2DVJA

Phosphorylated crk-ii
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
228
structure length
227
Chain Sequence
MAGNFDSEERSSWYWGRLSRQEAVALLQGQRHGVFLVRDSSTSPGDYVLSVSENSRVSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGNQEGSHPQPLGGPEPGPAQPSVNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords V-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog, isoform a
total genus 17
structure length 227
sequence length 228
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2dvjA02
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2dvjA01
3OP0A 3VROA 4OHLA 1BHHA 4ORZA 5GJVB 2DL8A 1JYRA 2RF0A 2L3PA 1CWDL 3TKZA 1U06A 2XP1A 2EW3A 1I07A 3H0FA 1UFFA 1UECA 3H41A 1A0NB 2DILA 3H0HA 2ETZA 1QLYA 1M3CA 2Y3AB 4NWFA 4GWFA 1FHSA 1GHUA 1IO6A 5AXIA 2DF6A 2D1XA 1SRMA 4HVWA 5J3XA 2DL3A 4HVVA 2ROLA 2JW4A 2JS0A 4OMQA 2K2MA 1H3HA 3S9KA 3REBB 5CDWA 1ZSGA 1O4JA 4FSSA 1AB2A 2DVJA 4NWGA 1K1ZA 2DE0X 2DLPA 3EHRA 2RQVA 3ZL7C 4AG2C 3EHQA 2YT6A 2AK5A 1JU5C 1M8MA 1WYXA 1O4IA 2K3BA 2L3SA 4F5BA 2KYBA 2FG0A 1R1QA 2MIOA 2LNWA 3QWYA 5BO4A 4AFZC 4J9DA 3M0SA 1CSZA 3ZNIA 2SEMA 4J9EA 4A63B 3IMDA 1O4CA 2X3WD 2K9GA 2JS2A 2PLEA 2PNBA 1XOVA 4K44A 4OMPA 2FPFA 2RSYA 5GJIA 2YUNA 1YWOA 2VVKA 2C0TA 3GBQA 1A1AA 3RBBB 1WXUA 1J3TA 2D0NA 2JMAA 2V1RA 5FW9A 1KA7A 2J6FA 3NHNA 4JJBA 2HMHA 5FWCA 4U1PA 2KEAA 1LCJA 4GL9E 1I1JA 2LQNA 1M30A 2NWMA 1BLKA 2RN8A 3JV3A 1ZBJA 1A07A 4X1VA 2J7IA 1RJAA 2MQIA 1AYAA 1AWXA 4EY0A 2MRKA 1SRLA 3N8MA 4FL3A 2CT4A 3VRZA 2MC1A 3WA4A 1A1BA 4HVUA 1ZLMA 1FU5A 3FJ5A 1O49A 1LUMA 1M3BA 2B86A 1CSKA 1UJYA 1NYGA 4OHIA 3R6NA 3UF4A 4IIMA 3REAB 2PNIA 4HCKA 5I11A 2MOXA 2RMXA 4JGHA 2DL5A 4D8DA 5IXFA 1UURA 1TCEA 2CR4A 1SHAA 2CH4A 2EVRA 1M3AA 2I0NA 3IN8A 1QWFA 2KGTA 1FBVA 2BBUA 3SHWA 4ESRA 2RQRA 2KNOA 2K6DA 2KRNA 1LKKA 1UHFA 1LUIA 3GQIB 3BUNB 2KROA 3NMZC 4OMOA 2CUBA 1UG1A 2C0IA 2KT8A 5EHPA 1GBRA 3IN7A 2CS0A 1UDLA 1O4KA 1FYRA 1G83A 2AOAA 1Z9QA 1BM2A 3VRRA 2HUWA 1AYBA 2HDXA 3SEMA 1O4QA 2DMOA 3S8OA 3EGUA 4AFUC 2Y1NA 2YU7A 4OMMA 1YVHA 1GCQC 2GQIA 2AZVA 1YN8A 3N84A 5D0JA 2EKHA 2PTKA 1QKWA 1P13A 3VS1A 1WXBA 1GL5A 2MK2A 3C7IA 1W1FA 5IHIA 1OPKA 1YP5A 1R1SA 5DF6A 1VA7A 2RVFA 1GFDA 1V1CA 3CQTA 1W6XA 3KFVA 1RUWA 2AKKA 1B47A 1BFJA 4JJCA 1MV0B 1YNZA 3PE0A 2VKNA 2VIFA 2RQWA 2H5KA 2DX1A 2EYXA 2JM8A 2A36A 2A28A 4Z88A 3A98A 1O46A 2ABLA 2CBLA 1TUCA 5IHNA 3UYOA 3GXXA 3OB2B 3VRPA 1KIKA 1KA6A 1NLPC 3M0QA 4AFSC 3THKA 2FEIA 3IMJA 2SHPA 2NUZA 1W70A 2KYMA 1RI9A 2EQIA 2AUGA 3M0UA 1A81A 2SRCA 1BHHB 4A4CA 4RTYA 3NPFA 1ZUKA 1D4WA 2OQ1A 2LJ0A 2OJ2A 2K79A 3VS2A 1SHFA 2IIMA 1G2BA 1BK2A 2DJQA 3PVQA 1BG1A 5HKYA 1NEGA 2CSIA 5EHRA 1AOJA 2DLZA 4F5AA 2L3QA 2MRJA 2DM0A 4OHHA 4Z8AA 2GGRA 1HD3A 3TL0A 1M27C 3PSKA 4J9IA 1QADA 2LJ1A 5I22A 1FBZA 2D8JA 4LUEA 3EG0A 3I9QA 4CC2A 3I5RA 1D1ZA 2DCRA 2IUGA 1GRIA 4JE4A 1K4US 2EKXA 4DEYA 4E93A 1BKLA 1JXMA 2LMJA 2AKLA 1RLQC 4RTXA 2ENMA 4J9BA 1OEBA 3VS4A 1JYUA 1T0JA 3VS5A 5IXBA 2P4RA 2EU0A 3K2MA 4E68A 1QWEA 2KRSA 2FRYA 3CBLA 4K45A 3NGPA 1WX6A 5IBMA 1LKLA 1O4LA 2CIAA 3M0PA 1PKTA 4JZ3A 1AEYA 1TG0A 1O42A 2CSQA 2PZ1A 1PICA 3I5SA 5DC0B 5L23A 4E6RA 3VGOA 1E6HA 1UGVA 2E5KA 1WXTA 2LCTA 4JJDA 2KBTA 1PRLC 2OZOA 4FL2A 1D4TA 2LCSA 1WFWA 1LUNA 1S1NA 3VS0A 2CI8A 3TSWA 1SSHA 5KAZA 2ROTA 2J06A 3PLFB 2EBPA 4OHDA 1WA7A 1O4RA 1B3QA 1BLJA 1ABQA 3VRYA 3O5ZA 2VWFA 2V1QA 1NZLA 5EC7A 2RORA 3OV1A 1E7OA 1OO4A 2J6OA 2YSXA 1CKBA 3OB1B 2CDTA 2FPEA 1WIEA 4F17A 5I6VA 1M61A 1QCFA 1SHBA 2AOBA 2BZXA 1WI7A 4F14A 2KNBB 1BBZA 4AFQC 2RQUA 1JEGA 2HSPA 1QG1E 1BFIA 1VYTA 1LCKA 1K0XA 1A09A 1H8KA 1AYCA 1MV3A 3OVEA 1TUDA 2M0YA 5FWBA 1QKXA 2J05A 3M0RA 1O4PA 2DYBA 2EGEA 1O4OA 1X2KA 1NLOC 2HDVA 1Y1UA 2IUIA 4DEXA 2KE9A 5HKWA 3MXYA 2IUHA 2L0AA 5IH2A 4RTWA 1SPKA 2EOBA 4HXJA 1KSWA 1UUEA 2KRMA 1N5ZA 1AVZC 1KJWA 2YDLA 3U23A 4P9ZA 5DC9A 2L4KA 5DC4A 2H8HA 4GBQA 2RMOA 2X3XD 5IBSA 2FRWA 2O2OA 4GLMA 1JU5A 2KXCA 1HSQA 3S8LA 2GSBA 2DL7A 3US4A 1AOTF 4ZNXA 2XMFA 4X6SA 3UA6A 1FYNA 1MUZA 1UJ0A 1X6GA 4KRTA 1FU6A 2EO6A 1AWJA 1X27A 1NZVA 4GPLB 4P9VA 4DGPA 1SHGA 4CC4B 3QWXX 3RNJA 1Z3KA 4JEGA 1JWOA 4CC3A 1JXOA 2K79B 4IIOA 4R0KA 2FPDA 2HBWA 1O4FA 2DX0A 1A08A 3VRQA 1WLPB 2G6FX 5HKZA 1O4BA 1NYFA 2EPDA 2GTJA 3BUWB 1CJ1A 2F2XA 2RNAA 4L1BB 1ABOA 1R1PA 2ECDA 2M51A 1O43A 1U3OA 2DBKA 4K2RA 2DRKA 1T3SA 1AD5A 2BZ8A 1O4DA 1CSYA 4LN2A 1YVLA 3UATA 2EL8A 4RTTA 4DGXA 1AOUF 1RLPC 3BUXB 1RPYA 3UA7A 3PFVA 3TVTA 2LZ6B 4JPBW 1AYDA 2L6KA 3MXCA 2HCKA 3N7YA 2EYWA 1F1WA 1OV3A 2YUOA 1O41A 1O4HA 4AG1C 2YSQA 1UHCA 2AZSA 1WDXA 2KXDA 2MCNA 3CD3A 1Y57A 1WQUA 1NM7A 4H1OA 1T3LA 1OPLA 1JYQA 1SKJA 2OI3A 1AZGB 5IHKA 1EFNA 4OMLA 2LNXA 4XZ0A 1T0HA 1JQQA 2J6KA 1BMBA 2EYYA 1Y0MA 1H92A 1BU1A 5GJHA 3BUOB 4M4ZA 1VYUA 1NRVA 2O31A 3EG3A 2W10A 1GCQA 2JMCA 2JT4A 1Z9ZA 3C0CA 1O4NA 1ZUUA 3CWGA 2DM1A 5EELA 2KK6A 2IZVA 2EGAA 1AWWA 1LUKA 2CI9A 4ROJA 4Z89A 2A08A 2C9WA 1IS0A 1O48A 1UTIA 2DA9A 2DNUA 2KR3A 1HJDA 2LJ3A 2DBMA 1O4MA 1O4EA 4J9FA 1ZFPE 2HDAA 1H9OA 4TZIA 4CC7A 2EGCA 3IQLA 2CT3A 1KFZA 1PWTA 1MILA 1E6GA 3VS3A 2JYQA 1K0SA 2CREA 2RQTA 4JZ4A 1CKAA 4H34A 2F2VA 2LX7A 1MW4A 1O44A 4WCIA 1UUSA 2BTTA 1YWPA 2HEQA 2LQWA 3BKBA 1YCSB 1K9AA 2C0OA 1X6CA 4XZ1A 4WWQA 2ESWA 2LP5A 3EG1A 4LNPA 2K7AB 2LNHB 1CWEA 2CRHA 1U5SA 2L3TA 2EO3A 5AULA 1PRMC 4J9CA 2YUQA 1PNJA 2O9VA 3LH5A 3CXLA 2DL4A 1HCTB 1ZUYA 3VS6A 3M7FA 4F59A 3BUMB 4OMNA 2K7AA 2YUPA 3PJPA 5ECAA 2DLYA 1M27A 3I35A 1SPSA 4EIKA 5GJWB 1A1CA 1B07A 2PLDA 1RQQC 4LE9A 4J9GA 1BF5A 3MAZA 2L2PA 1OO3A 2GTOA 3EAZA 3PS5A 1NG2A 1GFCA 1X69A 2GBQA 2JXBA 2W0ZA 4RTUA 4RTVA 3TSZA 1AZEA 1SHDA 2ECZA 2RPNA 3PVLA 3M0TA 1TZEE 1KC2A 2FCIA 3S8NA 3PSJA 2DRMA 5EEQA 2GE9A 4A4BA 3T04A 2PNAA 1BB9A 1HCSB 4RTZA 1GCPA 4RUGA 3VRNA 1NEBA 2EYVA 1K76A 2F2WA 4F16A 1SPRA 2QMSA 4J9HA 2OAWA 4Y92A 1OOTA 1ARKA 1IJRA 4QSYA 2O9SA 1X6BA 2A37A 2B3OA 3PQZA 1I0CA 1X2QA 4EIHA 1BHFA 2BZYA 1SEMA 1JO8A 1FMKA 3H0IA 1O4AA 3EACA 1ZX6A 2CUDA 1O4GA 2Y1MA 4FBNA 2CH4W 2ED1A 1UE9A 3VS7A 2EYZA 3ULRB 2JM9A 2QDLA 1GBQA 2KT1A 2FO0A 2JTEA 4QT7A 3HCKA 1I3ZA 4U17A 4OHEA 5EG3B 1BKMA 2GNCA 3KFJA 3HHMB 1X43A 4D8KA 1AWOA 1PHTA 1A1EA 4LUDA 3HIZB 5HCKA 1O47A 1X0NA 3GXWA 1XA6A 2ED0A 1PKSA 2D8HA 2O88A 1F2FA 1VYVA 3EG2A 1O45A 2H46E 4K11A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BHHA 4ORZA 4M7AF 2DL8A 4C0ZA 3TKZA 2MAMA 1VQ5A 4Z02A 4ZTFA 3H0FA 1G3WA 2RI2A 2Y4XA 3H41A 1A0NB 2ETZA 1RAEB 1YJNA 2LRQA 1VQ8Q 5D6WA 1GHUA 1M90R 4PFOA 1IO6A 5AXIA 1KK7A 4HVVA 4ZTJA 4B9XA 4KUDK 2K2MA 1H3HA 1G8XA 3CXCP 1VQPQ 5LJ3j 1AB2A 1K1ZA 2PU9B 4OMFB 3QPHA 2VASA 3ZL7C 3EHQA 1O75A 1WYXA 2AK5A 3CCRQ 2KYBA 1NJIC 4M7DC 2MIOA 2LNWA 2COZA 3QWYA 3JB9F 1CSZA 3JCMg 3IMDA 1RAFB 2JS2A 1BYMA 4JS4A 5IN1A 1YWOA 3GBQA 1A1AA 3LGFA 5FW9A 2QYZA 5FWCA 1MMGA 1WPYA 1LCJA 1D1AA 2NWMA 2QEXQ 3JV3A 1RJAA 1AWXA 4E7JA 2DIQA 3WA4A 3CCVT 2ZPHB 3CC4A 1FU5A 1Y7XA 3FJ5A 4OHIA 1IHVA 3DLLA 2RMXA 3EGDA 3CCEQ 2DPPB 1FBVA 3SHWA 3X24B 2KNOA 5KE2A 2K6DA 1YJ9Q 1LUIA 4HT9A 3GQIB 2K5FA 3ZBDA 4E7HA 3NMZC 3C95A 2KT8A 4M78C 2CS0A 3G4SQ 1B34A 1FYRA 4BY6B 1G83A 2AOAA 1Z9QA 3CC7T 1ZSZA 2HUWA 3UWNA 2DMOA 3S8OA 3EGUA 2PQWA 3N84A 4FT4A 1H3ZA 5D0JA 3HFNA 2F69A 1IB8A 1QKWA 3QHSA 2ZPIB 1GL5A 3C7IA 4JRIA 4ZN3A 2COWA 1R1SA 1FXXA 2EWNA 1RUWA 5A0GA 1PC0A 3PE0A 2JM8A 3GNGA 4RKUE 2RJCA 5IHNA 3UYOA 3VRPA 3GIBA 1KIKA 4AFSC 2FEIA 1BI2A 5GAN6 2SHPA 2AUGA 1A81A 3CXCA 2HAXA 3RERA 1ZUKA 2OJ2A 2WSFE 3P8BB 3LH0A 2IIMA 2IG0A 1NPPA 3PVQA 1BG1A 1NEGA 3OYBA 5EHRA 2L3QA 4ATOA 4OHHA 1OZ2A 4J83A 3CC2A 4PK4A 3MO8A 3P8DA 3G71A 4J9IA 3CXCS 1QADA 3JCMW 2D8JA 2CP6A 3EG0A 2IVWA 3I5RA 3V7CA 5GANh 4C8QE 2IUGA 3CCQT 4DEYA 2DFUA 1JYUA 3M5AA 4NL2A 3DB3A 3M9QA 2EU0A 4E68A 2KRSA 5IBMA 4MZMA 1AHJB 1O4LA 3CCUQ 2CIAA 3M0PA 2R5AA 4JZ3A 3I5SA 5DC0B 1WXTA 2LQKA 2LCTA 1LNXA 3KBGA 1NJIR 3VS0A 5KAZA 3TSWA 1SSHA 2ROTA 3PLFB 4C92E 1O4RA 1ABQA 2BE7D 2PUKB 3LX7A 5LJ3h 4NL3A 1ACMB 1M2OA 2RORA 2LCLA 4C92C 1CKBA 2FPEA 1YJWT 1WIEA 5I6VA 2DXTA 3EAEA 1SHBA 4BI4A 1K8AC 4F14A 4YTLA 5GAN3 2LX9A 3FC3A 3NFCA 2HSPA 2VC8A 4EMKA 3LLRA 3OSSC 1TUDA 2M0YA 3OVEA 5FWBA 4E47A 1QKXA 3H9NA 3OYDA 1M1KC 3M0RA 4BACA 2OTJA 1C1AA 2EGEA 2ZCFB 1UGSB 3V8KA 3VUZA 3CMAT 5HKWA 2I2LA 3CCVQ 3OYNA 1VQ9Q 2CGHA 5CCAA 2NUTB 4C92G 5DC9A 2H8HA 3JCMc 2EJGA 4BE0A 3LYIA 5IBSA 2FRWA 2O2OA 4C8QA 1JU5A 1K73C 1YHQT 2X9HA 4M7DD 1EIFA 2HD0A 1UJ0A 4GPLB 1X6GA 4KRTA 1FU6A 2EO6A 1NZVA 1X27A 8ATCB 4DGPA 2HSEB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3OP0 A;  3VRO A;  4OHL A;  1BHH A;  4ORZ A;  5GJV B;  2DL8 A;  1JYR A;  2RF0 A;  2L3P A;  1CWD L;  3TKZ A;  1U06 A;  2XP1 A;  2EW3 A;  1I07 A;  3H0F A;  1UFF A;  1UEC A;  3H41 A;  1A0N B;  2DIL A;  3H0H A;  2ETZ A;  1QLY A;  1M3C A;  2Y3A B;  4NWF A;  4GWF A;  1FHS A;  1GHU A;  1IO6 A;  5AXI A;  2DF6 A;  2D1X A;  1SRM A;  4HVW A;  5J3X A;  2DL3 A;  4HVV A;  2ROL A;  2JW4 A;  2JS0 A;  4OMQ A;  2K2M A;  1H3H A;  3S9K A;  3REB B;  5CDW A;  1ZSG A;  1O4J A;  4FSS A;  1AB2 A;  2DVJ A;  4NWG A;  1K1Z A;  2DE0 X;  2DLP A;  3EHR A;  2RQV A;  3ZL7 C;  4AG2 C;  3EHQ A;  2YT6 A;  2AK5 A;  1JU5 C;  1M8M A;  1WYX A;  1O4I A;  2K3B A;  2L3S A;  4F5B A;  2KYB A;  2FG0 A;  1R1Q A;  2MIO A;  2LNW A;  3QWY A;  5BO4 A;  4AFZ C;  4J9D A;  3M0S A;  1CSZ A;  3ZNI A;  2SEM A;  4J9E A;  4A63 B;  3IMD A;  1O4C A;  2X3W D;  2K9G A;  2JS2 A;  2PLE A;  2PNB A;  1XOV A;  4K44 A;  4OMP A;  2FPF A;  2RSY A;  5GJI A;  2YUN A;  1YWO A;  2VVK A;  2C0T A;  3GBQ A;  1A1A A;  3RBB B;  1WXU A;  1J3T A;  2D0N A;  2JMA A;  2V1R A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3OP0 A;  3VRO A;  4OHL A;  1BHH A;  4ORZ A;  5GJV B;  2DL8 A;  1JYR A;  2RF0 A;  2L3P A;  1CWD L;  3TKZ A;  1U06 A;  2XP1 A;  2EW3 A;  1I07 A;  3H0F A;  1UFF A;  1UEC A;  3H41 A;  1A0N B;  2DIL A;  3H0H A;  2ETZ A;  1QLY A;  1M3C A;  2Y3A B;  4NWF A;  4GWF A;  1FHS A;  1GHU A;  1IO6 A;  5AXI A;  2DF6 A;  2D1X A;  1SRM A;  4HVW A;  5J3X A;  2DL3 A;  4HVV A;  2ROL A;  2JW4 A;  2JS0 A;  4OMQ A;  2K2M A;  1H3H A;  3S9K A;  3REB B;  5CDW A;  1ZSG A;  1O4J A;  4FSS A;  1AB2 A;  2DVJ A;  4NWG A;  1K1Z A;  2DE0 X;  2DLP A;  3EHR A;  2RQV A;  3ZL7 C;  4AG2 C;  3EHQ A;  2YT6 A;  2AK5 A;  1JU5 C;  1M8M A;  1WYX A;  1O4I A;  2K3B A;  2L3S A;  4F5B A;  2KYB A;  2FG0 A;  1R1Q A;  2MIO A;  2LNW A;  3QWY A;  5BO4 A;  4AFZ C;  4J9D A;  3M0S A;  1CSZ A;  3ZNI A;  2SEM A;  4J9E A;  4A63 B;  3IMD A;  1O4C A;  2X3W D;  2K9G A;  2JS2 A;  2PLE A;  2PNB A;  1XOV A;  4K44 A;  4OMP A;  2FPF A;  2RSY A;  5GJI A;  2YUN A;  1YWO A;  2VVK A;  2C0T A;  3GBQ A;  1A1A A;  3RBB B;  1WXU A;  1J3T A;  2D0N A;  2JMA A;  2V1R A; 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