2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
1QLBA 5FS9A 3QVRA 5BUKA 3GYJA 3S5WA 3AE8A 3ZYXA 2A8XA 3UKQA 4A6NA 1KSUA 1D4EA 4C3YA 4Z2RA 1Y56A 2DKIA 5EOWA 1PDHA 2B9XA 3BNMA 4OCGA 1PJ6A 2GQWA 2JAEA 1YY5A 2QA2A 4CY8A 2WU5A 1E1NA 3M12A 4TM4A 5JCIA 4Z25A 3LZWA 1VRQB 1REOA 3I3LA 4REKA 2RGJA 2OLNA 2RABA 5IPYA 4CNKA 3GRTA 2I0ZA 2C64A 1P2EA 4BK2A 3DJEA 3GSIA 4GDPA 3QSEA 3NGCX 3GMCA 1D7YA 3DJDA 1GXFA 3VRDB 2GEWA 1PBBA 1EL7A 1D4DA 3VR9A 2BXSA 1IUTA 2WOVA 4K7ZA 3OZ2A 3VQRA 3F8RA 3UKPA 2C67A 1B8SA 1EBDA 4J36A 3F8PA 3GWDA 2ZZ0A 2WU2A 2XVHA 1HYUA 2X99A 2VVLG 2UZZA 2XLRA 5FS8A 2XLTA 4Z24A 3H8LA 2C70A 3COXA 2NVKX 1BGNA 4WX1A 2GB0A 3CNPA 4TLZA 2VVMA 4H4XA 3UTFA 2C65A 3ISHA 1KNPA 1RYIA 2PYXA 2ZBWA 4DSGA 1Q1WA 4NTDA 1Q9IA 3NKSA 4C5OA 1PJ7A 2RGHA 4A5LA 4RG4A 1V59A 2JKCA 1JEHA 1GRAA 2V3BA 1NG3A 3CN8A 4YKGA 1CC4A 2GH5A 4X9MA 2RGOA 3F8DA 1GOSA 2B7RA 2B7SA 3NIXA 4YWOA 1GTEA 2FJBA 1B4VA 3NRNA 1BKWA 4ZCDA 4BK3A 4DNAA 3FPZA 4K5RA 2YVJA 3Q9TA 2APGA 4EQRA 4YTPA 2FJAA 1S3EA 2C3DA 1EL5A 4U8LA 4CNJA 2WBAA 3QJ4A 4H4PA 3QFAA 3K7TA 4OPTA 3RHAA 1IUSA 1GREA 3DJJA 5BVAA 4U8NA 5GRTA 2FJEA 2WOWA 3I6DA 3AD9B 3DK4A 1MOKA 2WS3A 1VDCA 3AECA 4H50A 4FDCB 3SFDA 4EMIA 5IQ1A 4H4QA 4K22A 1BF3A 1N4VA 3UTHA 1CJ2A 3P4PA 5ER0A 1GSNA 1GESA 5JCMA 3CPIG 3WE0A 4I58A 2Y6RA 1L9CA 2DKHA 1GRGA 2C73A 3E1TA 3AE3A 1LV0A 1DODA 1XANA 2C76A 2YVFA 4H4ZA 1ZMCA 3LB8A 1MXTA 3CGBA 3QVPA 4MJWA 4EM3A 1BWCA 1F8SA 2ACZA 4H7UA 4Y4MA 2IVEA 2JB1A 3DK9A 2GR1A 1F6MA 2XVIA 4TM1A 2BA9A 3NN0X 4M52A 2QA1A 2WQYA 1N1PA 3BHFA 2BABA 2Z5XA 4AT0A 3K7MX 3II4A 3UKLA 2C66A 2V61A 2R46A 3AE1A 3GD4A 4RSLA 1FCDA 2V3AA 2VOUA 2ZZCA 4O5QA 2YQUA 1RSGA 3NN6X 4J34A 4YXDA 2GR2A 3GMBA 1PBCA 1FL2A 4IA6A 1PS9A 4FK1A 1QJDA 4B69A 2XCGA 1O95A 1VG0A 2GAHB 4X9NA 4JNAA 4U8IA 3V3OA 4ICYA 2JBVA 4OPCA 5FS7A 2YG3A 4IV9A 2XFUA 2GV8A 3ADAB 3BHKA 1ZK7A 1D7LA 3NT6A 3ICRA 3NYEA 4GRTA 1O94A 4LA1A 1JRXA 2W0HA 1E39A 1DNCA 4EQXA 2E4GA 1GNDA 1H7XA 3KKJA 4CBQA 1GTHA 4XWZA 1KFYA 2WOIA 3IF9A 2FJDA 1LTXR 3ITJA 2WDQA 1LVLA 1CHUA 2VRLA 4ECHA 4YT0A 3PS9A 3UTGA 5BULA 4YSXA 5FMHA 5U25A 4CRTA 2A87A 1S2YA 3P1WA 3UKKA 4AT2A 2CFYA 4YTNA 3CPJG 4EQSA 4JY3A 3SFEA 4APNA 4NEWA 4UDRA 2BS3A 1PXAA 1E1LA 3DJGX 3T37A 4O5UA 2WDRA 2GR3A 3QSMA 5KVHA 1PXCA 4B68A 2GMJA 1B37A 1ELIA 4BURA 3KD9A 4A7AA 3AD8B 2WPEA 3KA7A 4HB9A 4H2PA 1JNRA 2OLOA 4HA6A 3UTEA 1PBFA 2WPCA 4I59A 1H7WA 1P2HA 3DK8A 3LADA 2XFPA 1LQUA 1YQ3A 3CNDA 2YR5A 3RP7A 3KPFA 1EL9A 1OJDA 3AB1A 1K0LA 3IC9A 3PO7A 4H4SA 4EMJA 5HYMA 3QSSA 2R4EA 4KX6A 2PHHA 1XPQA 1H86A 1PN0A 3AYLA 4H4RA 4U2LA 2QCUA 4Z2TA 1S3BA 1BGJA 4K8DA 4CCRA 4H2QA 2TPRA 3AYJA 1CC6A 3AE7A 2GRTA 2VVLA 3H8IA 4A9WA 2VZ2A 2YM2A 2BXRA 5M10A 2B9YA 4J57A 1X31B 4U2TA 3NK1X 1M6IA 3IHGA 2Q0KA 1FECA 2VQ7A 2FBWA 3QFBA 4RG3A 2WDVA 2BYBA 4BV6A 2BC1A 1GEUA 3UKFA 4YSYA 2YG6A 3AE5A 3VRBA 2V5ZA 3BI5A 1NG4A 4U8OA 2JB2A 2VRMA 3G5QA 2R45A 5KOWA 4D03A 1Q1RA 3D8XA 3UP4A 2QAEA 1W4XA 1GRTA 1TRBA 1YQ4A 2CULA 3NK2X 3NTDA 3V76A 4TM0A 2AQJA 1IUWA 4LU6A 3PVCA 3VRAA 1IUVA 2X3NA 2V60A 4OPIA 2BACA 1B5QA 3GDPA 4U8JA 1O5WA 2BCGG 1L9DA 1S2QA 3RP6A 3ZDNA 5KRQA 4K5SA 4A79A 4EM4A 4XXGA 5HXIA 3KLJA 2WETA 4CCQA 1DOBA 2ARDA 3AD7B 3CPHG 1ZKQA 1K0IA 1TDFA 2BK4A 3AEAA 4EIPA 2OALA 3KU9A 4FK1C 2EQ6A 2V6OA 2WP9A 3G5SA 4YTMA 1FEBA 1NHPA 4USRA 1CJ3A 5HHFA 4C3XA 3ALJA 1PXBA 3CNTA 3UCLA 1NHRA 1VQWA 3ATQA 4GUVA 1LPFA 2GQFA 3RNMA 3CGDA 3FIMB 3K30A 4OPDA 2A89A 5M0ZA 4X4JA 4PAAA 2JB3A 1GPEA 4J31A 3HZLA 4JY2A 5EBKA 1TDEA 1NHSA 2C3CA 1E1MA 1FEAA 1FOHA 3KVEA 3UOVA 3REDA 4AOSA 4EQWA 5KXJA 1SEZA 2CDUA 5IQ4A 1TDKA 3JSKA 3NTAA 1AOGA 1TDNA 5EB5A 1H81A 1OJTA 4B67A 2IVDA 2YG7A 1RP0A 2YAUA 5JCNA 2XVFA 1NAAA 1DXLA 2XFQA 4A99A 3URHA 4AP1A 2X8HA 4Z26A 3SGLA 4JDRA 1JOAA 1ZY8A 2R4JA 1NHQA 4CY6A 3FMWA 3GRSA 4OPUA 1L0VA 1DJQA 3AEDA 1N4WA 5KOXA 3M13A 5TR3A 4Y4LA 3AEGA 4BK1A 4H4WA 3EANA 2BK5A 4JN9A 5JCKA 3LJPA 4OPLA 2GAGB 1TYTA 4KPRA 1UKVG 2XVJA 2OA1A 3IWAA 4GF7A 2H88A 3P9UA 1YKJA 1CF3A 3AE2A 1GRFA 3UOXA 4B65A 2F5ZA 2BS4A 5U1OA 4IVMB 4BJYA 1PJ5A 1H6VA 1CJ4A 3C96A 3DGHA 4WCTA 1GETA 2JK6A 2NPXA 3CNJA 3SQPA 1D5TA 3BI2A 2WESA 3CGEA 4Z43A 3B3RA 4B64A 4GR1A 4AOXA 1K0JA 2XFOA 2WP5A 1ZX9A 4NTCA 3NYFA 1ONFA 2XDOA 3LXDA 3NHOX 1CJCA 1NDAA 1OJAA 1NEKA 3L8KA 4U8KA 3UOZA 2YLWA 4GDEA 1ZMDA 3EPTA 3EF6A 4LIIA 1JRYA 4K2XA 3R9UA 2H89A 2YG5A 3CGCA 4U2SA 3UP5A 4YSHA 3ATRA 3NNEA 5GSNA 4H2RA 3ALMA 2B76A 3D1CA 4UP3A 2CVJA 5CKUA 4YSZA 1E1KA 1ZOYA 3LZXA 1IUXA 1NPXA 2X8CA 3AE4A 3DA1A 2VQBA 2BS2A 3AYIA 4C77A 2BCPA 3GYIA 3FBSA 1TYPA 4D04A 3AEFA 1L9EA 3P4RA 1KNRA 4ADWA 2XFNA 2EQ8A 2IIDA 1PHHA 3C4AA 3GD3A 3M0OA 3BI4A 1PBDA 2E5VA 4B63A 4ZN0A 5KWFA 1Z6LA 4BJZA 4Z2UA 3DGZA 1JRZA 3O0HA 3B6DA 4TM3A 4Y4NA 2WP6A 2EQ9A 1PBEA 5FS6A 3S61A 1CC2A 4P9SA 3LOVA 4B66A 1N4UA 5U63A 3UKAA 2YLRA 2XVEA 1F3PA 1H82A 2AAQA 4UDQA 1CBOA 3DMEA 3V3NA 1BZLA 1ZP0A 4USQA 4GCMA 3P4QA 5BRTA 3K7QX 1GV4A 3P4SA 1E7PA 2R0CA 2B9WA 1COYA 3ICTA 4IVOB 4JNQA 4YKFA 4A6NB 2C72A 1Y56B 4NTEA 3GWFA 1M64A 5DBJA 4IA5A 5J7XA 1GRBA 4U8MA 2XLPA 2WEUA 1GT8A 1IJHA 3AE9A 4JQ9A 1MO9A 3NG7X 2OAMA 1YQZA 1ZDLA 2Q0LA 2Q7VA 2YLTA 3GDNA 1GRHA 5L46A 1DOCA 4NZHA 3NH3X 2R0PA 2GR0A 2O9ZA 3AWIA 3C4NA 3DH9A 2EQ7A 4UDPA 2TMDA 3Q6JA 5J60A 4H4VA 2YLSA 3ALLA 1XDIA 4J56A 5C2TA 3L1RA 3RP8A 4U8PA 2AR8A 1IUUA 4OPGA 4H4UA 1E6EA 1EL8A 2YM1A 3G5RA 2J3NA 1H83A 2C7GA 3AXBA 3IHMA 4J2WA 1JNZA 1NENA 4DGKA 2WHDA 1LJ1A 3FG2P 5KVIA 3CNSA 1KF6A 3UOYA 1DJNA 4J33A 4OVIA 2YLXA 2GF3A 1K4QA 4ZCCA 5CQFA 2YG4A 3UKHA 1GERA 1Y0PA 4AP3A 4C74A 2GMHA 3ABVA 4PABA 3VR8A 3BNUA 3CIRA 5LV9A 3OC4A 2XLUA 1GALA 4H2NA 2ZZBA 3ICSA 3AEBA 4NEVA 2X50A 4E0VA 1LQTA 5HY5A 1ZOVA 1OJ9A 4N9XA 2HQMA 3AEEA 3SM8A 2Y6QA 1DOEA 1JU2A 2R9ZA 1H84A 2Q6UA 4EMWA 4Z44A 2C75A 1KSSA 2YR6A 2YR4A 2WPFA 4XWRA 5C3JA 1OJCA 3AE6A 1XHCA 3H4KA 4DSHA 2YWLA 4H4TA 4B1BA 5JCLA 5EB4A 4EIQA 4FX9A 4H4YA 2YVGA 3CTYA 1D4CA 1QO8A 2E1MA 4A65A 2XYOA 3EAOA 2X8GA 2BK3A 1KDGA 1VG9A 2XLSA 4TLXA 3NYCA 2GVCA 2YLZA 1F8WA 2Z5YA 3NK0X 2BC0A 3NLCA 1F8RA 2R0GA 1CL0A 1TDOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BUKA 3TGZA 3ZYXA 1SK1A 2OADA 4ZB8A 4A6NA 1KSUA 2V6KA 4C3YA 3GSTA 1M3JA 5EOWA 2V41A 3IC4A 3BNMA 2LNTA 3T2KA 2GQWA 2JAEA 4TM4A 2QA2A 2UZ8A 3I9V2 1N8JA 2LJRA 3LZWA 1REOA 1V2AA 2WZ9A 2RGJA 1TOFA 5IPYA 3GN3A 1CQGA 3BD2A 2I0ZA 1S3DA 1P2EA 4GDPA 3FY7A 3GKNA 1GXFA 4IVFA 1PBBA 1A2LA 3TKQA 3KD0A 4MNNA 4ZB9A 3F8RA 4USSA 3US3A 4J36A 1GULA 2HLSA 2X99A 3KEBA 2C70A 1NHYA 4FIWA 1XXUA 2C65A 1KNPA 2PYXA 2ZBWA 4XS6A 3NKSA 4PURA 1V59A 3ZREA 1CC4A 5HYMA 2JSZA 3QFAC 5DQSA 4YWOA 1EOHA 2FJBA 3NRNA 2CA8A 1BKWA 4JU5A 3LXTA 2YVJA 3Q9TA 4OCFA 2APGA 4YTPA 2F8AA 1EL5A 2VLVA 4H4PA 3QFAA 3GL5A 5D9TA 3ZVJD 4KCAA 5G31A 3DJJA 1VGLA 2L4CA 1KTEA 3AECA 3ZIVA 4H4QA 1BF3A 4K22A 2C0EA 3A5IA 1N4VA 4DSRA 5IMCA 5ER0A 3CPIG 1OAZA 3E1TA 2JADA 1LV0A 5ECSA 1XANA 3VWVA 3WGEA 1ZMCA 3LB8A 2ZCTA 4MJWA 4JZQA 2IL3A 2ACZA 1PMTA 1EWXA 3KXOA 4WR5A 2KHPA 4POMA 5DVBA 2DMMA 4TM1A 3NN0X 2QA1A 2WQYA 3BHFA 4AT0A 3II4A 3UKLA 2FWEA 3WGXA 3CYNA 2ES7A 2XBIA 1RSGA 1EEJA 3LORA 3GMBA 3ZZXA 4IA6A 3FW2A 4FK1A 2XCGA 2F3MA 4X9NA 3IAS2 5HR1A 2JBVA 4OPCA 4II3A 2KOKA 5FS7A 3BHKA 4FYBA 1ZK7A 3NYEA 3NT6A 3ICRA 1TRUA 1JRXA 2W0HA 1OKTA 2JU5A 3DGQA 3ZMKA 2GSTA 3Q74A 3GYKA 4CBQA 2WDUA 2K6VA 1TK8B 1KFYA 1WOUA 3V1WA 3IA1A 1FVJA 2WOIA 1XWKA 3ITJA 2WDQA 2C4JA 2C80A 2GZZA 4GLTA 4WF4A 1CHUA 8GSSA 4YT0A 3PS9A 3UTGA 4MF6A 4TRXA 2A87A 2YN1A 2YP6A 4TW5A 5DAKA 2CFYA 2HFDA 4RI6A 4NHWA 2EIRA 2OE0A 1KNGA 3T37A 3HYXA 2GR3A 1PXCA 4DEJA 4B68A 4GSSA 2GMJA 1B37A 1OYJA 4A7AA 2C4CA 4HB9A 3UTEA 2QGVA 2IMKA 4HU7A 2LJKA 1ERUA 1H4OA 1TKDB 1LQUA 3CNDA 1QQ2A 4K9ZA 3AB1A 1JZWA 5A4VA 4KX6A 2PHHA 5JWOB 3SXIA 2YZUA 3C71A 4V2LA 2WULA 1SL0B 3QAVA 3DKSA 4OMVA 5G2ZA 3TOTA 4YAPA 4K8DA 1BGJA 3KP8A 3QAGA 2I1UA 4EUYA 3AYJA 2R4VA 3AE7A 4HUAA 1J9BA 3FR6A 3HCZA 2CX3A 1SENA 2OE1A 4NV2A 1X31B 4U2TA 3NK1X 1DE1A 1FECA 1R7HA 2FBWA 3QFBA 4Q5QA 4BV6A 2VLUA 1GEUA 2BC1A 4YSYA 4IQ1A 1AAZA 4G0KA 5GAPD 4XCSA 1XOBA 2VRMA 3UP4A 4HOJA 3MYDA 2QAEA 1O6JA 1ABAA 1FOVA 3VWWA 3EINA 1SK0A 2XC2A 2HYXA 2O89A 3ERFA 5ECHB 5J4UA 3VRAA 3M8NA 1IUVA 4KSOA 4CDOA 1B5QA 4U8JA 1PRXA 4IP1A 1L9DA 3L9SA 1S2QA 2J23A 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