2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
1NG3A 4UDRA 1PBFA 3D8XA 2R4EA 1IUTA 2GVCA 2GV8A 3GYIA 4YTNA 3CGBA 3DJGX 3UP5A 3AEAA 3ATRA 4EMWA 3AD8B 3F8DA 5LV9A 2BA9A 4ZN0A 3E1TA 5J7XA 3UOZA 2WP5A 2YG6A 2GAHB 4H4YA 4GR1A 2C70A 2YLTA 4EIQA 1L9DA 1O5WA 3EAOA 3QFAA 4C5OA 2IVEA 2JB2A 4GF7A 1GETA 4C3XA 1E1LA 2OLOA 2V3BA 4GDEA 1DOEA 4U2LA 1F3PA 3AEEA 3UOXA 2X8CA 3SQPA 3AE6A 2Y6RA 1KSSA 2C3CA 4J36A 3NT6A 4P9SA 3H4KA 2YLSA 3ICTA 1LQTA 3BI5A 3H8LA 1GEUA 3KA7A 1GRAA 3P1WA 3Q6JA 4J57A 4TM1A 2WDVA 4B66A 2BK5A 4JN9A 5U63A 1O94A 2C73A 3AE2A 3HZLA 2BABA 2BK4A 5GRTA 3CNTA 2Q0KA 3K7QX 2X99A 4B65A 5JCIA 4GRTA 4YKFA 3GYJA 3L1RA 4CCQA 4JY2A 2HQMA 2B76A 2I0ZA 4H7UA 3RP7A 1PDHA 1TDEA 2FJAA 3GD3A 5U1OA 2XLPA 1EL7A 2E1MA 2WBAA 1IUWA 5KWFA 5HXIA 2QCUA 3PVCA 4A7AA 3QSMA 1TDNA 3FG2P 4YKGA 1PXAA 4J31A 2XFQA 1EBDA 3AYIA 5EB4A 2ARDA 4I59A 2BC0A 3UCLA 4A99A 4ECHA 4H4RA 1MO9A 2Y6QA 4GCMA 2AR8A 4H4VA 1D4CA 1FL2A 1KF6A 3ADAB 1FEBA 2YR4A 4BURA 4EM3A 1BF3A 1H84A 3NGCX 1GT8A 3KU9A 2PYXA 2JBVA 3ICRA 1GTHA 2JB1A 2V61A 1XDIA 1DNCA 4H4SA 4YSZA 1IJHA 1E6EA 1BGJA 4Z26A 2YM1A 3LADA 3QVPA 2BXRA 4CY6A 1BKWA 3AEDA 3IF9A 4OPTA 4XXGA 2WHDA 4K2XA 1REOA 4H2NA 4ZCDA 2QA2A 5ER0A 1CC4A 2GRTA 2FJEA 2WQYA 2WP9A 1GV4A 2BCPA 3AEBA 4HB9A 1B37A 1F8WA 2VVMA 1YQ3A 2WDQA 2YG3A 2RGOA 3VR8A 1OJ9A 5CKUA 2NPXA 4EQWA 2CULA 4EQRA 4Y4NA 4U2TA 1TDFA 2EQ7A 4UDQA 2XLUA 2XVHA 1TYPA 3RHAA 1LJ1A 2YG7A 5IPYA 2GR3A 4M52A 1UKVG 3FIMB 3NKSA 4OPLA 2APGA 4A6NA 1H7XA 3BNMA 2C3DA 4TM4A 1V59A 3F8PA 1TDOA 1D5TA 1PBDA 3NN0X 2JKCA 1YKJA 4BK1A 3GWFA 3NYFA 5EBKA 3EPTA 2WP6A 4OCGA 1EL8A 1E1NA 2OALA 3V3OA 5JCLA 1DOCA 3UOYA 3NTDA 3IWAA 1COYA 4KX6A 4APNA 4EQSA 2BXSA 1AOGA 1NHRA 2F5ZA 2V6OA 3LZWA 2R46A 4FK1C 3L8KA 1Z6LA 3M0OA 1CF3A 2GR1A 2QA1A 1B5QA 3CNJA 2CVJA 3WE0A 1RYIA 2BS3A 2GMHA 1NHQA 5M0ZA 3ALJA 2EQ9A 5C3JA 4TM0A 4DSGA 2YLXA 2WPCA 3UKKA 2NVKX 3UTGA 4H2RA 1GSNA 4J34A 3CGDA 2R45A 2Z5XA 3ALMA 5BVAA 1PXBA 1XANA 3H8IA 1IUXA 1FEAA 1ZP0A 1BWCA 3KVEA 2ACZA 3UKAA 1ZOYA 3OC4A 1SEZA 1N4UA 2BACA 2Z5YA 4U2SA 2R0PA 4U8KA 2H89A 4TM3A 3B6DA 2YG4A 4BJZA 1F8RA 1JRZA 3PO7A 3QFBA 2C67A 1LVLA 3EANA 4H4TA 4K22A 2GR2A 1M64A 3DGHA 3P9UA 3NRNA 4YWOA 5KRQA 3VRAA 2EQ6A 2C76A 2A89A 2VQ7A 2XFPA 3UP4A 4IVOB 1B8SA 1GERA 2YVGA 4BJYA 4X4JA 1LPFA 1Y56A 2Q6UA 1H86A 1VDCA 1VQWA 4DSHA 3VQRA 1DXLA 3BNUA 3P4RA 4X9MA 3SFEA 4JNQA 1JNRA 1Q1WA 4GUVA 4B67A 1H83A 1F8SA 3ICSA 3M13A 4C77A 3AD7B 2X50A 4A79A 1OJAA 4PABA 4U8PA 2XYOA 4RG3A 4J33A 1GRFA 1ZK7A 2GAGB 2GEWA 1GESA 3KKJA 1JRXA 2YLWA 4H4WA 3O0HA 3QVRA 2GR0A 3DMEA 1EL9A 3GMCA 2WS3A 4USQA 3P4PA 1M6IA 3F8RA 3C4AA 2JAEA 1IUUA 3ZYXA 4LA1A 1DJQA 4A65A 1PBCA 1TYTA 3LXDA 3CPIG 3ZDNA 4IA5A 1XPQA 2GF3A 4YSXA 2B7RA 1NEKA 2VRMA 3NN6X 3FPZA 1CJ2A 4TLXA 4U8OA 4O5UA 4CCRA 2A87A 1CC6A 4OPIA 4A5LA 4D04A 1LV0A 4JQ9A 3DJEA 4JNAA 3NYEA 2XLRA 3OZ2A 1JOAA 4REKA 4RSLA 1L0VA 2RGHA 1K0LA 1PS9A 3SM8A 4CY8A 3UKQA 4A6NB 4A9WA 2R4JA 4JDRA 1N4WA 1PJ7A 3NH3X 5TR3A 1P2EA 1D4DA 1HYUA 2X8HA 4K5RA 4XWRA 5L46A 4EMIA 2ZZ0A 1S2QA 4EM4A 1D4EA 2Q0LA 3GSIA 1OJCA 2BS4A 4OPUA 2ZBWA 2FBWA 5HY5A 4YSYA 1OJDA 4U8NA 4NTCA 3VRDB 2XVJA 4Z43A 1JU2A 3KPFA 1ZDLA 3BI2A 3V3NA 1KNRA 4H50A 2BYBA 4LU6A 2VQBA 5JCNA 2XVIA 2WOIA 4Z25A 4X9NA 4CRTA 2RGJA 4YXDA 1DOBA 1PN0A 1E39A 1F6MA 3P4SA 3G5RA 4ICYA 2OAMA 3GWDA 1RSGA 3REDA 4NEVA 1YY5A 3NLCA 2IVDA 4YTMA 3GDNA 4BK3A 4H4PA 4AP3A 4LIIA 2QAEA 4B69A 3DJJA 1GTEA 3KLJA 4KPRA 5FMHA 3UTEA 2C64A 1YQ4A 3ISHA 5HHFA 5KVHA 2V5ZA 2DKHA 1GREA 2XLSA 3KD9A 3D1CA 4OVIA 3RNMA 3UOVA 3K30A 4EMJA 3ABVA 2PHHA 4IV9A 4JY3A 2YR6A 1DJNA 3GRTA 1ZMDA 1ELIA 3S5WA 2WPEA 2WDRA 3GMBA 1JRYA 4DGKA 2WESA 3UKFA 4IA6A 4CNJA 5IQ4A 5BUKA 3IC9A 3BI4A 2XCGA 3ATQA 4J2WA 5FS6A 2IIDA 4UDPA 5M10A 1K0IA 1CL0A 1Y56B 1H82A 2GQFA 1S3EA 2WPFA 3FBSA 3COXA 3NNEA 2RABA 4TLZA 3K7MX 1FOHA 4N9XA 4USRA 1NAAA 3NK2X 3C96A 3II4A 2YLRA 3CIRA 4NTDA 3DH9A 2FJBA 2WOVA 5IQ1A 3VRBA 3AB1A 3DK9A 4B68A 1FCDA 5HYMA 1BGNA 4RG4A 1CJCA 1E1MA 2FJDA 4UP3A 3R9UA 2AQJA 3S61A 2XFUA 2VVLG 4EQXA 3CPJG 2E5VA 3PS9A 1RP0A 4U8LA 3NTAA 2WETA 2VZ2A 4PAAA 3SFDA 3BHFA 3AE1A 5DBJA 2C72A 3URHA 1KDGA 1DODA 4H2QA 2VRLA 5BULA 2TMDA 2R9ZA 2WU5A 4AT0A 2GQWA 1ZOVA 2VOUA 4CBQA 1NDAA 2YLZA 1CC2A 1LQUA 4FDCB 3CNDA 1GNDA 1ONFA 1IUSA 1TRBA 2UZZA 2VVLA 3AEGA 2EQ8A 4H4UA 2X8GA 3EF6A 4U8MA 2JK6A 3I3LA 4C3YA 1FECA 3BHKA 3CPHG 1K0JA 4OPGA 3NIXA 3UKHA 5CQFA 1YQZA 3QSEA 2GMJA 2V3AA 5C2TA 1CJ3A 1E1KA 1PBEA 1LTXR 2YAUA 3AYLA 1GOSA 5KOXA 3RP6A 4Z2UA 3FMWA 2YWLA 3CTYA 5U25A 1GRBA 3CNPA 5JCKA 3AD9B 2C66A 3QJ4A 5JCMA 5FS9A 4BV6A 4DNAA 4H4XA 1KSUA 4YT0A 2CDUA 2XVFA 1QJDA 3UKPA 2OLNA 4B1BA 2XVEA 1NG4A 1NHSA 3B3RA 4AOSA 3M12A 2J3NA 3DJDA 4K8DA 4NZHA 3NK0X 4AOXA 1ZY8A 1P2HA 5EB5A 2XFNA 3CNSA 1GRTA 5FS7A 1Q9IA 4OPDA 2BCGG 1QLBA 1ZMCA 2YVJA 1D7LA 3Q9TA 1L9EA 1PBBA 2XLTA 5EOWA 1W4XA 4D03A 4AP1A 3C4NA 4H2PA 4HA6A 1OJTA 3AWIA 3UKLA 4YSHA 1GRGA 3AYJA 4EIPA 2JB3A 2A8XA 2CFYA 3AECA 5GSNA 5KOWA 4K5SA 1H7WA 4Z44A 5KXJA 4ZCCA 3NK1X 1S3BA 2ZZCA 3G5SA 3GDPA 1CJ4A 5BRTA 3LOVA 4FK1A 2R0GA 1TDKA 3AE9A 4E0VA 2XFOA 4U8JA 4WX1A 1NHPA 1VG0A 3K7TA 4GDPA 3VR9A 1GRHA 3QSSA 4NTEA 3ALLA 3DGZA 4IVMB 5FS8A 1D7YA 4WCTA 1Q1RA 1N4VA 4CNKA 1PHHA 1S2YA 1JNZA 4YTPA 2GB0A 2GH5A 3AE4A 2O9ZA 3I6DA 1MOKA 2R0CA 1GALA 1B4VA 2E4GA 4Z24A 1PJ5A 2TPRA 4O5QA 1ZX9A 3UTHA 3NHOX 2YG5A 1JEHA 1EL5A 2AAQA 3DA1A 1KNPA 2C75A 1X31B 1ZKQA 2X3NA 1PXCA 4H4QA 4C74A 2V60A 2BK3A 1GXFA 1NENA 1KFYA 4H4ZA 4J56A 3SGLA 2YM2A 1L9CA 2B9YA 2C7GA 3P4QA 3AEFA 1CBOA 4Z2TA 1H6VA 3T37A 3DK8A 5J60A 3AE8A 3LJPA 2YQUA 2WOWA 3IHGA 1IUVA 1N1PA 4XWZA 1MXTA 4B64A 3CN8A 3CGEA 2DKIA 3AE5A 4OPCA 1O95A 3NG7X 3LZXA 3AXBA 2WU2A 4BK2A 1VRQB 4I58A 2YR5A 3DK4A 3V76A 5KVIA 1E7PA 1QO8A 3RP8A 3IHMA 2XDOA 4Y4MA 3ITJA 4NEWA 4Y4LA 2B9WA 2Q7VA 2ZZBA 2BC1A 2WEUA 4U8IA 3AE7A 1Y0PA 1NPXA 4FX9A 4ADWA 3AE3A 4MJWA 4Z2RA 3CGCA 4K7ZA 2BS2A 2C65A 1H81A 4B63A 1BZLA 1PJ6A 1VG9A 1K4QA 2YVFA 3JSKA 3GRSA 3LB8A 3NYCA 2W0HA 2B7SA 2OA1A 3G5QA 2B9XA 3UTFA 4AT2A 3GD4A 1GPEA 1XHCA 1CHUA 2H88A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PGTA 2REMA 4UDRA 4XRDA 2CV4A 12GSA 4G9HA 1A23A 5HFIA 3GYIA 4N30A 1V9WA 5HFKA 3RDWA 1B9YC 4EMWA 2BA9A 2WP5A 1FAAA 4GR1A 3LWAA 5IO2A 4EIQA 2VUPA 2ZUPA 3EAOA 2OLOA 4TN8A 4GDEA 1DOEA 4KE3A 3APQA 3UOXA 2H8LA 2Y6RA 1K0CA 2OE3A 3BI5A 1GEUA 3KA7A 3P1WA 4J57A 4B66A 3F4TA 2FWHA 3TDGA 2BK4A 3KCMA 5JCIA 2HRAA 4TRXA 3GSTA 3GYJA 4CCQA 4JY2A 2HQMA 3HZ8A 1OC9B 2A4VA 2E48A 3ZRDA 1VF4A 4AJ8A 4POLA 4ZL9A 1HNBA 1F2EA 2KLXA 5EB4A 2ARDA 3WGTA 1MO9A 2AB6A 2AR8A 1DBYA 3ADAB 2YR4A 3U5RE 4EM3A 4K7OA 1A0RP 3GKXA 5J4UA 3ERGA 2JB1A 1DNCA 2CA8A 3T14A 4YSZA 1E6EA 1BGJA 2DJJA 3HKRA 2ON7A 4A5PA 3DXBA 4IBPA 19GSA 5GZZB 2DJ1A 2VM2A 3IK9A 3QFAC 3ZIVA 2C3TA 4GF0A 1CC4A 1GH2A 2A2PA 3H8QA 1SL2B 1TJDA 1GV4A 2RUEA 1F8WA 2DC5A 2VCZA 2BJXA 2WDQA 4I97A 2IJYA 2YG3A 1OJ9A 3TB2A 4FO5A 3TKRA 3FZ5A 4UDQA 2C80A 4L8EA 3SWLA 2IMIA 2E49A 4G73A 4M52A 5F05A 3NKSA 1Y6EA 3H79A 2APGA 1H7XA 3WYWA 1VGLA 4TM4A 1V59A 1S3AA 1ZL9A 1D5TA 4BK1A 4V1Ag 1YKJA 3GWFA 1QXHA 5EBKA 3EPTA 3I69A 3QAWA 3IV4A 2FY6A 1BX9A 4YJFB 3UOYA 3FR3A 3IWAA 4J57E 4KUNA 2YOIA 3FHKA 5HR1A 2F5ZA 3T2YA 4RQXA 3LZWA 1HNCA 3KD0A 3L8KA 4ECBA 2GR1A 5G5EA 1RYIA 4TXOB 2WPCA 1XPVA 2LNSA 1PN9A 5BVAA 2C8UA 3ALMA 1O8WA 2MYGA 1FEAA 2MBTA 1BWCA 1PKWA 3W6GA 3KVEA 2YJ7A 2ACZA 5ECSA 3GYXA 2R0PA 4U8KA 3B6DA 1AW9A 1K3LA 5EY6A 1JRZA 3HCZA 2EIQA 3PR8A 1GSDA 1XZOA 2C67A 4GQFA 2CX3A 2IPAA 2DMMA 1HD2A 4KW6A 4HSCX 1M64A 3UOMA 2E82A 3GKKA 1VE9A 4TR1A 4G6GA 3MWHA 1LPFA 4KNDA 1NW2A 1Y56A 1H86A 1VDCA 3FR9A 2KUCA 3ZTLA 5DJMA 5ECLB 3BNUA 5ECRB 1T4ZA 2BRAA 2PVQA 1KTEA 4NV2A 2Z9SA 2ZNMA 4I5QA 2H66A 3U6VA 4TR0A 3CTFA 2YLWA 4H4WA 5ECMB 3GMCA 1WJKA 3PPUA 3C4AA 1GTUA 17GSA 1AC1A 3ZYXA 1B9XC 13GSA 3DEXA 1DJQA 4II3A 4A65A 1PBCA 1TYTA 2CAQA 1NM3A 3ZDNA 2VRMA 4MJEA 4TLXA 4CCRA 3W8SA 4OPIA 4A5LA 4G19A 1Z5YE 2QSIA 3JCML 2GQLA 3NYEA 4RSLA 4QQ7A 3UKQA 3SM8A 4A6NB 3NOFA 1PS9A 2VLVA 3SZCA 2R4JA 1C0PA 1N4WA 3NH3X 4ML6A 1P2EA 1M9AA 2GZPA 4QL9A 1D4DA 2G2QA 1S2QA 1D4EA 3EU3A 1VF3A 2L6DA 2BS4A 2VD0A 4K6XA 4K8MA 2ZBWA 3C1RA 4PQHA 2VOCA 3NIVA 2F51A 2C0EA 4KDXA 1M0UA 1PQNA 3BI2A 3V3NA 4H50A 4LU6A 5JCNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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