4CY6A

Apo structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase hbpa
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
582
structure length
561
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 181
structure length 561
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy6A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy6A01
1NDAA 1D4CA 2JK6A 3GYIA 4A65A 1KSUA 2IVEA 1NAAA 2VVLG 4A6NA 3KVEA 4OPLA 4Z44A 2CFYA 1TDEA 4C3YA 3K7TA 5KOWA 5JCNA 1V59A 1GREA 4LIIA 1K0IA 2C67A 3AE7A 2WESA 3NTDA 4ICYA 1H7XA 3ADAB 1PXBA 4EQRA 1JNZA 4B65A 3M13A 2Q0LA 1REOA 2V61A 3CNTA 4Y4NA 3UTHA 3E1TA 2BABA 4D03A 3ATRA 4UDRA 1VRQB 5U63A 3BI5A 4Z2TA 3AE4A 2YG6A 1D5TA 3G5SA 3UKHA 4YSZA 4XWZA 2YWLA 1IUUA 3UTGA 4I59A 4ZCCA 4EQXA 2C65A 1O5WA 3AEDA 1Z6LA 1CJ2A 1S2YA 3NK1X 4OPDA 1S3EA 3SGLA 3NN6X 4B66A 1E1KA 4K2XA 1L9EA 3CNDA 2XFPA 2VQBA 4CRTA 3UOYA 1NHPA 3P4SA 3P9UA 4YT0A 1CHUA 2XVIA 1RSGA 3CGEA 4XWRA 5CQFA 1YQ4A 3II4A 1ZMCA 5M10A 3AEAA 5HY5A 3ATQA 2VVLA 1ONFA 1E1LA 1Y56A 2OLOA 3EANA 2R0PA 2BCPA 4J36A 4BJZA 4U2SA 1CC6A 1ZDLA 2ARDA 1L9CA 1RP0A 3VRAA 1B4VA 3D1CA 1F8WA 4DSGA 5BULA 2Z5YA 1EL5A 4TM1A 4BURA 1O95A 4YSHA 3ALLA 4A7AA 1X31B 4DGKA 3B3RA 1DJNA 1JRXA 1XDIA 3SFEA 3RP6A 3AE2A 2YLZA 3UKFA 4J31A 1BZLA 1CJCA 1TDOA 1W4XA 2OALA 2EQ7A 2V3AA 3RNMA 3CPJG 5KWFA 2GRTA 2QCUA 3NYFA 2OLNA 4H4TA 1D7LA 4TLXA 4APNA 3VR8A 1LVLA 3ALMA 3L1RA 1FEBA 2YVJA 3NK0X 1E7PA 3KU9A 3DJDA 2O9ZA 2V6OA 1JRZA 1QLBA 2GMHA 3WE0A 3AYJA 4U8PA 4C3XA 3IHGA 1ZOYA 3AE1A 4RG4A 3SFDA 2BA9A 1XPQA 3M0OA 1E1MA 4CBQA 2B9XA 4AT0A 4ECHA 1Q1RA 4C5OA 2QAEA 3GMCA 4FK1A 1L0VA 2XLTA 3QVRA 4H2QA 4YTPA 3GRSA 3UTFA 3BI2A 1K4QA 2GF3A 4H4QA 4LA1A 5LV9A 1AOGA 4Y4LA 1M6IA 1NHRA 4H2NA 1OJ9A 2VRMA 4C77A 4H4WA 3CGCA 5FS8A 2YVFA 4TM4A 1KNRA 2R9ZA 4Y4MA 3UTEA 2BXRA 1Y56B 3DGHA 3K30A 4OCGA 1H86A 1KFYA 1DNCA 2GQWA 1NPXA 1NG4A 3UP4A 3LADA 2GR2A 1E1NA 5IQ4A 3B6DA 4J33A 3I6DA 4GR1A 1L9DA 1OJAA 4USQA 3C96A 4H4UA 4MJWA 2GAHB 2IVDA 3L8KA 2BK4A 4X9NA 5BUKA 1VQWA 1DOEA 2DKHA 3UKPA 5IQ1A 1GNDA 2X8HA 3GD4A 3QSMA 2WP5A 3ABVA 3KKJA 1Q1WA 2GR3A 2YR5A 5EB5A 5FS6A 1GERA 4AP3A 3BNUA 4H4SA 4OPCA 4A99A 3REDA 2JB2A 1B8SA 3BHKA 3UKAA 3GWDA 3NGCX 3CGBA 3GMBA 3DH9A 1TDKA 3DK8A 3GRTA 3KA7A 3BHFA 2E1MA 2WDRA 1GESA 1VDCA 2QA2A 1LQTA 5KOXA 1MXTA 3H4KA 3LZWA 4U8LA 1JOAA 3DA1A 2C7GA 1OJCA 1NENA 3AEBA 3NT6A 1VG0A 4IVOB 1ZOVA 4U8MA 3DJEA 2VZ2A 3F8DA 4OPGA 3BI4A 3EAOA 3AE8A 3CNSA 3G5RA 2CULA 2BK3A 2X50A 2FJDA 1EBDA 2C3DA 2C73A 2R4JA 1K0LA 1GRFA 3GDPA 1PJ7A 1DODA 1IUXA 1LPFA 1CJ4A 2C66A 5KRQA 4U8IA 3QJ4A 3Q6JA 2JB1A 3GDNA 4RSLA 4BK1A 5KVIA 3IC9A 4H7UA 2J3NA 2IIDA 1GOSA 2WP6A 1F8RA 4IVMB 4YSXA 3CPIG 3H8IA 3NLCA 2JB3A 4H50A 2AAQA 5GRTA 4EMJA 3EPTA 4UDPA 1CBOA 5KXJA 3R9UA 3JSKA 4K7ZA 1GRAA 4H4YA 1GPEA 4EMIA 1GRHA 4REKA 2XYOA 2OAMA 4RG3A 3T37A 2XLRA 2RGHA 1TRBA 1QJDA 3CNPA 3F8PA 4U2LA 1VG9A 2WBAA 3RP7A 1P2HA 4Z43A 1DOBA 2BS2A 4EIQA 1D4DA 3EF6A 5GSNA 2C72A 2TMDA 2I0ZA 1JU2A 3CIRA 2WPCA 4WX1A 2XCGA 3RHAA 4B63A 4EQWA 4YSYA 4K22A 2XFUA 3P4QA 2E4GA 2EQ8A 1Q9IA 4CCRA 2Y6QA 1GTHA 2YR6A 2V60A 2Q0KA 3PO7A 3CGDA 1S2QA 3GSIA 1PBCA 5HYMA 2APGA 1PN0A 3DK9A 4GDEA 4J57A 1GTEA 3ICSA 3UOXA 3AEEA 2JBVA 1YQZA 2XFQA 2B7RA 2C3CA 4CNKA 5DBJA 1GSNA 2WETA 2R45A 2WS3A 1BF3A 2YM1A 1FEAA 2EQ6A 1H81A 3BNMA 3DJJA 4NTEA 4O5UA 3UKKA 4I58A 2VQ7A 3H8LA 1XHCA 4M52A 1KNPA 1ELIA 2RGJA 1DOCA 2YLTA 4IA5A 1BWCA 2CVJA 5JCIA 3ISHA 4NZHA 3P4RA 4CY6A 1SEZA 3CPHG 1FL2A 4HB9A 4NEVA 2C76A 3RP8A 1CC2A 2JAEA 4YKFA 1F8SA 1K0JA 1GRTA 3K7MX 2YLSA 3LOVA 3QFAA 3ALJA 4JNAA 4OPUA 2Q6UA 3AEGA 3UP5A 4GUVA 2JKCA 5IPYA 2YQUA 4K8DA 4GDPA 2GVCA 2X99A 3I3LA 1F3PA 3AECA 3FIMB 3DGZA 2WOWA 2WU2A 3DJGX 3AD8B 4ZN0A 3F8RA 1PXAA 4Z2UA 1D4EA 1H82A 1XANA 2A87A 2WPFA 5ER0A 3C4NA 5FS9A 2YR4A 2PYXA 4GF7A 4NTDA 4DSHA 3AYLA 3IHMA 3LJPA 2XVJA 2ZZCA 1JRYA 4NTCA 4O5QA 3FG2P 1D7YA 3KD9A 1NEKA 3COXA 3URHA 3UKLA 1IJHA 4B67A 1GXFA 3NN0X 3QFBA 3VQRA 4YKGA 4Z25A 4JQ9A 1PBFA 1YY5A 2A89A 2XLSA 2A8XA 1LJ1A 3NTAA 2B7SA 5BRTA 2W0HA 2YM2A 3AD7B 3PS9A 3FMWA 1ZY8A 2NVKX 3CTYA 4B1BA 4OPIA 1CF3A 5M0ZA 4DNAA 2XLPA 2V3BA 3V3OA 3UOVA 5EB4A 1OJDA 4KPRA 1GV4A 1GRBA 4IA6A 4U8NA 3UOZA 5EBKA 4CY8A 4EIPA 2TPRA 2OA1A 1IUSA 3NNEA 4H2PA 5FMHA 4TM0A 3ICRA 2GV8A 4JDRA 2NPXA 2BS3A 1TDFA 1YQ3A 3UKQA 4AOXA 3AE9A 4J34A 2WPEA 1CC4A 3DK4A 4EM3A 1B37A 3SM8A 2YG4A 3VR9A 3UCLA 2F5ZA 4YXDA 2R46A 1M64A 2HQMA 3CN8A 3P4PA 5L46A 1TYPA 1N1PA 4J2WA 1GRGA 4HA6A 4JY2A 2YG5A 1H6VA 4Z2RA 1NHQA 1KF6A 2GMJA 2GR1A 4ZCDA 4H4XA 3GWFA 3D8XA 2FJBA 2XVFA 1EL7A 3V76A 4YTNA 3M12A 5J7XA 1TYTA 1PHHA 2C75A 4TLZA 4AOSA 1ZK7A 1IUWA 2GH5A 4J56A 1BGNA 5KVHA 1PBBA 1KDGA 2BCGG 2GEWA 1Y0PA 2VRLA 5TR3A 3NH3X 1JEHA 3S5WA 2C70A 1IUTA 3LZXA 2PHHA 3CNJA 3QSEA 5JCMA 3C4AA 2H88A 2R4EA 4GCMA 4BK2A 3AWIA 2E5VA 4FDCB 4KX6A 2QA1A 1N4VA 2EQ9A 2GQFA 2WDQA 1GETA 4CNJA 5BVAA 4BK3A 1PDHA 4A5LA 2FBWA 2WP9A 2ZZBA 4YTMA 1P2EA 1TDNA 2VVMA 3AXBA 3G5QA 4UDQA 5EOWA 5U25A 4EM4A 2BYBA 4A79A 1H84A 1BKWA 2WOVA 2GAGB 3VRDB 4B68A 1ZP0A 1COYA 1EL8A 1S3BA 3GD3A 3NRNA 1BGJA 2FJEA 2B9WA 1LTXR 1RYIA 2WHDA 2ACZA 2XFOA 1E6EA 3LXDA 4H4ZA 1IUVA 4NEWA 3NYEA 1CJ3A 4XXGA 3DMEA 2BC0A 4JNQA 2ZZ0A 1UKVG 3AB1A 4A6NB 2RGOA 2DKIA 2XVEA 1PJ6A 4USRA 2AR8A 2XDOA 5JCKA 2R0CA 1NHSA 3V3NA 3NKSA 2CDUA 1GT8A 2BXSA 3QVPA 2GR0A 3AD9B 4TM3A 1PJ5A 1FECA 3GYJA 1EL9A 1GEUA 2YG7A 2ZBWA 2FJAA 3NHOX 4JY3A 5J60A 1B5QA 1PXCA 4PAAA 1FCDA 3SQPA 4EMWA 2XFNA 4H4PA 1LQUA 2Q7VA 4U8KA 1H83A 3QSSA 1QO8A 1H7WA 5CKUA 4Z26A 4X4JA 3ZYXA 5C2TA 3OC4A 2YAUA 4H4VA 3KPFA 4N9XA 3OZ2A 4E0VA 4CCQA 4WCTA 3IF9A 4BJYA 2BC1A 4D04A 2WOIA 1JNRA 5HHFA 3ZDNA 1F6MA 2X8CA 2YLRA 3HZLA 4U8JA 4C74A 1MOKA 1DXLA 4FX9A 4X9MA 2B9YA 4JN9A 4EQSA 3FBSA 4GRTA 4Z24A 2V5ZA 1PBEA 4AP1A 3NIXA 3Q9TA 1PS9A 2B76A 2XLUA 5HXIA 4A9WA 1ZKQA 1PBDA 1ZX9A 2AQJA 4OVIA 1N4WA 4H4RA 1O94A 4P9SA 5FS7A 1ZMDA 4B64A 2WQYA 3AYIA 4U2TA 2YG3A 3PVCA 2R0GA 4UP3A 3ITJA 1CL0A 1OJTA 2BS4A 3IWAA 1FOHA 2VOUA 4YWOA 4BV6A 2YLXA 2C64A 4AT2A 1GALA 3VRBA 2Y6RA 2WU5A 3AEFA 2WEUA 3KLJA 2XVHA 2UZZA 1LV0A 3ICTA 3K7QX 4FK1C 1NG3A 2GB0A 4ADWA 3AE6A 2H89A 2YLWA 2RABA 1E39A 3P1WA 4K5SA 3S61A 5JCLA 3NYCA 2X3NA 3O0HA 3NG7X 4B69A 1YKJA 1N4UA 4K5RA 2YVGA 1KSSA 4PABA 3AE3A 3FPZA 4U8OA 3NK2X 1DJQA 5C3JA 2BACA 4OPTA 4LU6A 3AE5A 5U1OA 1HYUA 4IV9A 2Z5XA 1MO9A 2X8GA 4H2RA 2WDVA 3LB8A 2BK5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VM2A 3SWLA 3GTUA 2VVLG 5ECOB 1TDEA 2CFYA 4C3YA 1UN2A 5JCNA 4NHZA 1HQOA 5ECKB 2VL2A 2C4JA 3BJ5A 2L5OA 2YN1A 5IMAA 3HYVA 4F03A 1O7UA 2G2QA 5ECMB 5KN3A 5U63A 3BI5A 3AE4A 3G5SA 2YG6A 3IK7A 4Z7XA 4I59A 1EV9A 1AC1A 3AEDA 1FOVA 1S2YA 4OPDA 3NN6X 1NW2A 1QQ2A 4B66A 4EL1A 1A2LA 1FB6A 5DQSA 2H71A 2YANA 3CTFA 4NWYA 3VFIA 6GSTA 3TJBA 5IOWA 5IO0A 4QQ7A 4YT0A 3QOUA 4MPGA 3CGEA 4ZB6A 4XWRA 3II4A 3QDNA 5M10A 3IOSA 3IXRA 2VVLA 2YWIA 2BCPA 1ZDLA 3WD6A 1B4VA 4O5RA 1GLPA 3HA9A 2Z5YA 3VK9A 1EL5A 4MZBA 3GUSA 3SFEA 5IMCA 2OALA 2GRTA 2QCUA 3NYFA 3M9KA 4H4TA 1D7LA 3VR8A 1LVLA 3L1RA 3T31A 3BBYA 4XRAA 5G5FA 1FEBA 3LYPA 1GL8A 1HD2A 4HDEA 3C1RA 3DJDA 2GMHA 3TJFA 4N10A 3AYJA 1AUCA 1ZOYA 2QKEA 1QMVA 5J9CA 2R37A 1A2JA 1E1MA 4CBQA 3UBLA 4YAVA 2VCWA 1Q1RA 4C5OA 3GKKA 4NXIA 4H4QA 1K4QA 3UVHA 1TI3A 1UA5A 1OJ9A 4EDYA 4H4WA 3IDVA 1ZCPA 3TRPA 4TM4A 2R3XA 3L9SA 4OCGA 5LNKe 2VCVA 2GQWA 3UOMA 4G9KA 3LADA 3UP4A 3E9JB 4GR1A 4HU7A 3ED3A 1OJAA 5JWQB 5D9WA 4DSQA 4X9NA 1GSEA 1DOEA 2PBJA 2DKHA 3UKPA 2X8HA 4HS1A 2IMKA 3QSMA 3LGCA 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3HVSA 2GVCA 3BCKA 3AECA 3DGZA 2LRTA 2WOWA 3CXGA 4G0IA 1PX7A 3L9VA 2C0GA 4JR6A 3Q74A 3C4NA 1M3JA 4DSHA 4EUYA 3LJPA 2L4QA 2ZZCA 4O5QA 1AQXA 2VCZA 3COXA 3P7XA 3URHA 4B67A 1GXFA 5DCGA 2DMLA 1PBFA 3KGKA 4GAVA 5DBQA 4IVFA 5CNWA 3P2AA 5A4WA 1NHYA 5M0ZA 5ECHB 3V3OA 3UOVA 3N5OA 1YEXA 4WETA 4KPRA 5D9VA 2AHEA 4U8NA 5EBKA 1VGLA 3FW2A 4WR5A 5DJMA 2TPRA 3M3MA 3NNEA 5FMHA 4TM0A 1PKZA 3ICRA 1IYIA 4IBPA 2PUKC 2O85A 2CVBA 2BS3A 2O89A 3I43A 1CQHA 2WPEA 4EM3A 1WIKA 5CRWA 1KEBA 3H93A 1B37A 4K9ZA 1N1PA 4J2WA 4HA6A 2YG5A 1QK8A 4RI7A 4Z2RA 1U87A 4H4XA 2GSQA 4YTNA 3A2XA 2XVFA 1GULA 3M12A 5IQYA 1PHHA 5EPFA 2PU9C 2J9HA 2GEWA 5TR3A 1ACVA 1Z9HA 5ENUA 1OVNA 2GSRA 2C70A 3QSEA 3CNJA 3C4AA 1X5DA 3APSA 3F63A 3ME7A 2R4EA 4BK2A 4IKHA 2E5VA 4KW6A 2R4VA 2IMEA 2GQFA 2XBQA 4CNJA 2MMOA 5BVAA 3I6AA 4BK3A 5CREA 4A5LA 2FLSA 2VVMA 4UDQA 3FEUA 2YV9A 4ACSA 4A79A 4GF0A 3CQFA 4BVXB 3VRDB 4B68A 1COYA 1EL8A 1GRXA 1S3BA 3UL3A 4FH8A 1KNGA 4NV2A 3NYEA 3IC8A 4XHMA 2MBTA 3PR8A 4I8BA 1ABAA 3V3NA 1ZZYA 2UZ8A 2FWHA 4TM3A 3GHAA 1EOHA 3GURA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NG3 A;  2GB0 A;  4ADW A;  3AE6 A;  2H89 A;  2YLW A;  2RAB A;  1E39 A;  3P1W A;  4K5S A;  3S61 A;  5JCL A;  3NYC A;  2X3N A;  3O0H A;  3NG7 X;  4B69 A;  1YKJ A;  1N4U A;  4K5R A;  2YVG A;  1KSS A;  4PAB A;  3AE3 A;  3FPZ A;  4U8O A;  3NK2 X;  1DJQ A;  5C3J A;  2BAC A;  4OPT A;  4LU6 A;  3AE5 A;  5U1O A;  1HYU A;  4IV9 A;  2Z5X A;  1MO9 A;  2X8G A;  4H2R A;  2WDV A;  3LB8 A;  2BK5 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VM2 A;  3SWL A;  3GTU A;  2VVL G;  5ECO B;  1TDE A;  2CFY A;  4C3Y A;  1UN2 A;  5JCN A;  4NHZ A;  1HQO A;  5ECK B;  2VL2 A;  2C4J A;  3BJ5 A;  2L5O A;  2YN1 A;  5IMA A;  3HYV A;  4F03 A;  1O7U A;  2G2Q A;  5ECM B;  5KN3 A;  5U63 A;  3BI5 A;  3AE4 A;  3G5S A;  2YG6 A;  3IK7 A;  4Z7X A;  4I59 A;  1EV9 A;  1AC1 A;  3AED A;  1FOV A;  1S2Y A;  4OPD A;  3NN6 X;  1NW2 A;  1QQ2 A;  4B66 A;  4EL1 A;  1A2L A;  1FB6 A;  5DQS A;  2H71 A;  2YAN A;  3CTF A;  4NWY A;  3VFI A;  6GST A;  3TJB A;  5IOW A;  5IO0 A;  4QQ7 A;  4YT0 A;  3QOU A;  4MPG A;  3CGE A;  4ZB6 A;  4XWR A;  3II4 A;  3QDN A;  5M10 A;  3IOS A;  3IXR A;  2VVL A;  2YWI A;  2BCP A;  1ZDL A;  3WD6 A;  1B4V A;  4O5R A;  1GLP A;  3HA9 A;  2Z5Y A;  3VK9 A;  1EL5 A;  4MZB A;  3GUS A;  3SFE A;  5IMC A;  2OAL A;  2GRT A;  2QCU A;  3NYF A;  3M9K A;  4H4T A;  1D7L A;  3VR8 A;  1LVL A;  3L1R A;  3T31 A;  3BBY A;  4XRA A;  5G5F A;  1FEB A;  3LYP A;  1GL8 A;  1HD2 A;  4HDE A;  3C1R A;  3DJD A;  2GMH A;  3TJF A;  4N10 A;  3AYJ A;  1AUC A;  1ZOY A;  2QKE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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