4M4ZA

Sh3 and sh2 domains of human src-like adaptor protein 2 (slap2)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
158
structure length
152
Chain Sequence
TAVALGSFPLSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of Src-like adaptor protein 2 reveals close association of SH3 and SH2 domains through beta-sheet formation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Src-like-adapter 2
total genus 36
structure length 152
sequence length 158
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 4m4zA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4m4zA02
2PNIA 5EEQA 3LH5A 2KK6A 1W70A 4GL9E 2FRWA 2LNHB 2M51A 1O4FA 3M0TA 1P13A 3IQLA 2RQUA 1M3AA 2KT1A 3M0SA 3IN7A 2CIAA 3PQZA 1GCQA 3VRRA 2K7AA 2O9VA 1WQUA 1FMKA 4LUEA 1KFZA 3CBLA 4J9IA 4LE9A 1BMBA 2LMJA 3FJ5A 2J6KA 3VS5A 2RQRA 2AKKA 1X43A 2AKLA 2DLYA 2EOBA 2SRCA 1CWDL 5KAZA 2XP1A 1ZSGA 2EYZA 1Y0MA 1YWOA 1KA7A 2DLPA 1CWEA 1J3TA 1RLPC 2H46E 3ZNIA 5I6VA 1I1JA 2J05A 2RQWA 3M0UA 2IIMA 2NUZA 1O4QA 1TZEE 2KRMA 1WFWA 3OV1A 4A63B 1TG0A 1OPLA 2DM0A 3UYOA 4AFUC 3M0QA 2A08A 2HBWA 1X6CA 4E93A 3EG3A 2K2MA 3UA7A 4U1PA 3T04A 1CSKA 3VS7A 1O4CA 2L3QA 1HSQA 1KJWA 2HUWA 1NRVA 1CSYA 3K2MA 3BUXB 1OEBA 2RPNA 1K0SA 4GWFA 1X0NA 4GBQA 1UHCA 2CI8A 3OVEA 1UFFA 4F14A 1ZUYA 1A81A 1LCKA 4F5BA 3VS0A 1TCEA 3EHRA 2E5KA 3GBQA 2JM8A 1AWWA 4E6RA 1O4HA 3BUOB 1WXUA 2HCKA 1OV3A 1JEGA 1NEGA 4FBNA 1X69A 2MOXA 3VS3A 3PVQA 1RJAA 4J9BA 2LCTA 2RMXA 1UGVA 1VYTA 3EG2A 4Y92A 2DILA 3C7IA 1O49A 4OHLA 2FO0A 1T0HA 1YN8A 2K9GA 3I9QA 4R0KA 1HCTB 1N5ZA 2DBMA 1TUDA 1O4PA 2CDTA 2EO3A 1YNZA 3KFJA 5IBSA 4JJDA 3IN8A 5AXIA 1O4EA 3CWGA 3TKZA 1I3ZA 2VWFA 3WA4A 2CH4A 1JWOA 3U23A 1O4DA 3HHMB 4HVUA 1CKBA 1G83A 1WDXA 1O44A 2C0TA 2BZXA 3NMZC 2RORA 2MRJA 2RVFA 2CRHA 3REBB 1HJDA 3S8OA 2O31A 1BKLA 1K9AA 1M27C 4XZ0A 1M3CA 1E7OA 2W10A 2CSIA 2VVKA 4RTTA 2GE9A 1BM2A 4X1VA 3H0FA 2AOBA 3EG1A 4WWQA 1KA6A 1OO3A 1PRLC 3VGOA 3VRQA 1JYUA 2CUDA 1E6GA 2M0YA 2OQ1A 2FRYA 2YT6A 1O4KA 2FCIA 3BUNB 5GJHA 1QWFA 2JS2A 2EBPA 1KC2A 3NGPA 2LZ6B 1WXBA 3R6NA 3PSKA 1BG1A 4P9VA 1AYDA 2RF0A 1O42A 2LJ0A 3TSWA 1UUEA 1X6GA 2DVJA 4AG1C 1Y57A 1R1QA 2DL4A 3QWXX 2RSYA 2ROTA 3M0PA 1M8MA 4F16A 2J7IA 3VRZA 1SHDA 1O4LA 1BHHB 2O2OA 4JJCA 3UF4A 5IXBA 2D8HA 1M61A 2EVRA 3M0RA 1V1CA 1HD3A 1JQQA 2NWMA 1G2BA 2JMAA 1SPSA 2DRKA 2W0ZA 1D4TA 4AFZC 1O4GA 1M30A 5I11A 3PLFB 2IUGA 5EHPA 2JYQA 1AYAA 2YUOA 3EAZA 1AOUF 2J6FA 1SHAA 4HCKA 2EW3A 4Z89A 1O4MA 2CS0A 2LJ3A 5GJVB 1K4US 2D0NA 2CUBA 2ECZA 2X3XD 4JPBW 4EIHA 3S8LA 4RTYA 2CBLA 2YUQA 1NLPC 4JEGA 4LUDA 1W1FA 2YDLA 1Z9ZA 1UECA 3UA6A 5FW9A 1H8KA 2GBQA 4QT7A 2DX0A 4L1BB 2D1XA 1XOVA 4OMPA 4JGHA 1RUWA 4TZIA 5DF6A 3EHQA 2DM1A 2EGCA 1GRIA 2V1RA 1FBVA 1O47A 2HEQA 4RUGA 4DEXA 1SEMA 2K7AB 1K1ZA 2PLDA 3I5RA 4K45A 2BBUA 3KFVA 1AZEA 2KEAA 3GXXA 4GPLB 3EG0A 1JU5C 4OMLA 2G6FX 1MV3A 2DF6A 2GTJA 2KNBB 4LNPA 1SRMA 1T0JA 2L3TA 2CSQA 1A1CA 1O43A 2FG0A 1F1WA 4M4ZA 1ZBJA 2KRSA 1PHTA 2K6DA 4LN2A 2A37A 3VS4A 2A36A 2PNBA 1KSWA 5IH2A 1A1EA 1WYXA 1U3OA 1VYVA 2ECDA 1AD5A 1GL5A 4K11A 2QMSA 1NM7A 4OHHA 2ESWA 2KXCA 3ULRB 1UURA 5EELA 1IO6A 1H3HA 4JE4A 1AWJA 4F5AA 1ZFPE 2K79A 3VS6A 2QDLA 2JS0A 1AOTF 5HKYA 1O4OA 2D8JA 2LJ1A 2C0OA 2KNOA 3CQTA 3TL0A 1A1BA 1WA7A 2JW4A 2Y3AB 1TUCA 1K0XA 4DGPA 2LNWA 1A1AA 2BZYA 2MK2A 2MIOA 1JYRA 2EL8A 4NWGA 4QSYA 2AZSA 1O41A 5J3XA 3PJPA 1Z3KA 1W6XA 4A4BA 2DA9A 1SHGA 1H92A 3VRPA 3MAZA 3VRYA 4EIKA 1YWPA 2FPFA 3I35A 1ZUKA 1BF5A 2EKXA 5GJWB 2OZOA 2LCSA 1SSHA 2DL3A 1RQQC 2DBKA 1BFIA 4IIMA 4RTUA 1SPRA 1WI7A 4J9GA 1AB2A 2DCRA 5IXFA 1NEBA 4KRTA 1LKLA 2DMOA 2JXBA 2AOAA 2SHPA 3HCKA 1VA7A 1OO4A 4FSSA 2EQIA 1GBRA 1JU5A 3TVTA 2VKNA 1SRLA 3THKA 4IIOA 2PNAA 1BK2A 4OMMA 2Y1MA 1RLQC 1GFCA 1B3QA 1PICA 2GQIA 1FHSA 3RBBB 1O4AA 5HKZA 2DL7A 5CDWA 3BUMB 3MXYA 5IHNA 1MW4A 1CJ1A 1GCQC 2LNXA 1LUKA 4OHDA 2CI9A 5GJIA 2YU7A 2JM9A 5IHIA 1U5SA 4JZ4A 1AVZC 2CT4A 1PWTA 2MCNA 4K2RA 1X27A 1A08A 1NZVA 3N8MA 4JZ3A 3M7FA 4XZ1A 1OPKA 2EO6A 1E6HA 3EACA 2JMCA 2X3WD 3SHWA 2L2PA 4F59A 1RI9A 1RPYA 3VRNA 5HKWA 4J9FA 3OB1B 3BUWB 2MC1A 1WXTA 1LUMA 1R1SA 4ZNXA 1O45A 2JT4A 3VROA 1QG1E 2FPEA 2YUNA 3NHNA 1O4NA 3IMDA 1KIKA 1JYQA 1AZGB 1JXMA 5DC0B 2O88A 1FYRA 2KR3A 4U17A 2PTKA 5EC7A 4HVWA 2VIFA 4H1OA 4HXJA 1BU1A 1CKAA 1X2KA 1O4IA 1K76A 4D8KA 2GSBA 5IBMA 1A09A 2RN8A 1QKWA 1CSZA 4AFSC 1M27A 1NYFA 4A4CA 1BKMA 2J06A 1BBZA 4OMQA 1IS0A 1JXOA 2AUGA 3OB2B 4J9DA 4D8DA 3H0IA 3GQIB 1FYNA 1HCSB 1UE9A 2HMHA 3HIZB 2CH4W 1UJ0A 2RQTA 2LQWA 2HSPA 2EU0A 2K3BA 2MQIA 2J6OA 2EYXA 2P4RA 3US4A 2ROLA 1IJRA 3REAB 1UG1A 2CREA 2MRKA 1BFJA 3SEMA 1LUIA 1ZLMA 2BTTA 1UUSA 3S9KA 5AULA 4H34A 2ENMA 3IMJA 3ZL7C 2DE0X 2RMOA 1Y1UA 4OHEA 1MV0B 1SPKA 2OJ2A 1LKKA 4OMOA 2F2VA 4DGXA 2L0AA 1AWXA 1I0CA 2FPDA 1FBZA 5EG3B 1B47A 4ORZA 2H5KA 2B86A 3OP0A 3PVLA 2A28A 1D4WA 2DL8A 5D0JA 2LX7A 2KYMA 1O4RA 2DX1A 5ECAA 1NG2A 4FL3A 1Z9QA 2HDAA 1OOTA 2KYBA 2L4KA 1PKSA 1YCSB 5HCKA 1SHBA 4AG2C 2IZVA 1GBQA 5I22A 1AYBA 1X6BA 3QWYA 1LUNA 3A98A 3MXCA 2EYYA 1FU5A 1FU6A 4GLMA 1MILA 1YP5A 2DYBA 3O5ZA 2KE9A 2PLEA 4Z8AA 2L3PA 1QKXA 4Z88A 1YVHA 2FEIA 4J9CA 1MUZA 4RTZA 1UHFA 2PZ1A 3PE0A 5DC4A 1T3SA 2YSQA 1S1NA 3CD3A 2H8HA 5IHKA 4J9EA 1B07A 1M3BA 2C0IA 1GFDA 4K44A 2ABLA 3VS2A 2EGAA 2KGTA 4ROJA 3UATA 2CR4A 4CC7A 1ZX6A 4CC2A 2EYWA 2RNAA 2IUHA 1BLJA 1YVLA 2K79B 3EGUA 1BLKA 1A07A 1H9OA 1AEYA 2DRMA 3BKBA 4P9ZA 5L23A 2JTEA 2C9WA 1NLOC 1WLPB 4F17A 2KT8A 5FWBA 5DC9A 3RNJA 1T3LA 2CT3A 3H0HA 1PRMC 2ETZA 1A0NB 5EHRA 2GGRA 2OAWA 1AYCA 2EYVA 2HDVA 1WX6A 2F2WA 3H41A 4J9HA 3TSZA 1SHFA 4RTWA 4HVVA 2EGEA 2SEMA 1JO8A 4DEYA 1I07A 1QWEA 3PSJA 2DL5A 2KBTA 1ZUUA 3CXLA 1BHFA 1ABOA 1UTIA 2GTOA 3JV3A 4CC3A 1AWOA 2EPDA 1UJYA 3VS1A 1PNJA 3S8NA 5BO4A 4OHIA 1BHHA 1LCJA 4NWFA 2B3OA 1ARKA 1O4BA 1BB9A 1U06A 2ED0A 2Y1NA 1GCPA 4OMNA 1PKTA 4RTVA 1O48A 1VYUA 4WCIA 2GNCA 1X2QA 2AK5A 4JJBA 1D1ZA 4RTXA 1XA6A 2KRNA 2L3SA 4CC4B 4FL2A 2DLZA 2O9SA 3GXWA 1WIEA 3PS5A 1O46A 2HDXA 2LP5A 1QLYA 1AOJA 1O4JA 2BZ8A 4EY0A 1UDLA 2V1QA 1QCFA 2YUPA 2F2XA 2OI3A 2I0NA 4X6SA 1F2FA 2L6KA 2KXDA 2YSXA 1ABQA 1R1PA 2IUIA 1EFNA 2EKHA 2AZVA 3I5SA 2DJQA 2DNUA 2ED1A 4E68A 1QADA 1SKJA 2KROA 1NZLA 1GHUA 2LQNA 1NYGA 5FWCA 2RQVA 3C0CA 2XMFA 4AFQC 4ESRA 3N84A 3PFVA 3NPFA 3N7YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5M9OA 3OW2A 2PNIA 3JCMd 4ELYC 1W70A 2EQKA 1KHCA 3VYHB 4M7AD 4GL9E 3OSVA 1I81A 3IQLA 3GLXA 4PFOA 3CC2Q 3VRRA 3CCMQ 2O9VA 4Y91A 5DLOA 3QXEB 1Q82R 3VS5A 3CCQT 3M58A 1FXXA 2XDBA 2SRCA 2COWA 2XP1A 1VQ4A 2EYZA 4AMCA 4OGCA 1FMWA 2MK5A 4C8QE 2DLPA 1J3TA 4IKFA 2H46E 5I6VA 1R8OB 2RQWA 3M0UA 2NUZA 1C6VX 4FCYA 1KQSA 1KC8C 3A8GB 4FU6A 3UYOA 2A08A 2HBWA 4E93A 2RO0A 4NOYA 3UA7A 4U1PA 3T04A 1VQ7Q 2KAFA 3SB2A 1O4CA 2L3QA 3V7RA 3BUXB 1OEBA 3RIRA 4GWFA 3V8LA 1UHCA 2E5QA 4C8QA 1LOJA 5FU7C 1W4SA 3WVDB 2CI8A 2MWPA 4C92E 4PJNA 1ZUYA 2DIQA 3CCRQ 1VQ5T 4RCCA 2EQJA 2XDPA 2DKGA 1X69A 2E6NA 2QDYB 3M5AA 1NJIC 4GY5A 2LCTA 2RMXA 1VYTA 2P0PA 4PJOG 4BI8B 3OYCA 2DZCA 2QK0A 2K9GA 3CCVQ 1HCTB 4R0KA 1TUDA 2CDTA 2QQ9A 3D7SB 1OYXA 5KYUA 3PIPA 3G4SA 1VQNQ 5AXIA 1O4EA 1G3SA 1KD1U 1RAGB 3E2UA 3JAME 3G71T 2RORA 2P84A 5J39A 2RVFA 5HK3A 2W10A 4RTTA 4QKUA 2AOBA 4WWQA 2P0QA 3I56A 1IGQA 3A8MB 1BI1A 2OQ1A 1W2BS 5KYWA 3CCUT 2E3IA 3NGPA 2RI3A 1LPLA 2LZ6B 5LJ3e 3MP6A 4P9VA 2H3EB 3URGA 4OF1A 2XHCA 1Y57A 3HFOA 2OTJT 2DD5A 3MP1A 3JCMh 4NS5A 2QGFB 1Q81C 1G3YA 2O2OA 1K73U 2D8HA 3OYEA 3G6ET 3UDCA 3H6ZA 1HD3A 1G2BA 1VQPT 1D3BA 1YJ9T 1SPSA 3GNFB 4RCBA 1PCXA 4FW2A 2YRCA 1M30A 4XTWA 5I11A 1QVPA 1AYAA 3QO3A 4ZGEB 3EAZA 2RHUA 2DTHA 4HCKA 2EW3A 1K4US 4J5YA 2ECZA 3S8LA 4RTYA 2DXUA 2E1HA 5CK9A 1WHMA 2YUQA 2PVOB 1UECA 2DD4A 5IT9E 2DX0A 1RUWA 4LDVA 3EHQA 2L5QA 2V1RA 5GAMd 2QTXA 2HEQA 4RUGA 1SEMA 1YITT 2I2LA 2EKOA 3I5RA 2HBPA 2KEAA 2OTLA 3EG0A 2G6FX 1OULA 2KNBB 4FYYB 4M4ZA 2LCCA 1M90R 4XK8E 3OYHA 1KC8R 1I5OB 5IH2A 1A1EA 1WYXA 1YFNA 3TCJA 3RKXA 3N5BB 4A4EA 2JN0A 4JE4A 1N8RR 1PG5B 2K79A 3VS6A 2K5IA 9ATCB 3C12A 2LJ1A 5GANd 3I55T 3TL0A 1MHNA 1UGQB 2BZYA 2MIOA 2QAZA 2QG9B 1RI0A 3PMIA 1Z3KA 2DA9A 1RAEB 1SHGA 1YWPA 3CCET 3I35A 2DXBA 2LCSA 1SSHA 3DB4A 1MNDA 2AT1B 2H3JA 1WI7A 2CP7A 1MMDA 2XG8D 3SWNA 1NEBA 3ME9A 4WTOB 5KCHA 1OO4A 3M4GA 2EQIA 3OBYA 3CMEA 4M7AC 3J81E 4RG8A 2F5TX 1SRLA 3THKA 3NFCA 3QSUA 2P4TA 2PNAA 1QVGS 1X75C 2Y1MA 1JB0E 4BE0A 3TQ7P 2K5FA 1O4AA 2DL7A 4UC4A 3OQ5A 1CJ1A 1GCQC 3EH1A 3EFOB 3JCMb 2CI9A 3F70A 1YIJA 3RKWA 4JZ4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1TCE A;  3EHR A;  2E5K A;  3GBQ A;  2JM8 A;  1AWW A;  4E6R A;  1O4H A;  3BUO B;  1WXU A;  2HCK A;  1OV3 A;  1JEG A;  1NEG A;  4FBN A;  1X69 A;  2MOX A;  3VS3 A;  3PVQ A;  1RJA A;  4J9B A;  2LCT A;  2RMX A;  1UGV A;  1VYT A;  3EG2 A;  4Y92 A;  2DIL A;  3C7I A;  1O49 A;  4OHL A;  2FO0 A;  1T0H A;  1YN8 A;  2K9G A;  3I9Q A;  4R0K A;  1HCT B;  1N5Z A;  2DBM A;  1TUD A;  1O4P A;  2CDT A;  2EO3 A;  1YNZ A;  3KFJ A;  5IBS A;  4JJD A;  3IN8 A;  5AXI A;  1O4E A;  3CWG A;  3TKZ A;  1I3Z A;  2VWF A;  3WA4 A;  2CH4 A;  1JWO A;  3U23 A;  1O4D A;  3HHM B;  4HVU A;  1CKB A;  1G83 A;  1WDX A;  1O44 A;  2C0T A;  2BZX A;  3NMZ C;  2ROR A;  2MRJ A;  2RVF A;  2CRH A;  3REB B;  1HJD A;  3S8O A;  2O31 A;  1BKL A;  1K9A A;  1M27 C;  4XZ0 A;  1M3C A;  1E7O A;  2W10 A;  2CSI A;  2VVK A;  4RTT A;  2GE9 A;  1BM2 A;  4X1V A;  3H0F A;  2AOB A;  3EG1 A;  4WWQ A;  1KA6 A;  1OO3 A;  1PRL C;  3VGO A;  3VRQ A;  1JYU A;  2CUD A;  1E6G A;  2M0Y A;  2OQ1 A;  2FRY A;  2YT6 A;  1O4K A;  2FCI A;  3BUN B;  5GJH A;  1QWF A;  2JS2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2PNI A;  5EEQ A;  3LH5 A;  2KK6 A;  1W70 A;  4GL9 E;  2FRW A;  2LNH B;  2M51 A;  1O4F A;  3M0T A;  1P13 A;  3IQL A;  2RQU A;  1M3A A;  2KT1 A;  3M0S A;  3IN7 A;  2CIA A;  3PQZ A;  1GCQ A;  3VRR A;  2K7A A;  2O9V A;  1WQU A;  1FMK A;  4LUE A;  1KFZ A;  3CBL A;  4J9I A;  4LE9 A;  1BMB A;  2LMJ A;  3FJ5 A;  2J6K A;  3VS5 A;  2RQR A;  2AKK A;  1X43 A;  2AKL A;  2DLY A;  2EOB A;  2SRC A;  1CWD L;  5KAZ A;  2XP1 A;  1ZSG A;  2EYZ A;  1Y0M A;  1YWO A;  1KA7 A;  2DLP A;  1CWE A;  1J3T A;  1RLP C;  2H46 E;  3ZNI A;  5I6V A;  1I1J A;  2J05 A;  2RQW A;  3M0U A;  2IIM A;  2NUZ A;  1O4Q A;  1TZE E;  2KRM A;  1WFW A;  3OV1 A;  4A63 B;  1TG0 A;  1OPL A;  2DM0 A;  3UYO A;  4AFU C;  3M0Q A;  2A08 A;  2HBW A;  1X6C A;  4E93 A;  3EG3 A;  2K2M A;  3UA7 A;  4U1P A;  3T04 A;  1CSK A;  3VS7 A;  1O4C A;  2L3Q A;  1HSQ A;  1KJW A;  2HUW A;  1NRV A;  1CSY A;  3K2M A;  3BUX B;  1OEB A;  2RPN A;  1K0S A;  4GWF A;  1X0N A;  4GBQ A;  1UHC A;  2CI8 A;  3OVE A;  1UFF A;  4F14 A;  1ZUY A;  1A81 A;  1LCK A;  4F5B A;  3VS0 A; 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