3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
1UG1A 2DL4A 2SEMA 2PNAA 1VYTA 4AFUC 2C0IA 1PKTA 1PRLC 4DEXA 2BZYA 1FBVA 1I1JA 2DF6A 1F2FA 1BKMA 1B07A 1IJRA 1O47A 3OB2B 3ZL7C 4KRTA 3PS5A 2H46E 5IHIA 4GBQA 1QLYA 3KFVA 2C9WA 1U5SA 3GBQA 1GL5A 2RMXA 1KA6A 2EKXA 3MXCA 1KC2A 4ZNXA 1MW4A 2VWFA 1O4HA 1TCEA 5IH2A 1RJAA 4WCIA 2MOXA 1Y57A 2AKLA 5IHNA 2A28A 2BZXA 4LNPA 2GTJA 3REAB 4JGHA 3VRRA 1A1AA 1CWDL 3BUNB 1BFJA 2MK2A 1JU5C 1BB9A 2CT4A 2JM9A 1UECA 3PLFB 2FRYA 2KRNA 2YT6A 5GJVB 1O42A 4FL2A 1AZGB 2PNBA 1SPRA 2J6OA 2AOAA 3VS5A 5DC4A 1O4KA 2J6FA 1JU5A 2HUWA 1G2BA 2YDLA 1X27A 3PVLA 2RF0A 2RVFA 1NZVA 4E68A 2FO0A 1SSHA 1GFDA 3BUWB 1O4MA 5HKZA 2J6KA 2O2OA 2YUNA 1VA7A 2KYMA 1H9OA 2L2PA 2RSYA 2C0TA 5IBMA 1YN8A 5HKYA 2CI9A 3PJPA 2L3QA 4DEYA 3VRQA 1G83A 2DCRA 2CRHA 4F17A 4J9GA 2L4KA 4AG1C 2DA9A 1ZUYA 4J9BA 4OHIA 1A0NB 2VKNA 4HVUA 1O4RA 5CDWA 4H34A 2DBKA 1FBZA 1YNZA 1UUEA 1A09A 2JS0A 1AYBA 1AOJA 2EKHA 3VS4A 1OV3A 1A1EA 1YWPA 1B3QA 2KT8A 3I35A 2MCNA 2GGRA 1MV3A 2B3OA 5EELA 3QWYA 1E6HA 2D8JA 2D0NA 3VRPA 1WXUA 2EW3A 1BLJA 2EO3A 2X3XD 1H3HA 2D1XA 3FJ5A 1Z3KA 4JE4A 2DL8A 1M8MA 4HVWA 2OAWA 1AWOA 1V1CA 5AULA 3H0HA 1O4EA 5I22A 1TZEE 2LJ3A 2CREA 1KA7A 3BKBA 2BZ8A 2CH4A 2JMCA 2LJ0A 4AFSC 5IHKA 1O4PA 2DL5A 4NWFA 1LKLA 1M61A 2LCTA 1OPLA 1M3BA 2SRCA 4HXJA 1RUWA 5I11A 1BHFA 4JJBA 1ZLMA 1MILA 2EL8A 4ORZA 3I9QA 2B86A 1CKAA 1WI7A 1X2QA 2EBPA 3TKZA 1SEMA 2DM0A 4H1OA 3S8LA 1RPYA 2EQIA 2F2XA 3VRNA 4F5BA 2AZVA 3OB1B 1GFCA 1YP5A 2F2WA 1O45A 2DBMA 4GL9E 2JT4A 3S9KA 4CC4B 1ARKA 1GBQA 1A08A 2IIMA 5HKWA 2PZ1A 1WQUA 3GQIB 2KXDA 4AG2C 4JZ4A 1LCJA 2HCKA 1NLPC 1X69A 1LUNA 1HSQA 1PRMC 1H8KA 3OV1A 1MUZA 1JXMA 1QCFA 4M4ZA 2C0OA 2EYZA 1O4LA 1CSYA 1RI9A 2DE0X 2LNHB 1K4US 2AK5A 1I3ZA 1EFNA 2OZOA 1VYUA 3MAZA 3PFVA 4ROJA 3ZNIA 1HD3A 3US4A 1BMBA 3EAZA 3UATA 2ETZA 1AOTF 1JYQA 2CT3A 1NYGA 1NEGA 2A36A 1J3TA 2K79B 1D4TA 3M0RA 5GJIA 4AFQC 2EGEA 1AWXA 4E93A 2KT1A 1NYFA 4J9CA 1LUMA 1O43A 2FPEA 4GLMA 2ED0A 2CSIA 1QG1E 3CD3A 2FPFA 3VRYA 2GQIA 1WA7A 4JPBW 2RQTA 3I5RA 1GCPA 1JXOA 2ESWA 3NHNA 1BKLA 1AZEA 2LZ6B 1CWEA 1SKJA 2KBTA 1Z9ZA 1KJWA 2V1RA 1UDLA 3HIZB 2FG0A 2LP5A 2KGTA 4A63B 2YUQA 1U06A 2DL3A 2KNOA 2KYBA 1O41A 2L3PA 3I5SA 1O49A 2JS2A 1ZSGA 4J9IA 2AOBA 1D1ZA 2O9SA 1K0XA 4F14A 2EO6A 4OMMA 1OEBA 2I0NA 1FU5A 1BHHB 1PNJA 1QKXA 1CJ1A 2K7AB 1X0NA 3OP0A 1MV0B 3M0SA 4F16A 2DRMA 3H0IA 1BU1A 1T3LA 5GJHA 1BFIA 3TL0A 1FHSA 2HEQA 2SHPA 1K76A 2PLDA 2RNAA 2KK6A 4ESRA 4GPLB 2LJ1A 4XZ1A 2JW4A 4RTUA 1KFZA 1X6GA 1HCTB 4U17A 1AWWA 2BTTA 1O48A 1O4IA 3M0QA 2XP1A 2PNIA 4RTTA 2KEAA 3VGOA 1JWOA 4D8DA 5EHRA 1UHFA 2HSPA 1BLKA 1YCSB 2M0YA 2NWMA 1I0CA 1A07A 2V1QA 2KXCA 1GBRA 5GJWB 5DF6A 3VRZA 3EGUA 4L1BB 5HCKA 1KSWA 1BBZA 4DGPA 2CSQA 2A37A 1RQQC 4X1VA 2QMSA 3N7YA 2EVRA 1AB2A 1PKSA 1R1PA 1U3OA 1PICA 4LUDA 3H41A 5IXBA 3K2MA 3IQLA 2XMFA 1SHGA 5L23A 3TSWA 2FEIA 1M3CA 3VS1A 2DX0A 2CI8A 1OPKA 1QWEA 2W10A 1WX6A 2DLZA 3N8MA 5J3XA 1O4OA 1W1FA 2ECZA 3RNJA 2X3WD 2MQIA 1SRLA 1ZBJA 4LN2A 3PSJA 2DYBA 2RQVA 1CSZA 3EHRA 4RTZA 2CBLA 5KAZA 4F5AA 2GNCA 2LQWA 1XOVA 4J9DA 4OMPA 1K1ZA 2FPDA 4K2RA 2HDAA 1A1BA 2MIOA 4R0KA 4E6RA 3EG1A 3EG3A 4XZ0A 1A81A 2CS0A 1UHCA 2J7IA 4OHDA 1AVZC 2O9VA 2IZVA 1TG0A 2DMOA 1AD5A 1N5ZA 2MC1A 4Y92A 3BUXB 2H5KA 2CDTA 4LUEA 1JYRA 1LUIA 1AYDA 4A4BA 1B47A 1OOTA 1UJ0A 2DLYA 1T0JA 3TVTA 1AYAA 3MXYA 4NWGA 1WIEA 2EYXA 3UF4A 4JJCA 1R1QA 2ROLA 3U23A 2L3TA 2LNXA 1TUCA 2JXBA 5DC9A 3ULRB 1SHAA 3IN7A 2CUBA 1HCSB 1NZLA 2YUOA 1I07A 3NGPA 1SHFA 3IMJA 4FBNA 1O4QA 2ABLA 3GXWA 3M0TA 2DILA 4K11A 1SRMA 2EPDA 2JMAA 5IBSA 1BK2A 2H8HA 2GBQA 2LCSA 1ZFPE 2ED1A 1NG2A 2RMOA 1M30A 2JTEA 4Z88A 4CC7A 3T04A 2RN8A 1ZUKA 1S1NA 1YWOA 2O31A 2EYWA 1UFFA 2L0AA 3LH5A 1E7OA 1UTIA 1ZX6A 4OMLA 3KFJA 1AEYA 4WWQA 3PE0A 5EEQA 2L6KA 1UUSA 2DJQA 3H0FA 1FU6A 2OQ1A 4A4CA 1T3SA 2RQRA 4IIMA 3CQTA 4HCKA 2Y1MA 1OO3A 3CXLA 4DGXA 5D0JA 4EIHA 2QDLA 1Y1UA 1X2KA 4CC2A 4OMOA 1CKBA 4X6SA 2FCIA 2DVJA 2EU0A 4K44A 3N84A 1O4GA 1NRVA 1LUKA 3PVQA 3S8NA 1O4NA 3THKA 2YSQA 5I6VA 2HBWA 3M0PA 4IIOA 3EACA 3O5ZA 2EYVA 1IO6A 1AWJA 1WLPB 2DX1A 2O88A 2YSXA 3PSKA 3VS2A 1RLQC 2LMJA 1AOUF 1SHDA 1O4JA 1WDXA 4U1PA 3VS0A 5BO4A 2VIFA 2LQNA 2FRWA 1QADA 3UA7A 1ABOA 4P9ZA 2EOBA 4EY0A 4FSSA 1H92A 1UJYA 2EGAA 2A08A 1O46A 2L3SA 2AKKA 4OHHA 3C7IA 2Y3AB 2ECDA 2KRMA 2IUHA 4P9VA 4Z89A 3GXXA 4JZ3A 5EC7A 2YU7A 3BUOB 1BF5A 2RQWA 2IUGA 1GHUA 1BM2A 2YUPA 4RTXA 1K0SA 1QWFA 1FYRA 2E5KA 2K6DA 3TSZA 1O4FA 2CR4A 5AXIA 3IMDA 2HDXA 1RLPC 2ROTA 1HJDA 1WFWA 2K2MA 1UE9A 1R1SA 2NUZA 4QT7A 1JEGA 2MRKA 1O4BA 2GTOA 1BG1A 4D8KA 5FWCA 2PLEA 2VVKA 1WXBA 2RORA 3VS3A 1JO8A 3C0CA 4J9EA 2K9GA 2W0ZA 4QSYA 4J9HA 3OVEA 3CWGA 1LCKA 2GE9A 4F59A 1GRIA 2KRSA 1IS0A 4GWFA 2K79A 2EYYA 1X6BA 3JV3A 3UA6A 5ECAA 3RBBB 1OO4A 4TZIA 3QWXX 3UYOA 3PQZA 1X6CA 1SPSA 1ABQA 1WYXA 3HCKA 1SPKA 2IUIA 3VS7A 4J9FA 1X43A 3REBB 3IN8A 4JJDA 2M51A 3HHMB 1QKWA 2CIAA 3VS6A 1AYCA 2J05A 2LX7A 4HVVA 1F1WA 1Z9QA 1JQQA 5DC0B 1SHBA 4RTYA 4JEGA 4K45A 2OJ2A 2RQUA 2G6FX 1PWTA 4OMQA 1P13A 2DNUA 2DM1A 2PTKA 3BUMB 1TUDA 2F2VA 1VYVA 2JYQA 2KNBB 1K9AA 2KE9A 1GCQC 4CC3A 1UURA 1YVHA 1W6XA 5EHPA 2JM8A 4Z8AA 1FMKA 4RUGA 2BBUA 2GSBA 1M27C 3NMZC 4RTWA 1BHHA 2K7AA 2RPNA 5EG3B 4OHEA 4EIKA 2DRKA 2KROA 3A98A 2J06A 3SHWA 1JYUA 3M7FA 2MRJA 1GCQA 3EG2A 1D4WA 2Y1NA 1LKKA 2ENMA 1M27A 1O4DA 4RTVA 2OI3A 1CSKA 1A1CA 2D8HA 1KIKA 4OHLA 1ZUUA 2AZSA 4OMNA 1YVLA 1NM7A 4AFZC 1FYNA 3S8OA 1NLOC 1WXTA 1O4CA 1M3AA 3EHQA 5IXFA 2HDVA 5FWBA 1W70A 2HMHA 3SEMA 1O4AA 1NEBA 2LNWA 3WA4A 3NPFA 2DL7A 1O44A 3VROA 2AUGA 2KR3A 3EG0A 2P4RA 1UGVA 2EGCA 1PHTA 1Y0MA 2K3BA 5FW9A 3CBLA 1T0HA 3M0UA 1E6GA 4FL3A 2DLPA 2CUDA 2CH4W 1XA6A 3R6NA 4LE9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UG1A 2A7YA 2PNAA 1VYTA 2MI6A 4AFUC 2C0IA 5CAIA 1VQ5Q 5LJ5h 3CCEQ 5EG2A 1FBVA 4Z02A 4MMLA 3ZL7C 3CCSQ 4GBQA 1IXDA 2IVWA 1M4ZA 1YIJQ 2JZ2A 1GL5A 2EKXA 2A3LA 4ZNXA 1MW4A 2VWFA 4J7IA 4WCIA 3M55A 2EJGA 4JGHA 5GANd 1BFJA 3EFSA 1IHVA 1UECA 3DLLA 5GJVB 1O42A 3S3MA 2D6FA 1AZGB 3VS5A 1VQ5T 3CCET 4C0DC 2BE7D 3CCST 1HYOA 4E7IA 1H9OA 4M75C 4M7DB 3CXCA 2AIRB 5HKYA 3VV0A 1OX8A 5CO7A 2CI9A 2M02A 4M77D 3OYFA 1HXDA 3PJPA 3VRQA 3INZA 1I5LA 4OHIA 5CDWA 4H34A 2DBKA 1AT1B 1M5Q1 2JS0A 3GP8A 3CPWP 5GANj 1XJWB 2P0PA 3VS4A 4JRIA 3EG9B 5D6YA 2D0NA 1WXUA 1H3HA 4KUIA 3FJ5A 3MPUB 1PD1A 4JE4A 1M8MA 4M7AD 2OAWA 4PJLA 1TZEE 3S3OA 5CR2A 2HNIA 2YXYA 2BZ8A 5CQXA 3TREA 1VQ4A 5IHKA 3H8ZA 4C8QB 3QJ6A 3RMSA 3RR6A 2LCTA 1OPLA 1RUWA 4KT0E 4C0FA 2DETA 3JAME 4RG2A 2EQIA 2WACA 3OYKA 2H3EB 3VRNA 2HAXA 4F5BA 1GFCA 1XQHA 2QQRA 3H6ZA 4DQ2A 1ZHIA 1A08A 1NBEB 2KXDA 1NPPA 4XTZA 1LCJA 2E41A 1ZBXA 1QVGA 1X69A 1PRMC 1R0BG 4HT8A 3OV1A 1KQSA 1MUZA 1QCFA 3OYBA 2EWNA 2DAQA 1K4US 3PFVA 1VQPQ 2DD4A 2GQVA 3META 2PVOB 4EDUA 1NYGA 1J3TA 1M90C 1X75C 1YJNQ 1AWXA 4E93A 1O43A 1YJWQ 2FPEA 1PD0A 4GLMA 4KGVB 3OYAA 1QG1E 2VASA 2K3YA 3QO3A 2L89A 4X9DA 2MAMA 2KGYA 4IUPA 2KI7A 3CC4Q 4XTVA 5FU6B 2DD5A 2V1RA 1VQ6A 4FYYB 4MZTA 4A4HA 2KGTA 1VQPT 1U06A 5LJ3g 3HKSA 3CXCS 3EGDB 4C92D 3CCVA 1IB8A 3I5SA 2JS2A 4J9IA 3HL8A 2FZKB 8ATCB 2EO6A 4OMMA 3JCMP 1YJNT 1BHHB 1CJ1A 1MV0B 4L59A 1YJWT 3CC2Q 2EJFA 3CCLQ 5GANh 1BFIA 4FL6A 3TL0A 3CCJA 2HEQA 3A8OB 3E9GA 2PLDA 2DZ9A 4ESRA 5IN1A 4F7UE 2RA2A 3CC4T 3M4YA 2M0OA 3M53A 2KEAA 3BW1A 2ATCB 2AT1B 4XTUA 2WSEE 4D8DA 4DOVA 3V7SA 1DJ7B 2L3RA 1I0CA 4BE2A 2RJCA 1D1AA 2KXCA 5DF6A 4KULA 4XK8E 3VRZA 4QVZA 3RMQA 1KSWA 2A37A 1VQ9Q 2P0QA 3OSSC 2EVRA 3LWIA 3CC2T 3CCLT 4BI8B 3H41A 4XAXB 3A8GB 4AMCA 1N27A 1RAIB 3VS1A 1SG5A 2YRDA 4IUVA 1Y96A 3N8MA 2DJZA 1O4OA 4IUTA 2X3WD 2ZPGB 2CZ7B 2RD1A 1ZBJA 4LN2A 1YI2A 3PSJA 3EHRA 2CBLA 4F5AA 2LQWA 3G6EA 4K2RA 2F1LA 2MIOA 4R0KA 4E6RA 4PJOE 1I4K1 5A0LA 1VQ9T 1QVGS 2J7IA 1AVZC 2IZVA 1KQSS 4PFPA 4QKUA 2DVEA 3LW5E 1B47A 1UB4A 2BIVA 2DLYA 2VC8A 3UF4A 3CCSA 4C5HA 5DC9A 4JLGA 1TUCA 2JXBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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