3NHNA

Crystal structure of the src-family kinase hck sh3-sh2-linker regulatory region
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
DIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYKIRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Src Family Kinase Hck SH3-SH2 Linker Regulatory Region Supports an SH3-dominant Activation Mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein kinase HCK
total genus 31
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-06-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3nhnA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3nhnA02
2EYZA 2J05A 2KYBA 1YVHA 3GXXA 2A28A 4DEYA 1SHAA 1OPKA 2HSPA 1O4QA 3T04A 5EEQA 2GSBA 2LCSA 5AXIA 2KBTA 1WIEA 2G6FX 3KFJA 1UDLA 4JZ4A 3M0RA 2HBWA 2KT1A 4TZIA 1K9AA 5AULA 1SPSA 2QMSA 2JS0A 4X6SA 2DM0A 1PRMC 1BHHA 2NWMA 2RF0A 2BZ8A 1D4WA 1BFIA 1AYBA 1A1AA 5ECAA 4AFQC 1BU1A 4F59A 2JTEA 3CQTA 2CH4W 2ROTA 1BF5A 2DE0X 4LE9A 1WXUA 3H41A 5HCKA 3GQIB 1V1CA 2PTKA 2DYBA 2SEMA 2CI9A 1PKSA 2JS2A 2ETZA 3TVTA 1M27C 1NYFA 2L6KA 2B86A 2CUBA 1H9OA 2JT4A 3IQLA 2JMCA 2EL8A 4K44A 2CT4A 1AWOA 2CUDA 4EIKA 1CSYA 1W1FA 2W0ZA 4D8DA 3GBQA 2DLPA 2OAWA 4EY0A 1O42A 1OPLA 3MAZA 1U3OA 2DRKA 1LCKA 2LNXA 3M0PA 1WA7A 3VS4A 1GBQA 5IHNA 1ZLMA 5DC0B 1JU5C 2K3BA 2HMHA 3MXYA 1I1JA 2EYWA 2L3SA 4J9GA 1X27A 2OI3A 2OJ2A 4J9CA 2EQIA 4DEXA 1HSQA 1JYQA 4OMMA 5CDWA 2F2XA 2H8HA 4E93A 2AKKA 4F16A 1BM2A 3S8LA 1A81A 1M61A 2LX7A 3GXWA 4F5BA 1GBRA 1A1CA 5L23A 1AOJA 3VS3A 1TCEA 1OEBA 1SHFA 1PHTA 3EGUA 4F17A 1H3HA 5EHRA 1A08A 4RTVA 1AYCA 1AWJA 3PVLA 5HKWA 3VS5A 3PLFB 3PSJA 1RLQC 1NLPC 1ABOA 2LP5A 2O31A 1KA7A 5EELA 1UE9A 5GJHA 1SHBA 4ROJA 1OO3A 4Y92A 1YNZA 2AOAA 2KYMA 2EVRA 2HCKA 1M3BA 1ZUYA 1O49A 2L0AA 2ECDA 1MUZA 2GTJA 2BBUA 1QCFA 2DBKA 3JV3A 2D8JA 1FHSA 1Z3KA 1A07A 1IJRA 2DL4A 1T3SA 3EHQA 3A98A 1X6CA 2AOBA 2PNBA 2K6DA 5IBMA 1NEGA 3BKBA 1QWFA 1AD5A 3KFVA 5I11A 1T0HA 3THKA 2RORA 1OO4A 4EIHA 1FU6A 2IIMA 1K0XA 1LUIA 4JJBA 5GJWB 4U17A 3M0TA 1UHCA 2ED1A 1BG1A 4OHEA 3PVQA 4FSSA 2K7AA 1SHDA 4RTYA 1X0NA 1ZBJA 3PSKA 1SPKA 3HHMB 4AFSC 1KC2A 1MV0B 2GNCA 1KA6A 1CSKA 4HXJA 2YUQA 5FW9A 2L2PA 3VS2A 2A08A 1M27A 3OB2B 2KRMA 1KJWA 1Z9ZA 3NMZC 1X43A 5I6VA 4FL2A 3VS1A 2YSXA 2A37A 1O4IA 1P13A 3FJ5A 2EO6A 4A4CA 4J9IA 2LJ3A 2X3WD 3CWGA 2EKHA 1PWTA 3PE0A 1CSZA 2RQVA 2BZXA 1PKTA 1Y0MA 4KRTA 4JE4A 2LJ1A 3NPFA 1Y1UA 1O4JA 2KXDA 2ENMA 2LZ6B 1JU5A 3OVEA 2F2WA 2FRYA 4H1OA 2J6OA 1K4US 1FBZA 3EG0A 1AVZC 1NM7A 2DL3A 2JXBA 3TL0A 1N5ZA 2CI8A 3HIZB 2ABLA 2EGEA 3EG2A 2JM9A 3VS7A 1GL5A 1SHGA 2JW4A 2FO0A 2J06A 1O4LA 2HDVA 3VRNA 4JJCA 1M8MA 1X2QA 2LJ0A 1WDXA 2DMOA 4QT7A 2H46E 1VYUA 1LCJA 2M0YA 3C0CA 4OMPA 3PS5A 3S9KA 4OMQA 1IO6A 2DM1A 3BUNB 1O4KA 2V1RA 2AZVA 1LUMA 1O4OA 2KR3A 5EG3B 4LNPA 3N84A 2KNOA 2DL8A 3C7IA 3EAZA 1JWOA 2YSQA 3UYOA 1BLJA 2JM8A 3CD3A 1K0SA 2DNUA 4J9HA 1SSHA 1B07A 2MOXA 2DL5A 4OMLA 1D4TA 1U06A 2HDAA 1JYUA 2CBLA 2CS0A 2MK2A 2ED0A 2KRNA 2ESWA 3SEMA 2QDLA 2RN8A 4IIOA 4M4ZA 3UATA 3EG3A 4K11A 4CC2A 1O46A 2DX0A 1I07A 4QSYA 3VROA 4OHHA 2O88A 3OP0A 1JXOA 2DJQA 1UUSA 2AK5A 4HCKA 1M3AA 5DF6A 2ECZA 4OHLA 2GE9A 2DF6A 4ORZA 2HEQA 3EG1A 4JEGA 1AZEA 1TUCA 2GQIA 1O4PA 1YWOA 5IXBA 2LQNA 1G83A 5EC7A 1QG1E 2C0IA 2KRSA 1WFWA 2CSIA 1VYTA 5IHIA 1MW4A 2MC1A 2VVKA 3REAB 3TSWA 1AYAA 3UA7A 2M51A 3TKZA 1BHFA 1AEYA 5KAZA 1PNJA 1UTIA 2HUWA 3K2MA 2K79B 5DC4A 1GFCA 1U5SA 2CSQA 1O4MA 4AFZC 4WCIA 1K76A 1QKWA 2D1XA 2RVFA 4CC7A 4L1BB 1VYVA 1O47A 3PJPA 1XOVA 4RTZA 1A1EA 1CJ1A 4RTXA 1LUKA 2Y3AB 2EYVA 4F5AA 2KEAA 4GWFA 2RSYA 3BUMB 1J3TA 5D0JA 1A1BA 4IIMA 4JJDA 2VWFA 4H34A 4R0KA 3BUOB 2KE9A 3OV1A 2E5KA 2KNBB 4DGXA 2EO3A 4GPLB 1CKBA 2RQTA 2CR4A 2J6FA 1O4CA 1RPYA 1SKJA 1G2BA 1ZUKA 1QADA 1BBZA 2RQRA 2XMFA 1ZX6A 2W10A 4P9VA 5DC9A 3RBBB 4ESRA 1BHHB 1QWEA 3PFVA 1CWEA 2L3QA 3VS0A 1R1SA 1UECA 1X2KA 2AKLA 4LUEA 4JPBW 2LNHB 2GTOA 1BLKA 2NUZA 1JEGA 2EU0A 2CDTA 2DCRA 2KK6A 1PRLC 1O4DA 3IMJA 2O9SA 4OMNA 1WLPB 4RTUA 1WYXA 1HCSB 1AB2A 1R1QA 2K9GA 3I35A 1AOUF 1UJ0A 4U1PA 2EKXA 2RPNA 2EPDA 5FWCA 5BO4A 4HVVA 1SRLA 2D8HA 2YU7A 2FRWA 5GJVB 4Z8AA 2O9VA 1A09A 1RQQC 2RMXA 2GBQA 2BZYA 3WA4A 2Y1NA 1W70A 1CWDL 4X1VA 1B47A 5IBSA 2K79A 2FCIA 4FBNA 1UJYA 2FEIA 1LKKA 1O4EA 2RNAA 3M0QA 1QKXA 2EGCA 1FYRA 2MRJA 1KIKA 5I22A 2EYXA 1E6HA 1BB9A 2YT6A 1NZLA 5J3XA 1SRMA 2MCNA 1NG2A 2FPDA 5IXFA 2EBPA 3R6NA 2FPEA 1YVLA 4Z88A 1SEMA 1GCPA 1B3QA 1LKLA 1Z9QA 4NWGA 2L4KA 3ZNIA 1WX6A 2AZSA 2LCTA 1NLOC 1UURA 1BKMA 2LQWA 5IHKA 4GL9E 3TSZA 1JQQA 2DLYA 2KGTA 3EACA 2PLEA 2DX1A 2IUHA 3H0HA 2DA9A 3N7YA 2P4RA 2HDXA 1ZSGA 4D8KA 2KROA 1GHUA 1TUDA 3S8OA 2VKNA 1W6XA 3PQZA 4K2RA 1M30A 1JYRA 1RUWA 2IUGA 1T0JA 1UUEA 1TZEE 2MIOA 3OB1B 2RQWA 1O4AA 2CRHA 1FU5A 3VS6A 3VRQA 2X3XD 5HKZA 1M3CA 1GCQA 4CC4B 2L3TA 3S8NA 1H8KA 2K7AB 4J9BA 1UG1A 2PNIA 1PICA 3HCKA 4Z89A 4DGPA 5EHPA 3O5ZA 1K1ZA 5GJIA 4LN2A 2V1QA 2DILA 1YN8A 2O2OA 4AG2C 3US4A 2YUNA 4XZ0A 1E6GA 1HD3A 2PLDA 2Y1MA 2L3PA 3MXCA 3VRPA 1GFDA 1FBVA 2DL7A 1RJAA 3CBLA 1O4RA 5HKYA 3H0FA 3I5RA 1BFJA 3N8MA 2H5KA 4RTWA 1D1ZA 1FMKA 1YP5A 2PNAA 1YWPA 4AFUC 2GGRA 2RMOA 2MRKA 2ROLA 1O41A 3M0SA 2J6KA 1I3ZA 1FYNA 2C0OA 1KFZA 4RTTA 4K45A 2I0NA 1LUNA 1HJDA 3ULRB 1ZFPE 1O4BA 1MILA 3SHWA 2MQIA 2YDLA 3VGOA 1ABQA 2D0NA 1UGVA 1OOTA 2EOBA 1T3LA 2DLZA 4J9EA 1KSWA 2CT3A 4A4BA 2K2MA 1AOTF 1BKLA 3NHNA 3UA6A 1E7OA 1H92A 1NEBA 1SPRA 2EYYA 4NWFA 1O44A 4P9ZA 3H0IA 5FWBA 1O45A 2SRCA 2YUPA 4ZNXA 4J9DA 3I5SA 3UF4A 1EFNA 1A0NB 4A63B 2RQUA 1JXMA 2CREA 3M7FA 1NRVA 1GCQC 1O4FA 2CH4A 1Y57A 3EHRA 1S1NA 3BUXB 1CKAA 4OHDA 1JO8A 2OQ1A 4GLMA 1O4GA 1O4NA 3CXLA 1RI9A 3VRYA 2PZ1A 4F14A 4FL3A 1UHFA 2DRMA 1WQUA 1MV3A 1O48A 2FG0A 1TG0A 2BTTA 3QWXX 1HCTB 3ZL7C 1F1WA 1O4HA 2KT8A 4JGHA 1VA7A 2CIAA 2IUIA 4GBQA 5IH2A 3IMDA 1UFFA 3I9QA 1IS0A 4OHIA 1AYDA 2DBMA 1AWWA 1F2FA 3M0UA 2LNWA 3VRZA 2VIFA 4LUDA 1WI7A 1QLYA 4J9FA 3IN8A 1X6GA 3U23A 2B3OA 4HVUA 2IZVA 1ARKA 2F2VA 2YUOA 3REBB 2EGAA 1AWXA 1NYGA 1OV3A 1WXTA 3RNJA 1ZUUA 4AG1C 2C9WA 2C0TA 3BUWB 3QWYA 4E6RA 4JZ3A 3NGPA 4CC3A 1NZVA 1YCSB 2EW3A 4XZ1A 3VRRA 4E68A 3LH5A 3IN7A 2OZOA 2FPFA 4OMOA 1BK2A 2KXCA 2JMAA 1GRIA 2A36A 1AZGB 1X69A 2J7IA 4HVWA 4RUGA 1BMBA 2SHPA 4WWQA 1X6BA 1I0CA 2JYQA 1WXBA 1RLPC 1XA6A 2XP1A 2DVJA 2AUGA 2LMJA 1R1PA 1O43A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EYZA 2J05A 1YVHA 3GXXA 2HQXA 4DEYA 1OPKA 2HSPA 2LVMA 1O4QA 3T04A 2KBTA 3UPUA 3CMET 3CPFA 4C92C 1UDLA 2PVDB 3CC2Q 2CZ6B 4X6SA 1WHJA 1PRMC 1Q86U 2NWMA 1VQ6A 1AYBA 1A1AA 3R6OA 4AFQC 1TWBA 1HXDA 2ROTA 3QSUA 1LNXA 4LE9A 4XU3A 3CCLA 2PTKA 2L3RA 5KYWA 1PKSA 1V29B 2ETZA 3TVTA 1N8RU 4XU1A 3I55A 4L5GA 4QW2A 2QQSA 2P4TA 4EDUA 2DZCA 3GBQA 3SWNB 2DLPA 1KC8C 3CCUQ 3RKWA 3CCUT 1ZBXA 2E12A 1K8AU 3M0PA 4M7AE 1WA7A 3VS4A 5IHNA 5CQYA 5HK0A 5A2QE 4BACA 5GAMf 4N0AA 5CKFA 4PLIA 2EYWA 4M7DC 2L3SA 2OI3A 2V8KA 5LJ3f 5FRMA 4KGZB 1JYQA 4OMMA 1D3BA 3S8LA 1A81A 5FRNA 2RB6A 2OX7A 1C1AA 3RR6A 1JJ2S 3VS3A 1MMGA 1X75C 1KQSA 1A08A 2E6ZA 1AWJA 2GFUA 3PSJA 5KYUB 2KK4A 5GJHA 1SHBA 4JUVA 1YNZA 2KYMA 2EVRA 2JTMA 1SG5A 4IKFA 2RI5A 1QCFA 3JV3A 1FHSA 3OSVA 5KYXA 3EHQA 5LJ5j 5GANj 4C92A 5IBMA 5CIUA 5FU6B 1VQ7A 3BKBA 3KFVA 1T0HA 2DTOA 2M1HA 3EH1A 1LUIA 3QO3A 3M0TA 1I4K1 2ED1A 2L5QA 4F7UE 1SHDA 3JSCA 5GAN4 3HHMB 4MMKA 1BCMA 3GOXA 4E7JA 1KC2A 2GNCA 1KA6A 1G8XA 3CMEA 3EFOB 2K5FA 3VS2A 1YITA 1O75A 3S3NA 3CBMA 3NMZC 2XDBA 2YSXA 4JLGA 1P13A 3FJ5A 3HRUA 4A4CA 4J9IA 2F5TX 5DM7R 2X3WD 2QEXA 3JB9D 3SDZA 1QP3A 1JJ2P 2LJ1A 1O4JA 2KXDA 2ENMA 2LZ6B 2F2WA 3S6WA 4IUVA 2QA4A 1NM7A 1YHQA 3DLMA 3TL0A 5KYYB 4BE1A 2V8JA 1YCYA 5D7UA 5KYUA 2FO0A 1O4LA 1KD1R 5CKBA 4XTWA 2H46E 4OB0B 3QDFA 1S72T 1VQ4A 1O4KA 2V1RA 4KT0E 3FRNA 4M75G 3SD4A 3N84A 3C7IA 3EAZA 2RHZA 2YSQA 3UYOA 1K73R 1K0SA 2DNUA 4HCCA 5D6YA 1SSHA 1VQ5T 2DL5A 5GAOn 1JYUA 2HDAA 4JS4A 2QDLA 4M4ZA 2LNXA 3KBGA 5DLQE 4CC2A 1VQKQ 2DX0A 2AIRB 1WPYA 8AT1B 2O88A 3G71A 2EAYA 2QASA 3RMQA 4HKEA 4OHLA 1W2BS 4LDUA 2DF6A 3RESA 3EGXA 3CCEA 2HEQA 3EG1A 2LT1A 3MPUB 4BE0A 2LQNA 3FC3A 1BI0A 1M90U 4JRQA 3MCAB 1VYTA 2RK1A 5IHIA 2KVQG 1YI2Q 3QYGB 1RAHB 3REAB 4L6V5 2X4YA 2LRAA 1AEYA 3DKMA 2EIFA 4IUPA 2CSQA 4OGEA 5LJ5d 2RVFA 1K76A 5GANd 3PMTA 4L1BB 3QHSA 4PJOF 2QTXA 2A3LA 4RTZA 4DBRA 1CJ1A 2XICA 4RMOA 4GWFA 2RSYA 5D0JA 4XU2A 4JJDA 4H34A 3PMIA 3BUOB 2KE9A 4M75D 3OYEA 1VQPA 4VUBA 4DGXA 4XTVA 2RQTA 2J6FA 2E70A 1X01A 1G2BA 4M7AD 1ZX6A 3CCMA 2YHTA 2P84A 3LYIA 1CWEA 2RD1A 1R1SA 1X2KA 2NUPA 4E7HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2EYZ A;  2J05 A;  2KYB A;  1YVH A;  3GXX A;  2A28 A;  4DEY A;  1SHA A;  1OPK A;  2HSP A;  1O4Q A;  3T04 A;  5EEQ A;  2GSB A;  2LCS A;  5AXI A;  2KBT A;  1WIE A;  2G6F X;  3KFJ A;  1UDL A;  4JZ4 A;  3M0R A;  2HBW A;  2KT1 A;  4TZI A;  1K9A A;  5AUL A;  1SPS A;  2QMS A;  2JS0 A;  4X6S A;  2DM0 A;  1PRM C;  1BHH A;  2NWM A;  2RF0 A;  2BZ8 A;  1D4W A;  1BFI A;  1AYB A;  1A1A A;  5ECA A;  4AFQ C;  1BU1 A;  4F59 A;  2JTE A;  3CQT A;  2CH4 W;  2ROT A;  1BF5 A;  2DE0 X;  4LE9 A;  1WXU A;  3H41 A;  5HCK A;  3GQI B;  1V1C A;  2PTK A;  2DYB A;  2SEM A;  2CI9 A;  1PKS A;  2JS2 A;  2ETZ A;  3TVT A;  1M27 C;  1NYF A;  2L6K A;  2B86 A;  2CUB A;  1H9O A;  2JT4 A;  3IQL A;  2JMC A;  2EL8 A;  4K44 A;  2CT4 A;  1AWO A;  2CUD A;  4EIK A;  1CSY A;  1W1F A;  2W0Z A;  4D8D A;  3GBQ A;  2DLP A;  2OAW A;  4EY0 A;  1O42 A;  1OPL A;  3MAZ A;  1U3O A;  2DRK A;  1LCK A;  2LNX A;  3M0P A;  1WA7 A;  3VS4 A;  1GBQ A;  5IHN A;  1ZLM A;  5DC0 B;  1JU5 C;  2K3B A;  2HMH A;  3MXY A;  1I1J A;  2EYW A;  2L3S A;  4J9G A;  1X27 A; 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