1PNJA 4M7DF 3OYCA 1Q81U 4LN2A 5GANh 4OVAA 3VUZA 1JYUA 1YCYA 5DM7R 1G5VA 1ZHIA 4KRTA 1PWTA 1O4JA 3CEYA 2LJ0A 4H34A 3RR6A 1YJNA 1U8RA 3VRNA 3V8JA 4F7UG 5A0GA 1ZSGA 1FYRA 4KGXB 2V8KA 3OVEA 2DM1A 3QWXX 1JYQA 4PJOD 3VS1A 2VXEA 3UF4A 2DL8A 1KQSA 2EGEA 2M1HA 1O4IA 1JJ2A 1N6AA 1K8AR 2EQUA 4JRIA 1RABB 4B9XA 4DEYA 1AWOA 4E7IA 2EGCA 2K7AA 1O75A 1AWXA 2DZ9A 3A98A 3NTIA 3CCVT 1UUSA 4DGXA 1HCSB 5I2SA 4RKUE 1RJAA 3ZEHA 3ZL7C 1KC8R 3MEWA 2FVUA 2J6FA 3BDUA 4JRQA 2MQIA 1WHGA 1W2BA 2CR4A 2RK1A 1ABQA 1BKBA 1D09B 1LCJA 4IKFA 1JWOA 4PLIA 2RJFA 2RQWA 2O88A 1H3HA 1EZZB 3BUMB 2ZPGB 4BE1A 3OS0A 2HZYA 1O47A 2JZ2A 1K9AA 1PRMC 5GJVB 1O45A 1KQSS 1VA7A 3TEEA 3H0FA 2BZ8A 5GAMe 2DCRA 2P4TA 5GAMg 1JJ2S 4U17A 2I0NA 1Q7YR 4J83A 4DBHA 2GQVA 2A36A 2CZ0B 3UWNA 2LCSA 3G4SQ 1VQNT 1V29B 1YJWT 4RG2A 1SKJA 2ROLA 2X4XA 2EVRA 3VS4A 4OHEA 3FEOA 5GAN6 4M7DE 4A53A 1SSHA 3VRRA 3V7CA 1X6BA 3EFOB 1WXBA 2XDBA 4RTWA 4E7KA 3G4SA 3HL8A 1GHUA 3VJPA 1W2BS 2CP3A 1SHGA 3EH1A 1M27A 4ZN1A 4C5GA 1K9MC 3KFJA 2DLPA 3I56T 1RAFB 2DK3A 2JS0A 3CC2Q 1UJ0A 2VV5A 2DPPB 1GXIE 3E1SA 3WVDB 4OGCA 4M7DG 1Z3KA 2CSQA 5FU6B 3OBYA 4Y91A 5EC7A 3MO8A 3H0HA 2LNHB 3CC2A 1O48A 1MUZA 1LUNA 1K1ZA 1WHKA 1ACMB 4FW2A 5KYWB 1CWDL 3QG1A 1I1JA 2KNOA 4M7DA 2QQBA 4M78B 5FROA 1VIFA 3HHMB 1WGSA 3IMJA 2OX7A 2OTLT 2DF6A 4CC3A 3OB1B 2K3XA 2AOBA 2JYQA 2EKOA 3FIFA 5CVIA 4EMKB 4M7AG 1JEGA 4HCCA 3GNFB 3PFSA 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4OMLA 2NUPA 1E7OA 2C06A 5J26A 3D7SB 4BD3A 1QVFA 5IXFA 2CI8A 2IUHA 4J9HA 4DBQA 1RAHB 2HSPA 1T0HA 3JB9D 4PJOC 2EJFA 2KAFA 3M56A 5GMKl 4FM4B 4PJOA 5I6VA 3HP9A 2P0PA 3FC3A 3OSVA 5LJ3f 1TXQA 4OMNA 5EELA 1BK2A 5GAOp 3QJYA 2YRCA 1M3CA 4E7JA 1SHDA 2DM0A 4P9VA 3MP8A 1AOJA 3GQIB 4J7IA 1PM3A 2EYWA 3MEUA 2AKKA 4FCYA 4PFPA 2KGTA 3CCVQ 1UGQB 1LNXA 2XK0A 3HRUA 4BACA 1ZFPE 2WSFE 1I4K1 5GANf 3MP6A 4JDSA 1YWOA 1R77A 2DL5A 1D3BA 1WI7A 2M02A 2D6FA 3CCVA 3I55T 5GMKj 1D1ZA 1IREB 1QMCA 3OS1A 3RKWA 1LCKA 1NRVA 1VQKT 3N8MA 4X6SA 3MKDA 4JRPA 3TSWA 5IHKA 1UEBA 2A28A 3FRNA 3M4GA 4IUTA 2LTOA 2WSEE 1QVFS 3CWGA 2NYSA 2A0FB 3R6OA 1O4HA 2GNCA 3EAEA 2H5KA 1W6XA 1AT1B 1S72T 4RTTA 1WHHA 2KDSA 4A4FA 1VQNQ 1KG1A 1YJWQ 4A4BA 5KYXA 2LNVA 4BI4A 3CCQA 1TU0B 2ZPFB 2RHUA 4MDWA 4ATOA 1VQNA 2YLBA 2CKKA 1YJWA 1MNEA 3BY7A 3L2RA 4FBNA 3LYVA 3EG3A 1WJSA 5GAN7 1K4US 1D0XA 4PJMA 4JEGA 1VQ6T 1Y96B 3I56Q 1O9SA 2X3XD 3EH2A 4J7FA 1BCMA 1WXTA 3LGFA 3A8HB 2DBMA 2SEMA 4CC7A 1BHHA 3NGPA 1O4BA 4X9DA 3EGXA 3OYNA 5HCKA 3LWIA 2J6KA 3DLMA 2BZXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1BFJ A;  4L1B B;  1WXU A;  3VGO A;  2EGA A;  3EG2 A;  3THK A;  3REA B;  4OML A;  3KFV A;  1E7O A;  2FRW A;  2ED1 A;  4JGH A;  2JMA A;  2YUO A;  1J3T A;  2LCT A;  2D0N A;  1FHS A;  1PKS A;  2IUH A;  1UHF A;  5IXF A;  2CI8 A;  2E5K A;  1VYT A;  4J9H A;  2GGR A;  4ORZ A;  2HSP A;  1T0H A;  2YUN A;  2YSQ A;  3GXW A;  5ECA A;  3VS0 A;  1O4P A;  1BM2 A;  1UTI A;  4AFZ C;  5I6V A;  1K76 A;  2RPN A;  2RSY A;  4OMQ A;  5I22 A;  1UJY A;  3UA7 A;  4OMN A;  2EYV A;  5EEL A;  1AYD A;  1BK2 A;  1CWE A;  1M3C A;  1UHC A;  1SHD A;  2DM0 A;  4P9V A;  1OPL A;  1AOJ A;  3GQI B;  2EYW A;  2DVJ A;  2AKK A;  1N5Z A;  1U5S A;  1NZV A;  2KGT A;  3OB2 B;  4HVW A;  2RNA A;  1X43 A;  4JJC A;  1X0N A;  3S9K A;  3MAZ A;  1TUD A;  3VRZ A;  1ZFP E;  1O43 A;  2MIO A;  2HCK A;  2J05 A;  2ROR A;  2LNX A;  2LJ1 A;  1OV3 A;  1YWO A;  2KNB B;  2DL5 A;  4A63 B;  3EAZ A;  3OP0 A;  1BMB A;  5DC0 B;  1WI7 A;  1UGV A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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