2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords RebC
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
4ZN0A 1DJQA 1REOA 3BI4A 3COXA 3AEFA 2V5ZA 4E0VA 1CJ2A 2WOWA 2IVDA 4H2PA 4RSLA 2YLWA 5U1OA 2XYOA 1GRBA 3WE0A 2XFOA 2XFNA 3IWAA 1IUWA 1YKJA 4B1BA 1OJ9A 2WOIA 3OC4A 5BRTA 1Q9IA 3I3LA 1Y56B 1H7WA 4HA6A 4H2NA 3CPJG 5HY5A 1EL8A 5JCNA 3CTYA 2FJBA 1CC2A 2R4JA 4YKGA 4GRTA 4H50A 3I6DA 4J57A 1ZX9A 3IF9A 1ONFA 3RP8A 2X3NA 1N4WA 4YTPA 1B8SA 1LJ1A 2XVEA 1N1PA 4I58A 4A6NB 4REKA 4M52A 3M0OA 5KVHA 2WHDA 2YG3A 3SM8A 3UTFA 4TLXA 5GSNA 3AE2A 4Z2UA 2Z5XA 2BK3A 3LB8A 1JNRA 3AECA 4C77A 4Y4MA 4O5UA 1LQUA 2UZZA 3AE3A 5KWFA 4EM4A 4BJYA 1BWCA 4TM4A 4H4RA 4UDPA 1D4CA 3GRSA 2ACZA 4JNAA 4JDRA 5IPYA 2R4EA 3P1WA 4CY6A 4DGKA 1JNZA 2B76A 4YSZA 1H6VA 3UKKA 1D7YA 1N4VA 2C76A 3Q6JA 1GRGA 5BVAA 2GMJA 3QVRA 3ZYXA 1GV4A 3L1RA 3ICRA 4LU6A 4NEWA 2X8HA 2QA2A 2YLTA 2RGHA 2Y6QA 3URHA 3VQRA 2YG6A 3VR9A 3OZ2A 2A8XA 3UKHA 4U2LA 2GF3A 1DNCA 1KF6A 1KDGA 1PXCA 4WCTA 3NN0X 2PHHA 2YR5A 4AOSA 2C7GA 5KVIA 2BC0A 4RG4A 1KFYA 1IUVA 2RABA 3T37A 3ALMA 2GR0A 3P4QA 3AE1A 4CBQA 3AYLA 1NAAA 3AD7B 4H7UA 4ADWA 2R46A 4U8JA 3VRDB 2TPRA 2JKCA 4UDRA 2C67A 2C72A 1E1KA 1CC6A 2DKIA 4NZHA 4IA6A 3P4PA 3ALJA 4Z24A 5JCIA 1GERA 1ELIA 1F3PA 3FG2P 5EB5A 3K7TA 2V3AA 4JNQA 3HZLA 3NYCA 2FBWA 1L9DA 2VQBA 3BNMA 3UCLA 1IJHA 4GR1A 1Y0PA 1ZKQA 3H8LA 4GCMA 5GRTA 1L9CA 3FIMB 3R9UA 5KRQA 2BS3A 1OJTA 4U8OA 1JOAA 2A87A 2OALA 5FS9A 4C3YA 2NVKX 4EMWA 3KVEA 1AOGA 2WETA 3B6DA 4OCGA 2XFQA 2PYXA 3II4A 2GQWA 3CNTA 2BK5A 5JCMA 1D5TA 2WU2A 3NLCA 3UKLA 2R0GA 4BURA 2WPCA 3UOZA 2XDOA 3M12A 1BGNA 2VOUA 3IHMA 4FX9A 3G5SA 1GNDA 2YLZA 3AD8B 2V6OA 3NN6X 2ZZ0A 1CF3A 2EQ9A 4K8DA 4YKFA 4YSYA 3REDA 3B3RA 3ICSA 2WS3A 3SFDA 3VR8A 5CKUA 3K7MX 4GUVA 4BJZA 3PVCA 3SQPA 5JCKA 1PBFA 2FJAA 5J7XA 3AE7A 4B69A 1F8SA 2CFYA 2JBVA 3BI2A 2YLRA 4B65A 5FS6A 3GWDA 4FK1A 3DA1A 3FPZA 3SGLA 4K7ZA 4A65A 2C75A 2GEWA 3S5WA 3KA7A 4IVMB 4AP1A 5M0ZA 4DNAA 4AOXA 2VRMA 3QSMA 1H81A 2BS2A 3SFEA 2JB3A 5HXIA 2GB0A 1L0VA 1ZP0A 5TR3A 4C74A 1S3EA 5JCLA 2IVEA 1H82A 5BULA 4FK1C 4OPCA 4AT2A 2BXSA 3RP6A 3NIXA 1VG0A 3UTHA 1H84A 4EQSA 1FOHA 4C5OA 4H4SA 4H4WA 2BXRA 3UP4A 1FEAA 1Z6LA 4OPGA 1PDHA 1GT8A 2EQ8A 1K0LA 2R9ZA 3DK8A 2YLSA 5KXJA 4WX1A 3DMEA 3UOXA 4EIPA 3NHOX 1GPEA 2JB1A 1EBDA 1PXAA 4K2XA 4BK2A 3GMBA 3ITJA 2WDRA 1X31B 3UOVA 4TM0A 2Q0KA 1Y56A 2BCGG 2IIDA 4DSGA 1COYA 1VQWA 4H4PA 4TLZA 3DGZA 1TYTA 2Q0LA 1PBBA 2JK6A 3CGEA 4H4VA 4LIIA 3D8XA 4KX6A 2XVJA 4RG3A 4U8LA 3UOYA 3V76A 1RSGA 5J60A 3CGCA 1CJ4A 2XLTA 4A6NA 2OA1A 1PJ5A 3UKQA 1QLBA 1XDIA 4CNJA 1CBOA 4H4XA 1P2EA 2XCGA 2YWLA 3JSKA 3KPFA 2B7SA 4YSHA 5DBJA 2CDUA 2XVIA 2C73A 5ER0A 5M10A 2YQUA 1ZK7A 1EL9A 4B66A 4J2WA 2JAEA 2W0HA 1H83A 1BKWA 1RP0A 2FJDA 1DXLA 2GAHB 3D1CA 2R0CA 4D04A 3AEAA 4USQA 3AE6A 2WPFA 2J3NA 4U8MA 3QJ4A 2B9WA 1NDAA 1PN0A 1BF3A 3DGHA 1ZOVA 3BNUA 3DK4A 3AYJA 2AAQA 3NGCX 5BUKA 2QCUA 3NH3X 2C70A 3C4AA 4Z25A 4D03A 4U8PA 1CJ3A 4NTCA 1H86A 1L9EA 4YSXA 3GWFA 2WP9A 1EL7A 5U25A 2YM2A 3QSEA 1JU2A 3K7QX 4GDEA 4UP3A 4Z2TA 2WPEA 3ICTA 2BC1A 3QSSA 1PBEA 3LOVA 1PJ6A 3VRAA 2YVFA 4U2TA 1K0IA 3BI5A 2B9XA 3EAOA 5EB4A 4U8NA 2YG5A 1MOKA 1V59A 4Z44A 2OLOA 1LQTA 2RGOA 4N9XA 2QA1A 1PXBA 1TDFA 2VVLA 4GF7A 3P9UA 3NRNA 3GD4A 4O5QA 2VVLG 4B67A 2R0PA 1CL0A 1O95A 3GDNA 1K0JA 4H2RA 1DJNA 4JQ9A 1E1NA 3G5QA 2O9ZA 5C3JA 4CCRA 2X99A 2BACA 2NPXA 1JRYA 2C65A 1SEZA 4X4JA 1VDCA 3KD9A 1QO8A 3NYEA 4P9SA 4USRA 4XXGA 1OJAA 5FMHA 4Z43A 3EF6A 4CY8A 3CPHG 4XWRA 1JRXA 3ATQA 4H4UA 4Z26A 1O94A 2RGJA 4U8KA 4EQWA 2WDVA 2Y6RA 2GMHA 2YM1A 2BCPA 3E1TA 1GRTA 2X50A 1TDKA 1DOCA 4OPTA 2EQ7A 1GESA 4X9MA 2ZZBA 4B68A 1GTEA 1S2QA 4CRTA 4K5SA 3AWIA 3ISHA 1E39A 3LJPA 1D7LA 4J56A 4CCQA 2GR1A 3CGDA 1TRBA 1O5WA 4J36A 4I59A 2WP5A 1K4QA 1VRQB 1PBDA 2DKHA 2ARDA 4UDQA 1PBCA 3M13A 3QVPA 4B64A 1UKVG 1S2YA 2X8GA 4OPIA 4A5LA 1S3BA 1FEBA 2YR4A 3DJDA 5IQ1A 2GVCA 1PHHA 2GH5A 4Z2RA 1NHRA 2XFPA 2YVJA 4J31A 3GD3A 3UKFA 3GRTA 3G5RA 1Q1WA 3C4NA 4OPUA 4K22A 2OAMA 2YR6A 1LVLA 3L8KA 1FL2A 1KSSA 4A9WA 3NK2X 3AB1A 3RP7A 1P2HA 4DSHA 4C3XA 3AE4A 1W4XA 2B7RA 3AD9B 3KLJA 4A79A 4YWOA 2WU5A 3AE9A 3AEBA 3P4RA 1IUUA 3EPTA 2XFUA 1OJCA 2AR8A 2C3DA 4H4ZA 4APNA 3DJEA 5HHFA 1NEKA 1DOBA 3AE5A 4YTMA 1NG3A 5HYMA 5U63A 4EMJA 4IV9A 3RNMA 2XLPA 3NG7X 1E7PA 1YQ3A 2WQYA 4NEVA 3UTEA 4TM3A 1BZLA 3PO7A 4YT0A 2C3CA 4Y4LA 4EQRA 1ZDLA 1MO9A 2XLUA 4XWZA 3NT6A 2XVFA 3FMWA 1LTXR 1GRHA 3ABVA 4BK3A 3CNDA 4YTNA 1ZOYA 1XANA 3GDPA 4AT0A 1TDOA 1GTHA 2V61A 2Q6UA 3LZWA 2CULA 3V3OA 2XLRA 1M64A 3DJGX 3AYIA 2ZBWA 3NTDA 5EBKA 1KSUA 3QFBA 1LPFA 5KOXA 1TDNA 1KNRA 2BYBA 4H2QA 2CVJA 2GR3A 3CIRA 2WP6A 2VVMA 3F8RA 1E1MA 2Q7VA 4IVOB 3LZXA 1RYIA 1N4UA 4IA5A 2QAEA 4FDCB 2V60A 4NTEA 2GAGB 2YAUA 3UTGA 4OPDA 2WBAA 2WESA 4BK1A 1NPXA 4ICYA 1MXTA 2GV8A 2JB2A 3GSIA 5CQFA 1B5QA 2WEUA 2ZZCA 3CN8A 3NK1X 1D4EA 1F6MA 1QJDA 2XVHA 1GEUA 1GXFA 3P4SA 3RHAA 3UKPA 2APGA 4B63A 4EM3A 1DOEA 2A89A 1TDEA 2V3BA 3LXDA 1PJ7A 4EIQA 3DK9A 3S61A 1BGJA 1M6IA 4PABA 3VRBA 2OLNA 3PS9A 4JN9A 3H8IA 3C96A 1GOSA 4KPRA 2YLXA 3BHFA 4OVIA 2R45A 2HQMA 4YXDA 2VZ2A 1PS9A 1F8RA 1JRZA 3KU9A 2WDQA 3NTAA 4LA1A 4AP3A 1FECA 5L46A 1CC4A 1TYPA 1YY5A 1H7XA 2BA9A 3AEEA 1HYUA 3GYJA 1DODA 1KNPA 5IQ4A 1CJCA 1OJDA 4JY2A 2YG4A 1F8WA 4CNKA 3IHGA 2GQFA 5FS7A 4EMIA 4Y4NA 4EQXA 2YG7A 3QFAA 1XHCA 1IUSA 3ATRA 1E1LA 5FS8A 1CHUA 3ALLA 3CNPA 3ADAB 4MJWA 3UKAA 2BS4A 2B9YA 1E6EA 3F8DA 2I0ZA 3AEGA 4J33A 3AE8A 1NHSA 4J34A 2YVGA 4A99A 1GSNA 2TMDA 3CPIG 1EL5A 1D4DA 1VG9A 2VQ7A 3CNSA 5KOWA 3H4KA 3F8PA 2FJEA 1GRAA 3LADA 5LV9A 3IC9A 4ECHA 1NENA 2AQJA 2E4GA 4U8IA 1FCDA 1NHPA 4A7AA 2H88A 4H4YA 1GETA 3KKJA 2VRLA 2GR2A 3O0HA 2BABA 4TM1A 4X9NA 3CGBA 1LV0A 3FBSA 3NK0X 4JY3A 1GALA 1B4VA 3AXBA 3BHKA 3Q9TA 4GDPA 2WOVA 4ZCCA 1GRFA 3GMCA 3UP5A 1B37A 1IUXA 3K30A 5C2TA 4NTDA 3CNJA 3AEDA 3DH9A 3EANA 1NG4A 2X8CA 1YQ4A 1Q1RA 1ZMDA 2E5VA 3NYFA 4ZCDA 2E1MA 3NNEA 4U2SA 1YQZA 1IUTA 4BV6A 1JEHA 2F5ZA 2C64A 3DJJA 4HB9A 2GRTA 4K5RA 1ZY8A 4OPLA 1XPQA 4H4QA 4H4TA 1ZMCA 1NHQA 2XLSA 2Z5YA 2H89A 2EQ6A 3NKSA 3ZDNA 1GREA 3GYIA 4PAAA 2C66A 3V3NA 2BK4A 5EOWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CAQA 3IAS2 1REOA 3COXA 2VCZA 4CDOA 3LW9A 5D9XA 1DSBA 4G0IA 3CUKA 4J57E 2IVDA 4RSLA 5U1OA 2XYOA 4F82A 1GRBA 3WE0A 3VWVA 3BCKA 1HQOA 5C04A 2WOIA 3OC4A 4NMUA 3L9UA 2LJRA 3I3LA 4H2NA 5JCNA 5J41A 2FJBA 1CC2A 3RDWA 1KEBA 4YKGA 4H50A 2CVKA 3I6DA 3GYKA 2GZPA 4YJHB 2KP1A 2EIRA 4M52A 1GLPA 1GSYA 1WMJA 3HJOA 4I2TA 3M0OA 2K18A 1ZYPA 2WHDA 4TLXA 5GSNA 2M46A 2Z5XA 2VL9A 2BK3A 1JNRA 4C77A 2YWIA 4O5UA 3US3A 1JLWA 4ECCA 2UZZA 1LQUA 5IQYA 5KMQA 2R4VA 1AXDA 4TM4A 3MAKA 1XW6A 5HFKA 2ACZA 3GRSA 4JNAA 3T0KA 5AIVA 3UIWA 4DSSB 1OVNA 1EEMA 1H6VA 1Z7RA 3UKKA 1V9WA 5HR3A 4N0ZA 4MJBA 3HJMA 1N4VA 4NHZA 1WP0A 2NTOA 5BVAA 3QVRA 4MNNA 4ZB8A 1AQVA 2B7JA 3ICRA 2JZSA 2X8HA 5AGYA 4G6HA 3VR9A 1AUCA 4U2LA 1PL1A 5CNWA 4WCTA 4GRFA 4JU5A 1THXA 2C7GA 1GSUA 2BC0A 4YJFA 1B8XA 4OFMA 4RUVA 3H93A 1K0MA 3T37A 1SD9A 3AYLA 1QXHA 4NAXA 4H7UA 4ADWA 4D73B 2TPRA 1OE7A 1SK0A 2FWFA 4EE0A 1KBNA 4IA6A 2JZTA 3P4PA 3ALJA 5HR0A 4Z24A 3KTBA 1EEJA 2V3AA 4XS4A 1VGLA 2XBQA 1M99A 3UCLA 2YV7A 2B5EA 3KTLA 2ES7A 3R9UA 3CTFA 2PGTA 4EMWA 3DXBA 3KVEA 4MZWA 2HSYA 1MD4A 1EGOA 2XFQA 1V2AA 2PYXA 1GSSA 3CNTA 3O3TA 4N11A 2LNSA 2R0GA 2B5XA 2HZEA 2EIOA 2IIYA 3UOZA 2AJQB 3LFLA 5HQPA 1GNWA 4YKFA 3V1WA 4YSYA 1JLVA 3ICSA 3SFDA 4V2LA 1AC1A 5CKUA 4BJZA 3SQPA 1EOGA 2N5AA 1PBFA 1OE8A 4B65A 4LMVA 1OKTA 4K8MA 4FK1A 2FHEA 2HI7A 5G30A 5FWGA 4K7ZA 3KA7A 1F3BA 3QAWA 3QSMA 2BS2A 2JB3A 5HXIA 5INYA 5L71A 4BPYA 5KMPA 4AT2A 1Z7PA 5AISA 3NIXA 3A2XA 3UTHA 1XWKA 4EQSA 4C5OA 5IMZA 4H4SA 1XWCA 3UP4A 5KMRA 2EQ8A 1K0LA 2YLSA 2VLTA 3E9JB 3NHOX 1GPEA 5GAND 2JB1A 3ZIVA 3ZTLA 3UOVA 2IJYA 2WGRA 1XW9A 1COYA 3KCMA 2LKUA 4DSRA 4TN8A 1PBBA 2JK6A 3CGEA 2PERA 4RG3A 3V76A 2MZCA 2LNTA 1XZOA 2I4AA 2L4CA 3UKQA 3EINA 4CNJA 1P2EA 1VF1A 4ECJA 4YSHA 1YY7A 1F2EA 3A3TA 5M10A 18GSA 2CAIA 2YQUA 2GAHB 2R0CA 2IN3A 3AEAA 1VF4A 4USQA 3AE6A 3QPMA 1BF3A 5G5EA 3DGHA 3T31A 1T3BA 2VAFA 3ZIJA 3CSHA 3NGCX 3IDVA 3L0HA 2L4QA 2QCUA 3HYPA 4HI7A 2B7KA 3DYRA 3UVHA 3IXRA 4NTCA 3G7JA 5CRHA 3GWFA 3HA9A 1JU2A 3QR6A 1M7TA 2C80A 3TOUA 4BIKA 3ICTA 4TR4A 3W4JA 3M8NA 2IMIA 1DAOA 1ZZYA 1V58A 1V59A 4Z44A 5G1LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CAQ A;  3IAS 2;  1REO A;  3COX A;  2VCZ A;  4CDO A;  3LW9 A;  5D9X A;  1DSB A;  4G0I A;  3CUK A;  4J57 E;  2IVD A;  4RSL A;  5U1O A;  2XYO A;  4F82 A;  1GRB A;  3WE0 A;  3VWV A;  3BCK A;  1HQO A;  5C04 A;  2WOI A;  3OC4 A;  4NMU A;  3L9U A;  2LJR A;  3I3L A;  4H2N A;  5JCN A;  5J41 A;  2FJB A;  1CC2 A;  3RDW A;  1KEB A;  4YKG A;  4H50 A;  2CVK A;  3I6D A;  3GYK A;  2GZP A;  4YJH B;  2KP1 A;  2EIR A;  4M52 A;  1GLP A;  1GSY A;  1WMJ A;  3HJO A;  4I2T A;  3M0O A;  2K18 A;  1ZYP A;  2WHD A;  4TLX A;  5GSN A;  2M46 A;  2Z5X A;  2VL9 A;  2BK3 A;  1JNR A;  4C77 A;  2YWI A;  4O5U A;  3US3 A;  1JLW A;  4ECC A;  2UZZ A;  1LQU A;  5IQY A;  5KMQ A;  2R4V A;  1AXD A;  4TM4 A;  3MAK A;  1XW6 A;  5HFK A;  2ACZ A;  3GRS A;  4JNA A;  3T0K A;  5AIV A;  3UIW A;  4DSS B;  1OVN A;  1EEM A;  1H6V A;  1Z7R A;  3UKK A;  1V9W A;  5HR3 A;  4N0Z A;  4MJB A;  3HJM A;  1N4V A;  4NHZ A;  1WP0 A;  2NTO A;  5BVA A;  3QVR A;  4MNN A;  4ZB8 A;  1AQV A;  2B7J A;  3ICR A;  2JZS A;  2X8H A;  5AGY A;  4G6H A;  3VR9 A;  1AUC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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