4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
3IC9A 2BS3A 2BXSA 4XWZA 1B8SA 3FIMB 3M0OA 1EL5A 1ZK7A 3CNDA 5FMHA 3AE7A 3QJ4A 5KOWA 1GETA 1ZP0A 3KKJA 4KPRA 1PHHA 3H8LA 4GCMA 3GMCA 1QLBA 3S5WA 4C5OA 3RP7A 2JBVA 2IVDA 1PBDA 1CBOA 3DMEA 5KVHA 2YLXA 3UOVA 3L1RA 3ICTA 3VRAA 2C7GA 3P1WA 1LQTA 2OALA 2WOWA 2YR4A 3M13A 3GRTA 3B3RA 4U2SA 4U8LA 1H81A 1GOSA 1GNDA 1V59A 2GR3A 2GR2A 2XVEA 4H4QA 2B7RA 2XVFA 2TMDA 3P4SA 3GYIA 4X9NA 1H82A 3FMWA 3DK8A 4Z2RA 2B7SA 2A89A 2VVLA 5HHFA 3IF9A 4J31A 4FK1C 3DGZA 2BA9A 4H4WA 4YKGA 1H83A 1PS9A 4J34A 4D04A 1N4UA 1YQ4A 2H89A 1JNZA 4H4VA 4AOSA 3GYJA 2JAEA 4JY3A 2EQ8A 3G5SA 3CNJA 3DH9A 3F8PA 2B9YA 2XVHA 2XFPA 4EQXA 3S61A 1H84A 4AP1A 3DGHA 4Y4MA 1TRBA 1GRAA 1IUUA 1XPQA 4H4ZA 4K8DA 3AE8A 2BK3A 2BCGG 4JN9A 5KVIA 5JCIA 4Z2UA 4TM3A 1LPFA 2X3NA 3CN8A 1K4QA 3PS9A 3T37A 4C74A 2XFOA 1O5WA 4GF7A 2H88A 2BC0A 2GAGB 3AXBA 1E1MA 1PN0A 1IUWA 4A7AA 4N9XA 2QA2A 4ZN0A 2PYXA 1UKVG 4OPGA 4EQWA 1KFYA 3F8DA 2FJDA 2GH5A 4J2WA 3CNSA 3NYFA 1PBFA 3ADAB 5U25A 4U8KA 3C4NA 3NYCA 1CJ3A 1N4VA 4EQRA 1IUSA 1TDFA 1Z6LA 1ONFA 1PDHA 2GRTA 3KU9A 3ALJA 4OVIA 4YTMA 3UP5A 4B69A 4CCRA 2FJAA 3AD9B 3DJJA 4IVMB 3LXDA 2OAMA 4EIQA 3IWAA 4U8NA 1BZLA 1NEKA 1ZOYA 2I0ZA 2ZZCA 4GDEA 1KNPA 1XDIA 2BC1A 3ALLA 4H7UA 1LTXR 1PJ5A 3SGLA 1DODA 1ELIA 4WX1A 3UTHA 3EAOA 5EB4A 5J7XA 2RGJA 5CKUA 4A65A 2X99A 2XVJA 1E7PA 3BI4A 1K0LA 2JB1A 3NT6A 2BXRA 4WCTA 4YSXA 4YXDA 4BK1A 2DKHA 2J3NA 2CULA 4REKA 1OJDA 3NN6X 2OLNA 3ABVA 4YTPA 1GRTA 1BGNA 4TLZA 2XCGA 1FOHA 1F8WA 2IIDA 2O9ZA 4CY6A 4X4JA 4OPTA 1GTEA 2QAEA 4RG3A 1TDEA 4A6NB 1MO9A 3UKKA 4BK2A 3KD9A 4H4TA 3RNMA 2Z5YA 2B9XA 2Q6UA 1BF3A 2FJBA 4CNKA 5C2TA 2XFQA 3LZWA 5FS6A 1S3BA 3CPJG 3M12A 2Q0LA 4EMJA 3NKSA 4RG4A 4NEVA 1N1PA 3II4A 2WDVA 4DNAA 3QFAA 1KDGA 4O5QA 4BJYA 1LQUA 2GF3A 2OA1A 3I3LA 2JB2A 2Y6RA 1KSUA 2Y6QA 3UOYA 1RYIA 1NG4A 2WDRA 4J36A 1TDKA 2YLWA 4YTNA 3AE6A 1COYA 3NK2X 3NTAA 2XFNA 5IQ4A 2JB3A 5IPYA 2YM2A 3URHA 3PO7A 4A6NA 2AQJA 4I59A 3AEFA 1FEAA 3FPZA 1NPXA 3ICRA 2DKIA 4A5LA 2V6OA 5KRQA 3ISHA 3WE0A 3NGCX 1JNRA 3NHOX 3NIXA 1X31B 1EBDA 2NVKX 3NLCA 1E39A 1KSSA 3GRSA 1CC4A 2BCPA 4EM3A 2CDUA 4LIIA 4AT0A 1E1LA 3DK4A 1L0VA 3AEGA 3GWFA 3R9UA 1RSGA 3ALMA 1D5TA 4K5RA 3QSEA 1GESA 3UKFA 2C72A 3AEDA 3P9UA 3REDA 4ZCCA 2VRMA 4NTEA 4P9SA 5JCMA 1TDOA 2CFYA 3SFDA 2WOIA 2OLOA 2ACZA 2JK6A 3K7MX 5GRTA 3BNUA 1REOA 5ER0A 4GRTA 2GQWA 4K5SA 2ZBWA 4EQSA 1YY5A 3IHGA 2C64A 1GTHA 3D1CA 1RP0A 4H4XA 3ICSA 5JCKA 4FDCB 3RHAA 2GR1A 1PJ6A 3Q9TA 4YWOA 1QJDA 3ZYXA 4H4PA 3LADA 2VZ2A 3KVEA 4NTCA 4APNA 4ICYA 4K7ZA 1JU2A 1CC2A 1EL9A 2C3CA 2YLZA 4LU6A 3EPTA 1S2QA 4OPDA 1PBEA 1ZKQA 3G5QA 3ITJA 3GD4A 2XVIA 3NN0X 3NYEA 2A87A 3VR9A 4NZHA 1DOCA 2ZZ0A 4Z2TA 1XANA 1IUVA 2ZZBA 2YVFA 2YAUA 3PVCA 5EOWA 5BRTA 2V3BA 5U63A 2WS3A 3UKAA 3GDPA 4C77A 2YWLA 1QO8A 4H2PA 3AE5A 4Z43A 4E0VA 4OPIA 1BGJA 1L9EA 1P2EA 4H4RA 3F8RA 1GRFA 1MXTA 4XXGA 1E1KA 1Q1RA 1OJAA 3OC4A 1JOAA 2YM1A 1ZOVA 3VRDB 1B37A 4A99A 3AE1A 1O94A 2YG5A 4X9MA 2QA1A 2Z5XA 4OPCA 4B66A 4OCGA 5KXJA 1M64A 1F6MA 2F5ZA 2BK5A 1GEUA 4HA6A 2BK4A 3BI5A 3VQRA 5J60A 4IVOB 5FS8A 4AOXA 3HZLA 2V5ZA 3NH3X 1OJ9A 1NAAA 3SFEA 1H86A 3GDNA 4NEWA 4XWRA 1GXFA 1JRYA 4KX6A 3P4PA 3UTGA 2WU5A 3V3NA 2XLTA 3CNPA 4J33A 3ATQA 4CCQA 1ZMDA 2C70A 2VQ7A 3LJPA 5IQ1A 4BV6A 2YG6A 2YLTA 4RSLA 5DBJA 2B9WA 1D4CA 2C75A 3LB8A 4OPLA 4NTDA 5HXIA 3QSSA 2C3DA 2XLRA 2RABA 3CGEA 2VVMA 1IUTA 3L8KA 4FK1A 4U8OA 2GMJA 1Q9IA 3D8XA 5GSNA 3UTEA 1JRZA 1K0JA 4Z24A 3B6DA 1ZMCA 4H2NA 1YQ3A 4TM0A 5C3JA 1K0IA 2BS4A 4MJWA 2YVJA 4J56A 4U8IA 3O0HA 4CRTA 5TR3A 4C3XA 2GQFA 3VRBA 2WQYA 4UDRA 2V3AA 4H2QA 1VRQB 4UDQA 4AT2A 3CGCA 1GREA 3UKHA 2JKCA 1DOEA 3AB1A 3COXA 3DJGX 3EANA 1EL8A 3AE4A 3LOVA 2WESA 3AYIA 2PHHA 2HQMA 2XLSA 1TYPA 2R4EA 1S3EA 1AOGA 4C3YA 1ZY8A 1LJ1A 1BKWA 5FS9A 5EB5A 2RGOA 4UP3A 1Y0PA 1GT8A 1DNCA 2X8HA 2TPRA 3AYLA 4Y4LA 2V61A 2X8GA 3E1TA 3H8IA 4K2XA 1GPEA 4CY8A 4U8JA 2BACA 3LZXA 3NK1X 1GSNA 1W4XA 3QSMA 2WPEA 1O95A 3AE3A 1YQZA 1KF6A 2Q0KA 1D4DA 2BABA 5CQFA 3G5RA 2YLSA 1DJNA 2WP6A 3BHFA 2YLRA 2YR5A 2XYOA 4H4YA 5KWFA 2AAQA 3NRNA 1F3PA 2WPCA 3AYJA 4JNQA 3AEAA 4ADWA 4M52A 2YG3A 5KOXA 5M0ZA 1FL2A 1VQWA 1CHUA 3OZ2A 2GR0A 2EQ6A 3UTFA 4B65A 1M6IA 1NHSA 2R46A 3I6DA 2IVEA 3UKLA 1LV0A 2WHDA 4ECHA 1B5QA 3AD8B 2YQUA 2APGA 3SM8A 1IUXA 3NNEA 1XHCA 2GEWA 1FCDA 5M10A 4Z44A 2W0HA 2Q7VA 4IA5A 3AE9A 1IJHA 1F8SA 2XLPA 2X8CA 4H4SA 4YSYA 3NG7X 3C4AA 2CVJA 4BURA 2NPXA 4FX9A 1TDNA 1YKJA 2AR8A 3CNTA 2BS2A 2WOVA 3UCLA 3ZDNA 4CNJA 4EMWA 2R0PA 1ZDLA 3KPFA 3UP4A 4B63A 3BHKA 1N4WA 4H4UA 4PABA 4DSGA 4B68A 4A79A 3CGDA 1L9DA 3AD7B 2E5VA 3GWDA 3UOXA 4ZCDA 2X50A 3CTYA 2VVLG 4A9WA 1DOBA 3FG2P 4DSHA 2WP9A 3KA7A 3P4QA 1D7YA 1HYUA 3CIRA 4LA1A 4OPUA 2R45A 1Y56B 2R4JA 4GR1A 2C66A 1CC6A 1GRGA 3Q6JA 1GALA 1H7XA 4K22A 3BI2A 3BNMA 3P4RA 3K7QX 2YG4A 4JDRA 3AWIA 4TM4A 4UDPA 4AP3A 1PXAA 4EM4A 2C67A 5BVAA 1CL0A 3DK9A 3K7TA 1D4EA 2EQ9A 2XLUA 3CPHG 4J57A 4JNAA 1NHRA 2VRLA 1SEZA 2YR6A 3DA1A 1JEHA 1ZX9A 5U1OA 2ARDA 1TYTA 4U2TA 5BULA 1E6EA 3JSKA 4PAAA 4B64A 1Y56A 4H2RA 1FECA 1EL7A 2RGHA 1F8RA 4U2LA 3IHMA 1CJCA 5HYMA 2E4GA 3NK0X 4I58A 4EMIA 1NHQA 2R0CA 1B4VA 1GRHA 3QVRA 3QVPA 4USQA 4D03A 3V76A 2FBWA 4YSHA 4GUVA 2C73A 3UKPA 2C65A 4B1BA 2UZZA 1PBCA 1MOKA 4EIPA 4USRA 3CGBA 1VDCA 2B76A 3V3OA 5JCLA 2XFUA 3EF6A 2A8XA 3UKQA 2V60A 2VQBA 4JQ9A 1Q1WA 1JRXA 2BYBA 2QCUA 3RP6A 2WETA 2C76A 3DJEA 1VG0A 1KNRA 1E1NA 1P2HA 5HY5A 3CPIG 1DJQA 1CJ2A 1BWCA 2GB0A 3KLJA 2WPFA 2GV8A 4IA6A 4HB9A 1NDAA 1OJTA 3K30A 4Z25A 3GD3A 2WU2A 4B67A 5LV9A 2EQ7A 4H50A 2WBAA 1D7LA 2R0GA 2E1MA 4IV9A 1DXLA 2XDOA 4TLXA 4BK3A 2GAHB 2R9ZA 4YKFA 5EBKA 4BJZA 4Y4NA 2WEUA 3C96A 2YVGA 5FS7A 1S2YA 3AECA 3ATRA 3DJDA 1H7WA 4O5UA 3AE2A 1PBBA 1VG9A 1OJCA 3AEBA 1GRBA 4U8PA 4CBQA 3QFBA 3H4KA 1L9CA 2GMHA 4U8MA 4YT0A 2WDQA 1NG3A 1CJ4A 3AEEA 2FJEA 3UOZA 5JCNA 1PXBA 2GVCA 1LVLA 3NTDA 1CF3A 3RP8A 2WP5A 3GMBA 1GV4A 5BUKA 1FEBA 4TM1A 4DGKA 1H6VA 4GDPA 4YSZA 2YG7A 1PJ7A 1GERA 1PXCA 4JY2A 3VR8A 2VOUA 4Z26A 3SQPA 3GSIA 1NHPA 3FBSA 5L46A 1NENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BXSA 5FMHA 1GETA 1WIKA 3BBYA 4PUAA 1ZP0A 5IO0A 3KKJA 2F9SA 3GMCA 3BD2A 1JFUA 4WBRD 1PBDA 3HCZA 1CBOA 4F9ZA 2XHFA 4MJBA 3ICTA 3VRAA 1SJ6A 1LQTA 1M7TA 2OALA 2WOWA 3IK7A 3TKSE 2O8VB 2TRCP 2XVEA 4FIWA 4J56E 1MEKA 1X9WB 3FMWA 5HQPA 3DK8A 3IF9A 2DC5A 4H4WA 3N5OA 1YKCA 2H89A 4ML6A 4AOSA 2JAEA 2YPMA 4N0VA 4G73A 2B9YA 2VOCA 3SZWA 4EQXA 4WBJA 5A4WA 4Y4MA 4AF2A 1XPQA 4H4ZA 2OA7A 1S3AA 5KVIA 3VI5A 4Z2UA 4C74A 4IVFA 4JR4A 4GF7A 1ZCPA 4P3YB 3F4TA 1PN0A 4N9XA 2QA2A 2IWTA 2PYXA 1UKVG 4EQWA 2YJ7A 1FW1A 3FR3A 1WJKA 1TK8B 3F8DA 3IAS2 2GH5A 4J2WA 3CNSA 3NYFA 5U25A 4U8KA 3K8NA 2P5RA 3C4NA 3NYCA 1IUSA 3IHQA 1ZGNA 2VIMA 3IK9A 4OVIA 1XIYA 1NHOA 3DJJA 4IVMB 5DCGA 1XZOA 3GFKA 4EIQA 1XCCA 3RAZA 1BZLA 2ZZCA 2HI7A 5D9XA 1PJ5A 1DODA 4WX1A 3SZ0A 5EB4A 3HHVA 2FUG2 1V40A 5CKUA 2WRTA 4A65A 5KVHA 1E7PA 1XW6A 2BJXA 2BXRA 4WCTA 4YSXA 1UA5A 2C3TA 4NHZA 5FHIA 4REKA 1DE2A 1GRTA 1BGNA 1FOHA 3PPUA 2IIDA 4X4JA 3VWUA 3QMXA 1GTEA 1TDEA 6GSVA 1MO9A 4NV5A 2DMMA 3KMOA 5ECLB 5JWRB 3LW9A 1BF3A 2JSYA 5C2TA 5FS6A 1S3BA 3CPJG 5CYYA 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5J5NA 3UAPA 3SX6A 4ID0A 1U3IA 1X5DA 5GAPD 2B9WA 5J41A 3QSSA 2XLRA 3T2KA 2H74A 2VVMA 4TR4A 4HZ2A 1U6TA 2I81A 3TJJA 1B48A 2GMJA 3D8XA 4BIKA 3B6DA 4O7HA 1RK4A 4HJMA 1YQ3A 4TM0A 1G7EA 3GA4A 2H1GA 5D9VA 3APSA 5CRWA 1A2LA 4GTUA 5G31A 4H2QA 2D2ZA 4UDQA 2VL2A 3F6FA 3EYTA 1DOEA 1TK5B 2H1BA 3DJGX 5HR0A 4HOJA 3GKXA 5D9TA 5BMUA 3IDVA 2HT9A 5EB5A 1F9MA 3CQFA 4F03A 2X8HA 3AYLA 2V61A 2X8GA 3H8IA 1K3LA 3H79A 4GWRA 2VCXA 3LZXA 1W4XA 5B7CA 3QSMA 1O95A 3TKRA 1PL1A 2AJQB 5KWFA 2VL2C 3HA9A 2XYOA 1F3PA 3AYJA 1TI1A 2YANA 4JNQA 3C73A 2R5GA 4M52A 4QQ7A 1F2EA 2N5BA 4NAXA 3ISOA 3F0IA 1VQWA 2H70A 2LV3A 4B65A 3HYVA 2XBIA 1LV0A 1ZOFA 2YQUA 2APGA 3SM8A 1GULA 5LCZA 4OFMA 1XHCA 2W0HA 4EC0A 2CV4A 2GS3A 1SL2B 2Q7VA 2C0EA 4IELA 2XLPA 4K2DA 5G5FA 2CVJA 1TDNA 3FRCA 2AR8A 3UCLA 2VCQA 5DQSA 3EWLA 4N11A 4EMWA 2R0PA 1TXXA 1K0CA 5C00A 2DBCA 2E5VA 2VUPA 2DJKA 1X9SB 3D0ZA 2JACA 2H01A 3EU3A 3P4QA 1HYUA 3P90A 3FR6A 4LA1A 1PD21 3QAGA 4WXTA 4KUNA 5IPHA 3IPZA 2LEGA 1CC6A 1GRGA 2PPTA 3G9BA 3P4RA 3BNMA 2CZ3A 3Q18A 3AWIA 4AP3A 4IKHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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