4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

3ABVA 3AEGA 2BABA 1Q1RA 3L1RA 3AD7B 5JCMA 2X99A 4UDPA 3IF9A 3OZ2A 1Q9IA 2C67A 2XLPA 3NYEA 3AE9A 4U8NA 3SGLA 2GRTA 1DJQA 1XHCA 5FMHA 3QVPA 1K0LA 1IUUA 2V3BA 4Y4LA 2BK3A 2XVFA 3ATQA 3AYIA 1W4XA 4IA5A 4EQRA 1Z6LA 4AOSA 2WS3A 2XFUA 2GVCA 1B4VA 1YQZA 4AT2A 1OJDA 4U8MA 1GESA 1CC2A 3AEDA 1TDEA 1CJ2A 2B9XA 1CJCA 3AECA 4Z25A 1BGNA 3CIRA 2R9ZA 4RG3A 2Q6UA 3KA7A 2AR8A 3EAOA 4U2LA 4EQSA 2Q7VA 2C73A 3LADA 4H4WA 3DK4A 1PBEA 2WBAA 2BS2A 1D4CA 3KLJA 4OVIA 3IHGA 3UKLA 4BV6A 4B65A 2QA2A 5IPYA 4E0VA 1Y56B 4DSHA 2V5ZA 1E6EA 2JAEA 3CNJA 5KWFA 1H6VA 1CHUA 1LJ1A 4M52A 1M64A 3BI2A 4EQXA 3AE6A 4DSGA 2AQJA 2BC1A 2AAQA 4REKA 3AD9B 1JNRA 1NEKA 2Y6QA 3BI4A 2WPFA 3NN6X 5ER0A 5J7XA 5BUKA 1K0JA 3D1CA 2YG7A 2BA9A 2GEWA 1QJDA 3FBSA 2APGA 3H8IA 3IC9A 1MXTA 4NTDA 4I59A 3GSIA 4J2WA 4O5QA 4JY2A 2YM2A 3GYJA 4EM3A 2JB1A 1EBDA 4BK1A 1O94A 5EB4A 2JK6A 3C96A 1TDNA 3GRTA 1KNPA 1PBFA 3AYLA 1VRQB 5DBJA 1MOKA 1KSSA 2GAGB 3L8KA 1H7WA 5LV9A 4Z2UA 2R46A 2GF3A 3GWFA 1NG3A 1PXAA 1GNDA 1LPFA 1BZLA 1SEZA 3PO7A 3UKFA 2WPCA 3F8DA 5JCNA 4H4RA 3G5QA 1TDOA 2CFYA 3KU9A 1GEUA 4K5RA 1HYUA 2C72A 2XFNA 2TPRA 2YVJA 3BI5A 1GREA 3ICRA 4EIPA 3NN0X 3PVCA 4YWOA 3GMCA 1XANA 1BF3A 2E1MA 3DJJA 1ELIA 3UTEA 2UZZA 2BXRA 4KPRA 3UP4A 4A5LA 1FEAA 4J31A 1D4EA 3AE2A 4C3XA 3V76A 2BC0A 1YQ4A 1AOGA 3NYFA 3ALMA 3UKPA 1B5QA 2C76A 4UDQA 3NH3X 2Q0LA 1CL0A 2XLSA 2EQ8A 4U2SA 2RGJA 4A9WA 4JNQA 1L9EA 4YKGA 3EF6A 1NPXA 3AE4A 1EL7A 4LA1A 2BYBA 2IVDA 4ICYA 2XVIA 2XVEA 4RG4A 2FJEA 3DMEA 3H8LA 2WPEA 2BK5A 5IQ1A 3DH9A 1LQTA 3K7TA 3S61A 3K30A 4YSHA 2VRLA 4EM4A 3G5RA 4HB9A 4OPTA 1OJCA 4GCMA 1K4QA 3RP7A 3C4AA 5U63A 1JOAA 2WDRA 4EMJA 1E1KA 1DODA 1E1MA 3FPZA 4TLZA 1RYIA 2WU2A 1IUWA 4JDRA 3LJPA 2Q0KA 3P4QA 1H82A 3NRNA 1N4VA 4B63A 2V3AA 4YSYA 1KFYA 3AXBA 3SFDA 2C3CA 1D7YA 3NK0X 2FJBA 4CY8A 4WX1A 4H4SA 3KKJA 1DOBA 4WCTA 1IJHA 4IVOB 3COXA 4Z44A 3LZWA 4B69A 2DKHA 3UCLA 3NK1X 1QLBA 1JRYA 3DGZA 4U8LA 1ZY8A 2YG6A 3I3LA 2VOUA 1N1PA 1GSNA 2GH5A 4APNA 4CBQA 3FMWA 4OPUA 2WOWA 2BS3A 2WHDA 1PS9A 3S5WA 2C66A 1S2YA 2O9ZA 2GAHB 1KDGA 3M12A 5GRTA 1PJ7A 2GR1A 2H88A 2QA1A 1EL9A 4TM3A 4ZCCA 3SFEA 5EB5A 1FECA 2OAMA 2JB3A 4NTCA 1GRFA 1LVLA 2X8HA 1P2HA 4GUVA 1IUVA 2JB2A 1JRXA 1N4UA 3OC4A 3NG7X 1VDCA 1RSGA 5BRTA 4JY3A 3GDPA 4NEWA 4BK2A 3AE3A 3CNPA 2E5VA 1D7LA 1YKJA 3AE1A 4GDPA 1Y56A 3SQPA 3V3OA 4EMIA 1ZDLA 2R4JA 2VVMA 1ZX9A 4J34A 4Y4NA 2EQ6A 4UDRA 1KSUA 5EBKA 4BK3A 4ECHA 1ZOYA 1F8SA 1S3EA 1NHSA 2B7RA 4NEVA 4H4XA 3K7QX 3NYCA 2CVJA 3JSKA 1DJNA 1LTXR 2CDUA 5JCIA 1OJ9A 1K0IA 1NHRA 3ICSA 2C70A 3DJDA 4I58A 2ZBWA 5EOWA 1UKVG 2EQ9A 3CGDA 2YAUA 3RNMA 2BS4A 3IHMA 5KOWA 2GR0A 4CY6A 2VZ2A 4H4QA 3ITJA 2X8CA 2PYXA 4YTMA 4GRTA 5FS9A 2YG4A 3CPIG 4CCQA 3AE7A 3AD8B 3KD9A 3GWDA 3RHAA 4Z2RA 1FCDA 1REOA 3P4PA 4FK1A 4A6NB 4TM4A 1E7PA 4USQA 3UKQA 3QFBA 2ZZ0A 2WDQA 2XFOA 3VRAA 1B37A 4Y4MA 3NT6A 4JQ9A 2R0GA 2BACA 2YLTA 3UKKA 1MO9A 4B1BA 1VG0A 2E4GA 3O0HA 3M13A 2BXSA 1FL2A 2R45A 3NGCX 4K2XA 2CULA 3M0OA 5HY5A 3LXDA 1PBCA 2OA1A 2YVGA 2FJDA 2FBWA 1S3BA 3AEBA 3DA1A 1Y0PA 3KVEA 3UTGA 4ADWA 2GV8A 2XLTA 1E39A 5KVIA 1GOSA 2VRMA 2X50A 1D5TA 3ADAB 1FEBA 3SM8A 4C5OA 1L9CA 2A87A 2Z5YA 5U1OA 4DNAA 4LIIA 4B66A 1GALA 3NIXA 4A65A 4UP3A 2WP6A 1TYPA 4Z26A 3GRSA 1JNZA 1PXCA 5IQ4A 5KRQA 2JBVA 3VRBA 1O95A 2WP9A 3D8XA 3IWAA 5CQFA 3E1TA 2GMJA 3V3NA 2WEUA 4H2PA 4BURA 2YLXA 3B3RA 3NNEA 2GR3A 3VRDB 2XLRA 1IUSA 1PJ5A 2PHHA 5C2TA 1BGJA 1LQUA 2GMHA 3P9UA 4TLXA 4NZHA 1EL5A 3ICTA 5FS8A 1JRZA 2B9YA 3LOVA 2ZZBA 1B8SA 4FDCB 3URHA 1PDHA 3UTFA 3QJ4A 4X9MA 3EANA 4Z24A 2V60A 2X3NA 4K22A 2Z5XA 3QSSA 2XLUA 3RP6A 4OCGA 1JU2A 1D4DA 1EL8A 1XDIA 3P1WA 4AP3A 1NENA 3NKSA 2GQFA 2R0PA 1COYA 2V6OA 4H4TA 1NG4A 1CC4A 2YR5A 4A7AA 5U25A 5HHFA 3T37A 4OPLA 4U8OA 4C77A 5KOXA 3EPTA 1PXBA 4PAAA 1PJ6A 1ZP0A 2WDVA 3BHFA 3GDNA 4XWRA 4B67A 1FOHA 5KVHA 1TRBA 4OPIA 2WOVA 2VQBA 3ATRA 4RSLA 1CJ3A 1KF6A 4D03A 3AE5A 3CNDA 4CNKA 1NDAA 1GERA 3PS9A 2YG3A 2YR6A 3CNSA 3VQRA 4OPGA 1X31B 2ACZA 3DJEA 4K8DA 3WE0A 2XFQA 4TM0A 1F6MA 4U8KA 1OJAA 5FS6A 4B68A 1DOEA 4CRTA 1GT8A 5M10A 2RGHA 2WETA 3DK8A 1YY5A 2XCGA 5J60A 3NHOX 4EMWA 3LB8A 3G5SA 4B64A 1O5WA 4TM1A 5KXJA 1CC6A 4Z2TA 2XDOA 2Y6RA 3K7MX 4K7ZA 3DJGX 2YWLA 4EIQA 1KNRA 3GD3A 3HZLA 3QSEA 4GF7A 1RP0A 5BVAA 5GSNA 5FS7A 5L46A 2XFPA 3ZDNA 2B7SA 4DGKA 3QVRA 3NTAA 4X9NA 2JKCA 4GR1A 2QCUA 3UKHA 3UOXA 3F8PA 4A6NA 1H84A 1CJ4A 4H4YA 3BNUA 1IUXA 4CNJA 5M0ZA 3CTYA 3QFAA 2YLSA 2B76A 3Q9TA 2H89A 3ALJA 1CBOA 1H81A 3BHKA 4YSZA 5HYMA 2XVHA 2YVFA 4H4PA 4FX9A 4A99A 3P4RA 4AP1A 3FIMB 3CGCA 2WESA 4IV9A 2OALA 4Z43A 4OPDA 4H2NA 1N4WA 5JCKA 2B9WA 1ZKQA 2R0CA 2YR4A 4YSXA 2F5ZA 4ZCDA 2R4EA 2WOIA 4ZN0A 1F8WA 1YQ3A 1E1LA 4YKFA 3AEEA 3F8RA 2WP5A 3NK2X 2NVKX 4JN9A 4BJZA 4H2QA 3AEFA 4H4VA 2C3DA 3LZXA 1S2QA 2BCPA 1GETA 4O5UA 2I0ZA 4CCRA 3FG2P 1CF3A 1H7XA 3ISHA 3UOVA 3AE8A 1VQWA 1DOCA 2TMDA 3UKAA 3DGHA 4EQWA 4P9SA 4N9XA 2EQ7A 4J56A 2WQYA 1GPEA 3NTDA 5JCLA 3ZYXA 4GDEA 3CN8A 1M6IA 4U2TA 2C75A 1P2EA 5BULA 4C74A 4K5SA 4H4ZA 4IA6A 2BCGG 3VR8A 2YLZA 3DK9A 3REDA 2BK4A 1GTEA 3H4KA 3CPHG 1L0VA 1ZMCA 3BNMA 2W0HA 3AEAA 3AWIA 2WU5A 4D04A 4H50A 1GRTA 1TYTA 4J33A 3UTHA 1IUTA 1E1NA 2QAEA 1NAAA 4BJYA 2YLRA 1V59A 2XVJA 2ZZCA 4MJWA 1JEHA 1ZOVA 3KPFA 1PN0A 2VVLA 4H4UA 2VQ7A 3QSMA 3AYJA 1BKWA 1GRBA 4FK1C 1VG9A 3UOYA 4PABA 1PHHA 4U8PA 2C64A 1PBDA 4OPCA 5HXIA 2YQUA 1LV0A 3Q6JA 3GD4A 3R9UA 3P4SA 4IVMB 2RGOA 1BWCA 4J57A 1TDKA 4YT0A 4AT0A 4JNAA 3GYIA 4H2RA 2YG5A 3CNTA 1GXFA 3II4A 2C65A 4J36A 2J3NA 1TDFA 2GR2A 1GV4A 4KX6A 1GRGA 5C3JA 1DXLA 4LU6A 4H7UA 3CGEA 2GB0A 1PBBA 1F3PA 2ARDA 2IVEA 1GTHA 4U8IA 3NLCA 2HQMA 3ALLA 2FJAA 3UOZA 1DNCA 2X8GA 2A89A 4U8JA 1ZK7A 5TR3A 3GMBA 1H86A 1Q1WA 1XPQA 2OLNA 2NPXA 3B6DA 2DKIA 2YM1A 1F8RA 3VR9A 2IIDA 4YXDA 3C4NA 3CPJG 4NTEA 3CGBA 4XWZA 4XXGA 4USRA 4YTNA 3AB1A 4HA6A 1ONFA 3I6DA 4A79A 3RP8A 4X4JA 1NHPA 2OLOA 2XYOA 1NHQA 1ZMDA 2C7GA 2YLWA 1QO8A 2VVLG 5CKUA 4C3YA 3UP5A 1GRAA 4AOXA 1L9DA 1OJTA 1GRHA 2GQWA 2RABA 4YTPA 2A8XA 2V61A 1H83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3AEGA 1Q1RA 3L1RA 2X99A 1X5DA 5J9BA 3KGKA 5IMCA 3NYEA 5ID2B 1YQ1A 2GRTA 2K8SA 3RPNA 4G0IA 3UJ1A 1YKAA 2V3BA 2BK3A 2XVFA 3ATQA 1XIYA 4IA5A 1Z6LA 2C3QA 2WS3A 5LCZA 1YQZA 1GESA 1TDEA 2VCWA 2RUEA 2F3MA 3FZ5A 1BGNA 3FR3A 3ERFA 2GQMA 3EAOA 4K9ZA 4EQSA 4N11A 1FAAA 4PUFC 3O76A 2AAWA 4BL7B 5A4VA 1VF2A 3BOAA 5IPYA 1AIUA 4E0VA 1OKTA 1E6EA 2V5ZA 5KWFA 1H6VA 1CHUA 2AQJA 2AAQA 4REKA 1TXXA 5C00A 5B8AA 1JNRA 2Y6QA 1NHOA 2WPFA 5KN1A 3NN6X 3GH6A 3UMAA 1PD21 2AHEA 3H8IA 2GEWA 1BG5A 1EEJA 5COHA 4JY2A 3GYJA 3C1SA 2BRYA 1R5AA 1EVIA 1T4ZA 3L8KA 2VCTA 1H7WA 4IS0A 4POKA 2H6ZA 1A2LA 1UVZA 2GSRA 3GSTA 2CVBA 2H6YA 1S3AA 1MDJA 3G7JA 4GRFA 3PO7A 3UKFA 2WPCA 4H4RA 3G5QA 5ELGA 3KU9A 5DJMA 4F0BA 4ZXGA 4EDZA 2TPRA 4XIHA 4EIPA 1K0OA 1OAZA 2VL2A 1AUCA 3HYXA 2BXRA 4KPRA 4A5LA 4TVEA 1FEAA 2M72A 1O8XA 3AE2A 2HXKA 2QKEA 4KCAA 5HFIA 1GUKA 3IOSA 2DU8A 2BRAA 1BJXA 4A9WA 2CAQA 1B8XA 3D4MA 2IVDA 4ICYA 2XVIA 4XRAA 4AJ8A 2VCVA 3GIXA 2B5EA 5IQ1A 3PR8A 2DJ3A 1HNCA 3IR4A 2AB6A 5DCHA 4TR1B 3GHAA 1OJCA 5CRHA 3RPPA 1K4QA 3RP7A 1PL1A 5U63A 2HSYA 2WDRA 4EMJA 1RYIA 5DQYA 1IUWA 2WU2A 2L4CA 3KMNA 3LJPA 3NRNA 4B63A 3APQA 4YSYA 2FNOA 3Q6OA 2GT5A 4WX1A 2IMEA 3LZWA 14GSA 4E8EA 1ZY8A 3I3LA 1ZYQB 1GTBA 3IV4A 4APNA 2GZZA 5DQSA 3KH9A 5DALB 4OPUA 1U87A 3S5WA 1DE1A 2TRXA 3C1RA 1PJ7A 1PRXA 3HJPA 1HNAA 2H8LA 4RUVA 2X8HA 1P2HA 2ZCTA 5IMAA 3GX0A 3I6AA 4TXVA 1N4UA 2C0DA 3NG7X 3P8WA 4JY3A 3GDPA 4BK2A 3AE3A 3CNPA 2NPBA 4LMVA 2LJKA 4KX4A 5IPGA 4WKWA 3AE1A 1RK4A 1F3AA 1XZOA 2FCHA 2YP6A 4J34A 4UDRA 2WRTA 1ZOYA 5G2ZA 5ECHB 5B6NA 4YJHB 1F8SA 2G0FA 3NYCA 1LTXR 1NHRA 3IAS2 4G73A 5EOWA 4KSMA 4JE1A 1ERTA 5KOWA 3GKMA 1WPIA 2X8CA 1WWJA 2O7KA 1Z9HA 3CTGA 2LNSA 3AD8B 4Z2RA 1ZCPA 4WBRD 2YWIA 4IP1A 3QFBA 2PPTA 2VCQA 4DEJA 2EC4A 2ZUPA 1B37A 4JQ9A 2BACA 1MO9A 4B1BA 2E4GA 2C1YA 2R5GA 3NGCX 3IPZA 4K2XA 3LXDA 2XHFA 4BVXA 1K0CA 3MAKA 2FBWA 3AEBA 2R37A 2GS3A 2DJJA 1EEMA 3F4SA 1TKDB 2XLTA 2VAFA 3W8JA 1GOSA 1A8YA 2X50A 3F6DA 1FEBA 3QCPA 4B66A 5DBQA 4ZL8A 2AUVA 5A5KA 4GXZA 3CXGA 3PINA 3AY8A 5KRQA 1MD4A 1SL0B 3A5WA 3DD3A 1SU9A 2WP9A 4KNDA 5CQFA 5IMDA 4YQUA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4EIQA

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