4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
4H4YA 4P9SA 2C3CA 3ICRA 4H4SA 2BK5A 1PJ6A 2EQ7A 1V59A 2GAHB 1H7WA 1PS9A 2XVEA 4PABA 2VZ2A 4PAAA 1PBCA 3CGCA 1PXAA 2ACZA 4Z44A 4A6NA 4BJZA 2C64A 2ZZBA 3G5RA 2X50A 4UDQA 4EMIA 2TMDA 1VQWA 2X99A 2YVGA 4O5UA 3AE8A 3AE4A 1PHHA 1N4UA 2BK3A 4NZHA 4B68A 1JNRA 4RG4A 3UOZA 3P4QA 4Y4NA 4I58A 5U25A 2YM2A 4LU6A 3NHOX 4J34A 1ELIA 4BURA 3O0HA 1TDEA 4H2NA 2YLSA 2YR4A 2QAEA 4TLZA 3QSSA 4AP1A 2VQ7A 4AOXA 3HZLA 1NHSA 1TDFA 3LJPA 4H4UA 5KVIA 2WEUA 3DGZA 2YLTA 5FS9A 1N4VA 3AE7A 5EBKA 2R4JA 4CCQA 4GRTA 1VRQB 4GDPA 1M6IA 2I0ZA 3G5SA 3UKPA 2E1MA 1TDOA 3ZYXA 2WU5A 3DJJA 1TYPA 2H88A 2Q0LA 3LOVA 2BS3A 4Z25A 1CC6A 2BYBA 1DNCA 1IJHA 3NN0X 2OAMA 1D4DA 2BXSA 2AR8A 3Q6JA 1YY5A 2OLOA 2GMJA 4FX9A 1KFYA 3VRDB 2XVIA 4EIQA 3FIMB 2R0PA 4NTEA 4H4QA 4K7ZA 4J2WA 1PN0A 4YWOA 3DK9A 3CGDA 4OPIA 2IIDA 1Q1WA 2X8CA 3IHGA 1IUUA 3CNDA 5EOWA 4Z2TA 4YXDA 2GV8A 4U8IA 4OPTA 3NKSA 3RP6A 1F3PA 3CNJA 1L9DA 1OJTA 3CN8A 3CNPA 2R4EA 1H7XA 4IVOB 1TDNA 4Y4LA 1ZOYA 4NTDA 4C3XA 3H4KA 3QJ4A 5FMHA 1RP0A 3DJGX 1E1LA 1QO8A 4J56A 2VOUA 2B9WA 2BS4A 4HB9A 4Z24A 4EQSA 4YTMA 5KOXA 2JB2A 1PBBA 3K7TA 3QFAA 3T37A 2X8GA 2GEWA 2OLNA 2WETA 1E1MA 4AT0A 4CCRA 4UP3A 3PVCA 4JY3A 5HXIA 3M13A 3AEDA 1H83A 1XDIA 4KPRA 1JEHA 2WDVA 1KNPA 2XFPA 4K8DA 3GMBA 4USRA 2X8HA 1BF3A 3GD4A 3P4PA 4GCMA 3DMEA 4TLXA 2X3NA 1KF6A 3QSMA 2FJDA 5J7XA 1L9CA 3UTFA 2WU2A 2EQ8A 1QLBA 3AD8B 4UDRA 1GALA 3NG7X 1O5WA 4AP3A 1D5TA 2R45A 1GRHA 3ICSA 4C5OA 1FL2A 2WDRA 1GREA 2WOWA 3SFDA 4H4PA 1SEZA 5M10A 4B63A 5J60A 3LXDA 2R46A 5U63A 3ATQA 1OJDA 4OPUA 2GRTA 1CF3A 1PBFA 5HHFA 1NENA 4U2SA 1B4VA 2WOVA 2BCGG 2IVDA 1E39A 3UOYA 3NIXA 4TM4A 5EB4A 3EF6A 5C2TA 1YQ3A 4TM1A 1ZY8A 2VQBA 3SFEA 3GRTA 4YSYA 2WPCA 3EPTA 4GF7A 4OPGA 2GR0A 2GVCA 4J36A 2FJAA 1NG4A 2A87A 3AE6A 1DJNA 1KDGA 4B64A 2B9YA 4EMWA 2O9ZA 1BZLA 3CGEA 3VR9A 5JCIA 1GERA 2C3DA 3BI4A 1OJCA 3SM8A 1CBOA 3IWAA 3P9UA 2UZZA 4XXGA 1D4CA 1GSNA 3B6DA 3F8DA 1GRFA 2XYOA 3GYIA 4H4ZA 3CNTA 4H4XA 3COXA 3AEAA 4B67A 1NHQA 3DJEA 1OJ9A 1COYA 1H82A 1P2EA 2R0CA 4A65A 5L46A 1LV0A 1CC4A 1H6VA 2BA9A 1K4QA 2GF3A 3AWIA 4JNAA 1NDAA 1TDKA 1F8RA 3QVRA 4LIIA 3IF9A 4EM3A 5KRQA 1PJ7A 5BVAA 1VDCA 2XLTA 2JB1A 2GQFA 4Z2RA 3AE3A 1BGJA 2RGHA 4ADWA 4AOSA 5IQ4A 4WCTA 2CFYA 2Z5YA 3IHMA 1IUXA 2Q6UA 2JB3A 4Z2UA 3RNMA 3K30A 1GRGA 5JCLA 2W0HA 3B3RA 3AB1A 4J31A 2RGOA 4H2RA 3ZDNA 2GR1A 4NTCA 3NRNA 1K0LA 4GUVA 5KXJA 3DGHA 4H2QA 4CNKA 3GYJA 4GDEA 2GQWA 1EL7A 3F8RA 4JNQA 4A99A 2YQUA 1S2YA 3KVEA 4OCGA 1LVLA 4K2XA 1YQ4A 4JY2A 3Q9TA 2YR5A 3C4NA 3CGBA 4K5RA 1L9EA 1PXCA 2GR2A 3C96A 4M52A 4DGKA 1D7YA 2V60A 3UKFA 4FK1C 1F6MA 3PO7A 1CJ2A 4EQWA 1NEKA 4B1BA 4H4RA 4A7AA 2Q7VA 2BC0A 3NGCX 2B7RA 5TR3A 1LPFA 1ZK7A 2YLXA 4FDCB 3UTHA 4K22A 1NHRA 4Z26A 2E4GA 3UP5A 2WHDA 4K5SA 1JRZA 1PXBA 4B69A 5LV9A 1GT8A 3CPIG 1JOAA 4C77A 1CJ4A 2YG7A 1BKWA 1GTEA 5BUKA 3UOVA 3UKAA 1GESA 2NPXA 2XLPA 2C72A 1EL9A 1YQZA 1EBDA 2YVJA 4JDRA 2XLSA 2JKCA 2WESA 1KSUA 3II4A 4B66A 1S3BA 1ZOVA 1VG0A 3KD9A 2YWLA 5FS6A 3NNEA 3UKHA 4WX1A 4AT2A 1Q1RA 2FJEA 4HA6A 2C75A 4OPCA 3V76A 4TM3A 1H84A 2QA1A 3PS9A 2EQ9A 1PJ5A 3LB8A 5GRTA 3I6DA 2Z5XA 1P2HA 3V3NA 3VRAA 3RP7A 1Y0PA 2ARDA 1DOEA 4C74A 4U8JA 4H50A 3ADAB 4EQRA 3AEGA 2WQYA 3D8XA 4J57A 3BNMA 5U1OA 2EQ6A 3ISHA 3K7MX 4BK3A 1S3EA 4A5LA 1N1PA 2QCUA 2A89A 1ONFA 2XVJA 1CC2A 1DOCA 1F8WA 2APGA 3LZWA 1PDHA 2PYXA 2XFQA 3DK8A 5CQFA 4A9WA 4H4WA 1RSGA 2B76A 2J3NA 1AOGA 2YG3A 3V3OA 3NN6X 1CL0A 2CULA 2BCPA 3BNUA 2GB0A 1N4WA 3FBSA 3GD3A 3SGLA 3ALJA 3NYFA 4U8LA 3ALMA 3BHFA 2BACA 1S2QA 4U8PA 2YG5A 4X9NA 4IV9A 3QVPA 2WS3A 3GWFA 3NYEA 3QSEA 1YKJA 3P4SA 4ZCCA 1PBEA 1ZMCA 3K7QX 4EQXA 3AEFA 4DSHA 2YVFA 3OC4A 1RYIA 3GDNA 1GRTA 3AD7B 2FBWA 2AAQA 1ZP0A 1E6EA 2GR3A 1K0JA 1UKVG 1EL5A 2ZZ0A 4OPLA 4YSZA 1JNZA 3ABVA 2YG6A 3D1CA 3UP4A 1GPEA 4U8KA 3KKJA 1VG9A 2V6OA 3KLJA 4Z43A 1JRYA 2QA2A 3AYIA 2A8XA 4MJWA 1NHPA 3RP8A 4NEVA 3P1WA 1DXLA 2F5ZA 2XFUA 1B8SA 1FCDA 4X9MA 5FS8A 1D4EA 2C70A 3REDA 4REKA 3G5QA 3LZXA 4IVMB 3VRBA 1GETA 2VVMA 3E1TA 4A79A 3CTYA 4U2LA 3NH3X 2CVJA 4U2TA 3R9UA 3EANA 2XLUA 3ICTA 3AE5A 4TM0A 3GSIA 3UKLA 3CPJG 5JCMA 4XWZA 2GAGB 3CPHG 3ITJA 2BS2A 2ZZCA 3GDPA 1H81A 4DNAA 1DODA 1Y56B 2B7SA 2HQMA 3AEBA 3C4AA 4H7UA 4N9XA 4YT0A 5IQ1A 2E5VA 2YAUA 3S61A 2WP5A 3SQPA 4APNA 2XLRA 4BK2A 4E0VA 3UTEA 2AQJA 1FEBA 2XCGA 3UCLA 2JAEA 3URHA 3VQRA 2NVKX 2XFOA 1KSSA 4YTNA 4U8OA 3ATRA 3AE1A 1K0IA 1OJAA 1TRBA 4CNJA 2JK6A 4ECHA 3JSKA 1ZX9A 3NK2X 4H4TA 1IUSA 3FG2P 5BULA 1ZKQA 2RGJA 1XPQA 2PHHA 3NK0X 1IUVA 1E7PA 1E1NA 1CHUA 1MXTA 3NYCA 3NTDA 4CY6A 2C65A 2WP6A 1GEUA 1LJ1A 2BK4A 3KPFA 4IA6A 1GOSA 1F8SA 1O94A 1H86A 5DBJA 2YM1A 1E1KA 3AEEA 3CNSA 3GMCA 4UDPA 5M0ZA 4H4VA 5JCNA 4A6NB 1QJDA 3F8PA 3UKKA 4U8NA 5HY5A 2V3AA 1GV4A 3QFBA 1X31B 3BHKA 3P4RA 1DOBA 1L0VA 5JCKA 2YLWA 2CDUA 1DJQA 2BC1A 4B65A 5FS7A 2YLRA 2WDQA 3NT6A 4EIPA 1REOA 5C3JA 3AYLA 3KU9A 2DKIA 4X4JA 3UKQA 4LA1A 5KWFA 2V3BA 2JBVA 4GR1A 4BJYA 3ALLA 1EL8A 4JN9A 1LQTA 1NAAA 3AE2A 1CJCA 4FK1A 1NG3A 3OZ2A 2XFNA 3VR8A 2V61A 3AXBA 4YKGA 1CJ3A 2Y6RA 3AE9A 3GRSA 4Y4MA 2R0GA 4ZN0A 2VRLA 2WPFA 2VVLA 4YKFA 3EAOA 3FMWA 3S5WA 3GWDA 2C73A 1FEAA 2TPRA 3NK1X 3WE0A 1KNRA 2C67A 1MOKA 2DKHA 4JQ9A 1IUWA 3M12A 1ZDLA 3AD9B 3UOXA 4BV6A 5BRTA 3H8LA 4YSHA 2BABA 5KVHA 5ER0A 3L1RA 4YTPA 1IUTA 1ZMDA 4EM4A 3NTAA 3BI2A 1O95A 5KOWA 1BWCA 3DK4A 5GSNA 4D03A 1HYUA 2GMHA 4ZCDA 2XVHA 3DA1A 1XHCA 2C76A 4IA5A 2B9XA 4OPDA 2YLZA 3L8KA 2XDOA 2RABA 3CIRA 4CBQA 4CY8A 1GRAA 2GH5A 3NLCA 2VRMA 5CKUA 2ZBWA 1D7LA 2C66A 2WP9A 2FJBA 1FECA 1M64A 1NPXA 2XVFA 2R9ZA 2VVLG 4BK1A 1Z6LA 2IVEA 4C3YA 1LTXR 1GNDA 4J33A 4XWRA 1Q9IA 4RSLA 2V5ZA 1MO9A 4I59A 2WOIA 4RG3A 1W4XA 2Q0KA 4EMJA 1FOHA 5HYMA 4KX6A 1Y56A 1B37A 3DJDA 3AECA 3IC9A 2YR6A 3BI5A 1GTHA 1LQUA 2OALA 2WBAA 2OA1A 2Y6QA 3AYJA 3FPZA 3DH9A 3M0OA 4H2PA 1JRXA 4ICYA 4DSGA 4USQA 4U8MA 1GXFA 1TYTA 4YSXA 1XANA 4NEWA 3KA7A 3I3LA 4CRTA 2C7GA 1BGNA 1GRBA 3H8IA 2WPEA 4OVIA 5IPYA 2H89A 3LADA 1JU2A 4O5QA 3UTGA 4D04A 5EB5A 1PBDA 2YG4A 1B5QA 3RHAA 2BXRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T31A 2H1BA 2BK5A 1QFNA 2VZ2A 3CGCA 4BJZA 2C4CA 2HSYA 2ZZBA 5DALB 1GH2A 4D73A 2XBIA 2TMDA 3J7Yb 5KMSA 4B68A 3FEUA 1XIYA 5ECPB 3RPNA 5U25A 1F6MC 3NOFA 4LU6A 2H0HA 4BURA 4H2NA 2WDUA 1EOHA 2CAQA 5CRHA 4AOXA 2G0FA 3HZLA 5HR3A 3E0UA 2WEUA 3KEBA 3IRAA 3RAZA 4CCQA 2R4JA 4OFTA 1SYRA 2P5QA 1VRQB 1M6IA 3G5SA 3DJJA 5F8BA 2LUSA 1OKTA 4Z25A 1TJDA 3C73A 2OAMA 1UVZA 3ED3A 5KEJA 4IVFA 5L71A 3KPKA 3GV1A 2R0PA 2IMKA 4K7ZA 4ID0A 4J2WA 3DK9A 2B7KA 2YANA 4PTSA 2B5YA 8GSSA 3CNDA 2IMEA 2HI7A 4Z2TA 4YXDA 2GV8A 3RBTA 1L9DA 1V2AA 3FZ4A 1OJTA 4N11A 1ZYNA 1TDNA 5ECNB 1DE1A 3F4SA 3P8WA 3ZFBA 5IQYA 2YNXA 3DJGX 1E1LA 1QO8A 1PKZA 2O8VB 1M9BA 16GSA 2B9WA 4HB9A 3WGXA 1EEJA 4EQSA 3VPTA 3ZIJA 5LD0A 3WT1A 3QFAA 1RW1A 3GSSA 2OLNA 4AT0A 1ZCPA 5GAPD 3TKSE 4CCRA 3PVCA 3AEDA 1JEHA 1A2JA 4K8DA 1X9WB 3G7JA 3EMPA 1FVJA 3GD4A 4V2LA 4TLXA 2X3NA 3QSMA 13GSA 2FJDA 5J7XA 3UTFA 1O85A 1PN9A 2EQ8A 4AP3A 1GALA 4NPBA 4CDOA 1FL2A 3SFDA 3LXTA 2TRXA 4B63A 2QGVA 2NPBA 4H86A 2DC5A 5J41A 4TR1A 3IC8A 1B4VA 1EV9A 5HFKA 3NIXA 4TM4A 2GDRA 5EB4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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