2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Crk-like protein
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
1OOTA 2J06A 1O4IA 2CSQA 4J9EA 2DL3A 1BK2A 1CJ1A 2H5KA 2LNHB 1NLPC 2HSPA 4LNPA 1H3HA 1QG1E 3S9KA 1BHFA 1M3BA 1UHCA 2FEIA 3FJ5A 5IXFA 1G83A 2M51A 1WXTA 4H1OA 3PQZA 2ENMA 1WXUA 1FYNA 2FPEA 2HEQA 2RMXA 1BFIA 1M30A 1QKXA 2LX7A 1U5SA 4GBQA 5DC0B 5GJHA 2K2MA 3BUXB 4X6SA 1TUDA 2MRJA 3VROA 2YUOA 2A08A 1WQUA 1PKSA 2J05A 1TG0A 3VRPA 2DM0A 1QKWA 2KYMA 3GBQA 2Y1MA 2KT8A 1RI9A 1CKAA 2Y3AB 2D8HA 2EGEA 4JZ4A 2EKXA 2RSYA 1PICA 1X6GA 1BG1A 2OI3A 1RQQC 1Y1UA 2CUBA 3OB1B 4IIOA 2DF6A 1CWDL 2GSBA 3M0UA 4J9GA 2AKKA 2CH4W 1T0JA 2J6FA 2J6OA 1A07A 2L3PA 1YVLA 2J6KA 2W0ZA 1KA7A 2EL8A 3EG1A 4QSYA 1PRLC 2PNAA 3CQTA 2BZ8A 1O4JA 1UUEA 2ROTA 3VS0A 2K3BA 3NGPA 2MCNA 5HKYA 1X2KA 1O4EA 5IH2A 1WA7A 3SHWA 2EQIA 2MRKA 3VS5A 1G2BA 4F14A 3IMDA 3BUOB 1UJ0A 1Z9QA 1AZGB 4J9IA 1S1NA 2L3TA 2AZVA 1E6GA 1NZVA 1WLPB 4EY0A 4M4ZA 1R1SA 2KT1A 3EAZA 1WXBA 1QWEA 1LUKA 1O4PA 2CS0A 3H0HA 1OEBA 1AYCA 2PZ1A 1ZUYA 3A98A 1ARKA 5FW9A 4HVVA 3UF4A 3I9QA 4CC3A 2KRSA 4J9HA 3VS4A 1QLYA 2NWMA 2RQWA 1JYRA 2JT4A 2EYVA 1K9AA 1RLQC 4AFUC 1IS0A 2JM8A 4OMOA 1AZEA 3C0CA 1B3QA 2K7AA 4IIMA 3KFJA 2C0IA 4J9CA 3EHQA 2EOBA 3PS5A 2K9GA 5L23A 1M27A 2EU0A 3PVQA 3BUNB 4LE9A 2JM9A 1JYUA 2AUGA 1UURA 3GXXA 2F2WA 1JQQA 4ORZA 2EVRA 2KNBB 1KSWA 1YN8A 2OJ2A 2HBWA 1D4WA 1UE9A 1E6HA 4AG2C 4L1BB 1BKLA 2HDXA 3WA4A 1AOTF 1M3CA 1D1ZA 1JWOA 2L0AA 4GWFA 3PE0A 2LCTA 3GXWA 4DEXA 1WDXA 1FBZA 3QWXX 2DX0A 1GL5A 4K44A 2JMCA 2X3XD 3CBLA 3EG3A 1NLOC 1WX6A 1O49A 1V1CA 1A09A 1HSQA 1UGVA 4K2RA 2VVKA 2A37A 1OPLA 2M0YA 4JZ3A 2BBUA 1H92A 2JMAA 2JS2A 1WYXA 2LNWA 2FPFA 4KRTA 2EW3A 1NG2A 3UA7A 2Y1NA 2CDTA 1XA6A 2RN8A 1O4MA 2AOBA 2MC1A 2DL4A 1MV0B 3TSWA 1GCQC 5FWCA 4JJBA 3UYOA 3KFVA 5DC9A 2QDLA 1GFCA 4ROJA 2HDAA 5IXBA 1BBZA 2A36A 2ABLA 5ECAA 1FHSA 1O45A 5EELA 1UUSA 1H8KA 2D0NA 2QMSA 1NRVA 1PNJA 4CC2A 4Z88A 1JXOA 2DBMA 1MW4A 4E93A 2RMOA 1JXMA 3T04A 4CC4B 1O4NA 1X0NA 3UATA 3TVTA 2ESWA 1FBVA 5HKZA 4WWQA 1B47A 1K4US 4QT7A 2ETZA 5DC4A 2CI8A 1NEBA 2H46E 3TL0A 2IIMA 2L3SA 1ABQA 1BHHB 1FU6A 2HDVA 4OHIA 5I22A 2DRKA 2EO3A 3MAZA 2SRCA 1PHTA 2PTKA 3THKA 3VRRA 2RQUA 1I1JA 1O4DA 1O43A 2YT6A 2ED0A 4LN2A 2E5KA 1VYUA 2LJ1A 2LCSA 3VGOA 3EGUA 2GBQA 1U06A 1BM2A 2MQIA 2MIOA 1UDLA 3S8NA 4RTZA 2RQRA 3R6NA 1R1QA 3I5RA 4U17A 2FRWA 2K79A 3O5ZA 5AXIA 3TSZA 3M0SA 2KYBA 2DILA 4GLMA 1T0HA 3PLFB 2JXBA 3M0PA 1BMBA 1ZSGA 2YDLA 2LMJA 2CI9A 2YUNA 3VS2A 1UECA 1RLPC 1X43A 3PVLA 1HD3A 2OAWA 1JEGA 1SHBA 1YVHA 2FO0A 4RTUA 5I11A 1JYQA 5GJIA 5IHIA 2BZXA 3QWYA 2ED1A 1BKMA 1MV3A 5CDWA 1JU5C 1CSYA 4F16A 2GTJA 1K76A 1B07A 1TCEA 3VRQA 1GRIA 1ZUUA 1KIKA 1Y57A 1N5ZA 2YUPA 1T3SA 2DLYA 2AK5A 2YSQA 2CRHA 2IUGA 2RQTA 2D1XA 4RTTA 2VIFA 1O44A 2DL7A 4P9ZA 2NUZA 2L4KA 1PWTA 3SEMA 3S8OA 1X27A 1SKJA 1YP5A 1O48A 4J9DA 1CKBA 4NWFA 3EHRA 1QWFA 2LQWA 1WI7A 2KXCA 3VS3A 2CH4A 3PFVA 1LUNA 3N8MA 1ZLMA 1NM7A 1KC2A 1BLJA 4HCKA 1X6BA 4OMNA 1KJWA 3EG2A 3I5SA 4HVWA 4LUEA 2G6FX 1GCPA 4P9VA 2KNOA 4DGPA 3GQIB 4JJDA 2DA9A 4WCIA 2V1RA 4EIHA 3BUWB 2IZVA 4RTWA 2O2OA 1D4TA 2DE0X 1M8MA 1SRLA 4XZ1A 1RPYA 1SPKA 3H41A 4TZIA 2XMFA 1VYVA 4AFZC 1A1BA 1LCJA 3ZNIA 2A28A 2HUWA 1CSKA 2K79B 4CC7A 5GJVB 3I35A 1Y0MA 4XZ0A 1TZEE 2CT4A 2X3WD 2PLEA 2P4RA 4H34A 3HIZB 5D0JA 1AYBA 1CSZA 2OQ1A 4FL2A 2DCRA 1BF5A 2DMOA 2K6DA 5BO4A 4OHEA 2FPDA 1K0XA 4RTVA 2KROA 2O9VA 1A0NB 1IJRA 2RVFA 2XP1A 2FG0A 2CSIA 5IBMA 2DYBA 2EGAA 1H9OA 1ZBJA 2CT3A 1O4FA 4FL3A 4OHDA 1TUCA 2LJ3A 3M0RA 4HXJA 4RTXA 2KXDA 2C0TA 4A63B 1LUMA 2CIAA 3OB2B 4JJCA 2L6KA 1I0CA 2B86A 2O31A 2F2VA 1OV3A 3S8LA 1NYFA 4LUDA 1BU1A 2ECZA 3K2MA 3UA6A 4Z89A 1OO4A 2DLZA 1PRMC 1UJYA 3HHMB 4A4BA 4OHLA 3N7YA 1W70A 2W10A 2RORA 2L3QA 3VRZA 2VWFA 4AG1C 3NMZC 2H8HA 5EEQA 1HJDA 4E6RA 1SHDA 1O4HA 4K45A 3H0FA 2YSXA 1WFWA 1CWEA 3ULRB 1R1PA 3C7IA 1KFZA 2K7AB 3CD3A 5I6VA 5IBSA 4OMPA 2LP5A 1PKTA 1NYGA 1SRMA 1AYAA 4FBNA 5IHKA 1BLKA 1RJAA 2YUQA 4F5BA 4F5AA 1O46A 1SPRA 1W1FA 2PNBA 1O4OA 2DVJA 3LH5A 4D8KA 1X69A 4RTYA 1QCFA 1O4CA 1O4GA 4JPBW 3PSJA 1F2FA 1MILA 3IN8A 4F59A 3MXYA 3REBB 1GCQA 1X2QA 4F17A 1YCSB 3M0TA 1ZUKA 1E7OA 2JYQA 2PLDA 1AYDA 2RQVA 4OMQA 4EIKA 1OPKA 3REAB 1FMKA 1O4LA 1VA7A 2GTOA 1A08A 2KRNA 1AOJA 1FYRA 5J3XA 2FRYA 4ESRA 1X6CA 2GE9A 3US4A 1EFNA 2HCKA 1UFFA 1ZX6A 2BTTA 2LNXA 3M7FA 1AD5A 1BFJA 1AWWA 2RF0A 3OVEA 1Z3KA 1J3TA 2FCIA 3VRNA 1QADA 2EBPA 4GPLB 3H0IA 5HKWA 2GNCA 5AULA 2CBLA 4J9FA 5EHPA 2EPDA 2GQIA 2I0NA 3JV3A 2DL5A 1O4AA 2DLPA 1AWOA 2EGCA 1I3ZA 4K11A 1I07A 3IQLA 1UG1A 2DL8A 2KK6A 2DNUA 2DM1A 1HCSB 5KAZA 5FWBA 1M27C 2PNIA 4R0KA 1SEMA 4J9BA 2KR3A 1A1EA 1M3AA 4GL9E 2CUDA 1YWPA 1O4RA 4X1VA 2DRMA 1GFDA 2C9WA 1LKKA 1SHGA 1XOVA 3PJPA 5GJWB 2KGTA 1U3OA 2DJQA 4A4CA 2O88A 1O4KA 2ROLA 3VRYA 1WIEA 4Y92A 1A81A 3RBBB 1AB2A 1A1CA 2C0OA 1BB9A 4FSSA 2DBKA 5HCKA 3VS7A 3IN7A 2O9SA 1HCTB 2VKNA 3NHNA 3MXCA 2KE9A 1O4QA 1SHFA 1GBRA 1A1AA 4JE4A 1JU5A 4NWGA 2EKHA 1F1WA 2EYZA 2JS0A 2B3OA 3EACA 1UHFA 1YWOA 3BUMB 4Z8AA 3U23A 5EG3B 3OP0A 1VYTA 3CWGA 5DF6A 5EC7A 1BHHA 4DGXA 3ZL7C 1SPSA 1KA6A 1NZLA 2RPNA 3BKBA 1T3LA 3CXLA 3M0QA 1LCKA 3VS1A 1NEGA 2KRMA 2EYWA 4DEYA 1ZFPE 4OMMA 1O4BA 2SEMA 2MK2A 1IO6A 2BZYA 2MOXA 5EHRA 1AVZC 2IUIA 4JEGA 1Z9ZA 2LZ6B 4E68A 2EYYA 3RNJA 3VS6A 1AEYA 4ZNXA 1YNZA 2D8JA 4U1PA 1MUZA 1W6XA 2AOAA 2GGRA 2KBTA 1K0SA 2L2PA 4OMLA 2IUHA 1AOUF 3EG0A 1SSHA 1O47A 2J7IA 4RUGA 2AZSA 1OO3A 2CREA 4AFSC 3PSKA 3HCKA 2RNAA 4D8DA 2V1QA 1GHUA 1P13A 1UTIA 3TKZA 2SHPA 1O41A 1O42A 2CR4A 3IMJA 3NPFA 1LUIA 1LKLA 2JTEA 2ECDA 2F2XA 1ABOA 2LQNA 2JW4A 1RUWA 2DX1A 4HVUA 3OV1A 1AWJA 1K1ZA 4OHHA 2KEAA 2AKLA 1JO8A 4JGHA 2EO6A 2LJ0A 1AWXA 2HMHA 5IHNA 2YU7A 1GBQA 1FU5A 1M61A 2EYXA 1SHAA 4AFQC 3N84A 2OZOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ5T 2HQEA 3H9NA 1LJOA 3E19A 2H5KA 2DTOA 2LNHB 1NLPC 1BHFA 1M3BA 1WHGA 1UHCA 3QZ5B 3JB9G 4XQ3A 1OU9A 1YITT 3QXEB 5AT1B 2OTLT 2ENMA 4LD6A 2CZ1B 2FPEA 2HEQA 4LXCA 1M30A 1QKXA 2LX7A 1U5SA 3FB9A 2HKNA 2K2MA 4M75A 4ZTJA 2P0PA 3BUXB 1N9SA 1QQJA 2YUOA 3HL8A 3MPUB 3NTIA 1GXIE 1TG0A 5LJ3e 1VQ6T 1R8OB 2F69A 1RI9A 3JB9F 1NBEB 2D8HA 1FWZA 4E7KA 2RSYA 4J5YA 4NS5A 1RQQC 1Y1UA 1TWBA 3CBMA 3M0UA 2KK4A 3CCVA 2AKKA 1RAEB 2J6FA 1WQ7A 1A07A 1MMAA 2J6KA 3CCVQ 2PNAA 4KUIA 3CQTA 2MK5A 1UUEA 2ROTA 3NTHA 5EG2A 2MCNA 5HKYA 1O4EA 2FZCB 4PJOC 3LW5E 2EQJA 1K8AU 5D7UA 3IMDA 3O8VA 3RKWA 3A5ZB 1Z9QA 1S1NA 4FW1A 1NZVA 4C5HA 5A0GA 4IUTA 3EFOA 1ZBXA 3P8DA 2COZA 2XI9A 3X24B 3CCQA 1OEBA 1AYCA 3V8LA 3CPFA 3C4SA 5FW9A 1K73C 4GY5A 4J9HA 3CCQQ 3WVEB 4XU3A 1QLYA 2NWMA 4PLIA 2EYVA 3EGXB 1K9AA 3CMAT 2JM8A 1AZEA 4FSXA 5CCAA 1S72Q 2JJ9A 2FVUA 4BI4A 3OA6A 4OB0B 1B34B 5GAN7 3LH0A 1C6VX 2HSEB 3QG1A 2KNBB 1E6HA 1IGUA 1BKLA 3WA4A 1AOTF 1M3CA 1JWOA 4PJLA 2LCTA 2E4HA 3QWXX 1D0ZA 3EG3A 1WX6A 4EDUA 1TXQA 3J81E 3PFSA 1SSFA 4M7AE 1OPLA 1BIBA 4QQ6A 1H92A 2JMAA 3OYEA 2LNWA 2FPFA 1RL2A 5CAIA 3BDLA 3G6EA 1AT1B 2MPXC 5KE2A 3CCVT 1G3TA 5FWCA 1QCOA 2A36A 1JRIA 2K2VA 5CKBA 1O45A 3GF5A 1UUSA 1NRVA 2QMSA 2E12A 3OYNA 4Z88A 1JXOA 1LNXA 5AYFA 1MW4A 4M75E 3RIRA 3T04A 1BI2A 3UATA 1K4US 1NEBA 2H46E 5HK0A 3M9QA 3CPWP 1RAHB 4DBFA 1NZ9A 1FU6A 1QP2A 3ER0A 3OMCA 5I22A 2DRKA 3HFNA 3M59A 2DZ9A 1VQLA 3VRRA 3PMTA 5J3BA 2YLCA 1O43A 2YT6A 2XD0A 4LN2A 1S72T 1VYUA 3VGOA 4C5EA 2MIOA 2DAQA 3OYLA 3LWHA 2QG9B 4ELYC 3I5RA 1VQNA 2FRWA 4XTYA 1EIFA 5AXIA 1OZ2A 2DILA 3PLFB 2CI9A 2LMJA 2DD5A 3CC2T 1VQNQ 1UECA 1RLPC 1WPYA 1HD3A 1YVHA 5I11A 2YHTA 2ZCFB 1G8XA 3QWYA 5CDWA 1JU5C 1N8RR 1JJ2S 2GTJA 5FRMA 2IVWA 1K9MR 1ZUUA 2DLYA 3MP8A 4X9CA 3CCST 1O44A 1TUGB 2L4KA 1PWTA 3SEMA 2L89A 4C92D 1X27A 2EKOA 4NOYA 1CKBA 4NWFA 2LQWA 1QCNA 5GMKj 2CH4A 1BI1A 4P9VA 4DBQA 4ZN3A 3JCMQ 4PJMA 2DA9A 5GAOl 1HK9A 1SPKA 3ZBDA 2XMFA 4OF1A 1VYVA 4MZTA 1YHQT 4M77E 1WZOA 5GANh 1M2OA 3NFCA 2CT4A 2WSFE 2PLEA 2P4RA 2EQKA 1AYBA 5FU7B 1TSFA 2OQ1A 1JB0E 3M54A 1BF5A 2DMOA 2K6DA 2F1LA 5LJ5h 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3VRN A;  1QAD A;  2EBP A;  4GPL B;  3H0I A;  5HKW A;  2GNC A;  5AUL A;  2CBL A;  4J9F A;  5EHP A;  2EPD A;  2GQI A;  2I0N A;  3JV3 A;  2DL5 A;  1O4A A;  2DLP A;  1AWO A;  2EGC A;  1I3Z A;  4K11 A;  1I07 A;  3IQL A;  1UG1 A;  2DL8 A;  2KK6 A;  2DNU A;  2DM1 A;  1HCS B;  5KAZ A;  5FWB A;  1M27 C;  2PNI A;  4R0K A;  1SEM A;  4J9B A;  2KR3 A;  1A1E A;  1M3A A;  4GL9 E;  2CUD A;  1YWP A;  1O4R A;  4X1V A;  2DRM A;  1GFD A;  2C9W A;  1LKK A;  1SHG A;  1XOV A;  3PJP A;  5GJW B;  2KGT A;  1U3O A;  2DJQ A;  4A4C A;  2O88 A;  1O4K A;  2ROL A;  3VRY A;  1WIE A;  4Y92 A;  1A81 A;  3RBB B;  1AB2 A;  1A1C A;  2C0O A;  1BB9 A;  4FSS A;  2DBK A;  5HCK A;  3VS7 A;  3IN7 A;  2O9S A;  1HCT B;  2VKN A;  3NHN A;  3MXC A;  2KE9 A;  1O4Q A;  1SHF A;  1GBR A;  1A1A A;  4JE4 A;  1JU5 A;  4NWG A;  2EKH A;  1F1W A;  2EYZ A;  2JS0 A;  2B3O A;  3EAC A;  1UHF A;  1YWO A;  3BUM B;  4Z8A A;  3U23 A;  5EG3 B;  3OP0 A;  1VYT A;  3CWG A;  5DF6 A;  5EC7 A;  1BHH A;  4DGX A;  3ZL7 C;  1SPS A;  1KA6 A;  1NZL A;  2RPN A;  3BKB A;  1T3L A;  3CXL A;  3M0Q A;  1LCK A;  3VS1 A;  1NEG A;  2KRM A;  2EYW A;  4DEY A;  1ZFP E;  4OMM A;  1O4B A;  2SEM A;  2MK2 A;  1IO6 A;  2BZY A;  2MOX A;  5EHR A;  1AVZ C;  2IUI A;  4JEG A;  1Z9Z A;  2LZ6 B;  4E68 A;  2EYY A;  3RNJ A;  3VS6 A;  1AEY A;  4ZNX A;  1YNZ A;  2D8J A;  4U1P A;  1MUZ A;  1W6X A;  2AOA A;  2GGR A;  2KBT A;  1K0S A;  2L2P A;  4OML A;  2IUH A;  1AOU F;  3EG0 A;  1SSH A;  1O47 A;  2J7I A;  4RUG A;  2AZS A;  1OO3 A;  2CRE A;  4AFS C;  3PSK A;  3HCK A;  2RNA A;  4D8D A;  2V1Q A;  1GHU A;  1P13 A;  1UTI A;  3TKZ A;  2SHP A;  1O41 A;  1O42 A;  2CR4 A;  3IMJ A;  3NPF A;  1LUI A;  1LKL A;  2JTE A;  2ECD A;  2F2X A;  1ABO A;  2LQN A;  2JW4 A;  1RUW A;  2DX1 A;  4HVU A;  3OV1 A;  1AWJ A;  1K1Z A;  4OHH A;  2KEA A;  2AKL A;  1JO8 A;  4JGH A;  2EO6 A;  2LJ0 A;  1AWX A;  2HMH A;  5IHN A;  2YU7 A;  1GBQ A;  1FU5 A;  1M61 A;  2EYX A;  1SHA A;  4AFQ C;  3N84 A;  2OZO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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