2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords RebC
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
4DSGA 5EB5A 4YT0A 4EQSA 4OPUA 1GALA 1N1PA 1OJTA 1PBEA 3ITJA 4LU6A 3CGBA 2YG3A 1GTEA 3M12A 4EQXA 4MJWA 4DNAA 2NPXA 3AWIA 4J36A 2C64A 3LJPA 3K7TA 2APGA 4YSZA 3ADAB 2V60A 1L9EA 1D7LA 3DMEA 3ALJA 1LVLA 3NN6X 4KPRA 4FK1C 3ABVA 2BK5A 3P9UA 4I59A 2XFUA 2DKHA 1JRXA 1NPXA 5JCLA 2OLNA 2YLRA 3BI5A 1B5QA 4GUVA 1H81A 1H83A 3D8XA 2Q0KA 3GD4A 2X3NA 5BRTA 4B64A 3IHMA 1N4WA 2GMJA 2R45A 4NTEA 2C67A 1FL2A 4O5QA 3C96A 2GH5A 4BK2A 5IQ4A 3UTEA 3ZYXA 2XLUA 2C66A 1B8SA 2YG6A 1KDGA 4RG4A 1CHUA 2Y6RA 1CJCA 4H50A 2BS3A 3AEBA 3ICTA 1M64A 3SFEA 3UKLA 4AT2A 4OPIA 4OPGA 4Z26A 3DJJA 4CY8A 3UKFA 2IVEA 3AE6A 2XFQA 2XVFA 4RG3A 3BI2A 3ICSA 2C7GA 3AEDA 4NEVA 5EOWA 1GESA 2BA9A 3P4PA 3SFDA 1KSSA 3Q9TA 4U8KA 2C73A 3BNUA 2JK6A 4CCQA 1BWCA 2BCGG 2CDUA 2GMHA 3NHOX 2B9WA 2VQBA 5GSNA 3SGLA 4YSXA 4U8OA 2BC0A 2BC1A 4CRTA 2ZBWA 2IIDA 1GRFA 2C72A 3CPJG 2X8CA 4H4ZA 4IV9A 4UDRA 2IVDA 4YSYA 1CC2A 2WP9A 5BUKA 1IUXA 1GETA 3GYIA 1IUUA 1K0JA 1TDFA 3GRSA 1OJCA 2RGOA 5M10A 2RABA 2X50A 4K5RA 3VQRA 3KU9A 2XVIA 4OCGA 1DOCA 2WOIA 4C3XA 1L9CA 3HZLA 3RP8A 2XLPA 1E1LA 3ICRA 5ER0A 4C77A 4YXDA 2ARDA 3IWAA 3DJEA 4DGKA 3RHAA 1Y56A 5FS7A 1KF6A 5CKUA 1B37A 3REDA 1RYIA 4XWZA 3AEFA 3NNEA 3P4SA 1PHHA 1NDAA 5U1OA 3FPZA 1LQTA 2R0GA 2BYBA 4U8LA 4DSHA 4U8NA 1TYTA 2OA1A 2FJDA 1MXTA 2XLRA 1CC4A 3DH9A 1GRAA 1XDIA 1H7XA 1NAAA 1F8WA 2GR0A 5M0ZA 1TDOA 3NT6A 4OPTA 4XXGA 4Z24A 2QA1A 2YR5A 1PJ5A 2YG7A 1L9DA 3GWDA 4U2LA 1BKWA 3F8RA 3C4NA 4AOSA 4EMWA 5LV9A 5KOXA 3DA1A 1GNDA 2UZZA 3FIMB 3P4RA 3GWFA 1H7WA 4NTCA 4U8JA 1PN0A 5KWFA 1VG0A 4J33A 1GXFA 2PHHA 3GSIA 4EQWA 3O0HA 3PS9A 1FCDA 2GAGB 1H82A 2AQJA 3FG2P 3KD9A 4JN9A 4EIQA 2GB0A 5HY5A 1F6MA 3II4A 2XVHA 1E1NA 3NYFA 3QVPA 1BF3A 2VZ2A 1FEAA 3DJGX 3RP7A 3UOYA 1DXLA 1OJDA 4FDCB 4U2TA 5KXJA 2YLTA 3GMBA 5KOWA 4EQRA 2JB3A 3M13A 4H4WA 3IHGA 5J7XA 3UTHA 2GR3A 3AXBA 4X9MA 4JQ9A 1P2EA 4A7AA 4X9NA 2WDVA 2YG4A 2ACZA 1VDCA 2YLZA 2BK3A 3Q6JA 2WDRA 3UKAA 1JNRA 2ZZCA 2O9ZA 1ZX9A 3RNMA 2GRTA 1B4VA 3FMWA 1FECA 1UKVG 4UDQA 1Q1WA 1S3BA 4H4YA 3RP6A 4B65A 4CBQA 3KLJA 3S5WA 1X31B 3CN8A 3QSMA 4D04A 2GQFA 3COXA 3NYCA 1DOBA 2BS2A 2BABA 4JY2A 3UP4A 3NK1X 4TLXA 3AE7A 3AEAA 2C3DA 2QAEA 2B7SA 1D4EA 3AE3A 3B6DA 1E1KA 2JKCA 1D4DA 5JCNA 2C3CA 3AYIA 1TRBA 2A8XA 1GRGA 4H4UA 2Y6QA 4H2RA 4NTDA 3V3NA 1F8SA 1KNRA 1GRTA 4TM3A 4Z25A 2WDQA 3UKHA 2WP5A 4A65A 1GPEA 1GREA 5IPYA 4AT0A 5JCMA 2BXRA 1NEKA 2TMDA 2XLSA 2YWLA 2C75A 3R9UA 4LA1A 4BK3A 1DJQA 2Z5XA 4BK1A 2VQ7A 3BHFA 2FJAA 4EIPA 5IQ1A 3DGZA 3UKQA 3D1CA 4UDPA 2XYOA 3EAOA 1H84A 4REKA 4XWRA 5HXIA 3H8LA 5BULA 2JBVA 1PJ7A 3SM8A 3LADA 1COYA 4J31A 1KSUA 3CGDA 4EMIA 2ZZBA 2EQ8A 3GYJA 1LV0A 1AOGA 1PS9A 2DKIA 1CC6A 3EF6A 1GRBA 1D7YA 4JNAA 4YWOA 3VRBA 3DGHA 3KA7A 1QJDA 1Z6LA 3UOVA 1ZP0A 1E6EA 2EQ7A 1H86A 3NG7X 3CTYA 1M6IA 1IUVA 5JCKA 2E4GA 1O5WA 4HA6A 2V61A 3CIRA 3CNSA 3AD7B 2E1MA 4H4RA 1FOHA 2GVCA 4BURA 2Z5YA 3LZWA 4FK1A 3NH3X 4YKFA 5KVHA 5J60A 4JY3A 2TPRA 2YR4A 4IVMB 2ZZ0A 1OJ9A 3PVCA 4K8DA 4H4TA 4TM1A 1E39A 3ATQA 4YTPA 1GT8A 3NYEA 2I0ZA 3E1TA 1GRHA 2V3BA 3QFBA 4PABA 3B3RA 3QJ4A 3CNDA 4H4PA 4ICYA 4B63A 3GD3A 4YKGA 2YLSA 1ZKQA 3F8PA 3AE2A 2B7RA 1JRZA 1JNZA 1BGNA 1JEHA 2AAQA 2CULA 1MOKA 2J3NA 3AEEA 3AE4A 4N9XA 1YQZA 3M0OA 2X8GA 2WU2A 3CGEA 3G5QA 4D03A 3UKKA 3EANA 2YVJA 3IC9A 2C76A 1GOSA 2PYXA 2R9ZA 2XFPA 1VQWA 1ZMCA 3AE1A 4ECHA 1GEUA 5HHFA 3V3OA 1ZMDA 2X99A 2XFOA 2XVJA 1S2QA 2FBWA 2EQ9A 2XFNA 1ZDLA 3KPFA 1P2HA 2RGHA 1PBFA 1MO9A 3AD9B 3BHKA 3K30A 3L1RA 3DK9A 4OVIA 3T37A 1IUSA 1XPQA 2GV8A 4TM4A 1DODA 2GF3A 1TDEA 1ELIA 1JU2A 2A89A 1LJ1A 2C65A 4B67A 2Q0LA 3L8KA 4WCTA 4USQA 4GRTA 3ALMA 2RGJA 4YTMA 2WPCA 1EL7A 2EQ6A 2VVMA 2WU5A 4X4JA 1NHRA 1GSNA 4K5SA 3QSEA 3IF9A 2B9XA 3G5SA 1IUTA 1KNPA 2YG5A 1N4UA 1VG9A 5C2TA 1GTHA 2E5VA 1ONFA 4Y4NA 1CL0A 1YQ4A 4O5UA 4U8MA 3GRTA 4K22A 2GR2A 3UTGA 3ALLA 1DJNA 5C3JA 2BS4A 4GDEA 2JB2A 4Z2TA 1LTXR 3OC4A 1ZK7A 2V6OA 2VVLA 1IJHA 1O94A 5TR3A 1ZOYA 3ZDNA 2GQWA 1ZY8A 4OPLA 5EBKA 4H4VA 2WOWA 4Y4LA 2R0CA 5FS8A 1NHQA 3NTDA 1F8RA 2WP6A 4YSHA 4C5OA 1RP0A 3NKSA 3UKPA 3KVEA 4EMJA 5L46A 3AE8A 1CJ4A 4K2XA 1CBOA 1JOAA 1NG3A 1VRQB 3CNJA 3DJDA 4FX9A 3DK4A 4Y4MA 3NN0X 1CJ2A 3EPTA 1PJ6A 1V59A 3CPIG 1JRYA 4EM3A 1PXAA 3GMCA 1D5TA 1XANA 3CPHG 3K7QX 1H6VA 1PBCA 2WPEA 1Q9IA 4CNJA 2JB1A 3NTAA 4Z2RA 4AOXA 5BVAA 1TDNA 4EM4A 1K4QA 4U2SA 4U8IA 2YLXA 3NK2X 2WHDA 4GF7A 4IVOB 5FS6A 1NG4A 2V3AA 4H2QA 3UP5A 3VR9A 2X8HA 2CFYA 3BNMA 2B76A 2WEUA 3LB8A 2YQUA 3NGCX 5DBJA 5FMHA 4H4QA 1TYPA 2JAEA 4PAAA 1Y0PA 3P1WA 3CNTA 3AEGA 2BCPA 4JDRA 4Z44A 1DOEA 3UOXA 2Q6UA 2BK4A 2YVFA 4H4XA 3WE0A 4C3YA 2WQYA 4NEWA 3SQPA 4UP3A 3NIXA 1CF3A 1PBDA 4C74A 3H8IA 1LPFA 4KX6A 1K0IA 3P4QA 4AP1A 5JCIA 1QO8A 1FEBA 3OZ2A 1KFYA 4TLZA 5CQFA 1HYUA 5KVIA 2WS3A 4JNQA 1Q1RA 3G5RA 4U8PA 4NZHA 2R46A 4OPCA 4BJZA 3AYLA 3VRDB 2A87A 2GR1A 3BI4A 3LXDA 1PXCA 2WPFA 1S2YA 4CCRA 4WX1A 4I58A 1Y56B 1L0VA 1RSGA 3CGCA 4IA6A 1TDKA 1W4XA 2GAHB 4GDPA 1E7PA 3URHA 5U25A 3QVRA 3PO7A 4Z2UA 2YM2A 3V76A 1NHSA 2FJEA 1N4VA 1NENA 4HB9A 2WETA 4ZN0A 2AR8A 2XDOA 3AE5A 1EBDA 1IUWA 4A9WA 4J56A 4K7ZA 2FJBA 4TM0A 4B1BA 2XCGA 3JSKA 3NLCA 1QLBA 3NK0X 1PXBA 2WBAA 3VRAA 1GERA 3H4KA 1ZOVA 2OALA 3AE9A 3CNPA 3QFAA 4H7UA 5EB4A 4A99A 4AP3A 4ZCCA 4IA5A 4YTNA 3QSSA 1SEZA 2W0HA 2YLWA 2R4EA 2B9YA 1PBBA 3LZXA 3AECA 2OAMA 2WOVA 3LOVA 4Z43A 5GRTA 1K0LA 2OLOA 2VVLG 1EL5A 2CVJA 4A6NB 4CNKA 1CJ3A 3C4AA 2YVGA 3DK8A 4J34A 4B69A 1F3PA 1PDHA 2H89A 3I6DA 4GR1A 4H2PA 4LIIA 4APNA 1DNCA 5FS9A 4GCMA 2C70A 1XHCA 4J2WA 3I3LA 1YKJA 1EL8A 2R0PA 2H88A 4E0VA 2XVEA 4H4SA 2HQMA 2YR6A 2WESA 3GDPA 4B66A 5U63A 1OJAA 3FBSA 1YY5A 2V5ZA 4ZCDA 2F5ZA 4BJYA 5KRQA 2BACA 3ISHA 2R4JA 4OPDA 4BV6A 5HYMA 4P9SA 2Q7VA 2NVKX 3UCLA 4H2NA 1BZLA 4A6NA 4B68A 4RSLA 1YQ3A 2BXSA 1GV4A 2YM1A 3KKJA 3S61A 3UTFA 3K7MX 3AB1A 4A79A 2YAUA 3AD8B 2VRMA 2VOUA 3ATRA 1BGJA 2GEWA 3AYJA 4USRA 3UOZA 3GDNA 1NHPA 2XLTA 4J57A 4ADWA 4A5LA 3VR8A 2QCUA 1O95A 3F8DA 2VRLA 2QA2A 1S3EA 1E1MA 3NRNA 4M52A 4CY6A 1LQUA 1REOA 1EL9A 1D4CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DSGA 4YT0A 4OPUA 3G7IA 1GALA 4N10A 1B9YC 4YJHB 1GTEA 4J36A 3LJPA 2APGA 4YSZA 1TU7A 3H79A 2V60A 1L9EA 3UL3A 4FK1C 3ABVA 2BK5A 3G3EA 2P5QA 2DKHA 4LLRA 1WP0A 1NPXA 2OLNA 3M9KA 1GNWA 5C04A 2FHEA 4GUVA 1H81A 4GRFA 1K0OA 1BJXA 3IHMA 2YV7A 4FO5A 1N4WA 2GMJA 2FA8A 3Q6OA 3N9JA 2PMTA 1SD8A 5IQ4A 3IAM2 2XLUA 2M80A 1B8SA 2YG6A 5DJMA 3LWAA 2CA8A 1O7UA 2Y6RA 2E0QA 1CJCA 1R4WA 2BS3A 3SFEA 2K9FA 4QQ7A 1FG4A 5J3RA 1K3OA 3DJJA 1HNAA 2P5RA 1PX7A 3AE6A 3ICSA 2C7GA 5EOWA 2YCDA 2NTOA 4AJ7A 4JE1A 3BNUA 4CCQA 2BCGG 2GMHA 1Z5YE 2GZYA 2VQBA 4ZL7A 4U8OA 2OJLA 2XPEA 3QPMA 1GRFA 4UDRA 7GSSA 3FZ4A 4NPBA 2IIYA 2C3QA 5BUKA 3RPPA 2HLSA 3NZNA 1TDFA 3FRCA 1FVKA 4C3XA 3RP8A 5ER0A 4C77A 4YXDA 4ID0A 3UBKA 4LMWA 2I9HA 2VUPA 1BAYA 1ZZYA 1GH2A 5CKUA 3REDA 1RYIA 4XWZA 3AEFA 3P4SA 1NDAA 3HA9A 3C1SA 1LQTA 1XG8A 2RUEA 2L4QA 3DH9A 1GRAA 3NIVA 3LXZA 2GSTA 5M0ZA 1TDOA 2OE3A 4DSQA 4XXGA 4Z24A 4KGIA 1NW2A 4KW6A 2E2MA 3F8RA 3C4NA 3M0FA 3WYWA 3F0IA 5J4UA 2UZZA 4NTCA 3WGXA 1VG0A 5EPFA 4EQWA 1FCDA 2GAGB 3FG2P 3KD9A 2GB0A 2GSRA 3QVPA 1BF3A 3LXTA 2NDOA 5D73A 3UOYA 1DXLA 1AIUA 4K6XA 5KXJA 4DSSB 1GULA 4GSSA 4JQ9A 5CREA 4K8MA 2WDVA 2YG4A 2CX3A 2YLZA 3Q6JA 2WDRA 4EL1A 2VCXA 4XS6A 1UA5A 6GSWA 4IW9A 2GRTA 2MBTA 5COHA 2N5AA 3FMWA 2GGTA 4H4YA 5KN0A 4B65A 3GKMA 3QAVA 3QSMA 4DSSA 4XIHA 2GQFA 1BQ7A 1JZDA 5GSSA 2HI7A 2FWEA 4I6XA 2LS5A 3NK1X 4TLXA 4G0LA 3AEAA 3ZRDA 3J7Yb 4IJ3A 2QAEA 4OFNA 2B7SA 3AE3A 1OC9A 1PD21 5ABRA 2JKCA 5JWQB 1EZKA 1DUGA 2JL4A 3P2AA 2OA7A 3TDGA 4TM3A 3IBHA 3ME8A 4MCUA 1GREA 2YWLA 1QUWA 5JWOB 3R9UA 4LA1A 4G6GA 1TK0B 2VQ7A 3Q74A 3HD5A 3EMPA 2FJAA 1Z6MA 2XYOA 3EAOA 2ON7A 4K7NA 5BULA 2E82A 2IN3A 3CRUA 1PJ7A 3SM8A 1VF4A 1KSUA 3CGDA 2ZZBA 4V1Ap 5A5KA 1AOGA 3GUSA 1D7YA 2E7PA 1QJDA 1ZP0A 2TRXA 1H86A 4X1UA 5ECNB 2LSTA 4ZB6A 1O5WA 4KCEA 5EY6A 2Z5YA 2A2RA 1BEDA 5L71A 5HR2A 1VGLA 4TR1B 2GQMA 2TPRA 4GF0A 2H73A 4NMUA 3W4JA 1TDIA 1OJ9A 4HJMA 5AISA 2L6CA 3ATQA 4YTPA 3NYEA 3ZL5A 1GT8A 3FW2A 1RW1A 4KUNA 3QFBA 4WBRD 2IMEA 2C8UA 5CP1A 3CMMA 4WBJA 2RIIA 3CTFA 3AE2A 1JEHA 3AEEA 4QFDA 1MOKA 2J3NA 5IOWA 1HNCA 2X8GA 2WU2A 3TJJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DSG A;  4YT0 A;  4OPU A;  3G7I A;  1GAL A;  4N10 A;  1B9Y C;  4YJH B;  1GTE A;  4J36 A;  3LJP A;  2APG A;  4YSZ A;  1TU7 A;  3H79 A;  2V60 A;  1L9E A;  3UL3 A;  4FK1 C;  3ABV A;  2BK5 A;  3G3E A;  2P5Q A;  2DKH A;  4LLR A;  1WP0 A;  1NPX A;  2OLN A;  3M9K A;  1GNW A;  5C04 A;  2FHE A;  4GUV A;  1H81 A;  4GRF A;  1K0O A;  1BJX A;  3IHM A;  2YV7 A;  4FO5 A;  1N4W A;  2GMJ A;  2FA8 A;  3Q6O A;  3N9J A;  2PMT A;  1SD8 A;  5IQ4 A;  3IAM 2;  2XLU A;  2M80 A;  1B8S A;  2YG6 A;  5DJM A;  3LWA A;  2CA8 A;  1O7U A;  2Y6R A;  2E0Q A;  1CJC A;  1R4W A;  2BS3 A;  3SFE A;  2K9F A;  4QQ7 A;  1FG4 A;  5J3R A;  1K3O A;  3DJJ A;  1HNA A;  2P5R A;  1PX7 A;  3AE6 A;  3ICS A;  2C7G A;  5EOW A;  2YCD A;  2NTO A;  4AJ7 A;  4JE1 A;  3BNU A;  4CCQ A;  2BCG G;  2GMH A;  1Z5Y E;  2GZY A;  2VQB A;  4ZL7 A;  4U8O A;  2OJL A;  2XPE A;  3QPM A;  1GRF A;  4UDR A;  7GSS A;  3FZ4 A;  4NPB A;  2IIY A;  2C3Q A;  5BUK A;  3RPP A;  2HLS A;  3NZN A;  1TDF A;  3FRC A;  1FVK A;  4C3X A;  3RP8 A;  5ER0 A;  4C77 A;  4YXD A;  4ID0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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