4CY6 | Genus

Total Genus 181

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	181
sequence length	582
structure length	561
Chain Sequence	SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
publication title	Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
total genus	181
structure length	561
sequence length	582
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date	2014-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4cy6A03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4cy6A01

4YTMA 1B37A 2Z5YA 1CJ4A 4M52A 1GOSA 3DA1A 2ZZBA 4B69A 2AR8A 4OPGA 1Z6LA 3ISHA 4EM3A 3M13A 4LIIA 3EF6A 5U25A 3L1RA 2R4JA 3EANA 2BK3A 1E39A 3NTAA 1E1KA 2GR0A 4EIQA 1VQWA 4TLZA 2AQJA 3CGDA 3UCLA 5BUKA 5HXIA 3F8DA 3CPIG 3CGEA 3CNPA 1D7LA 4B68A 2Y6RA 3NK1X 4B65A 2FJEA 5LV9A 2YM2A 3AB1A 4CY8A 3QJ4A 3CNTA 4H4ZA 5FS7A 1NEKA 2GR2A 2X99A 1JRZA 1VRQB 2JK6A 3B6DA 2WESA 4J34A 3AEFA 3KD9A 3P4RA 4NTCA 2XLTA 1PBEA 2WS3A 1L0VA 2R0CA 3S61A 4Z25A 3SFDA 1LJ1A 1O95A 2BC0A 3DK4A 2XFOA 5HHFA 1ZMCA 3CN8A 2YLZA 4H4WA 3UKAA 3K7TA 1Q9IA 2CFYA 2HQMA 4E0VA 1DJQA 3BI4A 4A79A 2WPFA 2XYOA 4GUVA 2FBWA 3ICSA 1GESA 4RSLA 4EQXA 1ZOYA 2C65A 2APGA 2WDVA 4J36A 3GMBA 2RGJA 1TDKA 2JB2A 3NKSA 4GCMA 5BULA 1GXFA 2BS3A 4JQ9A 5FS8A 1GV4A 2YLWA 3GYIA 4Z44A 3G5QA 4H2RA 5CQFA 4BV6A 5BVAA 3DK8A 4TM3A 4JDRA 4U8LA 3GWDA 4UP3A 1JRYA 4BK3A 3H4KA 3T37A 3CNDA 4AP3A 4IVMB 1ZK7A 1VDCA 3EAOA 4NZHA 4NTDA 3DGZA 1GRHA 3NIXA 2ZBWA 4XWZA 4BJZA 2X3NA 1CHUA 2DKIA 2R45A 3UP4A 4U8MA 1DJNA 4Z43A 3NTDA 3V3NA 3BI5A 2FJBA 1ZP0A 2QAEA 1SEZA 2EQ7A 3SQPA 2V6OA 5KWFA 4A7AA 3AE3A 2YG3A 3UKHA 2YR5A 5DBJA 4JY2A 2OAMA 4K5SA 2GH5A 2V5ZA 3AE9A 3AE8A 3C4AA 3LOVA 1DOEA 3LZXA 1EL8A 4B1BA 3SFEA 2JB1A 2EQ6A 4OPLA 2R0GA 1F8WA 5IPYA 2XLRA 3VR8A 4GDPA 2CVJA 4YSXA 2X8CA 3C4NA 2GMHA 3UOYA 4K8DA 4BK1A 1BF3A 3BNUA 3DJEA 4TLXA 1MO9A 2QCUA 1LTXR 1PJ6A 5KVHA 1M64A 3AEDA 2O9ZA 1JOAA 1H81A 1CL0A 1CBOA 5IQ4A 4B64A 3ICTA 4A99A 1GREA 1YQ3A 3NHOX 4DSGA 5JCKA 1GRGA 2VRLA 5HYMA 2YG4A 5KOXA 1KSUA 2YG6A 3FBSA 1LVLA 2XDOA 1ZY8A 2OALA 4CRTA 4GDEA 2VQ7A 2XLSA 1H84A 3I6DA 2GQFA 2Q0LA 3NK0X 5HY5A 3NLCA 1ZOVA 1GT8A 1IUUA 3BHFA 4YKGA 5J60A 5EBKA 3RP8A 3M12A 4YXDA 1JNZA 3NK2X 1JEHA 1DXLA 2WP6A 3AEGA 1DOBA 2C76A 1IJHA 4D04A 5JCMA 2C64A 4CNJA 2Z5XA 4A9WA 4H4VA 4EMWA 4EMIA 1VG0A 1Q1WA 2ARDA 2WPCA 1PXCA 1JRXA 3NYCA 2YVJA 3CPJG 4P9SA 4UDRA 3H8IA 3LXDA 1Y56A 1X31B 3KKJA 2XCGA 2I0ZA 2GR3A 2GF3A 3QSSA 3FMWA 2AAQA 3ALMA 3ZYXA 3UTEA 2XVHA 1PBDA 5C3JA 3RP7A 1REOA 5JCNA 2QA2A 3DJGX 2ZZCA 3NN6X 3IHGA 2OA1A 2BABA 3NN0X 4IA5A 4OVIA 4B63A 3NYEA 1XDIA 3D8XA 4YTPA 5U1OA 1CC2A 1XANA 3NT6A 2OLNA 2WU2A 2RABA 2VVMA 4IV9A 1GALA 4EMJA 3PVCA 3V76A 5KVIA 2VVLG 3KPFA 3P9UA 2X8HA 3AE4A 4Z2UA 1E1NA 4A6NB 2WU5A 4AP1A 3V3OA 2NPXA 3PO7A 1IUWA 2EQ9A 3G5SA 4YSZA 1B8SA 1W4XA 3CGBA 1D4EA 1H86A 5EB4A 1S3EA 2FJAA 3SGLA 1NHRA 1S2QA 4XXGA 3COXA 3S5WA 3I3LA 2WHDA 3II4A 2RGHA 2GV8A 1PXAA 2YG5A 3AD9B 3P4PA 3UOZA 4TM4A 3ALLA 2Q6UA 4H4RA 4EQWA 3ZDNA 4YSHA 3K7MX 2GMJA 1TDFA 3K7QX 3AYIA 1E7PA 4OPDA 3P1WA 1M6IA 2C70A 5FS9A 2ZZ0A 4A5LA 4J57A 3EPTA 4OPCA 1NHPA 1B5QA 1GEUA 4MJWA 2E4GA 3UTGA 4CCQA 2PYXA 3IHMA 1KFYA 5C2TA 2C66A 4H2QA 1LQTA 4X4JA 2VOUA 2WP9A 2YM1A 4K7ZA 4WCTA 3AE6A 1Y56B 1BGJA 3IC9A 4H7UA 3ALJA 4NEVA 2B9YA 2NVKX 2IVDA 3UKLA 1EBDA 1N4WA 3ADAB 1F8SA 1GETA 2B7RA 2C73A 1RYIA 2JAEA 3L8KA 1K0LA 3AEEA 2XVIA 1ZKQA 2XVJA 3QFAA 1B4VA 3WE0A 2V3BA 2YLTA 2YLRA 4ZCDA 4KX6A 1N4VA 2GB0A 1GRTA 1O94A 1N1PA 3DH9A 4J2WA 2ACZA 2YR6A 4JY3A 1FEBA 1XPQA 2A8XA 3GYJA 2YLXA 1GRFA 4X9NA 2B76A 1GRAA 1UKVG 4Z24A 1S2YA 1ZMDA 1PN0A 3Q6JA 1E6EA 5GRTA 2XFPA 3OZ2A 4O5QA 4J33A 3QSMA 3B3RA 4YKFA 4A6NA 3GD3A 1K0JA 2EQ8A 2C67A 1PBBA 2C7GA 4IVOB 2A87A 4JN9A 1BZLA 3KA7A 1TYPA 4DGKA 4FDCB 4H2PA 4U2TA 1CF3A 1H7XA 5JCIA 2WDRA 3AEAA 1E1LA 3AECA 4CCRA 1FECA 2YVFA 3NNEA 2BA9A 3NGCX 4ICYA 1FL2A 4J56A 1NHSA 3IF9A 2A89A 1F8RA 3KVEA 1GRBA 2UZZA 2XLUA 1PHHA 4NTEA 3CNSA 4AOXA 4DNAA 1EL7A 2WEUA 5TR3A 4UDQA 1CJCA 1EL9A 2TMDA 5GSNA 3VRBA 4TM1A 3AE1A 4K22A 3AEBA 1NENA 2BACA 1DODA 2W0HA 3CPHG 2BS2A 3HZLA 1CC4A 4CY6A 1LPFA 4H4SA 3CIRA 4H4XA 2J3NA 1L9CA 2R0PA 4FK1A 4YT0A 5L46A 4OPUA 1YKJA 1KF6A 3AD7B 3NH3X 2WOIA 3KU9A 4RG3A 1KNPA 4Z26A 4GRTA 1TRBA 1LQUA 2BYBA 3F8RA 4J31A 1P2HA 2WDQA 4BURA 4ZN0A 1Q1RA 2GVCA 3QFBA 2Q0KA 1IUXA 4USQA 1HYUA 2JKCA 1NPXA 2E5VA 3VR9A 1GSNA 3P4QA 3BHKA 2YLSA 4AT2A 4C5OA 2C75A 3ATRA 3AXBA 1TDOA 3FPZA 2RGOA 4FX9A 2XFNA 5U63A 2F5ZA 1EL5A 4HB9A 5FMHA 1YQ4A 3DK9A 4EIPA 1GTEA 2CULA 2H89A 1D5TA 5ER0A 3LZWA 1H83A 4BJYA 3VRDB 1K0IA 2H88A 3BNMA 1ZDLA 1D4CA 4BK2A 4Z2TA 1D4DA 1LV0A 4O5UA 4YWOA 2X50A 1XHCA 4B66A 1F6MA 4U8NA 1H6VA 1AOGA 2GEWA 3DJJA 5FS6A 4Y4MA 2XFUA 1BWCA 2JB3A 2XVEA 3AE7A 2YWLA 1OJTA 4U8IA 2VVLA 4OPIA 1GTHA 1JU2A 1COYA 1NHQA 2GRTA 3GDPA 3URHA 2TPRA 1S3BA 4ECHA 4U8OA 4U8JA 1P2EA 4Z2RA 3VQRA 1RSGA 4LA1A 2BK5A 2GAHB 1ONFA 2XVFA 4OCGA 4I58A 4U8PA 2IIDA 4ADWA 2BS4A 2WBAA 3GMCA 4KPRA 4Y4NA 1KSSA 3FIMB 4REKA 3FG2P 3NG7X 3SM8A 2E1MA 3R9UA 1PJ7A 2BCGG 3KLJA 5KXJA 1YQZA 4B67A 3ICRA 2VRMA 4CBQA 3CTYA 3RNMA 2BXRA 2YAUA 3UKQA 4K2XA 5JCLA 3QSEA 5KRQA 3P4SA 3VRAA 1JNRA 2IVEA 2FJDA 2JBVA 1O5WA 1H7WA 3AE5A 1RP0A 3F8PA 2C72A 4ZCCA 2V3AA 3D1CA 1GNDA 3OC4A 2V60A 2V61A 1D7YA 4JNQA 5EB5A 2WPEA 2OLOA 2BXSA 3QVRA 4C74A 4NEWA 4JNAA 1CC6A 3DJDA 4D03A 2GQWA 1DOCA 1TDNA 2X8GA 1TYTA 2B9XA 1OJCA 2C3CA 1CJ2A 4C77A 4C3XA 4DSHA 3BI2A 4CNKA 1VG9A 2R4EA 1IUTA 2BC1A 2WOVA 1KDGA 2YG7A 3AD8B 2XLPA 5CKUA 1NG4A 1MXTA 1OJAA 1TDEA 2WP5A 1PBFA 4PABA 4H2NA 1GPEA 4EQRA 1PXBA 2GR1A 1FCDA 4IA6A 3AYJA 1OJ9A 2R46A 1Y0PA 3GRTA 3UOXA 4C3YA 3GRSA 3AYLA 1IUSA 3GD4A 2YVGA 3DMEA 4A65A 3M0OA 1V59A 3UP5A 1DNCA 3NRNA 1GERA 1K4QA 1BKWA 4N9XA 4GR1A 3CGCA 2WETA 3AWIA 2Q7VA 4PAAA 5IQ1A 2DKHA 2QA1A 5BRTA 1NAAA 1YY5A 2BCPA 4EM4A 3GDNA 5J7XA 4H4TA 4K5RA 4XWRA 1N4UA 3RHAA 3IWAA 1KNRA 3UKFA 1BGNA 2WOWA 3C96A 2R9ZA 4HA6A 4UDPA 3UTFA 2GAGB 2VZ2A 1ELIA 3REDA 3UOVA 1E1MA 3ABVA 4YSYA 5M10A 3DGHA 4USRA 1PDHA 2YQUA 2Y6QA 3AE2A 5M0ZA 5EOWA 4U2LA 1H82A 4AOSA 4H4QA 3LJPA 1QLBA 5KOWA 3CNJA 2B7SA 3PS9A 1MOKA 1FEAA 1PS9A 1FOHA 2WQYA 3JSKA 4X9MA 1QJDA 2BK4A 4H4UA 1F3PA 2B9WA 3LB8A 3GWFA 1QO8A 4YTNA 1OJDA 3ATQA 3K30A 3O0HA 1PBCA 4OPTA 1ZX9A 3UKKA 3GSIA 4WX1A 3RP6A 4LU6A 2XFQA 2C3DA 2PHHA 3ITJA 3Q9TA 3LADA 1NDAA 3NYFA 1L9DA 4U2SA 1PJ5A 3UTHA 4FK1C 1L9EA 4H4PA 1NG3A 3E1TA 4U8KA 3UKPA 3G5RA 1CJ3A 3H8LA 2VQBA 4AT0A 2YR4A 2CDUA 4H4YA 4EQSA 1IUVA 4I59A 4APNA 3QVPA 4RG4A 4TM0A 4H50A 4Y4LA 4GF7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1DSBA 5ECOB 4G0LA 4M52A 1CJ4A 2FHEA 1GOSA 3DA1A 1FVJA 2K8VA 2AR8A 1WP0A 3ISHA 3GX0A 4EM3A 3CMMA 3N5OA 3L1RA 2R4JA 3ZVJA 4D73A 3KMNA 3GX8A 2MYGA 3F8UA 3UCLA 2H01A 2H73A 4MPGA 3CPIG 19GSA 3TKQA 1ZYNA 2Y6RA 2WJUA 2WULA 1SD8A 3GNJA 3BCIA 2O85A 3QOUA 2VCWA 4P3YB 3G7YA 2GR2A 2B6MA 3B6DA 2GZYA 2WESA 4HSCX 4J34A 1HQOA 2G0FA 1L0VA 2R0CA 2C4CA 4ML1A 4JBBA 1O95A 1Y25A 2M80A 5HHFA 3DVXA 2B5EA 2HXKA 3CSIA 2CFYA 1GSDA 1DJQA 5LCZA 4A79A 2WPFA 4YH2A 2XYOA 4J56E 2JSZA 5FT3A 5AIXA 1GSQA 1UN2A 4J36A 4G74A 2K6VA 4K0NA 3TDGA 5FS8A 4H2RA 4BV6A 4WEYA 1E6BA 4ECBA 5G31A 2L5LA 4UP3A 3CNDA 4G6HA 2YANA 3NIVA 2D2ZA 5D9TA 1VDCA 3NIXA 2R45A 4U8MA 3GKXA 3NTDA 3A5IA 3V3NA 1USBA 1KNGA 1M2AA 1ZP0A 2FJBA 3D4MA 3QD9A 3SQPA 5ECNB 4A7AA 3D5JA 3UKHA 4XS4A 5DBJA 4A9WA 2GH5A 3L9VA 4POLA 2V5ZA 3AE8A 4B1BA 1DOEA 1EL8A 1SYXA 5KN1A 3SFEA 3FR9A 5G5EA 1FG4A 2A2SA 5G1KA 2EQ6A 5IPYA 2R0GA 3TRQA 3FKFA 3VR8A 4HJMA 4YSXA 4MMMA 4Q5NA 1BF3A 3VURA 2O9ZA 3AEDA 3WT2A 5ECPB 1YKCA 2YNXA 3FRCA 1EGOA 1GREA 1YEXA 3TJKA 3NHOX 4DSGA 1GRGA 3FHKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CY6A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

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