4CY6 | Genus

Total Genus 181

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	181
sequence length	582
structure length	561
Chain Sequence	SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus	181
structure length	561
sequence length	582
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date	2014-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4cy6A03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4cy6A01

2HQMA 4NEWA 1IJHA 1LV0A 2GVCA 1N1PA 4H2PA 1JNZA 2WOIA 4PAAA 1E6EA 4KX6A 4YKFA 4E0VA 1K0IA 4IVMB 2WEUA 4A7AA 2OLOA 4JQ9A 3NLCA 1BGNA 2GR2A 4K5RA 2YVFA 2XFQA 4TM0A 2IVEA 3SQPA 4DSGA 3ISHA 4JY2A 5HY5A 3UOXA 3L8KA 3BI2A 2V3BA 1NHQA 3I3LA 4OPTA 3CNTA 4TM4A 1DJQA 1N4VA 3ZYXA 3AB1A 2YG6A 3CPHG 1M64A 3P4PA 4J33A 3SM8A 4CRTA 1TDEA 2B9YA 2Q0KA 2X8GA 4GR1A 1Q1WA 1B37A 2E4GA 1N4WA 2BACA 4U2TA 1TDOA 2J3NA 2GR1A 3CGCA 4X9MA 1N4UA 3UTHA 4DGKA 4LIIA 3GMCA 4CBQA 3UKAA 1PBEA 3EANA 1TDKA 3AD9B 3IHMA 1K4QA 4A6NA 1TYPA 5C3JA 4AT0A 1YQ4A 2AAQA 3BI4A 2WS3A 4H4ZA 1M6IA 4GDPA 4Z24A 1DNCA 2R0PA 2DKHA 2B7RA 1GESA 1LQUA 2OAMA 3P1WA 4J56A 2V3AA 2ZZBA 2Q7VA 2BCPA 2XVJA 1PJ6A 3CPJG 3H8LA 3QJ4A 1RSGA 3NT6A 4CY8A 3GD4A 1NAAA 4PABA 4FDCB 4O5UA 5IPYA 3BHKA 3NN6X 4EMWA 3AE9A 3AE8A 1GERA 3NTAA 5KVHA 1XANA 1PBDA 3AEAA 5KVIA 2XCGA 4AOXA 4GCMA 3CGDA 1XPQA 2GAHB 2BABA 1E7PA 1F8RA 2CULA 2XVFA 2YG4A 3NTDA 1NG4A 1LTXR 2BK4A 4OCGA 1IUWA 3AYLA 1IUXA 4YTNA 2XYOA 3D1CA 3V3OA 5J60A 3C4NA 1E1NA 1BKWA 3BNUA 3NNEA 2ACZA 4TM1A 1ELIA 3DK9A 3AYJA 1FECA 4UP3A 1GT8A 3NRNA 3FBSA 3UTEA 2WP5A 4IV9A 4EMJA 1KSUA 3RNMA 1DOBA 1CJ4A 2RGOA 1F8WA 2YM2A 5IQ4A 1PBFA 3Q6JA 1Y0PA 3EF6A 1BGJA 2ZZ0A 3NYCA 5EB5A 1IUUA 1YQZA 1MO9A 4USRA 4RSLA 3AE4A 4K22A 4C74A 3DJGX 4J2WA 1QO8A 4FK1C 3KA7A 2GB0A 4H2RA 2A87A 3FIMB 1JU2A 4B69A 3VQRA 4C5OA 3AXBA 4JNQA 3DK8A 4J57A 3I6DA 4I59A 1Y56B 4IVOB 4XWZA 1IUSA 1RYIA 1S3BA 3SFDA 3VR8A 4Z26A 2XVIA 3URHA 2PHHA 2VOUA 4YSXA 1JNRA 2R46A 2AQJA 3AYIA 1E1KA 1H83A 2XLTA 2VZ2A 2EQ7A 2R0CA 1SEZA 2XFOA 3KPFA 3UP4A 3P9UA 2EQ8A 5HYMA 3CPIG 2BYBA 4B67A 3AECA 1CF3A 4EQSA 5KOXA 4K5SA 2WHDA 2BA9A 2YAUA 3AE6A 1O95A 2WESA 3ICTA 4NZHA 3REDA 1DOCA 2JKCA 1D4CA 4H4UA 4MJWA 1H81A 2W0HA 4XWRA 1LJ1A 1ZP0A 5FS6A 3UTGA 1ZY8A 4IA5A 1JOAA 2A89A 3KLJA 2Y6QA 4JDRA 3GRSA 3P4SA 5JCNA 1AOGA 2BS2A 1L9DA 3Q9TA 4U8OA 2WPFA 2YG7A 4U2SA 2E1MA 1EL7A 3V76A 3D8XA 4H4PA 4IA6A 1PJ5A 2TPRA 4J31A 3S5WA 1ZDLA 4YKGA 2V60A 3ATRA 3KU9A 1H7WA 4GF7A 4K7ZA 2XDOA 4B1BA 1B8SA 1CC6A 2GMHA 3ABVA 3QSMA 5KRQA 2OLNA 3DJDA 2YQUA 3CNJA 4GDEA 5IQ1A 3JSKA 2GQWA 2C76A 1Q1RA 2VVMA 4U2LA 4ZCDA 2YM1A 2WPCA 1JRYA 3LOVA 4LA1A 1FEBA 1GOSA 2E5VA 4WCTA 5JCMA 2I0ZA 3NYFA 5KWFA 2GR0A 1O5WA 2X8HA 2BS3A 2C75A 3PO7A 2GAGB 2C65A 3AE1A 2WDQA 3DMEA 3UKKA 4DNAA 4EMIA 4C77A 2X99A 1NEKA 2XFUA 4EM3A 3P4RA 2NVKX 3R9UA 3QVPA 1X31B 4ECHA 4A99A 4YSZA 2YLXA 3IC9A 4H50A 1EL5A 1PS9A 2YG3A 1JRXA 2JAEA 3GRTA 2F5ZA 1KSSA 1PHHA 4HA6A 2BC1A 3SFEA 3ZDNA 1GEUA 1Q9IA 3NHOX 4B68A 5L46A 1BF3A 2Q0LA 4U8JA 3F8RA 1FL2A 1GRGA 3PVCA 3LZWA 3OC4A 4K2XA 3AD7B 4U8NA 2WBAA 3QFAA 4REKA 3QSSA 2YG5A 4YWOA 1TYTA 1CBOA 3AEGA 2GH5A 3CNPA 4APNA 1CJ2A 1PXCA 4H4VA 1BZLA 4B64A 1GRTA 1DXLA 1FOHA 1GREA 2C72A 3AEFA 5BULA 3GYIA 2YLWA 2C66A 4GRTA 2VQBA 4JN9A 4X9NA 1D7LA 2RABA 5FS8A 3P4QA 3DGHA 2XLRA 4HB9A 1KNPA 4RG3A 1PBCA 1DOEA 2JB3A 4TLZA 4AT2A 3B3RA 4CCRA 1F3PA 4H4YA 4LU6A 1ZMDA 5M0ZA 4U8IA 1GTEA 1RP0A 2YR6A 3UOVA 1REOA 2BXSA 5JCLA 2B76A 3G5QA 4EQRA 1ZK7A 3ATQA 3KD9A 3QVRA 3GWFA 1B5QA 1CHUA 5U25A 3DJJA 5HXIA 4D03A 5KXJA 1D5TA 2V6OA 1NG3A 3FG2P 3UKLA 3H8IA 1ZKQA 4B63A 3GMBA 2XLSA 2XVEA 1GRHA 1QJDA 3GWDA 2BK3A 2WETA 5JCKA 1GTHA 4YXDA 4ICYA 1S3EA 2JB2A 4Y4NA 4NTCA 3VRAA 3IHGA 2Y6RA 5U1OA 2B9WA 4CNKA 4U8KA 4O5QA 3II4A 4H4XA 2APGA 3AE2A 3VRBA 1GV4A 4OPDA 1FCDA 1JRZA 3ADAB 4Z2TA 4OPGA 2C7GA 3DJEA 1IUVA 3FMWA 4X4JA 3LZXA 3NGCX 2V5ZA 1PXBA 4GUVA 2BXRA 1GNDA 4Y4MA 2QAEA 3NK1X 4EIPA 4H4RA 1TDNA 3RP6A 1PDHA 4NTDA 4WX1A 1S2QA 2QA2A 1D4EA 1NHRA 3B6DA 2R9ZA 3NH3X 2C64A 4D04A 4JNAA 2H89A 4ZCCA 2GV8A 4C3YA 3NYEA 1GSNA 4EQWA 2WOVA 1H6VA 2VVLG 1BWCA 4CCQA 1GALA 1OJTA 1TDFA 5KOWA 4H4QA 1F8SA 1KF6A 2VRMA 3AE7A 3UP5A 1D4DA 4JY3A 2YLTA 4AP1A 2GRTA 1NDAA 3GD3A 3VRDB 5BUKA 3LJPA 4YSYA 1PN0A 2AR8A 4Y4LA 1H86A 1CC2A 4Z44A 4A6NB 2WU5A 2QA1A 1LQTA 3AWIA 2WP9A 3RP7A 2OALA 1NHSA 3G5RA 4ZN0A 1CL0A 2R4EA 5EBKA 4DSHA 5ER0A 3K7QX 2YVGA 4A79A 2XFPA 2WDVA 3AD8B 5C2TA 3PS9A 5EB4A 2JK6A 2X8CA 3QFBA 2R4JA 3CIRA 2O9ZA 4J36A 4M52A 5LV9A 1XDIA 2XLPA 2YVJA 3G5SA 4UDPA 4XXGA 3F8DA 4B65A 4Z25A 1CC4A 3UKQA 1L0VA 2TMDA 3KKJA 4EQXA 1KNRA 1GXFA 1QLBA 2YLRA 3UTFA 5M10A 3E1TA 2JBVA 2CFYA 4U8MA 5CQFA 1PJ7A 1O94A 2OA1A 2YR4A 4AP3A 1D7YA 2H88A 2NPXA 3O0HA 1VG9A 1V59A 1TRBA 3CN8A 4RG4A 1VQWA 3RP8A 3AEBA 1L9CA 2BK5A 2WQYA 2XLUA 2GMJA 1Y56A 5FS7A 1XHCA 4KPRA 3EAOA 4Z43A 2WP6A 1EBDA 2UZZA 2IVDA 5CKUA 3UKHA 1EL8A 4BV6A 3F8PA 2C67A 2JB1A 3IF9A 1DJNA 2B9XA 1VG0A 4OPIA 2X50A 4U8PA 4OPCA 3DH9A 5U63A 2GEWA 4H4WA 1B4VA 3H4KA 3ALMA 4CNJA 2B7SA 4NTEA 2FJAA 3S61A 4BK2A 1L9EA 5JCIA 2FJEA 1YQ3A 3C4AA 3ALJA 3FPZA 3T37A 3IWAA 3WE0A 1GRAA 1H84A 3BHFA 4Z2RA 3SGLA 2VRLA 4BJZA 4NEVA 4OVIA 3DGZA 2CDUA 2DKIA 2CVJA 2YWLA 1ONFA 3ITJA 4Z2UA 1LPFA 2WU2A 2X3NA 4A9WA 2WPEA 1JEHA 3QSEA 4OPLA 5BVAA 3K30A 2EQ6A 3LXDA 2Z5XA 3ALLA 2YLZA 3RHAA 1UKVG 1MXTA 3EPTA 4A65A 4BJYA 3VR9A 3M0OA 4EIQA 2A8XA 1VRQB 3DK4A 4CY6A 1OJDA 4FX9A 4B66A 1PXAA 3NG7X 2C3DA 3AEEA 5DBJA 3NN0X 1KFYA 3UKPA 2Q6UA 3ICSA 4H2QA 2C3CA 1P2EA 1LVLA 3BI5A 1VDCA 2R45A 3ICRA 1GPEA 4YTPA 3K7MX 1ZOYA 4FK1A 1ZOVA 2RGHA 4UDRA 2C70A 3NK2X 2ZZCA 1P2HA 3AE5A 2V61A 4A5LA 3AEDA 3GYJA 3KVEA 4YSHA 2BC0A 5FS9A 4J34A 2IIDA 2XVHA 1H7XA 2QCUA 3K7TA 3OZ2A 4H4SA 2R0GA 4N9XA 3UCLA 5EOWA 2YR5A 1MOKA 3CTYA 2Z5YA 3C96A 2XFNA 1OJ9A 1ZX9A 3BNMA 4YTMA 3V3NA 3AE3A 3COXA 1CJCA 1NPXA 1CJ3A 4ADWA 1PBBA 3GDNA 1NHPA 2FJBA 1H82A 2ARDA 4USQA 4UDQA 4H7UA 1K0LA 2BCGG 5FMHA 5GRTA 3UOZA 1ZMCA 3CGBA 4EM4A 1IUTA 1NENA 4BURA 3GDPA 1GRFA 3NIXA 1GRBA 1F6MA 5BRTA 1Z6LA 1DODA 1W4XA 1YKJA 1K0JA 2GF3A 2VQ7A 4H2NA 4K8DA 4TM3A 4TLXA 5HHFA 3CGEA 1S2YA 2WOWA 4BK3A 3LB8A 4H4TA 5TR3A 4U8LA 2FBWA 1KDGA 3CNDA 5J7XA 2PYXA 1E39A 3LADA 2VVLA 3DA1A 1EL9A 1FEAA 3M13A 3NK0X 2YLSA 2EQ9A 3NKSA 1HYUA 2FJDA 1OJAA 4P9SA 1GETA 2C73A 4YT0A 1E1MA 3GSIA 3L1RA 4AOSA 1OJCA 3M12A 1YY5A 2WDRA 1E1LA 3CNSA 4OPUA 4C3XA 3UOYA 2GR3A 1COYA 3UKFA 2BS4A 4BK1A 4I58A 2RGJA 2ZBWA 5GSNA 2GQFA 3HZLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4NEWA 2A4VA 4MZBA 1M2DA 1EZKA 1IJHA 5EVOA 1N1PA 3MWHA 4YKFA 2GVCA 3CRTA 2P5RA 2LUSA 4MLYA 3GRXA 2VCXA 4OD7A 4A7AA 4JQ9A 5J5NA 1ERVA 5F0GA 2YVFA 2XFQA 1ERWA 4BVXA 3SQPA 3BCKA 4DVCA 1Z7PA 2TRCP 3UOXA 5HY5A 4K8MA 1MDIA 4IQAA 5CRGA 1OC3A 3I3LA 6GSWA 3P4PA 2YG6A 1M64A 2B9YA 1K0OA 2N5AA 3L9SA 1Q1WA 2E4GA 4YH2A 4MH3A 2J3NA 2GR1A 2TRXA 4TRXA 3KH7A 4DGKA 4CBQA 4F0CA 1PBEA 3UKAA 3AD9B 1K4QA 4A6NA 3ZMKA 1Y6EA 2VD0A 4AT0A 1YQ4A 1ZYNA 2AAQA 3BI4A 4POMA 1FVJA 2IWTA 2RM6A 3CTGA 2FCHA 1SJ6A 2ZZBA 1Q98A 1RSGA 4TXOB 1NAAA 3P8WA 3QMXA 3DRNA 4FDCB 2OJLA 2L6CA 4MABA 3NN6X 4EMWA 4ECBA 1X5DA 3GN3A 1PBDA 3AEAA 2X64A 4P3YB 4GCMA 3CGDA 2CAIA 1F8RA 3NTDA 1ZYPA 1WRYA 1NG4A 3UOMA 4OCGA 2VL3A 2P5QA 3V3OA 5J60A 3BNUA 5D96A 3TOTA 3UIWA 1ELIA 18GSA 1F3BA 4HS1A 3NRNA 3FBSA 3SYIA 4EMJA 1KSUA 1M0UA 2YM2A 2RGOA 1Z6MA 3K8NA 1PBFA 2V32A 4USRA 3AE4A 3ERWA 3DJGX 1T00A 1GUHA 3CMIA 4AJ6A 1TW9A 3J7Yb 2YZUA 2NDOA 4EO3A 3AXBA 5JCGA 1O8XA 4L5OA 2HSYA 1S3BA 2H71A 2VOUA 4YSXA 1K0DA 5F8BA 1H83A 1GSSA 2EQ7A 3KPFA 3QDNA 2EQ8A 3CPIG 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CY6A

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

pfam database annotations