4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
1KSUA 1LTXR 3AEBA 4A5LA 1REOA 3KD9A 2OALA 3ABVA 3GD3A 4K22A 4C5OA 4CCRA 4AT0A 1OJAA 5KVHA 3GD4A 1P2EA 4YTPA 1PS9A 3L1RA 1KSSA 3DMEA 5IQ1A 3LZWA 3LOVA 2WP6A 2XCGA 1GRTA 1N4VA 2C65A 1YY5A 2XFUA 1CC2A 2XVIA 3T37A 2YG4A 1YQ4A 2V3BA 4BJYA 1UKVG 3AXBA 3DK4A 3BI5A 4YTMA 5JCLA 5FS8A 3AD8B 3UP5A 5DBJA 1BZLA 1Y0PA 4K2XA 4K5RA 1H86A 2IIDA 4BK3A 4U8PA 2VRMA 2F5ZA 3DA1A 3LXDA 1GRGA 3DJGX 2Q0KA 2C3DA 3S61A 4OPUA 5KVIA 2C72A 1RP0A 2QA2A 1NPXA 1OJDA 2B76A 3UOYA 4FK1C 2JB2A 2VQ7A 4Z44A 3L8KA 3NT6A 1COYA 2GVCA 4GUVA 4RSLA 3M0OA 1CBOA 3V3OA 2XFNA 4YT0A 2JKCA 2WPEA 3UTGA 5IPYA 1XDIA 5JCNA 5JCIA 2GR3A 3FPZA 4U8IA 2VZ2A 4NTCA 2BXSA 3CPHG 4O5UA 3AYLA 2APGA 1PXBA 2C3CA 3NKSA 4I59A 4NTEA 5EB4A 2C64A 2VRLA 4B1BA 1B37A 3QFAA 4IVMB 5ER0A 3O0HA 2AAQA 4ECHA 1BWCA 2C73A 5HXIA 2B7SA 1PXAA 2GH5A 5EBKA 4JY2A 2JBVA 1LQUA 2V60A 3AECA 3H4KA 3K7TA 2GEWA 4YWOA 1GRFA 3IHMA 4USRA 4J36A 4B68A 3DK8A 1W4XA 2TMDA 1D4DA 1LPFA 2R4EA 2X99A 3FMWA 4GF7A 4NTDA 1CF3A 2JB3A 2YQUA 3AWIA 5KOXA 1BGJA 4H4SA 2B9YA 4UP3A 1H82A 4TM3A 5M0ZA 4OPTA 1FL2A 2BXRA 4GCMA 1CC4A 3DGZA 2R45A 2YLSA 1N1PA 2VQBA 3KVEA 1SEZA 3AE1A 3LB8A 4YSZA 3AE6A 1NHSA 1TDOA 2BABA 3K30A 2WETA 1JRXA 4OPGA 1JU2A 1TDNA 4U2TA 3CNPA 4CBQA 2YG3A 1FOHA 3EANA 4TM1A 1CL0A 4H4YA 4U2LA 2ACZA 3LJPA 1IUUA 3QVPA 2YLRA 1ZOYA 4JN9A 4M52A 1RSGA 2ZBWA 1TYTA 1PBDA 3I6DA 1GPEA 4B63A 3GYJA 3BHFA 2BK4A 3NIXA 1MOKA 1EBDA 2WPFA 4EQSA 5FS6A 2C7GA 1GTEA 5BULA 1KFYA 2BA9A 2RGJA 4UDPA 4CY8A 1PXCA 2WP5A 1CHUA 3UTFA 2VVLG 4K7ZA 3VR8A 3IF9A 4AP3A 2XLTA 3EF6A 4J56A 5HHFA 1K0JA 3GYIA 2VVMA 1OJ9A 3RNMA 3NHOX 4D03A 4AOSA 1Q1RA 3SFEA 2X8CA 3G5SA 2NPXA 1F8RA 2YM1A 4GRTA 2XLRA 4BJZA 2AR8A 4IA5A 3P4PA 3R9UA 1TDEA 1ZK7A 4HB9A 4A79A 4Z2TA 1E6EA 1H83A 1JRYA 1NHRA 2YAUA 4GR1A 4BV6A 2NVKX 4K5SA 4CRTA 4C74A 3GRSA 3KKJA 2XVEA 2GF3A 3SFDA 4ZCCA 3ALJA 4Y4MA 3RP8A 2BK5A 3NK2X 1DJNA 4BURA 4X9NA 4IVOB 1NDAA 4LA1A 4I58A 4EMIA 1L0VA 3DJDA 1RYIA 1LQTA 1YKJA 2C76A 2XVHA 4Y4LA 4B65A 1GREA 1ZY8A 2XLUA 2OA1A 4EQXA 4YKGA 3C96A 1D4CA 3CPJG 5U63A 3COXA 1GERA 1NHQA 1DXLA 3IHGA 1TYPA 2AQJA 5FS7A 5U25A 1Q9IA 1VG9A 2A89A 4BK2A 2JB1A 3G5RA 1JEHA 3D1CA 3KU9A 2R0PA 4JQ9A 2Z5YA 4TLZA 3CGBA 2YLXA 2FJEA 1PBFA 2WEUA 3GMCA 4EMJA 3I3LA 5BUKA 4A6NA 2EQ8A 4DSGA 2YM2A 5JCMA 1E1KA 2OLNA 5CQFA 1O5WA 1VG0A 1PBBA 2WOVA 3P1WA 3QSEA 1XPQA 2X8HA 4A99A 1Y56B 1N4UA 3P4QA 4HA6A 4Y4NA 1CC6A 4O5QA 3CNJA 2Q6UA 4H4UA 1QJDA 4YXDA 2E1MA 3JSKA 4JY3A 4OPLA 1EL8A 1NG4A 1NAAA 2YWLA 5L46A 3ALMA 4H4VA 3QFBA 2DKIA 4JNQA 4H2QA 2ARDA 3NYCA 2WOWA 2CULA 2YVFA 3VQRA 4CCQA 1KNRA 3GRTA 3AEGA 3B6DA 3ITJA 3AYIA 4AP1A 2UZZA 2GR1A 3GDNA 1IUWA 5KXJA 3ISHA 4PABA 3QJ4A 4J33A 3UTEA 1FECA 1M6IA 2WESA 1GRBA 4GDPA 4OPDA 3UKLA 3F8RA 3CPIG 1PHHA 4KPRA 3RHAA 2WP9A 1IUTA 4B66A 2ZZBA 1OJCA 1TDFA 1TDKA 1GV4A 2QCUA 2WHDA 2XFPA 1JRZA 1E1NA 3AD7B 3IWAA 3NG7X 2FJBA 1N4WA 3VRDB 3CNDA 3GMBA 2V5ZA 3B3RA 2V61A 3UTHA 3AEFA 3AEEA 4TM0A 2BCPA 2BS2A 2GMHA 4ADWA 1E1MA 2QA1A 2YR5A 1D5TA 1EL5A 1K4QA 2PYXA 4NEWA 4OPIA 3S5WA 4WCTA 1MO9A 4PAAA 3CN8A 4EIQA 2GR0A 4U2SA 3M12A 5C3JA 3EPTA 1KDGA 2RGHA 1DOEA 3ATRA 3AEAA 2VVLA 4OPCA 4LIIA 5J7XA 4Z25A 2XFQA 3BNMA 1FEBA 3UOZA 3NYFA 1ZX9A 2C66A 4OCGA 1JNZA 4B64A 3CNTA 3ADAB 2BYBA 2RGOA 2I0ZA 4H4WA 3NH3X 1D7YA 4H4RA 4EM4A 3SQPA 4H2PA 5GRTA 5BRTA 5EOWA 4EQWA 1NG3A 4H4TA 4A65A 4EIPA 1ZKQA 1GT8A 3GDPA 2CDUA 2OAMA 3NK0X 2GQFA 1K0IA 3VRAA 1PBEA 4K8DA 4YSHA 1S2QA 2BACA 4J2WA 4B67A 2YG6A 4H2NA 5LV9A 2ZZCA 1JNRA 1YQ3A 2R9ZA 4U8OA 2WBAA 4MJWA 1VRQB 4X9MA 1K0LA 2B9WA 1L9DA 3II4A 2YVJA 4H2RA 4H4ZA 3GWDA 1B4VA 3AE2A 4UDRA 1B5QA 2WDVA 2X8GA 3FIMB 3F8DA 2GB0A 4H4PA 2XDOA 3UCLA 3FG2P 2EQ7A 1GTHA 1CJ4A 3PO7A 2A8XA 4J57A 1L9CA 2WOIA 2YLTA 3NTDA 4H4XA 4APNA 1ZDLA 3UOXA 1HYUA 2Z5XA 3EAOA 2C75A 4H50A 2J3NA 3DJJA 3BI2A 4AOXA 1E39A 2XYOA 4EQRA 1GOSA 3K7MX 4UDQA 3NN0X 1GESA 1H7WA 2DKHA 4GDEA 4P9SA 3GSIA 3NRNA 2A87A 4U8KA 1S3BA 3AE8A 3FBSA 3BNUA 3GWFA 1B8SA 1L9EA 4YTNA 2IVEA 3IC9A 2W0HA 3H8IA 3CGCA 3NLCA 1FCDA 4WX1A 2EQ9A 4C3YA 4CNJA 3OC4A 1GALA 1H81A 2WPCA 4JDRA 5HY5A 1IUSA 4LU6A 3ALLA 3PS9A 1PJ5A 4AT2A 1E1LA 2FJAA 3AE4A 3VRBA 1QO8A 4NZHA 1D4EA 1QLBA 2BK3A 1GXFA 3UKHA 2GR2A 1DNCA 3PVCA 1ZMCA 2GAGB 1DJQA 2H89A 4X4JA 1GEUA 5BVAA 3H8LA 3DK9A 4XWZA 3M13A 1XHCA 2WU2A 4Z26A 3CGDA 3AB1A 3NN6X 1GNDA 1ELIA 2BCGG 2GRTA 3NTAA 2YLWA 1M64A 1EL9A 1FEAA 3K7QX 5FS9A 2XVJA 1H6VA 2B7RA 2JAEA 4REKA 3CTYA 3AD9B 3ICSA 3SM8A 2Y6RA 3AE3A 3Q6JA 3NNEA 5KWFA 4NEVA 4USQA 1IJHA 1PBCA 4C77A 3NK1X 3CNSA 3OZ2A 4RG4A 1IUVA 2YR4A 4FK1A 2FJDA 1MXTA 3AE9A 1PDHA 2XLSA 4IA6A 3QVRA 3V3NA 1ZMDA 4H4QA 3UKFA 2GMJA 3P4RA 4ZN0A 4XXGA 5GSNA 1O95A 3LZXA 2R0CA 2BC1A 3E1TA 4A7AA 3UP4A 4YSXA 4D04A 5KOWA 3DJEA 4YSYA 5KRQA 2X3NA 1H84A 2YG5A 1X31B 2XFOA 4B69A 1JOAA 2E5VA 1EL7A 4H7UA 1GETA 2WU5A 3WE0A 5HYMA 1ZOVA 3UKAA 1CJCA 4DNAA 1P2HA 1BKWA 3DH9A 1XANA 2R4JA 1KF6A 3D8XA 4KX6A 3UKPA 2HQMA 2WDRA 4Z24A 2YLZA 1NHPA 3P4SA 4U8JA 4CNKA 1Q1WA 2TPRA 2YR6A 3P9UA 3NYEA 4JNAA 2Q7VA 3G5QA 3C4AA 1O94A 3RP7A 4TLXA 2GV8A 2WQYA 2XVFA 1ZP0A 2WDQA 3ICRA 4EM3A 1F8WA 3KA7A 2O9ZA 2Q0LA 5TR3A 2GQWA 3QSSA 1S3EA 2H88A 1PJ7A 1BGNA 1D7LA 4CY6A 1NEKA 2V6OA 1LV0A 3AE7A 4TM4A 3ZDNA 5JCKA 2CFYA 3AYJA 3URHA 1BF3A 1NENA 1Y56A 2WS3A 1F8SA 2QAEA 1OJTA 2VOUA 2C67A 2JK6A 3BHKA 2X50A 3QSMA 5CKUA 2V3AA 1PN0A 1DOCA 1DODA 4ICYA 1VQWA 5FMHA 1F6MA 3KLJA 1PJ6A 1TRBA 2B9XA 4J31A 5J60A 4IV9A 2OLOA 1LJ1A 1LVLA 2IVDA 3Q9TA 3VR9A 2YG7A 2PHHA 2R46A 4A6NB 2R0GA 3LADA 2BC0A 1GRHA 3NGCX 1AOGA 4A9WA 3ICTA 2ZZ0A 3V76A 2C70A 4DSHA 2CVJA 3UKQA 3AEDA 2E4GA 3AE5A 1CJ3A 2XLPA 2YVGA 4OVIA 4U8LA 3SGLA 1IUXA 1YQZA 3UKKA 4EMWA 4FX9A 1VDCA 1ONFA 3BI4A 3CIRA 2EQ6A 2BS4A 1GSNA 3CGEA 3ZYXA 1F3PA 3UOVA 3RP6A 1KNPA 3KPFA 1S2YA 4N9XA 4Z2UA 4J34A 1CJ2A 1E7PA 4Z43A 4Z2RA 4XWRA 3ATQA 3DGHA 4BK1A 4FDCB 5IQ4A 5U1OA 1GRAA 2RABA 5C2TA 1H7XA 1V59A 4U8MA 4DGKA 3REDA 4E0VA 1Z6LA 4RG3A 2FBWA 5EB5A 4C3XA 1DOBA 2BS3A 3F8PA 4U8NA 4YKFA 3HZLA 2Y6QA 4ZCDA 5M10A 2GAHB 3C4NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KSUA 1LTXR 3ZITA 4A5LA 2YV9A 5IMVA 3KD9A 6GSUA 3ABVA 1J0FA 4KW6A 3EMPA 4CCRA 2NPBA 5DDLA 5J5NA 1OJAA 3P90A 1P2EA 5IQ1A 3GA4A 5DBQA 1GRTA 1YEPA 1K3OA 3T37A 3GX8A 4MNNA 2YG4A 2CX3A 3T2ZA 3IHQA 5J9CA 3AXBA 4WXTA 3BI5A 4ZBAA 5FS8A 3UP5A 1H86A 4WF5A 3IK7A 2YPMA 2GZZA 3LXDA 1GRGA 3SBCA 3DJGX 5DJMA 2M72A 5CNWA 2C72A 1OJDA 2OBKA 3IAM2 1FO5A 4O7HA 3L8KA 4GUVA 4HOJA 2P5QA 5IIZA 3V3OA 4YQUA 3UTGA 5IPYA 4HI7A 4DSSA 4TR1A 2H6XA 2LSTA 5JCNA 1NW2A 2GR3A 2GZYA 2F8FA 2V1MA 4IVFA 2BXSA 4O5UA 2C3QA 5EB4A 3CXGA 5IMAA 2VRLA 4B1BA 1M9BA 1QQ2A 2H01A 3O0HA 1GSUA 1BWCA 3TDGA 1B48A 2IFQA 3MNGA 4JY2A 3AECA 2V60A 3WT2A 3IHMA 4USRA 4J36A 1T4ZA 2HFDA 2NBSA 1W4XA 4OO5A 4GF7A 2X99A 2YQUA 3GKKA 1R26A 5GZZB 1AQWA 5EVOA 4UP3A 2MMNA 1OC3A 1EV4A 2BXRA 1SK0A 1U6TA 5ECIB 2YLSA 3C1RA 2VQBA 1XW9A 2LEGA 1SEZA 5ECSA 3AE6A 2H70A 3K30A 1M0UA 2WETA 1JRXA 2IIYA 3A5WA 1JU2A 5ID2B 1FOHA 3EANA 2VIMA 2C0FA 1M9AA 1ZOYA 2A4HA 2ZBWA 1TYTA 3I6DA 4POLA 2HYXA 1YEXA 3BHFA 3GUSA 1GWCA 1EBDA 2WPFA 5FS6A 5AIXA 2C7GA 4PX1A 3EINA 4CY8A 2WP5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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