2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords RebC
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
1EL9A 2V3BA 3AEGA 3QJ4A 1H86A 5KXJA 4A99A 1H84A 1XHCA 3FPZA 3F8DA 2GQFA 1GERA 3BNMA 3QFBA 4H4PA 2VQBA 3K30A 3G5RA 3REDA 3WE0A 5M10A 2JK6A 2QAEA 2EQ9A 3AD7B 3JSKA 3NK2X 1E1NA 1PXBA 1XDIA 2B76A 2H88A 5BVAA 1F8WA 1CHUA 1O95A 5EB4A 3GMBA 2NVKX 3AE3A 1S2QA 1IUXA 2R0GA 2XLTA 2YM1A 2GR3A 4H2PA 4EIQA 2XLUA 1BGJA 2GVCA 3ADAB 1YY5A 4YTPA 1GTHA 1M64A 1QLBA 4TM3A 2C73A 3URHA 2B7RA 4OVIA 3CNJA 5FS9A 1LPFA 1B5QA 5IQ1A 2XFOA 4H4VA 1D7LA 1XANA 4OPLA 3B6DA 2PYXA 4TM4A 4NZHA 2GH5A 4GRTA 2APGA 3NK0X 4BJYA 4DSHA 3M0OA 3R9UA 4YSYA 3DJEA 2Y6RA 4J36A 4D04A 2X50A 2GMHA 4CNJA 1EL7A 3AWIA 5FS6A 3UOXA 1SEZA 3P4QA 2Q0KA 2YG3A 4USQA 3AB1A 4U8JA 4X4JA 3AE8A 1Y56A 4YSZA 5C3JA 5JCMA 3S61A 4EM4A 4K22A 4U2TA 3LXDA 1NG4A 3BI2A 1NHRA 4H4WA 1JOAA 2JBVA 1LQTA 2V3AA 4J2WA 3GSIA 4FDCB 3CN8A 4OPTA 1VRQB 3EANA 2J3NA 3UOVA 1NDAA 1GV4A 2XLRA 3D8XA 1FEAA 4U8LA 3DJJA 1B8SA 1COYA 4Z2UA 2C64A 1H81A 4J34A 1F8RA 2OLNA 4J31A 3NIXA 3IHGA 4JNQA 3ATQA 2XVEA 3C4AA 4Z44A 4ZCDA 4WX1A 3CIRA 3P1WA 3T37A 2FJAA 4J57A 3AD8B 1YQZA 4K2XA 4USRA 1TDOA 2VOUA 1ONFA 2R9ZA 1KNRA 3FBSA 2CVJA 3EAOA 1D4CA 2A89A 2RABA 2IIDA 3IC9A 1PBDA 2YG6A 1PJ6A 3DK8A 1CBOA 3AE6A 4AT2A 1JNZA 3AE1A 1DOEA 4LIIA 5U63A 2Q6UA 3Q9TA 4EQWA 5JCIA 1L9DA 2RGOA 3UKAA 3VQRA 4E0VA 1KSUA 2XVIA 1GRGA 5LV9A 1FEBA 3BI5A 1GALA 1K0JA 2C67A 4EMIA 1F6MA 1QO8A 4H7UA 1YKJA 5HYMA 5KRQA 4P9SA 4YWOA 2GAGB 2ARDA 5KOWA 2GV8A 4AT0A 1RSGA 2WDVA 1PJ5A 4YTMA 3SFDA 4EQSA 4DSGA 2GAHB 4K5RA 5BRTA 3DGHA 4JN9A 4B69A 4BV6A 4EQRA 1KNPA 2YVGA 3UOZA 3QFAA 4JY3A 2AR8A 2EQ6A 4B66A 2C75A 5KWFA 3DMEA 1CC2A 3LB8A 2B9XA 1ELIA 1ZKQA 3FMWA 2UZZA 3P4SA 3QVRA 4AP1A 4IVMB 3NLCA 2YG7A 3AEBA 5HHFA 1Y0PA 3CGCA 4H4XA 4N9XA 3NHOX 3K7TA 3NH3X 1GRFA 1TRBA 4O5UA 1RP0A 2WQYA 3AYJA 2X8HA 2YR4A 2ZZBA 1ZK7A 4A6NA 4C3XA 1KSSA 4NTCA 1QJDA 1VQWA 3PVCA 2WS3A 4IV9A 2BXRA 3RP6A 2WEUA 4NTDA 3LADA 2YLTA 2YLRA 1NAAA 4KPRA 4U8MA 2JAEA 4GF7A 3H8LA 3IHMA 3L1RA 2TPRA 4YTNA 1CC6A 1JRXA 3NN6X 2Q7VA 3LOVA 4BURA 1JEHA 4IA6A 1IUTA 4GCMA 1H7WA 3O0HA 1TYTA 4OPCA 3RP8A 4YKGA 4YSXA 2YLSA 1EBDA 3AEFA 3CGDA 1NEKA 1E1KA 1L9CA 3S5WA 3UKFA 3RHAA 2V5ZA 1NHQA 3GRTA 3KA7A 4Z2TA 1PBFA 1E6EA 1CL0A 5DBJA 2JB2A 2YG5A 2BCPA 4ZCCA 2XCGA 5BULA 1S3BA 1K0IA 1S3EA 4U2LA 2RGJA 4C77A 2CFYA 4H4UA 4APNA 1TDNA 2WOIA 3NYFA 3L8KA 1RYIA 3GRSA 4REKA 2GMJA 1GESA 1PS9A 4B1BA 1IUSA 1GSNA 2XVHA 3ICRA 4U8IA 2NPXA 2V60A 3NTAA 2BS4A 3GD3A 1K4QA 4C5OA 1P2HA 3BI4A 2OA1A 2VQ7A 2VVMA 3M13A 1GOSA 3CNSA 4RSLA 1JRZA 1GT8A 2GEWA 3NNEA 4TM0A 4J56A 3HZLA 2XFQA 1Q9IA 1F3PA 1V59A 2E1MA 2PHHA 3VRDB 4XWRA 1N4VA 3ABVA 3RP7A 2XLPA 3KVEA 3C96A 2V61A 1PHHA 1IUWA 3CPIG 1TDFA 1MO9A 5EBKA 5IQ4A 3H4KA 4Z25A 4EMWA 3B3RA 1GTEA 2Y6QA 2E4GA 4U8KA 1BWCA 3DGZA 2R4EA 5BUKA 4FX9A 3CGEA 4WCTA 3ALJA 1E1MA 1PXAA 1PDHA 1Q1RA 1DJNA 2O9ZA 3GD4A 1IUVA 2WOWA 3UKPA 3NK1X 2BS3A 3UKQA 1B4VA 2OAMA 2BK3A 4NTEA 4BK2A 4UDQA 3FG2P 1Q1WA 3GWFA 2RGHA 1L0VA 3NGCX 2BC0A 1VDCA 1GPEA 2AQJA 2Z5XA 3KU9A 4PAAA 1D7YA 2EQ7A 1BGNA 2V6OA 2BYBA 2YR5A 5GSNA 4EM3A 1PBBA 3AEAA 4YSHA 4A7AA 4IVOB 1GREA 2C65A 2I0ZA 4I59A 4YXDA 4ZN0A 4I58A 4UDPA 3GDPA 1D5TA 3AD9B 1GETA 2GB0A 4OPDA 2C7GA 1N1PA 2XFUA 3CNTA 4B68A 1NENA 4OPGA 3GMCA 1D4EA 1CF3A 3ZYXA 4BJZA 5JCNA 4H50A 4B64A 4IA5A 2FBWA 4EMJA 2BA9A 4CY8A 2XVJA 4A9WA 2F5ZA 2E5VA 2GRTA 2WU5A 1M6IA 1ZX9A 4A79A 3RNMA 4H4QA 1EL5A 3DK9A 4GUVA 2R46A 2VRLA 2WESA 1CJ4A 4U8NA 1DJQA 2Q0LA 3K7QX 4XWZA 3IWAA 3VR9A 3NYCA 3UKHA 3IF9A 3CPJG 3GDNA 2ACZA 2WDRA 3SQPA 2BXSA 1TDKA 2C70A 5KVIA 2GF3A 1DNCA 1E39A 2VVLG 3DA1A 3NKSA 3NN0X 3SM8A 4U8OA 2TMDA 2WPFA 4B65A 3D1CA 4X9MA 4HA6A 1YQ3A 3C4NA 4UP3A 5CQFA 3UP4A 2YVJA 1BF3A 2GQWA 4OPUA 2YG4A 3NT6A 3UTGA 5KVHA 1KDGA 5CKUA 4H4SA 2B9YA 1ZDLA 2JB3A 3KLJA 3DJDA 5FS8A 3EF6A 1ZY8A 3DH9A 2XDOA 4M52A 1BZLA 2VVLA 3NG7X 3COXA 4XXGA 2R0PA 2GR0A 2X8CA 4HB9A 3P4RA 2ZZ0A 2A87A 2CDUA 3AXBA 3P4PA 3AE4A 3AYLA 4H4YA 2WPEA 2WBAA 2Z5YA 4H2NA 2OLOA 2GR2A 1NHPA 3ICSA 3NRNA 3ICTA 2R0CA 1UKVG 3KD9A 3SGLA 1Y56B 1E7PA 4RG4A 4H4ZA 4CRTA 1HYUA 2XYOA 2FJEA 2YLZA 3LZXA 2AAQA 3V3OA 2BS2A 5U1OA 3ZDNA 4PABA 3M12A 3AE9A 4LA1A 4NEWA 3CNPA 5J60A 3F8PA 3Q6JA 3UKLA 1FL2A 1LVLA 4B67A 1AOGA 2XFPA 3UTEA 1XPQA 4Y4LA 2R4JA 1W4XA 3ALMA 1L9EA 4A5LA 2XLSA 3ATRA 2EQ8A 5U25A 4CNKA 5L46A 3UTHA 3BNUA 4GDPA 3LZWA 2WPCA 1FCDA 4H4RA 4Z24A 1N4UA 2QA2A 1MOKA 2WP5A 1O94A 3AECA 3PO7A 3VRAA 3P9UA 2BACA 2CULA 3AE2A 1ZOYA 1PBEA 4JQ9A 3V3NA 1BKWA 1GEUA 2OALA 1JRYA 3GWDA 4TM1A 3OC4A 5FS7A 2FJDA 3KPFA 5FMHA 4ECHA 3LJPA 1PBCA 4D03A 1ZMDA 2C72A 1X31B 1DOCA 2XVFA 3UTFA 4BK1A 3G5SA 4KX6A 2BK5A 2R45A 4CY6A 1P2EA 2WU2A 4OPIA 4JY2A 3QVPA 2WP9A 3II4A 4BK3A 5C2TA 1CJ3A 2BC1A 2YLWA 4U2SA 3UKKA 4CBQA 3H8IA 4H4TA 1GRAA 1LV0A 1REOA 2QA1A 3AE7A 3ITJA 1EL8A 2A8XA 1FECA 3E1TA 1GNDA 4Y4NA 2WOVA 1VG0A 1CC4A 2YAUA 2YWLA 2YVFA 3F8RA 3QSMA 4K8DA 1H7XA 1OJTA 1GRBA 1GRHA 1MXTA 3EPTA 4GR1A 3I6DA 4AOXA 3OZ2A 3QSEA 2FJBA 5EOWA 4CCRA 1YQ4A 4B63A 3ISHA 4AOSA 2IVEA 2BABA 2X3NA 2YM2A 3KKJA 3VR8A 2X8GA 2VRMA 4H2RA 1TYPA 2DKHA 1VG9A 2WETA 4JDRA 4LU6A 1D4DA 1NHSA 4TLZA 1TDEA 3K7MX 1CJCA 1DXLA 2H89A 2WHDA 4C74A 3CTYA 5M0ZA 3AEDA 3AYIA 2DKIA 1NPXA 3GYJA 4RG3A 4A6NB 1K0LA 2WP6A 3DJGX 4X9NA 2B7SA 2VZ2A 2YQUA 1OJ9A 4DNAA 3VRBA 3UP5A 2XFNA 5ER0A 4K5SA 3GYIA 4Z26A 1OJCA 2C66A 1B37A 4U8PA 1OJAA 2IVDA 5GRTA 3AE5A 2YR6A 4Z2RA 4YT0A 3V76A 1N4WA 1IUUA 1LTXR 5JCLA 1DOBA 4DGKA 3G5QA 4Z43A 1LQUA 4K7ZA 3I3LA 2JKCA 5J7XA 1ZP0A 2HQMA 1FOHA 3UCLA 4GDEA 4FK1A 2C76A 1PN0A 3PS9A 1PXCA 5HY5A 2GR1A 3BHFA 5HXIA 1JU2A 1IJHA 2WDQA 1F8SA 1JNRA 4EIPA 2W0HA 1E1LA 1GRTA 3NTDA 3QSSA 4ICYA 4H2QA 1H6VA 2ZZCA 4TLXA 3BHKA 4ADWA 4Y4MA 4CCQA 3SFEA 1S2YA 1ZMCA 3AEEA 1OJDA 4YKFA 4AP3A 5EB5A 5JCKA 1O5WA 4OCGA 4A65A 1LJ1A 1H83A 4O5QA 5KOXA 3NYEA 4MJWA 2ZBWA 1NG3A 5IPYA 4JNAA 4EQXA 2C3CA 1GXFA 1DODA 5TR3A 3CGBA 2B9WA 2BK4A 3FIMB 2BCGG 1PJ7A 4UDRA 2QCUA 2C3DA 2X99A 4NEVA 1H82A 1CJ2A 3ALLA 1KFYA 3CNDA 3DK4A 4C3YA 4J33A 3UOYA 2JB1A 1ZOVA 1KF6A 2YLXA 1Z6LA 3CPHG 4FK1C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KUNA 5IMAA 3AEGA 1UA5A 4MP4A 2ON5A 1H84A 1ML6A 1FG4A 4JBBA 3BNMA 3QFBA 4H4PA 4BL7B 4GQFA 1URMA 2GT6A 3AD7B 4EXJA 4ECIA 1GSUA 2CT6A 3E0UA 2B76A 3SXIA 1AUCA 5EB4A 1OAZA 3QOUA 3E3EA 6GSSA 3AE3A 2R0GA 3QD9A 4OCEA 2YM1A 3HVXA 1A2JA 2GR3A 3R2QA 2NBSA 4EIQA 5IMDA 4V2NA 4RI6A 3URHA 3HJMA 1OC9B 3TKSC 3SZFA 2HRFA 2F8FA 4X0XA 3CNJA 5H5RA 1LPFA 1WPIA 2XFOA 1MDJA 1XANA 4G2EA 2PYXA 2MMAA 3FR6A 2GH5A 3W4KA 4ZXGA 1M9AA 5A4WA 3M0OA 4I5QA 3R9UA 10GSA 3DJEA 4I97A 16GSA 2A4HA 5D93A 3SX6A 3GKKA 3KH7A 1EL7A 3CSHA 1MD4A 3DXBA 4AJ7A 5FS6A 2PVOC 4G73A 4HUAA 4N10A 2EIOA 4USQA 1WOUA 3KJYA 1VF4A 1OC3A 4K7NA 3GSIA 3CN8A 4OMVA 5ID2B 2FWGA 4YQMA 1JZRA 3EYTA 3UAPA 3UJ1A 4K8MA 1GV4A 1NDAA 2XLRA 1EEMA 1B8SA 5ENUA 3ZMKA 1H81A 1F8RA 4J31A 3SY4A 3IHGA 3ATQA 2XVEA 2OA7A 3C4AA 4ZCDA 2R6KA 1PX7A 3CIRA 3RAZA 4J57A 2X4AA 1YQZA 2VOUA 4PX1A 2R9ZA 4PQ1A 3J7Yk 4IS0A 3GA4A 5IPHA 2IIDA 1IYHA 4TR4A 4BVYA 1YEPA 1CBOA 3DK8A 3HJPA 4AT2A 4OFTA 1JNZA 4IBPA 2C1YA 2DIZA 2Q6UA 2E2GA 3Q9TA 5IOWA 1B9YC 1L9DA 2RGOA 2L57A 3ERFA 3UKAA 2RM6A 1GRGA 5EPFA 1K0JA 3UL3A 1V9WA 1YKJA 2EIRA 1RW1A 1VE9A 1SD8A 4G0KA 2CVDA 2TRXA 1PJ5A 4DSGA 4K5RA 3DGHA 4JN9A 4ZL8A 4B69A 4EQRA 2YVGA 3QFAA 3PPUA 5D9TA 2DJ1A 2AR8A 4B66A 5AIXA 1CC2A 1ZKQA 2UZZA 4AP1A 3T31A 1T4YA 3HYXA 2HSYA 4H4XA 3T14A 1PMTA 4YJGB 3QAWA 5DJLA 1KSSA 1K0AA 4NTCA 1FW1A 2WS3A 4NTDA 3LXZA 2A4VA 5DCHA 2YLTA 4GSSA 5J4UA 3IHMA 2JAEA 4YTNA 2TPRA 3NN6X 2H1DA 3GKXA 4IA6A 4GCMA 2REMA 1H7WA 2P0GA 4YKGA 1TYTA 4USSA 3WGTA 3O0HA 4YSXA 4HZ4A 1TU8A 3VK9A 4MPGA 3S5WA 1MDIA 2HSHA 5C04A 3FRCA 4PUFC 3GRTA 1PBFA 4ZCCA 4BWQA 1SK1A 2BCPA 2HXKA 2L6DA 1S3BA 2RIIA 4U2LA 3IR4A 3CTFA 3LSZA 3WGEA 1M99A 2WOIA 3DMLA 3ZNOA 1AQWA 1DSBA 2E4AA 1IUSA 1XWCA 1QQ2A 3ZIJA 2VM2A 3VFIA 3GD3A 2I9HA 17GSA 2DBCA 3M13A 1PQNA 2CX4A 2VL3A 2GEWA 3NNEA 1JLVA 1Q9IA 2YP6A 3GMFA 1M7TA 4PTSA 1J0FA 2V61A 1GLPA 4MJCA 2ZUPA 1A0FA 1SJZA 5IOXA 1BWCA 4F82A 3ZITA 4WCTA 2E49A 3ALJA 2PWJA 1PXAA 1PDHA 1Z5YE 1QMVA 1TDIA 2FLSA 4FYBA 2WOWA 3NK1X 1QGVA 2OAMA 4NTEA 3GV1A 1PN9A 3HVSA 5CNWA 1GL8A 4HJMA 4GSNA 1D7YA 5KN3A 3GH9A 2EQ7A 1BGNA 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