3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
2K79A 3NMZC 1BFIA 2O2OA 2CS0A 2RNAA 1YP5A 4J9HA 1VYUA 4P9ZA 2DBMA 3M7FA 1WDXA 2E5KA 3VS6A 4IIOA 4GL9E 4E68A 1MV3A 2JS0A 2GE9A 2HBWA 1OV3A 1R1QA 2MK2A 3EG0A 2V1RA 3KFVA 4OHHA 1NYFA 2DA9A 1AB2A 1O4PA 2OZOA 1O4RA 1CKBA 1HCSB 2AOAA 2RQRA 3EACA 1CSYA 2DE0X 1WXBA 2EVRA 3PJPA 2Y1MA 1ZBJA 1X27A 3QWXX 4EIKA 3GXXA 2XMFA 2PTKA 1IS0A 2I0NA 2KT1A 2CH4A 2L3QA 4JJDA 2JS2A 2DL8A 2IZVA 1BB9A 2DYBA 1CJ1A 2D8JA 2KT8A 1O4EA 2LQWA 4LUDA 3TKZA 3VROA 1OPKA 2RN8A 1AZGB 1M8MA 3M0UA 5GJVB 2H8HA 1PRMC 2KXDA 1QG1E 1AWWA 2LP5A 4AG2C 2M0YA 3ZL7C 4CC4B 2KNOA 4QSYA 1JEGA 2FEIA 3GBQA 4RTXA 2JW4A 2DNUA 1X6GA 2K7AB 1UECA 2EGAA 1I07A 4JZ4A 1Y1UA 2J6FA 1S1NA 3VRZA 2YUNA 1XA6A 5IBSA 1X69A 2CR4A 1JXMA 2KRNA 3H0IA 3MXYA 4NWFA 2LNXA 1AWXA 3UA7A 1O4JA 1GCQC 3N7YA 1ZSGA 1YWOA 2H46E 1O4NA 2X3WD 3UF4A 2JM8A 3M0TA 3VS3A 1K0XA 1ZUUA 4DGPA 1X0NA 2CIAA 4DGXA 1YNZA 1A1AA 4F16A 5HKWA 1X2KA 2MQIA 1AVZC 4K11A 1ZX6A 4L1BB 2EYYA 1GRIA 4JZ3A 1LCJA 1D1ZA 2LJ3A 1YVLA 2W10A 2FPDA 4JGHA 1WFWA 4FL2A 4F59A 1AD5A 1TCEA 3EG2A 4IIMA 2KYBA 2CSIA 3EGUA 1PNJA 2VWFA 1UGVA 3PE0A 1OEBA 1M30A 1W1FA 4FSSA 5HKZA 2DM0A 2H5KA 2KEAA 1GFCA 1T0JA 1N5ZA 2K2MA 2CT4A 2RPNA 4ORZA 3VS5A 1A81A 4JEGA 1O44A 5EG3B 3OV1A 1BF5A 3M0SA 1OO4A 3FJ5A 2HDVA 1KSWA 3NHNA 1H8KA 2QDLA 3EG1A 4RTYA 3IN7A 2GTJA 1CWEA 1KA7A 3CXLA 1UJYA 1LCKA 1O4GA 4E93A 1W6XA 1UJ0A 2EYVA 2MOXA 2EKXA 4XZ1A 2SHPA 4J9FA 3H0FA 1JWOA 2MIOA 1R1PA 3K2MA 2BTTA 5HCKA 2K6DA 3REBB 3TSZA 2HCKA 2EO3A 3MAZA 2LQNA 1M27C 4OMLA 1K1ZA 5DC9A 1B47A 1P13A 1O41A 2LNHB 3VGOA 3VS4A 1ABQA 4Z88A 1D4TA 1JYUA 4AFUC 3IMDA 2AUGA 3HCKA 4OHIA 1BBZA 2PNBA 1SKJA 2GGRA 5EHRA 2O88A 1O42A 2K3BA 1O45A 2RMXA 4K2RA 3IN8A 4K45A 3I5RA 4HXJA 4EY0A 1IO6A 1NEBA 2D0NA 1BFJA 2XP1A 2EGEA 2EYWA 2K7AA 1JO8A 1SPSA 1PWTA 1K76A 2YDLA 1YWPA 3REAB 1CWDL 1HJDA 3PVQA 1GL5A 3US4A 4GLMA 1O4IA 2EO6A 5IXBA 2RQWA 2MRJA 3IQLA 1AOUF 2CI9A 1KFZA 1FBVA 2AOBA 3S8NA 2P4RA 2B86A 3PLFB 2DBKA 2LMJA 2PLEA 1H92A 1NEGA 3NGPA 2YSXA 1BKMA 1AWOA 1KIKA 1WX6A 4XZ0A 4JJBA 1UE9A 5EELA 3TSWA 4X1VA 1MILA 1WLPB 3LH5A 2V1QA 4ZNXA 2NWMA 2EYXA 3BUOB 1AYCA 2DLPA 4Y92A 2PZ1A 2ROTA 2DJQA 2F2VA 2CSQA 4LUEA 1U3OA 3GQIB 2SEMA 3VRRA 3U23A 3BUXB 2J06A 2OAWA 2ECDA 2C0IA 4RTUA 1BM2A 2RVFA 1RPYA 3TL0A 2D1XA 1K0SA 2PLDA 2A37A 2F2WA 2ENMA 1RLPC 3RNJA 2YUPA 3IMJA 2CDTA 4J9DA 1O46A 2KE9A 1WA7A 5FWBA 1O4HA 2LJ0A 1K4US 5IH2A 1LUMA 1YCSB 1E7OA 5FW9A 1T3SA 1ZUKA 2IUHA 2CH4W 4GPLB 4H1OA 1CSKA 2BZXA 2DL5A 1AYBA 2L4KA 4H34A 3R6NA 2CUBA 4ROJA 2PNAA 1A0NB 2FPEA 1ZFPE 3BKBA 4GWFA 1M27A 4HVVA 1FYRA 2GSBA 1QWFA 2KRSA 1O4DA 2C9WA 5DC0B 3JV3A 3I9QA 1WXTA 3PSKA 2YT6A 5J3XA 1Z9QA 2RQVA 5IHNA 1LUKA 1UHFA 3WA4A 2DL3A 1WYXA 1PKTA 1SPKA 1OPLA 2EOBA 4OMQA 4GBQA 2HDXA 2YU7A 1X6CA 1BU1A 5IXFA 1ZUYA 3VS1A 1O4LA 2LNWA 1Z3KA 1LUNA 2F2XA 1O4KA 1OO3A 1J3TA 4DEYA 1IJRA 2AK5A 3MXCA 2YSQA 2HSPA 1NRVA 2EW3A 3EAZA 2CT3A 1K9AA 1NZVA 1JYRA 3QWYA 1O4OA 1NYGA 2KK6A 1RI9A 4CC3A 2LCSA 4RTVA 2HDAA 4NWGA 5AULA 2ESWA 2SRCA 1O49A 1E6GA 1WQUA 2DL4A 4F5AA 1NG2A 1NM7A 4U17A 3PVLA 1W70A 2AZSA 2EYZA 2L3SA 5IHIA 3UA6A 3T04A 5EEQA 2LJ1A 5IHKA 2FO0A 3UATA 2IUGA 1MUZA 1MW4A 3PS5A 3M0PA 2G6FX 2GTOA 4E6RA 1SPRA 1UTIA 1SHAA 5AXIA 1O4BA 1NLOC 5D0JA 2NUZA 4AFZC 1QADA 2LCTA 3HHMB 1HCTB 1SRMA 2VVKA 1WI7A 2RF0A 1BHHB 3VRYA 2C0OA 1O48A 2BBUA 3OB1B 4RUGA 2OQ1A 1GFDA 1O4QA 3VRQA 1AYDA 4K44A 1GBQA 1QLYA 1SHFA 4A4BA 2L6KA 2LX7A 1BK2A 1M3BA 1A07A 3M0QA 2ABLA 3PFVA 1V1CA 4R0KA 1H3HA 3S8OA 1M3AA 4A63B 2IIMA 2DVJA 1R1SA 1FBZA 1WIEA 2DLYA 1PKSA 3ULRB 2OI3A 3THKA 1TUCA 2DILA 3SHWA 2KNBB 2FG0A 1B07A 3CWGA 1AYAA 4OHDA 1AWJA 1GBRA 3S9KA 2K9GA 1H9OA 2DX0A 3GXWA 1ABOA 2J05A 1O4AA 1SHGA 2FRWA 1G2BA 1HSQA 2FRYA 2X3XD 5KAZA 2JYQA 4F5BA 1JU5C 4OMNA 4Z89A 2YUOA 1VYVA 1SHBA 1A1CA 2CREA 4HVUA 5I6VA 1XOVA 1GHUA 1UUEA 1Y57A 4EIHA 2OJ2A 5IBMA 1SRLA 2L3PA 4D8KA 4KRTA 1A08A 2A36A 3EG3A 4M4ZA 2J6KA 2B3OA 3CBLA 4DEXA 1KA6A 2HMHA 3C7IA 4LN2A 1ZLMA 4FBNA 3M0RA 1KC2A 1YN8A 3S8LA 2RQTA 1UURA 2DM1A 1U5SA 2JMAA 3NPFA 5ECAA 4FL3A 1E6HA 3UYOA 1EFNA 2J6OA 1QKXA 5GJIA 5GJWB 2O31A 1PRLC 1F2FA 1X6BA 4X6SA 5DC4A 2AKKA 3N84A 2KGTA 1A1EA 2BZYA 2EBPA 3H41A 1U06A 3KFJA 4JPBW 3VS7A 2CUDA 4LE9A 5EC7A 2DRMA 2KRMA 4JE4A 2JM9A 3CD3A 2MRKA 4OMPA 2L0AA 4RTTA 4D8DA 5I11A 3ZNIA 2W0ZA 3SEMA 1LUIA 1BHHA 2JTEA 1O4MA 3BUWB 1GCPA 2MCNA 2KBTA 2JMCA 1BG1A 4JJCA 1FYNA 1PHTA 3I5SA 1UHCA 4WWQA 1X2QA 4LNPA 4HVWA 2ED0A 4AFQC 1CSZA 2MC1A 2Y3AB 1PICA 2M51A 4HCKA 1VA7A 1UG1A 1BLKA 2K79B 4OHLA 3I35A 5DF6A 1BLJA 2C0TA 2L2PA 1FU5A 4OMOA 4F14A 2FCIA 3PQZA 2AZVA 2GNCA 3VS0A 1SEMA 3C0CA 2GQIA 2L3TA 1SHDA 1QWEA 2EU0A 5FWCA 4AFSC 2EGCA 3TVTA 1AOTF 2HUWA 5L23A 3H0HA 2DL7A 4J9GA 1T3LA 2CBLA 1RUWA 2DLZA 2ECZA 2VIFA 4J9IA 1T0HA 1TG0A 2RQUA 1WXUA 1JU5A 2IUIA 2DRKA 3BUMB 5GJHA 4P9VA 4QT7A 4WCIA 1F1WA 2RMOA 3O5ZA 2YUQA 1TZEE 1RQQC 1O43A 2DF6A 4CC7A 2ETZA 1UFFA 1A09A 2VKNA 2J7IA 2BZ8A 2Y1NA 1O4FA 2GBQA 3EHRA 3HIZB 1O47A 2RSYA 1SSHA 2KXCA 1JYQA 4OMMA 2FPFA 1YVHA 3BUNB 3CQTA 1AZEA 1RJAA 1BHFA 2HEQA 5I22A 1I1JA 2ROLA 1O4CA 1BMBA 2PNIA 1ARKA 2CI8A 2KROA 1NLPC 4J9BA 2EKHA 1TUDA 4TZIA 3N8MA 5BO4A 1KJWA 2EPDA 1UDLA 4J9EA 2JT4A 1FMKA 1VYTA 2A28A 4AG1C 1NZLA 1I0CA 3OVEA 2JXBA 2DMOA 4RTWA 1BKLA 1FHSA 2O9VA 1D4WA 2KR3A 4A4CA 2EQIA 1OOTA 4OHEA 2RORA 2O9SA 1QCFA 2KYMA 1FU6A 2QMSA 2DCRA 2ED1A 4CC2A 2LZ6B 1JXOA 2EL8A 2A08A 2AKLA 3VRPA 2CRHA 5CDWA 1LKLA 1G83A 5HKYA 3PSJA 1QKWA 1B3QA 3EHQA 1A1BA 1X43A 1RLQC 1M3CA 3A98A 1Y0MA 5EHPA 2DX1A 1AEYA 1AOJA 1CKAA 3OP0A 3OB2B 1UUSA 4U1PA 3VRNA 4F17A 2D8HA 1I3ZA 1MV0B 3VS2A 4Z8AA 1GCQA 4J9CA 1Z9ZA 4RTZA 4ESRA 1LKKA 1M61A 1HD3A 1JQQA 3RBBB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CS0A 1AHJB 2RNAA 2WSCE 1VYUA 4J6YA 2E5KA 3VS6A 1VIFA 3CCET 1MV3A 4BB7A 5J26A 4O5VA 4OHHA 1WHKA 3JCMh 2EAYA 5D7UA 2OZOA 3GOXA 1XQHA 3JCMX 2AOAA 2RQRA 1JBMA 2EYQA 3EFRA 4C0ZA 1TU0B 1VQLT 2E10A 3QWXX 2BIVA 2DKGA 4B6MA 2LTOA 3OYIA 2ZPFB 1VQOA 5DLQE 4BE0A 1Q81R 4M7AC 3VKIA 3G6EQ 2YWWA 1YCYA 2LP5A 1PM3A 3CCMT 5KYYB 3I55T 1G3SA 5LL6S 1X6GA 4PNOA 1UECA 2HQEA 1Y1UA 2K7AB 1S1NA 1Q82U 5GAMj 4WTOB 4NWFA 4NL2A 2FYKA 5GAN2 4M78B 3H8ZA 1TH7A 2OTJQ 4DGPA 2CIAA 1YNZA 4F16A 2MQIA 1GRIA 3S6WA 5GAMe 3ZEHA 2LJ3A 2FPDA 1QVGP 2E3HA 4ME7A 2KYBA 2KMTA 1UGSB 1VQPQ 1OEBA 4BY6B 5FROA 1W1FA 1KHCA 3PTAA 4J7IA 4M78D 1GFCA 1IREB 1T0JA 2F5TX 5CIUA 5CO7A 1A81A 1K73C 3OV1A 3MO8A 1BF5A 3CC7Q 5IAYA 3FJ5A 3LYVA 5L8RE 4ZTJA 4RTYA 5GAMd 3CCQQ 1CWEA 5LJ5e 1UJYA 3FDRA 2M0OA 4E93A 1UJ0A 2QQSA 2K3YA 4QVCA 3K2MA 3TSZA 3MAZA 2LQNA 4BD3A 4OMLA 2CGHA 1O41A 1YJNA 1QQJA 2VGMA 2AUGA 4OHIA 1BBZA 4GY5A 4JRPA 5EHRA 1O42A 2K3BA 1O45A 2ZGWA 1SF9A 5KYYA 3CPWS 1BFJA 2EGEA 2K7AA 4C5HA 2E65A 1SPSA 3REAB 1CWDL 1KQSS 2EO6A 2RQWA 2VUBA 2DXBA 4M78A 5GANe 1KFZA 2E41A 3CMEA 2PLEA 1H92A 1WHHA 3RMQA 1AWOA 1KIKA 1EZZB 2HKNA 1NPPA 4M7DB 4X1VA 3ASKA 1O9SA 1WLPB 3LH5A 3BUOB 2F1LA 2ROTA 1D0XA 1U3OA 3O8VA 2OAWA 4C92F 1Q95G 4C8QC 3TL0A 1RPYA 1FMWA 3JCMP 1FX7A 3QKJA 2D1XA 4M75C 1K0SA 2PLDA 1RLPC 3RNJA 2XD0A 4V2SA 4J8OA 1O46A 3OYGA 2YRVA 3LGLA 3JB9H 2KE9A 2VV5A 4AT1B 5FWBA 1D0ZA 3C4SA 1LUMA 2KVQG 4M7DD 4F7UB 2IUHA 1M2OA 3HP9A 2L4KA 3R6NA 4ROJA 2PNAA 2CP3A 1A0NB 1M27A 1D3BB 1RAIB 2QEXQ 2HL3A 2KRSA 5DC0B 2HQHA 2M9UA 4PJNA 1KQ2A 3A8OB 1LUKA 5GMKj 1UHFA 4XTYA 1HXDA 1VQKT 2E12A 3FRNA 4WF2A 2EOBA 2FZGB 4TVRA 4A4GA 2E1HA 3BE3A 1BU1A 3D7SB 4PLLA 4OP0A 2LNWA 3CC4T 2DTHA 2YLCA 2KSSA 3GP8A 9ATCB 1ACMB 1Q81C 1NZVA 1RI9A 2HDAA 3QYGB 3X20B 2XICA 3M5AA 4NWGA 2ESWA 2DL4A 5A0DA 4PK4A 4U17A 3PVLA 4M7DA 3RUXA 1H3ZA 3UA6A 2P0PA 3T04A 2PVGB 3DLLA 5EEQA 2L3RA 4LD9K 3UATA 4ZTFA 1MUZA 5C6SA 1W2BS 2G6FX 1SHAA 1O4BA 3NTKA 3JCMf 5D0JA 2NUZA 1QADA 1M1FA 3RERA 3CMET 5AYFA 1M5Q1 1WI7A 1BHHB 4M75F 5CR2A 1GXIE 4F7UA 3CPWP 2BBUA 4XTZA 4BI8B 1Q7YR 4EMKB 3G4SQ 1KC8R 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1LUI A;  1BHH A;  2JTE A;  1O4M A;  3BUW B;  1GCP A;  2MCN A;  2KBT A;  2JMC A;  1BG1 A;  4JJC A;  1FYN A;  1PHT A;  3I5S A;  1UHC A;  4WWQ A;  1X2Q A;  4LNP A;  4HVW A;  2ED0 A;  4AFQ C;  1CSZ A;  2MC1 A;  2Y3A B;  1PIC A;  2M51 A;  4HCK A;  1VA7 A;  1UG1 A;  1BLK A;  2K79 B;  4OHL A;  3I35 A;  5DF6 A;  1BLJ A;  2C0T A;  2L2P A;  1FU5 A;  4OMO A;  4F14 A;  2FCI A;  3PQZ A;  2AZV A;  2GNC A;  3VS0 A;  1SEM A;  3C0C A;  2GQI A;  2L3T A;  1SHD A;  1QWE A;  2EU0 A;  5FWC A;  4AFS C;  2EGC A;  3TVT A;  1AOT F;  2HUW A;  5L23 A;  3H0H A;  2DL7 A;  4J9G A;  1T3L A;  2CBL A;  1RUW A;  2DLZ A;  2ECZ A;  2VIF A;  4J9I A;  1T0H A;  1TG0 A;  2RQU A;  1WXU A;  1JU5 A;  2IUI A;  2DRK A;  3BUM B;  5GJH A;  4P9V A;  4QT7 A;  4WCI A;  1F1W A;  2RMO A;  3O5Z A;  2YUQ A;  1TZE E;  1RQQ C;  1O43 A;  2DF6 A;  4CC7 A;  2ETZ A;  1UFF A;  1A09 A;  2VKN A;  2J7I A;  2BZ8 A;  2Y1N A;  1O4F A;  2GBQ A;  3EHR A;  3HIZ B;  1O47 A;  2RSY A;  1SSH A;  2KXC A;  1JYQ A;  4OMM A;  2FPF A;  1YVH A;  3BUN B;  3CQT A;  1AZE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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