2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
5LV9A 2XVEA 2YR6A 2BYBA 1GESA 1F8RA 4K8DA 2C67A 3BNMA 4XWZA 1LQUA 2V3AA 3T37A 1DOCA 2R46A 4LIIA 5KWFA 1YQ3A 4YSZA 2YVFA 4YSXA 4EM4A 2E1MA 4H4YA 4J34A 1KSSA 4ZN0A 1PJ5A 3AEAA 3BHFA 1IUVA 1D4DA 3GWFA 4O5QA 1D5TA 1ZOYA 1ZX9A 2WDVA 2X8GA 4OPTA 3AEFA 1RP0A 1JNRA 4A79A 1PBFA 2FJEA 2RGJA 1GETA 4H4RA 4A6NB 2Y6RA 1TDNA 3UCLA 2C76A 2C64A 3LXDA 1NHRA 3ABVA 5HY5A 1YY5A 2JB2A 2VQ7A 2OLNA 4PABA 3NN6X 4YTPA 3GSIA 1OJ9A 5JCNA 1FEBA 3P1WA 4NTDA 3DK9A 4H4QA 1JEHA 4OPIA 1JU2A 1H83A 3FMWA 1MOKA 2Q0LA 2RGHA 2IVEA 2C3CA 4CCQA 1PBCA 4JNQA 4U2TA 4O5UA 2R9ZA 2A8XA 2FJAA 1CC4A 1PHHA 3AE6A 1NDAA 1GTHA 3OZ2A 1CC2A 3G5RA 3IF9A 3NYEA 4OPLA 1PXAA 4J2WA 3P4SA 3CNPA 4NTEA 1V59A 4U2LA 1REOA 1K0IA 2EQ7A 4U8NA 5BRTA 3GDNA 2CDUA 3NRNA 3EPTA 1OJCA 2UZZA 4P9SA 2QA1A 2O9ZA 1LVLA 4IV9A 4XWRA 3UTHA 1IUSA 1NEKA 2J3NA 2YLZA 4DSHA 2QAEA 5FS7A 1EBDA 4NTCA 1TYPA 1VRQB 3UOVA 1ZKQA 4X9NA 1CHUA 2AAQA 3CPHG 3AE3A 2YLRA 1QJDA 4H4XA 3D1CA 1H82A 1GPEA 1Y0PA 5CKUA 4ICYA 3VRDB 4Z43A 1KSUA 3AE8A 4Y4MA 1NAAA 2DKHA 2H89A 3EAOA 4A7AA 1FL2A 4EQWA 5GSNA 2YG6A 3R9UA 4H50A 2VRLA 3FG2P 2CVJA 3ATRA 3BI5A 5JCIA 1PXCA 4H2QA 1VG0A 3CN8A 5HYMA 4RSLA 4GUVA 2WP9A 3CNTA 3AYLA 4M52A 3C96A 3NK0X 2XFOA 3UKHA 1OJTA 2V3BA 4U8JA 1AOGA 2W0HA 5KRQA 3L8KA 1PS9A 1Y56B 2BK5A 2OLOA 4REKA 2QCUA 4OVIA 3NHOX 4EQXA 1DJNA 4OPGA 3UTGA 2GAGB 4AP1A 4Z2RA 4USRA 3KVEA 1GOSA 3K30A 3B3RA 1EL9A 2WDQA 3GD3A 3P9UA 3NYFA 4GRTA 4U8OA 5HHFA 2YM1A 2XVJA 3QJ4A 4GF7A 3NNEA 2EQ8A 1E1MA 2BS2A 2XVHA 2WEUA 1CJ2A 2BCPA 3V3OA 3ALLA 2XFPA 3SQPA 1KF6A 3WE0A 4EMJA 2TPRA 3SFEA 3D8XA 3QFBA 3LZWA 2XLPA 1QO8A 3BI4A 2XLUA 3DK8A 3NK2X 1MO9A 1HYUA 1GRFA 1BZLA 4PAAA 5J7XA 4ZCDA 2E5VA 2JB1A 3AEGA 3NN0X 2X50A 3UKFA 4BK3A 2YM2A 3IWAA 2XFUA 1EL7A 2WOIA 2YG3A 2CFYA 3BI2A 4GCMA 3DK4A 1TDEA 5DBJA 2VRMA 4RG3A 4UDRA 4IVOB 4KX6A 3DGZA 3COXA 1H84A 3NG7X 4NEVA 3P4RA 3NTAA 1ONFA 2C75A 1L0VA 5KOXA 1BGJA 2ZBWA 4BJZA 4OPCA 5L46A 1BKWA 3Q6JA 3AB1A 2BABA 3K7TA 4EIQA 3UKQA 1N4WA 3BHKA 1GV4A 4N9XA 1F6MA 4D03A 3GDPA 1E1NA 1E1KA 4JN9A 1ZMCA 4C74A 2VOUA 1F8WA 1GXFA 4H4WA 3AYJA 3G5SA 3K7MX 4ECHA 4YKFA 2R0GA 2QA2A 2XFNA 2A87A 3L1RA 4J31A 4USQA 4C3XA 3CNJA 1QLBA 3P4PA 2HQMA 4Z25A 1VDCA 4B64A 1Q1RA 3NIXA 1D7LA 3OC4A 2C73A 4APNA 2X8HA 3FBSA 2CULA 2GQFA 4U8KA 4BK1A 4LU6A 2C70A 3V76A 2NPXA 2WETA 3AE1A 5FS9A 2GR0A 4EIPA 3ALJA 4JDRA 1PJ6A 2C3DA 5U1OA 5HXIA 3SGLA 4TLXA 2Z5YA 1CBOA 1CJCA 4H4SA 1H7XA 3CTYA 4XXGA 1H81A 2V61A 3FPZA 1B5QA 3O0HA 4Z2UA 3RP6A 4H4ZA 3M0OA 4J36A 4DGKA 2GR3A 5IQ1A 3ISHA 5FS8A 3UTFA 1NPXA 2B7SA 1LPFA 4H2PA 1NHQA 1RSGA 2YAUA 2BC1A 2Q6UA 1CC6A 1GNDA 2FBWA 3H4KA 4C5OA 2YG5A 3AE5A 3GRSA 1KNRA 3NT6A 3CPJG 3AEEA 4B68A 3LJPA 2WU2A 3ICSA 3P4QA 2GV8A 3CGEA 2EQ9A 4CBQA 2V60A 1IUWA 2GQWA 1L9CA 1BWCA 1D7YA 4UDPA 3IHGA 1CJ4A 1NENA 2WP5A 1LTXR 1KDGA 1PN0A 1XHCA 2GRTA 3K7QX 1GREA 4H4UA 2X99A 3UKAA 2YLWA 5M0ZA 1GRAA 1S2QA 5BUKA 3QSEA 1IUTA 3I3LA 2OALA 4IA5A 1JOAA 1DODA 1O95A 1KFYA 2WESA 1D4CA 3C4AA 4YSYA 1XANA 3CIRA 2YLTA 1Q1WA 1ZOVA 2Q0KA 2XVFA 4BJYA 2BC0A 3AD8B 2XLSA 4OCGA 4TM3A 3PO7A 4X9MA 1ZMDA 3CPIG 4H2RA 5CQFA 4C77A 5BULA 5FS6A 3DGHA 2B7RA 4AOSA 3NKSA 4EMIA 1UKVG 1GT8A 3RP7A 3UP4A 3RP8A 1NG3A 3ICRA 5BVAA 1O94A 1EL5A 1PBEA 2VZ2A 3I6DA 3AE2A 5GRTA 2C66A 3B6DA 3GD4A 1GRBA 2WOVA 2APGA 2XVIA 4I58A 2VVLA 3NLCA 3IHMA 2XYOA 3AE4A 5M10A 1BGNA 1KNPA 2WHDA 3H8LA 3QFAA 3SFDA 2FJBA 1IJHA 3NGCX 2YQUA 1E1LA 2BA9A 3AECA 2VVMA 3PVCA 4FK1A 1GRHA 3F8RA 4WCTA 5TR3A 1YKJA 2WDRA 2OA1A 1LQTA 5U63A 3II4A 3CNDA 3GYIA 4OPUA 2ZZ0A 3CGCA 3M13A 3QVRA 4K2XA 2I0ZA 2YLSA 3SM8A 4J57A 2EQ6A 3UOYA 1GSNA 2GAHB 3DJJA 2WPFA 4Z44A 1N1PA 4C3YA 4CRTA 4H4VA 1E6EA 5EB4A 4B1BA 1DXLA 2R0CA 3AEDA 3FIMB 1M6IA 2A89A 2GB0A 2Q7VA 2XCGA 1F3PA 4YKGA 1H86A 5J60A 1FCDA 4GDPA 4ADWA 4JY2A 2YLXA 3AD7B 2BACA 1IUXA 4J33A 4U2SA 3UKKA 2GH5A 2GF3A 1JRZA 2JBVA 5IPYA 1TRBA 2WBAA 2C72A 3LOVA 4AT0A 2AQJA 3F8DA 1JRXA 2TMDA 3UTEA 1N4VA 3VR8A 4TM4A 2WPCA 4B63A 4CNKA 5KXJA 1ZP0A 4FK1C 2YVJA 2H88A 4B69A 1YQZA 2GMHA 4AP3A 1COYA 5EBKA 1PJ7A 1GALA 3LZXA 3DJGX 2XLRA 4H4PA 4HA6A 1TDKA 5C3JA 2WPEA 1RYIA 1PBBA 2GVCA 2B76A 3GMBA 1FEAA 4K22A 2ACZA 4EQRA 1B8SA 1GEUA 1ZK7A 4DNAA 2BXSA 2GR1A 3CGBA 3DA1A 2WS3A 1S3EA 2V5ZA 4JQ9A 3UP5A 5KOWA 3JSKA 3GWDA 1Z6LA 3ALMA 3LADA 1CL0A 4U8PA 4NZHA 3RNMA 1MXTA 3BNUA 2BCGG 2VQBA 2XFQA 3E1TA 1K0JA 1LJ1A 1YQ4A 4GDEA 1L9DA 2RGOA 2R45A 4GR1A 4HB9A 1XDIA 4H4TA 3DJDA 2BK4A 1GRGA 2PYXA 3NK1X 2GR2A 4E0VA 2E4GA 4TM0A 3RHAA 3ATQA 3VRBA 1JRYA 1P2EA 2B9XA 4BV6A 2DKIA 1OJAA 3CGDA 3NYCA 2YR5A 2IIDA 4OPDA 3DMEA 3H8IA 4K5SA 3ADAB 1TYTA 3ZYXA 1B37A 1FECA 4YT0A 1NHPA 4A6NA 3LB8A 4I59A 5C2TA 3CNSA 3AXBA 1D4EA 4JNAA 2JB3A 5FMHA 5EOWA 2XDOA 1GTEA 4AT2A 1NG4A 4U8LA 3REDA 2FJDA 4A5LA 1K4QA 3QSSA 5KVHA 4H2NA 2BS3A 3GMCA 4YWOA 2YVGA 2ARDA 2PHHA 3VQRA 1JNZA 4TLZA 4X4JA 1K0LA 4WX1A 4KPRA 1VG9A 3HZLA 3KPFA 1ZDLA 3VRAA 2R4JA 3AYIA 4K7ZA 4RG4A 4Z26A 1PXBA 1GERA 4YTMA 3QSMA 4CCRA 1XPQA 2Y6QA 1EL8A 2XLTA 2YWLA 3AD9B 4EMWA 4JY3A 3V3NA 1E39A 2WQYA 4Z2TA 5U25A 4A99A 4Y4LA 4J56A 3UOXA 4BURA 1SEZA 1CF3A 4CNJA 4ZCCA 2Z5XA 4LA1A 4U8IA 1B4VA 4UDQA 5ER0A 1H7WA 2GMJA 3NH3X 2RABA 5JCLA 3AE7A 5JCMA 2R4EA 5IQ4A 1CJ3A 1ELIA 5KVIA 2WU5A 3EANA 2JKCA 3G5QA 4YTNA 3KU9A 3C4NA 2BS4A 2AR8A 3ZDNA 1PBDA 2C65A 5EB5A 4EQSA 4UP3A 3S5WA 3KD9A 1TDOA 3QVPA 4A65A 3VR9A 2NVKX 4Z24A 1DNCA 3AE9A 2YG4A 1Q9IA 2X8CA 3ITJA 3URHA 1P2HA 3NTDA 1OJDA 4YXDA 1X31B 3M12A 2WOWA 4K5RA 3UKLA 4YSHA 1PDHA 1Y56A 1F8SA 2B9YA 2V6OA 3EF6A 4BK2A 3KLJA 1N4UA 1H6VA 1E7PA 1L9EA 1NHSA 2F5ZA 4FDCB 1S2YA 2WP6A 2X3NA 1DJQA 2BK3A 2GEWA 4TM1A 4D04A 4FX9A 1IUUA 4NEWA 1DOBA 4AOXA 2YR4A 4IVMB 3UOZA 4CY8A 4B65A 1FOHA 1LV0A 2JAEA 2ZZCA 1DOEA 4B67A 2IVDA 3DJEA 3F8PA 3DH9A 1TDFA 3PS9A 4H7UA 1VQWA 4CY6A 2JK6A 4MJWA 3GRTA 1W4XA 3UKPA 2B9WA 3AWIA 3KKJA 4B66A 3IC9A 1S3BA 2R0PA 2VVLG 3AEBA 3ICTA 4U8MA 1BF3A 1M64A 3Q9TA 1ZY8A 4DSGA 2ZZBA 4A9WA 4IA6A 2OAMA 3GYJA 4Y4NA 5JCKA 2BXRA 1O5WA 3KA7A 2C7GA 4EM3A 1GRTA 2YG7A 3S61A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PNFA 2BYBA 1GESA 4OFTA 4E8HA 4PXOA 2C67A 1LQUA 3T37A 3A5IA 1QMVA 1KTEA 3LJRA 4ZN0A 4O7HA 4ISDA 1ZOYA 1K3YA 1GTBA 1O85A 2FJEA 2VIMA 1NSWA 1YY7A 4XRAA 5D9TA 2Y6RA 2C76A 2C64A 3W4IA 1YY5A 1HNCA 4KW6A 1IYHA 3DK9A 4PQ1A 4H4QA 2YWNA 1DDOA 2RGHA 1T00A 4Q5RA 1ERTA 5C00A 2OE3A 4JNQA 4U2TA 4JRRA 3VWXA 1XG8A 3AE6A 1AQXA 1SD9A 2L59A 2KP2A 1V59A 4I8BA 4U8NA 5BRTA 4I97A 5CNWA 3EPTA 2O9ZA 2YOIA 4JBBA 4GCIA 3FZ5A 4NTCA 1ZKQA 1PSQA 1TRWA 3ZYWA 1CHUA 2AAQA 3AE3A 2GT6A 3FZAA 3LORA 5IPHA 4H4XA 1GPEA 5IIZA 4Z43A 1KSUA 3AE8A 2C0DA 5ECQB 3KD0A 3GSSA 3EU4A 4CW9A 4EQWA 5GSNA 3FG2P 2YP6A 1SKRB 5IO2A 1VG0A 4QFDA 4RSLA 5IMAA 2K6VA 3HVNA 5ID2B 2WP9A 4M52A 3C96A 5D96A 2TRXA 1OJTA 2V3BA 2WGRA 2NVLA 1EP7A 4X0XA 4OPGA 5G30A 4Z2RA 1JZDA 3KVEA 4GRTA 3GD3A 1EL9A 3P9UA 1K0CA 2XVJA 4F03A 2QSIA 2L4QA 3QJ4A 4XS1A 3CXGA 2EQ8A 1WWJA 2E2GA 3HXSA 2WEUA 3D0ZA 2IWTA 2XFPA 2P5QA 2TPRA 3LZWA 3SXIA 1EV4A 4ZILA 2XLUA 3NK2X 1HYUA 4PAAA 5J7XA 2E5VA 5D93A 3O76A 2RUEA 4BK3A 2H75A 1EL7A 1GSDA 3D22A 5AIVA 1PQNA 3UBLA 5KMRA 4KE3A 1XVWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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