4CY6 | Genus

Total Genus 181

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	181
sequence length	582
structure length	561
Chain Sequence	SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
publication title	Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
total genus	181
structure length	561
sequence length	582
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date	2014-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4cy6A03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4cy6A01

2V3AA 4O5UA 1X31B 4GF7A 2PYXA 1LTXR 4AP1A 3P1WA 3AEGA 4C5OA 1E6EA 4Z2TA 4B63A 4DSHA 1KNRA 2IIDA 3KA7A 4DNAA 2OLOA 1FECA 1MOKA 1D4CA 1PS9A 1GXFA 1EL9A 2Q7VA 2BCPA 4U8NA 2CVJA 2GQFA 2BXSA 3DA1A 1RSGA 5LV9A 5JCMA 4U8JA 4CCQA 1IUUA 3K7TA 1B8SA 2WPEA 3RP6A 1PBEA 4PAAA 3H8IA 1CL0A 2C64A 3LB8A 2Y6QA 4C74A 3BI5A 1L9CA 2UZZA 2JBVA 3UKHA 4AP3A 1H81A 5U63A 3UP4A 2YVJA 4FX9A 2VRLA 1GRTA 4B68A 4J33A 4B66A 4RG3A 4XWRA 2GQWA 4U2TA 3K7MX 1IUWA 3P9UA 2PHHA 3NHOX 2B9WA 1GERA 1W4XA 1KF6A 1NDAA 1ZMDA 1Y56A 3P4QA 5BVAA 3VRAA 4K2XA 3ADAB 5HY5A 1DOBA 1IUXA 4Y4NA 3FMWA 2YG7A 2OA1A 3C96A 4IA5A 4CRTA 3AEDA 4BV6A 3WE0A 2GAHB 2BK5A 4YSZA 1DNCA 4JY2A 1ZP0A 3SM8A 1BZLA 4CNJA 1XPQA 3G5QA 1P2EA 1L9DA 3L8KA 3R9UA 4YTNA 3SFDA 1NHRA 4WCTA 2BK4A 4H4XA 4Z26A 3UKLA 5KOXA 3KD9A 2YM1A 1NG4A 3T37A 1TDFA 3NK0X 5EB5A 5U25A 4C77A 2GAGB 3F8PA 3GD3A 1EL8A 3DK8A 3CNSA 1NEKA 3DJEA 1CHUA 2GR1A 1EL5A 4A7AA 2YR6A 1TDKA 4ADWA 3I6DA 3LXDA 4CCRA 2GVCA 1K0IA 2XLPA 3ALLA 3PO7A 1K0JA 2RGOA 2BC1A 2C72A 4X9MA 4LU6A 2V60A 4Z24A 4Y4LA 5U1OA 1D7YA 2JAEA 1LV0A 2C67A 3NLCA 4TM0A 2E4GA 1LPFA 3CGEA 2JB2A 3AE7A 3C4AA 4EM4A 3II4A 2WOIA 4LIIA 1IJHA 3IF9A 1LJ1A 4TM1A 2XFQA 3NKSA 3UKQA 2XVFA 4ICYA 2WDQA 1KDGA 3NK2X 4A65A 4OPIA 1F8WA 3EF6A 4K5SA 4H2RA 3AWIA 3VR9A 2I0ZA 4OPUA 3UP5A 1CC2A 2VZ2A 5M10A 3P4SA 4EIQA 3V3OA 3GYIA 1KNPA 1CJCA 3ICRA 3O0HA 1NPXA 4NTEA 1ZY8A 3F8RA 3VRDB 1M6IA 2WBAA 4EQWA 4YKGA 4Z25A 4BJYA 2GH5A 1YY5A 2FBWA 3QSEA 1H84A 3VQRA 4BK3A 3AE6A 4USQA 5HHFA 5FS6A 4E0VA 3NT6A 1QLBA 2ARDA 2OAMA 4NEWA 2Q0KA 3UOXA 1GPEA 2YLZA 3P4PA 5JCNA 2YLSA 4EMJA 3PS9A 1VG0A 4A6NB 4ZCCA 1RP0A 3FBSA 2HQMA 2X3NA 4EQXA 4UDPA 4EM3A 4HA6A 1GNDA 1E1NA 2V61A 3AEFA 3URHA 3GMCA 4J36A 2WESA 2NVKX 5TR3A 2GV8A 2ACZA 3DJGX 3AE2A 5ER0A 4RG4A 4OPGA 1GEUA 1GTEA 4H4PA 3CGBA 1H7XA 3UOVA 1NG3A 2QAEA 5KRQA 4U2SA 3AEEA 4UDQA 3ISHA 4C3XA 1K4QA 1UKVG 1EL7A 4TM4A 4FDCB 3NTDA 5EBKA 2XVJA 3GDPA 3BNUA 1ZX9A 1H6VA 3DJJA 1S3EA 3RHAA 1F3PA 1O94A 1ZOVA 2GR3A 4B64A 3UKFA 3CNTA 1H86A 2VQ7A 2YLRA 3AE1A 3GSIA 2YG4A 2XFOA 2VVMA 1H83A 2C7GA 3NG7X 4K22A 1GV4A 3BNMA 1XANA 2C75A 4EMWA 3DGHA 4OPDA 2WPCA 4GCMA 2VVLG 1O5WA 3M12A 1Q9IA 3DH9A 2WU2A 4TM3A 4AOXA 2OALA 4GDEA 4YSXA 2BC0A 1SEZA 2W0HA 4I59A 1DJQA 4K5RA 4J31A 1TDOA 3NN0X 2C65A 1F6MA 2WPFA 3KKJA 5JCIA 5KWFA 3OC4A 1BGNA 1DOCA 3AE3A 1GALA 1B37A 1DJNA 3CGCA 4H4TA 2YAUA 4BURA 4NTCA 4ZN0A 4JNAA 2FJDA 1QO8A 2V3BA 2XLUA 1EBDA 2VVLA 3AD9B 4Y4MA 2IVDA 2A89A 1ZOYA 3QSSA 3GWFA 4A79A 2YG6A 3NIXA 2BA9A 2Q0LA 5JCLA 2BCGG 2H89A 2V6OA 3AECA 1GOSA 3CPHG 2NPXA 3KU9A 3LZWA 4OPTA 3REDA 5IPYA 2V5ZA 1S2YA 4NEVA 1Q1RA 3ALJA 3H8LA 3E1TA 1QJDA 4CY6A 3NTAA 1PHHA 2BXRA 3NK1X 4JN9A 3AXBA 3UTHA 4EIPA 3UTEA 5KVHA 2R4EA 3CTYA 3HZLA 4ECHA 2BABA 2Z5YA 4LA1A 4YKFA 2YR4A 3QFAA 1YKJA 3FPZA 3NRNA 4DSGA 4A6NA 3CPIG 1TRBA 1S3BA 2X99A 4OVIA 2APGA 4BJZA 1GESA 1Q1WA 2OLNA 1RYIA 3M0OA 1KFYA 4X9NA 2AR8A 1BF3A 2EQ7A 4B65A 2J3NA 4FK1C 4KX6A 3UKPA 4O5QA 4FK1A 2VRMA 3DGZA 3ZYXA 1O95A 2F5ZA 1DOEA 2E1MA 3V3NA 5KVIA 2X8CA 1PBDA 1PJ7A 4XWZA 2GMJA 3S61A 1JRXA 3SQPA 2WOWA 4IA6A 3AB1A 4JNQA 1GRAA 3LADA 4YSHA 2ZZBA 1VRQB 5M0ZA 5FS9A 4U8LA 1JNZA 1FCDA 3L1RA 5L46A 3B3RA 2EQ6A 3ICSA 4IVOB 3DK9A 1GT8A 4H4UA 3NN6X 3GRTA 1PBBA 4U8MA 4WX1A 3ZDNA 1FOHA 3AE8A 4GUVA 4OPLA 2C3CA 2ZZCA 1DODA 2YLTA 4CY8A 2GR2A 3I3LA 4OPCA 3GWDA 4JQ9A 4U8PA 3GYJA 4H2QA 3UOYA 2IVEA 3KLJA 2R45A 3EAOA 2R46A 3KPFA 1CJ3A 2WEUA 4M52A 2AQJA 1CC6A 1MXTA 2E5VA 3AD8B 4IV9A 4H4RA 2R0PA 3JSKA 2DKIA 3FG2P 2BS3A 2QA2A 5IQ1A 3Q6JA 3NYFA 1ZK7A 1H82A 2RGHA 4NTDA 5KXJA 3VR8A 1JRZA 3H4KA 1DXLA 4J2WA 4I58A 1CJ4A 4ZCDA 4AT2A 5HXIA 4GRTA 3ABVA 5FS7A 2CFYA 2JK6A 3ICTA 2GRTA 2TMDA 5BUKA 3UKKA 2YQUA 2EQ8A 4HB9A 1N4UA 5BULA 4H2NA 3AYJA 3NNEA 4CNKA 2YM2A 1AOGA 1H7WA 3UTFA 1TYTA 1TDNA 2YR5A 3ATRA 5J7XA 1GETA 3Q9TA 3EANA 3DK4A 4RSLA 2B9XA 1PXBA 3G5RA 3ATQA 4OCGA 3GMBA 4H4SA 3DMEA 3S5WA 3CPJG 1MO9A 1CC4A 4K7ZA 1YQZA 3PVCA 2XLSA 3QFBA 4YTMA 4A99A 2BACA 2XYOA 2BK3A 3RNMA 1P2HA 3QSMA 4EQSA 2BS4A 3UCLA 4K8DA 3AYIA 1GRGA 3UKAA 4BK1A 3AD7B 1VQWA 2JB3A 2GEWA 3IHMA 3V76A 3EPTA 3IC9A 2WP5A 5J60A 1CBOA 1FL2A 3SFEA 3CNPA 4GDPA 3AE5A 1Y0PA 1B4VA 2WP6A 1D5TA 2ZZ0A 3C4NA 4A5LA 1JU2A 1VDCA 2RABA 4H4WA 1BWCA 3LOVA 1CJ2A 3M13A 4UDRA 4Z43A 4REKA 4D04A 5HYMA 1FEAA 1GSNA 2FJBA 3DJDA 1OJ9A 1IUTA 1KSUA 2C76A 2Z5XA 3P4RA 4PABA 1L9EA 1N1PA 1COYA 2C73A 2WETA 4IVMB 4H50A 1N4VA 1JOAA 3KVEA 1IUSA 1GRFA 1GTHA 4H7UA 1HYUA 4Z44A 4BK2A 1NHQA 1YQ4A 4U8OA 4P9SA 3AE4A 3IWAA 1S2QA 2YLXA 3NGCX 3AEAA 1D4EA 2XFPA 4YSYA 4J34A 2WP9A 2XVEA 1PN0A 2XLRA 4N9XA 5GRTA 4YT0A 1KSSA 4APNA 4H4QA 1IUVA 4AT0A 1REOA 2H88A 1ONFA 1XHCA 2JB1A 3D8XA 4YTPA 3K7QX 1Z6LA 4D03A 4A9WA 4U2LA 3GRSA 1OJAA 3QVPA 2EQ9A 1YQ3A 2B9YA 4MJWA 3BHFA 2A87A 3F8DA 1NENA 1OJTA 1JRYA 4B1BA 2XFNA 3BHKA 2C66A 1OJCA 2GR0A 2YG3A 2YWLA 4XXGA 4U8KA 2WQYA 3CN8A 4H4VA 1GRHA 2YVFA 2Y6RA 5KOWA 2XCGA 1ZDLA 3AE9A 3K30A 1F8RA 2BYBA 4H2PA 4YWOA 4B69A 2TPRA 5C3JA 3LJPA 1LQUA 2WDRA 4KPRA 3GDNA 4EQRA 4NZHA 3ALMA 1LVLA 3AYLA 2CDUA 4AOSA 2FJEA 2XDOA 2YLWA 5EOWA 1TDEA 4EMIA 5JCKA 2R9ZA 3CGDA 3AEBA 2B7SA 1PBFA 2WDVA 3FIMB 1BGJA 2XFUA 2YG5A 4U8IA 5IQ4A 2QA1A 1D4DA 3SGLA 3OZ2A 2RGJA 4J57A 4UP3A 1ZKQA 2R0CA 2AAQA 4B67A 4X4JA 5FS8A 1E39A 1JEHA 1V59A 2X8GA 1GREA 1E7PA 2DKHA 2WU5A 3LZXA 2YVGA 4TLZA 3RP7A 4H4YA 1Y56B 3D1CA 3RP8A 3BI4A 1GRBA 3NYCA 2XVHA 3UOZA 2GF3A 1PJ5A 2FJAA 1M64A 2A8XA 2GB0A 2QCUA 2R4JA 3ITJA 5DBJA 2XLTA 2C70A 3VRBA 2WHDA 1BKWA 1E1MA 2Q6UA 2JKCA 4Z2RA 2ZBWA 4YXDA 2CULA 2R0GA 1F8SA 5CKUA 4JY3A 4USRA 3G5SA 1ELIA 4CBQA 1ZMCA 1K0LA 1LQTA 1XDIA 2X8HA 2O9ZA 5FMHA 1CF3A 1VG9A 1E1KA 4Z2UA 1PXCA 3QJ4A 1NHPA 1NHSA 1PJ6A 1PDHA 2GMHA 3CIRA 5EB4A 4H4ZA 3QVRA 3NH3X 5C2TA 1NAAA 2B76A 4J56A 2BS2A 3NYEA 5GSNA 1D7LA 3COXA 2B7RA 4JDRA 1OJDA 5CQFA 2X50A 3BI2A 3CNDA 3GD4A 5BRTA 4TLXA 1PXAA 1L0VA 3UTGA 3IHGA 2WOVA 4GR1A 2VQBA 1E1LA 2WS3A 2XVIA 2C3DA 3B6DA 3CNJA 4DGKA 1JNRA 1B5QA 4C3YA 1PBCA 1TYPA 2VOUA 1FEBA 1N4WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1LTXR 1E6EA 4DNAA 1FECA 1MOKA 2O89A 1PMTA 2AUVA 2Q7VA 1G7EA 2GQFA 1GLQA 3ED3A 2H19A 2B5XA 4HZ4A 2BXSA 1RSGA 4WBJA 3QAVA 5ECSA 1SJZA 4CCQA 1B8SA 4KNDA 1PBEA 4PAAA 2C64A 3AY8A 3BI5A 2UZZA 3GUSA 4AP3A 5U63A 4FX9A 1X5DA 1R7HA 1ZZYA 1GRTA 4RG3A 2DJ0A 4U2TA 3GMFA 3ZREA 2LTKA 3FR6A 2C0DA 2B9WA 1ZMDA 4L0UA 5BVAA 1ZCPA 2MYGA 1X5EA 3F6FA 1LJRA 2ZUPA 3ZMLA 5ID2A 2DBCA 3AEDA 3WE0A 1TKDB 3VWVA 2ON7A 2YV9A 4JY2A 2C3NA 3GTUA 4CNJA 1XPQA 1PL1A 4YTNA 4J2FA 4MZCA 4WCTA 5IM9A 3UKLA 3M0FA 3TJKA 2DJKA 1NG4A 2CZ3A 2HZEA 4OO4A 4EF0A 1HD2A 4A7AA 2YR6A 3LXDA 2XLPA 2YWIA 3ISOA 1WP0A 1K0JA 2RGOA 3ALLA 4E8EA 1TRVA 2GGTA 2CVBA 2L5LA 1SYXA 4L5OA 4Z24A 2YP6A 3GL5A 1KEBA 6GSUA 1LV0A 3NLCA 1LPFA 4EM4A 5CO3A 4LL1B 3TKQA 4D73B 1LJ1A 3IF9A 4TM1A 4PUFC 5ECOB 2VIMA 4ICYA 1KDGA 3ZITA 4OPIA 2XPDA 3SBCA 3VR9A 2I0ZA 4OPUA 3UP5A 5KMPA 3FZ9A 4OO5A 3J7Yb 3P4SA 2GZYA 3GYIA 1KNPA 1ZGNA 1SJIA 3GX8A 4ZB9A 4YKGA 2WBAA 3VRDB 18GSA 2KOKA 5GAPD 3Q18A 1PN9A 5AN1A 1YY5A 2FBWA 3FKFA 4JRRA 3VQRA 3AE6A 3KH9A 5FS6A 4E0VA 1VF1A 1U88A 4NHWA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CY6A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

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