3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
3HZLA 2DKIA 1K0IA 1W4XA 4N9XA 1TDOA 1PDHA 1H84A 1TYTA 3CN8A 4BURA 1YQ4A 1NEKA 3NN6X 4EQRA 4OPLA 2BACA 5IQ1A 4B66A 4CY8A 2V5ZA 4YWOA 1PXAA 2YQUA 1QLBA 4B1BA 3UKHA 4C5OA 3VRBA 4YKGA 3AE1A 2C72A 3GYIA 4LIIA 3AWIA 1GSNA 4NZHA 3NN0X 1LJ1A 4U2TA 3ALJA 5GRTA 1N1PA 1Q1WA 1B4VA 4ZCDA 1LV0A 2R45A 2Y6RA 4ECHA 1NG4A 4GF7A 2PHHA 3C4NA 4M52A 3AYLA 3NTAA 1E1NA 2BXRA 1NENA 1PBCA 1F8WA 4K22A 3KLJA 3ITJA 1EBDA 2OA1A 2TPRA 3NIXA 3LOVA 2TMDA 2GEWA 5HXIA 2R0CA 2WBAA 3AD7B 3ICSA 4H7UA 4FK1A 2Q7VA 4YTPA 2XFNA 3DJEA 3KVEA 1ZX9A 4EMJA 4YXDA 3AYIA 4EM4A 3UP5A 2XVIA 4I59A 1TYPA 3NRNA 3SQPA 3BNUA 4C3XA 4B69A 2YR4A 3LJPA 1CL0A 5KRQA 1O94A 1M6IA 3FMWA 3COXA 4C3YA 3CNPA 3SFDA 4OPGA 1ZKQA 4X9MA 1L0VA 4B65A 1E6EA 3S61A 4J31A 1NHQA 2A89A 1PJ7A 1FL2A 2YM2A 3IWAA 2VRMA 1XPQA 2Z5XA 2B7SA 1B37A 1S2YA 3G5RA 4GDEA 3UKQA 5C3JA 1H83A 2XFQA 3AE3A 1BWCA 1S3EA 2X3NA 2VQBA 4CRTA 3NK2X 4YKFA 1PXBA 2BS2A 2WPCA 3DK4A 1LVLA 3ATQA 3AE2A 3G5QA 3QVPA 1YQ3A 1DNCA 3ICRA 3BHFA 4FK1C 2X8HA 5ER0A 3GWFA 5DBJA 2GQFA 2WEUA 4ZN0A 4TLXA 2OLOA 4U8IA 4DSHA 4H4YA 3KA7A 3CIRA 2WPFA 3CNDA 2R0PA 4U8LA 4ZCCA 1GTHA 1H6VA 2BK4A 2J3NA 3UOXA 4A65A 2GR1A 2IIDA 3NT6A 4A5LA 1LQTA 2JBVA 3NGCX 5U63A 3CPHG 1F3PA 4D03A 4H4ZA 1Y56A 1GERA 1GALA 1PN0A 2JAEA 1BKWA 1H81A 1ZK7A 1GREA 1QO8A 2RGHA 1GRGA 4J34A 4O5UA 4YTMA 5HHFA 4FDCB 2GV8A 1CHUA 1IJHA 1REOA 2GVCA 1H7XA 2YVFA 3DJDA 1KNRA 1KSUA 1ZOVA 3AE7A 1GNDA 3EPTA 5KOXA 1TDKA 1JRXA 1YQZA 2V61A 3ATRA 3NK0X 1Y56B 3DJGX 4YT0A 2X8CA 4EMIA 4EQXA 3NLCA 2BCGG 1F8SA 4RG4A 2I0ZA 5U1OA 2GRTA 4AP1A 3EANA 1OJAA 5EB4A 2XLUA 4U8OA 2XCGA 1EL8A 1JRYA 3NTDA 4IA5A 4Z24A 1IUVA 1X31B 3VRAA 1F6MA 3II4A 5IQ4A 4B63A 2C3DA 2B9WA 2JB1A 1DJNA 1K0JA 3L8KA 2YM1A 1EL5A 2BK5A 2BABA 3SGLA 2XFPA 3AE5A 2R4EA 1N4VA 5JCMA 3AD8B 1SEZA 5HY5A 3RP7A 3KKJA 3ALLA 1CF3A 1D4CA 2GR2A 3BHKA 3NNEA 1XDIA 5FS8A 1NDAA 3UP4A 2Z5YA 3AEEA 2YLTA 1JRZA 4U2SA 1O95A 1YY5A 3GRSA 3LXDA 4GCMA 3IHGA 3QFBA 4MJWA 1RP0A 3B6DA 4A7AA 2Y6QA 2XVFA 4E0VA 1UKVG 2B9XA 4OCGA 3FIMB 3AE6A 2VVMA 4H4SA 1KDGA 4J36A 5J7XA 3UTFA 4CCQA 4H4XA 3P9UA 4H2NA 2FJAA 4CNKA 4U8PA 3CTYA 1NAAA 2WOVA 4EIQA 1PBFA 1ZY8A 2QCUA 4IVMB 2YG6A 2QA2A 2WPEA 4OPIA 5C2TA 2C67A 3QVRA 2XLSA 5J60A 1BGNA 4H4UA 4CCRA 1TDEA 3FPZA 3L1RA 5L46A 2Q6UA 4YSHA 3AXBA 1PJ5A 5BRTA 3DK9A 4Y4MA 1ZMCA 3BI2A 4Z43A 1VDCA 2UZZA 3AE4A 4DGKA 1KSSA 1B5QA 4RSLA 2X50A 4UDRA 2IVDA 1D4DA 1K0LA 3P4QA 3PO7A 4FX9A 3RNMA 5M10A 1D5TA 4P9SA 1ZOYA 1BGJA 2WDQA 3GYJA 2VOUA 2GR3A 3D8XA 4C77A 2EQ8A 2YR6A 2BS3A 2JK6A 2CDUA 3D1CA 2DKHA 2BYBA 2E1MA 2A8XA 3GDNA 2RGOA 3AEBA 4YSYA 2O9ZA 3CGEA 3DMEA 2BA9A 2V6OA 4U8KA 4H4RA 2C70A 2ARDA 2WDRA 4A9WA 3F8PA 2C64A 5CQFA 1FEAA 3UOYA 4OVIA 1E39A 3ZYXA 5FMHA 1H86A 2ZZCA 3DK8A 2VZ2A 1YKJA 3GSIA 3LZWA 4J2WA 3GWDA 1PBDA 3AE8A 3UTEA 1GRHA 3P4PA 5JCKA 3H8LA 4H4QA 3SFEA 3RHAA 1D7LA 1GRAA 3NHOX 2YAUA 1K4QA 1GRTA 3AD9B 3GD3A 4B67A 1QJDA 5KOWA 1S3BA 2OLNA 4TLZA 3ZDNA 4U2LA 4AT0A 4GDPA 3VR9A 1KFYA 2VVLG 2QA1A 2WQYA 3CGCA 1TDNA 2WHDA 4LU6A 4U8MA 1DJQA 1Z6LA 2V60A 4TM4A 3V76A 5KWFA 4EQSA 5BUKA 4EIPA 2GMHA 2H89A 3Q6JA 1EL9A 2GAGB 2YG4A 1F8RA 4H50A 1O5WA 4I58A 3ALMA 1NG3A 3AEAA 1RYIA 2YLSA 3H4KA 3BNMA 3QSEA 4XXGA 3IF9A 1OJTA 3T37A 1GETA 4H2RA 2Q0LA 1S2QA 2NVKX 2ZZ0A 4TM0A 1IUWA 2WP5A 4CBQA 1CBOA 1L9CA 2GB0A 2WP9A 4GUVA 4IA6A 2B76A 3DGHA 1ZP0A 4NTDA 3P4RA 4BJYA 4UP3A 5GSNA 1E7PA 1AOGA 3K7MX 1L9DA 3SM8A 1DXLA 3M0OA 4H2PA 1P2EA 1VQWA 1E1MA 4Y4LA 1COYA 3PS9A 4BK2A 1B8SA 4HB9A 1CJ2A 3NYEA 2AAQA 1XANA 1BF3A 4XWZA 2WESA 1PJ6A 2C66A 1JEHA 4K8DA 4BK1A 2C65A 4IVOB 2BK3A 1NHSA 1XHCA 5EB5A 3K30A 4IV9A 4Z2RA 1CC6A 3GMCA 3V3NA 1KF6A 3B3RA 5JCNA 3ISHA 4H4WA 3NYFA 5FS6A 1E1KA 1FECA 3P1WA 4AP3A 2FJDA 1L9EA 1GOSA 1TDFA 3OZ2A 3LZXA 4C74A 2YLWA 2APGA 2ZZBA 4USQA 2R4JA 5JCIA 1GTEA 4CY6A 4GR1A 3F8DA 1NPXA 1IUSA 2NPXA 4KX6A 4NEWA 1ZDLA 3KPFA 1OJDA 1NHPA 2WOWA 2XFOA 1VG0A 1PBEA 1PBBA 2WETA 3LADA 1IUXA 4UDPA 1H7WA 4JQ9A 3UKLA 3M12A 4RG3A 1PHHA 1GT8A 4JN9A 2E5VA 3FG2P 4UDQA 4K5RA 1P2HA 5HYMA 3NYCA 3QJ4A 4PABA 2Q0KA 3RP8A 3BI5A 1GRBA 3QFAA 2BC1A 3JSKA 4YSZA 4U8JA 1ZMDA 2GAHB 2V3BA 3UOZA 1N4UA 1JOAA 3CPJG 5CKUA 1VG9A 1CC4A 1FOHA 2OAMA 2VRLA 1RSGA 1OJCA 5JCLA 2JB2A 3LB8A 4H4TA 2BS4A 3UTHA 4A79A 3AYJA 2C76A 4AOSA 4X4JA 3DA1A 4BV6A 1M64A 3ICTA 4J56A 1H82A 2AR8A 5TR3A 4NTEA 4KPRA 2GR0A 3NK1X 1MO9A 4USRA 1GPEA 2FBWA 1MXTA 3AEDA 4WCTA 3AB1A 3NH3X 4OPCA 2BXSA 2XLTA 3FBSA 3VRDB 4K2XA 3H8IA 2BC0A 5KVIA 2YVJA 3F8RA 4TM3A 4K5SA 4OPTA 4JY3A 3AECA 2B7RA 4Z26A 3S5WA 2C73A 2X8GA 3CPIG 4ADWA 3CNTA 1Q9IA 4WX1A 5FS9A 5KXJA 3IHMA 2R46A 2ZBWA 3GRTA 4Z25A 1PXCA 5BULA 4B68A 2XYOA 2EQ6A 2YG3A 2YR5A 2YLXA 1DOEA 1ELIA 4J57A 5FS7A 1LTXR 3V3OA 2IVEA 2XVHA 3NKSA 1PS9A 1CC2A 5EOWA 2QAEA 3CNSA 2HQMA 3DJJA 2C75A 2XFUA 1JNRA 2RGJA 3VQRA 3IC9A 4A6NA 1MOKA 1HYUA 4H4PA 3GD4A 3GMBA 1N4WA 1JNZA 4BK3A 4B64A 1GXFA 3BI4A 4DSGA 1DOCA 2XVEA 3K7TA 5BVAA 2XLPA 3EAOA 4A99A 2AQJA 2C7GA 5LV9A 1FCDA 2ACZA 3CGDA 3O0HA 4EMWA 4A6NB 4TM1A 2R9ZA 3CGBA 1V59A 2XLRA 2E4GA 2V3AA 3UOVA 4Y4NA 4K7ZA 1EL7A 2JKCA 2WS3A 3UTGA 2EQ7A 4CNJA 1CJ4A 2H88A 4D04A 1NHRA 1D7YA 2F5ZA 4OPUA 4ICYA 2FJBA 1IUUA 5KVHA 3Q9TA 1CJ3A 3UKAA 3AEFA 3DGZA 3AEGA 3QSMA 2WDVA 4J33A 3REDA 1LPFA 1VRQB 4Z2UA 1CJCA 2CFYA 2XVJA 1OJ9A 3EF6A 4JNAA 4NTCA 3UKPA 1DODA 5EBKA 4PAAA 2BCPA 3OC4A 5U25A 4EQWA 1TRBA 2YVGA 3ADAB 4U8NA 2VQ7A 4YSXA 1E1LA 2W0HA 2GH5A 3GDPA 3CNJA 5IPYA 1FEBA 2A87A 1BZLA 4XWRA 1ONFA 2GF3A 4H4VA 2CULA 2WP6A 4Z44A 3C4AA 3E1TA 3M13A 1DOBA 4O5QA 3I6DA 2YG7A 3KD9A 3QSSA 2R0GA 3P4SA 4DNAA 3DH9A 1Q1RA 1GRFA 4JNQA 1KNPA 3UKFA 2YG5A 3K7QX 3VR8A 4LA1A 1IUTA 1GV4A 2X99A 2YLRA 2YWLA 2GMJA 3AE9A 2EQ9A 4HA6A 4NEVA 3RP6A 2WU2A 4JY2A 4BJZA 2YLZA 3UCLA 2VVLA 4AOXA 4JDRA 2JB3A 3I3LA 2GQWA 1Y0PA 5M0ZA 3WE0A 3G5SA 2RABA 4X9NA 2PYXA 4OPDA 2FJEA 3PVCA 4H2QA 4YTNA 3KU9A 3R9UA 4GRTA 2OALA 1JU2A 2B9YA 3C96A 3NG7X 1GESA 2WOIA 2CVJA 3UKKA 4Z2TA 4REKA 3URHA 1LQUA 4EM3A 4AT2A 4APNA 1GEUA 2WU5A 2XDOA 2C3CA 3ABVA 1D4EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F4TA 2JACA 1PDHA 5A5KA 5IMDA 2PGTA 3LXTA 2FNOA 5INYA 3MAKA 1NEKA 4OPLA 1O8WA 2BACA 4ML1A 4ULXA 5IQ1A 3O3TA 3CYNA 3BCIA 4CY8A 4B66A 3P8WA 1PXAA 2OE1A 4KCEA 5D9TA 1O6JA 1KEBA 3G7YA 1AW9A 4U2TA 3ALJA 4OCFA 5GRTA 1N1PA 4ZCDA 1LV0A 2Y6RA 2PHHA 3C4NA 3VK9A 5ECNB 5AIVA 1XVWA 3RAZA 5J5NA 1GNWA 1NENA 2H0HA 1S3DA 2MMAA 2PBJA 4K22A 1F8WA 1KIFA 1QMVA 3Q74A 2TPRA 5ECMB 1S3AA 2WBAA 2PN8A 3A2WA 2N5FA 2FCHA 4WR5A 2HZEA 3GTUB 2PUKC 4IP1A 1ZX9A 1K0CA 3NRNA 3NZNA 13GSA 4PQIA 3G7IA 1KNGA 1XOAA 6GSXA 1FW1A 1O94A 3COXA 1O73A 4B65A 1E6EA 4ZB8A 3E0UA 1NHQA 4F82A 1E6BA 2LJRA 3TJBA 2CVBA 4LLRA 3TKQA 3IWAA 1FOVA 2JZSA 4ZBAA 4TR4A 4G0IA 3UKQA 3KPKA 3LYPA 3IAM2 4MJAA 2XFQA 3IOSA 1JZWA 2VQBA 4YKFA 1PXBA 3BCKA 2CZ2A 5HR3A 2BS2A 3DK4A 1LVLA 1DUGA 3G5QA 3FZ5A 3ICRA 4FK1C 2X8HA 1SJIA 2CX4A 2IL3A 3GWFA 2WEUA 3KP9A 3FEUA 2WPFA 2R0PA 4MF5A 2J3NA 2BK4A 2DSAA 2YWOA 1LQTA 1F3PA 3SZ0A 4H4ZA 1GSDA 1GALA 2YLRA 1BKWA 2RGHA 4WEYA 1H81A 4J34A 2FWGA 3D21A 2GVPA 4RQXA 1TW9A 2YVFA 3DJDA 2VLUA 2FGXA 1WOUA 1TDKA 1MTCA 3EVIA 5F07A 4EMIA 4MH2A 2EIQA 1TP9A 2GRTA 4AP1A 3EANA 5KN2A 2L5LA 3LSZA 1WPIA 3F6DA 1H4OA 1F6MA 3QR6A 4B63A 5ECLB 2PVQA 1DJNA 1MDKA 1EL5A 5CO3A 5D8IA 2GDRA 3AD8B 1GH2A 1T3BA 3LORA 3RP7A 1HNAA 3KKJA 3ALLA 3BHKA 1D4CA 2GR2A 3QOUA 5FS8A 3DRNA 3UP4A 2Z5YA 4U2SA 2FY6A 3GRSA 3LXDA 5DALB 4MJWA 3GN3A 4A7AA 2Y6QA 1TRUA 2B9XA 2VCVA 1ZZYA 4CCQA 1G0TA 3H8QA 4TR0A 3P9UA 2FJAA 4H4XA 2Z9SA 1NAAA 3PH9A 2WOVA 1Y6EA 5HR2A 2QA2A 2WULA 1TI1A 1PMTA 1UN2A 3CMMA 2WPEA 4OPIA 2C67A 2WB9A 3GX8A 2OKAA 5ECRB 1BGNA 5ID2B 3GKNA 1TDEA 1TOFA 5L46A 2Q6UA 2E49A 4HSCX 1PJ5A 5BRTA 2B5YA 1QK8A 3GFKA 4Z43A 2K8SA 2QGVA 1VDCA 4MABA 2IVDA 4RSLA 1D4DA 3P4QA 2WZ9A 3GYJA 2JK6A 2CDUA 2E1MA 3K8NA 1M2BA 3HJOA 3OR5A 3R2QA 3A5IA 1SK2A 4FYCA 2C70A 2WDRA 4A9WA 2C64A 5B8BA 3UOYA 3RHCA 2E48A 1GP1A 3ZYXA 2DMLA 5FMHA 2IWTA 3UBKA 4TXVA 3LFLA 5H5SA 1GRHA 1D7LA 5D9XA 1K4QA 2H0GA 1QJDA 1YDKA 2OLNA 2B7KA 2YWNA 4TLZA 4AT0A 3VR9A 3SBCA 2QA1A 3WGDA 3CGCA 5GZZB 4AGSA 2C80A 3GL5A 3M3MA 3MDKA 5CP1A 4ZL7A 3G3EA 2WHDA 4NPBA 1Z6LA 1U6TA 2V60A 4G0LA 5LNKe 5KWFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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