2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords RebC
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
4NTEA 5EB4A 1DODA 2ACZA 1ZX9A 3AE6A 4Z43A 3K30A 3VR8A 2R0CA 4U8LA 4U8OA 2BYBA 4D03A 3ISHA 3NYEA 3F8RA 1ZOYA 3GD3A 3KA7A 4J57A 4RG3A 5HHFA 4C74A 4A6NB 3LOVA 1IJHA 3AYJA 4U8PA 1OJTA 4C3YA 5BRTA 2YLRA 2DKHA 4WCTA 4DNAA 1H7WA 3P4PA 5KWFA 2BCPA 3DA1A 5JCNA 2WU5A 3KU9A 1XDIA 1TYTA 3RP8A 2WPEA 2VOUA 2R46A 2HQMA 4N9XA 4YKFA 1ZP0A 3UKHA 3BNMA 3DJGX 3KD9A 2B9YA 4REKA 3FIMB 3IF9A 4E0VA 4NEVA 1FEBA 1NDAA 4MJWA 1KF6A 2B7SA 4J34A 5DBJA 1B37A 2YLTA 3QSEA 4U2TA 2WOVA 3C4NA 3P4QA 1S2QA 3GMCA 2Y6RA 4H4TA 2J3NA 4BJYA 4YXDA 3OC4A 4OPIA 3IHGA 3QJ4A 3AE7A 5CQFA 3AE1A 1S3EA 2CULA 2ZZ0A 3AEFA 3GD4A 5J7XA 2VRMA 4BK3A 4H2RA 3AE3A 2Y6QA 5U63A 4IV9A 4CY8A 1RYIA 4GUVA 4OPUA 4M52A 5U25A 2YG4A 4H4SA 4EQSA 3I6DA 2GR0A 1D7LA 2C72A 4YTPA 3D1CA 3T37A 4GF7A 1YKJA 2XFUA 5IQ1A 5KOXA 3DJJA 3UP4A 2JB1A 3CNSA 2XLRA 2GAGB 2H89A 5HXIA 3DH9A 4D04A 1H83A 3KPFA 4H4RA 4ZCDA 1L0VA 2X3NA 3ZDNA 2B7RA 1YQ4A 1GETA 1VQWA 4EMIA 3H8IA 4RG4A 4B67A 4CNKA 5U1OA 4EMJA 1GRAA 1LTXR 1ZMDA 2RGOA 3CNDA 4H4XA 4AOSA 5C3JA 1F8SA 3UKPA 2GR1A 2BK3A 2H88A 1NHPA 2QAEA 1K0JA 1Q9IA 3EANA 1JRZA 4U8IA 1OJAA 2YG5A 1LPFA 2V3BA 3KVEA 3NN0X 1ONFA 4U8KA 4B66A 1S2YA 2QA2A 1EL9A 3H4KA 1CHUA 4GR1A 5CKUA 3QVRA 1XHCA 2WETA 4UP3A 5KVIA 3AYLA 5BULA 4J56A 4J33A 2TPRA 3RHAA 4Z25A 3PVCA 4K5RA 4HB9A 5IQ4A 1IUWA 1E1NA 4CCQA 1DJQA 2X99A 1NHQA 2GR2A 3DGZA 3CGDA 1L9EA 2QA1A 1GEUA 2GRTA 4ADWA 3E1TA 3CGBA 1B5QA 2CFYA 2O9ZA 2IVDA 3PS9A 2C73A 3AEAA 4JDRA 3K7MX 3P4SA 1DXLA 2PHHA 1ZOVA 1TDFA 3EAOA 3F8PA 4BK1A 1DJNA 3ICTA 3V3NA 4LU6A 2WDQA 2YM2A 4BK2A 2E1MA 2XFNA 1EL8A 3AE8A 3CGCA 2YLWA 5GSNA 4YSXA 2BXRA 2GQFA 1CBOA 4H2NA 4PAAA 2YG3A 3AEGA 4H4ZA 1GV4A 4Z2TA 4P9SA 1AOGA 2ZZCA 5EB5A 2R4EA 2R9ZA 4EQRA 3CPHG 3AB1A 3ATQA 3GSIA 4EIQA 1GREA 1N1PA 4J36A 4X4JA 4K8DA 2GEWA 3G5QA 4I58A 4B69A 2W0HA 2CVJA 4K2XA 5M0ZA 2WEUA 4AP3A 2WHDA 3UKAA 2JKCA 1GALA 3L1RA 2F5ZA 3CNJA 4YWOA 1O94A 4H4VA 4TM3A 1N4WA 3C4AA 4USQA 5KOWA 1FECA 3AEEA 3R9UA 3S5WA 3VRDB 2GVCA 5KVHA 3ITJA 3JSKA 3UTEA 3ADAB 3C96A 4H4PA 3WE0A 1KDGA 1QLBA 4H4QA 4EMWA 1PHHA 3ALJA 5JCMA 4DSHA 1OJDA 2RGJA 5BVAA 3LB8A 1NHSA 4BV6A 3GWFA 3DK4A 2BACA 3LZXA 3BHKA 3AE4A 1F3PA 2C3DA 3UOXA 3HZLA 4OPCA 3UKKA 4YT0A 1Z6LA 2JAEA 1P2EA 4Z26A 1TYPA 2BS2A 4WX1A 4JN9A 4JQ9A 3AE5A 1GNDA 2GR3A 2XVIA 5FS9A 4U8MA 4OPTA 3BI4A 1REOA 1EL5A 2GQWA 4U2SA 2BA9A 2C75A 4IA6A 4B65A 1PN0A 1IUUA 1KNRA 4FK1C 1EBDA 4H4YA 5FS6A 1VDCA 2BXSA 3NHOX 2WOWA 1JU2A 1CC2A 5FMHA 3NLCA 1RSGA 1VG9A 4OPLA 1DOEA 2XVFA 3P1WA 3GMBA 1TDKA 3Q9TA 3VRBA 1PJ6A 1Y56A 4C3XA 2FBWA 4FK1A 5LV9A 2BABA 1KSSA 3UOYA 1CF3A 1GT8A 3DJDA 2XCGA 4JY2A 2WU2A 4A5LA 1O95A 2A8XA 4USRA 2YVJA 3M0OA 3M12A 3BHFA 4UDPA 1BGNA 1YQ3A 2VQ7A 4NTCA 3GYIA 3GRTA 1PBCA 2WOIA 1FOHA 1PXBA 4BURA 2R45A 4OCGA 4Z2RA 1SEZA 3BI5A 2OA1A 3NT6A 5JCLA 2I0ZA 4H50A 3UTHA 4YTMA 2BC1A 1EL7A 1GTHA 1GESA 1P2HA 4X9MA 1PJ7A 1BF3A 2EQ9A 3AE2A 1NEKA 3SQPA 4U8JA 4IVOB 1Y56B 1D5TA 3KKJA 1B4VA 4A7AA 2C3CA 4C5OA 4EM4A 1ZY8A 3AD7B 2A87A 3M13A 2XFPA 2BC0A 1DOBA 1K4QA 3CNPA 1NG4A 2C65A 3B6DA 5FS7A 3FG2P 2YQUA 5GRTA 2E4GA 4XWRA 2XLUA 2WP9A 1GRGA 1Q1RA 4AT2A 4IVMB 3NTDA 4JY3A 1K0IA 1CJ4A 2B9WA 4TM0A 2NPXA 5HY5A 4Y4MA 1FCDA 4KPRA 2Q7VA 3L8KA 1JEHA 1TDNA 2BS3A 3AD8B 1IUVA 2XVJA 1Y0PA 1ZK7A 2XLPA 4EIPA 3GRSA 4K5SA 5JCKA 3COXA 1OJCA 3VQRA 2E5VA 2VRLA 3ALMA 3NNEA 2AQJA 1GRHA 1IUTA 2GAHB 2AAQA 2VZ2A 3DMEA 4CNJA 1O5WA 3RP7A 1VRQB 1GRFA 2OLOA 3O0HA 1FEAA 2OAMA 3UOVA 3CNTA 1QJDA 1IUXA 2YG6A 2FJDA 3ICRA 4YKGA 4A99A 2RABA 1F8RA 3AE9A 2JB2A 4CBQA 1K0LA 2V3AA 2WBAA 2B76A 4PABA 3NTAA 3RNMA 2YR4A 2C70A 4ECHA 2Z5XA 4APNA 2V6OA 5EBKA 3NYFA 1QO8A 4XWZA 3NG7X 1GPEA 3AEBA 4EM3A 4UDQA 4K22A 1GXFA 2FJBA 2XDOA 4B1BA 1IUSA 4RSLA 1MXTA 1DOCA 3G5RA 3LZWA 3CPJG 2VVLA 1LQTA 4Z2UA 1CJCA 3AYIA 2XLTA 4B68A 5ER0A 2JK6A 1L9CA 4EQXA 4OPGA 2BK5A 2WP5A 2OALA 2EQ8A 5L46A 4K7ZA 4O5UA 1GSNA 3CPIG 4OVIA 1ZDLA 1CJ3A 1W4XA 2X8HA 3CIRA 1S3BA 3QSMA 4B63A 4DGKA 1NENA 2XVHA 2XYOA 4NEWA 1M64A 5KRQA 2JBVA 1H86A 1LQUA 2BCGG 1OJ9A 4C77A 1JRYA 1TDOA 4H4WA 3AECA 1KFYA 4AT0A 3BI2A 4YTNA 1KNPA 3G5SA 3CN8A 1BWCA 1PXAA 4TLXA 2VQBA 1RP0A 3NK1X 1UKVG 3UOZA 2WS3A 4NTDA 3KLJA 4Y4NA 2FJEA 4HA6A 1BGJA 1CL0A 4GDEA 2WPCA 4BJZA 5JCIA 2EQ6A 4H4UA 4GCMA 1L9DA 2QCUA 1CJ2A 3PO7A 1M6IA 5M10A 3GYJA 2V60A 1ELIA 1YY5A 2FJAA 3DK8A 2C66A 2GH5A 2RGHA 3I3LA 4LIIA 3S61A 4TM4A 4KX6A 4U8NA 2OLNA 2XLSA 4UDRA 3UP5A 3EPTA 4CRTA 4DSGA 3OZ2A 2YG7A 3DGHA 3NIXA 2X8GA 1TDEA 3D8XA 2APGA 2BS4A 3GDNA 3LJPA 1E1MA 1KSUA 2BK4A 3QFBA 1VG0A 2R0PA 1GERA 2AR8A 2YAUA 3NKSA 1PS9A 3SGLA 1JNRA 4IA5A 3VRAA 1YQZA 1ZMCA 3UKLA 1LJ1A 1ZKQA 4YSZA 3B3RA 3SFDA 4O5QA 1PBFA 2V61A 4B64A 1E39A 4OPDA 1CC4A 3ALLA 1D4EA 3SM8A 4TM1A 2TMDA 4ZN0A 1E1KA 3K7QX 2IIDA 1V59A 4A65A 2Q0KA 1PDHA 3FMWA 4JNAA 4H7UA 3UTFA 2WESA 1PXCA 3K7TA 1LVLA 2GMJA 1D4DA 5KXJA 2YLZA 5EOWA 2GF3A 1D7YA 3NH3X 3UKFA 4ICYA 3H8LA 1GTEA 3FBSA 1JRXA 3DJEA 4A9WA 1NHRA 4NZHA 3QFAA 1NPXA 3SFEA 4Z24A 2B9XA 3V76A 3ZYXA 1NG3A 1NAAA 5HYMA 3P4RA 1BZLA 4EQWA 1D4CA 2WDRA 1XANA 3NK0X 4YSYA 2Q0LA 3UCLA 1E1LA 3NYCA 3LXDA 4I59A 2UZZA 4XXGA 2YLSA 1PBEA 1H81A 1H82A 2YR6A 2C7GA 2V5ZA 3AEDA 3ATRA 3IC9A 2JB3A 2WDVA 2YVFA 2Z5YA 1JOAA 3II4A 1JNZA 4U2LA 3ICSA 1N4UA 2C64A 2X50A 2YWLA 2DKIA 4A79A 1FL2A 1DNCA 1E7PA 2VVLG 3GWDA 4J31A 5J60A 2XVEA 3RP6A 4LA1A 3ABVA 1PJ5A 2ZBWA 2PYXA 3GDPA 4ZCCA 3NRNA 5BUKA 2A89A 5IPYA 2YVGA 3NGCX 1MO9A 3LADA 1TRBA 4Z44A 2X8CA 2XFQA 2C76A 4YSHA 3NN6X 2ZZBA 1PBBA 1XPQA 5FS8A 3P9UA 3URHA 2R0GA 2YR5A 2WP6A 1BKWA 1HYUA 1N4VA 2GMHA 3CTYA 3Q6JA 4J2WA 4X9NA 3UTGA 3DK9A 3QSSA 1LV0A 2NVKX 4H2QA 3VR9A 4FDCB 4GDPA 2GV8A 4FX9A 1MOKA 1Q1WA 5C2TA 3NK2X 4CY6A 3REDA 1B8SA 2EQ7A 2WQYA 2VVMA 2YM1A 2CDUA 3BNUA 3QVPA 2Q6UA 4A6NA 4TLZA 3FPZA 2WPFA 3UKQA 2YLXA 4AOXA 3AWIA 1GRBA 3F8DA 1E6EA 3IHMA 2R4JA 1H7XA 1PBDA 4AP1A 2GB0A 1F8WA 2ARDA 2IVEA 1GRTA 1F6MA 2XFOA 3IWAA 1CC6A 1H6VA 1H84A 5TR3A 2C67A 4Y4LA 3V3OA 4CCRA 4GRTA 3CGEA 3AD9B 1COYA 3EF6A 4H2PA 4JNQA 1X31B 1GOSA 3AXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FOVA 4HJMA 3CUKA 4NTEA 5EB4A 4F82A 3GH9A 2ACZA 4Z43A 3K30A 2F51A 2MMNA 4MA9A 2R0CA 6GSWA 3VR8A 5CRHA 2BYBA 3ISHA 3F8RA 1U3IA 4KB3A 3GYXA 4J57A 2GLRA 2VM1A 3ME7A 3A2VA 3W4JA 2HI7A 2WZ9A 4DNAA 1EEJA 5G2ZA 1XW6A 6GSYA 5ID2A 2RUFA 2BCPA 5JCNA 1XDIA 1VF1A 2J23A 1TYTA 1ERUA 2R46A 1GSUA 4BA7A 2HQMA 2E2MA 4IN0A 3BNMA 3A5IA 3KD9A 2B9YA 4PNFA 4NHZA 1KF6A 1B37A 4KDYA 4YXDA 5AISA 3OC4A 4WR5A 1S3EA 2CULA 3AEFA 4BK3A 1DE2A 4IV9A 4M52A 2YG4A 4EQSA 5ID2B 3IRAA 5KN2A 2C72A 4YTPA 3D1CA 3VWXA 4XRDA 4P3YB 3CNSA 1ZYPA 3LYKA 3T31A 4D04A 3DEXA 3KPFA 3HYPA 2X3NA 1I9DA 4Q5NA 5U1OA 3BD2A 1LTXR 2RGOA 1C0PA 2VM2A 4I2UA 3CNDA 5LCZA 2H88A 2BK3A 1PL2A 1DSBA 5ECLB 3EANA 4POBA 2AYTA 1CQHA 3CRTA 3HHVA 4ML6A 4MJEA 3SYIA 2LS5A 3PPUA 2C0FA 2P31A 5B6MA 1THXA 1GNWA 2QA2A 3H4KA 1O81A 2GT5A 4GR1A 3QVRA 4RUVA 3DWVA 5D9XA 3RHAA 4Z25A 3PVCA 1ABAA 5IQ4A 1YDKA 1NM3A 2XPEA 2X99A 2GR2A 3RDWA 1TTZA 3VPTA 1GEUA 5J3RA 4ADWA 3MYDA 1G6YA 4GF0A 1EZKA 1N8JA 4Q5QA 1WIKA 1B5QA 2C73A 5FHIA 1ZOVA 3MDKA 4BK1A 5GSTA 4ZB6A 3GRXA 2WDQA 2XFNA 1EL8A 4XS6A 1OVNA 1CBOA 4H2NA 4PAAA 2YG3A 4H4ZA 4JZQA 1PA3A 4Z2TA 2ZZCA 2H6YA 3FZ9A 2R4EA 4BVYB 1K0NA 4KH7A 3AB1A 4EIQA 1GREA 4J36A 1TRWA 3FHKA 3G5QA 2LNTA 1PSQA 2LUSA 3DMLA 2F8FA 4OCFA 2PPTA 2D2ZA 1GUMA 4YWOA 1O94A 4TM3A 3KD0A 1VF2A 3HCZA 4G9KA 3GX8A 2GVCA 5KVHA 5IPGA 3ITJA 3WE0A 1KEBA 4H4PA 4H4QA 4NNJA 5JCMA 1Z9HA 5DQSA 1OJDA 3LB8A 4E8HA 4BV6A 3GWFA 4MDCA 3AE4A 3W8JA 1T7PB 2A2SA 3HZLA 3TKSE 1OKTA 4HOJA 3FK8A 1OE8A 4Z26A 2V1MA 4GLTA 2JU5A 2H01A 4MH2A 4JN9A 4JQ9A 5FS9A 5AN1A 3UJ1A 3TKQA 1BX9A 2WB9A 1PN0A 5JWOB 4FK1C 1EBDA 4IGJA 1F2EA 1M7TA 1TRVA 1VDCA 2BXSA 3HJPA 2WOWA 1JU2A 5FMHA 1RSGA 2FWHA 2OE3A 1DOEA 2V2GA 1PRXA 3P1WA 1PJ6A 5E59A 4FK1A 2BABA 2KP1A 3Q74A 1GT8A 2XCGA 2WU2A 2L59A 2V6KA 1G7EA 2K18A 3NIVA 1GTAA 4YJFA 4O7HA 1BGNA 4X1UA 4NTCA 3KMNA 3W8SA 2ZUPA 3GYIA 4NAXA 2WOIA 4MK3A 4Z2RA 2OA1A 5JCLA 5D9WA 4MF7A 4H50A 4ISDA 1EL7A 2WULA 1GTHA 4TW5A 5HFKA 1FG4A 1BF3A 3KKJA 2RLIA 4XTSA 3RPNA 2YZHA 1UC7A 4V2MA 1DOBA 1NG4A 1TOFA 2VCWA 1K0BA 3H1NA 4YJFB 2XLUA 1GRGA 2IMEA 4TR3A 3I6AA 2B9WA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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