4EIPA

Native and k252c bound rebc-10x
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
526
structure length
521
Chain Sequence
PIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDGTITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords Putative FAD-monooxygenase
total genus 163
structure length 521
sequence length 526
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 4eipA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4eipA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4eipA01
2WDVA 1TDFA 1Y56A 4YSXA 3L1RA 3NYCA 4OPUA 3GDPA 4YTNA 4BURA 3T37A 3K7TA 1NDAA 4OPTA 1YQ3A 1YQZA 1QO8A 3VRDB 4IVOB 1PS9A 4EQWA 1GREA 2XLPA 3QSMA 3I3LA 2FJAA 4H4UA 2BK5A 1NEKA 1PDHA 1F8WA 1GRHA 4H4WA 4HA6A 3CIRA 1XHCA 2B76A 2WOVA 3DGZA 2C70A 1NHPA 3NLCA 4TM1A 1EL9A 3AYIA 4U8IA 4YTPA 1D4DA 1FEAA 5JCIA 5LV9A 4BJYA 2YAUA 3DJDA 1M6IA 4C77A 3GRSA 2FJBA 3NTDA 2AQJA 3AEGA 2WP5A 4CY6A 2B7SA 4U8MA 1NHQA 1GTEA 3KKJA 4A79A 2JK6A 4H4RA 4NTDA 3LJPA 4WX1A 2C64A 1PBCA 4USQA 3ICSA 1D7LA 2FJDA 3KU9A 4H4XA 1NG4A 1KFYA 1EL7A 2X8CA 2QA1A 5BULA 2GV8A 3R9UA 1PBBA 4C5OA 1ZOYA 2WESA 1TRBA 4Z2RA 2GRTA 4H4YA 4WCTA 2YG4A 3UTHA 2X8GA 1TDOA 4B66A 3NHOX 2QA2A 4A6NA 4YXDA 3GSIA 3AE6A 2R46A 4AOXA 3K7QX 4IV9A 1COYA 1E6EA 1PBFA 1QJDA 2GVCA 1REOA 2Q0KA 2YVGA 3IWAA 3V3OA 3FPZA 2Q6UA 4BK1A 1UKVG 1ELIA 1CL0A 2XLTA 3KVEA 2BYBA 4NZHA 4P9SA 4U8LA 2C65A 3SFDA 3ZYXA 1PHHA 1JNZA 4YT0A 4TM3A 5U25A 2DKHA 4H2PA 2C3CA 3UKLA 2O9ZA 2VQBA 5FS9A 4H4SA 2I0ZA 1V59A 4YSZA 3AEAA 1DODA 3AE1A 4FX9A 1CBOA 1NHRA 1BF3A 4GF7A 3FBSA 4DSHA 4H2QA 4BK2A 3K7MX 5L46A 1LQTA 4OPDA 5BRTA 1CJ2A 1Z6LA 2GEWA 4RG4A 2VRLA 1Q1RA 2E5VA 4NEWA 4TLZA 3NG7X 5HY5A 1OJ9A 4NEVA 5EOWA 2R4JA 1YQ4A 3KLJA 4DSGA 3GMBA 2JB2A 2GF3A 3DK4A 3GWFA 1KSSA 3OZ2A 3RHAA 3UTGA 1YKJA 1GRTA 1H83A 1N4UA 1TDNA 2C7GA 1H84A 1ZK7A 4ZCCA 4I59A 4Y4LA 4U8OA 1LJ1A 3LXDA 4Z25A 2V6OA 3BI5A 4IA6A 2GQWA 5GSNA 2XVJA 5FMHA 2CDUA 4I58A 5IQ1A 1B37A 4DNAA 4K5RA 4CY8A 1FECA 3DJGX 1PBEA 1GETA 3GWDA 4XWRA 2VVLA 5KRQA 2QCUA 4Z44A 4BJZA 3NK2X 1CF3A 1LVLA 3VRAA 1GALA 4JNAA 3P4QA 1IUUA 1O95A 2A87A 3P4RA 4NTEA 3IF9A 1ZOVA 2YLTA 4CNJA 1CJCA 2BS3A 4UDQA 3ZDNA 3CPHG 2A8XA 2XFUA 4ZCDA 3V76A 2WPFA 4CBQA 5TR3A 2IIDA 2IVEA 3LOVA 1OJAA 2WOIA 3KA7A 3NYEA 1B8SA 2OLNA 2AAQA 3BNUA 3G5RA 3GYIA 3AE5A 2B9XA 3CGCA 4HB9A 3ADAB 4YKFA 3SGLA 4CNKA 3GD4A 1LPFA 4JN9A 2EQ6A 5JCKA 1JOAA 4D04A 1M64A 1GESA 1JRZA 1YY5A 2EQ8A 2C67A 2YLZA 4O5UA 4Y4NA 5GRTA 3I6DA 2RGHA 1JRYA 2EQ7A 2ZBWA 3AE4A 3CNDA 3CGBA 2XLUA 2YM1A 2V61A 4RG3A 2NPXA 3AE3A 1Q9IA 4JY2A 1TDEA 4M52A 3K30A 4U8PA 4PAAA 2WDRA 4EMWA 1GTHA 1PN0A 1RSGA 1Y56B 3QJ4A 2XVFA 3CGDA 2CFYA 3JSKA 3WE0A 2YG3A 3M13A 5IPYA 3D1CA 4YWOA 2X3NA 3CPIG 3QVPA 3B3RA 2XYOA 1ZKQA 3NKSA 4ZN0A 4A99A 3UOXA 1NENA 3GYJA 4N9XA 2RABA 3NK0X 2BK3A 1H86A 4JNQA 2J3NA 4J31A 3UKHA 3GDNA 2WP6A 4XWZA 2WQYA 1F8SA 1K0JA 1TYTA 1JNRA 4EQRA 3DGHA 5J60A 2JBVA 3SM8A 2GQFA 2OLOA 3P4SA 4Z24A 1GRAA 1H81A 3NH3X 2GH5A 3IC9A 3E1TA 3P4PA 1OJTA 5C3JA 3NN6X 3NN0X 2R0PA 1K0IA 1ZY8A 2X50A 2BACA 4Z26A 1E7PA 1L0VA 3Q6JA 4K7ZA 2WDQA 4EMJA 1L9CA 3AE2A 4B67A 3NT6A 2BC1A 3BI4A 3ITJA 3NIXA 3RP7A 4APNA 1GNDA 1GPEA 4K5SA 4AT0A 1Y0PA 3AYJA 1GERA 4OCGA 4X9NA 2WOWA 3CNPA 1L9EA 3CN8A 3LZWA 2EQ9A 3DA1A 3COXA 1E1NA 1EBDA 2QAEA 4A6NB 3NK1X 3EPTA 4B64A 1JRXA 2AR8A 4K8DA 2GR3A 4H4PA 1N1PA 4GUVA 1CJ3A 2A89A 2JB3A 2DKIA 1IJHA 2Q0LA 3F8DA 2VZ2A 1E1LA 1S3EA 3NYFA 4Z2TA 5KXJA 2ZZ0A 4Y4MA 4C3XA 3BHFA 1CC2A 1GRBA 3UP4A 3AXBA 3HZLA 1PJ7A 1D4EA 1RYIA 1IUSA 2YVJA 1QLBA 5EB4A 5KVIA 4YSHA 2HQMA 3AECA 1OJDA 2XCGA 2C3DA 3QSEA 3ATQA 4U2LA 1GEUA 3ALLA 1GXFA 3DJJA 3S61A 3FG2P 3UTEA 1CC4A 3DK9A 3L8KA 3H4KA 2WP9A 3AE9A 3UCLA 2XVHA 2B9YA 1E1MA 5FS6A 4JQ9A 3NRNA 2Y6RA 3PO7A 1PJ5A 3AD9B 4PABA 4D03A 4X4JA 3LZXA 2Z5XA 3ALJA 3QFAA 2BXRA 2F5ZA 1DOCA 3RNMA 1HYUA 1GT8A 5M10A 3AEBA 3C4NA 2BS2A 4CRTA 3G5QA 4USRA 2RGOA 1LQUA 2Q7VA 2XFNA 3CPJG 2PHHA 2Y6QA 1PJ6A 4K22A 1XDIA 2PYXA 4B65A 1DNCA 1H6VA 5EB5A 2YM2A 5FS7A 1KF6A 4EM3A 5CQFA 2H89A 2WHDA 4TM4A 3AD8B 4A7AA 2YLSA 1XANA 4DGKA 2YG6A 2GMHA 3II4A 2BCGG 4MJWA 3VR9A 1IUWA 4EMIA 1AOGA 1GOSA 3ICRA 4H50A 3LADA 1BWCA 4OPIA 2JB1A 1EL8A 4YKGA 4H4TA 4TM0A 3AWIA 4B1BA 3DJEA 3VR8A 2FJEA 2GR1A 4OPCA 4A5LA 4U8JA 3VQRA 3SFEA 2R9ZA 4JY3A 2WU5A 3H8IA 3P1WA 5ER0A 2VQ7A 1P2EA 3BNMA 4KPRA 4OPGA 3AB1A 2W0HA 2YQUA 4GR1A 3UOYA 1LV0A 2H88A 2BK4A 2R45A 4H7UA 4A9WA 4C74A 1K4QA 3B6DA 2VOUA 1BZLA 1D4CA 1SEZA 2ZZCA 3DMEA 3ALMA 1EL5A 1KSUA 3FIMB 2R0GA 1BKWA 2YR4A 4EIQA 2WBAA 3M12A 1L9DA 3D8XA 3H8LA 2WU2A 3KD9A 3PVCA 1GSNA 1FCDA 1CHUA 1VQWA 3GMCA 1DJQA 1O5WA 5JCMA 5EBKA 3UTFA 4OPLA 2B9WA 5U63A 3ISHA 2X99A 4BK3A 5CKUA 1O94A 3ATRA 2TPRA 2XLSA 3AE8A 4GRTA 4ECHA 5C2TA 4UP3A 2BS4A 1JEHA 1PXCA 5KWFA 3BI2A 4LIIA 2CVJA 3NTAA 3UKKA 2XVEA 4BV6A 3Q9TA 1X31B 3IHMA 4CCRA 4J56A 4C3YA 4EM4A 1TDKA 1S2QA 2OA1A 2VRMA 2C73A 4H2RA 4LA1A 5IQ4A 1ZX9A 2APGA 2NVKX 4H4QA 4AP3A 3UKPA 3F8RA 1E39A 1ZMDA 2JKCA 3KPFA 3NNEA 1FOHA 1GRFA 3ICTA 2FBWA 1S2YA 2XFPA 1IUVA 2GR2A 4B69A 5KOWA 1D7YA 4B68A 4YSYA 4AP1A 4Z43A 1CC6A 4JDRA 1D5TA 1DOEA 3O0HA 1Q1WA 3URHA 1H7WA 4UDRA 4A65A 2WS3A 4FK1A 2CULA 1P2HA 2GB0A 1ZDLA 3AEFA 5JCNA 1F6MA 1GV4A 3AEEA 3IHGA 4IA5A 4K2XA 1MXTA 2YLRA 1H82A 1N4VA 3C96A 4J57A 1NAAA 3G5SA 2BC0A 3ABVA 1N4WA 4UDPA 5HHFA 5M0ZA 3UKFA 2E1MA 4O5QA 1DOBA 4NTCA 1MO9A 3UOZA 1CJ4A 2OAMA 4FK1C 3VRBA 2YVFA 3AE7A 2C75A 3FMWA 3PS9A 4ICYA 2YWLA 2BCPA 1KNRA 2ZZBA 1VG9A 3UKAA 2V3AA 4LU6A 2BABA 4GCMA 4B63A 3AYLA 4XXGA 3CGEA 1H7XA 3QVRA 3RP6A 1E1KA 2YLWA 2V3BA 1JU2A 3UP5A 2GR0A 3EANA 1S3BA 1ZMCA 5FS8A 1F8RA 1BGNA 5J7XA 4TLXA 4AT2A 4U2TA 5JCLA 4CCQA 4EIPA 2RGJA 2WEUA 3LB8A 4U2SA 1NG3A 2YLXA 3SQPA 1TYPA 4H2NA 2YR6A 2JAEA 4J33A 1DXLA 3M0OA 2GAGB 1KNPA 3AEDA 3P9UA 1IUTA 2GAHB 4H4ZA 1FEBA 4IVMB 1FL2A 3V3NA 4Z2UA 1W4XA 4GDEA 3RP8A 5KVHA 1PXBA 1K0LA 2BA9A 1PXAA 2R4EA 3QSSA 4REKA 5HYMA 5KOXA 2R0CA 4X9MA 1VRQB 2YG7A 2X8HA 1KDGA 2XLRA 4FDCB 1F3PA 2OALA 3F8PA 4OVIA 2VVLG 1IUXA 1BGJA 3BHKA 1OJCA 2GMJA 2C66A 1MOKA 5DBJA 2YR5A 2ARDA 2C76A 4U8KA 3UKQA 4AOSA 2B7RA 4J2WA 5BVAA 1GRGA 2TMDA 1B4VA 1NHSA 1LTXR 4RSLA 2UZZA 4E0VA 2IVDA 4EQSA 5BUKA 3C4AA 3CNJA 3NGCX 1B5QA 4ADWA 3GD3A 2VVMA 4YTMA 3OC4A 3QFBA 4J34A 2C72A 3REDA 3CNTA 3DK8A 4H4VA 1ONFA 2BXSA 4GDPA 1VDCA 1DJNA 4KX6A 1ZP0A 4J36A 5HXIA 2Z5YA 5U1OA 1PBDA 2XFOA 3CNSA 2XDOA 3EF6A 2V60A 3DH9A 4EQXA 2XFQA 2XVIA 3GRTA 2WPEA 1VG0A 2WETA 2WPCA 3AD7B 1NPXA 3UOVA 2E4GA 2ACZA 3CTYA 2V5ZA 2YG5A 1XPQA 4U8NA 3EAOA 1RP0A 3S5WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IELA 4F9ZA 3J7Yb 4YTNA 4BWSA 3LXZA 3K7TA 4OPTA 2NPBA 4MPGA 1QO8A 4ILFA 1QQ2A 3VI7A 3VRDB 3HDCA 3TKQA 4ZIJA 2XLPA 1YJ6A 2FWHA 4GAVA 4GXZA 1PDHA 3UEMA 4HA6A 3CIRA 5JWOB 2WOVA 3DGZA 1ML6A 3IC8A 4TM1A 3L78A 2LJRA 3C73A 4K9ZA 4YQUA 1FEAA 5JCIA 4QFDA 2YAUA 2GZPA 2FJBA 2XPDA 4ML6A 2GSTA 1K0MA 4HJMA 1PD21 4V1Ap 4J56E 5IOWA 2B7SA 1B4QA 1GTEA 4A79A 4X43A 2JK6A 4NTDA 3ICSA 3PINA 4N30A 1EL7A 5BULA 2VL2C 3GIXA 2GV8A 2O89A 5C00A 1PBBA 1ZOYA 4Z2RA 2M72A 5D73A 2YG4A 2O87A 5CO3A 3QAWA 3NHOX 2QA2A 3L9UA 5KN1A 4A6NA 5BMUA 2F3MA 4IS0A 2HLSA 2C0FA 4JU5A 1TTZA 3K7QX 10GSA 4NHWA 17GSA 2RM6A 4J57E 2DJKA 3GH9A 1COYA 2F8AA 3V3OA 2Q6UA 1JLVA 4L8EA 1T00A 1ELIA 2XLTA 3GTUA 4EVMA 4NZHA 5LCZA 4BPYA 1EEMA 1PHHA 2HFDA 2OJLA 1Z3EA 2C3CA 2IFQB 1TXXA 1KTEA 3G7IA 1SYRA 1S3AA 2FY6A 4P3YB 1MEKA 2N5BA 4MA9A 5IMAA 1CBOA 5J41A 1NHRA 3L9SA 4K1FA 4KCAA 4TOPA 1CJ2A 1Z6LA 2GEWA 3KCMA 1Q1RA 2H1AA 2HRAA 5HY5A 2TRXA 4E8EA 3TKSE 2R4JA 1YQ4A 3KLJA 5EOWA 3VWUA 1SJ6A 3GMBA 3F4SA 2HZEA 2H6YA 4Q5RA 4IW9A 4ZXGA 5J9BA 4YJFB 1KSSA 2JB2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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