2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Crk-like protein
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
2Y1MA 2L3QA 2KGTA 2KROA 4OHLA 5KAZA 3VS3A 4HXJA 4D8KA 2FRYA 4AG2C 2GNCA 2C0IA 2L3SA 4NWFA 4OMQA 2F2VA 2LZ6B 1LUIA 1U3OA 3VRZA 2RPNA 5L23A 1FU5A 1O4QA 5J3XA 2K9GA 1BF5A 1WDXA 2KE9A 2ED1A 1O4DA 1O4KA 2OAWA 2DRKA 2MRJA 2GGRA 1M3AA 2O9VA 2YDLA 5HKYA 4JJBA 1M61A 4X6SA 3K2MA 2AK5A 2AKKA 1E6HA 4FSSA 4OMPA 1G83A 2RQTA 1QG1E 2ABLA 3HHMB 1QKXA 3NGPA 2LQNA 4P9ZA 4WCIA 2KEAA 2RF0A 2KR3A 4DGPA 1O4GA 1WX6A 2DM0A 3I35A 3NHNA 1QADA 1UHFA 1LCKA 2GTJA 1A1CA 3GBQA 1PICA 2F2XA 1W70A 1LKKA 3MXCA 1W6XA 1HD3A 4XZ0A 3GXWA 1AB2A 3OV1A 1ZUKA 1E7OA 1NM7A 2LJ1A 2VWFA 2PTKA 4JJCA 4LUDA 2DILA 1K1ZA 1ZBJA 2QDLA 1O4JA 1WXTA 1UFFA 1H9OA 1WI7A 1AEYA 1U06A 4J9GA 4H1OA 1J3TA 1UHCA 3GXXA 1JWOA 2O31A 3TVTA 1WYXA 3IN8A 1KA7A 1MV3A 2JXBA 3EG3A 2EYXA 1M3CA 2L3PA 1AYAA 1BFIA 3ZNIA 1VA7A 2DVJA 4CC4B 3CBLA 2L0AA 3O5ZA 1BHFA 2DL3A 1CWEA 1QCFA 3M0UA 1D4TA 1O4MA 2D1XA 3I9QA 1M27A 2JYQA 4DGXA 1RI9A 2HUWA 5EHRA 4JEGA 3FJ5A 1EFNA 3VROA 3N84A 1M27C 2DNUA 2B86A 2YUPA 1A1BA 1MILA 1O47A 2HDAA 1GL5A 4F5AA 1R1QA 1U5SA 1OO3A 5AULA 1JXOA 4K11A 4JZ3A 1SSHA 3UA6A 4EY0A 3NPFA 5DC4A 3PLFB 3BUXB 1XOVA 2C0TA 2AZVA 1RLQC 5IHKA 1IJRA 4OMMA 2DCRA 4FBNA 1NYGA 2DLPA 2K79B 2KNBB 3EG1A 1UJYA 5IHIA 5BO4A 4J9HA 1K4US 2JS2A 4AFSC 2RVFA 2P4RA 2LX7A 2DE0X 2JM9A 2ECZA 1HCSB 4GBQA 4TZIA 3HIZB 3TKZA 4E93A 2EGAA 1YN8A 3KFVA 3M0PA 3RNJA 1O42A 1FU6A 2H46E 1MW4A 4HVVA 3PJPA 1SHGA 4JE4A 3C7IA 4L1BB 2SRCA 4F16A 2E5KA 3IMJA 1AWOA 3UYOA 3PE0A 2YT6A 4RTUA 4F17A 2AOAA 1FBVA 2IUGA 2EVRA 3BUWB 1AOJA 1UDLA 2V1QA 3HCKA 1M3BA 2PZ1A 5ECAA 1AOUF 4K45A 4U1PA 1FHSA 2DA9A 2HCKA 4EIKA 2C0OA 1LKLA 1GFDA 2EOBA 4AFZC 2LNWA 2MRKA 1QWEA 4RUGA 4JPBW 1GRIA 1AOTF 1A09A 1JQQA 2KRNA 3S9KA 3THKA 2A36A 1O4FA 1X69A 3NMZC 2DBKA 2AKLA 1JYQA 2KYBA 2HEQA 2OQ1A 3QWXX 4OMLA 3VRYA 2KK6A 2YU7A 2J6KA 1O4HA 2EW3A 2K6DA 2RORA 2DBMA 3IQLA 4DEYA 1LUNA 2JW4A 2CSIA 2V1RA 5HCKA 2JT4A 4HCKA 2J05A 1Y1UA 2CH4W 3I5SA 2IUIA 2KNOA 2BTTA 1CSKA 1SPKA 2FCIA 1YCSB 2DF6A 4ORZA 1YNZA 4Z8AA 2ROLA 2DX1A 1VYVA 4R0KA 1F1WA 1OPLA 2CRHA 4RTZA 1TG0A 2YUNA 1O4OA 1FMKA 2CDTA 2ETZA 2J6FA 3TSWA 4OHDA 2L4KA 1SRMA 1WA7A 1WLPB 2KXCA 3GQIB 1KJWA 1KFZA 4Y92A 2L3TA 1NG2A 4OHHA 1Y0MA 4X1VA 3CXLA 5HKZA 1PHTA 1QLYA 4J9FA 3OVEA 2ECDA 1HSQA 2EYWA 2VIFA 1SHFA 4HVUA 2LNHB 2ESWA 4ESRA 4FL3A 4K44A 3VRNA 1SKJA 4JJDA 1P13A 2EYZA 2CUDA 2EYVA 4J9DA 2H5KA 1A08A 1O41A 1AVZC 1YP5A 1H92A 4J9CA 1D1ZA 3N7YA 1CSZA 4E68A 4E6RA 1HCTB 1Y57A 1LUMA 4JGHA 4RTTA 2NWMA 1X6BA 2FRWA 4NWGA 3CWGA 4QSYA 1X6GA 3EGUA 3PSKA 2DRMA 1A0NB 4Z89A 2CUBA 3VS1A 2FPDA 2L2PA 2M51A 1FYRA 3EHRA 3PVQA 2ROTA 1RJAA 5DF6A 3OB2B 3RBBB 5DC9A 3SEMA 2O2OA 1IO6A 2RQUA 1UTIA 2DMOA 2KXDA 2EO3A 3EAZA 1NLOC 5EHPA 2J6OA 2BZ8A 3BUOB 2DM1A 2K3BA 3PQZA 4AFQC 1A1EA 3VS4A 3VS0A 5I22A 3A98A 4GLMA 1I0CA 1YVLA 4ROJA 3VRQA 2EGCA 1O4PA 1R1SA 1OO4A 2CR4A 5EG3B 1WIEA 1H3HA 2IUHA 4M4ZA 1F2FA 1N5ZA 1YWPA 5HKWA 1HJDA 2RMOA 4Z88A 1I3ZA 4F14A 1CWDL 2RQWA 2DLYA 2VKNA 3VS2A 1JYUA 1VYUA 2DX0A 1K0SA 2SHPA 1AZEA 1NZVA 2DYBA 2MCNA 2H8HA 1TCEA 2FPEA 2PLEA 1QWFA 2M0YA 2Y3AB 3OB1B 3PSJA 1RQQC 4AFUC 1AWXA 2RQVA 4J9BA 1FBZA 2B3OA 1SPSA 1UUSA 3WA4A 3VRRA 3TSZA 2A37A 1CKAA 2MIOA 2NUZA 5IBSA 1GCQA 5DC0B 5IBMA 3UATA 2KRSA 4DEXA 2ED0A 1NYFA 2EBPA 1TZEE 2RN8A 1GCQC 1T0HA 3M0SA 1ZUYA 4A4CA 4IIOA 1SHDA 3OP0A 4LUEA 2C9WA 1NLPC 1RLPC 3I5RA 4LN2A 1BHHA 1BLKA 1O49A 1BK2A 4H34A 1RPYA 5FW9A 2XP1A 2DL7A 1GCPA 4D8DA 2O88A 1KSWA 4ZNXA 1VYTA 2DL8A 1JU5A 1I1JA 4LE9A 4OHIA 1SHAA 3EG0A 1JU5C 3H41A 1G2BA 1YVHA 1MV0B 2XMFA 1OV3A 2K7AB 1D4WA 2LMJA 1X2KA 2RQRA 1UG1A 2EU0A 2L6KA 1OOTA 2W10A 5I11A 1B07A 1ZUUA 3H0HA 2ENMA 3IMDA 4KRTA 2OZOA 2FPFA 2LQWA 1R1PA 4XZ1A 2CIAA 2OI3A 3ULRB 1SHBA 1GBQA 1NEGA 1JXMA 3UF4A 3VS6A 1Z9ZA 3PFVA 2DL5A 1SRLA 2YSXA 2GE9A 2O9SA 3U23A 5GJVB 2A08A 2EKHA 2YUQA 1AYDA 3S8LA 1OEBA 2MQIA 1M8MA 2K2MA 4EIHA 1AD5A 5IHNA 2OJ2A 1BG1A 1BU1A 2KRMA 3VGOA 1ARKA 2KYMA 2CI8A 1ZX6A 2D0NA 3M7FA 2EYYA 5EEQA 2JMAA 1O4BA 1ZSGA 2HDVA 1BFJA 2J7IA 1O4EA 1UE9A 3C0CA 1E6GA 2PNBA 3BKBA 5IXFA 2MC1A 1SPRA 1AZGB 4J9EA 3H0IA 5EELA 5AXIA 2KBTA 2CS0A 5IXBA 1O4LA 2A28A 5CDWA 2Y1NA 1GBRA 2CI9A 2YSQA 3TL0A 3S8OA 1CJ1A 2GSBA 2AZSA 2EO6A 2PNIA 1O4IA 2FO0A 2RSYA 2LP5A 1K0XA 4GL9E 3T04A 1JEGA 1UECA 1LCJA 2KT1A 1W1FA 4A63B 3REAB 1PWTA 3VS5A 1MUZA 3VS7A 1PRMC 3N8MA 4WWQA 3LH5A 1BM2A 1YWOA 1BKMA 1O46A 2BZXA 3M0TA 1ABOA 1OPKA 1WQUA 3BUNB 4QT7A 4P9VA 2HSPA 1QKWA 2LCSA 2D8JA 5GJWB 1PNJA 3R6NA 3CD3A 1UURA 3BUMB 1AWWA 3S8NA 1JO8A 2EKXA 2BZYA 1T0JA 2PNAA 1GFCA 2G6FX 1JYRA 1X0NA 1O4NA 3US4A 1GHUA 1BB9A 1O4RA 1ZFPE 2IZVA 1T3SA 1O48A 4CC2A 2IIMA 3UA7A 2HBWA 1V1CA 2JM8A 3ZL7C 1T3LA 5IH2A 1BKLA 1BLJA 2K79A 4AG1C 1K76A 1B47A 2DLZA 4RTVA 4CC7A 2CREA 3EG2A 2BBUA 1CKBA 1UGVA 5FWBA 2YUOA 2GTOA 1A81A 4U17A 4A4BA 1ABQA 1A1AA 1O44A 1PKTA 1TUCA 1KIKA 1IS0A 1M30A 1BBZA 3EHQA 4RTXA 1I07A 2CSQA 1X6CA 1PKSA 1LUKA 2F2WA 2CH4A 2LJ0A 1WXBA 2JMCA 3JV3A 2EQIA 3M0QA 1AYCA 2FG0A 2RMXA 4RTWA 3REBB 5FWCA 2JS0A 2LJ3A 1O4AA 1H8KA 2FEIA 3PS5A 1WFWA 1AWJA 3KFJA 1UUEA 2JTEA 2GQIA 1SEMA 2X3WD 4IIMA 5GJHA 1Z3KA 1TUDA 2K7AA 1A07A 2AUGA 2DL4A 4F5BA 3H0FA 2LNXA 3QWYA 1ZLMA 2CT4A 2QMSA 2W0ZA 1O4CA 1O43A 1CSYA 2SEMA 2J06A 2EGEA 3IN7A 1X27A 2I0NA 4LNPA 1NEBA 4OMNA 1FYNA 4RTYA 1AYBA 2MK2A 3MXYA 4JZ4A 1O45A 5D0JA 2X3XD 2AOBA 4CC3A 2HDXA 2PLDA 3CQTA 2LCTA 4FL2A 1B3QA 2MOXA 1KA6A 5EC7A 2KT8A 1UJ0A 1XA6A 2EPDA 3M0RA 1NZLA 2GBQA 1X2QA 2CT3A 1WXUA 3MAZA 1BMBA 2VVKA 1PRLC 1RUWA 2EL8A 2HMHA 5GJIA 2D8HA 1S1NA 4OMOA 4OHEA 5I6VA 1NRVA 3VRPA 1BHHB 1Z9QA 4GWFA 1K9AA 4K2RA 2CBLA 4F59A 3PVLA 4HVWA 1KC2A 4GPLB 2RNAA 3SHWA 3EACA 2DJQA 1X43A 4J9IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EGDA 2KGTA 3BE3A 3VS3A 5DLQE 1KG1A 4J83A 3E9FA 2C0IA 2L3SA 1U3OA 3JB9G 1FU5A 2KGYA 3TREA 5J3XA 2K9GA 2ED1A 5LJ3h 4C8QG 5CQYA 2VYTA 3CCJA 1PC0A 2CGHA 4JS4A 5GMKj 2O9VA 4DOVA 4BY6B 3FLGA 2DXBA 2ABLA 2P0KA 3CC4A 2RF0A 1O4GA 2RI5A 1QADA 4PJOG 1LCKA 1PICA 1Q81U 2ZZDA 3AT1B 1LKKA 1HD3A 4XZ0A 1AB2A 4M78E 3JCMQ 3EH1A 1I4K1 1E7OA 2VWFA 2K5IA 1K1ZA 1BI1A 2F1LA 3ZEHA 4CI0C 1UFFA 3BDLA 4MZMA 4J9GA 3MCAB 3EGXA 4KBMB 4M78C 1JWOA 2E12A 5GAN7 3NTKA 2D0QB 2JXBA 2OTLA 1AYAA 3LGLA 3VUBA 2EAYA 2BE7D 3QIIA 3OS1A 5KCHA 3CD6T 1V29B 2JJ9A 1O4MA 4C8QE 3QDFA 1MNDA 3M4GA 3OYMA 1UGQB 3N84A 3J81E 1A1BA 1MILA 5GAMd 2EJGA 1JJ2S 4BDYA 1R1QA 1OO3A 1JXOA 4JZ3A 4EY0A 4C8QC 5DY9A 1RADB 3G4SA 1RLQC 1KD1U 1IHWA 2NUPA 2DCRA 2EIFA 4M77F 2DLPA 2DTIA 2DXUA 2K79B 5IHIA 2JTFA 5BO4A 4J9HA 2JS2A 2XDPA 2LX7A 2CP5A 4BI4A 3I55T 2VGMA 5HY6A 2MMPA 3KFVA 1YI2T 4MMKA 2MAMA 3C7IA 2SRCA 2E5KA 2LTOA 3JCMf 3CXCA 3PE0A 4A4FA 1YBYA 1M1GA 4RTUA 1FBVA 3PGGA 3BUWB 2QYZA 2PVDB 2V1QA 4OGCA 1LNXA 4XK8E 2L8DA 1AOUF 2A0FB 3X26B 5GAOp 1GFDA 2FL7A 9ATCB 3R6OA 1QWEA 1K8AU 1A09A 2KRNA 4R56A 3THKA 3NMZC 1BLKA 3VRYA 4HCBA 1JJ2P 2PUOB 3QJYA 1O4HA 2LRQA 4DEYA 2JW4A 4PJOB 1VQ5Q 2XDBA 2K4YA 1VQNQ 2IUIA 3I5SA 5I2MA 3SD4A 1Q7YR 4ORZA 1F1WA 5A0DA 2YUNA 2L4KA 4FL6A 3GQIB 2LVMA 2L3TA 3NTIA 4J9FA 3JCMb 2EYWA 5GAOm 2LNHB 2ESWA 3VRNA 1VQMT 1SKJA 2PVGB 2E6ZA 5GANg 4J9CA 3N7YA 2H3JA 2XKOC 1Y57A 1LUMA 4Q5WA 1BI2A 1YIJT 2JN0A 2WSEE 1A0NB 3M56A 4JRQA 3VS1A 1D0YA 1VQOQ 3EHRA 3T9NA 1ZA1B 5KYYA 5DF6A 1QCNA 5DC9A 1IREB 2O2OA 2KXDA 2EO3A 1M1KC 3BUOB 3M53A 2DM1A 3PQZA 3LX7A 5I22A 4C92F 4A4HA 1BKBA 4C92B 4ROJA 1OO4A 1F1BB 3FRNA 3I55A 2IUHA 2ZPHB 1F2FA 3LWIA 1N5ZA 1YWPA 4C0DC 2KK4A 1NZ9A 3JRZA 2RMOA 4Z88A 3RKYA 4N4HA 2RQWA 2DLYA 2DX0A 2IPOB 1K0SA 4PJNA 3CCQT 2FPEA 1RQQC 2RQVA 4XTYA 4XTVA 3EAEA 4WF2A 4FYVB 3I56Q 2O01E 3HHTB 3S3MA 4DBRA 4RCBA 3OS2A 2AT1B 1W2BA 2ED0A 1T0HA 4F7UA 3M0SA 4L5GA 1SHDA 4E7KA 1RLPC 4BI8B 5LJ5j 2V8IA 1QVGA 5FW9A 2QQ9A 4D8DA 2JNGA 3SWNA 4ZNXA 1VQKQ 1OZ3A 2DL8A 2GFUA 4FU6A 2F5KA 1S72Q 1I1JA 3TU4K 1UGPB 2XHCA 3V8JA 1YVHA 2QDYB 4IURA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1MUZ A;  3VS7 A;  1PRM C;  3N8M A;  4WWQ A;  3LH5 A;  1BM2 A;  1YWO A;  1BKM A;  1O46 A;  2BZX A;  3M0T A;  1ABO A;  1OPK A;  1WQU A;  3BUN B;  4QT7 A;  4P9V A;  2HSP A;  1QKW A;  2LCS A;  2D8J A;  5GJW B;  1PNJ A;  3R6N A;  3CD3 A;  1UUR A;  3BUM B;  1AWW A;  3S8N A;  1JO8 A;  2EKX A;  2BZY A;  1T0J A;  2PNA A;  1GFC A;  2G6F X;  1JYR A;  1X0N A;  1O4N A;  3US4 A;  1GHU A;  1BB9 A;  1O4R A;  1ZFP E;  2IZV A;  1T3S A;  1O48 A;  4CC2 A;  2IIM A;  3UA7 A;  2HBW A;  1V1C A;  2JM8 A;  3ZL7 C;  1T3L A;  5IH2 A;  1BKL A;  1BLJ A;  2K79 A;  4AG1 C;  1K76 A;  1B47 A;  2DLZ A;  4RTV A;  4CC7 A;  2CRE A;  3EG2 A;  2BBU A;  1CKB A;  1UGV A;  5FWB A;  2YUO A;  2GTO A;  1A81 A;  4U17 A;  4A4B A;  1ABQ A;  1A1A A;  1O44 A;  1PKT A;  1TUC A;  1KIK A;  1IS0 A;  1M30 A;  1BBZ A;  3EHQ A;  4RTX A;  1I07 A;  2CSQ A;  1X6C A;  1PKS A;  1LUK A;  2F2W A;  2CH4 A;  2LJ0 A;  1WXB A;  2JMC A;  3JV3 A;  2EQI A;  3M0Q A;  1AYC A;  2FG0 A;  2RMX A;  4RTW A;  3REB B;  5FWC A;  2JS0 A;  2LJ3 A;  1O4A A;  1H8K A;  2FEI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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