4EIPA

Native and k252c bound rebc-10x
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
526
structure length
521
Chain Sequence
PIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDGTITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative FAD-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 163
structure length 521
sequence length 526
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 4eipA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4eipA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4eipA01
2Z5YA 1ZMCA 2TPRA 4YKGA 4K2XA 2BK5A 1KNRA 2BC0A 2VOUA 2C3CA 3LZWA 3S61A 4WX1A 2V3BA 3UKPA 3CGDA 3NYFA 2E5VA 4USRA 2YVJA 2ZZ0A 1SEZA 1GALA 3BNUA 4N9XA 3I6DA 3EANA 2ARDA 1TDFA 2Z5XA 2WDVA 4ADWA 3ICRA 1NG3A 1D5TA 1P2HA 3M0OA 2BK3A 4YXDA 4XWZA 1LJ1A 4YTNA 2Q6UA 1CC6A 1M64A 1N4VA 4HB9A 5HYMA 4PAAA 2EQ8A 4XXGA 3UP5A 4CRTA 4H4YA 1QJDA 5KXJA 1GTHA 4TM4A 4JQ9A 4JY2A 1GPEA 3CNTA 3UP4A 4BK1A 5C3JA 3OZ2A 2VQ7A 4EIQA 1CJ2A 4GUVA 5U63A 4J33A 4GF7A 1GRFA 4AOXA 1OJAA 1EL7A 2OALA 1KF6A 4CBQA 4CCRA 2O9ZA 1GRBA 3NLCA 4GDPA 2X8CA 3NIXA 1B5QA 1ZOYA 4REKA 4X9NA 2QCUA 3GSIA 2IVDA 4A99A 2QA2A 3WE0A 2Q0KA 2XLPA 1Y56A 1NDAA 5KVIA 2X8HA 3UKFA 2R0GA 1LVLA 1O5WA 2GQFA 4EMWA 4ECHA 3GRTA 1EL9A 1CC4A 1ZK7A 3QFAA 2YQUA 3LOVA 3M13A 3AE3A 4GR1A 4FX9A 1CL0A 4Z44A 1DXLA 2C66A 1H83A 1X31B 4Y4NA 3DJDA 4H2NA 2OLOA 1KSSA 1F8WA 4J2WA 4AP1A 5IPYA 1Y56B 2XLTA 4K22A 4RG4A 1CJ3A 2WOWA 3DK8A 5EBKA 2B9XA 4CY6A 3ATQA 4A5LA 3KA7A 3CGEA 1GTEA 1GRHA 3ICSA 2V5ZA 4EM3A 2YG5A 1YKJA 1ZMDA 4FDCB 2XLSA 3UKAA 5KRQA 3DGHA 1W4XA 2YG7A 3URHA 2BA9A 4U8PA 4UDQA 1QO8A 1DOBA 1B37A 2GV8A 3ITJA 2XVIA 3NRNA 4IV9A 5DBJA 4BV6A 2CDUA 1JU2A 2XFPA 5KOXA 3H8LA 3AEDA 3IHGA 2APGA 2BCPA 3NTDA 3GRSA 4PABA 3P1WA 2OA1A 3DK9A 2GAGB 5CKUA 1MXTA 2CFYA 3C4NA 3UOXA 1PHHA 2VRMA 5KOWA 1JNZA 1TDKA 3CPJG 3UTFA 1IUUA 1H7XA 3GD4A 3NK0X 4RSLA 3UKQA 4TM0A 3EAOA 1Q1RA 1BZLA 3AECA 4B69A 4DSHA 1LV0A 5BULA 2YLSA 4AOSA 2FJBA 1E39A 1F6MA 2TMDA 2CVJA 4K8DA 2ZZCA 4YWOA 1AOGA 3V76A 2BCGG 4OPGA 4OVIA 4JN9A 4I58A 3GWDA 2BXRA 4B63A 1KSUA 2CULA 3EF6A 2WS3A 3SGLA 2C7GA 4TM1A 1VQWA 1ZY8A 4OPLA 4U8IA 2RABA 4KX6A 4USQA 5IQ4A 3JSKA 2IIDA 1NPXA 2VRLA 3V3NA 3VRAA 3RP6A 2QA1A 2UZZA 2B7SA 2H89A 3UKLA 1MO9A 1FEAA 2PYXA 1PJ5A 2VVLG 2XYOA 5CQFA 4D03A 1LQTA 3NHOX 1GXFA 2BXSA 2YR5A 1FECA 3FG2P 3I3LA 4A6NA 1PJ6A 5J60A 1FL2A 4NTCA 3G5RA 5KVHA 2E4GA 1F3PA 1PJ7A 1GV4A 1PS9A 2HQMA 1GEUA 3PS9A 2YLZA 2R45A 3KVEA 1OJ9A 2GR2A 3M12A 4FK1A 4XWRA 3RP8A 2WP9A 3NGCX 3SFEA 4K5SA 2OAMA 1VRQB 3G5QA 4UP3A 4Z2UA 1Z6LA 1YQZA 4A6NB 4EQRA 3IWAA 3NKSA 3QSEA 4H7UA 5M0ZA 2GQWA 2WBAA 4H50A 2GMJA 4NTEA 3AD7B 2F5ZA 2V60A 1OJDA 1D4DA 3RP7A 3AEFA 2X99A 3UKKA 4BJYA 1E1KA 3CNPA 1S2QA 3F8PA 4H2QA 4ZCDA 3DJJA 3UTHA 3GD3A 4JNAA 1BKWA 3AD9B 3PO7A 4MJWA 4NEWA 3ALLA 3L8KA 2XVEA 4C77A 1CC2A 1DOCA 2GF3A 3AE6A 3REDA 3T37A 2XFUA 4TM3A 1CJ4A 2ZBWA 2AR8A 1O94A 4UDPA 1NHQA 1COYA 3CPHG 1PBCA 3QSMA 2WPCA 2XLUA 5J7XA 1H84A 1TDNA 3UCLA 4YSXA 4A9WA 3IC9A 1GNDA 3D1CA 1E6EA 5KWFA 1IUTA 4A65A 1LPFA 3F8RA 2X8GA 3AEGA 4YSYA 5LV9A 5GRTA 1H7WA 4ZCCA 3KU9A 2YG4A 3S5WA 1P2EA 3AE2A 3KKJA 5BUKA 1GERA 2GR3A 1S3EA 3II4A 2EQ9A 3ALMA 1PBFA 2C70A 2XFOA 1PXCA 2Y6RA 3KLJA 3OC4A 3GDPA 2C65A 3ICTA 4KPRA 1F8RA 3B6DA 2YR6A 3AE9A 3BHFA 3O0HA 2IVEA 2DKHA 3K30A 3NN0X 1E7PA 3KPFA 3AYLA 3KD9A 3AEAA 1TDOA 3CGBA 4LA1A 2WOIA 1E1LA 3QSSA 3DMEA 1ZKQA 4APNA 4DNAA 4H4WA 1K4QA 3DJGX 3VRDB 3D8XA 4B67A 2WEUA 3VR9A 3FBSA 3L1RA 3K7TA 4H4QA 1QLBA 5FS8A 3GMBA 1YY5A 4LIIA 1BWCA 1ZX9A 4U8NA 4H4RA 3K7MX 5FS6A 1NHSA 2H88A 3IHMA 2EQ7A 3BI4A 4DGKA 1MOKA 2WETA 3BI2A 3QVRA 2JB3A 2BYBA 5HY5A 3UOYA 1DNCA 3DGZA 4OPIA 2I0ZA 2YVGA 3CNJA 3DA1A 1N4WA 3E1TA 5TR3A 2YG3A 1KDGA 4Z25A 1KFYA 3FIMB 4Z2RA 1YQ4A 3CNDA 3NNEA 2Q7VA 2XFNA 3V3OA 4YSZA 3DH9A 3AYJA 2VZ2A 4Z26A 2BC1A 4GDEA 4GCMA 1VG0A 4P9SA 1BGNA 4BJZA 3AXBA 2Y6QA 1L9CA 4HA6A 2A87A 4CNJA 3AE1A 5HXIA 1Q1WA 1IUVA 2YLXA 2NPXA 1XPQA 1L0VA 1UKVG 4OPUA 1CJCA 5FS7A 3NK1X 4C3YA 1IUXA 1E1NA 1XANA 4CNKA 4AT0A 3GYIA 5M10A 1BGJA 1GREA 2JB1A 2C67A 1PXBA 3AD8B 1XDIA 4C5OA 2BABA 2XVHA 2FJAA 2QAEA 1M6IA 1OJTA 2WU5A 1O95A 4X9MA 1IUSA 1RYIA 2YLWA 3Q6JA 4OPCA 4J56A 1D7LA 2A8XA 2AAQA 4U2SA 2RGOA 2WP6A 3SQPA 4O5UA 4H4SA 2B7RA 3AYIA 1FOHA 1YQ3A 2FJDA 2OLNA 4NEVA 3BI5A 2WDQA 1H81A 3AWIA 4H4TA 3VQRA 1DJNA 4H4ZA 4U8LA 4J36A 1Q9IA 5L46A 2GR0A 2GRTA 2ACZA 2RGHA 2BS3A 4H4PA 1FEBA 1TYPA 4JNQA 5JCKA 1REOA 3ADAB 4GRTA 3ALJA 1KNPA 2XVFA 1IUWA 1GT8A 3P4SA 2YLTA 1K0JA 1E1MA 1NHPA 2JK6A 5ER0A 4J57A 4U8JA 2WU2A 2XDOA 1XHCA 3F8DA 4FK1C 4U8MA 2R0PA 2VVLA 2WDRA 2XFQA 1GESA 2GH5A 3BNMA 4K7ZA 1PBEA 2WP5A 3P4QA 1HYUA 1RP0A 3UKHA 3R9UA 1DOEA 3UTGA 3CIRA 2BS4A 3VR8A 3IF9A 4Y4MA 4OPDA 2V6OA 2XVJA 3GWFA 5FS9A 4NTDA 3UOVA 3NYEA 2DKIA 2WHDA 2GVCA 2X50A 3Q9TA 4A7AA 3CN8A 1ZDLA 4OPTA 4YSHA 3NH3X 1GETA 4EQSA 4J31A 4B65A 3BHKA 3P9UA 3LADA 3QJ4A 3SFDA 4C3XA 3C96A 3C4AA 2R46A 3DJEA 1CBOA 2GR1A 2R0CA 5GSNA 1K0IA 3LZXA 4DSGA 4CY8A 1N4UA 3AE8A 2ZZBA 3CGCA 1H6VA 4NZHA 2B9YA 1ZP0A 2WOVA 3K7QX 3NTAA 4Z2TA 3EPTA 1N1PA 2BK4A 3AEEA 3CNSA 1PDHA 2WPFA 1GSNA 3LJPA 1LTXR 2V3AA 2V61A 3B3RA 3P4PA 4A79A 3FPZA 2YM1A 2YAUA 4RG3A 2GMHA 1DJQA 4LU6A 4EMIA 1K0LA 3GDNA 3PVCA 3QFBA 4ZN0A 1JOAA 3COXA 4H2PA 1TDEA 1JRZA 4EIPA 1JRXA 1OJCA 2EQ6A 3AE7A 2WESA 3G5SA 4IA6A 2C72A 3P4RA 2A89A 2JB2A 4B66A 3SM8A 5BVAA 1ELIA 1RSGA 2YWLA 4IVMB 3UOZA 4B64A 4EQWA 1TYTA 2C64A 3NYCA 4J34A 4IA5A 4CCQA 1NG4A 1GRGA 2VQBA 3VRBA 1GOSA 4YTPA 1NEKA 1PBBA 4Z24A 1IJHA 1F8SA 2C3DA 2R9ZA 4Z43A 4EQXA 2YVFA 3LB8A 1D4EA 1EL8A 1DODA 4U2LA 1VDCA 2WPEA 2B9WA 2B76A 3CTYA 4TLZA 1B4VA 1CHUA 2XLRA 1S2YA 2YR4A 4H4VA 1TRBA 2W0HA 1GRTA 4X4JA 4AT2A 1NENA 5IQ1A 4U2TA 3QVPA 4Y4LA 1PN0A 3FMWA 3ABVA 3RNMA 4B68A 4YT0A 5FMHA 5BRTA 2JAEA 4H2RA 4UDRA 4BK3A 2C75A 4U8KA 1LQUA 4C74A 2JKCA 2XCGA 4WCTA 3ISHA 2R4JA 2GAHB 1D7YA 4JDRA 1VG9A 3AE5A 3GYJA 1L9EA 3AB1A 4JY3A 3GMCA 3NN6X 4H4UA 3ZDNA 1S3BA 3AE4A 1L9DA 1JRYA 1FCDA 2C73A 5HHFA 1PXAA 4K5RA 2YG6A 4OCGA 4IVOB 4BK2A 1V59A 3H4KA 1Y0PA 2YLRA 4D04A 1JEHA 4YTMA 3ZYXA 1B8SA 5EB5A 1H86A 3NK2X 1ZOVA 2GB0A 2RGJA 3UTEA 4AP3A 1ONFA 1NAAA 2AQJA 2FJEA 2JBVA 4EM4A 1H82A 2BS2A 3AEBA 3NG7X 4BURA 2X3NA 5JCIA 2VVMA 4M52A 1EL5A 1D4CA 4O5QA 1NHRA 2PHHA 2E1MA 2R4EA 3ATRA 3DK4A 2YM2A 3LXDA 5JCMA 1EBDA 1GRAA 3NT6A 4TLXA 5JCNA 4B1BA 4E0VA 1CF3A 4YKFA 3H8IA 5EOWA 3CPIG 2WQYA 4H4XA 5EB4A 5JCLA 2GEWA 2Q0LA 3RHAA 4I59A 3HZLA 4ICYA 2NVKX 1PBDA 4U8OA 1JNRA 2BACA 5C2TA 1BF3A 5U25A 2J3NA 4EMJA 2FBWA 5U1OA 2C76A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IXRA 1TJDA 4ZILA 3LZWA 4FYBA 3S61A 1M2AA 2GS3A 3KMNA 2H70A 4MZCA 4USRA 1K0BA 4ILFA 3PPUA 1SEZA 3BNUA 4ZBAA 1ZYQB 3SYIA 2Z5XA 5ENUA 1NG3A 1D5TA 3M0OA 1OVNA 1T1VA 4YJGB 3GX0A 4HB9A 5HYMA 5J3RA 2X4AA 4CRTA 4TR4A 4RQXA 1ST9A 4BVYB 3TB2A 2C4CA 1Y25A 5KXJA 2BJXA 1ERVA 1VF4A 4JQ9A 2H74A 2VL9A 4PNFA 3OZ2A 4HU9A 4L5LA 2GZYA 4RI6A 1DE1A 2YJHA 3TRQA 1NHYA 2L6CA 4K9ZA 2VLVA 2TRCP 2HSHA 4REKA 3NIXA 2YZHA 2XLPA 2KP1A 3NOFA 1NDAA 1Y56A 5KVIA 1AC1A 1R7HA 2X8HA 3A5IA 4OWYA 5D8IA 1O5WA 3TJFA 2GQFA 4ECHA 2CX4A 3AE3A 5EL8A 2C66A 4JBBA 2OBIA 3KP8A 3G7IA 4H2NA 2AAWA 3ZFLA 4AP1A 2BMXA 5EY6A 5HQPA 3WYWA 2XLTA 1VF1A 2WOWA 5EBKA 2B9XA 3KA7A 4AJ6A 1IYHA 3I6AA 4BWQA 4KA0A 4K0NA 5E4WA 3CUKA 1TRVA 1BQ7A 3SX6A 1T00A 1W4XA 4IJ3A 2BA9A 2LJAA 2NTOA 4I97A 1GLQA 4MA9A 3ITJA 3NRNA 2FHEA 5DBJA 4BV6A 3EWLA 3CQFA 3EMPA 4KSOA 4OMVA 3AEDA 5ECLB 4GXZA 1J9BA 3FZ4A 3DK9A 1VE9A 1SK1A 1UC7A 2Z9SA 2QKEA 1PHHA 3Q19A 3E3EA 2I3YA 3UTFA 1IUUA 3GD4A 3UKQA 3EE2A 3VWXA 2DU8A 1NM3A 2DJ3A 3QCPA 4FYCA 1USBA 4NNJA 2CVJA 1H4OA 3HVXA 2BCGG 4F82A 2BXRA 1GL8A 1SJIA 2CULA 1QFNA 2C7GA 2OE0A 1VQWA 2RABA 1GSQA 4KX6A 1OC8A 2VRLA 2VOCA 1SKSB 3ZNPA 3LXZA 3VRAA 3RP6A 2QA1A 5J9BA 2B7SA 1FAAA 2LUSA 2XYOA 3LYKA 2IFQA 4WXTA 1AN9A 1AAZA 1XVQA 4GTUA 1PJ6A 1T4ZA 3TGZA 1GV4A 2NBSA 3PS9A 10GSA 3HKRA 3NGCX 4K5SA 2YZUA 4BA7A 4A6NB 4EQRA 3IWAA 1FW1A 4KCAA 2WBAA 4H7UA 1Z6MA 2VM2A 4NTEA 3AD7B 3GMFA 4BJYA 3MWHA 3GN3A 4X1UA 1S2QA 4TVEA 5FWGA 4NWZA 4K2DA 2HZEA 4CW9A 2ES7A 3RHCA 4GAPA 5J41A 3KPKA 2ZBWA 4CDOA 1NHQA 3A2WA 2WPCA 3UCLA 1Q4JA 3D1CA 3GFKA 4ZB8A 3ERFA 5KWFA 2HI7A 2PMTA 4G74A 3GL3A 3AE2A 3KKJA 3W4KA 3II4A 3ALMA 1PXCA 4IN0A 1TRSA 1SL2B 1X5CA 5DCGA 5LCZA 5JWQB 2EIQA 3CGBA 1GUHA 4H4WA 1K4QA 3DJGX 1PL1A 2WEUA 3UKLA 2LV3A 3L1RA 2C3TA 4KDUA 1G6YA 1K0NA 4O7HA 2VLUA 3GYKA 5A4WA 3H79A 4U8NA 3W4JA 3M0FA 1PN9A 2EIRA 1NHSA 4NV5A 4BL7B 5CRGA 4DGKA 5G5FA 1K3YA 3BI2A 3GA4A 1VF3A 2MMZA 2I0ZA 5TR3A 3CNJA 2R4VA 3QR6A 3ZNNA 4Z25A 4NAXA 1KFYA 3V3OA 1S3CA 3ZL5A 1YQ4A 4YJFA 4YSZA 3AYJA 1MD3A 2NVLA 1BGNA 2OBKA 3UMAA 4N10A 2LQOA 1L9CA 2FA8A 3AE1A 3H8QA 1K0OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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