4EIPA

Native and k252c bound rebc-10x
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
526
structure length
521
Chain Sequence
PIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDGTITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative FAD-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 163
structure length 521
sequence length 526
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 4eipA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4eipA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4eipA01
4J2WA 2EQ7A 4C3YA 3UTEA 2GV8A 3IHGA 4B66A 2X99A 5HHFA 4OPCA 3RP8A 3SFDA 4K8DA 2VVLG 5BRTA 3URHA 4C74A 1QJDA 3DMEA 3OZ2A 4U2LA 1FCDA 3R9UA 2YLWA 3ADAB 3NK0X 3NN6X 2BYBA 2WDVA 2BCGG 2Y6RA 3FIMB 4NZHA 4K7ZA 4TM3A 3SGLA 1XANA 2BACA 3Q6JA 3NT6A 5GRTA 1GETA 3COXA 4U8PA 3NNEA 3KA7A 4K2XA 3LXDA 4KX6A 2YG7A 2GVCA 1CJCA 4YTMA 4Y4NA 4JNQA 3LZXA 3SM8A 2YLRA 3GD4A 2FBWA 3UOVA 2XDOA 3ISHA 2ZZCA 4BK3A 1GEUA 4XWZA 1ZDLA 1IUXA 1PBBA 1P2HA 2TMDA 5BVAA 3NH3X 4YWOA 4AOXA 2WETA 3K7MX 1W4XA 4YKGA 2FJAA 3AYIA 1GOSA 1EL9A 4CNKA 1ZP0A 3C4NA 5FS9A 3BI4A 4APNA 2YLTA 3C4AA 2CULA 2FJDA 5KXJA 2I0ZA 1TDKA 3AE8A 2BABA 2B7RA 2OLNA 3ICRA 3ICSA 3NHOX 2R0GA 3AECA 3AEFA 4WCTA 3UKQA 2WDRA 3GDPA 3B3RA 3FPZA 1JU2A 3QFAA 2C3CA 2TPRA 4EQWA 2OALA 3CGEA 3AXBA 3GWDA 2BXSA 1REOA 4H4TA 3L8KA 1GSNA 1BF3A 3QJ4A 1QLBA 4IA6A 4XXGA 2XYOA 3EANA 2X8GA 3NN0X 1ZY8A 4AOSA 3UTHA 4C77A 4YTNA 2B9YA 4PAAA 3VRAA 4DGKA 1L9CA 2H88A 2VVMA 4A6NA 4D03A 5EBKA 1L0VA 3H8LA 4H50A 5JCIA 4CY6A 1JRXA 4YSXA 5L46A 1DOBA 2Q6UA 2ZBWA 3CNTA 1ZMDA 1O95A 1Y56B 2YVGA 1KSSA 4H4RA 1N4UA 4U8IA 1LQTA 4C5OA 1DXLA 2VRLA 3PS9A 4OPDA 3FBSA 1GXFA 1H86A 2GB0A 1B4VA 3CGCA 1XPQA 3KD9A 4X9NA 5J60A 1JRZA 1CJ4A 4EMWA 1EL8A 1MXTA 5GSNA 3I3LA 4FK1A 2ZZBA 4A9WA 4H4ZA 1PBDA 2JBVA 3DJGX 3S61A 2XFUA 1FECA 4EM3A 1NENA 1E1LA 4NTDA 1NHPA 2WP6A 1BKWA 5IQ1A 4H4PA 2A8XA 2FJBA 1O5WA 4JDRA 3AE7A 2CDUA 3F8RA 3IC9A 3ALLA 1D5TA 1N1PA 3AWIA 1GRAA 4USRA 1UKVG 3KPFA 2R0CA 5JCLA 4J33A 1LQUA 3CNDA 3ZDNA 3P4QA 1ONFA 1RYIA 3QVRA 1TDOA 3RHAA 3KU9A 3SFEA 4AP1A 1YQZA 2GR0A 3GYJA 4BJYA 4B63A 4IVMB 4YSZA 2X8HA 5CKUA 1NHQA 4REKA 2VZ2A 2PHHA 1JRYA 1Q1RA 2XLRA 3AE9A 3KVEA 4A6NB 1XDIA 3Q9TA 3CNJA 3ALJA 4GR1A 4NEWA 1F8SA 4K22A 5FS7A 1H81A 2R4JA 4Z2TA 1Q9IA 3CPHG 3GYIA 2YM2A 4JNAA 3UKKA 1E7PA 3CGDA 4GDEA 2R9ZA 3AE6A 2IIDA 1Z6LA 3OC4A 1KNPA 4YSHA 4H4UA 3GRSA 3H4KA 4YKFA 1JOAA 2V3AA 3P4RA 3DK9A 3UKFA 1IUTA 1CF3A 1GRGA 1E1KA 1K0LA 1L9EA 1IUUA 2X3NA 2JB3A 2UZZA 1PHHA 1HYUA 2EQ9A 3NLCA 3P4SA 2YR6A 4B69A 2WHDA 2RGOA 2GMJA 3FMWA 2YVJA 1PS9A 1GRFA 1PDHA 2ARDA 1GNDA 2YR5A 2YR4A 2BK5A 3UOYA 4RSLA 1CJ2A 4ADWA 3AEEA 3ICTA 3G5SA 4CNJA 2C66A 1QO8A 3UKPA 1FOHA 2B7SA 4OPIA 4EMJA 2F5ZA 4Z43A 3QVPA 2ACZA 2YQUA 4EIPA 4H4XA 4DNAA 2JB1A 3HZLA 4AP3A 1Y56A 2XVEA 4UDRA 5LV9A 1EBDA 1H7XA 2XLUA 5ER0A 1CC6A 1PBFA 5JCKA 2PYXA 1D7LA 3UOXA 1DJNA 2C65A 3KLJA 1FL2A 2VQ7A 1EL7A 3UKAA 1E1MA 3ATRA 2CVJA 3UTFA 1E1NA 4N9XA 5EB5A 3UOZA 4GUVA 1OJAA 1IUSA 1YQ4A 4A99A 2GMHA 2B76A 2BS2A 4YT0A 4E0VA 1H7WA 3JSKA 4Y4LA 4OPUA 4HA6A 4CY8A 1PJ7A 3CN8A 3VRDB 5CQFA 2C75A 3QSEA 1LVLA 1F8WA 1NG4A 2YM1A 2DKHA 4J57A 4A7AA 3PVCA 3F8DA 1FEAA 2VRMA 4EIQA 3AE1A 4JY3A 2WP9A 3AYJA 3NRNA 5KVIA 1KF6A 3UP5A 3SQPA 3CNSA 1LTXR 3V76A 1VRQB 3BNUA 5DBJA 3LADA 3UP4A 5FS6A 4Z26A 4FK1C 2WPCA 4AT0A 2QCUA 1S3EA 1LJ1A 3UCLA 3NYCA 3AB1A 5JCNA 3GMCA 4O5UA 3L1RA 4A5LA 1K4QA 4U8KA 3RP7A 3UKHA 4UP3A 2GF3A 2Q7VA 3AE5A 1NHRA 1CJ3A 4D04A 4EM4A 2NPXA 3NTDA 2XFQA 2ZZ0A 1D7YA 2OAMA 2BS4A 3M13A 4RG3A 4DSHA 2GQFA 3DH9A 3NIXA 4K5RA 1GV4A 5C3JA 5KOXA 2EQ8A 1B8SA 2JK6A 4B64A 2C64A 1M64A 5BUKA 1COYA 3AD8B 3ITJA 4H4YA 4A79A 2BK4A 4BURA 3GWFA 2GR1A 3AE4A 5HY5A 3H8IA 2GEWA 1PXCA 3EPTA 2IVDA 3AEDA 4U8NA 4BV6A 2A87A 1TDFA 3M0OA 2HQMA 1TRBA 4LA1A 1DOCA 1ZK7A 3CPIG 1KFYA 1SEZA 3PO7A 1NEKA 4DSGA 1ZOVA 1ZKQA 4BK2A 3S5WA 4CBQA 1OJDA 1GPEA 3P4PA 4ZCCA 1N4WA 3NK1X 1YY5A 1PBEA 1L9DA 2BC0A 2XLTA 1D4DA 2WPEA 2QAEA 1IUWA 4U8LA 4OCGA 3P1WA 3DJEA 3RP6A 1BGNA 1MOKA 2XFOA 2GAHB 3RNMA 3D1CA 1M6IA 4H2RA 4O5QA 2R4EA 4ECHA 1XHCA 3REDA 1GT8A 4J31A 5U1OA 4B68A 2XFPA 3DK8A 2R0PA 2X50A 1F3PA 2E1MA 2OA1A 1AOGA 5U25A 1NDAA 4UDQA 3LB8A 1ZMCA 5TR3A 4Z2UA 4Z2RA 4LIIA 2X8CA 3O0HA 1VQWA 1ZX9A 4I59A 2B9XA 1GALA 2WOWA 1NPXA 2XFNA 1E39A 4RG4A 4UDPA 4ZCDA 3CNPA 3QSSA 1CC4A 5FS8A 2E5VA 3CIRA 4H2QA 1PBCA 1F8RA 1Y0PA 2O9ZA 5JCMA 3E1TA 1NAAA 4P9SA 3T37A 3I6DA 4H4SA 2XVIA 1D4CA 3P9UA 4TM1A 1GESA 2VVLA 4CCRA 3AYLA 3DJJA 2BCPA 2EQ6A 2V61A 2XVHA 4H4WA 1CBOA 3V3NA 2V6OA 2CFYA 2WU2A 2R46A 1RSGA 2XLPA 3DGZA 4X9MA 4XWRA 1N4VA 2YG4A 4Z44A 4H2NA 3UTGA 4BJZA 1GTEA 3D8XA 4TM4A 4U8MA 4AT2A 2WPFA 4A65A 3G5RA 2YG6A 1LPFA 1VG9A 1CL0A 2C3DA 4FX9A 2YLXA 5BULA 2YG3A 1KNRA 4GRTA 2RABA 1PN0A 2GR2A 4M52A 2BK3A 1E6EA 2XCGA 3K7QX 4WX1A 3QSMA 1JNRA 2BA9A 2WP5A 1OJTA 2VOUA 2WOVA 2YVFA 5U63A 1LV0A 1H6VA 1BGJA 2GQWA 4CCQA 1K0JA 3NG7X 4H4VA 4IVOB 4NTEA 3DK4A 4U8OA 4B67A 3AD7B 1D4EA 1OJCA 4IV9A 4B65A 2BXRA 3ATQA 2GR3A 2H89A 2YG5A 4Z24A 3II4A 4YXDA 3GD3A 2Z5YA 4LU6A 4H7UA 5M10A 3DA1A 1ELIA 3VR8A 4OPTA 1GRBA 3DGHA 3UKLA 1O94A 1IJHA 5KOWA 2R45A 3NTAA 1DJQA 2Q0KA 3GMBA 2QA2A 2IVEA 3BHKA 3M12A 2JB2A 1H82A 2JAEA 3BI5A 3CTYA 4C3XA 4CRTA 4U8JA 1VG0A 5IQ4A 2V5ZA 2WBAA 5FMHA 1VDCA 1TYPA 2A89A 1PXBA 2JKCA 3KKJA 4TLZA 4ZN0A 3B6DA 2OLOA 3NKSA 3ZYXA 1YQ3A 5M0ZA 3CGBA 1S2QA 3WE0A 1PJ6A 1ZOYA 3AD9B 2BS3A 2E4GA 1DNCA 4NTCA 1CC2A 1F6MA 1K0IA 3LOVA 3LZWA 4J56A 3VQRA 4EQSA 5C2TA 1CHUA 3NGCX 5EB4A 2WQYA 4JN9A 1P2EA 2AQJA 5KRQA 2VQBA 4BK1A 5HYMA 1B5QA 5KVHA 4Z25A 3QFBA 2GAGB 4Y4MA 1TDNA 3AEGA 1FEBA 2C73A 2GRTA 4H4QA 4YTPA 4HB9A 3ABVA 3GDNA 2C72A 3K30A 4U2TA 2C70A 1KDGA 2YWLA 3V3OA 3BI2A 3DJDA 2C7GA 3NYFA 3ALMA 5IPYA 1JNZA 4KPRA 2QA1A 2FJEA 3NK2X 4J36A 2RGJA 3GRTA 3NYEA 3EAOA 4OPLA 3K7TA 2C67A 3AE2A 1BWCA 3GSIA 4JQ9A 1GTHA 4OPGA 4TLXA 1IUVA 3CPJG 3VR9A 4EMIA 1DODA 4ICYA 3AE3A 3VRBA 1H83A 1EL5A 3AEBA 4EQRA 2AAQA 2WEUA 4IA5A 4H2PA 1YKJA 2NVKX 1H84A 2WS3A 4B1BA 1DOEA 1GREA 3BHFA 2RGHA 1GERA 2Y6QA 2Q0LA 1V59A 2V60A 1S3BA 2B9WA 2BC1A 2DKIA 3G5QA 2J3NA 2WESA 3FG2P 4GCMA 2YLSA 4TM0A 4X4JA 1B37A 4K5SA 3IF9A 1MO9A 2XLSA 2XVFA 1BZLA 2AR8A 2WU5A 4EQXA 1GRHA 1RP0A 3IHMA 4U2SA 5J7XA 1TDEA 4JY2A 4USQA 4GF7A 3F8PA 1PJ5A 1NHSA 4MJWA 2C76A 2WOIA 1S2YA 3LJPA 1GRTA 5EOWA 1JEHA 1X31B 3BNMA 4I58A 1PXAA 1OJ9A 3C96A 4YSYA 2XVJA 4J34A 3IWAA 1KSUA 2Z5XA 5HXIA 1NG3A 3EF6A 2YAUA 2W0HA 5KWFA 1Q1WA 2YLZA 4PABA 2APGA 4OVIA 4GDPA 1TYTA 3AEAA 2V3BA 2WDQA 2GH5A 4NEVA 4FDCB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K1FA 5C00A 5IPGA 3PH9A 1G0TA 4G9KA 4K8DA 2GT6A 2O8VB 3URHA 1B9XC 6GSSA 2ON5A 4L0UA 2WGRA 3ADAB 2FA4A 2O89A 1Y25A 1XWGA 1OC9B 2BYBA 1BJXA 2HNLA 3FIMB 4K7ZA 4NZHA 4MMMA 5E4WA 5J9CA 5JWRB 4WR5A 4YJDA 1X9WB 5IO0A 1GETA 3HKRA 2AV4A 3LXDA 2VLTA 2FGXA 2YG7A 3SM8A 4HUAA 4JNQA 4Q5RA 1WOUA 1R5AA 1OAZA 2ZZCA 1F37A 2V1MA 1SU9A 1GEUA 3QPMA 5A5KA 1P2HA 4K7IA 5HFGA 4MABA 3TKQA 1VRSD 3H8QA 4YWOA 2FJAA 3AYIA 2DIYA 5ECQB 2H6YA 1F3AA 4F2IA 3KMNA 4L8EA 3ICSA 3UBLA 2R0GA 2WFCA 2GSTA 1ZYNA 4PNFA 1BQ7A 3FPZA 1JU2A 3QFAA 4RI7A 2C3CA 1M2BA 3RPPA 4EQWA 1JLWA 3CGEA 3GWDA 1Z9HA 3FY7A 2BXSA 3L8KA 2PWJA 3FZAA 3EU4A 2VCWA 4AOSA 1RK4A 3NN0X 3UTHA 2M80A 2CZ2A 4YTNA 3QCPA 3VRAA 3SZ0A 1L9CA 3FZ9A 3U6VA 4G6HA 1SKRB 5EBKA 3H8LA 5DALB 3HDCA 3QAWA 5G31A 4YSXA 2DIZA 4YJHB 2F51A 4WEYA 4JBBA 3MNGA 4MK3A 1N4UA 3ME7A 2LJRA 2XPEA 3FBSA 4K9ZA 4ZL8A 2GB0A 1H86A 2I81A 2G2QA 3KD9A 3T31A 4IJIA 5B8BA 4N0ZA 1SD9A 1JRZA 1CJ4A 4EMWA 4J57E 1X5DA 3I3LA 4H4ZA 1PBDA 1TJDA 4XS4B 5LD0A 2JBVA 3S61A 4EF0A 2XFUA 3R2QA 3UARA 4NTDA 2WP6A 5IQ1A 4H4PA 2A8XA 1O5WA 1YEXA 2LNTA 4JDRA 2FWFA 1IYIA 2WRTA 4F9ZA 4GAVA 2WB9A 5ECPB 3GHAA 3GYJA 4IVMB 2B3SA 2H1DA 2PHHA 1TDIA 3AE9A 3KVEA 3VLNA 4II2A 4AJ6A 3ALJA 4FYBA 1GLPA 1F8SA 4MJEA 1H81A 2R4JA 4Z2TA 5JWOB 3UKKA 2YM2A 3CGDA 3ZYWA 2N5FA 4N10A 2HFDA 2FHEA 3CUKA 2H1BA 4YSHA 1AW9A 4N0VA 2IWTA 5KMSA 1XOAA 2H19A 1L9EA 1G7OA 3RPNA 2EQ9A 4J2FA 4B69A 2I3YA 1SL0B 2WHDA 2RGOA 4TXOA 2GMJA 3FMWA 2YVJA 1GRFA 1GNDA 5G1KA 3TJKA 3DMLA 2O87A 1GTAA 2RM5A 1A2MA 2DBCA 1QO8A 1HD2A 1R5PA 2C0DA 5CAXA 4XS6A 4Z43A 3QVPA 2JB1A 1JZOA 1Y56A 1XIYA 4TR1A 5HQPA 3A3TA 2RM6A 5JCKA 1FO5A 1D7LA 1AQVA 1YJ6A 1O6JA 4EDYA 2VQ7A 1JHBA 4KE3A 3ZFLA 1E1MA 2LTKA 4GTUA 2CA8A 4GQCA 3GYKA 1YQ4A 3IXRA 3IOSA 4NMUA 1H7WA 3JSKA 3WT2A 2B1KA 5CQFA 5DCHA 1F8WA 4ID0A 3F8DA 1FEAA 5ID2B 3AE1A 5KMRA 5D8IA 4EVMA 3KMOA 3SQPA 1RQMA 4G0KA 1PRXA 4PGTA 4EL1A 1VRQB 2V2GA 5DBJA 2C0GA 4G2EA 4F03A 2WPCA 3KM6A 2L5LA 3Q6OA 1LJ1A 3GMCA 1K4QA 4KX4A 5E59A 2YNXA 3CSHA 5ECSA 3ZMKA 3MAKA 5JWQB 3TRQA 1USBA 4RG3A 3R3EA 2VCQA 1GV4A 1X0RA 2B5YA 1C0KA 3AD8B 12GSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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