4M4ZA

Sh3 and sh2 domains of human src-like adaptor protein 2 (slap2)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
158
structure length
152
Chain Sequence
TAVALGSFPLSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Src-like adaptor protein 2 reveals close association of SH3 and SH2 domains through beta-sheet formation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Src-like-adapter 2
total genus 36
structure length 152
sequence length 158
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 4m4zA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4m4zA02
2OZOA 2GTJA 2JT4A 1U5SA 3SHWA 1LUIA 2AZVA 4K11A 4F5AA 2MOXA 1O4GA 3TL0A 2JW4A 1UGVA 3IQLA 1O48A 1GHUA 4DGXA 1TCEA 2DLPA 2ED1A 1LUMA 1WFWA 2EQIA 1O4CA 3IMDA 3S8NA 2DBMA 5EC7A 2IZVA 1R1PA 3VRRA 1KJWA 1KA6A 4A4BA 1UURA 1ZUYA 4AG2C 1FYRA 4P9VA 2LNXA 2K79B 1BBZA 3NHNA 1A07A 1E7OA 5HKYA 4LN2A 2J6FA 2HUWA 2ROLA 4ESRA 1UUSA 2RQVA 1KFZA 1BFJA 3EG0A 2KEAA 2X3WD 5DC0B 3I5RA 1TUDA 2AUGA 4FL2A 2A36A 4JGHA 4JZ4A 2AZSA 1M3BA 1PNJA 1FMKA 3CQTA 4OHEA 2RNAA 2CBLA 1BKLA 2MK2A 2DX0A 1AWXA 1GBQA 1BF5A 2DYBA 4JJBA 4ROJA 1NZVA 2JMAA 1YWOA 3C7IA 1MV0B 4CC2A 3GBQA 1LUNA 3BUNB 2KT1A 1JEGA 3US4A 1O4OA 3OB1B 5EHRA 1BKMA 1O4DA 1X43A 2PZ1A 1OOTA 2YDLA 1M3AA 3C0CA 2MIOA 5I6VA 2FO0A 1CKAA 1ZX6A 3GXWA 4JE4A 1W1FA 2LJ3A 1T3SA 1H9OA 2IUGA 5IH2A 3HCKA 1FBVA 1K76A 3VRQA 2IIMA 3MAZA 1O4MA 1VYUA 1HJDA 1O4QA 2I0NA 2RQTA 3QWXX 2RQUA 1UDLA 3PE0A 2EBPA 5GJWB 1ZFPE 2FG0A 1ZLMA 2GNCA 1BG1A 1D4TA 2CS0A 1AYBA 4RTUA 3VS3A 1LCJA 3CBLA 2KROA 4F14A 1IO6A 1WYXA 4XZ1A 3H41A 2H5KA 1TZEE 3M0PA 1NLPC 2C0IA 5L23A 3BUMB 5AXIA 1JU5A 2CI8A 1JYQA 1YNZA 2LMJA 1X2QA 2EYXA 4F59A 4L1BB 3VRZA 2KRSA 2EYZA 2LP5A 1U3OA 2ROTA 1FBZA 2GTOA 3BUWB 1FU6A 1A1AA 5I11A 1Z3KA 2EPDA 4OMQA 1O4PA 3CD3A 2SEMA 1H92A 3EG1A 2EL8A 1UECA 4D8KA 4J9FA 1M3CA 1H8KA 1M61A 2A37A 1UJ0A 3H0HA 3I35A 3I5SA 1ABQA 3KFVA 1CWEA 1JWOA 1K0SA 1BLKA 4HVWA 1RPYA 2DCRA 2X3XD 1AVZC 2K79A 1IS0A 3M7FA 4OHLA 2L3QA 1O47A 3A98A 2CDTA 3VS2A 3VRYA 1SHFA 4RUGA 2O88A 5GJIA 1K4US 1PICA 1YN8A 1OPKA 2DM1A 1BMBA 2RVFA 3UATA 1V1CA 1ZUKA 2SRCA 3KFJA 2YUQA 4QSYA 3UA6A 3IMJA 2J6OA 2B86A 1J3TA 2DE0X 1AYCA 3TKZA 1WXTA 2BTTA 3REAB 1T3LA 2DLZA 2YSXA 4OMNA 1SPRA 1X6CA 3MXCA 2FPDA 4P9ZA 5KAZA 3VGOA 1GRIA 1HSQA 1CJ1A 2DL5A 1NEBA 2DX1A 5ECAA 1X27A 2LJ0A 3UF4A 1E6GA 2CSQA 2L0AA 2MRKA 2AKKA 2DL7A 4X6SA 2DMOA 1I07A 2JTEA 3VRPA 2NWMA 1O44A 2FPEA 2YUOA 1A0NB 2EKXA 4J9HA 1O4JA 2L2PA 1VYTA 3NPFA 2IUHA 4E68A 3SEMA 1MV3A 1AWOA 1M27A 3FJ5A 3BUXB 1LKLA 2H8HA 2DLYA 1T0HA 2C0OA 3OB2B 2L3SA 3CXLA 4HCKA 3VS4A 1X69A 2DNUA 2EW3A 3QWYA 1JQQA 1MUZA 2VKNA 4JPBW 3IN7A 1T0JA 1PKTA 1NG2A 1Y0MA 1WLPB 1I0CA 2BZYA 3N7YA 4ZNXA 2MCNA 3WA4A 2NUZA 2CUBA 3EG3A 1UG1A 5IBMA 2ECDA 1U06A 1I1JA 2AK5A 3EGUA 1AYAA 1WQUA 2OAWA 4K45A 4D8DA 2J05A 2H46E 4EY0A 1Z9QA 3JV3A 4GBQA 4LUEA 4H34A 2CSIA 2DRKA 1H3HA 1YVHA 4OHHA 1BFIA 1K9AA 3S8LA 1UFFA 1VA7A 2CH4W 2CR4A 2JM8A 3HHMB 2KBTA 1Z9ZA 1HD3A 4AFSC 1NRVA 1GCQC 3UYOA 2MQIA 4A4CA 1X2KA 1PRMC 2PNIA 4J9BA 1ZSGA 2DVJA 2J6KA 5FWCA 5EHPA 2ENMA 1RI9A 2RPNA 2YU7A 1BHHB 2Y3AB 3NGPA 1A81A 3BUOB 4RTXA 4J9EA 4LUDA 2DILA 2KYMA 4OMMA 2OQ1A 1NYGA 1O4BA 2P4RA 2CI9A 3VS7A 1AEYA 1A1CA 1LKKA 1QCFA 3PQZA 3M0QA 1OV3A 2GQIA 1G2BA 2HEQA 4CC3A 2XP1A 5IHKA 1A08A 1NM7A 3M0RA 5GJVB 4U1PA 2O31A 1PWTA 2EYVA 2KRNA 3LH5A 1QLYA 4AFQC 2YUNA 3U23A 2EGCA 1MILA 1R1QA 1YVLA 5I22A 3RNJA 3EACA 2ED0A 1UHCA 2MC1A 1WXBA 1SRMA 4J9IA 2PTKA 2KK6A 1MW4A 2W0ZA 1O4AA 3REBB 1O4HA 1RUWA 1IJRA 2KXCA 3K2MA 4DEXA 2V1QA 2KGTA 4HVUA 4JZ3A 3R6NA 1K1ZA 2CT4A 2FRWA 2RORA 2PLEA 1K0XA 1YCSB 3THKA 1JO8A 2HDXA 3VS6A 2J7IA 4WCIA 2ESWA 1S1NA 3T04A 1AOUF 2L6KA 2PNBA 2HBWA 2RQRA 1A1BA 4AG1C 2YSQA 1TG0A 1ARKA 2HMHA 4FSSA 1N5ZA 1QKXA 4H1OA 2XMFA 1PRLC 1O49A 2L3PA 2RMXA 1KA7A 4TZIA 1E6HA 2KE9A 2D0NA 1A1EA 1F2FA 1SHBA 2Y1MA 3NMZC 2FEIA 2FPFA 2AKLA 2VVKA 4F16A 3PVLA 5IHNA 3ZL7C 2YT6A 5DC4A 2JS2A 3OV1A 2SHPA 1PKSA 1WX6A 5FWBA 3PSKA 4DGPA 2W10A 5IHIA 1Y1UA 5EG3B 4Z88A 1O4RA 1O46A 2CRHA 1AD5A 2K9GA 2K3BA 1SPSA 1NEGA 3I9QA 2GGRA 1YWPA 4F17A 2ABLA 2MRJA 1HCSB 2JXBA 1O4FA 1FHSA 2JS0A 1BHHA 2G6FX 2KRMA 5FW9A 1OO3A 4NWFA 1NLOC 1P13A 4EIHA 2EO3A 5IXFA 1CSYA 3N84A 4RTZA 2M0YA 1OPLA 1OO4A 4GPLB 3PVQA 1O4IA 5GJHA 1ABOA 1XOVA 2RF0A 2ETZA 1AWJA 2EYYA 4F5BA 2L4KA 2DF6A 2J06A 2V1RA 4A63B 1Y57A 4XZ0A 1GBRA 1SRLA 2LCSA 2BBUA 2CIAA 2LNHB 3TSWA 1CSKA 2JYQA 1TUCA 2KNBB 3N8MA 2DA9A 2DM0A 2KXDA 1JYUA 2F2VA 2DRMA 2Y1NA 1W70A 4DEYA 1D1ZA 2HDVA 2QDLA 2LQNA 1FYNA 1GCPA 1JXMA 1SKJA 2K2MA 4CC4B 2JM9A 3BKBA 2O2OA 1CWDL 3PS5A 1B47A 4Z8AA 5BO4A 2DL4A 3CWGA 3VS1A 1VYVA 1KC2A 4RTYA 2D1XA 3VS5A 3VROA 2CH4A 5HKZA 1SEMA 1JYRA 2FCIA 1KSWA 5AULA 2O9VA 1BU1A 4K44A 1UUEA 1WXUA 1ZUUA 2CREA 3M0SA 1AB2A 5IBSA 1R1SA 5EEQA 2LQWA 1O45A 1QG1E 2EGAA 1B3QA 1O43A 2C0TA 1O4LA 2RQWA 1UHFA 1QKWA 1BM2A 1PHTA 1RLPC 1QWEA 1SHAA 5HKWA 2KYBA 1OEBA 4CC7A 1UJYA 1LCKA 1GFDA 2LJ1A 3EHRA 4LE9A 1FU5A 2AOAA 3S9KA 2AOBA 2A28A 1B07A 4J9GA 2K7AA 3H0IA 1W6XA 4JEGA 1O41A 2LX7A 1QWFA 4E93A 3VRNA 1SHGA 1UE9A 1WA7A 2HDAA 1O4KA 1JU5C 1WI7A 1GCQA 2QMSA 4FL3A 2KNOA 2PNAA 2EVRA 4HXJA 2DBKA 1SHDA 1YP5A 2JMCA 2C9WA 4LNPA 4OMLA 3GXXA 1SSHA 3TSZA 2VWFA 4Y92A 2EO6A 1AOTF 2RMOA 4IIOA 1UTIA 3RBBB 1NYFA 1WDXA 1F1WA 1WIEA 2O9SA 3VS0A 2M51A 2E5KA 2YUPA 1GL5A 1AYDA 2PLDA 2F2WA 1XA6A 2EOBA 2KT8A 5J3XA 3OVEA 2DL3A 1RQQC 1G83A 4EIKA 1M8MA 3UA7A 2CUDA 4ORZA 1NZLA 1LUKA 1O42A 2K6DA 1JXOA 2HCKA 5IXBA 1X6GA 2GBQA 2B3OA 4J9DA 4OHIA 1CSZA 2GE9A 2LCTA 3GQIB 2KR3A 2RN8A 5DC9A 4E6RA 3EG2A 3ULRB 4HVVA 1AZEA 4OMOA 2LNWA 1RJAA 1X6BA 1I3ZA 1QADA 4QT7A 4Z89A 2L3TA 1GFCA 2D8HA 3TVTA 4KRTA 1O4NA 2FRYA 4GL9E 4J9CA 5D0JA 3EHQA 1BB9A 2EU0A 5DF6A 1KIKA 4FBNA 3PJPA 2K7AB 2EYWA 1X0NA 4M4ZA 1AZGB 1D4WA 4IIMA 1BHFA 4GWFA 3S8OA 1HCTB 2BZXA 2HSPA 4JJCA 3M0UA 3M0TA 2VIFA 3PLFB 4OHDA 2A08A 1O4EA 1A09A 2DJQA 2LZ6B 2ECZA 1CKBA 4AFUC 1M30A 4GLMA 4U17A 3O5ZA 3ZNIA 4RTWA 1ZBJA 3MXYA 4X1VA 2EGEA 5HCKA 1M27C 2DL8A 3OP0A 2D8JA 4K2RA 1AOJA 2OJ2A 2F2XA 3H0FA 1RLQC 5CDWA 4AFZC 4WWQA 4RTTA 2EKHA 4JJDA 2RSYA 1AWWA 5EELA 2BZ8A 2GSBA 2IUIA 4OMPA 2CT3A 2OI3A 1BLJA 1BK2A 4NWGA 1EFNA 4R0KA 4RTVA 1SPKA 3PSJA 3IN8A 3EAZA 3HIZB 3PFVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JCMV 3DLLA 1WJSA 3QG1A 4K11A 3JB9G 1YFNA 2MOXA 3JCMQ 4XK8E 5D6YA 3CCJT 1O48A 2HZYA 3CC2Q 4DGXA 5KYWB 1WQWA 3IMDA 3S8NA 1VQOQ 4M7AD 5EC7A 1WHMA 2IZVA 1R1PA 4E7LA 1FYRA 4P9VA 2K79B 3NHNA 1A07A 1E7OA 1QCOA 1VQ9A 5GANh 2HUWA 2ROLA 4ESRA 1UUSA 2RQVA 1KFZA 5DC0B 2BE9B 3TQ7P 3INZA 5FU6C 2WSEE 2VXFA 3EGXB 3CCVQ 1PNJA 1G8XA 2DX0A 5GAOn 4JJBA 4ROJA 2P84A 1VQNT 2RI5A 3Q1JA 2KT1A 8ATCB 1JEGA 5GMKm 4QVZA 2MIOA 2MI6A 5HY6A 1MMAA 2DIGA 1FBVA 1K76A 1Q81U 3OYCA 2QA4Q 1AHJB 2MMPA 3QZ5B 3MEVA 1PD0A 1O4QA 1VQ4Q 5LL6S 1N8RR 3LYIA 3CCRA 3HFNA 4A4EA 4A4HA 1ZLMA 2GNCA 4RTUA 2QTVA 3VS3A 1IO6A 1HK9A 3M57A 2RJDA 2CI8A 1JYQA 1I5LA 1RADB 2L5QA 5CIUA 4M7DF 3VRZA 2EYZA 2LP5A 1PM3A 3M4YA 3OYAA 1FU6A 2LCLA 4PJMA 5I11A 1I81A 3CCMA 2SEMA 1H92A 1R0BG 2LDMA 3I5SA 2DAQA 3KFVA 1YITA 4JDSA 2X3XD 1AVZC 3F70A 3TU4K 1KG1A 3VS2A 2NLUA 4ANJA 4RUGA 5GJIA 1K4US 1SG5A 2E10A 1YJNQ 1OU8A 1FXXA 2LNVA 4LDUA 3L2VA 4FCYA 3I56Q 4PFZA 3PT9A 4F7UB 4C8QB 1JB0E 3K2TA 5CQYA 1XQHA 4C92F 2BTTA 3REAB 1SSFA 4ZGJB 2HAXA 4P9ZA 3VGOA 1GRIA 1HSQA 4PL6A 2DL5A 2AIRB 3JB9D 4L59A 3OS5A 5ECAA 3JCMb 1E6GA 4CI0C 4X6SA 2DMOA 3VRPA 2NWMA 2FPEA 2YUOA 4J9HA 1NZ9A 1WGSA 1VYTA 4BI8B 1MV3A 4NL2A 4E7JA 4RMOA 1M27A 4KULA 1TWBA 3BUXB 2DLYA 3G4ST 1M5Q1 2L3SA 4HCKA 2QAZA 2EW3A 4PLLA 4FW1A 1N6AA 1T0JA 1M1FA 1Y0MA 4DBQA 2ZPEB 2YRCA 4ZNXA 1VQ6A 2K3YA 4EMKA 2NUZA 2CUBA 2XICA 1UG1A 1YCYA 3EG3A 3RMQA 2CP0A 3EGUA 1KHIA 4K45A 3HFOA 1YHQT 2H46E 2BUDA 4EY0A 3JV3A 3A8HB 4LUEA 5A0GA 2DRKA 5C6SA 3S8LA 1UFFA 1WQ7A 2CH4W 4A53A 2JM8A 2KI7A 3CC2T 5GANf 5LJ5j 1KQ1A 2MQIA 2RH2A 5GMKi 1PRMC 4C92D 2PUKB 4RG8A 3D7SB 2J6KA 3FRNA 3OA6A 1K9MU 1RI9A 1BHHB 3VJPA 3CXCA 3CCEA 1A81A 4RKUE 3BUOB 4J9EA 3LGLA 1D0XA 1NYGA 5CO7A 1O4BA 2P4RA 1QVGP 3CCVT 1VQMQ 3VS7A 1Q7YU 3S6WA 2HD0A 1VQPQ 2XP1A 6AT1B 1A08A 1VQ8A 3GNGA 5GJVB 4N4GA 4J5YA 2EGCA 1YVLA 4FU6A 4BI4A 1ZSZB 5GAMf 3EACA 4XU0A 3ZBDA 4M78E 1ZQ1A 5GAN8 1VQLQ 1BIBA 3SDZA 3E2UA 2HL3A 3EH2A 3CMEQ 4ELYC 1IJRA 4FYXB 2E70A 3K2MA 4DEXA 2HSEB 2V1QA 3R6NA 1M1GA 2PLEA 1YCSB 2HDXA 4GLKA 1S1NA 3DLMA 3T04A 4M7AE 3DB4A 4M75B 1TU0B 2ZGWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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