2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Crk-like protein
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
3S8LA 1YCSB 2LQNA 5EG3B 4HVVA 4JPBW 1O4MA 3VRYA 4FL3A 1SPSA 3PLFB 1BB9A 3EG3A 2K79B 1O4LA 2DBMA 2F2VA 1V1CA 1NZLA 5GJVB 2KRMA 2EL8A 2X3WD 3PSJA 4F14A 2QMSA 5AULA 1NRVA 4F59A 2IUIA 4FL2A 3VRQA 4DGXA 3C0CA 3KFJA 3NPFA 4OHLA 4F5BA 4OMQA 1KA7A 2FPDA 4ESRA 2DLYA 2K79A 1RLPC 2L0AA 4OMMA 3BUMB 1LCKA 1E6HA 3OB2B 1O4FA 4AG2C 1SHAA 2CI8A 2RN8A 1K9AA 5DC0B 1Z9ZA 1PKTA 1A07A 1JXMA 3I5SA 2ETZA 4CC3A 2CBLA 2ROTA 1LCJA 4QT7A 3SEMA 3M7FA 2ABLA 2SHPA 4JJCA 1BHHA 2DL8A 1O42A 2KYBA 1WFWA 3WA4A 2FO0A 2L3TA 1O4IA 1O46A 1OO3A 1CKBA 4GWFA 4J9GA 1BKMA 2NUZA 2W10A 2H8HA 1BKLA 1O4QA 4OHIA 5D0JA 5HCKA 1GL5A 1TUCA 3VS1A 2GNCA 3IMDA 4LNPA 2C0TA 1CSKA 3EG2A 1UG1A 3S8OA 2RQRA 1A1BA 4HVUA 3UA7A 4HCKA 1AB2A 2IIMA 1ARKA 2L3PA 3KFVA 1U5SA 1X2QA 1Z3KA 2AUGA 5IBMA 2J6KA 1QWFA 1KIKA 2KRSA 3RBBB 4H34A 1WLPB 4J9EA 1JYUA 3TKZA 4AFUC 2EYXA 2OAWA 2DX0A 3VS4A 2JW4A 1AYDA 2CH4W 3O5ZA 1O4OA 3PS5A 1UECA 2LZ6B 1NYFA 2VKNA 3PVLA 1R1PA 2ROLA 2LCSA 2DM1A 2SEMA 3ULRB 1Y0MA 4J9CA 1I3ZA 1JWOA 3VS7A 1MW4A 1RPYA 2D8JA 2JMCA 3I35A 2MOXA 2RVFA 4WWQA 1WQUA 1MV0B 3PJPA 2ECDA 5KAZA 1JO8A 3T04A 1B07A 4L1BB 5EHPA 1BBZA 1FYNA 2GTJA 1GCPA 1UJ0A 2K7AB 1HJDA 3OP0A 1A1CA 5J3XA 2KE9A 1VYTA 1WXTA 2DYBA 4R0KA 1GRIA 1QADA 2YSXA 4K11A 2A28A 2MC1A 4RTTA 2EPDA 1GFCA 4Z89A 2K6DA 1M30A 4CC4B 3H0IA 2LNHB 1T0HA 1ZX6A 1BLKA 2JM8A 1JU5C 1YVLA 4OHEA 1QKXA 1K1ZA 1BLJA 2LQWA 1I0CA 3M0UA 4X6SA 1AWJA 2FG0A 2M51A 4RTVA 1X43A 1A09A 4FSSA 1A0NB 2LJ0A 1X6GA 4A63B 3TL0A 3VS5A 5HKWA 1K76A 1O4DA 2FCIA 2LJ3A 5FWBA 2BZ8A 4JJBA 4K45A 2CDTA 1JYRA 1LUIA 2EVRA 2F2WA 1O4BA 1K0XA 1RUWA 1FBVA 1LKLA 4JEGA 1GCQA 2A08A 2DBKA 3H0FA 1O4CA 1GBQA 1R1SA 3UATA 1H8KA 4J9IA 1W6XA 4RUGA 1W1FA 2YUQA 1BK2A 1H92A 1K4US 3NGPA 4CC2A 2RORA 2GTOA 1H9OA 1B47A 4LUEA 2J05A 1X0NA 1W70A 1LUKA 1HSQA 1YVHA 2JMAA 4A4BA 2KROA 3UF4A 4H1OA 3THKA 4RTUA 4KRTA 3EACA 2IZVA 1A1EA 1AOJA 2OQ1A 1NEBA 1RQQC 1G83A 1SHFA 3RNJA 2EBPA 3GXWA 2LCTA 3M0RA 2RNAA 1AYBA 4EY0A 3CXLA 2EOBA 4JJDA 1P13A 5GJIA 2DRMA 4P9ZA 1NG2A 1A08A 1MV3A 4DEYA 2IUGA 2SRCA 1H3HA 2O9SA 1Y57A 2KK6A 2D1XA 5IXFA 2KGTA 1JXOA 1UUSA 4P9VA 2FRWA 2F2XA 1UHCA 4ROJA 1OOTA 2QDLA 3SHWA 3VS6A 2YUOA 1O45A 2PLDA 2JM9A 1O4PA 1OO4A 2AOBA 5HKYA 1PWTA 2EQIA 2EKXA 1UURA 5IBSA 1SKJA 2HDAA 1KFZA 1NEGA 2KRNA 2RF0A 1AZEA 1ZFPE 2DCRA 1X2KA 1T3LA 3PSKA 1PNJA 4U17A 4FBNA 2HBWA 1K0SA 2CUDA 1E6GA 3PE0A 4RTYA 2MCNA 1LUMA 1Y1UA 2EGAA 2KT8A 2EKHA 2KR3A 1UDLA 1AVZC 2AKLA 3GQIB 2RQVA 2MRJA 5IHIA 1I1JA 2W0ZA 4NWFA 1PRMC 1O43A 1X27A 1AWOA 2K2MA 1PICA 1EFNA 2VIFA 3MAZA 1O41A 1YN8A 1UJYA 1GHUA 3EHRA 3N7YA 3GBQA 4M4ZA 4LE9A 2M0YA 5HKZA 1RI9A 1PKSA 1TUDA 2EW3A 2KXDA 2CRHA 3JV3A 1O47A 4OMOA 2VVKA 1YNZA 4DEXA 3VS2A 1O4KA 2HMHA 2MQIA 3UYOA 1KA6A 3QWYA 3VS3A 2KT1A 4GBQA 2C0IA 3BKBA 2AK5A 1FMKA 4RTZA 1AWXA 1S1NA 4JZ3A 2LJ1A 3TSZA 1HD3A 4K44A 2HCKA 1SRLA 2V1QA 1M27A 1D1ZA 2MRKA 1M3CA 2CSQA 3EG0A 1BF5A 1X6BA 3EHQA 2DRKA 1UGVA 1T0JA 2HDVA 1AD5A 5FWCA 1SSHA 1MUZA 5GJWB 1WA7A 4Y92A 2VWFA 2YUPA 5IHKA 3N84A 4A4CA 2YDLA 1OEBA 3IN8A 2D0NA 3TSWA 4GLMA 1FU6A 2KNOA 4XZ0A 1OPLA 1ZBJA 3US4A 5CDWA 2CSIA 1I07A 2YU7A 2BZYA 2K7AA 3I9QA 1U06A 1GBRA 2ENMA 1TZEE 2CREA 3VGOA 2CS0A 1QCFA 1BMBA 5AXIA 3HCKA 3IMJA 1BG1A 2AZVA 2BZXA 4F17A 1T3SA 2J7IA 3K2MA 4AFQC 2H5KA 3A98A 2EYZA 2PNIA 4GL9E 2DL3A 1O4JA 1O4GA 3OV1A 2JYQA 3ZL7C 2O31A 3VS0A 2I0NA 1E7OA 1J3TA 4OMPA 3GXXA 1WYXA 2GSBA 3IQLA 1VYVA 4F16A 2EGEA 1O49A 1SPKA 4XZ1A 1O4HA 5EC7A 1PHTA 2RQWA 4JGHA 2KXCA 2BBUA 1UTIA 2EYVA 1WIEA 1GFDA 1CKAA 2DA9A 3S9KA 2CUBA 2HDXA 3C7IA 1CSYA 3IN7A 4J9DA 3H0HA 3HHMB 3QWXX 1RJAA 1VYUA 4J9FA 1QKWA 1SPRA 1XA6A 5DF6A 1O4EA 1SRMA 2YT6A 2EYWA 2KBTA 4OMNA 2A36A 2CT3A 1TCEA 2L6KA 2PTKA 2PZ1A 2OZOA 3BUWB 1SEMA 2FEIA 5ECAA 2JS2A 4CC7A 2DL7A 4D8DA 2MIOA 3VRNA 2GQIA 2DNUA 2DX1A 5IHNA 4F5AA 2FRYA 2RMXA 1YWPA 2PLEA 2CI9A 2B3OA 1NYGA 3VROA 1KC2A 3HIZB 1HCTB 1SHBA 1RLQC 1XOVA 3EGUA 1UE9A 1B3QA 3N8MA 2J6FA 3TVTA 3CWGA 2DE0X 3U23A 2DL4A 1UFFA 2DLZA 3CD3A 3MXCA 2NWMA 2C0OA 1N5ZA 1QG1E 1ABQA 1AZGB 1VA7A 2A37A 4RTWA 1IS0A 1D4WA 1GCQC 1FHSA 4WCIA 4DGPA 1BHHB 2RMOA 3EAZA 1LKKA 2LX7A 5IH2A 1SHGA 2B86A 4OMLA 3H41A 2GE9A 1KJWA 2DJQA 2RSYA 4U1PA 2ED1A 1U3OA 4JZ4A 2KEAA 4AFZC 2K3BA 2O88A 2EGCA 4HXJA 2ED0A 4EIKA 1BFIA 2JS0A 4AFSC 5IXBA 1O48A 1HCSB 1SHDA 1AOUF 1Z9QA 2JT4A 2D8HA 5I11A 4OHHA 3M0SA 4IIMA 3UA6A 4E6RA 2CIAA 1BU1A 5EEQA 1NLOC 4LUDA 1AYCA 2OI3A 2H46E 2BTTA 1X69A 4HVWA 2G6FX 1M61A 1WI7A 2KNBB 2LNXA 3PFVA 3S8NA 2KYMA 3NMZC 1KSWA 2DM0A 3M0TA 1UUEA 5DC9A 2XMFA 4RTXA 1O44A 1CJ1A 1ZUYA 3ZNIA 1LUNA 2DMOA 2JTEA 2HEQA 2P4RA 2DF6A 3M0QA 3BUNB 2PNAA 2Y1NA 1WXUA 1IO6A 1JYQA 5BO4A 1ABOA 1ZUUA 1NZVA 3BUXB 3OB1B 2CR4A 4LN2A 4J9HA 2RPNA 1JU5A 1YWOA 3CBLA 1PRLC 3FJ5A 4X1VA 3VRZA 1YP5A 2AZSA 3VRRA 2IUHA 2FPEA 2K9GA 3MXYA 5I22A 1OV3A 1ZLMA 1FU5A 4Z88A 2O2OA 2Y3AB 4E93A 1CWEA 2AKKA 2DLPA 1AWWA 1OPKA 2FPFA 1CSZA 3NHNA 1R1QA 1UHFA 2E5KA 2L3SA 2EO6A 1AEYA 2HUWA 4JE4A 1JEGA 2Y1MA 2EO3A 1F2FA 1AOTF 2DL5A 1JQQA 4ZNXA 1WDXA 1AYAA 4QSYA 3PVQA 2PNBA 4Z8AA 4OHDA 2LMJA 1BHFA 3PQZA 2RQTA 5L23A 1G2BA 4J9BA 2LNWA 1F1WA 1TG0A 4ORZA 2CT4A 2RQUA 2L2PA 2LP5A 4K2RA 1NLPC 2HSPA 3CQTA 2OJ2A 5EHRA 2ECZA 3R6NA 1FBZA 1A1AA 2J06A 2J6OA 3BUOB 3M0PA 1M27C 1M3BA 2XP1A 3REBB 4D8KA 1M8MA 1ZUKA 3REAB 2DILA 5EELA 2DVJA 4IIOA 2C9WA 1FYRA 2MK2A 1QWEA 3VRPA 1CWDL 2AOAA 1M3AA 2X3XD 1X6CA 4AG1C 1QLYA 3LH5A 1BM2A 1D4TA 4GPLB 2ESWA 1ZSGA 2YUNA 1WX6A 1IJRA 1BFJA 4E68A 3EG1A 3I5RA 2O9VA 2GGRA 3OVEA 2GBQA 2L3QA 1O4AA 5FW9A 4NWGA 2CH4A 2EU0A 5I6VA 2V1RA 1O4RA 4EIHA 2JXBA 1A81A 1MILA 5GJHA 1NM7A 1WXBA 1O4NA 4TZIA 2YSQA 5DC4A 2L4KA 2EYYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E19A 1YCSB 2LQNA 5EG3B 5GAMf 1VQNQ 3MEUA 3CD6A 4TVRA 3JB9D 2DIGA 2QK0A 3PLFB 2K79B 5GMKm 1IZ6A 2KRMA 2LT1A 1NRVA 1SF9A 1VQ6T 4J7FA 1W4SA 2OTJA 1MNEA 4M77E 1BI2A 3C0CA 3KFJA 4F5BA 4OMQA 2MYSA 2YXYA 3META 2FPDA 4QKUA 2DLYA 2XDBA 2FVUA 1OX9A 1E6HA 2CI8A 1SHAA 4C0ZA 1Z9ZA 3UWNA 1A07A 2R58A 1VQMT 1LCJA 2K5LA 2ABLA 2RJCA 8ATCB 5CKDA 1EX4A 2FO0A 2L3TA 2VB6A 4FW2A 3LH0A 1OX8A 2R57A 3CCUA 2LVMA 2COZA 4AMCA 1NE8A 3EG2A 1UB4A 3S8OA 2IIMA 3OYNA 1VQNA 1U5SA 5IBMA 2J6KA 1QWFA 4KGZB 2KRSA 2YRDA 1WLPB 2RHXA 1JYUA 4PJOA 2F69A 2OAWA 1WHLA 3L2UA 5LJ3g 3O5ZA 4JS5A 3LGFA 2VKNA 3HKSA 4A4GA 1WZOA 3CBMA 2SEMA 2Z0WA 2LCSA 1Y0MA 3OYBA 5DM7R 2EAYA 3VS7A 2D8JA 2IVWA 3I35A 4HCBA 1MV0B 4PJOD 5EHPA 1BBZA 3J7AF 1MHNA 2K2VA 4XU3A 2NUTA 3QUIA 5GANg 2OTLT 2DEQA 3MP6A 2K7AB 1KQSS 1A1CA 2KE9A 1VYTA 4JUVA 1PSEA 1ZBXA 1QW1A 2MC1A 1GFCA 4Z89A 2WSFE 2K6DA 3M4YA 3OS1A 1TTHB 1D0YA 2JM8A 3CXCP 1M8VA 1JU5C 4E7LA 1QKXA 1EIFA 2LQWA 1BIBA 3M0UA 3QDRB 4X6SA 1AWJA 1M90C 3CXCS 3A8HB 4FSSA 1A0NB 1X6GA 2XDDA 1OI1A 1K76A 1O4DA 1BCOA 1U1TA 3D7SB 1JYRA 1TUGB 4A4EA 2NYSA 1I5LA 2HQEA 2VYTA 1IGUA 3LX7A 1H8KA 2KGYA 2YUQA 1BK2A 3NGPA 2FB7A 2RORA 4IUTA 2GTOA 5GMKh 4WF2A 3OYLA 2J05A 1X0NA 1M9SA 1W70A 3MEAA 1LUKA 2FZGB 2KROA 4H1OA 4MMLA 3EACA 4M75C 1R0CB 3DLLA 1RQQC 4BI4A 4OB2B 4JJDA 1YHQQ 4EMKC 1A08A 1MV3A 2IUGA 2EQKA 1H3HA 3H6ZA 2O9SA 2G3RA 2D1XA 5IXFA 4M75E 4PLIA 1UHCA 4ROJA 2QDLA 3SHWA 3VS6A 4C0GA 3JB9F 1O45A 4C8QE 3EH2A 2HAXA 1O4PA 3NTKA 2DTHA 3CMET 3EGDA 3FLGA 5KYNA 4N0AC 1QCOA 1KFZA 1NEGA 1W2BS 3CBPA 2F5KA 1VUBA 4X34A 4RKUE 1PNJA 4EMHA 2QXFA 5LJ3d 5AT1B 2EGAA 1VQ4T 2KT8A 1UDLA 1N8RR 4ATOA 2AKLA 2MRJA 5IHIA 1I1JA 2W0ZA 4IUPA 3CCLQ 1GHUA 3N7YA 4LE9A 2M0YA 4M75G 5DLQE 1RI9A 5HKZA 1ZSZA 2CZ1B 2CRHA 1TUDA 5GANd 1VQOQ 3G71T 3JV3A 4C0DC 2VVKA 1HK9A 3HL8A 2MQIA 3BFMA 1KA6A 5GAMg 3G6EQ 2KT1A 2ZPEB 1YHQA 1FMKA 1S1NA 1HD3A 2QA4Q 6AT1B 2MRKA 2CSQA 3EHQA 1M2OA 2A0FB 1UGVA 2R5AA 5KYWA 4PJLA 1G3YA 9ATCB 3N5BB 2AT1B 3QSUA 3N84A 3FIFA 4B9WA 1ZBJA 3GF5A 5CDWA 2X35A 1GBRA 4M75B 4MZMA 1N8RU 4FYYB 3V8JA 4PJOC 2AZVA 2BE7D 4DOVA 4JRQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3E19 A;  1YCS B;  2LQN A;  5EG3 B;  5GAM f;  1VQN Q;  3MEU A;  3CD6 A;  4TVR A;  3JB9 D;  2DIG A;  2QK0 A;  3PLF B;  2K79 B;  5GMK m;  1IZ6 A;  2KRM A;  2LT1 A;  1NRV A;  1SF9 A;  1VQ6 T;  4J7F A;  1W4S A;  2OTJ A;  1MNE A;  4M77 E;  1BI2 A;  3C0C A;  3KFJ A;  4F5B A;  4OMQ A;  2MYS A;  2YXY A;  3MET A;  2FPD A;  4QKU A;  2DLY A;  2XDB A;  2FVU A;  1OX9 A;  1E6H A;  2CI8 A;  1SHA A;  4C0Z A;  1Z9Z A;  3UWN A;  1A07 A;  2R58 A;  1VQM T;  1LCJ A;  2K5L A;  2ABL A;  2RJC A;  8ATC B;  5CKD A;  1EX4 A;  2FO0 A;  2L3T A;  2VB6 A;  4FW2 A;  3LH0 A;  1OX8 A;  2R57 A;  3CCU A;  2LVM A;  2COZ A;  4AMC A;  1NE8 A;  3EG2 A;  1UB4 A;  3S8O A;  2IIM A;  3OYN A;  1VQN A;  1U5S A;  5IBM A;  2J6K A;  1QWF A;  4KGZ B;  2KRS A;  2YRD A;  1WLP B;  2RHX A;  1JYU A;  4PJO A;  2F69 A;  2OAW A;  1WHL A;  3L2U A;  5LJ3 g;  3O5Z A;  4JS5 A;  3LGF A;  2VKN A;  3HKS A;  4A4G A;  1WZO A;  3CBM A;  2SEM A;  2Z0W A;  2LCS A;  1Y0M A;  3OYB A;  5DM7 R;  2EAY A;  3VS7 A;  2D8J A;  2IVW A;  3I35 A;  4HCB A;  1MV0 B;  4PJO D; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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