2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
2E1MA 3BI5A 1V59A 1NDAA 2VVLG 4H4ZA 2RGHA 3KLJA 2WPCA 1KSUA 3EAOA 4OPIA 2HQMA 1E1NA 2H88A 4H4QA 3UKQA 4EMWA 3PS9A 3AEAA 2Y6RA 4YKGA 3DJEA 3ATRA 1FOHA 2R0CA 1K0JA 3NYCA 1E1LA 1CC6A 1IUTA 2BC0A 4J36A 1GRFA 5EBKA 4AT2A 4YWOA 2UZZA 2NPXA 3KA7A 2BC1A 3FG2P 4C3YA 1RYIA 1IUWA 4U8IA 5J7XA 3M13A 1PBFA 3NTDA 3SFDA 4BK3A 4Z25A 2C70A 4OPTA 2B9WA 2OLNA 2C66A 3UOVA 2GRTA 4YT0A 3UTEA 4FX9A 4Y4MA 2Q6UA 3RP8A 2X8CA 2Q0LA 4Z2UA 4NEVA 4N9XA 1E6EA 3AE1A 1B4VA 3FPZA 1GTEA 4CCRA 5BVAA 5L46A 2RABA 2XVEA 4C77A 3V76A 1N1PA 4JY3A 2X50A 1SEZA 3COXA 1CL0A 3UP5A 2GR1A 1XANA 2B9XA 3AE2A 3IHGA 1TYTA 4K7ZA 4Z24A 4GRTA 3SGLA 2BK5A 1JNRA 1CJCA 2VQ7A 1NG3A 1UKVG 3AD9B 1H6VA 4U8OA 4FK1A 3ICSA 4A6NA 3C96A 3EANA 3GMBA 1GESA 1TDFA 4JNAA 1LQUA 3SFEA 2RGOA 3DA1A 1Y0PA 3RNMA 4CY6A 3DMEA 1O94A 4IA5A 2WU5A 4B66A 5FS7A 3AEEA 3CNSA 2WOVA 1PBEA 3Q6JA 1ZKQA 4USRA 4EQWA 5JCMA 2ZZBA 3P1WA 1PHHA 2WP5A 3CGBA 2O9ZA 3AEBA 3AEFA 4UDQA 3BNMA 3BHKA 3JSKA 1MO9A 2DKHA 2WU2A 5U63A 1JRYA 3FIMB 3P4RA 4U2SA 1RSGA 4J2WA 3LZXA 5HY5A 5HXIA 4BK2A 4TM3A 4U8PA 4AOSA 2YLXA 2WPEA 3D8XA 2JB1A 4X4JA 1NEKA 1YY5A 4NTCA 3RP7A 3P9UA 1QO8A 2A87A 3NK1X 5U25A 4I58A 1LTXR 2C76A 3UP4A 3BI2A 2YLSA 4HB9A 2ZBWA 3F8PA 3M0OA 2EQ8A 1Q1WA 3I3LA 4JQ9A 1Y56A 4EMIA 2XFNA 1REOA 3PO7A 2YLWA 3GWFA 3AE9A 2TPRA 2VOUA 5EB4A 3KD9A 4DGKA 1JNZA 3NIXA 1EL7A 1ZY8A 4BURA 1OJTA 1QJDA 1NHQA 1E7PA 2C65A 1LQTA 1FECA 2GB0A 2XLPA 2YVFA 1GXFA 2JBVA 3BHFA 4B68A 1E1MA 2R0PA 1KNPA 1PN0A 2JB3A 4H2PA 3VRAA 1YQZA 2C7GA 4GF7A 5BRTA 1MXTA 3LOVA 2VVLA 5GSNA 1L9DA 2EQ9A 2YG7A 4C5OA 2AQJA 2V60A 1GTHA 1GNDA 1F8WA 4GUVA 4K22A 2X99A 4NTDA 1DOEA 3DK4A 3NRNA 3PVCA 4ICYA 5KOWA 3NH3X 4OCGA 2AR8A 3QVPA 3AEGA 3BNUA 1NENA 4ECHA 1GV4A 3DJJA 3GRTA 3IF9A 1D7LA 1GREA 4YSXA 3RP6A 1K0LA 2JK6A 3IHMA 2X8HA 4OPDA 3GYJA 5HHFA 2C67A 1DOBA 1GALA 1JRXA 2YR5A 4DNAA 3DGHA 4BJYA 4NEWA 4YSYA 1OJAA 2OAMA 4BV6A 3DK8A 5JCIA 1B8SA 1NHSA 2XYOA 1PBDA 2FJDA 2WBAA 3IC9A 1OJ9A 2XVHA 3KVEA 2YVGA 2JKCA 3GD3A 1BGNA 1GERA 4CNKA 5KOXA 1IUVA 2Q0KA 2C3DA 3ISHA 2YVJA 3UKAA 4USQA 2GQFA 3II4A 1H82A 3NN0X 2CVJA 4OPCA 4PABA 2GF3A 3DJDA 3HZLA 1D5TA 3ADAB 3REDA 4B64A 3IWAA 1W4XA 1JEHA 2XCGA 2C72A 4H4SA 2IIDA 3EF6A 2YG5A 1O5WA 2V3AA 4B65A 4AP3A 1P2EA 3C4AA 3S61A 4PAAA 3NYEA 1GRAA 2GMHA 4U8JA 2BK3A 3CGDA 1F8RA 4H4TA 3LB8A 5FMHA 3VR9A 3AD7B 4K8DA 4CY8A 2B7SA 4GR1A 3NKSA 1EL9A 1NPXA 1HYUA 1QLBA 3K7MX 4B63A 4K5RA 3R9UA 1AOGA 5TR3A 2WP6A 2E5VA 5HYMA 1VG9A 2A8XA 4IVMB 3GRSA 1NG4A 4A6NB 1L9CA 1TDKA 1CF3A 1LPFA 2RGJA 2WOWA 5M10A 2CDUA 3NHOX 3KU9A 4A79A 3UCLA 3VR8A 1N4WA 1X31B 4Y4LA 1K0IA 1CC2A 3RHAA 2IVDA 4IV9A 4YKFA 2W0HA 1VRQB 3C4NA 5KVHA 1CC4A 1FL2A 1VG0A 1YKJA 4O5QA 5DBJA 1Q1RA 2I0ZA 2YR4A 3QVRA 4MJWA 4U2TA 3D1CA 5KRQA 1PJ5A 2C3CA 3NGCX 4EQSA 3H4KA 3AE4A 2R46A 2XLTA 4A5LA 1GRHA 2WESA 3CN8A 3NYFA 1JRZA 4EM3A 2R4JA 4TLXA 1ZK7A 4FDCB 2YLTA 3AYJA 2PHHA 4B69A 4B67A 3NK0X 1KF6A 4Z2RA 5KVIA 3GDPA 3OZ2A 1S2QA 3B3RA 4EIQA 2EQ6A 2XFUA 3K7QX 1OJCA 1S2YA 2ACZA 4KPRA 3AYIA 2BK4A 2XFQA 3AE3A 4EIPA 1Y56B 4J33A 1GETA 4OPUA 1PBBA 5JCKA 2GH5A 1LJ1A 2R4EA 2WDVA 5EOWA 1O95A 2EQ7A 3AE5A 4RG4A 1KNRA 3NG7X 2GR3A 1NHRA 2VRLA 4DSGA 3GDNA 1N4VA 2YLRA 3KPFA 5IPYA 4BK1A 1F8SA 1LVLA 1EL5A 4TM1A 2CULA 4H4XA 3ALLA 2YQUA 4H4PA 1CJ3A 4AT0A 1Z6LA 2WETA 4B1BA 4EM4A 3ALJA 2GR2A 1PS9A 2QA1A 2QCUA 4D03A 4LIIA 1BWCA 5C3JA 2V61A 1DODA 4U8NA 1M64A 1GT8A 3CIRA 1H86A 3CNJA 4FK1C 5JCNA 3S5WA 5ER0A 1ELIA 1GRTA 1DJQA 3EPTA 2CFYA 4UP3A 3B6DA 1YQ4A 4RG3A 1KSSA 4C74A 1PDHA 4YTNA 3BI4A 2WEUA 3QFBA 4NTEA 3UKLA 4RSLA 3VQRA 3UKKA 3GMCA 2YAUA 4H4UA 4NZHA 4GDEA 4ZCDA 1LV0A 4YSHA 3AD8B 3CPIG 5GRTA 1D7YA 1K4QA 2FJEA 1NAAA 1D4DA 3NNEA 1M6IA 2YG4A 4DSHA 1FEAA 3UKFA 3ZYXA 4U8KA 4AOXA 4XXGA 1IJHA 4GCMA 4H50A 2J3NA 4KX6A 4K5SA 3ICRA 3UKPA 1DXLA 4WCTA 3FMWA 4IA6A 3UTFA 3ALMA 4UDPA 2QA2A 2YLZA 1GPEA 2B7RA 1PXBA 1BZLA 2OLOA 3K7TA 4H4YA 4P9SA 4CRTA 3LZWA 2VVMA 4H2NA 2OA1A 2YM1A 1XHCA 1BGJA 3UOYA 1DJNA 4Z2TA 4YTPA 1D4EA 1CJ4A 3P4SA 2V5ZA 1H7XA 2BS4A 2WQYA 1B5QA 2BXRA 2TMDA 4LU6A 2R9ZA 4JN9A 2B9YA 4H2QA 2H89A 3GWDA 3NT6A 1TRBA 4U8LA 2XVJA 5IQ1A 1TDOA 3UOZA 4A9WA 3LJPA 3UTHA 1ZMDA 1TDNA 2YG6A 1GSNA 2XFOA 2ZZCA 3K30A 3KKJA 2Y6QA 4I59A 1L0VA 1PJ6A 2C64A 2XLSA 5LV9A 2GQWA 1IUUA 1S3BA 2OALA 4J56A 1PXAA 1XDIA 4X9MA 4X9NA 2YR6A 4IVOB 4O5UA 2A89A 2IVEA 3AE6A 5C2TA 1ZDLA 5KXJA 1GRBA 4LA1A 4A65A 2WPFA 3ABVA 2NVKX 3F8RA 3L1RA 4GDPA 3G5QA 1RP0A 5BULA 5EB5A 1DNCA 4H7UA 3DH9A 3M12A 2PYXA 3QSSA 3QSEA 3Q9TA 2VQBA 4TLZA 4OVIA 4A99A 1ZP0A 3DJGX 3VRDB 4YXDA 1GOSA 3AE8A 3CNPA 1B37A 3E1TA 2C75A 2X8GA 3AXBA 2XLUA 1CHUA 1IUXA 3OC4A 2GVCA 4UDRA 2VRMA 4E0VA 1ONFA 3CTYA 4XWRA 3ZDNA 2FJBA 1PJ7A 1H7WA 1OJDA 1E39A 1H83A 4JY2A 2BYBA 1CBOA 1JU2A 2BABA 3DK9A 3UTGA 3V3NA 5J60A 3DGZA 3G5RA 3AB1A 3CPHG 1IUSA 4K2XA 2Z5XA 2BS2A 3T37A 2WP9A 3ATQA 4XWZA 1PBCA 2YM2A 3G5SA 3ITJA 4D04A 5FS9A 4JDRA 1XPQA 1ZMCA 2GAHB 1ZOYA 2YWLA 3UKHA 4EQXA 2YG3A 3LADA 4APNA 3AECA 4TM0A 3F8DA 2FBWA 2BA9A 3O0HA 2Q7VA 1N4UA 2XLRA 4H4RA 2JAEA 3QSMA 4ZN0A 2WOIA 2ARDA 2BACA 4EMJA 3NTAA 3P4PA 5KWFA 2F5ZA 3AYLA 2BCPA 2XVFA 3NK2X 4BJZA 2XFPA 1KDGA 5CQFA 3AEDA 1KFYA 3SQPA 3P4QA 5CKUA 2X3NA 1H81A 1S3EA 2GMJA 4Z44A 4CCQA 2E4GA 1PXCA 3CNTA 2WS3A 2R45A 4OPLA 2GAGB 2V6OA 3SM8A 1TDEA 2XDOA 4J31A 4JNQA 1GEUA 2GV8A 4Z43A 3NN6X 4M52A 5FS8A 4C3XA 2QAEA 3I6DA 4WX1A 3H8LA 4ZCCA 2AAQA 3WE0A 1E1KA 5BUKA 1NHPA 2FJAA 1COYA 2ZZ0A 1VQWA 4J34A 5JCLA 1F6MA 2Z5YA 4Y4NA 4CBQA 1H84A 1D4CA 1GRGA 1Q9IA 1BKWA 3AWIA 1YQ3A 3CGEA 3GD4A 4YTMA 4A7AA 4CNJA 4HA6A 3V3OA 2WDRA 1TYPA 5IQ4A 4H4VA 4U2LA 4EQRA 2GR0A 2V3BA 1F3PA 2GEWA 2BCGG 2VZ2A 3NLCA 3CNDA 3GSIA 4H2RA 2WDQA 2C73A 3QJ4A 1L9EA 3CPJG 4Z26A 4AP1A 3ICTA 2JB2A 4OPGA 4REKA 2APGA 3UOXA 5M0ZA 4H4WA 1JOAA 3QFAA 1FEBA 4J57A 1MOKA 3VRBA 1ZOVA 2BS3A 3GYIA 4U8MA 4ADWA 2XVIA 1BF3A 4TM4A 1P2HA 2BXSA 3H8IA 1ZX9A 3CGCA 4YSZA 3LXDA 1EBDA 1EL8A 2WHDA 5U1OA 3FBSA 2DKIA 1FCDA 1CJ2A 2B76A 1VDCA 3URHA 3AE7A 2R0GA 1DOCA 5FS6A 3L8KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E1MA 1QGVA 3KLJA 2HSHA 3ISOA 3KH9A 2O85A 4KA0A 4OPIA 1E1NA 2H88A 1EV4A 4MJAA 1CC6A 4EUYA 4J36A 3FK8A 4FQUA 2YWMA 2I4AA 3BJ5A 3WT1A 3EC3A 4YWOA 4MJCA 4E8EA 2UZZA 2VD0A 2BC1A 4TXOB 1TI1A 4BK3A 3NTDA 3TJJA 4G74A 4JU5A 3Q74A 5B8BA 2C66A 2GRTA 2GSRA 4Y4MA 3RP8A 1DUGA 2X8CA 2Q0LA 2M80A 4NEVA 3LEFA 4MDCA 2A2RA 5D9TA 4NAXA 1FAAA 3A2VA 3COXA 1CL0A 1H4OA 4K6XA 3IHGA 1TYTA 4DSRA 4C74A 1MDJA 1NG3A 1X5CA 2YP6A 3GRXA 4FK1A 2AUVA 1GESA 3GKKA 4JNAA 2RGOA 2H1BA 4GSNA 3U5RE 3C1RA 5H5SA 1Y0PA 4B66A 4CHSA 2WU5A 4QQ7A 3G7IA 4MZBA 9GSSA 3AEEA 1JZOA 4MP4A 2YCDA 2IMEA 4USRA 1XIYA 2FCHA 2LRNA 1UA5A 3C73A 5F05A 3AEFA 4UDQA 1WRYA 3U6VA 5U63A 1B8XA 3UBLA 6GSTA 1RSGA 2FWEA 4HQZA 1MEKA 5HY5A 1SU9A 4TM3A 4U8PA 1XW5A 5C04A 2YLXA 1WPIA 2JB1A 3P2AA 3RP7A 3W4JA 1QO8A 5U25A 2C76A 1YY7A 5JCUA 5A4WA 3BI2A 3APQA 4JQ9A 4TN8A 2E4AA 1REOA 3GWFA 3AE9A 2TPRA 4JE1A 3NIXA 1E7PA 4GLTA 4IGJA 1ERTA 2H70A 1LQTA 1FECA 2BRYA 2HFDA 1WE0A 1E1MA 2R0PA 2OACA 1PN0A 2FWHA 3H93A 4H2PA 5BRTA 2K8SA 2REMA 4GRFA 2YG7A 4ILFA 2OKAA 3TJBA 7GSSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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