3NHNA

Crystal structure of the src-family kinase hck sh3-sh2-linker regulatory region
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
DIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYKIRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase HCK
publication title Crystal Structure of the Src Family Kinase Hck SH3-SH2 Linker Regulatory Region Supports an SH3-dominant Activation Mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 31
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-06-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3nhnA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3nhnA02
4OMLA 1BK2A 2EKXA 2CSIA 2JW4A 1AWWA 3PE0A 1FHSA 2J05A 3CBLA 1HCTB 1BU1A 1NYGA 3PVLA 4HVUA 1YWPA 4CC3A 5AXIA 5BO4A 3GBQA 1BB9A 1F2FA 1SRMA 1O4EA 4K11A 1AWXA 2CRHA 1QLYA 1J3TA 2X3WD 1YVLA 1K76A 1BF5A 1B3QA 2DRKA 1O4AA 2RVFA 1A1AA 2ECDA 1XA6A 1UUSA 4J9HA 1KSWA 1W1FA 1FBZA 1CWEA 1YN8A 1O4QA 1O47A 3M0UA 1NEBA 2DCRA 3VS5A 2L3SA 4GL9E 3BUNB 4A4CA 2D1XA 3PQZA 2CUBA 4AFQC 2W10A 2CR4A 1A1EA 1WI7A 3I5RA 2FG0A 2GTOA 2H5KA 2KT8A 1AVZC 1Y57A 4E68A 3OB1B 1O4RA 1AWJA 1LUKA 4DEXA 1R1PA 5I6VA 2KNBB 2KK6A 1PRLC 1KA7A 2EYXA 2VIFA 4HVWA 1PNJA 1TUDA 2ED0A 2VKNA 2FO0A 3NHNA 1B07A 5HCKA 2XMFA 3VRPA 5IBMA 4P9VA 3VS3A 1NRVA 1JYQA 2RORA 2I0NA 2V1RA 2BZYA 4HVVA 2IZVA 3CD3A 1AOTF 1ZBJA 2NUZA 2MRKA 2L3PA 1O49A 2EYVA 4H1OA 2KNOA 5EELA 1BLJA 2M0YA 1UDLA 3BUXB 2XP1A 1XOVA 2MRJA 1CJ1A 1NLPC 3MXYA 2IUGA 1M61A 4J9FA 1ARKA 2EOBA 3IN7A 1M3AA 1W70A 1M3BA 2RQVA 3OV1A 1H8KA 4J9IA 4ESRA 1WXTA 2O9SA 1QWEA 3CXLA 3GXXA 2KEAA 4J9CA 3VGOA 5EG3B 2H8HA 2DL5A 4LE9A 2OAWA 4RTUA 5D0JA 3UYOA 2EGCA 1Z9QA 1GFCA 4OHHA 1AB2A 1FMKA 2DX0A 1RLPC 1A1CA 2PNBA 5L23A 2YSXA 1WX6A 1T3LA 1VYTA 1WXBA 4DGPA 5ECAA 1FU6A 1U5SA 2DM1A 3R6NA 1ZFPE 1O48A 2AOBA 2M51A 1ZX6A 4Z88A 2C0OA 3VS2A 3UA6A 1K9AA 3EG1A 4J9BA 3EACA 2D8HA 2CI8A 1SHFA 1WDXA 4RTVA 1UUEA 3UATA 2NWMA 4OMOA 5EEQA 1O42A 1LUNA 1TCEA 4RTYA 4OHIA 3N84A 2F2WA 2SEMA 1SHGA 2ENMA 4OMPA 1K1ZA 1K0XA 5IBSA 1CSYA 2ROTA 2EYYA 2LNHB 3SEMA 3VS4A 3K2MA 2KR3A 4FBNA 1U06A 2A36A 4OMMA 2EYWA 5EHPA 3U23A 1I3ZA 4WWQA 2GE9A 5DF6A 1JWOA 3IN8A 2DYBA 2EBPA 4ROJA 3KFVA 1ABOA 4R0KA 1KC2A 5EC7A 4CC2A 2MC1A 1O4OA 1QKWA 3LH5A 3M0SA 1T0HA 4OMQA 1K0SA 1X6CA 1UJYA 1UJ0A 2LQWA 1SKJA 1LCJA 1OEBA 1PKTA 1LUMA 4GBQA 3PSJA 1O46A 1TZEE 4AFZC 2K7AA 2FCIA 2W0ZA 3HCKA 1PKSA 2RNAA 2LP5A 4HXJA 4ZNXA 2FRYA 3PSKA 1QG1E 2JM8A 3H41A 3ULRB 2ETZA 4OMNA 1TG0A 2KXDA 1GL5A 2DLZA 2DA9A 1YP5A 2JTEA 3JV3A 3PFVA 3REBB 1UFFA 2C9WA 3IQLA 3EHRA 1G2BA 5IHIA 3PJPA 1LUIA 2YUNA 2MIOA 1YVHA 3H0FA 2EO6A 3EGUA 2L2PA 1WXUA 2JMCA 4X6SA 2CUDA 2G6FX 2HEQA 2DL8A 5I11A 1OPLA 2FRWA 1MUZA 1GFDA 2EW3A 2JS2A 2RPNA 1HCSB 2RSYA 2A28A 2K79A 1E6GA 2DL3A 2PZ1A 4RTZA 1BMBA 2F2VA 5GJIA 1GCPA 3IMDA 3EG0A 1KIKA 5EHRA 5FWBA 2LJ1A 3GQIB 3C0CA 5HKWA 2OQ1A 2LCTA 2KRMA 1G83A 1Z9ZA 2GBQA 3M7FA 1X2KA 2HDAA 1HJDA 1O4CA 4KRTA 4RTWA 5I22A 2EGAA 1M8MA 1PRMC 1IJRA 2L0AA 3RBBB 3PS5A 2CH4A 1CWDL 1A07A 3NGPA 1O4HA 3QWXX 3S8LA 4F16A 3BKBA 4CC7A 1GCQC 2PTKA 4AG1C 3EHQA 4AG2C 2CT3A 4E6RA 1HSQA 2DILA 1O43A 1GCQA 4WCIA 4P9ZA 1RLQC 5FWCA 4K44A 2GQIA 1JU5A 2RMXA 1GBQA 2Y3AB 2GSBA 4F17A 3EAZA 4XZ0A 2IUHA 3NPFA 3GXWA 1BBZA 2E5KA 4LN2A 2HDXA 2BTTA 2AZVA 1CKAA 1UE9A 3TL0A 3I5SA 2LMJA 1M3CA 2EQIA 2P4RA 2SRCA 1I0CA 4JGHA 1ZLMA 2PNAA 2D0NA 2YUOA 1JXOA 2O9VA 2DE0X 1I07A 1A81A 2QDLA 4HCKA 4ORZA 4F5AA 1SRLA 2A37A 2MOXA 1NZLA 4RUGA 1YNZA 3HIZB 4J9EA 1H9OA 4JZ4A 2L3TA 2DM0A 4K2RA 1QWFA 2EGEA 2L6KA 1X69A 1AYAA 1RI9A 2ESWA 3M0PA 3S9KA 2AK5A 1UHFA 4JJDA 3S8OA 3OVEA 3SHWA 4L1BB 3NMZC 1OV3A 1ABQA 4FSSA 4Z8AA 1IO6A 2YU7A 1HD3A 1QKXA 3PVQA 3C7IA 1SPKA 2FPFA 2JYQA 3O5ZA 4LNPA 2AUGA 2DL7A 1ZUYA 2HCKA 1SHAA 2RN8A 4QT7A 2VVKA 3M0RA 4OHDA 4FL2A 2JMAA 2O31A 3VS1A 1QCFA 2LZ6B 1AYCA 2DBMA 3T04A 2KYBA 1AWOA 3TSZA 1V1CA 1UURA 2AOAA 3OB2B 4GPLB 2FEIA 1BHHA 2VWFA 2EVRA 4LUEA 3UF4A 4CC4B 4TZIA 1WQUA 3TKZA 3FJ5A 3H0HA 1AZEA 3VS7A 2D8JA 2CI9A 2CSQA 1ZUUA 2K3BA 2BBUA 1LKLA 3N7YA 5J3XA 1H92A 1SHDA 2CREA 2DMOA 5DC4A 3EG3A 2KROA 1OPKA 2RQRA 5GJWB 1AOJA 3MXCA 5IH2A 1O4NA 2CT4A 5AULA 5DC9A 1MV0B 1X6GA 1EFNA 1W6XA 1O4JA 2CDTA 2K2MA 1O41A 3BUOB 2J6FA 1LCKA 4RTXA 2C0TA 4X1VA 1SPRA 2DF6A 5HKYA 1Y0MA 2RF0A 4Y92A 4AFUC 4AFSC 1D4TA 2RQTA 2DJQA 1WYXA 3QWYA 4F59A 4IIMA 1O4BA 1K4US 3I35A 5KAZA 4GLMA 3BUWB 4JZ3A 3REAB 1R1QA 1BKLA 2L4KA 4OHEA 4D8DA 2K7AB 1A08A 2RQUA 1JYUA 1PICA 1T0JA 5IHNA 1AD5A 2B3OA 5GJHA 1SSHA 2X3XD 2HMHA 2K6DA 1YCSB 2GNCA 1H3HA 4E93A 3IMJA 2ECZA 1UGVA 2GTJA 3VRZA 1O4KA 5DC0B 2O88A 4EIHA 1Z3KA 4A63B 1KFZA 4FL3A 1M27C 5IHKA 4LUDA 1BHFA 4EY0A 1OO4A 3HHMB 4DEYA 2DRMA 2SHPA 1M27A 2HBWA 1UECA 3I9QA 1NG2A 1F1WA 2CBLA 2H46E 2KGTA 4F14A 1JO8A 3KFJA 1S1NA 3ZNIA 1VYUA 2JT4A 1NZVA 2OZOA 2IUIA 1UHCA 4JEGA 1O44A 1CKBA 2K79B 3OP0A 2KYMA 2F2XA 2EU0A 2B86A 2AKKA 4F5BA 1BFIA 1NM7A 1O45A 1AYBA 1NYFA 1UTIA 1R1SA 4H34A 1SEMA 1X27A 2AKLA 2K9GA 2DLYA 1JU5C 2O2OA 1O4FA 3N8MA 3THKA 4OHLA 3WA4A 1WLPB 3US4A 4U17A 1AEYA 1IS0A 1Y1UA 1RUWA 2AZSA 1M30A 4NWGA 1JEGA 1WIEA 2KBTA 1BG1A 2PNIA 4XZ1A 1FYRA 2GGRA 1CSZA 2DNUA 3H0IA 3ZL7C 2LCSA 2EO3A 2PLEA 1NEGA 2YUPA 1ZSGA 2J06A 1T3SA 2DBKA 3M0QA 1O4GA 1FU5A 2PLDA 2KXCA 3TVTA 4U1PA 1E6HA 1BLKA 4K45A 5GJVB 2EKHA 3EG2A 4J9GA 1X0NA 3A98A 1KA6A 4NWFA 2ROLA 1AZGB 5IXBA 1A1BA 2JS0A 5IXFA 1RQQC 1KJWA 5FW9A 4IIOA 3VRRA 4EIKA 2JXBA 2YDLA 1O4LA 3VRNA 2LNXA 1GRIA 4DGXA 1OOTA 2ED1A 1LKKA 4JJBA 2HSPA 3VS0A 3UA7A 2BZXA 4JPBW 1O4IA 1O4MA 2YSQA 1MILA 2DVJA 3VRYA 1SPSA 1X2QA 3VROA 1B47A 2JM9A 3CQTA 5HKZA 2L3QA 2YT6A 4QSYA 2DX1A 2FPDA 2DL4A 1BM2A 2LNWA 3CWGA 1I1JA 4Z89A 1N5ZA 2LJ0A 1QADA 4J9DA 2J7IA 3S8NA 2C0IA 2LQNA 3VRQA 1JQQA 1NLOC 1A0NB 1GBRA 2KT1A 4GWFA 3VS6A 1BFJA 2LJ3A 1RJAA 1CSKA 2J6OA 1FYNA 2EPDA 1BKMA 1JXMA 1PWTA 5CDWA 2MQIA 1P13A 1JYRA 1O4DA 2FPEA 1MW4A 3RNJA 2HUWA 2CS0A 2J6KA 4D8KA 1GHUA 2ABLA 3MAZA 1X43A 1A09A 1OO3A 2A08A 1TUCA 2EL8A 2LX7A 2DLPA 2V1QA 2MK2A 1U3OA 3TSWA 1SHBA 1VA7A 2KRNA 1PHTA 2YUQA 2IIMA 1FBVA 1BHHB 1AOUF 1D1ZA 1E7OA 2EYZA 4M4ZA 2KRSA 1O4PA 3BUMB 2KE9A 2HDVA 2CIAA 2OJ2A 4JJCA 2Y1NA 2CH4W 1D4WA 3PLFB 4JE4A 1UG1A 1AYDA 1X6BA 2RQWA 1YWOA 1RPYA 1WFWA 1WA7A 1ZUKA 1MV3A 2OI3A 2QMSA 4A4BA 1VYVA 2Y1MA 2BZ8A 2RMOA 4RTTA 2MCNA 3M0TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QP2A 4OMLA 4B6MA 4M7AC 3ASKA 2EKXA 3CMAA 2ZGWA 3PE0A 3CBLA 5BO4A 5LJ3f 1BKBA 2QG9B 1Q81C 2EJFA 3PMTA 3DKMA 4ATOA 1BF5A 2RVFA 5GAN2 3C95A 1UUSA 4J9HA 4PFZA 3VUZA 4TVRA 1O4QA 1YN8A 3VU3C 3M0UA 3JCMc 4JJNK 3CCST 1Q82C 3VS5A 2L3SA 4GL9E 2JUFA 4A4CA 2VXEA 2HBPA 4E68A 1H3ZA 2QQSA 4QKUA 1O4RA 4PL6A 3CCSA 2VGMA 2L8DA 2EYXA 1B07A 3GNFB 2H3EB 1WQ7A 3VS3A 2BZYA 4HVVA 3CD3A 2L3PA 3ZFJA 1YI2T 2DYIA 2QK0A 3G4ST 3V7CA 1BLJA 4PJNA 3BUXB 4JRKA 2XP1A 2M0OA 2YRDA 1XOVA 4RMOA 2MRJA 1LNXA 4RCBA 1CJ1A 1NLPC 1VQOT 4JS4A 2HSEB 4J9FA 1M3AA 1W70A 1WJSA 2JNGA 5GAOq 1YI2A 4FYYB 5GANj 1QWEA 3G4SA 4J9CA 5EG3B 1NJIU 1N27A 4RTUA 3JB9I 1Z9QA 2X4YA 2DXUA 3MEWA 4EMKC 1RLPC 2P0KA 2YSXA 3I56A 4X34A 5ECAA 1U5SA 3G71A 2M51A 5GMKi 4BI4A 1ZX6A 4Z88A 2VB6A 3OSSC 4E7SA 4FT2A 2X4XA 1RACB 1SHFA 3P8HA 4RTVA 1KD1R 1UUEA 3UATA 3INZA 2OTLQ 3JRZA 1LUNA 3CBMA 3CEYA 2ENMA 3OYFA 4OMPA 5IBSA 2RHZA 2ROTA 2KR3A 2MMPA 4M75E 3U23A 4M75G 1TH7A 4WWQA 1ZSZB 3JB9F 2GFUA 1WHKA 3KFVA 3MKDA 1O4OA 3LH5A 1KC8C 2RO0A 1K0SA 1V29B 2XI9A 1UJYA 1UJ0A 4HCCA 1S72A 1OEBA 1O46A 2MPXC 3LGLA 2EAYA 4A4KA 3OYNA 4AFZC 2W0ZA 2F5KA 1Q81R 1HYOA 1YP5A 8AT1B 1M1KC 5I2MA 3OBYA 4XU3A 2KAFA 4UC4A 1PG5B 1LUIA 1QVGA 1MHNA 3H0FA 2M1HA 1Q82R 3EFSA 2L2PA 2JTMA 2P84A 5I11A 1RAAB 1YITT 1MUZA 1GFDA 1VQNQ 2EW3A 2R58A 4OGEA 2XKOC 1ZA2B 2K79A 2E10A 1ZA1B 5GJIA 2DTOA 4QVZA 2OTLT 4PLIA 3IMDA 1KIKA 4LD9K 5FWBA 3C0CA 3MPUB 1X2KA 2HDAA 1UEBA 2EGAA 1VQ6A 1M2VB 1YITA 3C12A 3QDRB 3RBBB 1M90U 1CWDL 4ZGEB 3VUBA 5LJ5e 4C5GA 2RI5A 5GAOp 3BKBA 3S3MA 1OZ2A 3RR6A 1YJNQ 1GCQC 4AG1C 4ZN1A 4E6RA 4WCIA 4K44A 2GQIA 3C4SA 2JTFA 1YFNA 5KH6A 4N4HA 4LN2A 2HDXA 3N5BB 1CKAA 2YXYA 3HFOA 3CPWP 3CCJA 1I0CA 1K8AC 4EDUA 4JGHA 4C8QE 2PNAA 1VQLQ 4C8QG 2O9VA 2LQKA 2QQBA 4F5AA 4FT4A 2MOXA 2XIDA 4J9EA 1H9OA 4JZ4A 4DBQA 4K2RA 3F70A 2EGEA 1QVGP 2L6KA 1AYAA 3OYBA 1M9SA 1R77A 1Y7XA 1BCOA 3SHWA 5LJ3h 1N8RC 5LJ3d 1OV3A 4FSSA 4IURA 3C7IA 3FC3A 1KD1U 2AUGA 3CCUT 4QT7A 1VQ4A 2VVKA 4FL6A 4FL2A 2JMAA 3EGDA 2O31A 3CXCA 2G3RA 2LZ6B 1AYCA 2QASA 2BIVA 3QZ9B 4M77B 3OB2B 3H8ZA 4GPLB 2FEIA 2EVRA 4LUEA 4CC4B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QP2 A;  4OML A;  4B6M A;  4M7A C;  3ASK A;  2EKX A;  3CMA A;  2ZGW A;  3PE0 A;  3CBL A;  5BO4 A;  5LJ3 f;  1BKB A;  2QG9 B;  1Q81 C;  2EJF A;  3PMT A;  3DKM A;  4ATO A;  1BF5 A;  2RVF A;  5GAN 2;  3C95 A;  1UUS A;  4J9H A;  4PFZ A;  3VUZ A;  4TVR A;  1O4Q A;  1YN8 A;  3VU3 C;  3M0U A;  3JCM c;  4JJN K;  3CCS T;  1Q82 C;  3VS5 A;  2L3S A;  4GL9 E;  2JUF A;  4A4C A;  2VXE A;  2HBP A;  4E68 A;  1H3Z A;  2QQS A;  4QKU A;  1O4R A;  4PL6 A;  3CCS A;  2VGM A;  2L8D A;  2EYX A;  1B07 A;  3GNF B;  2H3E B;  1WQ7 A;  3VS3 A;  2BZY A;  4HVV A;  3CD3 A;  2L3P A;  3ZFJ A;  1YI2 T;  2DYI A;  2QK0 A;  3G4S T;  3V7C A;  1BLJ A;  4PJN A;  3BUX B;  4JRK A;  2XP1 A;  2M0O A;  2YRD A;  1XOV A;  4RMO A;  2MRJ A;  1LNX A;  4RCB A;  1CJ1 A;  1NLP C;  1VQO T;  4JS4 A;  2HSE B;  4J9F A;  1M3A A;  1W70 A;  1WJS A;  2JNG A;  5GAO q;  1YI2 A;  4FYY B;  5GAN j;  1QWE A;  3G4S A;  4J9C A;  5EG3 B;  1NJI U;  1N27 A;  4RTU A;  3JB9 I;  1Z9Q A;  2X4Y A;  2DXU A;  3MEW A;  4EMK C;  1RLP C;  2P0K A;  2YSX A;  3I56 A;  4X34 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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