2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Crk-like protein
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
2CI8A 3VS6A 1SRLA 1GL5A 2L2PA 2CUDA 2EQIA 5GJIA 3EHRA 1JWOA 1UJYA 2CIAA 1J3TA 5KAZA 2EKHA 1TZEE 3VS2A 4F5AA 5GJWB 1BHHB 1M27C 4M4ZA 2JMCA 2BZYA 3OB2B 1D4TA 3PSKA 2JT4A 1QG1E 2YSXA 4FL3A 2RORA 4EIKA 3BKBA 1UGVA 2DL5A 2HBWA 5HCKA 2LNWA 2DL3A 1AWJA 2YUPA 2A08A 3NGPA 2F2WA 2CSQA 3M0TA 2EYWA 2KT8A 4OMLA 1LKLA 2DYBA 2W10A 3RBBB 1MILA 4E93A 4F16A 1H92A 1P13A 1TG0A 1W70A 1OOTA 1WX6A 1Z9ZA 1A07A 4XZ0A 4TZIA 3THKA 2RQTA 1BK2A 1O48A 4GBQA 1NYFA 3ULRB 1VA7A 1GBQA 3GBQA 2EYXA 2FRYA 2IIMA 3IN8A 1RI9A 2ROLA 4JGHA 1PICA 1CSKA 1Z3KA 1QKXA 1JQQA 2CT4A 1O44A 1BLKA 3UA7A 4K45A 2DL4A 4WCIA 2DLZA 3PE0A 2DJQA 2MRKA 4A4BA 2FPEA 1H8KA 1SHGA 4H1OA 5DC0B 1S1NA 4HVWA 1A1CA 2YUOA 2DBMA 1O41A 2GSBA 2V1QA 3EGUA 2KRNA 1YVLA 3I5SA 2H5KA 4JE4A 4RTTA 3OB1B 2HDVA 2JS2A 3CD3A 1LUMA 2KNOA 2MQIA 1X6CA 1GCQC 1OO4A 4F14A 4IIOA 2CH4W 1AWWA 2L6KA 2X3WD 1O4FA 1GCPA 2DMOA 1TUCA 3CWGA 2CT3A 4AFQC 5IBSA 1LUIA 1LCKA 1BKLA 2Y3AB 3KFJA 1AOUF 2YUQA 3EG0A 1E7OA 2RQRA 1WIEA 4P9ZA 1JU5A 2IZVA 4EY0A 1WI7A 2IUHA 2KXCA 1ARKA 2PLDA 3IQLA 2BZXA 1BMBA 1ZUUA 2MIOA 2LNXA 1FYRA 1LCJA 3US4A 2IUGA 1PWTA 2LP5A 2M0YA 1SPSA 4HCKA 3M7FA 1HCTB 2EKXA 1ZSGA 2CBLA 2J6KA 1ZLMA 3HCKA 4AFUC 1RJAA 1AB2A 2PNAA 2ROTA 2B3OA 3EG1A 2OQ1A 4X6SA 5J3XA 2K79A 4F5BA 2KRMA 2RNAA 2E5KA 5IHKA 1H9OA 2HUWA 3N7YA 4OMNA 1M3CA 1BB9A 4GLMA 4RUGA 4NWFA 1BFJA 2KEAA 1N5ZA 1BG1A 2AK5A 3HHMB 2L3QA 1WYXA 5EHPA 5IBMA 2PTKA 3EACA 1BKMA 1UURA 4U1PA 4OMQA 3MXCA 2DCRA 5EEQA 1M8MA 4D8DA 1QLYA 2KROA 2A28A 2KR3A 3PSJA 1K4US 5GJHA 5ECAA 1UHCA 4X1VA 1O4HA 1FYNA 2FEIA 1D1ZA 2F2VA 3PLFB 1Y57A 1Z9QA 3GXXA 2A37A 4J9FA 4JJBA 1YVHA 1AYBA 3PQZA 2L3PA 4HXJA 1PNJA 2CSIA 4Y92A 5DF6A 2KK6A 1AYCA 1QCFA 1A0NB 2NWMA 2CREA 3KFVA 2YU7A 3HIZB 3SHWA 5FWCA 3EG3A 3H41A 3MXYA 4GL9E 3TVTA 1VYUA 2RN8A 1NYGA 4K2RA 2EYYA 1OEBA 2DE0X 2EU0A 3TSZA 1YWPA 2MC1A 3ZL7C 3S8OA 1LUKA 2GQIA 2DX0A 1K76A 3IN7A 2K3BA 3VS5A 2DL7A 1JEGA 3M0QA 2X3XD 4D8KA 4LUDA 3A98A 1BM2A 2O9SA 3PVLA 3BUWB 1BF5A 2YSQA 1WDXA 1X43A 5HKWA 1I1JA 2KXDA 2RVFA 4F17A 2DRMA 1AOTF 1M3AA 1UFFA 1D4WA 2QMSA 1A09A 3IMDA 2SEMA 4Z8AA 2FPDA 3JV3A 1KC2A 1ABOA 3VRNA 4E68A 1KA7A 2EYVA 1JU5C 3BUOB 4CC4B 4OHEA 3M0RA 4FL2A 3REAB 3NHNA 1UE9A 2Y1NA 4H34A 1WXTA 1T3LA 3M0SA 3VS3A 1A81A 3PS5A 1QWFA 3WA4A 2J7IA 1FMKA 2HCKA 3O5ZA 4QT7A 2AOBA 1CWDL 1AD5A 2LMJA 2MRJA 5BO4A 1W1FA 1K0XA 2FG0A 2LJ1A 4FBNA 2CUBA 2ED1A 1WA7A 2HMHA 2RMOA 1SHDA 1OV3A 1UTIA 3I5RA 1HJDA 1VYTA 4LN2A 4ESRA 1I3ZA 3I9QA 3EAZA 1CJ1A 1O49A 1UUSA 3VRQA 3M0PA 2D1XA 1CWEA 1FBVA 4OHIA 5DC4A 3NPFA 1YP5A 2EO6A 2PZ1A 2D8HA 1GHUA 1BBZA 1TCEA 1UG1A 4U17A 1V1CA 1NEGA 1G83A 4J9IA 2AOAA 2EL8A 1O42A 1K0SA 2JTEA 3SEMA 2F2XA 3UF4A 2JW4A 1UJ0A 1WQUA 1E6HA 1OPLA 2VWFA 4DGPA 2P4RA 2VKNA 4XZ1A 1M30A 1E6GA 1LKKA 2AKLA 4ZNXA 1M27A 1QADA 2MK2A 1JXOA 5IH2A 2DX1A 2JYQA 2JMAA 2VIFA 2K6DA 4WWQA 2LQNA 1WXBA 2C0IA 2CI9A 2EO3A 1JYUA 1RQQC 4J9HA 1AOJA 4A63B 5GJVB 4OHLA 3VRRA 1MUZA 1ZUKA 2IUIA 2AKKA 1A1BA 1YN8A 1BLJA 2O2OA 5IXBA 3U23A 2EPDA 2J06A 4DEXA 2H46E 2BZ8A 5EHRA 4RTZA 2O31A 3EHQA 1HSQA 4AG1C 1X0NA 1WFWA 2EBPA 1QWEA 1X27A 4IIMA 2K7AA 4JZ3A 1X2KA 1O4RA 2DLYA 5EG3B 2AZSA 2JXBA 5FWBA 1NZVA 2K9GA 4FSSA 5IHIA 2CS0A 1PRMC 1GFCA 1X2QA 2KRSA 1UDLA 1MV0B 1PRLC 1AZEA 1GBRA 3QWXX 1A08A 2OJ2A 2C0TA 1OPKA 2EW3A 2RMXA 1GFDA 5I11A 3PFVA 4A4CA 1RLQC 3H0IA 5FW9A 1K9AA 4OMPA 1KIKA 1AZGB 2HDXA 2GTJA 1X69A 2KT1A 4JPBW 1HCSB 1T3SA 1O4GA 3GXWA 1SKJA 1JYRA 1SSHA 1FHSA 2L3SA 1O4LA 1GCQA 1NM7A 1NLPC 2CR4A 5D0JA 1O4BA 1PKTA 1CSYA 1O47A 2K79B 3NMZC 1F1WA 2CRHA 5AULA 2KE9A 2H8HA 1R1PA 2DF6A 4JJDA 4RTUA 4ROJA 2DA9A 1A1AA 2ETZA 1O4AA 2LJ3A 2XP1A 2D0NA 3VRZA 3VGOA 1CSZA 1NZLA 2ECDA 3K2MA 2SRCA 1MV3A 1YCSB 2A36A 1PKSA 1VYVA 2FCIA 3BUMB 1AYAA 4OMOA 1BU1A 3TL0A 1I0CA 4GWFA 1ZFPE 2NUZA 2BTTA 2KYMA 1U3OA 2JM9A 1X6BA 2OI3A 5I6VA 1IJRA 4HVVA 2ABLA 1AYDA 1YNZA 3CQTA 1FU6A 4F59A 1RPYA 4OHDA 4LUEA 4Z88A 5EC7A 2JM8A 5I22A 3VS7A 4GPLB 2EGAA 2EOBA 3CXLA 2YT6A 3BUXB 2O9VA 4AFZC 4NWGA 1UECA 2VVKA 1F2FA 2YUNA 2AUGA 2RQVA 1MW4A 1RLPC 3N84A 1Y1UA 1FBZA 1B47A 1HD3A 3N8MA 3OP0A 4P9VA 1SPKA 1O4MA 1SHAA 2DM1A 1KFZA 4RTVA 2B86A 1JO8A 1GRIA 3UYOA 1B07A 2RPNA 1O4DA 5HKZA 4J9GA 4LE9A 2ED0A 1W6XA 2BBUA 2CDTA 3VROA 1BFIA 1O4OA 4AFSC 1G2BA 1U06A 2AZVA 3C0CA 3ZNIA 1XA6A 1Y0MA 1O4JA 1RUWA 2MOXA 4CC7A 2O88A 2PNIA 1ZBJA 2DNUA 3EG2A 3QWYA 4K11A 2J05A 1O4NA 1O4IA 3H0HA 4J9EA 1AWXA 1ZX6A 2C9WA 2RQWA 1O46A 1FU5A 1U5SA 2SHPA 1X6GA 4J9CA 2GBQA 1SHBA 5HKYA 1AVZC 4OMMA 4E6RA 2HSPA 2EYZA 1IS0A 1BHFA 4JEGA 1ZUYA 4JJCA 3VRPA 1YWOA 1WXUA 5CDWA 2M51A 4ORZA 1KA6A 4RTXA 4K44A 1ABQA 5EELA 2XMFA 1R1QA 3H0FA 2G6FX 1NG2A 2RF0A 2JS0A 3UA6A 3S8LA 4DGXA 4J9BA 3PJPA 2EGCA 4L1BB 1LUNA 3T04A 2GNCA 4LNPA 2QDLA 5DC9A 2KYBA 1K1ZA 1SEMA 1R1SA 1WLPB 2HDAA 1UHFA 2EVRA 3TSWA 2GTOA 2K2MA 3VRYA 1JYQA 1NLOC 1O43A 2KGTA 3TKZA 1M61A 2L4KA 2MCNA 1I07A 1AWOA 2ENMA 2LJ0A 2LQWA 1EFNA 1PHTA 4R0KA 3BUNB 2GGRA 3RNJA 1O4PA 2L3TA 5L23A 4DEYA 2J6FA 2ESWA 3FJ5A 3PVQA 1IO6A 1CKAA 2I0NA 2LX7A 2OAWA 2RQUA 2J6OA 4HVUA 1KSWA 1UUEA 3IMJA 2LCSA 2ECZA 4KRTA 3VS4A 2RSYA 1XOVA 2C0OA 2FPFA 2L0AA 1QKWA 3LH5A 3I35A 2D8JA 1NRVA 2DLPA 2LNHB 3M0UA 3R6NA 1M3BA 4AG2C 2EGEA 1SRMA 4JZ4A 3C7IA 3CBLA 4CC2A 1B3QA 2KBTA 4J9DA 2K7AB 4EIHA 1TUDA 2DVJA 2DL8A 2OZOA 2PLEA 1BHHA 1T0JA 2FRWA 2DRKA 1O4CA 2LZ6B 1O4QA 1JXMA 2GE9A 1NEBA 3VS1A 4CC3A 2CH4A 2FO0A 2W0ZA 4Z89A 2V1RA 2DM0A 1SHFA 2YDLA 3UATA 1KJWA 1T0HA 2DBKA 2DILA 4RTYA 1H3HA 1AEYA 4RTWA 3S8NA 4OHHA 4QSYA 1O4KA 1A1EA 2PNBA 3OVEA 1CKBA 3VS0A 1OO3A 3REBB 5IXFA 2KNBB 3OV1A 1SPRA 2Y1MA 2HEQA 2LCTA 5AXIA 3S9KA 3GQIB 3MAZA 1O45A 5IHNA 1O4EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CI8A 4M7DF 1M1KC 3JB9D 1JWOA 4E2FB 1UJYA 1WHHA 3GP8A 3VS2A 4GY5A 5HKCA 3OB2B 5A2QE 2JT4A 5D6XA 2YSXA 4FL3A 2RORA 4EIKA 5KYYB 2RHXA 1UGVA 2DL5A 5HCKA 2LNWA 1AWJA 5GANg 1K9MC 2OTJQ 2EYWA 3CPWS 2CP5A 1TG0A 3ZEHA 1Z9ZA 4OB0B 3INZA 1D0XA 1OYXA 1BK2A 4C8QA 4C5HA 1GBQA 2G3RA 2FRYA 2IIMA 1U1TA 4E7JA 4OB2B 1PICA 2X4XA 1Z3KA 1QKXA 3HP9A 3G6ET 2ZPEB 4CI0C 4MDWA 4J83A 1BLKA 3UA7A 2HKNA 4K45A 5KCOA 2OX7A 2FPEA 1H8KA 5DC0B 1A1CA 1KD1C 5GAN5 4RTTA 1D0YA 1VQ7Q 1VQMQ 2HNIA 5J3BA 2KNOA 3DLLA 1GCQC 3FEOA 2CH4W 3CCSQ 1RAHB 3PMTA 1G3SA 1GCPA 1M90U 1TUCA 5IBSA 5J26A 5AYFA 3KFJA 1Q7YU 2IZVA 1WI7A 5AT1B 5HK3A 3IQLA 3OBWA 3SB2A 4HT8A 2LT4A 1FYRA 1VUBA 1Q81U 1PWTA 2LP5A 1RAAB 3CCLA 3CCMQ 1HCTB 2K5FA 2EKXA 2CBLA 2J6KA 2DTOA 1B7TA 1ZLMA 3L2RA 2ZPIB 1RJAA 1AB2A 2ROTA 1IRXA 1R0CB 1G3WA 2JTMA 3N7YA 2E5KA 1AT1B 4LD6A 3WVDB 2RJDA 1VQKA 3CCRQ 1VQ6T 2PTKA 1M8MA 1QLYA 2KROA 3OBYA 2KR3A 3QZ5B 1QW1A 1UHCA 3JCMP 2FEIA 3URGA 3OYIA 1D1ZA 5HY6A 4RCBA 2QA4T 1YVHA 1AYBA 1WHJA 3PQZA 4HXJA 1KD1U 2KSSA 1X01A 1VQ4A 4NOYA 1QVFA 1AYCA 4M75C 3A8MB 1MNEA 2NWMA 3SHWA 1QMCA 5FWCA 1VYUA 1MGQA 1QP3A 4HCZA 1YWPA 3DLMA 2DVEA 2WSCE 4JS5A 2GQIA 2FB7A 2ZZDA 3A98A 2VB6A 5CO7A 5LJ3f 1IHVA 1I1JA 5I21A 1VQ8T 3CPWP 1X75C 4EMKA 1AOTF 1VQLA 4ME7A 1UFFA 1D4WA 2QMSA 3IMDA 1IREB 5D6WA 4Z8AA 4HA8A 1KA7A 4OHEA 3M0RA 4B9WA 4FL2A 3NHNA 1UE9A 2CZ6B 4HKEA 4JS4A 1A81A 3RERA 5CR2A 2FZGB 2KVQG 2CYZB 4AMCA 2LMJA 3EG9A 1W1FA 4FBNA 5CAIA 2RMOA 2YLBA 3E9GA 4LDYA 1TSFA 4M7AG 2XDDA 3I5RA 1D1AA 1VYTA 4KT0E 4LN2A 1HJDA 2QTXA 2D1XA 3NPFA 2EO6A 1BBZA 1TCEA 4PJOG 2VGNA 4OMFB 5FLXE 3SEMA 3UF4A 3OYDA 4JDSA 4B6MA 1SF9A 5FU6C 4JUVA 4DGPA 4XZ1A 1LKKA 2DTIA 1M27A 3MEVA 2DAQA 1JXOA 4N4IA 3V8JA 2IVWA 2JYQA 2JMAA 2L3RA 2LQNA 3CPWA 4MMKA 1G3TA 3VRRA 1MUZA 2AKKA 3P8DA 4FYXB 2EFIA 2EPDA 2H46E 5EHRA 1WQWA 4OP0A 1V76A 3EHQA 2L8DA 2RJFA 3M54A 2EBPA 4IIMA 3F70A 2RI5A 2DLYA 1NZVA 2YWWA 2X4JA 1GFCA 2KRSA 1AZEA 1GBRA 2OJ2A 1OPKA 4IUQA 3SWNB 4PJOE 4A4CA 2AHJB 3E19A 2HDXA 2GTJA 5CKEA 4JPBW 3CCLQ 1RAGB 2DD5A 3MO8A 1IGQA 5I2MA 3L42A 1VQKT 3VUZA 1O4LA 2JN0A 2E5QA 3EGDB 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2GGRA 1Y71A 3RNJA 1O4PA 2HQHA 4DEYA 2JZ2A 2J6FA 3FJ5A 1M2VB 1EIFA 2I0NA 1KC8R 3LWHA 1ZA1B 3LW5E 4DQ2A 3V8KA 3BY7A 4M7DE 2NUTB 2D8JA 2LNHB 3OYYA 1M3BA 4AG2C 4M75G 4FIBA 1SRMA 5IAYA 1I8FA 4BI4A 2A0FB 2DVJA 4BDZA 4M7AF 3CCJA 1O4QA 2LZ6B 3BDLA 2E41A 1NEBA 3MJXA 1WJRA 4QVDA 2DM0A 3EGXB 1KJWA 1AEYA 3OY9A 4OHHA 4QSYA 1O4KA 5KCHA 3P8BB 2CP7A 1OO3A 2OTJA 3MP6A 1RAIB 2HEQA 3QG1A 3MAZA 5IHNA 5KYNA 3VS6A 1GL5A 2CUDA 4EPCA 5GJIA 1MMDA 3FIFA 3EHRA 4M77C 2VYTA 2OAUA 1VQ9Q 2CIAA 3M5AA 1N8RR 2RD1A 2EKHA 1TZEE 5GJWB 2NLUA 1XQHA 3OS1A 4OVAA 4M7DD 1BHHB 3QYHB 1D4TA 4M75E 1OX9A 2DXUA 4XU1A 1QG1E 4BY6C 4ELZC 4M7DB 1JJ2P 3I55Q 4E7KA 2YUPA 3NGPA 1K73C 2DYBA 2W10A 2DZCA 3KXTA 1VQ7A 3EFRA 1VQMA 1P13A 1WX6A 1A07A 4XZ0A 8ATCB 5GAN3 5A0DA 1VQ5T 2RQTA 1NYFA 3EFSA 1VA7A 2EYXA 3HL8A 2XG8D 4J6YA 1YJWQ 4ZTFA 2ZPHB 2COZA 3ASKA 1FMWA 1JQQA 2I2LA 2CT4A 1VQOT 1JJ2S 3CC7Q 1O44A 2DL4A 3J80E 3LH0A 4WCIA 3PE0A 4A4BA 4H1OA 1TTHB 1SHGA 1LNXA 5GAOr 1S1NA 4HVWA 2YUOA 2K3XA 3JB9H 1O41A 3CCMA 1M2OA 4FYYB 1YVLA 2H5KA 5KE3A 3OB1B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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