2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
1COYA 1MOKA 1ZMCA 3CGDA 4YSZA 1EL7A 3GD3A 5HY5A 5M10A 2YLZA 3ATQA 1P2HA 4A9WA 4B63A 3VRBA 1CJ2A 5KRQA 1E7PA 4OPIA 4K22A 4EMJA 2V60A 2VZ2A 4DSGA 2XFQA 5KVIA 3RP7A 4C5OA 2JK6A 2VVLG 1QLBA 3ALLA 1ZOYA 2JAEA 3NIXA 1Q9IA 1NENA 2GH5A 3EF6A 3NH3X 4IA5A 3KKJA 4H4QA 1E39A 3LXDA 2ZBWA 2RGHA 3ABVA 3BHKA 5FMHA 2GEWA 3P4RA 3NYFA 4EQWA 1GRGA 3GMCA 3AYIA 1BZLA 3LOVA 4Y4NA 2GR1A 2RGJA 1OJ9A 1Y0PA 2WPCA 4A6NA 3GYJA 4BK2A 2WOVA 3ALMA 4Z26A 2JB3A 4FK1A 3NK2X 4A99A 4OPLA 1DOBA 3NKSA 4K5RA 3CIRA 3G5SA 2J3NA 1PN0A 2XLPA 1TDEA 2X8GA 1GERA 5L46A 4U8OA 1LQTA 3GSIA 1PJ7A 2X99A 2XVEA 1E1LA 3DA1A 2V3AA 1B5QA 4U8LA 2XVHA 1QO8A 4KPRA 4REKA 4TLZA 4X9NA 1KSSA 3UKKA 2OLOA 1O5WA 4N9XA 2YVFA 5KXJA 5CQFA 1CC2A 4JY2A 1NHPA 3DK9A 2BYBA 1GT8A 2A8XA 2YM1A 4CY6A 3CGBA 1O95A 4J36A 2C72A 3AYLA 3NK0X 4LA1A 1LJ1A 3QSEA 3VR8A 1OJDA 3BHFA 2GR3A 4J2WA 5U25A 2QA1A 5KOXA 4BK1A 3LZXA 2YG3A 4TM3A 1B8SA 1IUXA 1XDIA 1NG4A 1E1NA 2YG6A 4HA6A 2C65A 3K30A 3DK8A 4RG3A 5M0ZA 3SFEA 4EQSA 2FJAA 1GRBA 4JQ9A 4TLXA 5DBJA 3P4PA 3WE0A 2R4JA 3LB8A 5EOWA 4FDCB 2GVCA 2RABA 1GTEA 3T37A 1K0IA 4B1BA 2YLTA 3VRAA 5LV9A 4IV9A 3M0OA 2WU2A 3FMWA 2W0HA 5BUKA 2GQWA 2AQJA 1S2QA 2WDRA 4WX1A 1IUTA 2YR4A 4GR1A 3UP5A 2BA9A 3AE5A 1YQ3A 3ZYXA 1ZP0A 3K7MX 3NN0X 2YVGA 1O94A 4U8JA 4EM3A 4CRTA 4EMIA 1AOGA 3D8XA 4YTNA 1L9EA 2BXSA 3DGHA 4USRA 4B67A 1IUWA 3NTAA 1GTHA 4BV6A 2YG7A 3LJPA 4TM4A 4ECHA 1K0LA 1M6IA 4YKGA 3DMEA 2A89A 3NNEA 4ZCCA 3SGLA 2ACZA 2XFPA 3CNJA 2GB0A 1IJHA 3KA7A 1PXBA 4NTCA 4UDRA 4BK3A 3CPHG 2Z5YA 5JCKA 2E5VA 4OPUA 1TDNA 2BS2A 4X4JA 2EQ6A 2FJBA 2YG5A 4LIIA 2CDUA 2A87A 3BI5A 2DKIA 2NPXA 3CNSA 3RP6A 3QVPA 4B65A 3C4AA 1QJDA 4APNA 2B7RA 1CHUA 3PVCA 1BKWA 2TPRA 1PXCA 2GRTA 2V61A 3UKPA 1YKJA 4IA6A 4EQXA 1F8RA 1GREA 4Z2TA 1DJNA 1FL2A 3RP8A 2VVLA 1NHSA 3AD7B 3ICTA 3AE2A 3B3RA 1VRQB 4EIQA 1N4WA 2X8CA 3NTDA 1GRHA 4Y4LA 1TYPA 2BCGG 2OAMA 2WP6A 5ER0A 2JB2A 2WEUA 1H81A 2E4GA 2C7GA 3AECA 3AEFA 2QA2A 3GRSA 3PS9A 3VQRA 2YLSA 2YG4A 2XVIA 4GUVA 5BRTA 2APGA 4H4RA 3LZWA 4K7ZA 3VR9A 2GR2A 3UOZA 1JNZA 4AOSA 4J34A 4EM4A 4OCGA 2V3BA 2I0ZA 4A5LA 4IVMB 4YSHA 1GRFA 2IIDA 2YLWA 3AYJA 4H4UA 5HXIA 1EL9A 4U8KA 3EAOA 1Q1RA 2B7SA 1ELIA 2WPEA 2R4EA 4X9MA 1OJTA 3UOVA 3V3NA 1SEZA 2XVJA 4RG4A 1LVLA 2YR6A 1Y56A 3IHMA 4YTMA 1GRTA 1VG0A 2GMHA 1RP0A 4U8IA 3NN6X 4BURA 1CJCA 1XANA 3AEAA 4YXDA 1BGNA 1L0VA 2Y6QA 1EBDA 2R46A 4GRTA 4OPGA 3UTHA 1S2YA 4GDPA 4O5UA 3F8DA 2AAQA 2X50A 3DJDA 4ZCDA 3LADA 4YSYA 1GESA 2Y6RA 3M12A 3QVRA 4KX6A 4Z44A 5IPYA 5FS6A 1TDOA 3GD4A 3C4NA 3AE6A 3QJ4A 3P9UA 5BVAA 1PXAA 1BWCA 3L8KA 3AEGA 3UTGA 2JKCA 2PHHA 2BXRA 2GAGB 2DKHA 3AE1A 1GOSA 4H4VA 4Z25A 1GXFA 1OJCA 3CNTA 4NEVA 5JCMA 4J56A 3KD9A 1PS9A 5GSNA 3B6DA 2H88A 2V5ZA 3PO7A 2C67A 3Q6JA 4YT0A 1KNRA 3UCLA 1DOCA 3K7TA 1JU2A 2GV8A 4U2TA 1GRAA 2XFUA 2XLRA 4OPTA 5U1OA 1H86A 4B64A 5JCNA 4AOXA 4OVIA 2YM2A 2BS4A 4H4SA 1PBDA 2ZZBA 2YVJA 1Q1WA 2VQ7A 2C66A 2BC1A 1NHQA 3BI2A 1FEAA 2CFYA 3KLJA 2XDOA 1D4CA 1JNRA 3C96A 4H4YA 1ZY8A 2C70A 1GV4A 3QFBA 5J60A 1ONFA 1LV0A 2XVFA 1EL5A 4UP3A 3Q9TA 1GSNA 2WOIA 2VOUA 1XHCA 4ADWA 3D1CA 3E1TA 4FK1C 3KVEA 3ISHA 3NYCA 4ICYA 3DJGX 1GALA 1D7LA 2FBWA 2WETA 2WOWA 3DH9A 2VRLA 4Y4MA 1K0JA 2Z5XA 3BI4A 5JCIA 4OPCA 4B69A 3UKLA 3AD8B 1H82A 1JRXA 2XLUA 4HB9A 1HYUA 1DODA 1F3PA 2RGOA 2YWLA 1DNCA 1PJ6A 3IC9A 1ZK7A 2IVDA 1GNDA 3VRDB 4JY3A 3V76A 2X8HA 2HQMA 2WESA 3REDA 3M13A 5KOWA 3H8LA 3OC4A 4H4TA 4H2RA 2FJEA 4B68A 4GF7A 1DXLA 2Q7VA 1VQWA 4XWRA 5GRTA 4P9SA 2GQFA 1Y56B 4DGKA 5J7XA 5C3JA 5BULA 3KU9A 3NLCA 1REOA 4AP3A 1VG9A 2JBVA 1NG3A 1LTXR 4Z2RA 1NHRA 2XLSA 3COXA 3FG2P 1TDKA 4BJZA 4YWOA 2GAHB 4I59A 4JDRA 4A6NB 1D4EA 4C3XA 1JRYA 3UKAA 3IWAA 3QFAA 3UKQA 1PBBA 2H89A 3G5QA 2FJDA 3FBSA 3S5WA 5CKUA 3ADAB 4D03A 3BNMA 1FCDA 2WPFA 5KVHA 1H83A 1F6MA 3AE4A 4H2PA 2XLTA 2YLXA 2IVEA 3CNPA 1ZKQA 1TDFA 2EQ7A 3K7QX 1PJ5A 1ZDLA 4C74A 3GMBA 1L9DA 3GYIA 3CPJG 4K2XA 2OALA 1FECA 2C73A 2CVJA 2YLRA 3ZDNA 3AE7A 4E0VA 1ZX9A 2B9XA 1TRBA 2WHDA 4I58A 3CGCA 2R0GA 2C3DA 4C77A 3GRTA 4AT2A 1GPEA 4GCMA 1CF3A 2X3NA 2BK3A 3NT6A 5HHFA 1CJ3A 3AEDA 3I6DA 4GDEA 4J57A 3FPZA 3UOYA 4U8MA 1PBCA 4A79A 4J31A 4TM1A 1K4QA 4YKFA 2Q0LA 1S3EA 1JEHA 3CNDA 1NEKA 2CULA 3AEEA 2B9WA 4UDPA 5U63A 1IUUA 2V6OA 2XFOA 3DGZA 1V59A 2WQYA 3NGCX 4Z24A 3URHA 4AT0A 3RHAA 4A7AA 3DK4A 4XWZA 4CY8A 1Z6LA 2C3CA 2WDQA 3UP4A 2YAUA 1MXTA 1D5TA 4PAAA 3H8IA 4U2LA 1LPFA 2ZZCA 2EQ9A 3I3LA 4TM0A 2Q0KA 4DSHA 1F8SA 4IVOB 4NTEA 3CGEA 1BF3A 3L1RA 2VRMA 3JSKA 4MJWA 1F8WA 4NEWA 2YQUA 4WCTA 5TR3A 4U8PA 3RNMA 3AE3A 1PHHA 3AEBA 3AWIA 1YQZA 5EB5A 1YY5A 1CC4A 4M52A 1PBEA 1P2EA 3V3OA 1UKVG 1W4XA 2BK5A 3FIMB 3GWFA 4H7UA 4O5QA 3QSMA 4RSLA 4YTPA 3UKHA 3NG7X 4D04A 3H4KA 1KF6A 2C76A 2GMJA 2WS3A 4H2QA 1TYTA 3OZ2A 4USQA 1XPQA 4H50A 3EANA 2BK4A 2GR0A 3CPIG 1CBOA 1KFYA 2QCUA 2WU5A 3ALJA 4H4WA 2B9YA 4H4PA 4K8DA 1H84A 4U8NA 1D7YA 1RSGA 1FEBA 2R9ZA 2O9ZA 3GWDA 1B4VA 1FOHA 4EMWA 1DJQA 2BS3A 3G5RA 5EB4A 4YSXA 1PDHA 3R9UA 4BJYA 2BC0A 3ICRA 1E1KA 2R45A 3ITJA 3AE8A 4JNAA 2NVKX 2XYOA 4FX9A 2C64A 2PYXA 1CC6A 4EIPA 4Z2UA 4U2SA 2WP9A 2R0PA 1MO9A 4PABA 2F5ZA 4EQRA 1JRZA 2BACA 2C75A 3CN8A 3DJEA 3P4SA 4CCQA 3AD9B 2AR8A 1EL8A 3F8RA 2EQ8A 2XCGA 2XFNA 3NRNA 2UZZA 5IQ1A 3EPTA 2ARDA 2ZZ0A 3QSSA 1KDGA 5C2TA 1GEUA 4JNQA 1LQUA 2BCPA 2JB1A 5JCLA 1H7WA 3AE9A 3SM8A 3UTFA 4JN9A 2TMDA 3O0HA 4NZHA 4Z43A 1H6VA 3SFDA 4C3YA 4CCRA 4AP1A 1KSUA 2GF3A 5HYMA 3HZLA 2WBAA 4H4XA 4OPDA 3ATRA 1BGJA 4A65A 2WP5A 4J33A 3AB1A 1B37A 1E1MA 3SQPA 4NTDA 1E6EA 1OJAA 3GDPA 1VDCA 3BNUA 3GDNA 2BABA 1PBFA 3S61A 4DNAA 1ZMDA 4ZN0A 5IQ4A 2OLNA 4H4ZA 2OA1A 2R0CA 2Q6UA 1JOAA 3NHOX 3UOXA 3UTEA 2WDVA 3UKFA 1N1PA 3NK1X 2YR5A 1H7XA 4K5SA 1IUSA 1DOEA 1YQ4A 5FS9A 1X31B 3II4A 1M64A 5KWFA 1ZOVA 1D4DA 1N4UA 3IHGA 1N4VA 1L9CA 2B76A 2VVMA 3CTYA 1IUVA 1GETA 4CBQA 1KNPA 1S3BA 3P4QA 5FS7A 1NDAA 5FS8A 4UDQA 1CL0A 3ICSA 1CJ4A 3KPFA 4XXGA 3AXBA 2VQBA 5EBKA 4B66A 1RYIA 3P1WA 3IF9A 3NYEA 2QAEA 4H2NA 4LU6A 4CNKA 1NAAA 1NPXA 3DJJA 4CNJA 2E1MA 3F8PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EC4A 2IJYA 4KSMA 5M10A 2C8UA 3BCKA 3ATQA 1P2HA 4A9WA 4JR6A 5HR3A 4B63A 3VRBA 5KRQA 4OPIA 4K22A 2M72A 5CRGA 1TU7A 2VZ2A 2MMZA 4K8MA 2VIMA 4NNJA 4GCIA 3KZQA 4EVMA 2VVLG 2C1YA 3HJOA 5ID2A 2TIRA 2GH5A 3GHAA 3EF6A 1HQOA 3NH3X 3QFAC 1Z7PA 3I43A 3KEBA 4BL7B 1Y6EA 3MDKA 2RGHA 3BHKA 2A2RA 3ZIJA 1C0LA 3ABVA 3W8JA 4BWQA 3SX6A 5KN3A 4ECCA 1MTCA 1DBYA 1BZLA 2RGJA 1XVWA 2JB3A 2VL3A 3NKSA 2K8SA 2OBKA 4EO3A 4MZBA 2J3NA 4NPBA 2CX4A 2XVEA 2V3AA 1B5QA 4ZBDA 3D4MA 4RI7A 3ZYWA 2CA8A 2GDRA 5KXJA 2KLXA 4EDYA 5CQFA 1NHPA 3DK9A 1S3CA 4DSSA 1GT8A 3MSZA 1CQGA 5ECRB 2A8XA 2YM1A 3CGBA 2P31A 3IBHA 3AYLA 2V6KA 4LA1A 2BRYA 1OJDA 3BHFA 3RBTA 2DIZA 3IA1A 4X43A 1TRVA 4TM3A 2RUEA 4HEA2 5J9BA 2P5QA 3RHBA 3US3A 3HVVA 2VD0A 4EQSA 5M0ZA 1GL8A 2R4JA 5EOWA 2GVCA 4B1BA 1GP1A 1TK5B 1ZMAA 3CUKA 4OD7A 1BJXA 3L0HA 5BUKA 2GQWA 2EIOA 4IP1A 2CVBA 3MWHA 4GR1A 2HSYA 4OCEA 1RQMA 2LV3A 4JZQA 2YVGA 1O94A 1I5GA 4EM3A 2FA4A 1TDIA 2IMFA 4YTNA 3DGHA 4USRA 4TRXA 1OC3A 4FQUA 1GTHA 2F9SA 5DVBA 1AN9A 1M6IA 4YKGA 3DMEA 4X1UA 5IQYA 1JLVA 3NNEA 4ZCCA 3SGLA 5GAPD 5C00A 3CNJA 4BK3A 1M9BA 1SJIA 1B4QA 1IJHA 4UDRA 5KMQA 1PGTA 4HJ2A 2DJJA 3I69A 1GUHA 2BS2A 3W4IA 4KSOA 4X4JA 4LIIA 2DKIA 1C0IA 1Q98A 2N5BA 3RP6A 3C4AA 4ID0A 4HU9A 2HZFA 1CHUA 5A4WA 3UKPA 4V1Ap 3DYRA 4MJBA 1YKJA 1S3RA 4GWRA 4EQXA 1U3AA 4Z2TA 3RP8A 1FL2A 5IIZA 3EMXA 4PTSA 1PMTA 2JSZA 3D0ZA 4EIQA 2IN3A 3NTDA 1A2MA 4CDOA 1OC9A 3TOTA 2E4GA 1IYHA 1O73A 4IJ3A 3GRSA 3VQRA 17GSA 5BRTA 9GSSA 4GQFA 3VR9A 2LUSA 4EM4A 4J34A 4IVMB 2IIDA 3AYJA 2CVKA 4ECBA 2WZ9A 2QGVA 3E9JB 11GSA 2B7SA 1FVJA 2R4EA 4X9MA 3SXIA 4CW9A 3Q74A 1QUWA 1PL1A 2LJAA 4IJIA 1Y56A 2O85A 5DJMA 1GRTA 4YTMA 3UJ1A 1CJCA 2KP2A 1QQ2A 1E2YA 3KJYA 1DSBA 3UTHA 4GDPA 1O8WA 4YSYA 1GESA 4KDYA 4FYBA 1AUCA 7GSSA 4G0IA 5FS6A 3GD4A 1UC7A 4P3YB 4TN8A 2I9HA 3L8KA 1VE9A 1SU9A 3KXOA 1Z6NA 3KTBA 3F0IA 4Z25A 5GSTA 5A4UA 3IV4A 2H6ZA 4NEVA 5JCMA 3WT2A 3M8NA 1PS9A 4WKWA 1ZYPA 1M0UA 3PO7A 4GF0A 2MMNA 1KNRA 3UCLA 1DOCA 1JU2A 2GV8A 4RQXA 3SY4A 3SBCA 2BC1A 1UVZA 13GSA 1JNRA 3C96A 2YZHA 2CZ3A 1ONFA 3FW2A 14GSA 2GLRA 3ME7A 3TKRA 3Q9TA 1GSNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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