3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
2DL3A 2H8HA 3I5SA 1LUMA 3ZL7C 1AWOA 1O4FA 1BB9A 2RQRA 2DCRA 3SEMA 5EG3B 1QCFA 5EELA 1JU5C 2HDVA 3CD3A 5HKWA 4FL3A 2V1RA 1BFJA 2AKLA 1O42A 3BKBA 1ABOA 4D8DA 2K2MA 2LJ1A 4IIMA 5FW9A 3BUMB 5EEQA 2BZ8A 2OZOA 2CSQA 2ED0A 3T04A 2DRMA 2EYYA 1CWEA 1JXOA 3NHNA 3NGPA 3S8LA 1G83A 1E6HA 2KT8A 1R1SA 5I6VA 2RPNA 1OPKA 1GCQA 1Y1UA 2DLPA 2DLYA 1YP5A 2L3SA 1BHFA 1LUIA 2RMXA 2A28A 2EGEA 2ESWA 1BMBA 1S1NA 1K76A 1T3SA 2JTEA 1A81A 2MRKA 1WX6A 3PVQA 3REAB 2CT4A 5BO4A 2JXBA 2CT3A 1UJYA 2C0OA 1QKXA 2GGRA 2J06A 4CC7A 3S8OA 1BHHB 1FYNA 2J6KA 1BFIA 1G2BA 2EYWA 2VKNA 3CBLA 1XA6A 3PVLA 2CS0A 2RVFA 5CDWA 2KEAA 1O4OA 2EYXA 2PNAA 1QLYA 4RTYA 1O4BA 2IZVA 1NG2A 2Y1NA 2G6FX 1SHBA 1U5SA 2IUHA 2EVRA 4P9ZA 1WDXA 2JYQA 1UECA 3NMZC 3H0HA 4R0KA 1WFWA 1A1EA 2OAWA 3BUWB 2I0NA 2K6DA 3KFVA 1NM7A 2MOXA 2JM8A 5DF6A 3JV3A 1LKLA 1VA7A 2K7AA 4EIHA 1NYFA 2OJ2A 3UA6A 1K0XA 2HDXA 5GJWB 1I07A 2DNUA 1LUNA 2RSYA 2BZXA 1AZGB 2EYZA 2CI9A 1O4PA 2LMJA 2SRCA 3VRRA 5HCKA 3VRQA 1FU5A 2EL8A 4RUGA 4Z88A 1PICA 3EGUA 1UDLA 5IHKA 3EAZA 2KT1A 1SPRA 2YSXA 4Z89A 3PE0A 5GJHA 1YWPA 4J9GA 2L3TA 1I1JA 2QDLA 3BUOB 4F14A 1JWOA 1QG1E 2LCSA 1GL5A 4J9CA 2D0NA 3RNJA 1X6GA 1O45A 2CUDA 4RTVA 1K4US 4H1OA 3VS0A 2YDLA 1H8KA 4OMNA 1MV3A 1JEGA 1AB2A 4F5AA 1RUWA 1GBQA 1K0SA 1CJ1A 4QT7A 2MIOA 3PFVA 1Z9ZA 1WXUA 1O4GA 1BG1A 2DL5A 3EG0A 4CC2A 2PLDA 3OB1B 5AXIA 1MILA 4A4BA 3HHMB 4ESRA 3REBB 2GE9A 3OVEA 5KAZA 3IQLA 2O31A 2O9SA 2KXCA 1CWDL 1SEMA 1WYXA 1RI9A 2KROA 1HD3A 2LQWA 3VS1A 1OV3A 1SRMA 1AWXA 1M27A 4CC4B 1PKTA 2KR3A 1X43A 3UF4A 3QWYA 3OV1A 3NPFA 4OHEA 4X6SA 3VRNA 1HSQA 1JO8A 1OPLA 4DGPA 2EYVA 1FU6A 4JPBW 1NRVA 2F2WA 2EQIA 5EC7A 1BU1A 1W1FA 1GFDA 1O4MA 2CH4W 4U1PA 4NWFA 2DJQA 1K1ZA 2DA9A 3S8NA 1F2FA 3VGOA 4OHHA 1VYTA 2DRKA 2NUZA 4H34A 4QSYA 1AVZC 2ROTA 1AD5A 1UUEA 3TSZA 1O44A 4K44A 1A1CA 5IXFA 4RTWA 1AOTF 1KJWA 1O4RA 4KRTA 2X3WD 1CKBA 1H92A 2DL7A 2EO3A 2FRWA 1BBZA 2EOBA 1A1BA 2JS0A 1FHSA 1UURA 1PRLC 4L1BB 1A1AA 4LUDA 4F16A 3M0UA 1M3CA 2PZ1A 2DLZA 3GQIB 1AOJA 1I0CA 2M0YA 1FYRA 4X1VA 1GCQC 1IJRA 4EIKA 2Y3AB 1M8MA 3M7FA 3ZNIA 3H41A 2KNOA 2JM9A 3VS2A 2KRNA 1QADA 2EO6A 4AFSC 2K79A 4EY0A 2YUPA 2JT4A 1ZUYA 5IHNA 2JS2A 1O4JA 1BF5A 3MXYA 2CSIA 3UYOA 4WWQA 1SSHA 1HJDA 1SKJA 4JE4A 1PWTA 1X0NA 1ABQA 4AFZC 1CSYA 2ENMA 1O48A 1Z3KA 1K9AA 1KA6A 1SHDA 2OQ1A 5D0JA 1O41A 2CREA 3QWXX 1CSZA 1NZLA 4JEGA 1NLOC 2L0AA 2RQVA 1XOVA 1UHCA 1IO6A 1M3AA 2KYBA 2PTKA 3H0FA 3CXLA 5IHIA 2F2VA 2MC1A 1BLJA 1RQQC 4HXJA 3K2MA 2J7IA 3SHWA 1GCPA 3C7IA 2LQNA 1AOUF 4RTUA 4AG2C 3CQTA 3I5RA 1AYCA 5I22A 1AWJA 3GBQA 1CKAA 1X69A 1TG0A 1OO3A 2D8HA 4AFUC 1O4IA 1D4TA 4GL9E 3EG2A 1UUSA 2L6KA 2C0IA 2CBLA 4U17A 4FSSA 5GJVB 4P9VA 2GSBA 2GTJA 4D8KA 1HCTB 1YWOA 1BM2A 2L4KA 1YN8A 1ZLMA 2DM0A 2DF6A 4NWGA 4ROJA 1TUDA 2HSPA 1X6CA 1YVLA 1JYQA 4DEXA 1YCSB 5IBMA 1YNZA 1WXBA 2O9VA 2HCKA 4XZ1A 1FBVA 3VRZA 1GHUA 1Y0MA 3BUNB 2F2XA 3EHQA 4TZIA 1SHGA 1NYGA 2JW4A 4OHDA 2K3BA 4OMMA 1O43A 1X2QA 5EHPA 2LJ3A 1H9OA 3PSJA 1AYDA 2PLEA 5I11A 1NZVA 1P13A 3MAZA 2K9GA 1O4DA 2AOBA 2DBMA 3EG1A 1KC2A 1LCJA 1WI7A 4HVWA 2AKKA 3EG3A 3ULRB 1F1WA 2CI8A 2MQIA 3IMDA 2GBQA 3I9QA 2V1QA 1QKWA 1FBZA 5FWBA 2ABLA 1OEBA 3VRPA 1LKKA 1X6BA 1M27C 2K7AB 2KGTA 3HCKA 2CDTA 1T0HA 1Z9QA 5EHRA 1E6GA 4F5BA 4Z8AA 1FMKA 2HEQA 4DEYA 1YVHA 1O4NA 1V1CA 4JJCA 4LNPA 3THKA 2XMFA 2HMHA 1W6XA 2DVJA 4IIOA 2FPFA 2QMSA 4OMOA 1PHTA 1JXMA 3TL0A 1MW4A 2LJ0A 2FO0A 2FCIA 1B07A 2H46E 2GTOA 2EKXA 4J9HA 2CUBA 2X3XD 1AWWA 2D1XA 3VS3A 2KNBB 5DC0B 1LCKA 2DL4A 3GXXA 2J05A 3VS5A 3N7YA 3M0RA 3OB2B 1UJ0A 2GNCA 2FPEA 3KFJA 2YU7A 2YT6A 1UHFA 2RQWA 2E5KA 2LNWA 1B47A 1O4HA 1X27A 3EACA 2BZYA 2HDAA 1UE9A 1EFNA 2J6OA 2JMCA 3N84A 3PJPA 4DGXA 2JMAA 1U06A 1PRMC 5L23A 2A37A 4LUEA 3VS7A 3IN8A 2DM1A 5J3XA 4E68A 3O5ZA 4GWFA 4K11A 2LX7A 1SRLA 1WXTA 1KIKA 1H3HA 1ZBJA 3MXCA 3VS6A 2MK2A 2RF0A 2IIMA 1M3BA 2YSQA 3R6NA 1NLPC 2ECZA 2FRYA 3PLFB 4OMPA 1RLQC 1KSWA 4J9FA 2EPDA 2OI3A 1D4WA 1A0NB 1TCEA 4OMQA 1D1ZA 1JU5A 1NEGA 2KBTA 1MUZA 1QWEA 4Y92A 4F59A 2EGCA 3M0PA 3EHRA 2EBPA 2RQUA 4CC3A 2B86A 4M4ZA 5ECAA 3RBBB 1KA7A 1TZEE 3A98A 1UTIA 1VYUA 1OO4A 3OP0A 2YUNA 4FL2A 1Y57A 4E6RA 5IH2A 2LCTA 2RORA 4J9EA 2XP1A 3S9KA 1T3LA 3IN7A 1WQUA 3VROA 3TKZA 2KK6A 3M0SA 2D8JA 3C0CA 2CH4A 1O4EA 5HKYA 3BUXB 1O4CA 4RTXA 1JYRA 1A07A 4OHIA 1WA7A 4AFQC 1SPSA 2CRHA 1BLKA 4OMLA 1W70A 2RN8A 3PQZA 3LH5A 1HCSB 3U23A 1O4LA 2AOAA 5GJIA 4LE9A 2FPDA 1UFFA 2K79B 3N8MA 4A63B 2W10A 1O49A 2J6FA 2EU0A 4HCKA 2DMOA 1GRIA 2VVKA 2AUGA 2IUGA 4J9IA 1GBRA 4A4CA 2L3PA 2A08A 2RQTA 2O88A 1CSKA 1KFZA 4HVUA 2KRSA 2EKHA 2GQIA 3CWGA 4J9DA 1SPKA 1WIEA 1VYVA 2KRMA 4GLMA 1O46A 1O4AA 2L2PA 2ROLA 2PNBA 2Y1MA 1UGVA 5AULA 1RJAA 2EGAA 4ORZA 1BKLA 3US4A 2LP5A 4FBNA 1E7OA 2HUWA 4ZNXA 1ARKA 2AZVA 2L3QA 3H0IA 1I3ZA 1AZEA 1LUKA 2RNAA 1J3TA 4GPLB 3UATA 1RLPC 1X2KA 4RTZA 2BBUA 3IMJA 3UA7A 1AYAA 3I35A 1AYBA 4WCIA 1NEBA 1PKSA 2SEMA 4LN2A 3PS5A 4JJBA 1JQQA 5FWCA 1IS0A 4JGHA 2ECDA 2DX1A 2RMOA 2IUIA 4F17A 1PNJA 2C9WA 2KE9A 1SHFA 1O4KA 3TSWA 3VS4A 2MCNA 2DILA 2W0ZA 2DBKA 4GBQA 2VIFA 3GXWA 5IBSA 2DYBA 1ZFPE 2PNIA 2C0TA 1ZSGA 4J9BA 2B3OA 5IXBA 2ED1A 1M61A 1B3QA 2A36A 2HBWA 1ZUUA 3PSKA 2H5KA 1ZUKA 1A08A 3HIZB 1O47A 4OHLA 1R1QA 1JYUA 2VWFA 1T0JA 1QWFA 2LZ6B 2CR4A 4K45A 3WA4A 3M0QA 2DX0A 2KXDA 2YUOA 2SHPA 2M51A 2DE0X 4AG1C 4E93A 2LNHB 1M30A 2MRJA 2ETZA 1U3OA 1MV0B 1WLPB 4K2RA 1BK2A 4RTTA 1N5ZA 1AEYA 3M0TA 1GFCA 2BTTA 2EW3A 2NWMA 2YUQA 4JJDA 1O4QA 1TUCA 2FG0A 3VRYA 2P4RA 1R1PA 2KYMA 4JZ4A 1BKMA 1ZX6A 1SHAA 5DC9A 1BHHA 5DC4A 3TVTA 3FJ5A 2AK5A 4XZ0A 1UG1A 2DL8A 2O2OA 1OOTA 2FEIA 2CIAA 2AZSA 1RPYA 4HVVA 4JZ3A 1A09A 2LNXA 5HKZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZBDA 4C8QF 2DL3A 4M77A 4QKUA 1B34B 1BB9A 2RQRA 2DCRA 3CCMQ 2EQMA 3QKJA 1QCFA 4C5HA 5A0LA 2LC4A 3I55Q 1JU5C 2KK4A 2PVOB 5HKWA 3BKBA 4D8DA 4IIMA 4RCBA 4C0DB 2ED0A 2H3EB 3T04A 3S8LA 3NGPA 5A0GA 1OPKA 3MP6A 2RMXA 5DLQE 3QSUA 2FZCB 4O6JA 1ZA1B 1NBEB 2XG8D 5BO4A 3LW5E 2GGRA 2J06A 3S8OA 2J6KA 2EYWA 3PVLA 2CS0A 2DTOA 1YBYA 2G6FX 4A4HA 3T9NA 1WDXA 2JYQA 1N27A 3NMZC 1ZQ1A 4XTUA 1ACMB 2XU8A 4IURA 1VA7A 4LDYA 3UA6A 4OB0B 1UEBA 2RD1A 5KE2A 1LPLA 4M78F 4C92C 2CI9A 2EYZA 3VRRA 5HCKA 3VRQA 1R77A 1W4SA 3BY7A 2EL8A 4Z88A 2AHJB 5IHKA 1Y96A 2YSXA 3PE0A 1YWPA 4J9GA 2L3TA 4F14A 4IUQA 1DJ7B 2M0OA 1OU9A 3HSBA 1M1FA 4DQ2A 4D6WA 3CCJA 4J9CA 5GAMj 3ER0A 1K4US 2H3JA 3VS0A 1H8KA 4OMNA 4F5AA 4J7IA 4J83A 3LLRA 3OYIA 3PFVA 2CP2A 1VQ9A 1O4GA 3X20B 4PFZA 1G8XA 2PLDA 4M75C 4KUIA 4M75E 4A4KA 3HHMB 4HKEA 1X6OA 3OVEA 3QIIA 4KULA 1RI9A 2JTFA 1M27A 1Q82C 3SD4A 2KR3A 3QWYA 1Q82U 4X6SA 1JO8A 5GMKi 4C92B 1NPRA 4JPBW 2F2WA 5LJ5e 5EC7A 5LJ5d 1W1FA 1O4MA 4NOYA 1GFDA 4E7IA 1K1ZA 1BI0A 1LNXA 5CAIA 4C0GA 4F7UE 3S8NA 1SF9A 2YRCA 2DXUA 4XTVA 3VGOA 1KD1C 5LJ3h 3G4SA 2DRKA 2MF2A 2NUZA 4H34A 1VQ5Q 3J81E 1AD5A 1X01A 4NL3A 4K44A 4RTWA 1AOTF 2X3WD 3I56T 1OX9A 4KGXB 1H92A 5DM7R 3QJYA 4L1BB 3D7SB 4F16A 3M0UA 2O01E 3CMAT 5CKEA 4X1VA 1GCQC 4EIKA 2E70A 4M75B 1BCOA 3ZNIA 4L59A 1QADA 2KRNA 4AFSC 2K79A 3FJPA 5IHNA 1P92A 4PJOF 1O4JA 1BF5A 4FCYA 2FVUA 3VUBA 2FL7A 4OGCA 2XDDA 2JVVA 2DTHA 2RQVA 3M9QA 4J6YA 2IG0A 3K2TA 3PIOA 2F2VA 1R0CB 1YJ9A 4Y91A 2EAYA 1GCPA 3MEUA 1WQWA 2YLCA 3SWNC 2C06A 3LH0A 3I5RA 3KBGA 3S3MA 4OB3B 3HP9A 1X69A 2V8IA 4M7DA 1O4IA 3CMEQ 2A3LA 2P4TA 4FSSA 5GJVB 4P9VA 4D8KA 1YWOA 1BM2A 1M5Q1 1ZLMA 2DM0A 2DF6A 3GP8A 4KH0B 3VRZA 5KCHA 4A53A 1M90R 3RKYA 3BUNB 4J5YA 3EHQA 4FW2A 4OHDA 2K3BA 1O43A 5I11A 2K9GA 1TH7A 5GANh 9ATCB 2X4XA 3HL8A 4C0FA 1QKWA 2MAMA 5FWBA 2ABLA 3M4YA 1OEBA 4C8QE 3P8DA 1D3BA 5KYYB 3SWNB 5CR2A 4R56A 4ZGEB 1T0HA 1Z9QA 4FYWB 5EHRA 1GXIE 1Q7YC 2XMFA 4IIOA 2CZ7B 4WTOB 2LJ0A 2FO0A 1JJ2A 1B07A 2V8KA 2BKDN 2GTOA 3MCAB 4J9HA 2D1XA 3VS3A 2KNBB 3RMSA 3PMIA 1BI2A 3N7YA 1WHKA 3M0RA 3OB2B 4DA4A 2E3IA 4NL2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1A07 A;  4OHI A;  1WA7 A;  4AFQ C;  1SPS A;  2CRH A;  1BLK A;  4OML A;  1W70 A;  2RN8 A;  3PQZ A;  3LH5 A;  1HCS B;  3U23 A;  1O4L A;  2AOA A;  5GJI A;  4LE9 A;  2FPD A;  1UFF A;  2K79 B;  3N8M A;  4A63 B;  2W10 A;  1O49 A;  2J6F A;  2EU0 A;  4HCK A;  2DMO A;  1GRI A;  2VVK A;  2AUG A;  2IUG A;  4J9I A;  1GBR A;  4A4C A;  2L3P A;  2A08 A;  2RQT A;  2O88 A;  1CSK A;  1KFZ A;  4HVU A;  2KRS A;  2EKH A;  2GQI A;  3CWG A;  4J9D A;  1SPK A;  1WIE A;  1VYV A;  2KRM A;  4GLM A;  1O46 A;  1O4A A;  2L2P A;  2ROL A;  2PNB A;  2Y1M A;  1UGV A;  5AUL A;  1RJA A;  2EGA A;  4ORZ A;  1BKL A;  3US4 A;  2LP5 A;  4FBN A;  1E7O A;  2HUW A;  4ZNX A;  1ARK A;  2AZV A;  2L3Q A;  3H0I A;  1I3Z A;  1AZE A;  1LUK A;  2RNA A;  1J3T A;  4GPL B;  3UAT A;  1RLP C;  1X2K A;  4RTZ A;  2BBU A;  3IMJ A;  3UA7 A;  1AYA A;  3I35 A;  1AYB A;  4WCI A;  1NEB A;  1PKS A;  2SEM A;  4LN2 A;  3PS5 A;  4JJB A;  1JQQ A;  5FWC A;  1IS0 A;  4JGH A;  2ECD A;  2DX1 A;  2RMO A;  2IUI A;  4F17 A;  1PNJ A;  2C9W A;  2KE9 A;  1SHF A;  1O4K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2DL3 A;  2H8H A;  3I5S A;  1LUM A;  3ZL7 C;  1AWO A;  1O4F A;  1BB9 A;  2RQR A;  2DCR A;  3SEM A;  5EG3 B;  1QCF A;  5EEL A;  1JU5 C;  2HDV A;  3CD3 A;  5HKW A;  4FL3 A;  2V1R A;  1BFJ A;  2AKL A;  1O42 A;  3BKB A;  1ABO A;  4D8D A;  2K2M A;  2LJ1 A;  4IIM A;  5FW9 A;  3BUM B;  5EEQ A;  2BZ8 A;  2OZO A;  2CSQ A;  2ED0 A;  3T04 A;  2DRM A;  2EYY A;  1CWE A;  1JXO A;  3NHN A;  3NGP A;  3S8L A;  1G83 A;  1E6H A;  2KT8 A;  1R1S A;  5I6V A;  2RPN A;  1OPK A;  1GCQ A;  1Y1U A;  2DLP A;  2DLY A;  1YP5 A;  2L3S A;  1BHF A;  1LUI A;  2RMX A;  2A28 A;  2EGE A;  2ESW A;  1BMB A;  1S1N A;  1K76 A;  1T3S A;  2JTE A;  1A81 A;  2MRK A;  1WX6 A;  3PVQ A;  3REA B;  2CT4 A;  5BO4 A;  2JXB A;  2CT3 A;  1UJY A;  2C0O A;  1QKX A;  2GGR A;  2J06 A;  4CC7 A;  3S8O A;  1BHH B;  1FYN A;  2J6K A;  1BFI A;  1G2B A;  2EYW A;  2VKN A;  3CBL A;  1XA6 A;  3PVL A;  2CS0 A;  2RVF A;  5CDW A;  2KEA A;  1O4O A;  2EYX A;  2PNA A;  1QLY A;  4RTY A;  1O4B A;  2IZV A;  1NG2 A;  2Y1N A;  2G6F X;  1SHB A;  1U5S A;  2IUH A;  2EVR A; 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