3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RdmE
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
source organism Streptomyces purpurascens
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
1P2HA 1V59A 4TLXA 1PJ7A 2BABA 4NZHA 1N4VA 4IVOB 3KU9A 4H2NA 1H81A 3UKFA 2WPFA 3AE7A 3KKJA 2APGA 3DH9A 1LQTA 3GRTA 2E5VA 3NH3X 1DNCA 1VG9A 2X8GA 1H82A 2VOUA 5KOWA 1ZDLA 2WESA 1GALA 2WPEA 3P4RA 4DSGA 4YSZA 1GNDA 4J36A 1JNZA 4RG4A 4D03A 3FBSA 1MXTA 3K7QX 2YG5A 3HZLA 4U8LA 1H7XA 2GR1A 3P9UA 4U8NA 1DOEA 4Z43A 4ECHA 3PO7A 5GRTA 1REOA 5JCNA 1JRXA 2V3AA 4IA6A 4USRA 3NK2X 1L9EA 1M6IA 2AR8A 2BK4A 2Q7VA 2XFOA 1N4WA 1ZOYA 2WU2A 4NTCA 5KVHA 4Z2RA 1QLBA 2YLRA 2ZBWA 3DMEA 2O9ZA 2FJBA 4O5QA 4WX1A 3G5RA 3ABVA 3IWAA 2A8XA 5J60A 5FS8A 1GESA 1E1KA 2XFQA 3K7MX 2YLXA 4TM4A 2V6OA 2BK5A 4HA6A 2XLUA 1XANA 3EPTA 1NHPA 3PVCA 2VRLA 1GETA 1F8RA 2XVEA 2GV8A 3C96A 3LJPA 4OPIA 3REDA 2XLPA 1LV0A 1D7LA 4U2LA 4JNAA 2WOWA 3M12A 3AEAA 3CNJA 4U8IA 3M0OA 4OPUA 2DKHA 1EBDA 1VQWA 4TM1A 3UKPA 3VQRA 2YLSA 4BURA 5IPYA 2C65A 3UOVA 4H2RA 1DOBA 2JBVA 1LVLA 2GMJA 3GDNA 3IF9A 4EMJA 1GREA 3AWIA 1TDKA 1PN0A 2I0ZA 4OCGA 5KWFA 4UP3A 3UTHA 1IJHA 2XLRA 5IQ1A 2VVMA 3AYIA 2C75A 2WOVA 3AE3A 2FJDA 3NLCA 1K0LA 4E0VA 3UKQA 3DJGX 3I3LA 1L0VA 2GB0A 4A79A 2GAHB 2BC0A 3VRDB 1YY5A 1TYPA 4TM0A 4B67A 1PXAA 4U2SA 2WPCA 2V3BA 1PS9A 3RHAA 1FECA 3O0HA 4K8DA 3JSKA 2BA9A 4EIPA 2BXSA 3F8DA 2BK3A 2GR2A 4H7UA 4MJWA 1ZP0A 4YTMA 2B7SA 2Z5YA 1VG0A 4H2PA 1GRTA 1VDCA 2R9ZA 2VVLG 3DK8A 3I6DA 5M0ZA 5FS9A 4Z2TA 1GRFA 3VR9A 5J7XA 3BHKA 3IC9A 1S2YA 4PABA 2C3DA 2VQ7A 3ADAB 2W0HA 1KNRA 5C2TA 4U2TA 4K5RA 1GRHA 2YM2A 3AECA 3UOYA 3AEDA 4YWOA 3QFBA 1DOCA 2J3NA 3BNMA 4EM4A 3ALLA 1E1MA 1TRBA 1E7PA 1H86A 2IVEA 3CGCA 2C7GA 3DJDA 2X99A 1UKVG 5LV9A 4B65A 4CBQA 1TDFA 2NVKX 5BUKA 5BULA 4H4SA 4RSLA 3VRAA 3NHOX 1KSUA 1AOGA 3GD4A 1Y56B 1DJNA 4TM3A 4Z2UA 3AE5A 3P1WA 1XHCA 3H8IA 2GQWA 3GMBA 4H50A 5HY5A 3GMCA 1IUTA 1IUUA 1GOSA 1PJ6A 1W4XA 4U8MA 4K2XA 1CHUA 2FJEA 2GMHA 1KSSA 3C4NA 3FPZA 3KVEA 3OC4A 1OJCA 3UKKA 5JCLA 1L9CA 3AB1A 3L8KA 2YG4A 1NG4A 2C73A 1ZMDA 3SGLA 1XDIA 5EB5A 3EANA 2EQ8A 2Z5XA 4HB9A 1B37A 4FDCB 3FIMB 3NNEA 4FX9A 1OJAA 4C5OA 3ATRA 4EIQA 1NHQA 3DJEA 2DKIA 1CL0A 3II4A 3NRNA 1S3BA 4CRTA 5JCIA 2XFUA 3UP4A 1FOHA 1K4QA 5BRTA 1ZOVA 3OZ2A 5FMHA 2H88A 2Q6UA 1GT8A 2WOIA 3DGHA 1D4EA 3EAOA 4A6NB 3NK0X 1CC2A 1F8SA 2GQFA 3CNPA 3EF6A 3P4QA 4LA1A 3P4PA 5FS7A 4GF7A 1CC6A 2C70A 2YLTA 4N9XA 1GERA 4EQSA 1SEZA 1E1NA 4J33A 4JQ9A 5DBJA 2BCGG 1GTHA 1EL7A 1P2EA 3AEBA 4NTEA 4B1BA 1EL5A 1HYUA 1PBDA 3NN6X 4Y4NA 3RP7A 1JOAA 3CGEA 3S61A 3AE9A 2X3NA 1KNPA 1D4DA 4EQRA 3ZYXA 2C3CA 5U1OA 4OPTA 4YXDA 2YWLA 4A65A 2YG3A 2YQUA 2QA2A 3AE4A 2ZZ0A 1PBBA 2YR5A 2B9YA 3B3RA 1RP0A 2B7RA 1O94A 4A7AA 2XVJA 2Y6QA 1FEBA 5EBKA 3ISHA 4D04A 2X50A 3CNSA 1KDGA 3GD3A 4YSYA 3K7TA 3AD8B 3V76A 4YT0A 1JNRA 2A87A 2UZZA 3AE6A 4IA5A 2R0CA 2WP9A 4H4QA 2E1MA 3M13A 1D7YA 3LXDA 5C3JA 2QAEA 4UDRA 4H4TA 4JNQA 4CNKA 5KOXA 1LPFA 2HQMA 3AEGA 2JB3A 1YKJA 2YG6A 4REKA 3FG2P 1COYA 1E1LA 4FK1C 1Y56A 2XVHA 4YTPA 4USQA 1ZKQA 2C66A 4YSXA 4J31A 4H2QA 1IUXA 3DJJA 3URHA 4CY6A 1Q9IA 3ICRA 4A9WA 1QO8A 2F5ZA 3S5WA 1Q1WA 2EQ9A 2R46A 3AYLA 2V60A 5HHFA 2WBAA 3UOZA 3UCLA 4XXGA 3H4KA 4OPDA 2ARDA 1NDAA 2RABA 4EMWA 4H4YA 1OJTA 4CCQA 1L9DA 1ZY8A 2BACA 4B68A 2BCPA 2YLZA 1K0IA 2TMDA 2CDUA 3DK9A 5U25A 3G5QA 4AT2A 3AXBA 1PBCA 3VR8A 3AE1A 1NHSA 4A5LA 3AYJA 1O5WA 2E4GA 4C3XA 2WDVA 2BYBA 2BS3A 1O95A 1DODA 1DJQA 1VRQB 5KXJA 2XYOA 4PAAA 1GSNA 2JKCA 3LZWA 5GSNA 3R9UA 1JRZA 4X4JA 2CULA 5CKUA 4Z26A 3BNUA 2GAGB 3SQPA 4K22A 1Y0PA 2OLNA 4A6NA 4UDPA 2NPXA 1B5QA 5L46A 1D4CA 1GEUA 2JAEA 4GCMA 4AP1A 1BF3A 1E39A 2JB2A 4GR1A 1ONFA 2JK6A 3NTDA 2BC1A 1XPQA 2QCUA 1X31B 3NT6A 4XWRA 4EM3A 5KVIA 1BKWA 4U8PA 1PBFA 3QSSA 1KFYA 3BI4A 3RNMA 4EQWA 3DGZA 4H4ZA 5JCMA 5HXIA 4K5SA 2RGHA 1TYTA 1LQUA 2OLOA 2VVLA 2YM1A 2V5ZA 4U8OA 3COXA 2XFPA 1N4UA 2WP5A 2WHDA 2H89A 2C72A 3C4AA 4BJYA 1OJ9A 2V61A 3GWFA 2C64A 3UTGA 4GDEA 1GRAA 4GUVA 5CQFA 4WCTA 2VZ2A 4DGKA 3KPFA 3CPJG 2WDRA 4JY3A 4C77A 4X9NA 1ZMCA 3GSIA 3CTYA 4TLZA 4YSHA 3GRSA 2R45A 2VRMA 4OPGA 1GV4A 2CFYA 3B6DA 1RSGA 3KD9A 4H4PA 1CC4A 1NPXA 2GR0A 5TR3A 4BJZA 2XFNA 4Y4LA 3T37A 3ZDNA 3SM8A 3BI5A 3LB8A 1S2QA 4U8JA 3NYFA 1PDHA 4EQXA 1TDOA 3GYIA 4Z44A 2B9XA 2VQBA 3IHMA 1TDNA 4FK1A 4I59A 4XWZA 4AOXA 3QFAA 1JEHA 4BK3A 4NEVA 3QJ4A 3CGDA 2GR3A 3SFDA 3K30A 2B76A 2RGJA 1D5TA 1YQ3A 3WE0A 2XDOA 1KF6A 5BVAA 2BS2A 3L1RA 3G5SA 4IVMB 2YVFA 3GWDA 1YQZA 4IV9A 4EMIA 2X8HA 5EB4A 1Q1RA 4B64A 2R0PA 1TDEA 5IQ4A 4JY2A 1E6EA 4J34A 4APNA 4Z25A 4KX6A 2WDQA 2GEWA 2BXRA 2XLTA 4H4RA 4AP3A 3ICTA 4C3YA 2R4JA 4CNJA 2XVFA 4J57A 3Q9TA 4H4UA 2PHHA 1IUVA 1CF3A 3BHFA 1ZX9A 4GRTA 1H83A 1NHRA 3AE2A 4H4VA 3RP6A 1CJ2A 1JU2A 2WETA 2FBWA 4J56A 4NEWA 4O5UA 1BWCA 2IVDA 3AE8A 1M64A 2OAMA 1CJ4A 2OALA 4P9SA 4RG3A 4YKGA 3UOXA 3UKAA 1NG3A 3E1TA 3SFEA 3D1CA 4U8KA 3ITJA 3AEEA 4J2WA 2XCGA 3P4SA 2PYXA 2R4EA 4BK1A 2YVJA 1BZLA 2R0GA 1JRYA 1PHHA 5FS6A 3NG7X 3QVPA 3UTFA 2YG7A 5U63A 3QSEA 3V3OA 1NENA 3Q6JA 2Q0LA 3CN8A 2EQ7A 1NEKA 4UDQA 1YQ4A 2YAUA 3F8RA 4DSHA 4OPLA 3CIRA 1QJDA 4LIIA 1LTXR 1RYIA 2EQ6A 4LU6A 2Y6RA 4CCRA 4Y4MA 3NK1X 1GTEA 1BGJA 1ELIA 1IUWA 2GF3A 1B8SA 2GRTA 2YR4A 3NTAA 4I58A 1H7WA 1Z6LA 4KPRA 4NTDA 1CJ3A 1GPEA 2X8CA 3NYCA 3LOVA 2B9WA 2ZZBA 1MOKA 2AQJA 2GVCA 1ZK7A 3V3NA 3FMWA 1FCDA 3ATQA 4B63A 1DXLA 4BK2A 1LJ1A 4OPCA 1F8WA 3NIXA 4H4WA 1BGNA 2JB1A 2IIDA 1GXFA 1H6VA 2TPRA 2WS3A 1B4VA 3DA1A 4AOSA 2A89A 3KA7A 4ADWA 3H8LA 5ER0A 5HYMA 3NKSA 5EOWA 4Z24A 3LZXA 3UKHA 2RGOA 1F3PA 2GH5A 2FJAA 3ICSA 4B69A 1CJCA 3CNTA 2BS4A 3UP5A 1GRBA 2YR6A 2QA1A 3AD7B 3IHGA 1MO9A 2WP6A 4YKFA 1F6MA 3CPIG 4ZCCA 1K0JA 4ZCDA 3BI2A 4OVIA 3PS9A 3CPHG 3KLJA 1FEAA 3CGBA 3GYJA 4GDPA 3UTEA 4BV6A 2OA1A 3NN0X 4JN9A 1PXCA 5KRQA 2WQYA 4CY8A 1N1PA 2XVIA 2ACZA 4H4XA 4X9MA 2C76A 3UKLA 1PJ5A 2CVJA 4AT0A 1EL9A 3CNDA 1FL2A 2YLWA 3NGCX 1PBEA 1PXBA 4YTNA 4A99A 3AEFA 3GDPA 2Q0KA 2ZZCA 1GRGA 2WEUA 3QVRA 3F8PA 3DK4A 5JCKA 2C67A 3ALJA 2WU5A 3ALMA 3RP8A 3QSMA 4C74A 1CBOA 5M10A 4M52A 4K7ZA 1IUSA 3AD9B 4DNAA 2YVGA 1EL8A 2XLSA 3D8XA 2AAQA 4ZN0A 3NYEA 1OJDA 1S3EA 4B66A 4ICYA 3LADA 4JDRA 1NAAA 1H84A 3VRBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NZHA 4IVOB 4YJFB 2LQQA 4POMA 1XVQA 3DH9A 4AGSA 3IAS2 1VG9A 2X8GA 3VPQA 1AC1A 2C8UA 3F4RA 1H7XA 4Z43A 4KDUA 4ECHA 3PO7A 1K0DA 2V3AA 2K9FA 1C0KA 3UVTA 2AR8A 2Q7VA 2XFOA 3M3MA 1ZOYA 1HNBA 4NXIA 4NTCA 1SK1A 4MPFA 4FYCA 1X9MB 1NW2A 2YWNA 6GSSA 4F2IA 4TRXA 1VF1A 2GZZA 5ECLB 4XHMA 2PVQA 5ECQB 2XFQA 3CRUA 3K7MX 2YLXA 4MPGA 1XPVA 3F3QA 4TM4A 4ZBBA 4K0GA 2YOIA 5JCUA 1XANA 1NHPA 5C04A 1T1VA 3C96A 1F8RA 2LRTA 4OPIA 3REDA 2AHEA 1GSEA 3IHQA 5G30A 5JCWA 1UA5A 1M2DA 4XS4B 1EBDA 4MF7A 5IPYA 3FKFA 3UOVA 2E48A 1ZYEA 3AWIA 2LNSA 2VL9A 2H74A 2KLXA 5DAKA 5KWFA 3CTFA 5B6NA 3IOSA 2XLRA 3LFLA 5IQ1A 3F9UA 4PNGA 2VL2A 4WR4A 2OKAA 3DJGX 3I3LA 4A79A 3RPPA 2C80A 3RHCA 1PXAA 1DDOA 4U2SA 4HZ4A 4G9KA 1FECA 3HY2A 1QXHA 2GSRA 1YJ6A 2H75A 2JSZA 2AAWA 2B7SA 2Z5YA 2I81A 3DMLA 1VDCA 1GRFA 2VQ7A 2W0HA 2FNOA 5C2TA 1WJKA 3GX8A 2YM2A 1ILOA 3US3A 3AEDA 2YWIA 2C4CA 1DOCA 2NDOA 4ZL7A 3UJ1A 1TRBA 1H86A 1WP0A 4MNNA 2E2GA 2YANA 4X1UA 3TJJA 4YJGA 2L4QA 3KGKA 1TI3A 3NZNA 1A0FA 1XHCA 3MIXA 4U8MA 3ZMLA 3TCOA 4IP6A 1K3OA 1XWKA 1KSSA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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