3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
source organism Streptomyces purpurascens
molecule keywords RdmE
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
2B9YA 3NYCA 1E1KA 1OJDA 4CNKA 4U2SA 3QSEA 3EANA 2WU2A 4TM1A 2GAHB 2DKIA 4EMWA 4USRA 2X3NA 3AE3A 4GDPA 1KF6A 1RSGA 4U2LA 2VOUA 3AWIA 1O94A 1HYUA 1DJQA 3AEBA 2I0ZA 3H4KA 4APNA 1IUWA 1IUUA 5BVAA 1ZKQA 3PS9A 3BI5A 4K7ZA 4Z2UA 3ALJA 1JOAA 3DA1A 4GRTA 3BI2A 4A65A 2GB0A 1LQTA 1P2EA 1YQ4A 3UTEA 3QVRA 4KPRA 2TPRA 3EAOA 3T37A 4EM4A 4U8IA 1PJ6A 3K7QX 4CBQA 1JEHA 3ATQA 4NTDA 3DK9A 4EQSA 5IQ1A 1GSNA 5FS6A 4YSZA 1E1NA 5U1OA 5JCKA 2WDQA 5KXJA 3GWFA 3DMEA 5DBJA 1Y56B 1KSUA 3LADA 4A6NA 1Y0PA 1E1LA 1OJTA 3AYJA 5GRTA 3SFEA 4CY6A 4JNQA 1QLBA 1FEBA 4JY2A 1SEZA 2XVEA 4X9NA 3L1RA 2YG6A 1D7LA 4Y4LA 3CIRA 3JSKA 2JKCA 2C3DA 3UTGA 4YSYA 2BACA 4YXDA 4WCTA 2GR0A 3KA7A 2CDUA 4B1BA 3B3RA 2IIDA 3LJPA 1VG9A 3GRSA 1DOBA 2C76A 1XANA 2J3NA 1D5TA 2Q0KA 4A9WA 1ZK7A 4C74A 1NHSA 1D7YA 1CJCA 4H4WA 1D4DA 4J34A 1D4EA 5J7XA 3ZDNA 5JCNA 2YVJA 2B7RA 3AECA 2XLTA 2QA1A 4JQ9A 2YR4A 1FECA 1H7XA 1XHCA 2ARDA 1YQZA 2BXRA 2YLTA 3DGZA 2AR8A 4B64A 1TDEA 3M13A 5JCMA 4Z2TA 1DOEA 2BS2A 3NK0X 3ZYXA 2R0GA 3FG2P 2V3AA 1PXCA 2YG4A 1Q1RA 1TDFA 3UOYA 2FJBA 1CL0A 3NH3X 4YTNA 4IA5A 5FS9A 1L9DA 3I3LA 4IV9A 1S3EA 2WS3A 2JK6A 4JN9A 1LPFA 1ZX9A 2V6OA 4BK2A 1OJAA 3KPFA 3QSSA 3CNSA 3D1CA 2YG7A 1ONFA 5EBKA 4K8DA 1NPXA 2R4JA 3C96A 2R45A 4RSLA 4J2WA 4NZHA 1H6VA 3AD8B 2XVIA 3QJ4A 1ELIA 3NN6X 1KDGA 3RP6A 4H50A 2A89A 2GQFA 2RGJA 4FDCB 5C3JA 5J60A 4H2PA 1H84A 2B9XA 2RABA 2YLZA 1NHPA 1O5WA 1RYIA 3ATRA 3FBSA 5CKUA 1H86A 2WDVA 1XPQA 4NEWA 4U8JA 2TMDA 3NGCX 1L9EA 1GRFA 3CPJG 1YKJA 3UKAA 4Z44A 1N4UA 2XVHA 1REOA 4MJWA 2GMHA 3RP7A 3UKHA 2C73A 4K5RA 4ZCDA 1KFYA 1ZY8A 2FBWA 3RHAA 3LZWA 4U8LA 3RNMA 1GREA 3KVEA 1BWCA 3AE1A 4U8OA 3CGCA 3AD9B 3IF9A 4YSHA 1E1MA 4LU6A 3L8KA 3UP5A 4EM3A 2VRLA 2RGHA 3AEEA 1FEAA 3LXDA 4EQXA 4TLZA 1KSSA 1TDKA 2JAEA 2YLSA 3F8PA 1ZMDA 4YTPA 1JRYA 2GAGB 3AE8A 3G5SA 4PABA 3P1WA 1CC4A 3O0HA 5U25A 2PYXA 1EBDA 5ER0A 2YG5A 4H2QA 3ICSA 5EB5A 5FS8A 2C67A 2JB3A 4C3XA 1ZMCA 3FMWA 2A8XA 2WOVA 2F5ZA 4CNJA 5L46A 1Y56A 3KKJA 2YLXA 3NG7X 1PJ7A 4GUVA 2JBVA 1CJ2A 2BS3A 1CJ4A 3F8DA 1S2QA 3QFAA 1K4QA 4X4JA 3UOXA 4D03A 2CVJA 3K30A 3AYIA 4OCGA 2YM1A 2R0CA 3AE4A 5U63A 1M64A 3SGLA 1ZDLA 1F8RA 1GT8A 4EIQA 1JRZA 3VR8A 2OA1A 2YQUA 1PBEA 3NHOX 2BK5A 3EPTA 4GDEA 4J33A 1H82A 3NIXA 2YLRA 3BNMA 3UTHA 4CCRA 1GNDA 4OPTA 3G5QA 2GQWA 2WPEA 1IUTA 4AP1A 1TDOA 2B7SA 4BK1A 1E6EA 1PBCA 4CRTA 1FCDA 3ADAB 3GSIA 4RG4A 3BI4A 5EB4A 2BCPA 2WOWA 3KLJA 4K2XA 1GV4A 1EL8A 2GR3A 2WP6A 3UP4A 1NHQA 3AE7A 5KOXA 3NT6A 2BS4A 2EQ8A 2Q7VA 2BXSA 2GVCA 1LQUA 2QAEA 1EL7A 3H8LA 1OJ9A 2YLWA 2B9WA 2WESA 2XFNA 3GYJA 1CJ3A 1GOSA 2QCUA 1QJDA 2BABA 1N1PA 3C4AA 3AXBA 2VVMA 1DOCA 3AB1A 3OZ2A 4EMIA 4ADWA 2XYOA 1CHUA 3II4A 1GXFA 1F8SA 2NPXA 3ISHA 2XDOA 3K7TA 5HXIA 3KD9A 4B65A 2ZBWA 4OPDA 1COYA 5KWFA 3PO7A 4A79A 2YR5A 5JCLA 4JNAA 3NYFA 2X8HA 3CN8A 1GPEA 4EMJA 5HYMA 1JU2A 3QFBA 2C70A 4M52A 4EQRA 1GALA 2OAMA 1PS9A 2GMJA 2YR6A 2XCGA 1DXLA 2HQMA 3CNPA 3NRNA 1S2YA 3BNUA 1OJCA 1NAAA 3DH9A 4U2TA 3UKFA 3G5RA 5HHFA 3UKQA 4AT0A 1NDAA 2ZZCA 4CCQA 1GRTA 1NG3A 1KNPA 1H7WA 1PXBA 3IHGA 3CNTA 4DSGA 4GR1A 4RG3A 4B67A 3K7MX 2VQ7A 1TYPA 5IPYA 1N4VA 3ALMA 2QA2A 2GV8A 2XLUA 2R0PA 1LVLA 3F8RA 4BV6A 2ZZ0A 1P2HA 5IQ4A 2V3BA 3VQRA 4GCMA 1K0JA 2VZ2A 2CULA 1GTHA 2C65A 2WP5A 2XVFA 3P4RA 1GTEA 1AOGA 5M0ZA 3E1TA 2WP9A 5BUKA 3VR9A 4Z26A 4H2NA 5CQFA 5LV9A 2WPCA 2YM2A 2WETA 3GD4A 4PAAA 1DODA 2XFPA 4YT0A 3CGDA 1NENA 2GR2A 1VG0A 3AEGA 1PN0A 1B8SA 1Q9IA 4U8NA 5EOWA 3FIMB 3I6DA 3R9UA 3H8IA 1PBDA 4ECHA 1X31B 3D8XA 2YWLA 3AEDA 1QO8A 4NTEA 4H4YA 3HZLA 4Z24A 3ICRA 2WBAA 4XWZA 4H4UA 1BF3A 3DK8A 3WE0A 3GDPA 4J57A 3FPZA 5KVIA 1RP0A 4Z2RA 4FK1C 3AE6A 3GD3A 4OVIA 1S3BA 5HY5A 4C3YA 2WOIA 4REKA 1TDNA 2WU5A 2XFQA 4EIPA 4JDRA 2Q0LA 4U8PA 4U8KA 1F3PA 2GEWA 5TR3A 1H81A 1O95A 1XDIA 3V76A 4A7AA 2XVJA 4HB9A 2XFOA 4BJYA 2APGA 4U8MA 4B69A 2O9ZA 2VVLA 4TM0A 3NN0X 4C5OA 2FJAA 1D4CA 3ICTA 1MXTA 3CGBA 3LB8A 1YQ3A 2R4EA 2FJEA 3GYIA 1PBBA 2RGOA 4FX9A 2V61A 4ICYA 4H4QA 3DJEA 1VQWA 1DNCA 4OPCA 2GR1A 3AE5A 3COXA 1KNRA 1L0VA 1ZP0A 3NLCA 2R9ZA 2X50A 1K0LA 2UZZA 2AQJA 2VVLG 4J31A 3SQPA 4K5SA 3VRDB 2X99A 2GF3A 1VRQB 4A5LA 4EQWA 3UKKA 2XLPA 4H4RA 3REDA 1FOHA 1BZLA 2DKHA 3CPIG 3AEAA 3QVPA 4LA1A 3UOZA 4Y4NA 4BK3A 3BHFA 4FK1A 2YAUA 3CNDA 3B6DA 1K0IA 2C66A 3M0OA 3DJJA 4E0VA 4P9SA 4OPGA 4Y4MA 1FL2A 4OPUA 4JY3A 1GRBA 3S61A 2BC0A 4IVMB 4O5UA 4D04A 1E39A 3P4PA 4J56A 3EF6A 1NEKA 2C3CA 4AOXA 1TRBA 1B37A 3NK1X 3KU9A 4ZCCA 3URHA 1MO9A 1TYTA 2B76A 4YTMA 1LTXR 3GWDA 4I59A 4H4TA 1JNRA 4AP3A 2YVGA 1W4XA 1CC2A 4ZN0A 2C7GA 1GRAA 5KOWA 1YY5A 1GETA 2VQBA 4H4VA 5BULA 2BC1A 5KRQA 4TM4A 3P4QA 3SM8A 4KX6A 1MOKA 5C2TA 2V60A 3PVCA 4TM3A 2ACZA 1PHHA 2OALA 5BRTA 3AEFA 3C4NA 3UKPA 1ZOYA 2GRTA 4AOSA 1BGNA 2WDRA 1PDHA 1PJ5A 1V59A 2BCGG 2H89A 2Y6RA 3CNJA 4UDQA 2CFYA 3OC4A 1GESA 2YG3A 2BA9A 1GERA 2NVKX 4H7UA 4N9XA 4UP3A 4X9MA 4YSXA 1Q1WA 1CC6A 3CTYA 3VRBA 3BHKA 1DJNA 3Q9TA 3Q6JA 3QSMA 2AAQA 4NEVA 1BGJA 2X8CA 1GRHA 4HA6A 3S5WA 2W0HA 3IWAA 3V3OA 2JB1A 4H4PA 2WQYA 4UDRA 1IUXA 2Z5XA 2EQ9A 1BKWA 3UCLA 3NKSA 4USQA 3AE2A 4UDPA 4A6NB 4B66A 4DSHA 1NHRA 3UOVA 3DGHA 3DJDA 4GF7A 3NNEA 1EL5A 3NTAA 5FMHA 2BK4A 3CPHG 2IVDA 2E5VA 1GRGA 2BYBA 2ZZBA 2EQ7A 2R46A 3P9UA 4DGKA 3V3NA 3GMBA 4OPLA 3AYLA 3NTDA 2XLSA 1M6IA 1PXAA 1B4VA 2FJDA 4XXGA 4WX1A 2EQ6A 1LV0A 4BURA 3NK2X 4J36A 4YKGA 2C72A 5M10A 1N4WA 5KVHA 4NTCA 3GDNA 4YWOA 4AT2A 1VDCA 2H88A 1IJHA 2A87A 2Z5YA 4H4XA 1ZOVA 1CBOA 3AD7B 2V5ZA 4OPIA 2C64A 3UKLA 2OLNA 4O5QA 3RP8A 2YVFA 2WEUA 2C75A 3VRAA 4K22A 3LZXA 5GSNA 2E4GA 4A99A 2IVEA 4C77A 4H2RA 1IUVA 1E7PA 2GH5A 2X8GA 2XFUA 4IA6A 2WPFA 1F6MA 3AE9A 2VRMA 3IC9A 3IHMA 4CY8A 4H4ZA 4Z43A 3ABVA 4Z25A 2PHHA 2XLRA 3DK4A 3UTFA 3DJGX 3GMCA 1EL9A 4H4SA 5FS7A 1JNZA 4LIIA 3P4SA 5JCIA 3LOVA 3NYEA 1CF3A 4DNAA 3CGEA 1Z6LA 1IUSA 2OLOA 4YKFA 3ALLA 2BK3A 1L9CA 1B5QA 3ITJA 3M12A 2Y6QA 4BJZA 4I58A 1PBFA 3SFDA 4B68A 1H83A 1NG4A 2WHDA 1JRXA 2E1MA 1F8WA 4XWRA 1GEUA 4IVOB 1UKVG 4TLXA 4B63A 2JB2A 3GRTA 2Q6UA 1LJ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZUPA 4MH3A 4U2SA 3QSEA 1EZKA 3EANA 2WU2A 2X3NA 2C4CA 1TP9A 4ZBAA 1PKWA 4RUVA 2PU9C 3H4KA 3TOUA 2K8VA 3A5WA 1J9BA 1IUUA 1V57A 1T8EB 1PL1A 4ZBBA 4Z2UA 4JEDA 4A65A 5CRWA 3G9BA 3UTEA 3QVRA 4KPRA 2TPRA 3T37A 3ZMKA 1R5AA 1JEHA 2AB6A 4EQSA 1E1NA 3DVXA 5DBJA 1KSUA 3LADA 5ECOB 1Y0PA 3L78A 1A8YA 4HQSA 1OJTA 4E8EA 5HFIA 3CXGA 1FEBA 4JY2A 2XVEA 3IE3A 4Y4LA 3Q6OA 3CIRA 2I81A 3IPZA 4YSYA 2BACA 4YXDA 4WCTA 2GR0A 2WGRA 2WRTA 2MZCA 3EWLA 1F3BA 3B3RA 2IIDA 3KIJA 1I9DA 2LQOA 1DOBA 3FK8A 5A4WA 2V6KA 2Q0KA 1D5TA 3GYXA 1XXUA 3HCZA 2L4QA 4HOJA 1A8LA 1TW9A 2HLSA 1Q98A 4GXZA 1CJCA 4H4WA 4J34A 5C04A 5J7XA 2IMIA 2C3TA 1ERWA 4V2NA 1S3DA 5J3RA 3GH6A 4B64A 5JCMA 5DJMA 1T3BA 2A4HA 4Z7XA 18GSA 2R0GA 4L5OA 4WETA 2VO4A 3TRXA 1TRVA 4HJ2A 4TKYA 4EXJA 4IA5A 1BAYA 1L9DA 3NH3X 4KW6A 1MD4A 4N0VA 4L0WA 1K3OA 1EGRA 3ZRDA 2YNXA 2OE3A 3H8QA 5G1KA 2YG7A 4TR4A 5FHIA 4K8DA 4V2LA 4NZHA 2L6DA 1ELIA 1Q4JA 1YEPA 1GTUA 1X9SB 13GSA 4GSSA 3F9UA 1NHPA 1O5WA 5ELGA 3CPJG 1YKJA 2L4CA 3MYDA 2XVHA 1REOA 4PUAA 5E59A 1JZOA 3ZNNA 4K5RA 5KMRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ZUP A;  4MH3 A;  4U2S A;  3QSE A;  1EZK A;  3EAN A;  2WU2 A;  2X3N A;  2C4C A;  1TP9 A;  4ZBA A;  1PKW A;  4RUV A;  2PU9 C;  3H4K A;  3TOU A;  2K8V A;  3A5W A;  1J9B A;  1IUU A;  1V57 A;  1T8E B;  1PL1 A;  4ZBB A;  4Z2U A;  4JED A;  4A65 A;  5CRW A;  3G9B A;  3UTE A;  3QVR A;  4KPR A;  2TPR A;  3T37 A;  3ZMK A;  1R5A A;  1JEH A;  2AB6 A;  4EQS A;  1E1N A;  3DVX A;  5DBJ A;  1KSU A;  3LAD A;  5ECO B;  1Y0P A;  3L78 A;  1A8Y A;  4HQS A;  1OJT A;  4E8E A;  5HFI A;  3CXG A;  1FEB A;  4JY2 A;  2XVE A;  3IE3 A;  4Y4L A;  3Q6O A;  3CIR A;  2I81 A;  3IPZ A;  4YSY A;  2BAC A;  4YXD A;  4WCT A;  2GR0 A;  2WGR A;  2WRT A;  2MZC A;  3EWL A;  1F3B A;  3B3R A;  2IID A;  3KIJ A;  1I9D A;  2LQO A;  1DOB A;  3FK8 A;  5A4W A;  2V6K A;  2Q0K A;  1D5T A;  3GYX A;  1XXU A;  3HCZ A;  2L4Q A;  4HOJ A;  1A8L A;  1TW9 A;  2HLS A;  1Q98 A;  4GXZ A;  1CJC A;  4H4W A;  4J34 A;  5C04 A;  5J7X A;  2IMI A;  2C3T A;  1ERW A;  4V2N A;  1S3D A;  5J3R A;  3GH6 A;  4B64 A;  5JCM A;  5DJM A;  1T3B A;  2A4H A;  4Z7X A;  18GS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2ZUP A;  4MH3 A;  4U2S A;  3QSE A;  1EZK A;  3EAN A;  2WU2 A;  2X3N A;  2C4C A;  1TP9 A;  4ZBA A;  1PKW A;  4RUV A;  2PU9 C;  3H4K A;  3TOU A;  2K8V A;  3A5W A;  1J9B A;  1V57 A;  1T8E B;  1IUU A;  1PL1 A;  4ZBB A;  4Z2U A;  4JED A;  4A65 A;  5CRW A;  3G9B A;  3UTE A;  3QVR A;  4KPR A;  2TPR A;  3T37 A;  3ZMK A;  1R5A A;  1JEH A;  2AB6 A;  4EQS A;  1E1N A;  3DVX A;  5DBJ A;  1KSU A;  3LAD A;  5ECO B;  1Y0P A;  3L78 A;  1A8Y A;  4HQS A;  1OJT A;  4E8E A;  5HFI A;  3CXG A;  1FEB A;  4JY2 A;  2XVE A;  3IE3 A;  4Y4L A;  3Q6O A;  3CIR A;  2I81 A;  3IPZ A;  4YSY A;  2BAC A;  4YXD A;  4WCT A;  2GR0 A;  2WGR A;  2WRT A;  2MZC A;  3EWL A;  1F3B A;  3B3R A;  2IID A;  3KIJ A;  1I9D A;  2LQO A;  1DOB A;  3FK8 A;  5A4W A;  2V6K A;  2Q0K A;  1D5T A;  3GYX A;  1XXU A;  3HCZ A;  2L4Q A;  4HOJ A;  1A8L A;  1TW9 A;  2HLS A;  1Q98 A;  4GXZ A;  1CJC A;  4H4W A;  4J34 A;  5C04 A;  5J7X A;  2IMI A;  2C3T A;  1ERW A;  4V2N A;  1S3D A;  5J3R A;  3GH6 A;  4B64 A;  5JCM A;  5DJM A;  1T3B A;  2A4H A;  4Z7X A;  18GS A; 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