4EIPA

Native and k252c bound rebc-10x
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
526
structure length
521
Chain Sequence
PIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDGTITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative FAD-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 163
structure length 521
sequence length 526
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 4eipA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4eipA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4eipA01
4XXGA 1O94A 2HQMA 1OJCA 2FJBA 2YR5A 3CGEA 1Q1RA 4YKGA 2Z5YA 4A9WA 1PXCA 1JOAA 4B1BA 1NHQA 3PVCA 4H2PA 1KNRA 2X50A 3UKFA 1L9EA 3SGLA 3K7TA 3AYIA 4ICYA 1MXTA 1E1NA 3CIRA 4Y4NA 4BJYA 2V5ZA 5HXIA 3DK9A 5LV9A 3AEDA 4K5RA 1E1LA 2JBVA 5KRQA 3NN0X 1F8WA 2E1MA 2XLUA 4YTNA 3B3RA 2VZ2A 3JSKA 4H4TA 4GF7A 3K7QX 2C76A 3AB1A 5EB4A 2WOWA 3UP4A 3VR8A 2V3AA 4YWOA 3UKKA 4EM4A 3FIMB 1H84A 2GQFA 4GUVA 3AE2A 2FJAA 2XLRA 1CJ4A 2WS3A 3CGCA 1NHPA 2PHHA 2WDQA 2WPFA 4NTCA 2WP9A 3Q6JA 1GEUA 4AT0A 3GD3A 1E6EA 1HYUA 2IVDA 4YSHA 4FK1A 1VQWA 4GRTA 3BHKA 3AECA 3AEEA 3M0OA 1E39A 2XLSA 3UTFA 2XFOA 2GQWA 2WPEA 2C70A 1GT8A 3KU9A 3NYCA 2JB1A 4GCMA 4H2RA 4U8LA 1ONFA 2WU2A 2C67A 3I6DA 3NIXA 4U8IA 4YT0A 3II4A 3P9UA 3AEGA 3H8LA 3L8KA 3PO7A 1TDOA 2PYXA 2O9ZA 1GV4A 1NPXA 3QSMA 4UDRA 1H86A 4YKFA 4A79A 1GRGA 4JNAA 4YSZA 2BK4A 2AR8A 1ZX9A 1ELIA 2X8GA 4DSHA 1VG9A 4U2LA 4H4QA 1LVLA 3NYFA 3BI2A 4JN9A 4Y4MA 3IWAA 3UCLA 4TM3A 5IQ1A 2VRMA 3AE7A 5FMHA 1N4UA 4M52A 4H50A 2NPXA 2JK6A 3QSEA 2BC1A 2FBWA 1F6MA 3NLCA 1GRFA 3URHA 1BWCA 2BYBA 2BACA 1JRXA 2JAEA 1GOSA 1DNCA 2WPCA 2GB0A 4ZCCA 2B9YA 1KF6A 2Y6QA 4UDPA 5HY5A 3AE5A 3AE3A 2R9ZA 3GYJA 3D8XA 1PBBA 1LPFA 3AE6A 4OPGA 4H4UA 2GV8A 1PBFA 3NRNA 4I58A 1KSSA 4BK3A 5U1OA 4B69A 1FL2A 1JRYA 3LB8A 1NG4A 3CGBA 4JQ9A 5BULA 1JEHA 4C5OA 4U2TA 3G5QA 1CL0A 2YVFA 3IHMA 4C3YA 2WETA 2Q6UA 2VQBA 2WP6A 3H8IA 2EQ6A 4BK2A 3WE0A 4EMWA 1JU2A 3CNJA 4Z44A 4RSLA 1LV0A 4A99A 3NHOX 4B63A 1B4VA 1OJ9A 4TLXA 4AOSA 4DNAA 3OC4A 3F8RA 1F3PA 3M13A 2Q0KA 1P2EA 2GR3A 4E0VA 3RHAA 4IVMB 4J2WA 4YSYA 3AEAA 5JCIA 2XVIA 3ALMA 2OLNA 4APNA 5KOXA 3E1TA 4YTPA 1REOA 5C3JA 1TDEA 1PBDA 2ZZBA 1CC4A 2C64A 2B7SA 4CRTA 5IPYA 3ITJA 2R0CA 1DOCA 2Z5XA 1B5QA 5EBKA 2CULA 3REDA 3ICTA 3AEBA 4H7UA 3AE8A 3GYIA 4J31A 3BHFA 3CN8A 1GRAA 4P9SA 2BXRA 3UOYA 4TM0A 1H6VA 2EQ7A 4LIIA 3NG7X 3UOZA 1YQ4A 4TM1A 3SM8A 2QAEA 2YM2A 4A6NA 3AEFA 2V60A 1PHHA 3VRAA 1OJAA 2BABA 2NVKX 3C4NA 4AP3A 1GNDA 3CPJG 5U25A 2RGOA 3KVEA 2GR1A 3BI4A 3P4RA 4K7ZA 1GERA 1CJ3A 2FJEA 2RGHA 2TPRA 2YM1A 2YG4A 2QCUA 1ZOVA 2YR4A 3F8PA 3L1RA 4REKA 3SQPA 1E1MA 1NG3A 1YQZA 2YG7A 3ICRA 2X3NA 4X4JA 4EMIA 1TYTA 3RNMA 4CBQA 5GRTA 4FK1C 2JKCA 4U8PA 1VDCA 2YLSA 1K0IA 5GSNA 2E4GA 2QA2A 1DOEA 3EF6A 1L9DA 4H4YA 4PAAA 3NK2X 3VQRA 4ZN0A 4BK1A 2OAMA 4HB9A 4J34A 3ABVA 2UZZA 2VRLA 1D4EA 2YVJA 4X9NA 3G5RA 1SEZA 3FG2P 3G5SA 1GTHA 1MOKA 1PXAA 1JNRA 3D1CA 2C72A 4K5SA 4RG3A 4JNQA 2BCGG 3COXA 4KX6A 1UKVG 4U8MA 4NTDA 2GAHB 3SFDA 3AD8B 2I0ZA 5KWFA 1VRQB 1D4DA 2GR2A 1IUUA 3UKHA 1FOHA 1DXLA 4O5QA 1FECA 2BCPA 3AE1A 2OLOA 3OZ2A 2YG3A 1CBOA 5JCKA 4B66A 2YAUA 5J60A 1GTEA 1O5WA 1M6IA 1PS9A 2C3CA 2BS2A 5KOWA 2ZZCA 1XHCA 1ZMDA 1EL7A 2B7RA 2IIDA 5M10A 1COYA 3GWDA 1XPQA 4H2NA 1XANA 2YLTA 4NEWA 2C66A 2RGJA 1H81A 5BVAA 4NTEA 3UKQA 3C96A 3AD9B 4PABA 1GRHA 2XDOA 3DK8A 3AYLA 1D7YA 2BS3A 3IF9A 3QFAA 2GAGB 4EM3A 1CC6A 2OA1A 1H7WA 2XFNA 1MO9A 3FMWA 1LTXR 1CC2A 4Z43A 3KLJA 4IA5A 3QVPA 1P2HA 1PN0A 4CY8A 4CNKA 4Z25A 1DOBA 1ZDLA 2ZZ0A 2GEWA 3P1WA 4YTMA 2H88A 3NGCX 1IJHA 1AOGA 4YSXA 1L9CA 1PDHA 1KSUA 1TRBA 2V3BA 2JB3A 1IUVA 3QVRA 1H83A 3QSSA 2B76A 3BNMA 4WCTA 4K2XA 3GRTA 3ZDNA 4LA1A 1LQUA 1N1PA 4GDPA 1FEAA 4B64A 3KD9A 1O95A 3FBSA 2C65A 4CCRA 3LJPA 4J57A 2XCGA 3HZLA 4A5LA 4EQWA 3KPFA 2VQ7A 2XFUA 2ACZA 2H89A 1Q9IA 4MJWA 4C74A 3O0HA 3T37A 3DJEA 2WQYA 4JY3A 1OJDA 2BC0A 4USQA 1CF3A 4CY6A 2YLXA 4TLZA 3V3NA 2YVGA 4NEVA 2X8CA 5M0ZA 2XFQA 4LU6A 3S5WA 3CPIG 2W0HA 1PXBA 3CNPA 3NK0X 2ZBWA 2Y6RA 1Y56A 2XLPA 1RP0A 1PBCA 1VG0A 2WP5A 2AQJA 3RP8A 1B37A 3UTEA 4N9XA 3CGDA 2QA1A 1GSNA 1ZK7A 3ZYXA 2OALA 2BK5A 3DJJA 3DJGX 2YR6A 3GWFA 2XLTA 4Z2RA 1LJ1A 1BF3A 2GH5A 2WESA 3IC9A 5KVHA 5U63A 3AWIA 4JY2A 2GR0A 4U8NA 1GPEA 3ALLA 1XDIA 1D7LA 1DJQA 2WOVA 4OPIA 4H4ZA 1EBDA 5HYMA 4AP1A 1RYIA 3ATRA 3LOVA 3EAOA 1L0VA 2VVLG 1JRZA 2B9XA 4J36A 4U8KA 3ADAB 3EANA 4C77A 2BS4A 4Y4LA 1H7XA 1NHRA 4Z26A 5BUKA 2XFPA 2GRTA 3ICSA 4H4XA 1DJNA 1ZMCA 4WX1A 3F8DA 3ALJA 3C4AA 2GVCA 1K4QA 1OJTA 4IA6A 1GRTA 3NNEA 3V76A 2C3DA 2WDVA 2Q7VA 4A65A 3K7MX 1N4WA 4GR1A 4H2QA 2B9WA 2CVJA 2JB2A 4IVOB 1TDNA 3DJDA 3LZWA 4NZHA 1N4VA 3CTYA 1B8SA 4JDRA 2C7GA 4U8JA 3B6DA 1GETA 1PBEA 2APGA 3PS9A 4Z24A 2YQUA 2YG5A 1TDKA 3DA1A 4I59A 3VR9A 4B65A 2IVEA 2YWLA 3Q9TA 2TMDA 1KNPA 4OPTA 1QO8A 4A6NB 1YQ3A 3VRBA 3P4QA 3ATQA 2VVLA 1D5TA 1NAAA 4CCQA 2R45A 4B67A 4IV9A 3GSIA 3LADA 5C2TA 5EB5A 2R4JA 2BXSA 3P4SA 4H4WA 1W4XA 1FEBA 2WU5A 1TDFA 4BURA 3DK4A 1ZKQA 4UP3A 4XWZA 3CNSA 2WDRA 3NN6X 5L46A 1IUWA 5ER0A 3R9UA 1Y0PA 2A8XA 2R0GA 1V59A 2CFYA 1F8SA 5KVIA 1E7PA 4K22A 1S2YA 3LXDA 4U8OA 4AT2A 3GRSA 4HA6A 4Z2UA 2X8HA 4EIQA 3ISHA 1PJ7A 2GMHA 5DBJA 3M12A 4CNJA 5FS9A 4ZCDA 1E1KA 2WOIA 1GALA 4A7AA 1BKWA 3NKSA 1EL5A 2WEUA 4H4PA 5FS6A 4EMJA 2BA9A 1ZY8A 1BZLA 1S3BA 3QFBA 1KDGA 4H4RA 3UKLA 4J33A 3DH9A 2A87A 2XVJA 3NYEA 5HHFA 1K0JA 1YKJA 1CJCA 3AXBA 3FPZA 3KKJA 1BGNA 1NEKA 3QJ4A 4RG4A 4OPUA 2FJDA 2DKHA 1FCDA 5EOWA 4OCGA 4FDCB 2YLWA 4OVIA 2R46A 3CNDA 3UTGA 1GXFA 2XVHA 3UKAA 1PJ5A 2XYOA 1F8RA 1Z6LA 3GD4A 1TYPA 2V61A 5JCLA 3DGZA 3K30A 3NK1X 2C73A 3GMCA 4USRA 2YLRA 3NH3X 4U2SA 5KXJA 2R4EA 3P4PA 2RABA 3CPHG 4EQXA 3DMEA 3UOVA 4OPDA 1NDAA 1EL9A 1EL8A 2ARDA 1IUTA 1PJ6A 1RSGA 1ZOYA 2EQ8A 3RP7A 3V3OA 5JCNA 4XWRA 3DGHA 3NTDA 1IUSA 2XVEA 4D04A 4C3XA 1D4CA 2WHDA 5IQ4A 1S3EA 4B68A 4EQSA 3UP5A 3CNTA 3S61A 4Z2TA 1GRBA 2AAQA 2YLZA 2J3NA 3KA7A 1M64A 3NT6A 3SFEA 3AYJA 1KFYA 2XVFA 1NHSA 4O5UA 3EPTA 4DSGA 2GMJA 3I3LA 4KPRA 2E5VA 4ECHA 1H82A 4DGKA 1K0LA 1QLBA 4YXDA 2X99A 1CJ2A 4H4SA 1CHUA 4OPLA 2R0PA 2DKIA 4EIPA 4UDQA 4X9MA 2WBAA 5J7XA 3UTHA 4AOXA 4BV6A 3IHGA 1BGJA 3GDNA 2A89A 2VOUA 5CQFA 4GDEA 1DODA 4J56A 3RP6A 2C75A 2BK3A 1S2QA 1GREA 1Q1WA 3AE4A 3NTAA 5FS7A 2CDUA 4FX9A 1YY5A 1GESA 1LQTA 2F5ZA 5BRTA 1ZP0A 5TR3A 2EQ9A 2V6OA 2VVMA 3AE9A 4D03A 4EQRA 1Y56B 1X31B 3AD7B 4K8DA 5CKUA 4TM4A 4ADWA 4BJZA 2Q0LA 2YG6A 3UOXA 3BNUA 2GF3A 3GMBA 3BI5A 1QJDA 3GDPA 3H4KA 4H4VA 4OPCA 1NENA 3UKPA 5JCMA 1JNZA 3VRDB 5FS8A 1IUXA 3LZXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4D73A 1O94A 2HQMA 2FJBA 2YR5A 2CVBA 2Z5YA 2YPMA 3UKFA 3SGLA 1E1NA 1GSUA 1TW9A 4ILFA 3ZFBA 3DK9A 5CRDA 5LV9A 2JBVA 3NN0X 1EWXA 3A2VA 3QFBC 2IWTA 2VZ2A 3EYTA 4QL9A 3K7QX 3AB1A 5G2ZA 4N10A 3VR8A 3Q74A 2OA7A 4IVFA 2GQFA 3ZNOA 2WS3A 3CGCA 2GZYA 1NHPA 4NTCA 3RPNA 4AT0A 1E6EA 2IVDA 4FK1A 3MDKA 3M0OA 1XW6A 3AEEA 2HSYA 3F4RA 1PKWA 2WPEA 3HYVA 3KU9A 3NYCA 2JB1A 1A0RP 4U8LA 3HYPA 2WU2A 5IPGA 3I6DA 3Q6OA 3II4A 4FYUA 10GSA 3AEGA 3H8LA 1TDIA 4PURA 3E9JB 4Q5NA 4AGSA 2AR8A 1VG9A 1A8YA 4YQUA 1LVLA 3U5RE 3BI2A 5CO3A 5HFIA 3IWAA 2N5AA 5IQ1A 3TJGA 2C0DA 3LFLA 5ENUA 3DWVA 1F37A 4NNJA 4M52A 2NPXA 2GT6A 5IMCA 4O7HA 2WDUA 1JRXA 1GOSA 2GB0A 5ECHB 2MZCA 2B9YA 2Y6QA 2B1LA 2E2MA 2I3YA 3AE3A 1BG5A 3D8XA 2C4CA 3IBHA 4H4UA 1PBFA 4BK3A 3EC3A 4N0ZA 1J9BA 4KB3A 1KSSA 2MBSA 4GSNA 3Q18A 5D96A 1OC9B 3CSJA 5IIZA 4TW5A 4C5OA 3G5QA 5AIVA 2I81A 2VQBA 4BK2A 3QAGA 1C0IA 3FR6A 3WE0A 5CRHA 1B4VA 1M2BA 1F3PA 3M13A 1VF4A 1SD8A 2CVDA 1A8LA 4HZ4A 2H01A 3UAPA 4J2WA 4YSYA 1IYIA 1ZGNA 3GSSA 2XVIA 3N5OA 2OLNA 3E1TA 1O7UA 2KLXA 2ZUPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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