4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
2GEWA 1N4UA 1F6MA 3NK2X 4H2RA 4DNAA 1PBBA 2BXRA 1L9DA 2GAHB 2XLRA 1Z6LA 4AP1A 1SEZA 2C73A 2WDVA 3LADA 4OPCA 2GR0A 3CGDA 1LPFA 3CNPA 2CULA 3NN6X 3QSSA 2C70A 4J2WA 5BVAA 3RP6A 1Y0PA 1GEUA 1H82A 3B3RA 2YAUA 2YM2A 1E6EA 1MOKA 4ZCCA 2WOWA 4Z2RA 4HA6A 5KOWA 2GQFA 2JK6A 1EL5A 1PJ5A 3CN8A 3K7QX 4H4YA 4U8JA 4U8OA 5DBJA 1H7XA 3AE4A 3P1WA 4DGKA 1GRAA 1DNCA 2Q0KA 1H6VA 3QFAA 3ABVA 4A9WA 4OPLA 2VVLG 5U1OA 3KA7A 5KWFA 2R0PA 2Z5YA 2WOVA 1TYTA 5ER0A 4K5SA 4ZCDA 2PYXA 3UP5A 1IUXA 5KOXA 2B9YA 4YKGA 2XVEA 1CJ4A 1COYA 3H8LA 1S2QA 1H81A 1K4QA 4J57A 4JQ9A 1VG0A 2XFUA 3GMBA 3L1RA 4K7ZA 2IVDA 2B7RA 2WOIA 4B65A 3LJPA 1ZMCA 2E5VA 2W0HA 3CPIG 3IF9A 3NHOX 2FJAA 2XLPA 4IVOB 3H4KA 3HZLA 2GQWA 2YQUA 4ADWA 1GETA 1QLBA 3DK4A 3Q9TA 1NG3A 4B68A 2RGJA 4U2TA 3EAOA 1N1PA 2DKHA 1NAAA 3K30A 3UOXA 2O9ZA 2A8XA 1EL8A 1X31B 3AE3A 2YVJA 1H86A 1LQUA 1ZOVA 2BC0A 1DOCA 3IC9A 3PO7A 3GWFA 1P2EA 4E0VA 3FPZA 4H4TA 4I59A 3NRNA 1TRBA 2XLTA 3DGHA 4KX6A 4H2PA 2RGOA 5BULA 3FG2P 2WHDA 3NIXA 4H50A 3BI2A 1H84A 3RHAA 5M0ZA 3OZ2A 3QSEA 3NTDA 3CGBA 3G5SA 1F8WA 2OA1A 4CRTA 4K22A 4JY2A 3V3OA 1XPQA 1CC4A 3PVCA 2F5ZA 4RSLA 3UCLA 4AOSA 1K0IA 2R4JA 4H4WA 2BK5A 1M64A 4CCQA 4EMIA 4EIQA 3DJGX 1PXAA 4EMJA 3RNMA 1YQ3A 4D03A 3DGZA 1XDIA 3AE2A 1Q1WA 3BHFA 1KNRA 3GRSA 2GAGB 2IIDA 2V5ZA 3CGEA 3DJEA 4OPTA 4NTCA 4UDPA 2QCUA 3F8RA 1CJ3A 2AAQA 3COXA 1CHUA 2GMJA 2YLXA 2YG5A 2BCGG 3K7MX 3NK0X 3RP8A 1GPEA 3BI5A 3LB8A 1JEHA 1OJ9A 2A87A 1F3PA 1P2HA 1B5QA 4H7UA 2J3NA 2C7GA 3CIRA 3GWDA 4H4QA 5CKUA 1PDHA 4YTMA 2FJBA 3P4QA 1MXTA 2A89A 2R9ZA 1PN0A 4EM4A 3GDNA 4D04A 3ADAB 1JRXA 1GESA 2R0GA 1PS9A 3AYJA 3UKFA 2WS3A 3NN0X 4H2QA 2FBWA 4C74A 4XWZA 1REOA 3K7TA 2YLSA 3UOZA 3ATQA 3V76A 3GYJA 4EM3A 3AE6A 3G5QA 3NG7X 4U2LA 3M0OA 4H4XA 4A5LA 2EQ6A 1BKWA 1DOBA 2OALA 3RP7A 2C76A 1TDOA 4O5UA 3GRTA 3IHGA 3PS9A 3DJDA 1GTHA 4TM3A 1GOSA 1GTEA 1YQZA 3QSMA 5J7XA 3URHA 1CL0A 1QO8A 5EBKA 1DODA 2ZBWA 4K2XA 2DKIA 3GMCA 1BGNA 3T37A 2WU2A 1B8SA 3II4A 2GV8A 3GYIA 3ITJA 3UKAA 1NHQA 1IUUA 3ALMA 2YLWA 2C72A 4H4VA 2TMDA 2C64A 2VQBA 1E39A 4UDQA 4B67A 2WP9A 4NTDA 3CNSA 3AD9B 1GALA 4A6NA 3NKSA 2R0CA 3DK8A 4MJWA 1ZDLA 4EQWA 3Q6JA 4GCMA 2XCGA 4U8KA 4A7AA 2GB0A 2XVJA 3DK9A 3VRDB 1ELIA 3P4RA 4NTEA 4TLZA 1GRTA 3UKPA 4CCRA 4TLXA 4GR1A 5GRTA 5EOWA 4U8PA 4APNA 5KVIA 2B9WA 2BYBA 3UTGA 2V6OA 3OC4A 1RSGA 4GDPA 2GR1A 1PBDA 1TDEA 2UZZA 1JRZA 3AEDA 1NENA 1H83A 2BABA 1GNDA 4Z25A 2WEUA 2OAMA 1CC2A 2RGHA 4OCGA 2V3BA 1Y56A 3AD7B 3LZXA 1EL7A 2AQJA 1GREA 2Q7VA 2Y6QA 2V3AA 2YG4A 3ALJA 4UP3A 1N4WA 4JNAA 3NT6A 1JU2A 2ARDA 1F8SA 2C3CA 3F8PA 2BXSA 3BNMA 1CC6A 1JNRA 2YVGA 3UP4A 4DSGA 2X8GA 3KU9A 4IVMB 1K0JA 1LJ1A 1ZOYA 2XYOA 4C3XA 3SM8A 3ATRA 3UOYA 3VQRA 2YWLA 2HQMA 4OVIA 5FS6A 3UTFA 4JNQA 1S3EA 5C2TA 3EANA 2APGA 1PXBA 3AEGA 4O5QA 4Z24A 3AE9A 2V60A 4ECHA 1GRHA 3C96A 4TM0A 1FOHA 2FJDA 4KPRA 3G5RA 2YG7A 1K0LA 1FECA 1LVLA 1XANA 1M6IA 2YLZA 4EIPA 1EL9A 3CTYA 2GR3A 1RP0A 4XXGA 1OJAA 2H89A 2JB3A 4EMWA 4EQSA 2JBVA 4K8DA 4YXDA 1IJHA 1ZX9A 5LV9A 2B7SA 1PXCA 5IQ1A 2CFYA 3AE5A 1CF3A 4C5OA 1GXFA 1L0VA 4ZN0A 4YSXA 1GT8A 2YLRA 2CVJA 4AT2A 3ICTA 3NTAA 2WQYA 3LOVA 5TR3A 1KFYA 4FK1C 4Z26A 2I0ZA 4AP3A 1YY5A 2GR2A 5J60A 3P4SA 1BZLA 3IHMA 5IPYA 2R4EA 3AEBA 1BF3A 4C77A 1AOGA 1O95A 2WPFA 1H7WA 4CBQA 2WPCA 4X9NA 4J56A 4B64A 4J33A 2WBAA 2ZZ0A 5CQFA 3VRAA 4HB9A 1VG9A 2Q0LA 4GF7A 3UKLA 3B6DA 3KPFA 4X4JA 5KVHA 4CY6A 4YWOA 3WE0A 2R46A 1V59A 2EQ8A 4B1BA 4CNJA 4P9SA 4TM4A 1ZKQA 4Z2TA 1F8RA 2XDOA 2XVIA 4FX9A 4A65A 5KXJA 1E1MA 5BUKA 4C3YA 5HY5A 3S61A 1KSSA 5IQ4A 4GUVA 4FDCB 3NYFA 4BK3A 1FEAA 3GD3A 2JAEA 2XVHA 5HHFA 4WCTA 2XVFA 3DJJA 2C67A 1GRGA 4NEVA 1D7LA 2GH5A 3CNJA 1IUVA 5FMHA 2X50A 3GSIA 1JRYA 1PBCA 2FJEA 4PABA 4NZHA 4J36A 4H4SA 2XFOA 3KVEA 1JOAA 1IUWA 1D5TA 3P9UA 3O0HA 1TDKA 2PHHA 3ZYXA 2Q6UA 2OLOA 2IVEA 4BV6A 1QJDA 3P4PA 5FS8A 5FS7A 4CNKA 1VDCA 2B76A 3AE1A 2BK3A 2WU5A 3AYLA 4U8NA 4RG3A 2X8CA 4RG4A 5U63A 1FEBA 2VOUA 2ZZCA 3FIMB 4TM1A 4OPIA 1DJNA 4PAAA 5GSNA 2NVKX 4J31A 1D4EA 1N4VA 4B69A 2XFNA 4YSYA 4U8LA 4BK1A 5C3JA 5BRTA 2JB1A 3AYIA 1YQ4A 1E1LA 3E1TA 1NHRA 2YR5A 3AEEA 3REDA 4WX1A 1XHCA 2XLUA 3SFEA 1OJDA 3AD8B 4Z2UA 2C3DA 1MO9A 1CJCA 1NDAA 3AXBA 1HYUA 3DA1A 2QA1A 4DSHA 1GSNA 2EQ9A 2WDQA 2BC1A 1ZMDA 3AB1A 4OPUA 3QFBA 1GRBA 1B37A 2ZZBA 4BJZA 4EQRA 5M10A 4I58A 3QVRA 2ACZA 2C75A 3D8XA 2YG3A 3KD9A 3CNTA 3EF6A 4JY3A 1VQWA 2VVMA 5EB4A 4Z43A 1PJ7A 3BI4A 2H88A 1YKJA 3UKQA 1RYIA 3H8IA 3C4AA 4A6NB 1ZY8A 2R45A 3AE7A 3NH3X 1DXLA 1UKVG 3LZWA 3ICRA 1L9CA 4OPDA 3C4NA 3NLCA 4USRA 1D7YA 2GF3A 5KRQA 1BGJA 1PJ6A 4BURA 4X9MA 5JCNA 1DJQA 3AEAA 4AT0A 5HXIA 1Q1RA 2QAEA 4Y4MA 2YG6A 1PHHA 4NEWA 1S3BA 2VVLA 5EB5A 1IUSA 5JCLA 1E1KA 1E1NA 1OJCA 1EBDA 1E7PA 2EQ7A 2E1MA 5U25A 2X99A 4LU6A 1Y56B 3FBSA 4Y4NA 3ALLA 1LTXR 1NG4A 2OLNA 1ZP0A 3V3NA 1NPXA 1CJ2A 4U2SA 3VR9A 4B63A 3ISHA 2XFPA 3UTEA 1NHSA 1NHPA 1OJTA 4H4PA 2YLTA 3CPJG 4BK2A 3KKJA 4H2NA 1FL2A 4A99A 1S2YA 1NEKA 4N9XA 4YSZA 1JNZA 5HYMA 1TDFA 2YR6A 4YT0A 3AWIA 4YTNA 2VZ2A 1D4DA 3AECA 1L9EA 2GRTA 2BS3A 2WDRA 3L8KA 5FS9A 2C66A 2TPRA 3R9UA 3NNEA 4H4UA 4JDRA 1VRQB 3ZDNA 4H4RA 2NPXA 3BNUA 3KLJA 1GERA 3I3LA 2GVCA 4GRTA 2VRLA 3AE8A 1KDGA 1FCDA 3FMWA 1LQTA 1GRFA 3VR8A 2E4GA 2WP6A 1ONFA 1LV0A 2VQ7A 3CPHG 3DH9A 3QVPA 4FK1A 5L46A 4EQXA 3S5WA 3F8DA 4A79A 2WPEA 3GD4A 4IA5A 1CBOA 4XWRA 1ZK7A 2QA2A 1O94A 2XLSA 3GDPA 1O5WA 1Q9IA 3JSKA 3NYCA 2B9XA 3UKKA 1TDNA 4USQA 3IWAA 4BJYA 1PBFA 4LA1A 3EPTA 2V61A 2XFQA 4IV9A 1PBEA 3UKHA 1DOEA 2YR4A 4YSHA 2YM1A 4ICYA 3SFDA 3CNDA 4M52A 4B66A 2AR8A 3D1CA 3UOVA 4CY8A 4GDEA 2X8HA 3BHKA 2YVFA 1IUTA 2BS2A 3ICSA 2BS4A 4H4ZA 3SQPA 1TYPA 4UDRA 1KF6A 2GMHA 3SGLA 4YTPA 4IA6A 4REKA 4U8MA 1D4CA 1KNPA 2JKCA 2RABA 2Y6RA 3CGCA 3DMEA 3NYEA 4Z44A 1GV4A 2WP5A 3M12A 2BK4A 5JCMA 2Z5XA 3M13A 4JN9A 3NGCX 2JB2A 2WETA 5JCIA 2BCPA 2X3NA 4U8IA 2BACA 2WESA 1KSUA 4YKFA 1BWCA 3NK1X 4LIIA 3I6DA 4J34A 2VRMA 5JCKA 3UTHA 3VRBA 4Y4LA 2BA9A 3LXDA 2CDUA 3AEFA 1B4VA 4K5RA 3QJ4A 4OPGA 1W4XA 2C65A 4AOXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ES7A 5FT3A 2K9FA 4DNAA 1PBBA 3M0FA 1L9DA 2G0FA 1XWAA 1EOGA 4J2WA 3L0HA 5BVAA 2YNXA 1Y0PA 5ECPB 4BPYA 2YM2A 2H1GA 4K9ZA 1S3AA 2JK6A 1F3AA 4H4YA 4ZBAA 1PGTA 5DBJA 2PUKC 1YDKA 2Q0KA 3QFAA 2VCTA 4OPLA 1FB6A 4MLYA 2C0FA 3FYGA 2Z5YA 3MDKA 2WOVA 1TYTA 2GQMA 2PYXA 1V58A 1IUXA 1X5DA 2DJ2A 1MDIA 1XFLA 1YKAA 2DSAA 3L1RA 2XFUA 2B7RA 4B65A 3F3RA 3LJPA 4XS4B 4IVOB 2GQWA 4ADWA 4B68A 4BIKA 4U2TA 2L6DA 5KN1A 3CQFA 4IHUA 3IE3A 3L4NA 2CX4A 4N30A 3UOXA 4L8EA 3AE3A 2B5YA 4NAXA 3WT2A 4FYCA 3IC9A 2LNSA 3GWFA 2P5QA 4E0VA 3L9VA 3G7YA 3NRNA 4I8BA 2XLTA 1BJXA 3J7Yk 3LYPA 4XHMA 1HNCA 2HE3A 5BULA 1USBA 2D2ZA 2LKUA 3O3TA 4H50A 4JEDA 1H84A 5D93A 3RHAA 1S3RA 3ERFA 4TR3A 1SL0B 3QSEA 4GLTA 3CGBA 2OA1A 4CRTA 2LRNA 4K22A 1CC4A 2F5ZA 2I1UA 2H0IA 1M0UA 2V2GA 5CRWA 5DVBA 1M64A 4CCQA 3DJGX 2F9SA 4D03A 3ERGA 1OC8A 4HOJA 4HEA2 4KF9A 5IMAA 1Q1WA 2GAGB 2HT9A 2V5ZA 3F8RA 4KSOA 2HZEB 3S9FA 2WS2A 4YH2A 2A4HA 1TXXA 4J57E 4POLA 3QAVA 1M2DA 3IAM2 4K7NA 2OA7A 1SJZA 2KP2A 1PDHA 2L5OA 2VO4A 1MXTA 1PL1A 5DJMA 1JRXA 5AIXA 2R0GA 3E9JB 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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