2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
2I0ZA 4U2TA 1PBDA 1VQWA 2IIDA 2GMHA 2JAEA 4H2PA 2APGA 3UOZA 1DOCA 4Z44A 4Z2RA 1KFYA 1IJHA 4JNQA 4Y4NA 4YXDA 2XLSA 3AE8A 1GERA 2A8XA 2C65A 4B69A 5TR3A 4JN9A 1H81A 4KX6A 4TM4A 4WCTA 3DA1A 3QSSA 4RSLA 2GQFA 4USQA 4E0VA 2C3DA 3AYIA 3GDPA 3IF9A 1GRGA 3ADAB 4J34A 4ECHA 2BXRA 3DK9A 2XVHA 5HYMA 1DODA 1VG9A 2XFUA 2YR5A 1B8SA 2GV8A 4FDCB 1N4UA 4LIIA 1PDHA 4GDEA 3I3LA 4EMJA 4LA1A 5BRTA 2C76A 1PXAA 1GALA 2W0HA 3C96A 3DH9A 3B6DA 2QAEA 3QVRA 1JOAA 4B66A 1E39A 1F3PA 1KDGA 2R9ZA 1JRXA 2NVKX 5FS6A 2E5VA 2A87A 2BK4A 1ONFA 3DGHA 3QJ4A 3UOXA 1TYPA 1GRAA 1SEZA 4OPTA 1E1LA 1EL8A 4I59A 3AB1A 4I58A 2FJAA 3P1WA 4J56A 1H86A 2AAQA 1K0LA 1YQ3A 4DGKA 4DSGA 1NDAA 5HXIA 1Y56B 2YAUA 4OPUA 3UCLA 3H4KA 4N9XA 1NHPA 2QCUA 1IUSA 2WBAA 3AEGA 3F8PA 3GSIA 2WOIA 2XFPA 3CPJG 3S61A 1L9EA 4YSXA 2CVJA 4YWOA 4Z2TA 1NG4A 2BK5A 1Q1WA 4NEWA 1O95A 2EQ7A 2WP9A 4PAAA 5M0ZA 2B9XA 3IHMA 1PBBA 1XDIA 2HQMA 4H4WA 5HY5A 3CPIG 4EMWA 1CC4A 1BZLA 2GR3A 2RABA 4HB9A 3V3OA 2OLNA 1FOHA 1OJDA 1L9CA 2GAHB 2IVEA 4H4XA 1AOGA 3NNEA 4BV6A 2R46A 4IA6A 1S2YA 1YQ4A 1YQZA 3GD3A 2YG4A 3LJPA 1TRBA 2Q0KA 3AD8B 2O9ZA 3IC9A 1D7YA 3AEDA 3CGCA 1PS9A 4H4SA 3ATQA 3AE9A 4U8MA 2AR8A 5JCKA 1EL9A 1W4XA 3AYJA 1L0VA 4BJYA 4A65A 3ATRA 1ZP0A 1B37A 3RNMA 1YY5A 2XCGA 1H84A 5L46A 3SFDA 3AD9B 1H6VA 1H83A 2YLXA 4GR1A 3UKLA 1KSSA 1PN0A 4TM0A 2WP5A 3VR9A 4H4YA 3VQRA 5KRQA 1NHQA 5KVHA 1BGJA 2XFQA 1PHHA 2C7GA 4OPLA 1OJ9A 3UTFA 4AT2A 2WPCA 1REOA 1Q9IA 1GSNA 1XANA 2YVFA 3P4RA 4H7UA 4U8JA 4UDPA 4BK1A 3F8DA 2WU2A 3ITJA 2V3AA 1TDNA 4U8NA 1BGNA 3L8KA 3K7MX 4UDQA 5EOWA 4ZCDA 1PXBA 2C64A 3LB8A 5CQFA 3SM8A 4H2RA 4JY3A 3G5SA 3P4QA 4YKFA 4NEVA 1DOEA 1DNCA 3VRBA 3AEEA 2WEUA 1S3BA 1ZK7A 2CULA 3C4NA 3GYIA 3KVEA 3RP7A 4NTDA 4B64A 3UTHA 3ZYXA 1S2QA 2CDUA 3CPHG 1IUWA 3ICSA 3K7TA 3AE3A 1N4VA 1GRFA 4NTCA 4TLXA 1QO8A 1KF6A 5U63A 2YLSA 1K4QA 1PBEA 2JK6A 4H4TA 3VR8A 1JEHA 2RGOA 4Y4LA 4GUVA 2BCPA 4RG4A 5FMHA 4C3XA 2UZZA 1PBCA 2BS4A 1OJCA 1H82A 1GPEA 1NHRA 1DOBA 3NRNA 2XYOA 4B63A 2JKCA 2FJBA 2XVEA 1GTHA 3LZXA 3BI5A 5EB4A 3P4PA 5DBJA 4GDPA 2VOUA 3CNDA 3GWDA 4EQWA 1PXCA 2BABA 2OLOA 2R45A 2GF3A 3K7QX 4U2LA 4RG3A 4U8IA 3CIRA 2QA1A 2OAMA 5EB5A 2ZBWA 3S5WA 2NPXA 4IA5A 1GTEA 1TDOA 4A5LA 2WESA 4H4QA 5KOXA 4EM3A 1VDCA 2VRLA 4Z2UA 3JSKA 3QSMA 4CBQA 1IUVA 3COXA 1LVLA 3EAOA 2YWLA 1P2EA 3PO7A 1RP0A 1CJCA 3NN6X 1LTXR 3ALJA 4B1BA 2YM2A 3KPFA 3H8LA 1NG3A 4WX1A 2GH5A 4JQ9A 2BC0A 2FJDA 3RP6A 1NPXA 2YG3A 3NK2X 2VVMA 3C4AA 3KU9A 1NENA 2E4GA 2GMJA 2XLPA 1PBFA 2YLRA 3AE6A 3AWIA 3BHFA 4K7ZA 2WETA 4XWZA 3EPTA 3H8IA 1GRTA 2XLRA 1L9DA 3UKPA 4FK1C 3SGLA 3UKQA 2BYBA 1JNRA 2V5ZA 2WP6A 4AOXA 1CF3A 1ELIA 3AEAA 4YTMA 3CN8A 4Z25A 4JNAA 1IUTA 4X9MA 3UKAA 4BK2A 4A99A 4H4PA 2R0PA 4REKA 4APNA 2XDOA 1D5TA 2C73A 4K22A 1JNZA 2GRTA 2YR4A 2X3NA 2R0GA 2RGHA 5JCNA 4TLZA 1BKWA 4X4JA 4ZCCA 4P9SA 2GR0A 4D04A 1K0IA 1LV0A 4CNJA 4USRA 3ICRA 1QLBA 1MXTA 1S3EA 2BC1A 2XFNA 1YKJA 3UP5A 4C5OA 2YVGA 3DJJA 2RGJA 3G5RA 2V61A 2BXSA 3LADA 4JDRA 4OPCA 4YKGA 5KXJA 4UDRA 4EQRA 1LQUA 2GB0A 3NLCA 5J60A 2JB1A 3CNJA 2TPRA 1K0JA 3P9UA 2WHDA 3FIMB 3AXBA 3NGCX 3DK4A 1MO9A 2WDRA 4NTEA 1GXFA 2B7RA 2GQWA 2Z5YA 2VQBA 5J7XA 3FBSA 2C75A 3KLJA 3T37A 2Q0LA 5EBKA 3V3NA 1PJ6A 5U1OA 1KNPA 4AP1A 2VQ7A 2R4EA 3UOVA 2XLUA 4MJWA 4ICYA 4BK3A 3IHGA 1TDEA 2B76A 2BK3A 2X8HA 3UOYA 2YG6A 1LJ1A 3KD9A 3SQPA 5FS7A 4OPDA 2E1MA 4ZN0A 2BS3A 5JCLA 1Z6LA 4BJZA 1E1MA 1F6MA 1KNRA 3UTGA 3URHA 1GETA 2B9WA 3M12A 1Y0PA 3DMEA 2WS3A 4K5RA 3NK0X 2FJEA 4EMIA 2BACA 1O5WA 2XVFA 4EQXA 1GRBA 3CNTA 3OC4A 2JBVA 1FECA 3EF6A 2V6OA 3AEFA 3Q9TA 1P2HA 1MOKA 2EQ6A 2VVLA 4OPGA 4J31A 4XXGA 5BVAA 4EM4A 4LU6A 4IVMB 4U2SA 3CNSA 3GDNA 4AP3A 4YSZA 4Z43A 2VVLG 4EIPA 2AQJA 3VRDB 1D4DA 1RYIA 5IPYA 3GRTA 3QVPA 4FK1A 2PHHA 1ZMDA 1CJ2A 2XLTA 3V76A 1DJQA 5GRTA 4ADWA 4BURA 5M10A 5KOWA 2F5ZA 3IWAA 1H7WA 3R9UA 1GT8A 3DJGX 4YTPA 1GREA 3RHAA 2GR1A 4K8DA 2FBWA 4CCRA 2C67A 2YVJA 2ZZBA 1GV4A 3LXDA 1H7XA 2BA9A 4IV9A 1TDFA 3AE5A 4X9NA 1D7LA 3VRAA 1EL5A 1VRQB 4H2NA 3GMBA 1COYA 4YSYA 3CGEA 5CKUA 2X8GA 2GVCA 4UP3A 4OPIA 4U8KA 3CTYA 3NYCA 2Y6QA 2ZZ0A 5C2TA 3AE4A 3E1TA 4B65A 1FCDA 1NEKA 3I6DA 3NYEA 3BNMA 3NH3X 1TYTA 5ER0A 5GSNA 1JU2A 2X8CA 3AECA 4HA6A 5JCMA 4B68A 5KWFA 1M64A 1N1PA 2B9YA 3NTDA 2H88A 2WOWA 4PABA 1GRHA 4TM1A 3WE0A 2Q6UA 1D4EA 4H4RA 5IQ1A 3L1RA 3M0OA 4JY2A 3AE2A 3PS9A 3RP8A 3PVCA 2CFYA 3UTEA 2GAGB 2Q7VA 3QSEA 4GCMA 2DKIA 2TMDA 1LQTA 1ZX9A 1DJNA 2OA1A 1JRYA 2YLWA 3DGZA 1GNDA 3AEBA 4EQSA 2R4JA 1ZMCA 2A89A 3ZDNA 1FL2A 2J3NA 2V60A 3BNUA 3AE7A 3AYLA 3F8RA 3GMCA 4H2QA 2BCGG 3KKJA 4AT0A 5HHFA 2YQUA 1LPFA 4A6NA 3NYFA 1E1KA 4CNKA 4U8PA 2V3BA 4K2XA 1M6IA 3DJEA 4A9WA 1FEAA 3UP4A 4IVOB 2QA2A 1BF3A 4OCGA 3M13A 4H4UA 4NZHA 4FX9A 1XPQA 3II4A 1OJTA 4C3YA 1D4CA 2WU5A 3UKKA 3SFEA 4DNAA 4H4VA 1ZOYA 1GESA 2WDVA 3QFAA 3UKHA 1ZY8A 3ABVA 2YLTA 3LZWA 4CRTA 1E1NA 3GYJA 3CGBA 3REDA 3FG2P 1ZKQA 1Q1RA 4M52A 2IVDA 5C3JA 3NKSA 1NAAA 3D1CA 3NHOX 2C3CA 1FEBA 3GRSA 4KPRA 4Y4MA 4Z26A 5IQ4A 1N4WA 4AOSA 1CHUA 4U8LA 4EIQA 5U25A 1OJAA 5FS9A 3KA7A 4J57A 4J36A 1UKVG 1CC2A 2H89A 3HZLA 2X99A 2B7SA 4O5QA 4A79A 1E6EA 4YTNA 3BHKA 3NN0X 1HYUA 4U8OA 3ALMA 2PYXA 1GOSA 3EANA 4H50A 3B3RA 2ARDA 4B67A 2GR2A 4CY6A 2Z5XA 2XVJA 3P4SA 1IUUA 1F8RA 2WPEA 3DK8A 4CCQA 1EBDA 2WPFA 3BI2A 2VZ2A 5FS8A 2XFOA 4GF7A 3AE1A 2YR6A 3NK1X 4YSHA 2C66A 1VG0A 3GD4A 1F8SA 1NHSA 1TDKA 2WOVA 3O0HA 4O5UA 1EL7A 1IUXA 1B4VA 4GRTA 1RSGA 4XWRA 1QJDA 3OZ2A 3UKFA 3FPZA 3NT6A 2YLZA 4TM3A 3K30A 4J2WA 5BULA 3ISHA 3ALLA 2JB2A 3NG7X 4Z24A 4A7AA 1V59A 4K5SA 1B5QA 1Y56A 4CY8A 2JB3A 1ZDLA 1CBOA 1DXLA 2OALA 3CNPA 3D8XA 4YT0A 1CJ4A 2R0CA 2ACZA 3BI4A 3NIXA 3AD7B 2ZZCA 1PJ5A 2Y6RA 3NTAA 1XHCA 5BUKA 1GEUA 4H4ZA 4DSHA 2C70A 4D03A 5JCIA 3G5QA 5LV9A 2YG5A 1BWCA 3ICTA 1CC6A 2GEWA 2YG7A 3GWFA 4OVIA 1X31B 4C74A 3Q6JA 2EQ8A 1CJ3A 2C72A 5KVIA 1JRZA 3CGDA 4J33A 3FMWA 1F8WA 2YM1A 4A6NB 2XVIA 3LOVA 3QFBA 4C77A 2VRMA 3DJDA 1O94A 2X50A 2DKHA 1CL0A 1E7PA 2WDQA 2BS2A 1ZOVA 2WQYA 1KSUA 2EQ9A 1PJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W4VA 3VWUA 1VQWA 3E3EA 4U2TA 3O3TA 3M9JA 1DOCA 4YQVA 4Z44A 3UOZA 2JSZA 2R6KA 4BWSA 5GAND 2IFQA 1WE0A 2OE1A 4YAVA 1PN9A 1QK8A 3F6FA 5ECPB 5TR3A 2FNOA 2DJ2A 4WCTA 1H81A 3DA1A 3QSSA 1EP8A 4USQA 5G1LA 2C3DA 1JHBA 4D73B 3I9V2 5HYMA 4LL1B 1WOUA 1B8SA 1KNGA 3I3LA 3P90A 4QFCA 4BVXB 2H6XA 2R2JA 1PXAA 22GSA 4HJMA 2K8SA 3APOA 2QAEA 2RIIA 1F3PA 4G74A 3CTGA 2MZCA 2PERA 3WT2A 2BK4A 1ONFA 4GLTA 2F8FA 2LKUA 5DQYA 4HQZA 5JCUA 3GX0A 4EC0A 4F03A 1KEBA 1E1LA 4I59A 4FIWA 3KH7A 1K0LA 2GLRA 1A2LA 1XWGA 5IO0A 3VWWA 2VLVA 2X64A 4EDZA 1XFLA 1IUSA 5KMPA 1LU4A 1SL1B 2K6VA 2YZHA 4YWOA 2EIQA 4GSNA 4NEWA 2EQ7A 1FB6A 1MD3A 1VF4A 5DBQA 2B9XA 4XS1A 4HI7A 1A24A 4HB9A 2OLNA 3SZFA 1L9CA 4AF2A 3NNEA 3TKPA 3SBCA 1YQ4A 2IIYA 2KUCA 2I3YA 3G7JA 3EMXA 2JADA 1DE2A 4I2TA 1SD9A 3GMFA 4FH8A 2XHFA 2VL2A 1QFNA 1UC7A 1SKWB 1B37A 4OFMA 1YY5A 1K3OA 2DLXA 1H84A 1MDIA 2WB9A 2YLXA 3UKLA 1PN0A 2WP5A 3SZCA 5IPHA 1NHQA 2XFQA 2H1BA 2DMMA 3HZ4A 4AT2A 2R5GA 5BMUA 1REOA 4ZIJA 4H7UA 3FZ4A 4U8JA 3A2XA 1TP9A 4KH7A 2WU2A 3ITJA 2V3AA 4POKA 4U8NA 4KDYA 3L8KA 5INYA 5IMZA 4HSCX 3WD6A 1C0PA 1ZK7A 4KNDA 4IJIA 4TR0A 9GSSA 1DSBA 3ZLPA 2E2MA 3E0UA 4NTDA 1S2QA 5CP1A 2CAIA 4AGSA 1IUWA 1GLPA 4TLXA 3I43A 3AE3A 1K0MA 3VR8A 1A2MA 2RGOA 2DU8A 1OJCA 1XOBA 2AUVA 2FJBA 1GTHA 2YWOA 1B48A 2VOUA 3FR9A 4U8IA 3W4KA 2AB6A 3K7QX 4RG3A 5EB5A 3DIEA 2NPXA 4IA5A 3WYWA 5B8BA 1GTEA 4A5LA 5KOXA 2DJ0A 1VDCA 1M2BA 3JSKA 3QSMA 1F6MC 4CBQA 1ERVA 6GSYA 1IUVA 2HSMA 4Q5FA 5G2ZA 1LVLA 1DAOA 3T0KA 2CVDA 1CJCA 1LTXR 1B8XA 4KW6A 3ALJA 5ENUA 4B1BA 4GQFA 2YM2A 3WGTA 1JLWA 3L78A 4WX1A 2GH5A 4JQ9A 3GH6A 3RP6A 1Z6NA 4MP4A 3LXTA 1EZKA 1NENA 2GMJA 3BHFA 3CSJA 1S3RA 3AE6A 3H8IA 2C4JA 4FK1C 3SGLA 1GTUA 4HOJA 2VCVA 2V5ZA 2WP6A 3UVHA 3GSSA 3AEAA 3N9JA 3D22A 1IUTA 3UKAA 1XW9A 2JZTA 4I5QA 4X1UA 4BK2A 2M72A 4TR4A 2LTKA 4A99A 1S3DA 2R0PA 4H4PA 1K0CA 3ISOA 4K22A 2GRTA 2PN8A 1BKWA 1K3LA 2A2PA 4X4JA 4RI6A 1PKWA 3HVXA 5ECSA 2GR0A 4D04A 1ON4A 1AQXA 4CNJA 3IOSA 1YKJA 4CW9A 2H66A 3IC8A 2V61A 2BXSA 3RPNA 3C1RA 1YJ6A 4UDRA 2B7JA 1LQUA 1JLVA 3CNJA 2IMFA 4WETA 5IO2A 3P9UA 4Q5RA 1PRXA 4YJFB 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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