3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
100200300400500020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
3CGCA 1F8RA 1IUWA 3ICRA 1DOCA 2ZBWA 1IUUA 4GR1A 2YQUA 5U63A 4YXDA 1N4WA 2OA1A 1L9CA 5M0ZA 2BK5A 3NYCA 3NNEA 3II4A 1JRYA 2GB0A 4BK3A 2AR8A 4D03A 5JCLA 4FK1A 3AEDA 1ZY8A 3I3LA 1CL0A 1S3EA 4CCRA 2R46A 1KFYA 2YWLA 4PABA 3LB8A 2X50A 3AE3A 1F3PA 2YR5A 2V3AA 5CKUA 5U25A 3NHOX 2XFOA 4YWOA 1RYIA 4Z2UA 3UOZA 4LU6A 4GCMA 4Y4MA 4C3YA 2ZZCA 2XLTA 4FX9A 2BABA 2WP9A 5M10A 3T37A 4EIPA 3CGDA 3DJEA 3VR9A 4B64A 4H4QA 1LQTA 1PJ6A 3SGLA 3AEGA 2XVHA 1ZK7A 2O9ZA 4O5UA 3DK9A 2YVJA 4GF7A 3AWIA 1NG4A 3CTYA 1FECA 3UKKA 4Z43A 2A87A 3P1WA 1XDIA 2XCGA 4UDQA 4OPGA 4U8JA 1GALA 4OPUA 2EQ8A 3CNDA 3GMBA 2C70A 5FS9A 4BJYA 2GR3A 4H7UA 1D7LA 2C73A 5FS8A 1FOHA 4KX6A 2WPCA 3NGCX 1L9DA 2TPRA 4ICYA 3JSKA 4MJWA 5TR3A 1W4XA 3BI4A 1H7XA 3L8KA 2BXSA 1CJ2A 3E1TA 3CNSA 5IQ4A 4J36A 4TM3A 1IUVA 4J33A 3CN8A 4YT0A 2EQ9A 4RG4A 1PBCA 1B37A 3NK2X 2BC1A 2Y6QA 3AYLA 2YLSA 1D5TA 3IHMA 1PHHA 3UOVA 1JRZA 4Z24A 1LV0A 1OJCA 2XFQA 4H4RA 4H4ZA 2XDOA 4B65A 1CC2A 1LPFA 2YLZA 5HY5A 1OJAA 4TLXA 2RGHA 3GRTA 4DNAA 1CF3A 1JNRA 3LOVA 1Q9IA 4J57A 3FPZA 3QVRA 3LJPA 1OJDA 2WDQA 1DOEA 3BHKA 3CIRA 4OCGA 1BKWA 3LZXA 4REKA 4UP3A 3IC9A 2YLTA 1S2YA 1OJ9A 2YG5A 2RABA 1H6VA 1EL9A 4H50A 2GR1A 1MO9A 1FCDA 1S3BA 2PYXA 3DJJA 5LV9A 1GREA 1ZMDA 4CY8A 2X3NA 4A6NB 2B9YA 1Q1WA 1DOBA 2ARDA 1F8WA 1GRGA 2TMDA 1IUXA 2YVGA 2Z5YA 4N9XA 5GRTA 4X9MA 3BNMA 4EMIA 4USQA 3D8XA 2BXRA 4NZHA 3QSSA 2B7RA 3F8PA 3PVCA 5U1OA 4NTEA 1DXLA 4NTDA 3SM8A 2FJDA 3BI5A 3NRNA 4I58A 1CJCA 1NHRA 5EBKA 4I59A 2V61A 2OLOA 1UKVG 5J60A 4GRTA 5C3JA 1CJ4A 5GSNA 3G5QA 1BF3A 3G5RA 2GF3A 3CGEA 1CHUA 1E1KA 1M64A 2YVFA 3GDPA 3GYIA 4ECHA 2XLUA 2DKHA 2GR2A 1IUSA 1AOGA 1NHQA 4RG3A 2GQFA 2QAEA 3UKFA 3K7TA 2GQWA 3C4NA 4H4YA 1Z6LA 5EB5A 2OLNA 3UTGA 1SEZA 2C75A 3FIMB 3GSIA 3AE4A 3QSEA 4K8DA 2J3NA 2WP5A 3LZWA 3COXA 4IV9A 4OPCA 4B67A 2FJAA 3ITJA 2B9WA 1ZX9A 3CNTA 3UTEA 1QO8A 4C5OA 5L46A 1GOSA 4M52A 4JDRA 4U2SA 4AT2A 1FEBA 3ICTA 4JQ9A 1LTXR 3G5SA 1VDCA 1LQUA 1EBDA 1PJ7A 1YKJA 3KKJA 2BA9A 4KPRA 1ONFA 4U8NA 1GRAA 2C76A 2APGA 4CCQA 1GRBA 4EM4A 1GRHA 2E1MA 5KWFA 3SFEA 3QFBA 4A65A 1B4VA 2GV8A 4WX1A 4A5LA 4FDCB 2BK4A 1S2QA 2E5VA 3ADAB 4JNQA 1LJ1A 3UKAA 2C67A 2CULA 2BS3A 2FJEA 1F8SA 1GRTA 2H88A 2WS3A 1COYA 2Q0KA 5HXIA 4U8KA 4A99A 4B66A 4BJZA 1GTHA 3ISHA 4H4XA 4Y4LA 1PS9A 5BUKA 3D1CA 4Z2TA 1NDAA 3GDNA 3UOYA 1TDEA 4AT0A 1O95A 2BCPA 4ADWA 1DJQA 2WETA 3O0HA 4APNA 5HYMA 1QLBA 3Q6JA 2JBVA 4OPDA 2YR4A 2ZZBA 3P4QA 4EMJA 4U2LA 3UKHA 4TM1A 1GERA 2C72A 1XANA 1JRXA 4J31A 3NIXA 2WOWA 3R9UA 1PBBA 1VRQB 1YY5A 1E7PA 4A9WA 3OZ2A 2JB1A 1E1MA 1BGJA 1D7YA 3UKPA 3UP5A 3GWDA 4BK1A 2WP6A 1GXFA 3NYEA 2WDRA 3ALLA 1O94A 1P2HA 1L9EA 2NVKX 4DGKA 1NG3A 3UOXA 3FG2P 3AE2A 1BGNA 1Y56B 1N4UA 2Q7VA 3NKSA 2OALA 3NLCA 4A7AA 3AE7A 4YSZA 3GD3A 4K5RA 4Y4NA 3SQPA 3VQRA 2XFNA 4ZCDA 5KXJA 3I6DA 1K4QA 3NTAA 2Y6RA 2IIDA 4BV6A 1N1PA 1GETA 4DSHA 3DK4A 4J56A 4B68A 4K5SA 4USRA 3L1RA 2GAGB 2C3DA 2V6OA 1PXBA 2VQ7A 2WPEA 2XLRA 3GD4A 3NYFA 2WU5A 4Z26A 3AE8A 2XVIA 2QA2A 3ALMA 1GNDA 1JU2A 3WE0A 3ALJA 2XVJA 3K7MX 4XWZA 4OVIA 2GEWA 5FS7A 4HA6A 2XYOA 2PHHA 3S61A 1TDOA 4EQWA 4U2TA 4EQXA 3EANA 3UKLA 5JCIA 3VRBA 2R4JA 1K0IA 2BK3A 1ELIA 4H2NA 3PO7A 4H4PA 4RSLA 5J7XA 3C4AA 2JB2A 2CVJA 1NAAA 2YG7A 5BRTA 1TDNA 4XXGA 2VVMA 2WESA 1HYUA 2IVEA 3AEEA 4Z25A 5CQFA 3P4SA 3NG7X 1ZOYA 2B9XA 2V60A 4LIIA 4YSXA 1XPQA 2AAQA 4K22A 4H4VA 4H2RA 4Z2RA 2VZ2A 5C2TA 3H8IA 3NN6X 2OAMA 3BNUA 3EPTA 3KPFA 4YTNA 3NK1X 1EL5A 1PJ5A 3KU9A 3EAOA 4B1BA 1FL2A 4TM0A 3F8RA 5KOWA 2VOUA 1NHSA 1KF6A 4GUVA 4CNKA 3HZLA 3NH3X 3GMCA 3QFAA 1E39A 2C3CA 3M12A 1E6EA 3NT6A 2GR0A 1YQZA 5KVIA 1D4EA 2VVLG 4J34A 4B63A 2GVCA 2X8HA 4X4JA 5KOXA 3AEAA 1N4VA 1PDHA 1IJHA 1CBOA 3KD9A 4GDEA 4NTCA 1GEUA 4YKFA 1TDFA 2R9ZA 3RP6A 1TDKA 2B76A 3CPHG 2XFUA 3CGBA 1PBDA 4YSYA 3RNMA 5EOWA 1CJ3A 4H4UA 3URHA 4EIQA 3M0OA 4FK1C 4UDPA 4BK2A 4C3XA 1RP0A 3ATRA 4ZCCA 2C64A 4C74A 4JY2A 4H2PA 1GRFA 2R4EA 2VRMA 4H4SA 3H4KA 2HQMA 3K7QX 2YAUA 2YLWA 1K0LA 2X8GA 1IUTA 1H81A 4OPLA 4UDRA 2Z5XA 3IHGA 1KNRA 2GH5A 1H86A 1PXCA 3QJ4A 2WBAA 4EQSA 1B5QA 3AB1A 2GRTA 2I0ZA 3KA7A 2YLXA 2UZZA 4LA1A 4A6NA 3AECA 3RP7A 1EL8A 4YTPA 2E4GA 2QA1A 1B8SA 4AP1A 1FEAA 2EQ6A 1H7WA 2V3BA 3ZDNA 2Q0LA 3UP4A 2WOVA 4H4TA 3IWAA 4EMWA 2BACA 2CDUA 1NEKA 3CNPA 3UKQA 1GV4A 2C65A 1JEHA 1MOKA 1JOAA 1X31B 3SFDA 1M6IA 1REOA 2YG4A 4TLZA 4EM3A 2BS4A 5DBJA 2W0HA 2NPXA 4OPIA 1ZDLA 2RGJA 2R0GA 3CPJG 4JN9A 3EF6A 4YSHA 2ZZ0A 1KDGA 3S5WA 3AD8B 1Q1RA 3GYJA 1F6MA 1PXAA 2RGOA 3AEFA 5FS6A 3P4PA 3C96A 3GWFA 1YQ3A 2FJBA 3DJDA 1O5WA 4IVMB 1MXTA 1GSNA 3AE9A 3AE1A 4NEWA 4YTMA 1H84A 3DGHA 2VRLA 2IVDA 5JCKA 1YQ4A 4K7ZA 2GAHB 4GDPA 1E1LA 4K2XA 3BHFA 1ZOVA 3H8LA 2WPFA 3AE5A 4JNAA 5BVAA 3PS9A 2VVLA 4X9NA 1DNCA 2YLRA 3UCLA 3VR8A 4B69A 4IA5A 1LVLA 1QJDA 2ACZA 1DJNA 3AD7B 4IVOB 1P2EA 5FMHA 4Z44A 1GT8A 2AQJA 3RHAA 2BS2A 4TM4A 1KSSA 4BURA 2A8XA 3ZYXA 3OC4A 4EQRA 1RSGA 4H4WA 3ABVA 2XLSA 1D4CA 1JNZA 1GPEA 1CC4A 3F8DA 1EL7A 4CBQA 4CNJA 3B3RA 3DMEA 4WCTA 4XWRA 5KRQA 1XHCA 4C77A 4J2WA 1GTEA 4H2QA 1CC6A 2BCGG 3BI2A 3CPIG 2QCUA 1VQWA 3K30A 2BYBA 1NPXA 1K0JA 4JY3A 3FBSA 4DSGA 2WHDA 4A79A 1ZMCA 2WEUA 1H82A 1BZLA 2H89A 3P9UA 3DK8A 3RP8A 2YG6A 2R45A 2DKIA 1NHPA 5HHFA 1KSUA 4P9SA 3DGZA 3DA1A 1V59A 2WOIA 4U8IA 3AE6A 2V5ZA 3ATQA 3P4RA 3VRDB 2XVFA 4U8PA 4IA6A 4CY6A 2A89A 1TRBA 1H83A 1TYTA 3IF9A 3Q9TA 4U8OA 4AOXA 5JCNA 2R0PA 1GESA 2XVEA 2YR6A 2FBWA 3UTFA 3V76A 2CFYA 2X8CA 1D4DA 5IQ1A 4D04A 1VG0A 3KVEA 4U8MA 3QVPA 2B7SA 1ZKQA 3LXDA 3CNJA 3GRSA 1Y56A 4AP3A 2XFPA 2YM1A 3DH9A 3NK0X 2JAEA 2F5ZA 2VQBA 3NN0X 4OPTA 4PAAA 3B6DA 3AXBA 4E0VA 3ICSA 4YKGA 5JCMA 5KVHA 5EB4A 3FMWA 3QSMA 2C66A 2JKCA 1BWCA 2C7GA 2Q6UA 2WQYA 4O5QA 4U8LA 3KLJA 3AEBA 2JB3A 2BC0A 2YM2A 3AYJA 3NTDA 3UTHA 2XLPA 3REDA 4ZN0A 4HB9A 1L0VA 2JK6A 1E1NA 3V3NA 5IPYA 1PBFA 4CRTA 1PBEA 4AOSA 3LADA 2GMHA 5ER0A 5BULA 3V3OA 1VG9A 3VRAA 2EQ7A 4NEVA 2GMJA 3AYIA 3AD9B 1OJTA 2YG3A 2X99A 1DODA 1PN0A 1TYPA 1Y0PA 2R0CA 1ZP0A 2WDVA 2WU2A 1NENA 1KNPA 3DJGX 3M13A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XWGA 5IMVA 3GIXA 2H30A 2P5QA 1DOCA 5ECNB 1B9YC 1IUUA 1AIUA 2YQUA 2OA1A 5CAXA 3MAKA 5BMUA 1GTBA 3GKNA 3NNEA 2GB0A 1GSUA 2N5AA 4D03A 4FK1A 1ZY8A 4XHMA 1PN9A 3GURA 1N8JA 3LJRA 3M3MA 3LB8A 2GQLA 3G9BA 2V3AA 5IO0A 2PUKC 2XFOA 2OACA 4HZ4A 1H4OA 4GCMA 4C3YA 1X5DA 3BJ5A 4WF5A 3DRNA 2XLTA 2BABA 3CSHA 5G1LA 5CREA 3T37A 3ME8A 2E49A 3CGDA 1ZYPA 1GSSA 1T00A 5IQYA 3CSIA 4O5UA 2O9ZA 1A0RP 3DK9A 2YVJA 3UKKA 2A87A 2XCGA 4UDQA 4U8JA 3FZ9A 5G5FA 1GALA 3SZWA 2GR3A 1EGRA 1YKAA 3ZTLA 3NGCX 2JU5A 3IA1A 5IPHA 2TPRA 3JSKA 2LTKA 3L8KA 1OKDA 3HVNA 5IQ4A 3LSZA 4TM3A 1X9SB 3CN8A 5ENUA 3UBLA 1PBCA 3F3QA 1B37A 4WETA 5JCUA 1AW9A 2Y6QA 1D5TA 5ECKB 5IMAA 1RK4A 2TRXA 5C04A 4J2FA 1JRZA 4O7HA 3KP9A 1LV0A 2XFQA 4ACSA 4KNDA 1FAAA 2VL2A 1OJAA 4DNAA 4MPGA 1JNRA 3LOVA 4J57A 3FPZA 3QVRA 2IL3A 4ZB6A 3M9JA 1DOEA 2PN8A 1BKWA 3QFAC 4REKA 2E7PA 2YG5A 3DYRA 1PFOA 4NPBA 5ECMB 4GCIA 2DMMA 2N5BA 2GR1A 2C0DA 5LV9A 3GN3A 1UN2A 4A6NB 3P90A 1DOBA 1R5AA 4EL1A 4L5LA 4WR5A 2YVGA 4X9MA 1G7OA 3BNMA 2BXRA 3F8PA 5U1OA 3TGZA 4NTEA 3ZIJA 1EEMA 2XBQA 4MP4A 5EBKA 1XOAA 3GKMA 5J60A 1M9BA 3IAS2 1A2MA 3PPUA 3G5QA 5GSNA 2I9HA 4MCUA 2LRCA 1F3AA 3ZFLA 4ECHA 3KZQA 5HFGA 1IUSA 1I5GA 2O89A 2GQFA 3KH7A 4IP1A 1FG4A 1GTUA 3VK9A 2IIYA 1SKSB 1M2AA 5F0GA 2IPAA 3P8WA 2C75A 3M0FA 1KIFA 3HJOA 2GTUA 2TIRA 4K8DA 4XRDA 4IV9A 3LZWA 3D4TA 4GWRA 4TOPA 1K3LA 1TK5B 2FJAA 3CYNA 4WKWA 2B9WA 3CNTA 1V40A 1TTZA 2R6KA 4AT2A 1XPVA 3G5SA 1PJ7A 1EBDA 3HCZA 1ONFA 3G7IA 5E4WA 1ZOFA 2C76A 2H0IA 3D22A 5A4VA 1EGOA 3GFKA 4O92A 5AGYA 3A3TA 4A65A 1X9MB 1B4PA 5DQSA 2R37A 4NXIA 3ADAB 4FDCB 4DSQA 1LJ1A 4IQ1A 2C67A 2CULA 2FJEA 5IO2A 4U8KA 1QGVA 3TRQA 1RW1A 3EMXA 4ML6A 2L5OA 4FO5A 1GH2A 1C0IA 1DJQA 3FZAA 2JBVA 2YR4A 3UKHA 3ZFBA 5C00A 4BL7B 5GZZB 1GERA 2C72A 4Q5NA 1JLVA 3VLNA 2WOWA 1EV4A 1XXUA 1YY5A 3KGKA 2LKUA 2JB1A 3VWVA 1D7YA 4BK1A 2WP6A 3KMOA 5J4UA 4K2DA 3TRXA 3NYEA 4NNJA 1EOGA 4HUAA 1WOUA 1P2HA 1L9EA 3LORA 4XS4B 3FG2P 1N4UA 3NKSA 4OFMA 4DSRA 4A7AA 3GD3A 4Y4NA 2GLRA 2XFNA 2YV7A 3I6DA 12GSA 5IIZA 1O8XA 4TXOA 4EC0A 4J56A 3L9SA 3GNJA 3F6DA 2E0QA 2C3DA 3W4KA 2C4CA 3DGQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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