4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
3QVRA 1K0IA 2B76A 1XANA 4BURA 2GRTA 2RGOA 3SFEA 2H89A 3AECA 4GRTA 3UKPA 4IA6A 2BCGG 4C3XA 1F6MA 4GDEA 2QA1A 4EMJA 2GQFA 3GMCA 1LPFA 4H4YA 3LXDA 2WOWA 2ZZCA 3CNTA 1Q9IA 1ZMCA 1S2QA 2C67A 3GRSA 3RNMA 2GR2A 3CIRA 1TDOA 2B9XA 1KF6A 3UP5A 4AOSA 5IPYA 3AE2A 5J7XA 5BRTA 4B66A 2R0CA 2BS3A 3BNMA 2VZ2A 3L8KA 4TLZA 2C76A 2OAMA 2W0HA 3ABVA 3B3RA 3F8DA 2BACA 4Z43A 1NG3A 2CFYA 2GQWA 1B37A 1NHPA 4LA1A 3AE4A 3CPHG 1IUXA 4BK3A 2DKIA 4EQWA 4NEVA 1JRZA 1PJ6A 1TDNA 2RGJA 2BK3A 1NHSA 3UP4A 3M0OA 5C2TA 3CGBA 5KVHA 3GDPA 2GAHB 3ZDNA 3IHMA 3LZWA 4A99A 4N9XA 2XDOA 2XLSA 3C96A 1YQ3A 5KWFA 2RGHA 1N4WA 4D04A 1GRFA 3AEGA 1LVLA 4EQRA 4OPLA 5EB5A 2VVLA 4JY3A 2X50A 5HY5A 1GT8A 3GSIA 4YTNA 4B65A 2YVJA 1L9EA 2YM2A 2C3CA 3CNSA 1O95A 3KLJA 1PBEA 4U8MA 3UTGA 2WU2A 1P2HA 1YQ4A 1GTHA 3GRTA 1GOSA 3Q9TA 1Q1RA 1D5TA 2FJBA 1LTXR 3DK8A 4J31A 1ZMDA 2YVFA 2Z5XA 5M10A 4DNAA 1D4EA 4WX1A 4Z25A 3QJ4A 2WDVA 2WOVA 1M6IA 3K7TA 4J33A 1ZDLA 3ISHA 3UKHA 1JU2A 1K0JA 1TYPA 4U8LA 1GRTA 2Q0KA 2EQ7A 2WOIA 5GRTA 4I59A 2WESA 2BS2A 3AEFA 2AR8A 2GR3A 4MJWA 1GNDA 2ZZ0A 2X3NA 2YM1A 4RSLA 3NRNA 4EMWA 3ATQA 4JNAA 2YR6A 2BS4A 1GERA 4J2WA 4JN9A 4XXGA 4PABA 1IUTA 3II4A 1W4XA 3EANA 4YKFA 3ICTA 3REDA 4IVOB 1FECA 3K7MX 1DNCA 3NG7X 2R0GA 3UTHA 4EIQA 1F8WA 4Y4LA 3GMBA 1BWCA 1EL7A 4H4ZA 3KKJA 2YR4A 3NHOX 2WPCA 2WP9A 3E1TA 3ALLA 3EPTA 2GMHA 1Q1WA 2C3DA 2V3BA 4U8OA 1VDCA 3G5QA 1PJ5A 1OJTA 3ALMA 3NT6A 2E1MA 3G5SA 1ONFA 1L9DA 5JCKA 1S3EA 2XLTA 1KNRA 1GALA 4CNJA 1IUUA 4YSZA 1SEZA 1QJDA 1ZOVA 1GRGA 4H4VA 2R9ZA 2YQUA 3AXBA 2VOUA 1VRQB 3QFAA 3QSMA 1JOAA 4FK1C 2Q0LA 3OC4A 1CJ4A 5HXIA 2J3NA 2XVJA 3GYJA 2BYBA 3BHFA 3BNUA 1FOHA 3NYCA 2YLZA 1BZLA 2FJEA 2XVIA 2CDUA 4H2PA 3DJDA 5JCIA 1KNPA 4GCMA 2IVDA 3DK9A 4A65A 4A7AA 3P1WA 3CNPA 2OALA 4OCGA 3ICRA 3PO7A 4RG4A 4BJYA 4CCRA 1ZP0A 3IWAA 3BHKA 4DGKA 1P2EA 2ARDA 2V3AA 2YWLA 3NTDA 3CNDA 4AP3A 4B68A 3AE9A 2R4JA 2YLSA 5DBJA 3AEBA 2AAQA 2E5VA 4OPGA 2YG5A 3BI4A 1M64A 1MXTA 3SGLA 1TYTA 2A87A 4U2TA 1CC4A 1JEHA 2B9WA 4H4SA 1FCDA 3CN8A 1H84A 2C64A 3VQRA 1REOA 4JDRA 2Q6UA 3M13A 4CBQA 5J60A 3Q6JA 4KPRA 3I3LA 3P4PA 2YLRA 2VVMA 2WPEA 2I0ZA 1PXCA 4Z2TA 2WDQA 4YSXA 2CVJA 3F8PA 3H4KA 1NHRA 2WS3A 2A8XA 4O5QA 3D8XA 4B69A 1JRYA 4BJZA 4YXDA 1L9CA 1BGNA 2H88A 1FEAA 2B9YA 3AD8B 1GRAA 1ZY8A 3GD3A 3CTYA 1E1NA 2C73A 3R9UA 2AQJA 2PHHA 1VQWA 2YG6A 4J34A 1LQTA 1GXFA 1EL8A 3VR8A 1FEBA 2WHDA 2JKCA 4CRTA 2BC1A 4H2QA 1RP0A 1CJ3A 1OJ9A 4FX9A 4H4TA 3HZLA 4IVMB 1GPEA 2IVEA 1H7XA 2XLUA 3NIXA 1GTEA 4DSGA 3KD9A 1MO9A 2C7GA 1N4UA 1K0LA 2BABA 2BK5A 2XFNA 1GSNA 4B67A 2GEWA 4CNKA 2QCUA 4FK1A 1NPXA 3C4AA 1UKVG 2X8CA 3G5RA 3LJPA 4A79A 1CC2A 4EQXA 4H4XA 1K4QA 2JBVA 3NK2X 4XWRA 4OPTA 1DOEA 2R46A 3CGEA 3P9UA 1EL5A 5EBKA 1DJQA 1F8RA 3COXA 4EIPA 3NNEA 2VVLG 4A9WA 3EF6A 3CGCA 3AE3A 4ZCCA 4Z24A 4Z2RA 1GREA 1NHQA 4X9NA 4A6NB 2BK4A 4DSHA 2WP5A 4JQ9A 3V3NA 3V3OA 1GV4A 1OJAA 3AE7A 1GRHA 1L0VA 1ZKQA 4ICYA 4OPUA 2TMDA 4IV9A 1RYIA 2A89A 3O0HA 4H4PA 3IF9A 4HB9A 2XVFA 1QO8A 2Q7VA 5KOXA 2VRLA 3OZ2A 3RHAA 3AYJA 5CQFA 1BF3A 1DODA 3DMEA 3GYIA 4P9SA 1BKWA 4K8DA 4ZN0A 3PVCA 4A6NA 4WCTA 2V5ZA 2IIDA 4C74A 2XCGA 4EM3A 4JY2A 4B64A 5FS8A 3EAOA 5KXJA 1H81A 1ELIA 4CY6A 2EQ6A 1YQZA 5U1OA 1PS9A 4TM3A 3UKFA 4LIIA 2C75A 3IC9A 3K7QX 4M52A 5JCMA 4C3YA 3UOVA 2YAUA 2YLXA 2JB1A 2DKHA 3VRAA 4H2RA 5KVIA 1E6EA 3AD9B 1Y56B 2YG7A 4H4WA 3CGDA 4K22A 4Z2UA 5EOWA 3VRDB 4APNA 4NEWA 3JSKA 5IQ1A 1H86A 2XLRA 3WE0A 2JB2A 3AE1A 3T37A 2E4GA 2X8GA 2VQ7A 2Y6RA 5LV9A 4H4RA 2V60A 3FMWA 3SQPA 1D4DA 2XFOA 4H4UA 3RP7A 4HA6A 4U8JA 1V59A 2JAEA 2VQBA 2APGA 4AT2A 3KVEA 2GF3A 3URHA 3F8RA 2BCPA 2ZZBA 1D7LA 3RP6A 2JB3A 2XFPA 1Y56A 4OPCA 1N4VA 1TDKA 3C4NA 5HYMA 3NYFA 1NDAA 1KSUA 1D7YA 3KA7A 4OPDA 3GD4A 2YLWA 3NN0X 3NN6X 1H82A 4JNQA 1E7PA 4GF7A 3SM8A 2GVCA 1KDGA 4OVIA 5CKUA 2OLNA 1S3BA 5JCLA 3CPIG 3AD7B 2XLPA 2V6OA 1N1PA 1B8SA 4NTEA 1JNZA 4NZHA 1PBFA 3NK1X 3DH9A 1B4VA 3NH3X 1PBDA 2EQ9A 2BC0A 4KX6A 3AYIA 4J56A 4BK1A 1IUWA 3ZYXA 2RABA 3QVPA 3UKAA 1BGJA 1VG9A 3CPJG 1PDHA 1ZX9A 4O5UA 3LB8A 2R0PA 4PAAA 2GB0A 1H7WA 4GR1A 2B7RA 1DXLA 3AE5A 5KRQA 4GDPA 2F5ZA 3QSSA 1B5QA 1NEKA 4K5SA 4YWOA 4AT0A 4TM1A 3S5WA 1OJDA 2V61A 2BA9A 2XFQA 4GUVA 2Z5YA 2O9ZA 1OJCA 2BXRA 1GRBA 1EL9A 4E0VA 1F3PA 4U8PA 1DJNA 3DGZA 4UDQA 5BUKA 4J57A 1NG4A 3UKQA 1Z6LA 3SFDA 5U63A 2C70A 3H8LA 1O5WA 2R45A 2ACZA 3LOVA 3RP8A 4YT0A 3NK0X 4UP3A 1IUSA 1KFYA 4XWZA 1Y0PA 3V76A 1CL0A 1S2YA 4C5OA 3ALJA 2XVEA 1CF3A 2FJDA 3AE8A 3UKKA 3S61A 3UOXA 1NAAA 2CULA 3DA1A 4OPIA 1H83A 5FS6A 2FBWA 4U8IA 2YG3A 2Y6QA 4Y4MA 5U25A 1CHUA 5C3JA 4A5LA 2WEUA 4ECHA 5FMHA 3IHGA 3D1CA 1COYA 4RG3A 2GH5A 4B1BA 2EQ8A 2ZBWA 2TPRA 2GV8A 1H6VA 1MOKA 1DOCA 3I6DA 4X9MA 5FS9A 4YKGA 3H8IA 3NGCX 3QSEA 4YTPA 4X4JA 5HHFA 3AEDA 4J36A 5ER0A 3UOYA 5KOWA 1RSGA 1YKJA 3AB1A 3ICSA 1QLBA 2WP6A 4H7UA 4TM0A 1PBBA 3K30A 2B7SA 4EMIA 3UCLA 2NVKX 3AWIA 3BI2A 3GDNA 1TDFA 3DJJA 1AOGA 2X99A 4TM4A 5TR3A 1PXBA 1PJ7A 3FPZA 2XYOA 2XFUA 2WPFA 4K5RA 3NKSA 1LV0A 3KPFA 2QAEA 4YSYA 4UDPA 1GEUA 2C72A 3DGHA 5L46A 2YR5A 1PHHA 2YG4A 2OA1A 4BV6A 3UOZA 1PXAA 2PYXA 2WU5A 3BI5A 3GWFA 4LU6A 3UKLA 4YTMA 1CC6A 1YY5A 1TRBA 2UZZA 3NYEA 1CJCA 2YLTA 3ADAB 3CNJA 4IA5A 3ITJA 3DJGX 5IQ4A 4UDRA 3DK4A 1CJ2A 1E1KA 2GR1A 3FBSA 4B63A 2WETA 2X8HA 4BK2A 2NPXA 4AP1A 3LADA 3PS9A 3FG2P 4CY8A 4K7ZA 4U8KA 4H4QA 1CBOA 1PBCA 4D03A 3NTAA 4YSHA 5FS7A 5BVAA 3L1RA 1IJHA 2QA2A 1TDEA 1X31B 1ZOYA 3P4QA 5GSNA 2WDRA 5EB4A 2XVHA 3GWDA 4NTCA 1JRXA 4USQA 2R4EA 1LQUA 2OLOA 3AYLA 5M0ZA 4U8NA 1DOBA 1JNRA 1XPQA 4ZCDA 4H2NA 2C66A 1NENA 3NLCA 3LZXA 3AEEA 3M12A 2VRMA 3P4SA 3FIMB 3DJEA 3QFBA 1E39A 1E1MA 4K2XA 4AOXA 1FL2A 3AE6A 5BULA 1XDIA 2GAGB 2FJAA 3KU9A 2GMJA 4TLXA 4Z44A 1IUVA 3UTFA 1LJ1A 2HQMA 5JCNA 4NTDA 4FDCB 1GESA 3B6DA 3VR9A 1GETA 1HYUA 1PN0A 4I58A 4H50A 4USRA 4EM4A 4REKA 1O94A 1F8SA 4C77A 4Y4NA 2YVGA 4ADWA 1D4CA 2C65A 2JK6A 4U2LA 2BXSA 1E1LA 1KSSA 2GR0A 1EBDA 2WQYA 3UTEA 3VRBA 1XHCA 2WBAA 4U2SA 4Z26A 3ATRA 3AEAA 3P4RA 1VG0A 4CCQA 4EQSA 1ZK7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QVRA 3IC4A 4I2UA 3G7IA 1S3CA 4BURA 2FCHA 5G31A 3SFEA 4GRTA 3UKPA 3UMAA 4WXTA 4K0NA 3T14A 4GDEA 4EMJA 2GQFA 3GMCA 4Q5RA 2VL3A 2WOWA 3CNTA 3RNMA 1ZMCA 3H93A 2C67A 3GRSA 2PVQA 2GR2A 2B9XA 2H0HA 3QCPA 1V57A 4XRDA 3DVWA 5E59A 1Z5YE 3BNMA 3SYIA 3L8KA 2YP6A 2C76A 2OAMA 4Z43A 3F8DA 2BACA 1VF3A 1B37A 4IJIA 3AE4A 1ST9A 4A5PA 1JRZA 3MSZA 4BWSA 5C2TA 1VF4A 4HSCX 2C0DA 4N9XA 3I9V2 2XLSA 3QFAC 1N4WA 4PX1A 1E2YA 3T2KA 1GUHA 5HY5A 1YQ1A 1TK8B 1ZYNA 3CNSA 3KLJA 4U8MA 1GTHA 3DWVA 5IO0A 4OD7A 2H6YA 2HRKA 3HYVA 2FY6A 4FQUA 1ZMDA 2Z5XA 1BJXA 4WX1A 1O73A 2H76A 1GSEA 2C80A 2AHEA 1ZL9A 2LJRA 3GX8A 1VRSD 1M9AA 1JU2A 1N8JA 3E9JB 2Q0KA 3P8WA 5GRTA 5KMQA 1U87A 1OVNA 3AEFA 1GNDA 2HRAA 4MNNA 1ZYQB 2UZ8A 2YR6A 2V2GA 4BL7B 2WGRA 1V40A 3GA4A 3QR6A 4YKFA 3ICTA 1FECA 3K7MX 1DNCA 3NG7X 5F0GA 2R0GA 3UTHA 4EIQA 3LYPA 4Y4LA 3GMBA 1GSYA 2WS2A 3L9UA 3E1TA 8GSSA 3EPTA 2C3DA 2V3BA 4OCEA 5J3RA 1OJTA 2NVLA 4BL7A 2QSIA 5KN3A 2FNOA 1GALA 1PA3A 1GRGA 4K6XA 1VRQB 1JOAA 4FK1C 1BX9A 3ME7A 2XVJA 3BHFA 5GAND 3FW2A 2H71A 4KCEA 2YNXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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