3NHNA

Crystal structure of the src-family kinase hck sh3-sh2-linker regulatory region
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
DIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYKIRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the Src Family Kinase Hck SH3-SH2 Linker Regulatory Region Supports an SH3-dominant Activation Mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase HCK
total genus 31
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-06-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3nhnA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3nhnA02
1AOJA 3VRYA 1X0NA 1M61A 2DA9A 2CI9A 1RI9A 2EKXA 3TKZA 2JM8A 2KBTA 4RTUA 2OAWA 3PQZA 2CT4A 1AB2A 2GGRA 1BU1A 4Y92A 4H1OA 2JTEA 1A1AA 4CC2A 4OMNA 1A1CA 1X6BA 3OVEA 1FU5A 1I07A 4M4ZA 2Y1NA 2H46E 1JQQA 2ED1A 2AUGA 3TSZA 2C9WA 4RTTA 4Z8AA 3NPFA 1FYRA 2CRHA 4U1PA 5DF6A 2RSYA 1WLPB 2GNCA 1VA7A 1D4TA 1VYVA 4D8DA 4OHIA 1CSZA 1JXMA 2DRMA 3UYOA 2CSQA 2YSQA 4F59A 2AZVA 4CC3A 4J9EA 3H0IA 2C0IA 1ZX6A 4ORZA 3RNJA 2EGCA 1O4HA 4FBNA 2MIOA 1O45A 2FPDA 1SRLA 1AYBA 2EYVA 4R0KA 4DGPA 2QMSA 1M3CA 4TZIA 1M3BA 1O4IA 1YWPA 2V1RA 2EYXA 4F17A 4QSYA 1WQUA 1CKAA 1MW4A 1X69A 2GQIA 2L3SA 2MRKA 4OHLA 4AG2C 2CH4W 5EC7A 2KR3A 1UUEA 1GCQA 4GBQA 2BBUA 2J06A 2EBPA 3H0FA 1ZSGA 2FG0A 1UHCA 4Z89A 4X1VA 2EYWA 3MXYA 1T0HA 4J9CA 2OZOA 1VYUA 3QWXX 4AFUC 1O46A 2AK5A 2CDTA 3EG2A 1IO6A 1M8MA 1NG2A 4D8KA 4ROJA 2FRWA 5IBMA 1YNZA 2JMCA 1MILA 4H34A 2RN8A 1WXBA 1ARKA 1AYAA 1OO4A 1BHHA 3NMZC 4LUEA 1Y1UA 2IUGA 1FYNA 1O4MA 3EAZA 3PSJA 4RTWA 1GRIA 1SHBA 1YN8A 2MK2A 2EKHA 3QWYA 3EACA 1G2BA 1A1BA 1SPSA 3C0CA 1M27A 3VS6A 2CBLA 1K4US 2YSXA 2J05A 2JS0A 3NGPA 5GJIA 1PKTA 4EY0A 1O4CA 1F2FA 1LKLA 3U23A 4OMQA 2RF0A 2KEAA 2EQIA 3HCKA 3TSWA 3VGOA 3IMJA 1I1JA 2EOBA 4JE4A 5BO4A 1O4KA 5DC4A 4J9BA 1ABQA 2PLEA 4A4CA 2KE9A 3R6NA 2RNAA 2BZXA 1X2QA 1BMBA 4OMPA 3I35A 3EHQA 2DRKA 2DCRA 2HDVA 1UHFA 1BFJA 2L6KA 1LUMA 4K11A 1SKJA 4E6RA 1O4PA 1Z3KA 2JYQA 2DM1A 2DLYA 2CS0A 3KFJA 1BM2A 1FBVA 3S9KA 2DILA 1NRVA 2KXCA 2BTTA 1AZGB 1KA6A 2DL7A 1AYDA 2EW3A 2CH4A 1I0CA 1W6XA 2G6FX 2EYZA 5EHRA 2GTOA 2GE9A 1AD5A 1PRMC 2HCKA 1CWDL 2DL3A 2CREA 4F5BA 2HDAA 2RMOA 5IHKA 4OMLA 2GSBA 4AFSC 1U06A 1NLOC 4HVUA 1QKWA 3IN8A 5I6VA 1O4RA 3PVQA 1Y0MA 1O41A 1IS0A 2KK6A 5HKWA 2K79B 2IIMA 1OV3A 1Z9ZA 2A37A 2LQWA 2P4RA 3H0HA 2C0OA 1K0XA 2LCSA 1O4NA 2GBQA 3PS5A 3TVTA 1YP5A 3I5RA 1PHTA 4DEYA 1BKMA 1A0NB 2D8JA 2DF6A 2X3WD 3PVLA 2X3XD 2B86A 2ETZA 2IUHA 2D0NA 1ZUYA 1FU6A 1TUCA 2D8HA 3THKA 1PICA 3UA6A 1OPKA 2RQTA 4WWQA 5IXFA 3UA7A 3VS7A 1H8KA 2RMXA 1AOUF 2RORA 2VVKA 4KRTA 1R1QA 1MV0B 2W0ZA 3JV3A 2DLPA 3OV1A 1T0JA 3VRPA 3PSKA 3CWGA 1SEMA 5CDWA 3BUMB 1RLPC 4IIOA 4LNPA 1H92A 4HCKA 3O5ZA 3MXCA 2A28A 4F5AA 1XOVA 5FW9A 1U3OA 3BUOB 1JXOA 4J9DA 2JXBA 2KRMA 1CSKA 2DL8A 3PFVA 3N84A 3HIZB 4ESRA 1QLYA 1SRMA 2LP5A 1AEYA 2LNXA 2HSPA 2J7IA 1JWOA 2MCNA 1LCJA 2DJQA 2JM9A 1ZLMA 1WYXA 1T3SA 4WCIA 1QG1E 2CUDA 2AOBA 4NWGA 1WI7A 2YU7A 3VS0A 4AFZC 2CUBA 1LUKA 2JMAA 2K7AB 1O42A 1HD3A 3VS5A 4EIKA 1ZFPE 1A07A 2VWFA 2ED0A 3IMDA 1AVZC 4P9ZA 1GCQC 1GFCA 3I5SA 4OMMA 2ROTA 2YUNA 2Y1MA 4E68A 4JZ3A 1QKXA 1O4GA 4F16A 3BKBA 2V1QA 2SEMA 3GBQA 4K45A 1BFIA 1GCPA 1NYFA 1KC2A 4RTXA 2HMHA 4JEGA 2ROLA 1J3TA 2LCTA 1UJYA 2DL4A 3I9QA 3ZL7C 3S8LA 1SHGA 2EPDA 1HSQA 5ECAA 5GJHA 3TL0A 1NYGA 4RTZA 1O4AA 3VS1A 4AG1C 3UF4A 4LN2A 5GJWB 4RUGA 2FPFA 1A08A 3GXXA 4X6SA 1JU5C 3SEMA 1R1SA 1SPRA 2RQWA 4LUDA 1YWOA 2H5KA 1KFZA 2FPEA 1WXTA 2SHPA 3WA4A 3ULRB 2L3TA 4J9GA 1CSYA 1S1NA 2VIFA 3OB2B 1WXUA 1KJWA 1O43A 5IH2A 2K6DA 1AWXA 2LJ0A 1D4WA 5IBSA 1E6GA 1UURA 2DVJA 1PNJA 3CD3A 4HVVA 5FWCA 2EYYA 3GXWA 3VRQA 4E93A 2L0AA 2O9SA 2D1XA 2JT4A 1ABOA 2LJ3A 1OO3A 1O4JA 1W1FA 4RTVA 1X6GA 1UE9A 1O4BA 4FL3A 1RUWA 3REAB 4JPBW 1O49A 3EG0A 1GFDA 2Y3AB 4IIMA 1Y57A 3M0QA 3M0RA 1A1EA 4RTYA 4OMOA 3US4A 1CKBA 2KXDA 1TUDA 3CXLA 2SRCA 3VRZA 5HKYA 4J9IA 2AZSA 3EG1A 1P13A 2LJ1A 1OOTA 2PTKA 1WIEA 1AZEA 1UECA 2AOAA 5EG3B 4CC7A 3VS2A 1W70A 2MOXA 4Z88A 5IHIA 3VS3A 2KGTA 2RPNA 3M0PA 1Z9QA 1H9OA 2YUPA 3NHNA 2LQNA 1HCSB 2CR4A 2KRSA 1K1ZA 4P9VA 2DMOA 1QADA 3PJPA 2KNBB 2OQ1A 4DEXA 2EGEA 3FJ5A 2JS2A 2L3PA 5EEQA 2J6KA 1N5ZA 1RLQC 4J9FA 1O48A 1XA6A 2DLZA 1O4OA 2RVFA 4A4BA 2DX1A 1O4DA 2L3QA 2IUIA 1X6CA 1JYRA 2PNAA 2KT8A 2LX7A 3H41A 4JGHA 2HDXA 1B07A 4ZNXA 1UG1A 2MQIA 2DM0A 1NLPC 2FRYA 2LMJA 2O31A 1NZLA 2HEQA 1GHUA 2AKKA 3A98A 5D0JA 2FO0A 2HUWA 3M0UA 2NUZA 4GLMA 2O9VA 5AULA 2XMFA 1I3ZA 2K2MA 1UTIA 2M0YA 2PLDA 1BLJA 3LH5A 1WX6A 4QT7A 2LZ6B 1E7OA 2EL8A 1U5SA 1LCKA 2KYBA 2CSIA 2MC1A 2K7AA 3HHMB 1JEGA 1MUZA 2K9GA 2I0NA 5IHNA 2XP1A 3CBLA 1M3AA 5I11A 3ZNIA 1JYQA 1G83A 3BUXB 1O4QA 2ESWA 1PKSA 2BZYA 2LNHB 2OI3A 2VKNA 4J9HA 4OHHA 3IQLA 1O4FA 5EELA 2EVRA 2HBWA 4XZ1A 1HCTB 2ENMA 2W10A 4LE9A 4HXJA 1AWOA 2NWMA 1WDXA 2RQRA 3BUNB 1LKKA 4JZ4A 3CQTA 1YVLA 5HKZA 4EIHA 2K3BA 1SSHA 1ZUUA 2EGAA 3KFVA 3VS4A 1B47A 4GPLB 1O44A 1LUNA 4HVWA 1SHDA 2YT6A 1X2KA 1GL5A 1BK2A 2RQUA 2QDLA 1YVHA 1RPYA 2KNOA 2EO3A 3SHWA 4A63B 1JYUA 5GJVB 1T3LA 1BG1A 1NEBA 2C0TA 2PNIA 1YCSB 1UFFA 1WA7A 2DE0X 1F1WA 2ECDA 3VROA 1V1CA 1KSWA 2CT3A 1R1PA 4F14A 1CWEA 1BLKA 1OPLA 1HJDA 4JJDA 4CC4B 1D1ZA 2LNWA 2L4KA 2M51A 4FSSA 1A81A 4OHEA 2KYMA 1ZBJA 3VRRA 1SHAA 2MRJA 1UDLA 1M27C 2GTJA 5HCKA 3N8MA 1O4LA 3BUWB 2JW4A 2O88A 1AWJA 1QWEA 2PZ1A 1RJAA 4L1BB 3PLFB 3M7FA 1VYTA 2DX0A 5DC0B 1PRLC 2BZ8A 2DNUA 1K76A 3EGUA 1NM7A 1E6HA 3MAZA 4U17A 3REBB 1BB9A 1FHSA 1RQQC 1A09A 1UGVA 1CJ1A 1AOTF 2H8HA 4GL9E 1JU5A 4AFQC 2FCIA 2J6OA 2J6FA 1SPKA 1BBZA 2KROA 2YUQA 2E5KA 3UATA 1NZVA 3VRNA 1JO8A 2KT1A 3EHRA 5IXBA 2A08A 1K0SA 1BKLA 1GBRA 1M30A 4XZ0A 2ECZA 1LUIA 4NWFA 1BHHB 2K79A 5EHPA 1KA7A 4GWFA 1IJRA 1ZUKA 1TZEE 1X43A 2EO6A 1AWWA 2B3OA 5DC9A 4JJBA 1KIKA 1B3QA 1TCEA 1QCFA 4OHDA 1SHFA 3K2MA 2YDLA 2DBKA 2YUOA 2DL5A 1O47A 1EFNA 1MV3A 5I22A 4FL2A 3S8OA 1QWFA 3EG3A 1FBZA 1K9AA 1O4EA 2O2OA 1PWTA 1UJ0A 2FEIA 4K2RA 3OB1B 2CI8A 2F2VA 4JJCA 1H3HA 2DYBA 2PNBA 3IN7A 3T04A 2OJ2A 2F2WA 2CIAA 2EU0A 2IZVA 2L2PA 1NEGA 3S8NA 3M0SA 2AKLA 3GQIB 1OEBA 1X27A 2A36A 2RQVA 1BHFA 1TG0A 2DBMA 3OP0A 5AXIA 5J3XA 1BF5A 3N7YA 1GBQA 2F2XA 4K44A 2KRNA 4DGXA 3M0TA 1UUSA 3C7IA 5L23A 1FMKA 3RBBB 1AYCA 5KAZA 3PE0A 1WFWA 5FWBA 2ABLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QDYB 1MNEA 2JM8A 2KBTA 3EFOB 3CMAT 2OAWA 3PQZA 2RJFA 1IB8A 1ZSZC 1FMWA 4H1OA 1A1CA 3CCJQ 4FIBA 5LJ5f 2H46E 1JQQA 4M77E 2MYSA 2X4XA 2X4WA 1B7TA 3TSZA 1O9SA 5GANd 1FYRA 2CKKA 4L6V5 5IAYA 4U1PA 2RSYA 5A0LA 2P0PA 1ZA1B 1CSZA 5DLQE 2DRMA 2JNGA 1Q86R 2AZVA 3JB9D 1N27A 3X24B 3H0IA 2M9UA 2C0IA 4ORZA 4C8QD 4FBNA 4CRIA 1YJNA 1YI2A 1M3BA 1O4IA 1YWPA 2LVMA 4OP0A 4F17A 1R8OB 2KY9A 1MW4A 4JS5A 2GQIA 2L3SA 1R0BG 2CH4W 3CPWA 4LDVA 3OYAA 3H0FA 1ZSGA 4Z89A 2BE9B 2ZPBB 1T0HA 1MMGA 4Q5WA 3QWXX 4AFUC 1MGQA 4MMKA 1YCYA 1NG2A 4ROJA 3N5BB 1WXBA 1AYAA 4LUEA 1Y1UA 4RTWA 1SHBA 3M9QA 2VGNA 2XDBA 1A1BA 3C0CA 3OW2A 3VS6A 3M5AA 1NE8A 2JS0A 5GJIA 5LJ5d 1O4CA 3MEVA 3X28B 1N8RU 3IMJA 4M75D 5GAOr 3M4YA 1VQKQ 5BO4A 1BI2A 2RJDA 2QA4T 1FMVA 4BACA 2KE9A 4C0DC 2RNAA 1MNDA 1TSFA 3MKDA 2L6KA 3EGDB 3OQ5A 3SWNC 1R0CB 2DLYA 1FBVA 3S9KA 2DILA 1M2VB 1X75C 4M77F 2FZCB 2D6FA 5GAMg 1I0CA 4C92C 3EFOA 4OGEA 4FL6A 1PRMC 2DPPB 5CR2A 3GOXA 1YJWA 3JRZA 2EFIA 2K5FA 1QQJA 2QXFA 4E2FB 1Y0MA 1O41A 1IS0A 2KK6A 5HKWA 1VUBA 1QVGP 2QQAA 1OV3A 2P4RA 1SG5A 4BE0A 1K0XA 2GBQA 3PS5A 2EAYA 3I5RA 4KUIA 1N6AA 2XG8D 1BKMA 2DF6A 2X3XD 2B86A 3AT1B 4LD6A 2CP7A 3JAME 1VQNQ 2D8HA 1PICA 3UA6A 2X9HA 2JOYA 1NJIU 5IXFA 1KC8C 1H8KA 4LDXA 2DXBA 1D0ZA 4KRTA 1MV0B 3JV3A 1T0JA 1FWZA 3VRPA 1RLPC 5GMKi 1WHJA 2E4HA 3OSVA 3E1SA 3QHSA 1AEYA 1M1KC 3D7SB 2LNXA 3M58A 1Q7YR 2L89A 3R6OA 2CZ7B 4BD3A 4DBHA 1LCJA 1G3SA 1W2BP 1WYXA 2ZGWA 4FM4B 4DOWA 4WCIA 4Y91A 2MWOA 3OMCA 3VS0A 3M57A 3TQ7P 1WZOA 1Y96B 2VWFA 2M0OA 2ED0A 5CIUA 1GFCA 4C5IA 4J6YA 4F7UE 2ROTA 4BE2A 4E68A 5KYXA 1QKXA 3RERA 3OYYA 1O4GA 3V7RA 3EG9B 4GY5A 4J6XA 4RTXA 2HMHA 2RB6A 3S8LA 4PJOC 1Q81U 3CCMA 5ECAA 4LDWA 1IREB 3TL0A 2LQ8A 3DB3A 1XJWB 1OU8A 1A08A 3EGDA 3G4SQ 1GXIE 2X4JA 2HSEB 2FPEA 4M75B 4IUQA 1VQMA 2SHPA 5J39A 4OB3B 3G6EQ 1O43A 1K8AU 5GAN3 2KMTA 1VQPA 3PFSA 3CC2T 5IBSA 1OX8A 2E10A 3HTRA 1PNJA 2ZPEB 3JCMh 3SDZA 3CCST 3GXWA 1TU0B 2D1XA 3QJYA 5GANg 3RMSA 1IHVA 4TVRA 4XK8E 3EG0A 3KBGA 1Y57A 3CCVA 5CQYA 2KXDA 2NYSA 2SRCA 1OX9A 1VQ4T 1P13A 4X9DA 1VOMA 1VQ8Q 1KQSA 4XTWA 2MOXA 1F1BB 1H9OA 2JTMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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