3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords RebC
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
4K8DA 2JK6A 4H2PA 5BVAA 1S2QA 5EB5A 1Y56A 4YKFA 2E1MA 5JCLA 4K22A 2YG5A 5KOWA 1BWCA 2TPRA 4YTNA 2B76A 4EMJA 4U8IA 2IIDA 5ER0A 4B67A 1Z6LA 1ZMDA 2BC0A 2OLNA 3F8PA 2C66A 2GQFA 1QO8A 1NHQA 2Q0LA 4ZN0A 1CC6A 2JKCA 2WPFA 4H4ZA 4AOXA 3KD9A 4CY6A 2W0HA 1CJCA 4ZCCA 1ZDLA 1FOHA 1GETA 2PYXA 4H4UA 1VG0A 4U2SA 2WP5A 4BJYA 4C74A 1H7XA 2TMDA 4JNQA 1CJ2A 2GRTA 1DJNA 3NG7X 1DOCA 1K0JA 1Q9IA 2YLSA 4TLZA 4GCMA 4A65A 2WU2A 3V3NA 4Z44A 4AT0A 1D7YA 2R45A 2WESA 1W4XA 1F8WA 3C4NA 4K5SA 1OJAA 2YG7A 3UCLA 3AEFA 1LV0A 3ABVA 3CGDA 3UKQA 4AP3A 1DOEA 3UTGA 1GOSA 2E4GA 3GWDA 3IHMA 1CL0A 3FPZA 3FMWA 2C75A 3UKAA 4A5LA 1JEHA 4NTCA 4BK1A 4H2QA 5L46A 3NYEA 1E1MA 1COYA 1TDKA 1GRGA 1PJ5A 3AXBA 4OCGA 1DOBA 1D4DA 5DBJA 3ALJA 3DJJA 4DSGA 2B9XA 4OPLA 1Y56B 2BK3A 4A99A 3AEBA 4ICYA 1IUTA 2ZZBA 4C3XA 4GUVA 1LQTA 1VQWA 3ICSA 3QVRA 2Z5YA 2C3CA 3AD9B 3NYCA 1GRAA 1EL9A 1LTXR 5KRQA 1PBBA 3L8KA 1S3BA 1O95A 1TDNA 1PS9A 4LU6A 2VRLA 2FBWA 3AB1A 2CVJA 2WS3A 1OJCA 3H4KA 4ZCDA 1MOKA 3CNDA 3SGLA 2BC1A 2BCPA 4LIIA 1PXAA 2BCGG 2J3NA 5CQFA 4H4RA 4B63A 3EAOA 2XLTA 4BK2A 3P1WA 1H81A 4H2NA 1YKJA 1DJQA 4RSLA 4Z2TA 1ZY8A 2V61A 4B64A 4H4YA 5HY5A 3DK9A 1B5QA 3ATRA 4OPIA 4NEVA 2WQYA 5EBKA 5J7XA 3NK2X 3SM8A 2C67A 2VVLA 1NHPA 3P4RA 3VR8A 2XVHA 3AE1A 3BHKA 3CNSA 4GDEA 1X31B 3NH3X 2IVDA 4EQXA 2EQ6A 4TM4A 1XDIA 3PVCA 1F8RA 3G5RA 4U8KA 4OVIA 3BI5A 2Q7VA 3K7QX 3DJDA 5IPYA 2AQJA 4LA1A 5U63A 1B37A 2WU5A 4XWRA 3ZDNA 5FS7A 3GMCA 5M0ZA 4EIQA 4REKA 4H4XA 1BGNA 1K0IA 1M6IA 1OJTA 2VQBA 4X9MA 3UTEA 2BABA 3AE9A 1EL5A 3CGBA 4B69A 1XHCA 4I59A 3UKHA 4K7ZA 2YLZA 2BS2A 1LJ1A 1S3EA 3OC4A 5JCIA 3RP7A 2VOUA 1YQ4A 4I58A 2Q0KA 3HZLA 3ICTA 3H8LA 4U8NA 2YR5A 1PHHA 1GTHA 3QJ4A 2EQ7A 3GSIA 3KLJA 4B68A 3CNPA 4APNA 2XFUA 2FJBA 4N9XA 4TM0A 4DNAA 2YG3A 4FK1C 2YWLA 4CCQA 1F3PA 1GSNA 1NG4A 2GR2A 3AD7B 2VVMA 4JY3A 1PXCA 1PDHA 2B9WA 1RYIA 2VZ2A 3LZXA 5KVIA 5JCKA 1MO9A 4U8LA 4UDRA 4Y4NA 3DK8A 3GD3A 3IWAA 3V76A 4ECHA 3IHGA 2X8GA 1TDFA 4Y4LA 2APGA 3GD4A 1FL2A 1YQ3A 4H4WA 4Y4MA 4H4PA 2WEUA 3C4AA 1GXFA 2CDUA 1YY5A 1GRBA 3PS9A 1IUWA 2A87A 4UDPA 2XFQA 3B3RA 2XFNA 3P9UA 3BNMA 3RNMA 1DXLA 1Y0PA 2XFOA 3Q9TA 4Z26A 3G5QA 4KPRA 3NTDA 3CPHG 4U8MA 3FG2P 2XLPA 1NAAA 4AOSA 4CNKA 3CTYA 4GDPA 1EL7A 4M52A 3ITJA 1GESA 2BXRA 4A79A 1BGJA 1NENA 1H82A 4H50A 5JCNA 5HXIA 1CJ3A 2XCGA 3NN0X 2OALA 4USRA 3KU9A 3AWIA 4IV9A 2WHDA 3T37A 1DNCA 3I6DA 2YLXA 1LQUA 4JNAA 2PHHA 4FX9A 4CRTA 2XFPA 4OPGA 1AOGA 1EBDA 1FEAA 2C3DA 3AD8B 5C3JA 4YSHA 1RSGA 1PBDA 5KVHA 2QAEA 1BZLA 4J33A 2OA1A 5EOWA 3ZYXA 1OJDA 1ONFA 1ZX9A 5BRTA 4Z43A 5C2TA 5FS9A 4GR1A 2IVEA 2YM1A 3JSKA 1IJHA 1JRZA 2I0ZA 4C5OA 2X3NA 1N4VA 1PBEA 3K7TA 4O5UA 3VRDB 2R0PA 2B7RA 3AEEA 5U25A 3NKSA 1O5WA 1TDEA 1LPFA 2WOVA 3C96A 3DJGX 4P9SA 4H2RA 4IVOB 4X4JA 2YLRA 1DODA 4TM3A 4B1BA 2WOWA 3AEDA 3LXDA 2YM2A 4J56A 3AE7A 2ZBWA 2BK5A 3SFEA 1CHUA 4AP1A 2GH5A 4USQA 3GYJA 3DA1A 2ARDA 3QSMA 3UP4A 4Z2RA 2QA1A 2ACZA 5GSNA 1F8SA 2JB1A 3VRAA 2R0GA 1TYTA 1ZP0A 2C65A 4O5QA 1H7WA 2WDVA 1H86A 3CNJA 2GR1A 3CGCA 3QFAA 3CPIG 4H7UA 3QSSA 3RP8A 1JRYA 1FEBA 1N1PA 2BYBA 1JU2A 2NPXA 3ISHA 3E1TA 3CNTA 4BURA 1CC4A 1E1LA 3QVPA 1FCDA 1KNRA 4GRTA 2Z5XA 4U8JA 1IUUA 4JN9A 2RABA 2XVJA 5M10A 2X8HA 1L0VA 1VDCA 3Q6JA 3AE6A 4JY2A 1TDOA 3GRSA 5TR3A 1H6VA 4E0VA 3DGHA 2GMHA 1GREA 2A89A 2QA2A 5EB4A 2XLSA 3BNUA 1F6MA 4TLXA 1KNPA 4CBQA 4EIPA 4D04A 2C72A 5LV9A 1SEZA 4OPUA 3ALLA 1GRHA 1GT8A 4EMIA 2EQ9A 4K5RA 3KVEA 2HQMA 3NGCX 4JDRA 3GDNA 3DK4A 4PABA 2YR6A 4WCTA 4A6NA 1LVLA 4UDQA 4A7AA 2BK4A 1KFYA 2GEWA 2WDQA 3BHFA 3COXA 3O0HA 4J36A 3R9UA 3UOZA 3LZWA 4Z25A 2JAEA 3ADAB 1H83A 4H4SA 4EM4A 1PBCA 2YAUA 5BUKA 3RHAA 1UKVG 3BI2A 4NZHA 5KWFA 1ZMCA 1E39A 3K7MX 3NRNA 2UZZA 3H8IA 3AE2A 3NHOX 1K0LA 2AAQA 1M64A 3M13A 5FS8A 4EQSA 4FDCB 1D4EA 5GRTA 1PJ7A 3K30A 3AYLA 3CGEA 3FIMB 1O94A 2YLTA 2XYOA 1L9DA 1KSUA 3S5WA 3P4PA 4OPCA 2OLOA 1GRTA 4YTMA 2YLWA 3VQRA 2A8XA 2XVIA 1E1KA 1NEKA 5FS6A 1GEUA 1GV4A 3UKKA 4HA6A 4IA6A 2NVKX 4B66A 3L1RA 1N4UA 2YVGA 5IQ1A 2JBVA 3NYFA 3URHA 4DGKA 5HYMA 1E7PA 4U2LA 2C7GA 2BACA 3UOXA 2XLRA 1IUVA 3M0OA 4EQRA 3CPJG 3QFBA 4FK1A 3NNEA 2VRMA 3NTAA 4OPDA 1IUSA 1V59A 2DKIA 4MJWA 2X99A 1D5TA 1JNZA 3AECA 1GNDA 2FJAA 1HYUA 1TRBA 3F8DA 1NHRA 2V3AA 4TM1A 3G5SA 1P2EA 4NTDA 4NEWA 5BULA 3NT6A 3NK1X 4J34A 4YSYA 1GERA 3AE3A 3GWFA 4Z24A 2B7SA 4A6NB 1E6EA 2GR0A 2WP9A 3LOVA 4YXDA 1MXTA 2GAGB 3UP5A 3NK0X 3P4QA 3UTFA 1PBFA 1JNRA 3AE5A 4BV6A 2AR8A 2XVEA 4NTEA 2FJEA 3B6DA 2B9YA 1D7LA 3QSEA 3DH9A 3DJEA 4X9NA 3WE0A 2V5ZA 2RGJA 4U8PA 2C73A 1VRQB 5FMHA 4YT0A 2CFYA 1VG9A 2H89A 1NHSA 2QCUA 5HHFA 1P2HA 4HB9A 3AYJA 1JOAA 2R46A 5JCMA 1QLBA 5IQ4A 4YWOA 1IUXA 1KSSA 4J57A 4EM3A 3AE4A 2R4JA 1B8SA 2Y6QA 4CCRA 3S61A 2V3BA 4C3YA 4BJZA 1YQZA 2R4EA 3DGZA 4RG4A 3VRBA 2GQWA 3UOVA 3OZ2A 1GTEA 4JQ9A 1ZK7A 4PAAA 3ATQA 4H4VA 4XWZA 2F5ZA 3F8RA 2R0CA 4D03A 3NN6X 3D8XA 3UKLA 4WX1A 2GR3A 2JB3A 1BKWA 3CN8A 3UKPA 2BA9A 1S2YA 4KX6A 4U2TA 3KPFA 4RG3A 2YVJA 2WETA 5J60A 4H4TA 3BI4A 3V3OA 1L9EA 2FJDA 3KA7A 3VR9A 1XPQA 3KKJA 3PO7A 3IF9A 5U1OA 1H84A 4ADWA 1QJDA 3EF6A 1REOA 2RGHA 4U8OA 2YQUA 3NIXA 2XLUA 2BXSA 1JRXA 1PN0A 2WPEA 4YSXA 2WDRA 2O9ZA 2CULA 1KDGA 3AEAA 2VQ7A 4GF7A 4DSHA 1ZKQA 1D4CA 3UTHA 2XVFA 2JB2A 3EPTA 1EL8A 3SQPA 3UKFA 4EMWA 1CJ4A 2V60A 2XDOA 2YVFA 1B4VA 2C64A 5KOXA 2WOIA 3II4A 3P4SA 4OPTA 1ZOVA 2EQ8A 2C76A 4C77A 4K2XA 4Z2UA 3LADA 2GMJA 2GB0A 3EANA 4IVMB 4YSZA 1N4WA 3D1CA 3LB8A 1Q1RA 2V6OA 3ALMA 1NPXA 3RP6A 4EQWA 1CC2A 2ZZ0A 3NLCA 3GYIA 3GMBA 3DMEA 2WBAA 2WPCA 3AEGA 5CKUA 1KF6A 4YKGA 3SFDA 4CNJA 4UP3A 1BF3A 1ELIA 4CY8A 2E5VA 1CBOA 2X50A 2H88A 3UOYA 4YTPA 1GPEA 1E1NA 1OJ9A 3IC9A 2VVLG 3GDPA 3LJPA 2BS4A 1PJ6A 2Q6UA 4A9WA 2BS3A 4J31A 3FBSA 4XXGA 1NDAA 4B65A 2X8CA 2YG4A 1XANA 3M12A 1FECA 1K4QA 2OAMA 3CIRA 3I3LA 2RGOA 3GRTA 4H4QA 2ZZCA 2Y6RA 1Q1WA 2DKHA 1ZOYA 1RP0A 2GF3A 1TYPA 2C70A 3AE8A 3ICRA 1NG3A 1L9CA 1GALA 2GV8A 4IA5A 1CF3A 2YR4A 3AYIA 1PXBA 5KXJA 2WP6A 4AT2A 1GRFA 2YG6A 4J2WA 3REDA 2R9ZA 2GVCA 2GAHB 4BK3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHSA 1RW1A 2CT6A 1Y56A 3T2ZA 5KMRA 2PU9C 5KNLA 4BL7A 1TTZA 2IIDA 1FB6A 1V98A 14GSA 1ZMDA 4IS0A 4V2MA 2OLNA 2GQFA 3UBKA 3QCPA 1E6BA 1DE1A 1VRSD 4EF0A 5HFGA 3UARA 3PINA 3KP8A 4C74A 3ZREA 4GLTA 2VD0A 3NG7X 1DOCA 1K0JA 2YLSA 4XIHA 2PERA 2EIRA 1KNGA 2FWEA 3N9JA 1D7YA 2E82A 1X9MB 3IXRA 1S3RA 4G0IA 4PQHA 2YG7A 2X4AA 3GYKA 3AEFA 2K8SA 3PH9A 4FH8A 5G31A 1DOEA 2E4GA 1JEHA 3ZVJD 4H2QA 3NYEA 2RM6A 1E1MA 3SBCA 1COYA 1PN9A 5CRDA 1GRGA 3AXBA 3NOFA 2CQ9A 2EC4A 4PNFA 4I2UA 4JRRA 3ALJA 3HD5A 1OAZA 2YZUA 2HT9A 4DSGA 1Y56B 4V1Ag 3AEBA 1JZRA 4L0WA 3WD6A 1LQTA 1VQWA 4G19A 3QVRA 2V2GA 3AD9B 5JWRB 1IYHA 1EL9A 4E8HA 2QSIA 3EC3A 2AHEA 2RUFA 6GSUA 3FRCA 5HFIA 3L8KA 4K0NA 2VRLA 2FBWA 1DE2A 4ZCDA 4DEJA 2IPAA 2AV4A 2NPBA 5ID2A 5J5NA 3EAOA 4JZQA 4BK2A 1YKJA 1DJQA 4Z2TA 4B64A 4H4YA 1PQNA 3DK9A 4NEVA 1SL1B 1AW9A 5EBKA 5J7XA 1ABAA 4AJ6A 3VR8A 2C67A 1NHPA 2XVHA 2L5OA 4ZB8A 5B7CA 2EQ6A 3PVCA 1X9SB 1HNCA 2R3XA 3IR4A 2Q7VA 1KIFA 1U3AA 4XWRA 3A2WA 5FS7A 1TI3A 2RUEA 1SL2B 2LRTA 1Z6NA 1BGNA 3TJKA 3TRPA 4MPGA 4ZL7A 1SU9A 4PQ1A 3CSJA 1WP0A 4WBJA 1GUKA 1S3CA 1LU4A 3HCZA 3CGBA 3E0UA 2WDUA 3L78A 1NHYA 4I59A 2ON5A 2YLZA 3I69A 2RM5A 2BS2A 2PBJA 1LJ1A 1S3EA 1A0FA 3CRTA 3HVNA 2VOUA 1YQ4A 4I58A 1GTUA 5IOXA 4HU9A 3GSIA 3KLJA 1SKRB 3CNPA 2LTKA 2RIIA 2XPEA 4TM0A 5ID2B 4KCAA 2OBKA 1GSNA 1NG4A 2GR2A 3AD7B 2VVMA 2H30A 1PXCA 2K6VA 2I4AA 3LZXA 4U8LA 4UDRA 3W4JA 3I6AA 1Z5YE 4ECHA 5JCUA 3G7YA 4Y4LA 1HQOA 1FL2A 4H4WA 1W4VA 4Y4MA 3US3A 4H4PA 3CQFA 2MMAA 3KP9A 3KIJA 3PS9A 1DUGA 1YY5A 3L9VA 3B3RA 1XPVA 5KN0A 4KF9A 1Y0PA 2XBIA 4GF0A 1QMVA 2I1UA 3VURA 3A5IA 2WB9A 3CPHG 5CRGA 3CTYA 4N0VA 2LQQA 1EV4A 5IMVA 1NENA 1ZZYA 2MBTA 1TRVA 1NM3A 2XCGA 4USRA 5CAXA 5DVBA 5A4UA 4BVYA 3IV4A 1LQUA 3FEUA 2LRNA 1SENA 4OPGA 2A2RA 3AD8B 4V2NA 2C3DA 5KVHA 4YSHA 1RSGA 2DMMA 3Q6OA 2QAEA 2F9SA 5EOWA 1JHBA 4MNNA 4GR1A 2IVEA 1YF1A 4C5OA 5AGYA 1IJHA 1PBEA 2PVQA 3K7TA 5F06A 3ZRDA 4MA9A 3SWLA 2GTUA 3ZLPA 1O6JA 1BEDA 2YLRA 5J41A 4EDZA 12GSA 2HZEA 2YM2A 2HXKA 4KH7A 3UMAA 3AE7A 3SFEA 4AP1A 2V32A 4USQA 3UP4A 2KP2A 4Z2RA 2QA1A 1EOGA 1SK2A 4OWYA 1ZL9A 5BMUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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