4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

2GR1A 3GWFA 5FS7A 3UOZA 3ICTA 1EL7A 2V3BA 1E1LA 1ZMCA 3LZWA 4NEVA 4JY3A 4X4JA 2NVKX 3Q9TA 5KRQA 2B9WA 2WP5A 2XFOA 1V59A 1N4UA 3ALJA 2WHDA 2XFPA 2GVCA 1XPQA 2BS2A 4JDRA 2YG6A 3SM8A 2ZBWA 4B69A 2R9ZA 4GRTA 5M0ZA 2B7SA 3ABVA 5EOWA 1D4CA 1YQ4A 1ZDLA 3SGLA 3RP6A 1PS9A 1TYTA 2XFNA 1QO8A 3BHKA 2XCGA 4OPTA 2YLZA 3GRSA 3UOVA 2EQ9A 2JKCA 2YAUA 3DK4A 1PJ5A 1F6MA 4J33A 4U8IA 4APNA 1SEZA 1NDAA 2Y6RA 3UTHA 2BS3A 2CDUA 4Z24A 5CQFA 2HQMA 3NK1X 3GD4A 3H8LA 4Z26A 3D1CA 1S2QA 3NK0X 1L0VA 1GEUA 2PYXA 4H4WA 1IUWA 1ZMDA 1H83A 1NHQA 2VQ7A 4BK3A 4C5OA 2JBVA 2WP6A 4TM1A 3FMWA 1CBOA 1PDHA 4IA5A 4Y4NA 1IJHA 2XLSA 4NTDA 2C3DA 2ZZBA 3P4SA 2X3NA 2EQ8A 3AE5A 2OA1A 4XXGA 3NGCX 3NTDA 3NK2X 1GV4A 1TDOA 4M52A 3SQPA 4A6NA 4HB9A 3UOYA 1PXBA 1M64A 4DSHA 1K4QA 3AE9A 1PBBA 4ADWA 2WU2A 3GDPA 3GMBA 4REKA 5L46A 1MXTA 1BZLA 3NG7X 4Y4MA 3UKAA 4U2TA 3NTAA 1Y56B 4XWZA 2R4JA 2WDRA 3GWDA 2YG3A 3UKKA 5J60A 5IPYA 2VRMA 2A87A 2JK6A 3PVCA 1BGNA 1VQWA 4A99A 5JCMA 2EQ6A 3P4PA 3AE4A 1D4EA 2YG4A 1IUSA 1COYA 2GAGB 2Q0LA 4GR1A 5C3JA 3I6DA 1LQTA 2IIDA 3DH9A 2WOVA 4A9WA 2CFYA 3NYEA 1N4WA 1TYPA 5BRTA 1NENA 2OAMA 3ICRA 3AXBA 4JN9A 3KU9A 2WBAA 3KD9A 1CJ2A 1OJ9A 1Q1WA 4BV6A 2BK5A 4PAAA 1GETA 1M6IA 1OJTA 4B67A 3CN8A 3JSKA 1CF3A 4J31A 3AB1A 3CNJA 5HYMA 1H7XA 4A5LA 3IWAA 3CNTA 5EB4A 2C76A 2F5ZA 1EL8A 4AOXA 1E1NA 2DKHA 3KKJA 2OLOA 1P2EA 3H4KA 4U8MA 1CC6A 1FCDA 1DOEA 2ACZA 5BVAA 3KVEA 3G5RA 2WOIA 4IVMB 2YLSA 4B64A 4H4QA 2WPCA 3VQRA 1NPXA 3NRNA 3NYFA 4D04A 3PO7A 2YVGA 3G5SA 4DNAA 2BXSA 4U2LA 3REDA 1L9CA 2BCPA 2V3AA 2XLTA 3P4RA 4H50A 1OJCA 3HZLA 2GV8A 3LXDA 3R9UA 3F8PA 4A6NB 5DBJA 1F8SA 1H6VA 2GQWA 4Z2TA 4AOSA 1JEHA 2GB0A 3UKLA 1K0JA 3KLJA 1E39A 2YVFA 1KSSA 4YKFA 3VRAA 3CPHG 3EANA 2VRLA 3URHA 4B65A 4C74A 2GR2A 1IUXA 1LVLA 3UTGA 2JB1A 3FBSA 4CNJA 4YTNA 2BABA 1NHPA 2BACA 3NT6A 1TDEA 2GRTA 2YWLA 3K7QX 4GUVA 5C2TA 3RP8A 3CIRA 2YLTA 1F8RA 1D4DA 1FECA 2TPRA 2QA2A 1L9EA 1PBCA 1D7YA 1VDCA 3ITJA 4OPGA 3NIXA 2VQBA 3II4A 1MO9A 2OALA 4YKGA 4OCGA 3LJPA 1GREA 2YM1A 5U63A 1LV0A 4FDCB 5CKUA 2C73A 1W4XA 2YLRA 4Y4LA 5J7XA 2H89A 2GF3A 3AWIA 2WU5A 3VR8A 2VZ2A 1NG3A 2YG5A 4UDQA 3CTYA 3LOVA 1EL5A 2VOUA 4JY2A 3P4QA 4GCMA 1NEKA 2BC0A 3S61A 4EMWA 3GYJA 3CGCA 4H4VA 1B37A 1F8WA 5KVIA 3AD9B 3AYIA 2WQYA 4GF7A 1B8SA 2C67A 1O94A 2Q6UA 2X50A 4H4PA 4J36A 1GRBA 4I59A 3ALLA 2XVEA 3BI2A 1Q9IA 2Q0KA 3B3RA 5TR3A 1ZX9A 4PABA 3V3NA 2CVJA 4ICYA 2ZZ0A 4A79A 2I0ZA 4O5UA 3EAOA 4J2WA 3AE3A 1GRGA 4E0VA 4U8PA 3AEFA 3RNMA 4A7AA 2IVEA 4BJYA 3AECA 3NH3X 4H4RA 2BS4A 5EBKA 2XFUA 2B7RA 3WE0A 3CNDA 1H82A 1NHSA 3GYIA 2R45A 3COXA 2AQJA 1GOSA 4UDRA 4YXDA 1RSGA 2V60A 4H4ZA 3AD7B 1NG4A 1NHRA 4BJZA 4BURA 1OJDA 1PJ7A 2ZZCA 4IA6A 5JCKA 2QCUA 4WCTA 3ALMA 1K0IA 4USRA 1FL2A 1O5WA 2V5ZA 4A65A 1H84A 1KNPA 3QSEA 4CY8A 1ZKQA 4TLXA 4LA1A 3AE2A 1ZP0A 1GRTA 2FJEA 1KSUA 4B63A 1AOGA 3CPIG 2JAEA 2A89A 3FIMB 2C75A 1OJAA 1UKVG 4K5SA 2C7GA 3QJ4A 4BK1A 4D03A 3C4AA 1CJ4A 1FEAA 4U8NA 4CCQA 2B9YA 2YVJA 1GNDA 5BULA 1EBDA 1LJ1A 3UP4A 2VVLA 2RGJA 3GSIA 4EM4A 4EQSA 2O9ZA 4LIIA 2BC1A 2BK4A 3H8IA 1YQZA 3P1WA 4YSHA 4OVIA 4FK1C 3EF6A 1CC2A 2V6OA 3UTFA 2GR3A 2Q7VA 4H2QA 1JRZA 3D8XA 2GQFA 2BK3A 4KX6A 4U8OA 4FX9A 1H81A 3K30A 4Z25A 5ER0A 4YSZA 1VG9A 4X9NA 2FJBA 2YR4A 2R0CA 3NKSA 4C3XA 3CNPA 3AYLA 2E4GA 2IVDA 4OPUA 4K5RA 3QSMA 3SFDA 4U8LA 4YSYA 5GSNA 2AAQA 1BKWA 1X31B 3QFAA 1XANA 2C72A 1E6EA 1E7PA 2E5VA 4H2PA 5HXIA 2WPFA 3DK9A 4EMJA 3CPJG 2RGHA 2XLPA 1YKJA 3DGZA 2R46A 4GDPA 2DKIA 2RABA 3UCLA 3UKHA 3UTEA 3IC9A 3VR9A 2YM2A 5GRTA 1IUVA 3KA7A 2WP9A 2GEWA 1QJDA 3QSSA 2WEUA 2YG7A 3E1TA 4UDPA 4Z43A 5FMHA 4Z2RA 4EM3A 3M0OA 4ECHA 2EQ7A 2Z5XA 3DK8A 4C3YA 2X8CA 3AEGA 5FS9A 2XVHA 4ZCCA 1PHHA 2NPXA 3CNSA 4H4UA 1ONFA 1VG0A 4MJWA 5KVHA 2WS3A 2C66A 2W0HA 1PBFA 4HA6A 2XYOA 3F8DA 3NYCA 5U1OA 4CNKA 1TDFA 1ZOYA 4YSXA 2XVFA 2A8XA 3FPZA 2GAHB 1ZK7A 4JNQA 3GD3A 1JRYA 4TM0A 1B4VA 4K22A 2C65A 3IHGA 1Z6LA 4CBQA 1YQ3A 3ISHA 3L8KA 4IVOB 2FJAA 3AE1A 3BI5A 1S2YA 1XHCA 1GERA 4H2NA 1DNCA 3M12A 2QAEA 3FG2P 3I3LA 3UOXA 1IUUA 3AD8B 2WPEA 5KWFA 4RG3A 1KFYA 1RP0A 1DXLA 1E1MA 4N9XA 4KPRA 1DJNA 1GALA 1ZY8A 1MOKA 4B1BA 5KXJA 1VRQB 1FOHA 2J3NA 2X8GA 3ZDNA 2FBWA 3ATQA 5JCNA 1KDGA 1N4VA 3DJDA 4H4YA 1ELIA 1K0LA 3OC4A 4BK2A 5KOWA 2V61A 2C64A 1CJ3A 5M10A 4EIPA 3BHFA 2C70A 3B6DA 2XLRA 3RHAA 2R0PA 1GESA 1PJ6A 1GRFA 4AP1A 3DGHA 3QVPA 4EQRA 4C77A 3QVRA 4OPDA 4AP3A 2XVJA 2QA1A 2APGA 2XLUA 5BUKA 2YQUA 5U25A 4DSGA 3V3OA 4H7UA 2R4EA 3UKPA 1GSNA 4EMIA 5HHFA 1IUTA 1S3BA 1XDIA 1JOAA 1TDKA 1CC4A 4RSLA 3BI4A 3P9UA 4O5QA 4X9MA 1BWCA 4I58A 4K7ZA 1CJCA 3AYJA 1H86A 1NAAA 2Y6QA 4CRTA 4EIQA 3K7TA 1YY5A 2AR8A 3L1RA 3QFBA 3C4NA 3ATRA 2JB3A 1LQUA 1ZOVA 5KOXA 1DJQA 1PXCA 3AEEA 3VRDB 4U8KA 4NTEA 3ADAB 4U8JA 4B66A 4K8DA 2C3CA 1JRXA 1JNZA 3CGBA 3Q6JA 2WDQA 1Q1RA 3NNEA 4H4SA 2YR6A 4NTCA 3AE8A 3ZYXA 2B9XA 3AE6A 1D5TA 2GMHA 4YWOA 3F8RA 2YLWA 4ZCDA 5JCLA 3NLCA 4AT0A 2VVMA 2YR5A 4EQWA 1QLBA 4B68A 1KNRA 1PBEA 3AE7A 4H2RA 4USQA 4NEWA 2RGOA 2E1MA 3LB8A 1LTXR 1GTEA 4H4XA 1Y0PA 3GRTA 5EB5A 5LV9A 4FK1A 3DJJA 5IQ1A 1DOBA 3V76A 2GMJA 3CGEA 3RP7A 1H7WA 3SFEA 1GRHA 3M13A 2H88A 1B5QA 1RYIA 1TDNA 2GH5A 4JQ9A 4U2SA 1LPFA 5FS8A 4OPLA 4AT2A 1JU2A 2WDVA 2PHHA 3DA1A 3O0HA 2BA9A 1PXAA 1F3PA 4Z2UA 2FJDA 1D7LA 2YLXA 4EQXA 2UZZA 4OPIA 2XFQA 2TMDA 3AEAA 2XVIA 3AEDA 1BGJA 3CGDA 3EPTA 2OLNA 5FS6A 4ZN0A 5HY5A 2GR0A 4P9SA 3GMCA 1GT8A 1HYUA 3LADA 4TM4A 4YTMA 3DMEA 1CHUA 4OPCA 1GXFA 3NHOX 5IQ4A 4TLZA 3ICSA 1P2HA 1KF6A 1FEBA 3GDNA 3K7MX 3DJGX 4XWRA 2BYBA 4GDEA 2XDOA 4J34A 3UKFA 1EL9A 4IV9A 3C96A 1DODA 2X8HA 3IHMA 1O95A 2WETA 3OZ2A 3S5WA 1TRBA 2WOWA 4YTPA 4K2XA 3DJEA 3NN6X 3NN0X 3UKQA 4YT0A 1PBDA 4NZHA 1L9DA 2R0GA 4LU6A 4H4TA 1GTHA 2JB2A 4RG4A 3KPFA 1GRAA 1GPEA 3G5QA 3UP5A 1CL0A 1S3EA 3AEBA 4JNAA 3BNMA 2ARDA 1REOA 1N1PA 3IF9A 4J57A 4CY6A 1DOCA 2BCGG 4UP3A 3VRBA 2Z5YA 1JNRA 2BXRA 1PN0A 2X99A 3LZXA 4WX1A 4DGKA 1BF3A 4J56A 3T37A 4TM3A 2B76A 2VVLG 3PS9A 4Z44A 4CCRA 1Y56A 5JCIA 3BNUA 2CULA 2WESA 1E1KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3IOSA 3VLNA 3GWFA 1YEXA 4NEVA 4DSSA 5C00A 2NVKX 4H86A 2XFOA 4USSA 3ALJA 2WHDA 2GVCA 3D6IA 3TJJA 2BS2A 4GRTA 4ISDA 1YEPA 1TYTA 1QO8A 1BEDA 2HSHA 1OC8A 3UTHA 2AYTA 3TRXA 1R5AA 2CDUA 2HQMA 2Z9SA 3D1CA 3NK0X 3KTLA 1L0VA 2LEGA 2E2MA 1H83A 3WGXA 4BK3A 5EL8A 4QFCA 6GSUA 2H01A 4TM1A 2B1LA 2GZYA 1CBOA 4TR4A 1IJHA 3H1NA 5HR0A 3P4SA 2X3NA 5LD0A 3NTDA 3NK2X 4HB9A 1A2LA 1T8EB 4MA9A 5GSSA 3AE9A 3KMOA 3F63A 1A0RP 1ZGNA 1W89A 1MXTA 3TRPA 1BZLA 3NG7X 4KDYA 4Y4MA 3BBYA 4D73B 4DEJA 3UKAA 2MBTA 1M3JA 5G1LA 1Y56B 2R4JA 3GWDA 5D9VA 1HD2A 3GX8A 5IMZA 1TI3A 4V2MA 4II3A 1D4EA 5B8BA 1IUSA 1COYA 2Q0LA 3A3TA 5C3JA 3LYPA 2P31A 1LQTA 1VGLA 2JZRA 3NYEA 4IVFA 3KU9A 1N2AA 4YQUA 2VL2A 3QDNA 2BK5A 4PAAA 1K3YA 2LQQA 1M6IA 1UVZA 4B67A 1MEKA 3CN8A 3JSKA 2DJJA 2HYXA 4ECCA 4MLYA 3IWAA 1E1NA 3HJMA 3KKJA 1CC6A 1XW9A 3R2QA 1DOEA 1FCDA 1O8XA 4PURA 4H4QA 1TJDA 1YKCA 3T31A 2WPCA 4G9KA 3NYFA 4DNAA 5H5RA 3WGEA 2BXSA 4U2LA 3P4RA 3KPKA 4MABA 1OJCA 2GV8A 1X5DA 4ZL8A 3F8PA 3PH9A 1VF4A 2G0FA 2AJQB 5G2ZA 3QR6A 5LCZA 5IPGA 3TJFA 3VRAA 4ZL9A 4II2A 3L9UA 3URHA 4B65A 4C74A 2H70A 2GR2A 1GTUA 1LVLA 2P5RA 4KDXA 3NIVA 4CNJA 1LU4A 2HZFA 1NHPA 1TDEA 3DD3A 3K7QX 1XWCA 2E49A 4HDEA 3ISOA 2QA2A 1PBCA 5B7CA 5JCGA 3ITJA 4NAXA 4OPGA 1EEMA 5IMAA 1S3CA 5AN1A 1U3IA 4OCEA 4OCGA 2VD1A 1FB6A 4Q5QA 5U63A 4FDCB 2GTUA 1PL1A 2YLRA 3EMXA 2GF3A 3AWIA 2L59A 3VR8A 4WBRD 2VZ2A 1NG3A 4UDQA 1Y6EA 2BTOT 4GCMA 2IIYA 3TKQA 2BC0A 3S61A 4EMWA 3CGCA 3AD9B 3AYIA 2R6KA 5H5SA 3GTUA 2KP1A 1O94A 1LJRA 3HZ8A 1EEJA 1K0DA 3I6AA 2XVEA 2CZ2A 4G74A 1XFLA 2GGTA 3V3NA 2LS5A 3PPUA 1K0MA 2FWEA 4L5LA 4TR0A 2JU5A 4F03A 4PQIA 3EAOA 4QFDA 4J2WA 22GSA 1U88A 1GRGA 4U8PA 2LRNA 3AEFA 3RNMA 5DALB 3AECA 3IHQA 1R5PA 4H4RA 5EBKA 3M3MA 5BMUA 4TXOB 2O7KA 3TRQA 2B7RA 2XFUA 4NNJA 4EE0A 3LSZA 1NG4A 4BJZA 2ZNMA 1NSWA 2QCUA 4WCTA 4KCEA 3SWLA 3CXGA 4JU5A 1T4ZA 3KP9A 4TLXA 4MZBA 4LA1A 4DSRA 1G6WA 4MZWA 2GSRA 3FIMB 4EXJA 4HU9A 2C75A 3DIEA 2PPTA 4WBJA 11GSA 3QJ4A 3A2VA 2B9YA 4K9ZA 5BULA 1EBDA 3HA9A 5FT3A 2O9ZA 2H73A 3TB2A 1AXDA 1YQZA 1DSBA 3CRUA 2IMIA 3DYRA 2K8VA 1XVQA 3D0ZA 3UTFA 2Q7VA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3KPF A;  1GRA A;  1GPE A;  3G5Q A;  3UP5 A;  1CL0 A;  1S3E A;  3AEB A;  4JNA A;  3BNM A;  2ARD A;  1REO A;  1N1P A;  3IF9 A;  4J57 A;  4CY6 A;  1DOC A;  2BCG G;  4UP3 A;  3VRB A;  2Z5Y A;  1JNR A;  2BXR A;  1PN0 A;  2X99 A;  3LZX A;  4WX1 A;  4DGK A;  1BF3 A;  4J56 A;  3T37 A;  4TM3 A;  2B76 A;  2VVL G;  3PS9 A;  4Z44 A;  4CCR A;  1Y56 A;  5JCI A;  3BNU A;  2CUL A;  2WES A;  1E1K A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IOS A;  3VLN A;  3GWF A;  1YEX A;  4NEV A;  4DSS A;  5C00 A;  2NVK X;  4H86 A;  2XFO A;  4USS A;  3ALJ A;  2WHD A;  2GVC A;  3D6I A;  3TJJ A;  2BS2 A;  4GRT A;  4ISD A;  1YEP A;  1TYT A;  1QO8 A;  1BED A;  2HSH A;  1OC8 A;  3UTH A;  2AYT A;  3TRX A;  1R5A A;  2CDU A;  2HQM A;  2Z9S A;  3D1C A;  3NK0 X;  3KTL A;  1L0V A;  2LEG A;  2E2M A;  1H83 A;  3WGX A;  4BK3 A;  5EL8 A;  4QFC A;  6GSU A;  2H01 A;  4TM1 A;  2B1L A;  2GZY A;  1CBO A;  4TR4 A;  1IJH A;  3H1N A;  5HR0 A;  3P4S A;  2X3N A;  5LD0 A;  3NTD A;  3NK2 X;  4HB9 A;  1A2L A;  1T8E B;  4MA9 A;  5GSS A;  3AE9 A;  3KMO A;  3F63 A;  1A0R P;  1ZGN A;  1W89 A;  1MXT A;  3TRP A;  1BZL A;  3NG7 X;  4KDY A;  4Y4M A;  3BBY A;  4D73 B;  4DEJ A;  3UKA A;  2MBT A;  1M3J A;  5G1L A;  1Y56 B;  2R4J A;  3GWD A;  5D9V A;  1HD2 A;  3GX8 A;  5IMZ A;  1TI3 A;  4V2M A;  4II3 A;  1D4E A;  5B8B A;  1IUS A;  1COY A;  2Q0L A;  3A3T A;  5C3J A;  3LYP A;  2P31 A;  1LQT A;  1VGL A;  2JZR A;  3NYE A;  4IVF A;  3KU9 A;  1N2A A;  4YQU A;  2VL2 A;  3QDN A;  2BK5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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