3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
2OLNA 2ZZ0A 1GESA 3CGCA 4K8DA 2YVGA 1UKVG 4OPGA 2XVHA 3GSIA 3GYIA 1E1NA 4B67A 3ISHA 3HZLA 5KWFA 1PBEA 3LXDA 3L1RA 4B1BA 3AE4A 3NKSA 1D4CA 2V6OA 1EL7A 2C65A 1GT8A 2JKCA 1GRTA 2R0CA 3P4QA 2JB1A 2Z5YA 5BUKA 3Q6JA 2CVJA 2HQMA 1ZKQA 5HYMA 2WDVA 1LQUA 1IUTA 1NEKA 1CF3A 2BCGG 4O5UA 4FDCB 2XFPA 2QA1A 2GVCA 3NK1X 3CPHG 1MXTA 1YY5A 1KF6A 3AEAA 3NYEA 5EOWA 1GV4A 1VQWA 2RABA 3P4RA 4YSYA 1H81A 1JU2A 2JK6A 4TLXA 3H8LA 5J7XA 1ONFA 2RGOA 3CGDA 3H4KA 1FEBA 2C3CA 3AB1A 3I6DA 3LZXA 1FECA 4H4PA 5C3JA 2BC0A 4FX9A 1TDNA 4GDPA 1CHUA 3VRBA 4YT0A 2NPXA 2BC1A 2YVJA 4CY8A 3UTEA 2H89A 3PVCA 2GRTA 3AD8B 1D5TA 1JEHA 3O0HA 3EAOA 2XCGA 2C64A 2BS2A 2H88A 3CNJA 1GREA 2FJDA 3Q9TA 3CPJG 1PBFA 4APNA 2YQUA 4X4JA 4MJWA 1F8WA 5IPYA 1K0JA 1YKJA 1JOAA 3ALJA 3KPFA 4IV9A 3F8PA 3VR8A 1KSUA 5FS6A 1JNZA 1O94A 1YQZA 1O5WA 1CBOA 1AOGA 3AD9B 2R0PA 3IC9A 3GMCA 5JCMA 4NTDA 1HYUA 2BK5A 2YG6A 4H2PA 3GYJA 2GQFA 4A5LA 3H8IA 2PYXA 4H4SA 3ICTA 2Q0LA 5EBKA 1TDEA 4Z25A 4CBQA 1FOHA 2FBWA 1IUXA 4C5OA 1LJ1A 2YAUA 2ACZA 1CJCA 1L9DA 5FS9A 5TR3A 1NHQA 4H7UA 2GV8A 5EB5A 4DNAA 2UZZA 1EL5A 2B76A 1V59A 2BA9A 1XPQA 3ALMA 2RGJA 3CNPA 3BI2A 4AT2A 2APGA 2EQ8A 1COYA 3DJDA 3G5SA 2IVEA 4OPIA 1S3BA 4Y4NA 2A8XA 2TPRA 4REKA 3VR9A 1RSGA 1M6IA 2BXRA 2B9YA 1CC4A 5FS8A 2JB2A 3FPZA 1L9EA 2VQBA 1NENA 1P2HA 2WPFA 2YG3A 3GWDA 1OJDA 4HA6A 1P2EA 2E1MA 4A79A 4C74A 3LZWA 2C75A 1QJDA 1H86A 1REOA 4RG3A 3AEBA 4GR1A 2WPEA 4CNKA 2VOUA 4PABA 2X8GA 5KVHA 1GERA 3AYIA 3UTFA 3UCLA 4OPCA 1E6EA 3UOVA 1X31B 3NRNA 2CFYA 5BVAA 3QVRA 4D03A 3DH9A 4H4YA 2WOVA 4PAAA 4UP3A 1PXCA 4OPDA 4K2XA 2YR5A 4M52A 3EPTA 2XLPA 3UTHA 4U2LA 4K5RA 2XFQA 3NYCA 1NDAA 3UTGA 4H4XA 1DODA 1VDCA 1YQ4A 3DK4A 4B66A 2YM2A 2AR8A 1Q9IA 5JCNA 4KX6A 3RHAA 3CNTA 1PS9A 3ABVA 4WCTA 4KPRA 3FG2P 2WP5A 1KDGA 2XLSA 1NPXA 3NGCX 3CIRA 1PXAA 1N4UA 4J34A 4LA1A 4AT0A 4U8IA 2V3AA 2AQJA 3OC4A 5EB4A 4EMIA 3DK9A 2XVEA 1DJNA 2OAMA 2YLTA 5DBJA 4I58A 3VQRA 4J57A 3R9UA 3ITJA 1TDFA 3KKJA 1Z6LA 1NHPA 2YM1A 3NNEA 3QFAA 4H2RA 2XFUA 3PO7A 1KNPA 3L8KA 3II4A 4EQRA 2ZBWA 4NEWA 3NN0X 5J60A 4OPTA 3QJ4A 2B9XA 4BURA 1GRBA 2XYOA 3F8DA 3ICSA 4NTCA 4EM4A 1VG9A 1D7YA 1GSNA 1TYPA 3AE2A 2ARDA 1KNRA 2V61A 1JNRA 2WDQA 2WQYA 3NT6A 4OCGA 3DGHA 4XXGA 4EMJA 3GRSA 1ZMDA 3B6DA 3AYLA 3GMBA 3DMEA 3UKLA 2YR6A 3AEGA 4ADWA 1E1MA 1XANA 2JAEA 4YXDA 3IHMA 4AOSA 4C3YA 5HHFA 2IVDA 1GXFA 1LPFA 2FJBA 5IQ1A 3T37A 1E1LA 1DXLA 1PDHA 1PN0A 1TDOA 2BACA 2BYBA 2EQ7A 2RGHA 4B68A 1PBCA 2GR2A 1D4EA 4U8NA 2XFNA 1D4DA 4YTNA 3AE3A 2WEUA 4TM1A 1O95A 2X3NA 3CPIG 4BK1A 3BHFA 2CDUA 2WOWA 2XFOA 4C3XA 2GQWA 3M13A 5U25A 4A65A 3UP5A 5M10A 3K30A 3LOVA 2J3NA 3C4AA 3EANA 2GR0A 1IUVA 1GRFA 2AAQA 2B9WA 1S3EA 3AE6A 2R4EA 4C77A 5BULA 2FJEA 4JN9A 1B4VA 3NLCA 4JNQA 2F5ZA 4JY3A 1GPEA 2W0HA 4YKFA 5FS7A 1E7PA 2CULA 2VZ2A 3CGBA 2OALA 2YLSA 2JBVA 4H4ZA 4B69A 3P4PA 1YQ3A 4J33A 1IUSA 3CNSA 5BRTA 2WU2A 4J2WA 4XWRA 2GB0A 1LQTA 1CJ3A 2YG5A 3NHOX 4Z43A 2GR1A 3D8XA 3AE5A 4H2QA 1GEUA 4YSHA 2C76A 2I0ZA 3GWFA 2Y6QA 3AXBA 2Z5XA 2EQ6A 1F6MA 2XVFA 4A7AA 4Z2TA 2WOIA 4U8LA 1B5QA 3M12A 1S2YA 1DNCA 3AE1A 1XDIA 3COXA 1CJ4A 3BNMA 2WESA 2ZZCA 3P1WA 3QVPA 2V3BA 2VQ7A 2YLZA 4J36A 3ZYXA 3BHKA 2WS3A 2XDOA 3E1TA 1DOEA 2C73A 3FMWA 4UDQA 5M0ZA 4DGKA 3NYFA 3KLJA 1L0VA 3LB8A 1Y56A 4A6NA 3GRTA 4AP1A 2X8HA 3V3NA 3VRDB 1Y0PA 1BKWA 1KSSA 1ZP0A 2VVLG 3AE7A 3BI5A 5GSNA 5KXJA 1IUUA 2DKIA 1M64A 1N4VA 4OPUA 1PHHA 1VRQB 1QLBA 3QSSA 4B65A 3AECA 3PS9A 4H4TA 3UKAA 3DK8A 1Y56B 2E4GA 3NN6X 1GNDA 5CQFA 2V60A 1GRAA 1K0LA 1PJ5A 4NZHA 4A99A 4UDPA 5HXIA 2C70A 1MOKA 4K22A 3LADA 2BABA 4Z2RA 4H4UA 4E0VA 1DOCA 2GH5A 3I3LA 4GRTA 5KRQA 2WDRA 2R0GA 3AD7B 4Y4LA 2QAEA 4ICYA 4TM4A 1PXBA 3NTAA 2WU5A 4TM3A 3UP4A 2DKHA 2O9ZA 3RP7A 1IUWA 4JQ9A 3CTYA 4Z24A 4AP3A 2X50A 3OZ2A 2YVFA 4O5QA 4EQXA 3SQPA 4LU6A 2C67A 1NHSA 1FCDA 2GEWA 3DA1A 4U8KA 3AEDA 3NK0X 4LIIA 5JCKA 4B63A 1BWCA 4BJYA 3UKQA 1N1PA 4EQSA 1H84A 1JRZA 2B7RA 3ZDNA 3UKHA 2WBAA 5U1OA 4TM0A 3NTDA 2E5VA 1ZX9A 1IJHA 1ZY8A 3SM8A 1EL9A 5JCIA 4EM3A 3SGLA 2BK4A 1H83A 2V5ZA 4EIPA 1NG4A 1Q1WA 1SEZA 4YTPA 1PJ6A 5ER0A 2XLUA 2QCUA 4YSZA 1DOBA 3ADAB 4USRA 4Z2UA 5KVIA 4N9XA 3F8RA 2YLRA 3V3OA 2A87A 1GRHA 1NAAA 1OJCA 4DSGA 3P9UA 2C3DA 2TMDA 3EF6A 1PBBA 2C72A 4U2SA 2C66A 4YSXA 4USQA 2C7GA 4NEVA 1LTXR 1H82A 1OJTA 4Z44A 1CC6A 4I59A 1NHRA 1D7LA 2YG7A 4JY2A 4H4WA 5LV9A 4U8PA 3NG7X 2BK3A 2Q0KA 1TDKA 3QFBA 1PJ7A 3C4NA 1W4XA 5FMHA 3G5RA 4BV6A 3RNMA 3NK2X 4NTEA 3IF9A 2BXSA 3ALLA 4FK1A 4J31A 1RYIA 1TYTA 4WX1A 4D04A 1KFYA 4P9SA 3M0OA 3ATQA 2X99A 3AE9A 2JB3A 4J56A 2WPCA 3UOYA 2IIDA 2X8CA 3UOXA 3D1CA 4IVOB 3K7QX 1L9CA 4RSLA 4YTMA 2R45A 2BS4A 2A89A 3IWAA 5CKUA 4ZCCA 2XVIA 3RP8A 2OLOA 3FIMB 3KU9A 4YKGA 4HB9A 1FEAA 2VRMA 5L46A 1ZOYA 2BCPA 1DJQA 4AOXA 3AEEA 3K7MX 4BJZA 1B37A 1QO8A 1ZOVA 2ZZBA 4Y4MA 3DJGX 1PBDA 4Z26A 1JRXA 1OJAA 2YG4A 2YR4A 1B8SA 1BF3A 4K5SA 1ZDLA 1BGJA 1JRYA 3DGZA 3SFEA 3VRAA 1LV0A 1ZMCA 1GOSA 3JSKA 1BGNA 4GF7A 4BK3A 4X9MA 1F8SA 2XVJA 3KD9A 2B7SA 4CCRA 5GRTA 3REDA 2GMJA 3WE0A 4B64A 2PHHA 5U63A 2NVKX 2OA1A 4ECHA 1ZK7A 2YWLA 3QSEA 3DJEA 4EMWA 1FL2A 1XHCA 2VVMA 4A9WA 2R4JA 5HY5A 1K0IA 1VG0A 4K7ZA 1CJ2A 4FK1C 4GDEA 2GAHB 3KA7A 2YLXA 1LVLA 3BNUA 2WP9A 1CL0A 1F8RA 3CN8A 3NIXA 1H7XA 4IVMB 4JDRA 4JNAA 2R9ZA 2R46A 2VRLA 3KVEA 4H4RA 2XLTA 3CNDA 5KOXA 1ELIA 4U8OA 4ZCDA 3SFDA 3UKPA 4EQWA 4GUVA 3ATRA 1Q1RA 5JCLA 3QSMA 3LJPA 1RP0A 3V76A 1F3PA 3AEFA 3S61A 4DSHA 1CC2A 3NH3X 4A6NB 3GDPA 1MO9A 5C2TA 2WP6A 1H6VA 4H2NA 1H7WA 2GAGB 3K7TA 4TLZA 2BS3A 1E1KA 3IHGA 1GRGA 2WHDA 4OVIA 3P4SA 2Q7VA 4U8MA 4BK2A 4CY6A 4H4QA 1GTHA 4UDRA 1BZLA 3GD3A 3AYJA 1K4QA 1TRBA 4CCQA 3ICRA 4U8JA 4YWOA 3AE8A 2Q6UA 2YLWA 3UKFA 2WETA 3GD4A 1EBDA 4H50A 1EL8A 4IA5A 4ZN0A 3DJJA 3S5WA 3CGEA 3FBSA 3GDNA 3URHA 5IQ4A 2VVLA 1GTEA 1NG3A 4H4VA 4XWZA 1GETA 2Y6RA 2EQ9A 4OPLA 3RP6A 2FJAA 3UKKA 4EIQA 3C96A 4IA6A 3G5QA 1GALA 1OJ9A 4RG4A 4U2TA 3BI4A 2QA2A 4X9NA 2GF3A 1S2QA 2XLRA 4GCMA 1N4WA 5KOWA 3B3RA 4CRTA 2GMHA 3AWIA 3UOZA 1E39A 4CNJA 2GR3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OLNA 5HQPA 2PERA 4MJBA 4K8DA 2BJXA 2VUPA 2F9SA 4ZL9A 4IHUA 1M9AA 3RPNA 3GSIA 4PGTA 2XVHA 3LGCA 4NV5A 3ISHA 1RK4A 2IJYA 4B1BA 3AE4A 4IBPA 1D4CA 3VI7A 3ZNQA 1OC9A 1GUMA 4Q5QA 2NBSA 5FT3A 2HQMA 3HJMA 5B6NA 1IUTA 2BCGG 4O5UA 2E48A 3VPTA 1MXTA 2IMFA 1VQWA 2RABA 2LTKA 1H81A 2JK6A 5HFKA 2DJ1A 1NSWA 3KEBA 3LXZA 4PNFA 4FYBA 2RLIA 1XVWA 3H4KA 4P3YB 3I6DA 5C3JA 4TR1B 1CHUA 1O7UA 2BC1A 3UTEA 3VK9A 3UVHA 2XCGA 3RPPA 2P31A 6GSTA 4EL1A 1PBFA 1YEPA 3CSHA 1X5CA 2H1AA 4MF6A 1TI1A 2HE3A 5B6MA 5IPYA 1K0JA 2VCQA 3UIWA 2OACA 1YQ1A 4MZCA 5D9VA 5FS6A 3FY7A 1A0RP 4MDCA 3CRTA 1O5WA 1B8XA 3AD9B 2R0PA 3IC9A 2YG6A 4H2PA 2GQFA 3ZLPA 2PYXA 3FRCA 2CQ9A 5IMAA 3TCOA 3LYPA 5EBKA 1B48A 2FBWA 4MH2A 4IELA 4EXJA 4ECBA 4POBA 4FQUA 2UZZA 1SL1B 3BI2A 3UBLA 2B7JA 5DDLA 4AT2A 4NV2A 2EQ8A 1TJDA 4LMWA 2IVEA 1YF1A 2TPRA 4REKA 1ZCPA 3IBHA 5IPGA 3CXGA 2H74A 1AQXA 2B9YA 1CC4A 5ECIB 4ECJA 1WMJA 2JB2A 2VQBA 2WPFA 1G7OA 10GSA 1K3YA 1H86A 1DAOA 2E2GA 3I69A 3KXOA 3M3MA 4PTSA 2WPEA 2X8GA 4WR4A 1JFUA 3TJGA 3AYIA 3UTFA 2YWOA 1ON4A 4NPBA 4O7HA 3GA4A 1OKTA 5J9BA 3NRNA 5BVAA 3QVRA 2FNOA 4PAAA 1PN9A 1K3LA 4H4YA 1S3CA 4RQRA 4K2XA 2YR5A 3UTHA 3CTFA 2XFQA 4H4XA 2A4HA 1DODA 1YQ4A 3UOMA 3DK4A 4B66A 2AR8A 4D73A 4KX6A 3GTUA 3CNTA 5JCWA 3ABVA 4WCTA 2XLSA 1Y6EA 1NPXA 3C73A 3NGCX 4LA1A 2WRTA 5GZZB 5EB4A 4E8EA 1YKCA 3R9UA 3WT1A 1NHPA 3NNEA 1R5AA 4IKHA 2OE1A 2LRCA 1GTUA 1F3BA 3SZCA 4RI6A 4MZBA 1Z9HA 3IR4A 3ICSA 4EM4A 1DE1A 1D7YA 4GAVA 1TYPA 4ZBAA 1QMVA 1KNRA 2WDQA 4GLTA 3NT6A 4OCGA 1XZOA 3C1RA 4MCUA 1TRSA 1U3IA 2QGVA 2LUSA 4ISDA 1ZMDA 3DMEA 2JAEA 1K0NA 3KH7A 1GTBA 3T37A 4OMVA 1PDHA 3DVXA 1PN0A 3PINA 4QL7A 2BYBA 3IC8A 2EQ7A 2LKUA 1R26A 2O89A 4WKWA 1I9DA 2GR2A 2R4VA 2HXKA 2O87A 2P5RA 3AY8A 2WS2A 4JEDA 2X3NA 3ERWA 3DKSA 3QFAC 4POKA 1NW2A 1YEXA 3K30A 4MPFA 1EZKA 4POMA 3C4AA 4V2NA 4WXTA 2ON7A 2GR0A 3D4TA 5LCZA 1GRFA 2Z9SA 2B9WA 1S3EA 2YP6A 2LJRA 3LW9A 4EVMA 3IE3A 7GSSA 2H0IA 4MABA 1E6BA 3VWXA 1M2BA 5FS7A 1E7PA 2DJKA 1LU4A 1ST9A 1VRSD 1A24A 4HJ2A 4MJCA 4LMVA 2JBVA 4H4ZA 1DUGA 1GSDA 1ILOA 1YQ3A 1IUSA 4V1Ap 5BRTA 1EGOA 4USSA 2WU2A 2L5LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2OLN A;  5HQP A;  2PER A;  4MJB A;  4K8D A;  2BJX A;  2VUP A;  2F9S A;  4ZL9 A;  4IHU A;  1M9A A;  3RPN A;  3GSI A;  4PGT A;  2XVH A;  3LGC A;  4NV5 A;  3ISH A;  1RK4 A;  2IJY A;  4B1B A;  3AE4 A;  4IBP A;  1D4C A;  3VI7 A;  3ZNQ A;  1OC9 A;  1GUM A;  4Q5Q A;  2NBS A;  5FT3 A;  2HQM A;  3HJM A;  5B6N A;  1IUT A;  2BCG G;  4O5U A;  2E48 A;  3VPT A;  1MXT A;  2IMF A;  1VQW A;  2RAB A;  2LTK A;  1H81 A;  2JK6 A;  5HFK A;  2DJ1 A;  1NSW A;  3KEB A;  3LXZ A;  4PNF A;  4FYB A;  2RLI A;  1XVW A;  3H4K A;  4P3Y B;  3I6D A;  5C3J A;  4TR1 B;  1CHU A;  1O7U A;  2BC1 A;  3UTE A;  3VK9 A;  3UVH A;  2XCG A;  3RPP A;  2P31 A;  6GST A;  4EL1 A;  1PBF A;  1YEP A;  3CSH A;  1X5C A;  2H1A A;  4MF6 A;  1TI1 A;  2HE3 A;  5B6M A;  5IPY A;  1K0J A;  2VCQ A;  3UIW A;  2OAC A;  1YQ1 A;  4MZC A;  5D9V A;  5FS6 A;  3FY7 A;  1A0R P;  4MDC A;  3CRT A;  1O5W A;  1B8X A;  3AD9 B;  2R0P A;  3IC9 A;  2YG6 A;  4H2P A;  2GQF A;  3ZLP A;  2PYX A;  3FRC A;  2CQ9 A;  5IMA A;  3TCO A;  3LYP A;  5EBK A;  1B48 A;  2FBW A;  4MH2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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