2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
b'MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
1TDOA 1VQWA 3DMEA 3V76A 1O94A 4X9NA 2F5ZA 4TM4A 1XDIA 2GH5A 3UOYA 1NG4A 4H4TA 2WPFA 4BK3A 1NEKA 3NNEA 1KFYA 4EIQA 4H4XA 3UKKA 4M52A 2WBAA 3GDNA 4C3YA 4YSYA 3NH3X 4NZHA 1GREA 3AD9B 4AOSA 1H86A 3K7QX 3UOVA 4H2QA 1GOSA 2WU2A 2X50A 3QFBA 4CCRA 4IVMB 1TDKA 4OPUA 5JCIA 4B1BA 3REDA 3QFAA 1CJ2A 1HYUA 2YVFA 4NTCA 2EQ8A 2Q0LA 1LQUA 1BZLA 1K0JA 4C5OA 2ZBWA 1MOKA 3KA7A 4Z2TA 2QCUA 3RP8A 3LXDA 1E39A 2W0HA 3DJJA 1GTHA 3NK0X 4YSXA 2XYOA 3H8IA 4H4UA 1PDHA 2ACZA 1LJ1A 2XLRA 1CC6A 1JOAA 4J56A 1PHHA 1GRAA 2WS3A 2YG6A 3P4PA 3IWAA 3LADA 2GQWA 3O0HA 2YQUA 1PJ5A 2H88A 4Y4MA 1GSNA 1PBDA 1ZMDA 2R4JA 4K8DA 5EOWA 4CNJA 4YKGA 2BA9A 1S2QA 2XDOA 3K30A 4PAAA 1PN0A 2R45A 2JB2A 1PXBA 3SM8A 2B9YA 2BS2A 3NN6X 4Z43A 4WCTA 5FS9A 2GB0A 1RSGA 2OLNA 3NKSA 3BNMA 2ZZ0A 5M10A 4A99A 2GVCA 3FBSA 1OJAA 4B64A 3AEGA 3GSIA 3UTEA 3AB1A 4ICYA 3AEBA 5J60A 2BACA 2XFPA 4U2TA 1CHUA 1VG0A 1PBFA 1GESA 2YLSA 3NGCX 2ARDA 4RG4A 1EBDA 3IF9A 2GQFA 1E1LA 1L0VA 4GCMA 1CC4A 3BI4A 3P1WA 4UDPA 2BYBA 2DKHA 1B5QA 3EF6A 3NYEA 1L9CA 4A6NA 3SFDA 3F8DA 1Q9IA 2FBWA 3ICSA 2O9ZA 3UCLA 1QO8A 2R0PA 2HQMA 3AE2A 4OPLA 4OPIA 2TPRA 1NDAA 3GWDA 2PYXA 3CIRA 1CJCA 1PS9A 3COXA 3RNMA 1F8SA 4YXDA 1EL5A 2YLZA 4AP1A 1RYIA 3ATRA 1V59A 4OPTA 2YLRA 4U8MA 3P4SA 2XLPA 2J3NA 2YG5A 4Y4LA 3SFEA 5BULA 2WETA 1GERA 1E1NA 1S3BA 4B68A 3F8RA 5M0ZA 1TYPA 4JY2A 2B76A 4CY6A 3FIMB 3G5SA 4Z24A 4DNAA 4BK2A 2B9XA 5U1OA 1CF3A 1OJDA 1N4WA 1QLBA 2VQBA 4XWZA 1GETA 1ZOYA 2Z5XA 2YAUA 3AE7A 3UKQA 4JNQA 1CL0A 1GEUA 1N4VA 2FJBA 3CGCA 3F8PA 1DOEA 5JCMA 2YLWA 4J34A 4IVOB 2V60A 2X8HA 3CPJG 4U2SA 3GD3A 1CJ4A 2VRLA 3AEFA 4KX6A 1DNCA 1H84A 4D04A 1OJCA 1JRZA 1NHQA 2OLOA 1VRQB 1O95A 2WDRA 4CBQA 5TR3A 1IUVA 1DOBA 4K22A 3P4QA 4Y4NA 4ADWA 3RP7A 4J2WA 4RSLA 2VZ2A 3NN0X 1D7YA 3BHKA 3BI5A 3ABVA 3LB8A 4EM4A 3H4KA 1FECA 2AAQA 5FMHA 3NYFA 3AE5A 3CGBA 3AE4A 3C4NA 4BJZA 4H4WA 5LV9A 4YT0A 4OPDA 2BXRA 3CGDA 3KD9A 2AR8A 1IUUA 1JRYA 2BC1A 3G5QA 1YQ3A 3AE6A 3GYJA 2QA2A 4H2NA 4H4RA 1H83A 4U8PA 1TYTA 2XLUA 5CQFA 4A6NB 1OJTA 2C70A 2YG3A 1VDCA 2WPCA 3GMCA 3DJGX 1H6VA 2RABA 3C4AA 2GEWA 4MJWA 4O5UA 1GNDA 1H7WA 3UKFA 5FS6A 2BC0A 2NPXA 4N9XA 3UKAA 2JK6A 2Q0KA 3UTHA 4H7UA 2R0CA 5HYMA 1TDEA 4U8OA 2VRMA 1CJ3A 3II4A 3UOXA 1ZOVA 2QAEA 3LZWA 3ICTA 1K4QA 3Q9TA 2BCPA 4EMIA 4A9WA 2XFQA 4A5LA 4H4PA 4C3XA 4H4SA 2R0GA 2JBVA 4EMWA 3DGZA 3BI2A 4JDRA 1NG3A 2A87A 2XVIA 3CNJA 2GV8A 3HZLA 3NK1X 4EQWA 4YSZA 2EQ9A 2JKCA 3C96A 4ZCDA 3R9UA 1H81A 2V61A 3B3RA 2Y6QA 3FMWA 2B7SA 3AE9A 3CNSA 3GDPA 3NTAA 1Y56B 1DJQA 1Q1RA 3NRNA 4JNAA 4A79A 4ECHA 1DODA 2BCGG 3KVEA 5KOWA 4I58A 2YLTA 4TLZA 1Z6LA 4B63A 5KOXA 1BKWA 3K7TA 3WE0A 3ADAB 3AD8B 4GDPA 2GMHA 2XCGA 3URHA 3QJ4A 4YTPA 3OZ2A 1GPEA 3KU9A 2YR5A 1RP0A 2VVMA 2WHDA 2BK3A 4U8LA 1ZMCA 4IA5A 3AE1A 4USRA 4APNA 3B6DA 4AOXA 3VR9A 5JCKA 2C66A 5IQ4A 5EBKA 2XFUA 1K0LA 3S61A 1GRHA 2EQ6A 2X99A 3CPIG 3NT6A 4OCGA 1BF3A 5KXJA 4P9SA 5JCNA 3DK9A 1DXLA 4CNKA 5L46A 2C3DA 3AE8A 3ALLA 1KF6A 4H2RA 1N4UA 1ZKQA 1M64A 2YG7A 3GRTA 4JY3A 1TDFA 4NEVA 1S2YA 4BV6A 5BVAA 1YQ4A 2PHHA 2JB1A 3SQPA 3P9UA 2YR6A 2GAHB 5U25A 3UKHA 4ZN0A 3VRAA 4X9MA 2X8GA 2XVEA 4D03A 1LPFA 3QSEA 2WOIA 3IHGA 3NIXA 4J36A 1IUWA 4EMJA 1NHRA 1X31B 3UTFA 1KSUA 4YTNA 4U8JA 4CRTA 4PABA 5ER0A 4XXGA 3H8LA 3EANA 1EL7A 2GR2A 5BRTA 2BS4A 2WP5A 3KLJA 5IPYA 1FEBA 1PBBA 4K5RA 2C7GA 2YVJA 1GXFA 4HB9A 4FK1C 1KNPA 3T37A 2UZZA 1DOCA 1O5WA 1ONFA 2V6OA 1Y56A 4J33A 1BGNA 2XVJA 3CNTA 4BURA 3DJEA 4J31A 2IIDA 3KKJA 2VVLA 4EQRA 1UKVG 3CGEA 5CKUA 3LOVA 1B4VA 2FJEA 3AXBA 2CVJA 2GMJA 4B65A 3GMBA 2VQ7A 1OJ9A 3I6DA 2BS3A 3VQRA 4A65A 3UOZA 4HA6A 4K2XA 1EL8A 1JNZA 1ZP0A 3DH9A 1L9EA 1ZK7A 2H89A 3NYCA 4H4QA 4JN9A 3RHAA 2NVKX 2RGHA 4YSHA 5JCLA 2YM2A 2V3AA 2WPEA 3IHMA 3PVCA 2WU5A 1H82A 4NTEA 5J7XA 2XFOA 2FJAA 3AYJA 3FG2P 4H4ZA 1JU2A 2C75A 1BGJA 3ISHA 1ZX9A 3KPFA 2WP6A 2Y6RA 4UP3A 3UP5A 2APGA 4OPCA 3UP4A 4O5QA 4EIPA 4AT2A 1REOA 2B7RA 3UKPA 1LQTA 1LTXR 1SEZA 2JAEA 2YWLA 3M0OA 1P2EA 1NHPA 2Q7VA 1ZDLA 2WP9A 4X4JA 3CN8A 4YKFA 4REKA 3G5RA 1BWCA 1GTEA 3AYLA 5KVHA 3NK2X 2C72A 3ATQA 4YWOA 1Y0PA 4B67A 1IUSA 4K7ZA 2OAMA 2GRTA 2EQ7A 5EB5A 1K0IA 2I0ZA 4U2LA 3NHOX 4FDCB 4WX1A 4IV9A 2JB3A 4H2PA 2E1MA 3AWIA 4U8IA 5GRTA 5U63A 1LV0A 3EAOA 4GRTA 2XFNA 1MXTA 4IA6A 2BXSA 2C65A 3BNUA 4C74A 3DK4A 4H4YA 4ZCCA 1CC2A 3DK8A 3IC9A 4Z26A 4FK1A 1GT8A 3ALJA 5KVIA 1AOGA 1ZY8A 3AE3A 1GRGA 3LJPA 1JEHA 1NHSA 1S3EA 2OALA 2VVLG 4AP3A 4CCQA 1YY5A 2BK5A 3QVRA 4TM3A 1GALA 3EPTA 1PJ6A 3ZDNA 4BJYA 2GR0A 4TM1A 2DKIA 2WDVA 3AEAA 4YTMA 1TRBA 4DSHA 4H50A 3L1RA 4GDEA 4NEWA 2V5ZA 5GSNA 1FCDA 5FS8A 5BUKA 4AT0A 2GR1A 2YM1A 2YR4A 3VRBA 1E1KA 3RP6A 3V3NA 3NLCA 2RGOA 3CNDA 5IQ1A 4Z25A 1CBOA 2XVHA 4B69A 4GR1A 5HXIA 2QA1A 1COYA 2C3CA 3P4RA 2GF3A 3VRDB 1GRTA 3GYIA 1JRXA 3QSSA 1QJDA 1GRBA 2ZZBA 4H4VA 4Z2UA 4E0VA 4OPGA 3K7MX 1XANA 1MO9A 4FX9A 4U8NA 4Z44A 2R4EA 1F8RA 1L9DA 3CPHG 4JQ9A 3Q6JA 3AEEA 4LIIA 3ZYXA 5C2TA 3FPZA 2CULA 5DBJA 2XLSA 2R9ZA 1LVLA 1IUXA 2WEUA 1KSSA 1ELIA 3D8XA 1GRFA 4CY8A 1B37A 2BK4A 2A8XA 4I59A 5KRQA 2WOVA 2WQYA 2YLXA 3DA1A 1TDNA 1EL9A 4Z2RA 1IJHA 2C67A 2FJDA 4OVIA 1NPXA 2ZZCA 3D1CA 1YQZA 3QSMA 5HHFA 1D5TA 3LZXA 1PXCA 3PO7A 5FS7A 2IVDA 1NENA 2Q6UA 3I3LA 4DSGA 5KWFA 2AQJA 1H7XA 2CDUA 3GRSA 1PXAA 4TLXA 2BABA 2WDQA 2IVEA 3L8KA 1NAAA 4GF7A 4NTDA 1F6MA 4USQA 1YKJA 3DGHA 1FEAA 3M13A 2E4GA 4EQSA 4A7AA 1FL2A 1XHCA 3PS9A 1D4CA 3OC4A 2TMDA 3M12A 3S5WA 5C3JA 3SGLA 4U8KA 4TM0A 5HY5A 4GUVA 4C77A 3ICRA 3V3OA 1PBCA 3GD4A 4K5SA 4EM3A 2V3BA 1VG9A 1XPQA 1B8SA 3GWFA 1PJ7A 4DGKA 3ALMA 2C76A 4UDQA 4B66A 1DJNA 1FOHA 1GV4A 1KNRA 1E1MA 4BK1A 1F8WA 1E7PA 3ITJA 3JSKA 3CNPA 2WESA 2A89A 3E1TA 1D4EA 1N1PA 1P2HA 1W4XA 2XLTA 2YG4A 3NTDA 3AEDA 2E5VA 4RG3A 2RGJA 2GR3A 2XVFA 1KDGA 2OA1A 3DJDA 2R46A 4XWRA 2X3NA 3AYIA 1PBEA 1F3PA 2YVGA 3QVPA 2X8CA 5EB4A 3CTYA 1E6EA 3NG7X 3VR8A 2C64A 2VOUA 3AD7B 3BHFA 1JNRA 2CFYA 2C73A 4KPRA 1D4DA 4J57A 4EQXA 4LU6A 3UTGA 2Z5YA 4UDRA 2B9WA 2WOWA 3AECA 4LA1A 3UKLA 2GAGB 1Q1WA 1M6IA 1D7LA 1IUTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DMEA 2F5ZA 3GNJA 3UOMA 3DMLA 1XDIA 5IMCA 4K8MA 4H4TA 2WPFA 2LKUA 2EIRA 1HNAA 3QAWA 3ZVJD 4YSYA 4C3YA 4BL7B 2LUSA 5CREA 4NZHA 3M1GA 4MJCA 2X50A 4CCRA 1TDKA 4B1BA 4QFDA 2R3XA 1CJ2A 3GL3A 4NTCA 1O73A 1TI3A 2MMAA 1EV4A 2HZEA 1MOKA 4QFCA 4RQXA 4NWYA 1E39A 2W0HA 1MDIA 3J7Yk 3TJFA 1OKDA 2XLRA 2TIRA 5DQSA 1GRAA 1ZYNA 2H66A 2IMKA 2WS3A 3P4PA 1CQGA 2VD0A 2DBCA 2H88A 4Y4MA 4CNJA 2L57A 3PR8A 3QMXA 4GTUA 4YKGA 1XWKA 4PAAA 3K30A 3BD2A 1G6YA 3SM8A 1PXBA 2LRNA 4HSCX 2B9YA 5IMVA 4A99A 2GVCA 4B64A 1V58A 6GSWA 2BACA 1GESA 4LMVA 2WS2A 4F2IA 3NGCX 1WP0A 1SKRB 2GQFA 5A5KA 3UBLA 3T2ZA 1E1LA 4YJFB 4IELA 3F63A 1B5QA 3O3TA 3QOUA 4ILFA 3L78A 3ICSA 3UCLA 3E3EA 2YANA 4KGIA 1QO8A 4OPLA 3AE2A 1R5AA 4BL7A 3L9UA 3ZIVA 1AQXA 1PS9A 4YXDA 3RNMA 1C0KA 1EL5A 1RYIA 2A4HA 2IN3A 2P5QA 3KH9A 1V59A 4U8MA 2AUVA 2RUEA 2J3NA 5ECMB 4A5PA 1B8XA 1IYHA 2C0FA 4DNAA 13GSA 2DJJA 3I69A 1PD21 4P3YB 1BX9A 1M2AA 3LW9A 1GP1A 3UL3A 1CL0A 3CGCA 5JCMA 1AUCA 1LBKA 1SYXA 3TKSA 4MH3A 3TOUA 4IVOB 3CPJG 1K0MA 2X8HA 5KN3A 1T3BA 4KX6A 7GSSA 1SKWB 3A2XA 2OLOA 1FB6A 4BVXB 1TRWA 4CBQA 1NHYA 3F6DA 1TRSA 3DVXA 3P4QA 3ZMLA 4RSLA 4J2WA 2V1MA 2WB9A 4HOJA 2F51A 3EU3A 1FECA 5ECHB 1GUMA 3NYFA 2DLXA 4IN0A 2IJYA 1KIFA 3C4NA 4OPDA 2LNSA 5B8BA 3ZZXA 3G5QA 1YQ3A 1LJRA 2HFDA 2QA2A 4YQUA 4ID0A 4L0WA 4U8PA 4WKWA 1SENA 4WR4A 2H0HA 4A6NB 1OJTA 2C70A 5J41A 4MJAA 1EGOA 4O5UA 1H7WA 4N9XA 3UKAA 1YKCA 4G10A 2A2PA 3VK9A 1TDEA 1ACVA 4GSSA 1URMA 2YV7A 4YAVA 3UOXA 1UA5A 3GX0A 4ML1A 1SL2B 1JFUA 2A2SA 4EMIA 3IC8A 4RQRA 1ZOFA 1FB0A 4H4PA 4H4SA 2JBVA 3HXSA 5H5RA 3FZ4A 3BI2A 3CNJA 3I43A 2AB6A 3A5IA 4EQWA 1TK5B 4ZCDA 4BVXA 1X9WB 1QXHA 1GSUA 2EIOA 3VURA 1TK0B 1WWJA 3FMWA 3GDPA 3NTAA 1DJQA 1Q1RA 4JR4A 4A79A 2C0DA 1DODA 2WCIA 1GTUA 3IAS2 2H6XA 3V1WA 4TLZA 1Z6LA 4G73A 4B63A 5KOXA 3HJPA 1A0FA 3GSSA 3ADAB 3UARA 2XCGA 1UC7A 2QSIA 1XXUA 5A4VA 1C0IA 4WBRD 3KD0A 4POLA 2VVMA 3QCPA 2JADA 4USRA 4AOXA 5JCKA 1OC3A 3S61A 2EQ6A 5IM9A 2FWEA 3DK9A 4CNKA 2C3DA 3AE8A 3GH9A 1M64A 3DRNA 5ABRA 5D9XA 4BV6A 4JU5A 4PQHA 2YR6A 3UKHA 4D73B 2E7PA 2VLVA 4MA9A 2XVEA 1LPFA 2O7KA 2OKAA 2WOIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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