4EIPA

Native and k252c bound rebc-10x
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
526
structure length
521
Chain Sequence
PIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDGTITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
publication title An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative FAD-monooxygenase
total genus 163
structure length 521
sequence length 526
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 4eipA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4eipA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4eipA01
3AEGA 2WETA 3AE2A 2OAMA 3AYJA 1E6EA 5EB5A 2V5ZA 2BK5A 3D8XA 5CKUA 1BF3A 3CGDA 2JBVA 4J56A 4EIPA 1PBEA 1UKVG 3DK8A 1IJHA 3NN6X 1GRHA 1PBCA 1F8SA 4A79A 4YWOA 1RP0A 2YG3A 2YLRA 2JB1A 2BABA 2V3BA 2WDRA 2ZZ0A 1DJNA 3AEBA 2BK4A 3Q9TA 1N4VA 4X4JA 1GALA 1ZDLA 2Q0LA 2XFQA 3UP5A 4H2PA 5FS8A 3KKJA 4KX6A 3FBSA 4O5QA 4TM0A 2YVFA 3CNSA 3DJGX 4D04A 2Q7VA 3P4QA 1FEAA 3DK9A 1H6VA 1CC2A 2WOVA 4OVIA 4GDEA 3GDNA 4NEWA 3SFEA 5IQ1A 3KVEA 1S3EA 2WESA 1XDIA 2JAEA 4XWZA 5JCLA 5J7XA 4B64A 1CF3A 2H89A 5JCMA 5BULA 5L46A 4X9NA 4O5UA 4A6NA 2OLOA 2PYXA 3BI4A 1W4XA 2XFOA 1ZY8A 3QSMA 1YKJA 2WDVA 1MOKA 4DNAA 1FEBA 2VVLA 1E1NA 4CCQA 1BGNA 1VRQB 4I59A 2OA1A 1QLBA 3LB8A 5KVIA 1H7WA 1JRYA 2BYBA 1GEUA 4FX9A 4H50A 3KD9A 2GAGB 1KSUA 1FCDA 3CPJG 4ZN0A 1Y0PA 4M52A 1CBOA 1CJ2A 1VQWA 4YXDA 4USQA 3UOYA 2WU2A 1PJ6A 1XPQA 3UTFA 1NG4A 3I3LA 1DOBA 2C7GA 3IHMA 4Z25A 2W0HA 5KWFA 2V3AA 3QFAA 2QA2A 4OPCA 5HHFA 5TR3A 5JCIA 4H4QA 3QVPA 4EMJA 3UKKA 1N4UA 1E7PA 4K5SA 4LU6A 1ZX9A 1L9EA 1ZOVA 1CC6A 3CNJA 3FG2P 4C3XA 2O9ZA 5EBKA 4ICYA 1DXLA 1PXBA 2R0GA 3AE8A 2I0ZA 3NTAA 4LIIA 4AP1A 2WU5A 2GQFA 4BV6A 1EL7A 1H82A 5HYMA 1FECA 3AEEA 2XLPA 1TYTA 3IF9A 4OCGA 3GMCA 1VDCA 3G5RA 3G5SA 1PS9A 2AAQA 4U8NA 1ZP0A 1ZKQA 3AEDA 3NT6A 3QSEA 5HY5A 2CFYA 3V3NA 2GQWA 1X31B 1Z6LA 4JDRA 2YR6A 1V59A 1NHRA 2C3CA 4UP3A 3CNTA 1F3PA 2GF3A 2C73A 2PHHA 2JB2A 1H83A 4Z2TA 4EQSA 2A89A 1GETA 4JY3A 2RGOA 3UOXA 2TMDA 3B3RA 4ECHA 4EM3A 5KOWA 2F5ZA 2OLNA 1F8RA 2X8GA 1GNDA 2WOIA 2GRTA 1PXAA 3AYLA 1MO9A 3FMWA 3P4SA 4NTCA 1K0IA 4UDPA 1O94A 3NYCA 5KXJA 1PBBA 4BURA 1N4WA 1L0VA 2GAHB 4TLZA 4Z2UA 1SEZA 3AEAA 3AE5A 3UTGA 2Q0KA 3ATRA 4ADWA 3V3OA 2R46A 2YQUA 4AT0A 1P2HA 3UKAA 1ZMDA 2WP5A 2YM1A 4XXGA 2R0CA 3JSKA 4OPTA 2GV8A 5U25A 1PJ7A 4TM4A 5EOWA 1TDKA 2RGJA 2Y6QA 3AXBA 1EL9A 1GESA 3GD3A 3LJPA 1PBFA 3P4PA 4IA6A 4U2SA 1GOSA 2YAUA 3GYIA 5FS6A 2CULA 4A6NB 3EANA 4CBQA 3GYJA 3VRAA 3DJJA 3GSIA 3QSSA 1M64A 1RYIA 4U8OA 2WPCA 1K0LA 2YR5A 4FK1A 3ISHA 2GR2A 1NHQA 2AR8A 2BC1A 2EQ6A 3RP7A 2BC0A 3AE3A 4RSLA 1EL8A 3URHA 1GRAA 4K7ZA 2XVEA 4YSYA 3PS9A 4DGKA 1TDNA 1IUXA 2ACZA 2VRMA 3V76A 3VRDB 5IPYA 4YKFA 3SM8A 4TLXA 1YQZA 2ARDA 4OPGA 3AD7B 3LZWA 4H4SA 3EAOA 4ZCCA 4BK1A 2NPXA 1NENA 3UTEA 3L8KA 3S5WA 2WP6A 1JOAA 5KVHA 2ZZCA 2C70A 2JKCA 3DGHA 1GRGA 2UZZA 3QFBA 3SQPA 2WOWA 1GRBA 1GTHA 4H4PA 3KPFA 2OALA 4GCMA 4IV9A 5IQ4A 2R45A 2VRLA 2VZ2A 1F8WA 1COYA 3L1RA 4PAAA 3M13A 3HZLA 4P9SA 3NK1X 1CJ4A 3SGLA 2FJBA 2BACA 1NDAA 4JY2A 3AE1A 5ER0A 4K2XA 3NYFA 4U8PA 2CDUA 1XANA 3FIMB 1BZLA 2WP9A 1LV0A 3BHFA 2GR1A 3UCLA 1NEKA 3LZXA 4H4WA 1B5QA 4REKA 1JNZA 2E1MA 2V61A 5FS7A 4GUVA 4U8MA 1KDGA 1D7LA 2BS4A 3CGCA 4J31A 5C3JA 2XVHA 3VR9A 1TDFA 3AE4A 1GTEA 4Y4LA 5KRQA 5BVAA 4Z26A 4U2TA 3CGBA 3VR8A 3DGZA 1EL5A 4J34A 2C65A 2XLUA 4C77A 4CNJA 1PBDA 4BJZA 2IIDA 1ONFA 4I58A 2C75A 3K30A 3LADA 2WBAA 2WPEA 3ALJA 3IHGA 3T37A 4U2LA 3UTHA 2R4JA 2YLSA 3G5QA 3EF6A 2B76A 1CHUA 1O5WA 4C3YA 1LQUA 3F8PA 3AE7A 3UOZA 4AOXA 1TDOA 4Z2RA 2FJEA 4OPUA 3RP6A 4K22A 2J3NA 2XFUA 1ZMCA 4K5RA 5GRTA 4B1BA 3H8IA 4AOSA 2A8XA 4A5LA 5BRTA 1D4CA 1KNRA 3EPTA 1E39A 1Q9IA 4FDCB 4PABA 4JNAA 2XVFA 2Z5YA 3IWAA 2YWLA 2B9YA 4C5OA 3ADAB 2XFNA 1LQTA 2GB0A 2APGA 4YKGA 1YY5A 2YR4A 3M12A 1VG9A 5FMHA 1L9CA 1PHHA 4OPDA 2Z5XA 4U8KA 4JQ9A 1LTXR 1LVLA 4H4UA 3NNEA 2RGHA 5HXIA 4ZCDA 2JB3A 2WEUA 1H81A 3DA1A 1M6IA 4EQRA 4GDPA 3UP4A 1EBDA 2XCGA 3F8RA 3AYIA 3GMBA 2FJDA 1OJTA 3NK2X 2YVGA 3ATQA 4OPLA 3BNMA 4YTMA 4Z43A 5CQFA 4YSZA 1JNRA 1IUTA 3GRTA 1S2YA 4EMIA 2JK6A 1ZOYA 3UOVA 3NKSA 2WQYA 3ICRA 4YT0A 2Q6UA 1E1KA 1GRTA 2RABA 4JN9A 3F8DA 2BS2A 4OPIA 4BK2A 3CPHG 1ELIA 2VOUA 4GF7A 2YG6A 1E1MA 3QVRA 4J33A 3NIXA 4YSXA 1QJDA 3AE6A 4A99A 4CCRA 4GRTA 3NYEA 1DODA 2WS3A 1OJDA 1NHSA 4USRA 1ZK7A 4TM1A 2YG5A 3NLCA 2XVIA 4YSHA 2WHDA 1XHCA 4JNQA 3R9UA 3DH9A 4BJYA 2CVJA 1IUVA 1IUWA 2XFPA 2DKHA 2X3NA 1YQ4A 4B63A 2R4EA 3C4NA 2C67A 4J57A 4EIQA 2C76A 4C74A 1P2EA 1QO8A 1MXTA 1F6MA 1TDEA 1Y56A 2BXRA 3GRSA 1OJ9A 3DJEA 4U8LA 3P1WA 3Q6JA 3ZYXA 2ZZBA 2C64A 4Y4MA 1H7XA 2FBWA 1GT8A 3AD8B 1NG3A 3PVCA 4HA6A 2B7SA 2XLRA 2YLXA 4AT2A 1PXCA 2XDOA 1S2QA 2V60A 3NGCX 4FK1C 3CNPA 5GSNA 2BCGG 2NVKX 4CY8A 3C96A 4UDRA 2IVDA 2BK3A 3NH3X 2WPFA 2X50A 4NZHA 1S3BA 2BXSA 4RG4A 2BCPA 1CJ3A 2A87A 2GMJA 2VVMA 1TRBA 3DMEA 2E5VA 4IVOB 1CJCA 3IC9A 1CL0A 1PJ5A 1HYUA 1JEHA 3RNMA 4RG3A 3UKQA 2YM2A 3UKFA 1FOHA 2VQBA 5DBJA 3AB1A 5KOXA 1IUUA 3RHAA 2EQ9A 2R9ZA 1B4VA 1JRZA 3C4AA 4DSGA 4B66A 4EM4A 1H86A 1GPEA 3BHKA 3CIRA 1CC4A 1PDHA 2IVEA 4B65A 1GV4A 2VQ7A 3CGEA 4H4TA 1BWCA 4H4XA 1GREA 2GH5A 2YLWA 2ZBWA 5JCKA 3RP8A 1K4QA 3DK4A 4A7AA 1RSGA 1PN0A 3H4KA 3NRNA 3O0HA 4U8JA 5U63A 4KPRA 2YLTA 2B9WA 1Q1WA 4H7UA 4A9WA 1DJQA 2BA9A 3WE0A 2QA1A 5C2TA 3CPIG 2WDQA 4B68A 1JRXA 5JCNA 3GWDA 3AEFA 3AWIA 2V6OA 1GERA 4NTDA 2B7RA 3B6DA 1KNPA 3H8LA 1IUSA 1TYPA 3ICTA 4GR1A 2C72A 5LV9A 1LPFA 3BI5A 4H2QA 3P4RA 2BS3A 2YG7A 2GMHA 4NTEA 5EB4A 4K8DA 1KF6A 4J2WA 1K0JA 3OC4A 1H84A 4HB9A 4NEVA 4Z44A 4TM3A 2XLSA 3DJDA 2QAEA 4DSHA 4H4RA 3QJ4A 3GD4A 3ABVA 4CNKA 2FJAA 5M10A 5J60A 3COXA 1VG0A 2XYOA 1BKWA 3CNDA 1KSSA 4N9XA 1O95A 3KU9A 3NTDA 4X9MA 3ICSA 3AECA 4CY6A 2GR3A 5M0ZA 2X8HA 1Y56B 3ALLA 1OJAA 1FL2A 4H2RA 4H4YA 4H4VA 4APNA 3KA7A 3AD9B 3PO7A 2XVJA 3VQRA 2B9XA 3VRBA 3S61A 3P9UA 3M0OA 2E4GA 3REDA 2XLTA 4IA5A 2H88A 3E1TA 1D4DA 3GDPA 3LXDA 3NG7X 1DNCA 4U8IA 5FS9A 3BNUA 3K7MX 4B69A 2VVLG 3I6DA 3UKPA 3NN0X 4H4ZA 1DOCA 5BUKA 1AOGA 1LJ1A 3II4A 4WCTA 2AQJA 4WX1A 1JU2A 2C3DA 2EQ7A 1GXFA 1NHPA 1NPXA 1B37A 4EMWA 5U1OA 4EQWA 1KFYA 1N1PA 3ALMA 1YQ3A 2GR0A 2GEWA 1B8SA 1D4EA 4AP3A 3UKHA 3FPZA 2TPRA 2YVJA 2EQ8A 1REOA 1Q1RA 2X99A 2R0PA 4MJWA 1NAAA 3NK0X 2DKIA 1DOEA 1GRFA 4Y4NA 4BK3A 4YTPA 2YG4A 3CTYA 1GSNA 4B67A 2GVCA 2QCUA 3K7QX 3KLJA 3D1CA 1OJCA 2YLZA 2C66A 3AE9A 3SFDA 1D5TA 3ITJA 4IVMB 4UDQA 1L9DA 2HQMA 4Z24A 4H2NA 4A65A 3K7TA 1D7YA 4LA1A 3UKLA 1BGJA 3NHOX 1E1LA 3GWFA 4D03A 3ZDNA 3OZ2A 4XWRA 4YTNA 3LOVA 4EQXA 4CRTA 4J36A 4E0VA 3BI2A 3CN8A 2X8CA 2Y6RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WETA 2HRNA 2E49A 2IPAA 1PQNA 5EB5A 1PMTA 4BVXA 4XHMA 1IJHA 1GRHA 1THOA 4YWOA 1AIUA 2WDRA 3KPKA 4WBJA 1VF4A 2XFQA 3UP5A 4H2PA 5FS8A 2WFCA 3FEUA 3VI7A 1PD21 4D04A 3P4QA 1FEAA 1G0TA 5CO3A 4KAEA 4GDEA 4NEWA 3ED3A 4IKHA 2WESA 1XDIA 3F4SA 5JCLA 3BCIA 5J7XA 9GSSA 2KLXA 5JCMA 5L46A 4IHUA 5ECPB 4L5OA 3W4JA 2LQOA 5EY6A 4II2A 2FHEA 3QSMA 1ZY8A 1YKJA 3WGTA 1MDKA 3S9FA 1MOKA 4G6HA 2DU8A 2YV7A 2VVLA 3EMXA 4WETA 5KVIA 3LB8A 1QLBA 3KEBA 4H50A 1YF1A 4YJHB 1GTBA 1A2MA 4L8EA 1KSUA 4ZN0A 2FD3A 2HI7A 4M52A 5ECOB 1VQWA 4USQA 2VCQA 1V9WA 1PJ6A 4XS4A 5FHIA 1DOBA 3D6IA 2VLTA 1BYEA 5TR3A 3RHCA 4K5SA 1L9EA 3G9BA 3CNJA 1XBSA 10GSA 3L9VA 1KIFA 1PXBA 2I4AA 3A2WA 2I0ZA 1T4ZA 1EL7A 2F51A 2NBSA 4IJ3A 1ZOFA 2XLPA 1TYTA 3FR9A 3QFAC 4TW5A 1VDCA 3H1NA 3G5RA 2AAQA 1ZP0A 1ZKQA 3AEDA 2H19A 3M3MA 2H1DA 2OADA 2CFYA 2GQWA 1X31B 2YR6A 5LD0A 3CNTA 1S3AA 1YZXA 2PHHA 4AJ6A 1C0PA 1H83A 1O81A 3CSIA 2B5EA 4O32A 4ECHA 2LQQA 2OLNA 2BRAA 3GH6A 2X8GA 1GNDA 4HJ2A 4IELA 5CREA 3HVXA 3FMWA 3AYLA 1K0IA 2A2RA 3NYCA 3APOA 1U88A 2L6DA 3UTGA 2Q0KA 4GAVA 2H71A 2R46A 2YQUA 1ZMDA 2XBQA 2R0CA 4HQZA 5AISA 3TJBA 3JSKA 5EOWA 1V58A 5G30A 3P4PA 2HZEA 22GSA 2YAUA 5J3RA 2CULA 2MMAA 4CBQA 1VF3A 1Y6EA 3QCPA 1T8EB 1X9WB 1FHEA 4OMVA 4TR0A 1SKWB 1M64A 4G2EA 1K3OA 2WPCA 3HVVA 2YR5A 3HHVA 3FRCA 2VL2A 1NHQA 3BD2A 2BC1A 1WJKA 3RP7A 3AE3A 1EEJA 3LXZA 4RSLA 1GRAA 5JWRB 1W89A 18GSA 1OC9A 5CAXA 1IUXA 2ACZA 3SX6A 3VRDB 5IPYA 3SM8A 2BJXA 4K8MA 2ARDA 5C00A 5F0GA 1O6JA 1NENA 3UTEA 4WBRD 2E7PA 6GSVA 2HRAA 3FZ5A 2JKCA 1GRGA 2UZZA 1GRBA 1FO5A 4H4PA 2R45A 3IK7A 3JCML 3GYXA 5CRGA 2P5QA 4P9SA 1GULA 1GWCA 3AE1A 4K2XA 4MZWA 4PUAA 2LRCA 3T2YA 4U8PA 1XANA 5B8AA 2WP9A 1LV0A 3BHFA 3QFBC 2GR1A 1AUCA 1A8YA 3DVWA 1K0OA 3I6AA 3C1RA 4PQIA 4H4WA 2E1MA 2P5RA 1YEXA 3GHAA 4TR3A 3VR9A 1TDFA 3AE4A 1GTEA 4I2TA 3MIXA 3EINA 3FY7A 4Z26A 2HYXA 1EL5A 4J34A 1T7PB 3ZRDA 1PBDA 2H1GA 2A4VA 1EVIA 1ONFA 4I58A 4U2LA 3UTHA 2R4JA 2B76A 1ZL9A 4FO5A 4AOXA 1PGTA 1KBNA 2OA7A 3RP6A 2J3NA 2DJKA 4K5RA 4B1BA 2C0DA 2E0QA 4K1FA 2A8XA 4A5LA 4K0NA 1KNRA 4FDCB 4PABA 1Q9IA 2XVFA 3IWAA 2P0GA 4ZB6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1GSN A;  4B67 A;  2GVC A;  2QCU A;  3K7Q X;  3KLJ A;  3D1C A;  1OJC A;  2YLZ A;  2C66 A;  3AE9 A;  3SFD A;  1D5T A;  3ITJ A;  4IVM B;  4UDQ A;  1L9D A;  2HQM A;  4Z24 A;  4H2N A;  4A65 A;  3K7T A;  1D7Y A;  4LA1 A;  3UKL A;  1BGJ A;  3NHO X;  1E1L A;  3GWF A;  4D03 A;  3ZDN A;  3OZ2 A;  4XWR A;  4YTN A;  3LOV A;  4EQX A;  4CRT A;  4J36 A;  4E0V A;  3BI2 A;  3CN8 A;  2X8C A;  2Y6R A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WET A;  2HRN A;  2E49 A;  2IPA A;  1PQN A;  5EB5 A;  1PMT A;  4BVX A;  4XHM A;  1IJH A;  1GRH A;  1THO A;  4YWO A;  1AIU A;  2WDR A;  3KPK A;  4WBJ A;  1VF4 A;  2XFQ A;  3UP5 A;  4H2P A;  5FS8 A;  2WFC A;  3FEU A;  3VI7 A;  1PD2 1;  4D04 A;  3P4Q A;  1FEA A;  1G0T A;  5CO3 A;  4KAE A;  4GDE A;  4NEW A;  3ED3 A;  4IKH A;  2WES A;  1XDI A;  3F4S A;  5JCL A;  3BCI A;  5J7X A;  9GSS A;  2KLX A;  5JCM A;  5L46 A;  4IHU A;  5ECP B;  4L5O A;  3W4J A;  2LQO A;  5EY6 A;  4II2 A;  2FHE A;  3QSM A;  1ZY8 A;  1YKJ A;  3WGT A;  1MDK A;  3S9F A;  1MOK A;  4G6H A;  2DU8 A;  2YV7 A;  2VVL A;  3EMX A;  4WET A;  5KVI A;  3LB8 A;  1QLB A;  3KEB A;  4H50 A;  1YF1 A;  4YJH B;  1GTB A;  1A2M A;  4L8E A;  1KSU A;  4ZN0 A;  2FD3 A;  2HI7 A;  4M52 A;  5ECO B;  1VQW A;  4USQ A;  2VCQ A;  1V9W A;  1PJ6 A;  4XS4 A;  5FHI A;  1DOB A;  3D6I A;  2VLT A;  1BYE A;  5TR3 A;  3RHC A;  4K5S A;  1L9E A;  3G9B A;  3CNJ A;  1XBS A;  10GS A;  3L9V A;  1KIF A;  1PXB A;  2I4A A;  3A2W A;  2I0Z A;  1T4Z A;  1EL7 A;  2F51 A;  2NBS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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