4M4ZA

Sh3 and sh2 domains of human src-like adaptor protein 2 (slap2)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
158
structure length
152
Chain Sequence
TAVALGSFPLSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of Src-like adaptor protein 2 reveals close association of SH3 and SH2 domains through beta-sheet formation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Src-like-adapter 2
total genus 36
structure length 152
sequence length 158
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 4m4zA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4m4zA02
2SRCA 2F2XA 1LUMA 4U1PA 1ZFPE 4DGPA 2KT8A 2H5KA 2KNBB 2RQRA 2GTOA 2RMXA 2EQIA 3VRRA 2JMAA 2K2MA 3PQZA 4OHEA 3EG0A 1HJDA 2J6KA 3VRNA 4D8KA 1QG1E 3S8LA 3EACA 1AWOA 1WIEA 5IHNA 2J6OA 2GTJA 1Y57A 1UJ0A 3HIZB 3TL0A 4QT7A 1SPKA 2A36A 2GE9A 4Z89A 1UJYA 2A08A 2IUHA 1VYTA 1BMBA 1O4LA 2RPNA 2CS0A 2GQIA 1G83A 1WXTA 4F16A 3S8NA 2M0YA 1O46A 2PNIA 2KYMA 1SSHA 4X1VA 1IS0A 1SPRA 3RNJA 3N84A 3H0FA 1O4NA 1TUCA 2HBWA 4RTWA 2RSYA 1RJAA 2YSXA 5HKYA 5GJHA 3S9KA 1GBRA 2L3QA 2FPDA 4JZ3A 1F1WA 3OVEA 1BK2A 2LCSA 1A1EA 2DM0A 1E7OA 4WWQA 1FU6A 4A4BA 4JJBA 4JPBW 1O4PA 5I6VA 1CJ1A 2DL7A 1A1CA 2I0NA 2Y1MA 2MK2A 1O4QA 2JXBA 4EIHA 4OMPA 3IN8A 2MRKA 3CD3A 2JT4A 3CXLA 2IUGA 1OPLA 4QSYA 1QADA 1AOUF 3I5SA 1B07A 3BUWB 2FRYA 3VS5A 2VVKA 3PE0A 3HCKA 4RTUA 3UA7A 5HCKA 1O49A 2DMOA 2VIFA 4RTXA 2ETZA 3PVQA 2YUQA 2JM8A 2RNAA 2MQIA 1VA7A 1YWPA 1ZBJA 2KXDA 3EG1A 4IIOA 1NLOC 4LN2A 1O4DA 4E6RA 3EAZA 2KRNA 3NPFA 1O4AA 1X6CA 1XOVA 2ED0A 2K79A 4CC2A 4JE4A 2CT3A 3SHWA 1X43A 1PKTA 5EHRA 1MILA 4OMLA 1Z9QA 3M0UA 2QMSA 1CWEA 1W70A 3VS6A 1N5ZA 4EIKA 3MXCA 1GL5A 1CWDL 2D0NA 2HDXA 1AB2A 3IMJA 1AD5A 1WQUA 4HVVA 4J9HA 1YP5A 2EW3A 4F17A 1CKBA 1G2BA 3I35A 3PSKA 1SKJA 2JS2A 3T04A 1AYDA 2KBTA 5GJWB 2V1QA 4DGXA 4CC4B 3H0IA 1GCPA 3ZNIA 1GFDA 5IXBA 5BO4A 4JJCA 1UFFA 2DLPA 2C0TA 1FBVA 1SHFA 4GL9E 2J05A 2AZVA 1M3BA 5HKZA 5FW9A 4J9CA 2FG0A 1VYVA 3KFJA 1UDLA 2K6DA 1GCQA 2LMJA 1WXBA 3VRYA 4RTTA 2EYYA 2RQUA 4OMNA 2P4RA 4DEYA 1W6XA 4AG2C 5IBMA 1TG0A 2LZ6B 1QCFA 1CKAA 1CSZA 1P13A 3TKZA 1I1JA 2DVJA 2ROLA 1UE9A 2RQTA 2M51A 1SRMA 4F59A 5ECAA 1D4WA 1X27A 2ROTA 2YDLA 2XP1A 5AXIA 2CBLA 4FBNA 2ABLA 2LX7A 1TZEE 1AWJA 5GJVB 1JEGA 2CH4W 1O4BA 2PNBA 3EG3A 2CDTA 4GWFA 2H46E 4XZ1A 2DRMA 1NEBA 1PKSA 2FO0A 2DILA 2HDAA 2EGEA 3NMZC 1HCSB 1NLPC 1JWOA 1RQQC 2CI8A 1AVZC 5FWCA 5EELA 3UYOA 4RUGA 1KA7A 4JEGA 1ZX6A 1SPSA 4OHHA 2EBPA 2LJ1A 3PLFB 1A1BA 2KRMA 2L0AA 4P9VA 1O4GA 1LCKA 2AOBA 3A98A 4LUEA 2J7IA 1GCQC 1BHFA 5IBSA 2LNHB 2E5KA 1HD3A 2DBKA 1AOTF 1WFWA 2C0IA 1WX6A 1AYAA 1UHFA 1UUEA 2KT1A 2O88A 2CI9A 4RTVA 2DNUA 1ABOA 1HCTB 3H0HA 2CSIA 4LUDA 4P9ZA 4L1BB 4U17A 2DL3A 2DL8A 1O4RA 1ZUYA 2BTTA 1B47A 1LUKA 1K0SA 4F5AA 1E6HA 1JYQA 5DC4A 4GPLB 5GJIA 1O4EA 1KSWA 1RPYA 5EEQA 3VROA 4F5BA 1NG2A 2D1XA 2X3WD 2EYVA 5CDWA 2Y3AB 2DA9A 3GXXA 2ECZA 1X69A 3HHMB 1UG1A 2AKKA 1UUSA 4D8DA 1CSYA 2K3BA 3FJ5A 2OQ1A 5AULA 1T3LA 4AG1C 1O43A 1R1QA 4OMQA 1A07A 5KAZA 2FPEA 3REAB 1FYNA 1ZLMA 2YT6A 3CBLA 2JTEA 2RN8A 1KA6A 1R1SA 5I11A 2F2WA 3S8OA 2LJ0A 2JM9A 3OB2B 3NGPA 1PHTA 2KNOA 2O31A 1ZUUA 2D8JA 2DX0A 4FL3A 1QWEA 4A4CA 2L4KA 1LUNA 5FWBA 3QWYA 1O42A 2YUOA 1LKKA 1EFNA 2F2VA 4RTZA 3UF4A 3ZL7C 4OMOA 1BKMA 2L3TA 1RLQC 2W10A 1O4FA 2CR4A 1GFCA 1AYBA 2V1RA 1M61A 1BBZA 1O48A 2MRJA 3ULRB 1JO8A 1NYGA 2KGTA 1D4TA 2YU7A 2RORA 2AUGA 1OO3A 1MW4A 1JQQA 1A81A 2KR3A 1KC2A 3OP0A 1JYUA 2L3PA 1FU5A 1ABQA 1KIKA 1BU1A 1SRLA 1W1FA 2QDLA 2A37A 1FMKA 3RBBB 2BBUA 4LE9A 3OB1B 4OMMA 2DF6A 1QKWA 2VWFA 1A0NB 2RQVA 1QKXA 2LP5A 1AWXA 2OAWA 4NWGA 1M3CA 3M0SA 4ORZA 3REBB 1KJWA 2PTKA 4FSSA 1AZEA 1O4MA 2YSQA 1TUDA 2GSBA 2DCRA 2HEQA 3VRZA 4LNPA 2PZ1A 4X6SA 1O4CA 1K0XA 2HUWA 1NZLA 2O2OA 1BFJA 1UECA 1JU5A 1O4IA 1YVLA 3R6NA 3EG2A 1WLPB 4JJDA 3TSWA 1SHBA 1WYXA 3VS1A 3N8MA 1VYUA 2GNCA 2AKLA 3TSZA 5DF6A 2HMHA 2EL8A 2AOAA 1PRMC 2EYWA 3C0CA 1AYCA 2LNXA 5IXFA 1X2KA 3PFVA 2LJ3A 1H9OA 3CWGA 2HDVA 3BUXB 3I9QA 4XZ0A 4EY0A 5D0JA 1O4KA 1UGVA 2EPDA 2L6KA 1OEBA 3VS4A 2RF0A 4H1OA 4E93A 2CSQA 1UHCA 4ESRA 4GBQA 4K2RA 4TZIA 3PJPA 2EO6A 4F14A 3GQIB 2XMFA 1LCJA 1X2QA 2PNAA 1T3SA 1Y0MA 1GBQA 2OI3A 1RLPC 5IH2A 2DYBA 2C9WA 1BHHB 2AK5A 1M8MA 3VS2A 1H92A 3SEMA 1M3AA 3WA4A 1BLJA 1YVHA 1QLYA 4AFQC 3BUMB 2KEAA 4J9EA 3MXYA 1YNZA 2J6FA 2RMOA 1JU5C 4KRTA 1PICA 2A28A 2DLYA 2K7AB 2D8HA 2GBQA 3PSJA 3VS0A 4E68A 1U3OA 5I22A 1A08A 3M0PA 4HVWA 4OHIA 2JYQA 2HSPA 4CC7A 1M30A 1U5SA 2GGRA 2DE0X 1MV3A 1BKLA 1OV3A 2RQWA 1YCSB 2EGAA 4OHLA 1JXMA 1K76A 3O5ZA 2HCKA 2BZ8A 3PVLA 4J9BA 2J06A 4AFSC 5L23A 2DBMA 2LCTA 2CUDA 4R0KA 1BF5A 2EOBA 1D1ZA 2EO3A 2BZYA 2IIMA 4M4ZA 4Z88A 3M0QA 1GRIA 2JW4A 1YWOA 4FL2A 2LQNA 1I07A 3MAZA 1UTIA 3QWXX 2G6FX 1O41A 2OJ2A 2KXCA 1TCEA 4WCIA 2MC1A 1RUWA 2L3SA 3VS3A 1SEMA 1O45A 3BUOB 4H34A 4ROJA 3EGUA 1YN8A 3KFVA 1M27C 2DL5A 3UA6A 1X6BA 1OO4A 3BKBA 3BUNB 3OV1A 3H41A 1H3HA 2MIOA 2X3XD 3N7YA 1FYRA 2EVRA 2L2PA 1LUIA 4DEXA 2IUIA 2PLDA 3C7IA 1JXOA 4J9DA 2CRHA 1I3ZA 4HVUA 3K2MA 3EHRA 1BLKA 1H8KA 2EGCA 3GBQA 2PLEA 2FPFA 1O4JA 1FBZA 1UURA 2CREA 1JYRA 5EHPA 3M0TA 1LKLA 3VRQA 1B3QA 2JS0A 3M0RA 5J3XA 3US4A 1KFZA 2RVFA 1A09A 2SEMA 1X6GA 1O4OA 2SHPA 3CQTA 2DRKA 2JMCA 1ZUKA 1AOJA 1T0JA 2B86A 2NUZA 2KYBA 1BM2A 4AFZC 2B3OA 1NZVA 1CSKA 1I0CA 1WA7A 3I5RA 2CH4A 4RTYA 3EHQA 2DL4A 1SHGA 3VGOA 4ZNXA 1HSQA 2ESWA 4J9FA 2O9SA 3JV3A 2FCIA 1WDXA 4K11A 1O47A 3VRPA 1Z9ZA 5EC7A 1BFIA 2YUPA 1FHSA 2CIAA 3IN7A 3M7FA 1ZSGA 2KRSA 1BHHA 3VS7A 1NEGA 1F2FA 3TVTA 2EU0A 1E6GA 2DLZA 2MCNA 1WI7A 1SHDA 3NHNA 1ARKA 2BZXA 2CT4A 2EKHA 3IQLA 4JGHA 2C0OA 1IO6A 1SHAA 4A63B 2YUNA 5EG3B 2LNWA 1X0NA 3U23A 1PRLC 2KROA 1PWTA 1QWFA 2K7AA 2EYXA 2IZVA 1AZGB 1AWWA 1RI9A 2AZSA 2KK6A 2MOXA 5HKWA 1MV0B 5DC0B 1A1AA 2VKNA 1U06A 1J3TA 1T0HA 2Y1NA 5DC9A 2DX1A 2K79B 1S1NA 2K9GA 3THKA 4HCKA 1IJRA 4OHDA 1GHUA 2O9VA 3LH5A 4CC3A 4Z8AA 2ED1A 2ENMA 4NWFA 1O44A 4Y92A 1NYFA 5IHIA 4HXJA 1Z3KA 3GXWA 4K45A 2LQWA 1K4US 2KE9A 2FEIA 4GLMA 1PNJA 1OPKA 2DJQA 2DM1A 4AFUC 3IMDA 2W0ZA 2OZOA 1NRVA 1BG1A 1O4HA 3UATA 1R1PA 2FRWA 1XA6A 1Y1UA 4IIMA 4J9IA 4K44A 1K9AA 1M27A 1V1CA 2CUBA 2ECDA 2EKXA 2EYZA 4J9GA 5IHKA 3PS5A 1OOTA 1WXUA 4JZ4A 1AEYA 2NWMA 1BB9A 1MUZA 2H8HA 1NM7A 1K1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2SRCA 2O4XB 2H5KA 3VRRA 1YI2T 2GTOA 3DB3A 2D9TA 2QAZA 3I56T 4OHEA 3EG0A 3VU3C 3JCMe 3VRNA 4D8KA 3S8LA 1AWOA 1ZHIA 4FYVB 4XQ3A 2GTJA 4QT7A 2GE9A 1UGQB 3JSCA 4E7LA 5FU7C 3CCLQ 1YI2A 2FYKA 3KBGA 1BMBA 3I56A 2RPNA 2CS0A 1QVFA 2DTIA 3S3MA 4KUDK 2E41A 4M7DA 4M77D 4X1VA 4PJOD 3N84A 1SPRA 3H0FA 1B34A 1I5LA 1RJAA 2YSXA 5GJHA 3RIRA 4B9WA 3JCMd 1HK9A 5IN1A 1YHQA 4A4BA 4JJBA 1TWBA 3G71Q 4J5YA 5I6VA 5AT1B 1H3ZA 2I0NA 2D6FA 4ZGEB 2JXBA 3CEYA 1D1AA 1WHGA 1SF9A 1IHVA 2JT4A 3R6OA 3CD3A 3CXLA 5GANh 1RAIB 4FT2A 1RAGB 3ASKA 1Y07A 3BE3A 3CMAQ 3BUWB 2FRYA 3UA7A 5HCKA 3MJXA 2ETZA 3PVQA 3E9GA 1QVGP 2RNAA 1WQWA 3CXCP 3EG1A 3EAZA 4E6RA 1MGQA 3NPFA 1X6CA 1VQOQ 1PKTA 1RAAB 2JVVA 5LJ5f 1AT1B 1W70A 1YJNT 3MXCA 2ATCB 2E3IA 2D0QB 3IMJA 2RHZA 2XI9A 4F17A 2VXEA 1CKBA 1G2BA 4CRIA 2JS2A 3T04A 2M02A 1GCPA 3ZNIA 2HQXA 5BO4A 4JJCA 4M7DG 2CP0A 1YJNA 5DLOA 1SKUB 1SHFA 4GL9E 4YTLA 1I4K1 2AZVA 2O4XA 2FG0A 1NJIR 4M7DE 2QI2A 3J7AF 1WXBA 2CP5A 4RTTA 2EYYA 1PD0A 4J6WA 2V26A 2Y90A 2P4RA 4DEYA 4LDXA 1W6XA 1P13A 3TKZA 1G3YA 1UE9A 2RQTA 1SRMA 4F59A 1D4WA 4PFZA 1QVGS 2H3EB 3CXCS 4M78B 4J6YA 5GJVB 1JEGA 3L2RA 3KUFA 3EG3A 4M78C 3PT9A 4XZ1A 3OS5A 5KE2A 1JWOA 2EGEA 3NMZC 2LQKA 1BIBA 3TCJA 4JEGA 2XDBA 3S3OA 2LJ1A 4XU0A 1A1BA 3TU4K 2KRMA 1RAEB 3G6ET 4C8QG 1LCKA 4KGZB 2J7IA 3OYAA 1V76A 1YJNQ 2IG0A 4F04B 3OYFA 4C8QE 1WFWA 3HHTB 1WX6A 1UHFA 2O88A 1K9MR 1ABOA 3HFNA 5LJ3f 3CD6T 1ZQ1A 2CSIA 2KMTA 4P9ZA 4U17A 2DL8A 2BTTA 3O8VA 1JYQA 2XICA 4OB3B 3G6EA 5GJIA 1KSWA 3CCQQ 4V2SA 4PK4A 2DA9A 2DYIA 1TS9A 4IUUA 3DLLA 3GXXA 1VQPT 1UGPB 1VQ8Q 1UG1A 2AKKA 1UUSA 3JCMV 3FJ5A 4D6WA 5GAN7 3HSBA 2OQ1A 4AG1C 1R1QA 3OBYA 5GAMh 2DZ9A 1KA6A 2RN8A 4X9CA 4TVRA 3NGPA 1PHTA 1QCNA 2KNOA 1VQPA 3FC3A 4EMKB 2L4KA 4A4CA 2DD4A 4QQGA 2P0QA 1LKKA 1K9MC 4EMKC 4OMOA 2VUBA 1AYBA 4MMLA 2NUPB 2KGTA 4AT1B 4OP0A 1N8RR 1W2BA 2YU7A 3MPUB 3SFMA 2AUGA 2RORA 1JQQA 3WVDB 6AT1B 1WJQA 4M78A 2RHXA 2OX7A 5LJ3j 1KC2A 4LDUA 1BI2A 3JCMh 2VC8A 7AT1B 2QA4T 1W1FA 2QDLA 3CD6Q 1FMKA 2BBUA 4LE9A 1QKWA 1QKXA 2LP5A 4NWGA 3OS0A 3REBB 4C5EA 3CBOA 3PMIA 3VYGA 3OYGA 1K73R 2ZGWA 3HRSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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