4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

4ICYA 2YVGA 4DSHA 4C3YA 1OJDA 3KVEA 2BS4A 2YG6A 3OC4A 1DJNA 4J34A 1LPFA 2GR2A 2V3AA 2YWLA 4RG4A 1GETA 4U8IA 3P4QA 3EF6A 2C72A 4AP1A 3NN0X 1D4EA 4EQSA 2YM1A 3FG2P 3V76A 1LQUA 1PDHA 2BK5A 3P9UA 1GPEA 1MOKA 3I3LA 1GRBA 5FMHA 3S61A 4YWOA 4U8OA 2BS3A 2ZBWA 2XCGA 1E39A 5J60A 5C2TA 1B37A 4A6NA 2BXRA 4YXDA 1D7LA 2GAGB 3UOXA 5IQ4A 1PN0A 3VRAA 5GSNA 2V6OA 3AWIA 1N4UA 1UKVG 5U63A 4H4VA 4TM4A 4ZCCA 2C76A 4B65A 2YR5A 4H4RA 2A8XA 3CPIG 2J3NA 3KA7A 2V61A 3QVRA 4Y4MA 5BRTA 3AEFA 3UTEA 2JK6A 3NIXA 1GRTA 3UKKA 1GV4A 3AEAA 4AOXA 2OA1A 3G5SA 3LXDA 3CNDA 4H4WA 3IHGA 5EB4A 2WHDA 4LA1A 1E7PA 4A7AA 4CCRA 1LVLA 2BACA 3BI2A 4BK2A 2X3NA 4O5QA 3H8IA 1CC2A 4OPGA 1ZKQA 1KSSA 1M6IA 3UOYA 4A6NB 3UTGA 1DOBA 5BUKA 1CJ2A 4H4UA 4U8NA 3AE9A 1DOEA 2GAHB 2YQUA 3KLJA 1ELIA 1PS9A 3FMWA 4H4SA 1XHCA 1XDIA 3CNSA 3QFAA 4JQ9A 1RSGA 1ZDLA 4B64A 4J2WA 1DXLA 2XFQA 2C7GA 3PS9A 5KVHA 4FK1A 2AQJA 2XYOA 1ZOVA 4CNKA 1CC6A 3F8DA 4P9SA 5FS7A 4OCGA 4U8PA 1LJ1A 1NHPA 2WPCA 4U8KA 4NZHA 1KFYA 3UKLA 2WP6A 3B3RA 1E1LA 4EIPA 4KX6A 2QCUA 3UKFA 4CNJA 3C4NA 4B66A 2C3DA 4UDPA 4H2RA 5L46A 3QVPA 4OPTA 2XVHA 1NDAA 2V3BA 3H4KA 3ICSA 1GRGA 2XFUA 4J56A 5JCMA 1JU2A 4H2PA 4GUVA 5EB5A 2Q6UA 2YVFA 1S2QA 3NYEA 1TYTA 3UCLA 2B9XA 4C74A 4H50A 4TLZA 3IF9A 3ALJA 2Q7VA 1XPQA 4J36A 1PXBA 2Z5YA 2FJDA 3M13A 3URHA 3ADAB 3E1TA 3KKJA 4CBQA 1ZY8A 2XVEA 4H4XA 4USQA 3AYLA 1TDOA 1CF3A 4YTNA 3CNPA 4BURA 4IVOB 3LB8A 2X8CA 4H2QA 1HYUA 1BZLA 2EQ8A 2GMHA 1N4WA 2WOVA 3ABVA 4GDPA 2ZZBA 3RP7A 4EQXA 3AXBA 4WX1A 2FJBA 3IC9A 4REKA 5KOXA 3ALLA 5KVIA 3UOVA 4DNAA 4E0VA 1AOGA 4NEWA 1K0LA 4YSHA 1FEAA 2OLOA 2YLRA 4YSYA 3ICTA 3I6DA 3AYIA 1BKWA 1RYIA 2BXSA 2R0CA 2E5VA 4GR1A 2YAUA 3O0HA 4XWRA 1NPXA 3NNEA 2Y6QA 3AE6A 1B5QA 1KDGA 1VRQB 4X9NA 2WDRA 1BGNA 1VG0A 2WOIA 3NK0X 4X9MA 3VRBA 2GR3A 1JRXA 4APNA 2Z5XA 3CGBA 5M10A 4D03A 2EQ9A 2X50A 3QSSA 1O94A 4JY3A 1EBDA 3AE2A 2Y6RA 4XWZA 3VR8A 3CGCA 2C65A 4FDCB 1BF3A 2FJEA 3DGHA 2UZZA 1K0JA 4PAAA 1E6EA 2B76A 3CPJG 3AD8B 3AEEA 2BABA 4U2TA 5KOWA 2JKCA 4U8LA 5FS6A 1CJ4A 4C5OA 4DSGA 2YR4A 1NHSA 1N1PA 1GRHA 1PBEA 3BI5A 2AAQA 1DJQA 5BVAA 2XLPA 2TMDA 3VRDB 5JCNA 3RNMA 4XXGA 2YM2A 2VRMA 4BK1A 4U8JA 4U2SA 1H7XA 2RGOA 4H4TA 4EQRA 1OJAA 3AE4A 2GH5A 5EOWA 2BK3A 1TDNA 2C64A 1TDKA 2IVEA 1M64A 3GD3A 2JB2A 5KXJA 3NYFA 1CJCA 5KWFA 1EL5A 2VVLA 3DJDA 3DH9A 2BCPA 3FIMB 4K8DA 3GDNA 3EPTA 1K0IA 2GR1A 4A79A 4TM3A 4NTCA 3EAOA 3DK8A 3P4SA 3REDA 1PJ5A 3GWDA 3K30A 3LOVA 4B68A 2YLZA 4Y4NA 1GXFA 2QAEA 3GYJA 4H4PA 2BC1A 3F8RA 2OLNA 4USRA 4Z2UA 3QJ4A 4JDRA 4DGKA 1D4DA 2NVKX 2AR8A 1Y56A 2I0ZA 3GSIA 1NHRA 3DMEA 1VQWA 3GRSA 4Z43A 2C73A 2EQ6A 4J31A 2VZ2A 1GESA 1GALA 1YKJA 4Z25A 3ITJA 2WU2A 4H2NA 1PBDA 3DK4A 3DJEA 1P2EA 2WS3A 1IJHA 1Z6LA 3DJJA 3G5RA 3VQRA 5CQFA 2XFPA 2OALA 1YQZA 3AB1A 4BJZA 1MO9A 3ZDNA 1Q1RA 3ISHA 4PABA 2WQYA 3BI4A 3V3NA 1L0VA 4HB9A 4NEVA 4A5LA 1F8SA 2XVIA 3M12A 1FOHA 5FS8A 4GRTA 1FL2A 1OJ9A 4UDQA 3L1RA 3UKPA 5JCLA 5C3JA 3BHKA 2R9ZA 2JB3A 2R0GA 2VVLG 3ICRA 4OPLA 1Y56B 4H4ZA 2GF3A 1BGJA 2VVMA 3HZLA 4A99A 2C66A 3GDPA 4OPCA 1O5WA 1QLBA 1DNCA 1H81A 1ONFA 1PJ7A 5U1OA 1IUVA 1LQTA 2C70A 1PBBA 1YQ3A 2IIDA 1IUSA 1X31B 1D4CA 1TRBA 4B63A 1VDCA 4YSZA 1N4VA 3AE7A 3C4AA 1P2HA 2APGA 2ZZCA 2C67A 2JAEA 1FECA 1LV0A 2O9ZA 4UDRA 4ZCDA 1PXCA 2WPEA 3UTFA 4Z44A 1H86A 4I58A 1GERA 2NPXA 1PBCA 2XLTA 1K4QA 3GYIA 4EIQA 3D8XA 3AECA 1BWCA 5U25A 4AT0A 2CVJA 5EBKA 1GNDA 1IUXA 1KSUA 2BC0A 4FX9A 4H4YA 2CFYA 2X8GA 2PHHA 2XFNA 4EM4A 1DODA 1CL0A 3BNUA 4TM1A 3ATQA 2W0HA 2XLRA 5GRTA 2WPFA 3P4RA 5DBJA 3UKHA 1CJ3A 1ZP0A 2GEWA 3CTYA 4UP3A 1H7WA 1O95A 2X8HA 3DK9A 1ZOYA 2QA2A 1NEKA 1SEZA 3CNTA 3V3OA 1PXAA 4A9WA 4TM0A 3SFDA 1FEBA 2XVJA 3AE1A 3G5QA 2Q0KA 4B1BA 2Q0LA 4JY2A 2YR6A 1VG9A 4LU6A 4ADWA 4GCMA 1NG4A 1W4XA 1GT8A 2XLUA 2WEUA 4IVMB 1L9DA 1RP0A 4U8MA 2R45A 2VQBA 3NK2X 3QFBA 3C96A 4EMWA 3GRTA 2CULA 2WU5A 3SFEA 1B8SA 3K7TA 2C75A 2WDQA 3GD4A 4YT0A 5KRQA 4N9XA 3UKAA 5JCKA 2WDVA 3NKSA 2YLSA 4H4QA 2XLSA 3AD7B 3RHAA 3GMCA 1NG3A 4JNQA 1E1NA 2V60A 4EQWA 4OPUA 1COYA 4MJWA 1PBFA 1S3EA 4ZN0A 4EMJA 2YLWA 2E4GA 4HA6A 4EM3A 2RGHA 2A87A 3AEDA 2C3CA 2ACZA 3DJGX 3F8PA 3FPZA 3OZ2A 2XFOA 3SQPA 5M0ZA 1L9CA 3H8LA 1ZMCA 1NHQA 3AE3A 1NAAA 3D1CA 3AE8A 3ATRA 3NGCX 3UTHA 3B6DA 2IVDA 4YTMA 2WESA 1OJTA 2TPRA 4CCQA 1JRZA 2B9WA 4JN9A 5IQ1A 1F8RA 1F6MA 3AEGA 4AP3A 4YSXA 1S2YA 2GR0A 4H7UA 3M0OA 2WBAA 4NTDA 4M52A 2ARDA 3ALMA 3BHFA 3P4PA 3CN8A 3LZWA 4K7ZA 1H83A 3UP4A 1CBOA 1QJDA 2YLTA 4J57A 5JCIA 1DOCA 2GQWA 1JOAA 1H6VA 4OPDA 3WE0A 1L9EA 1D5TA 3K7QX 3NT6A 4OPIA 4Z2RA 4GF7A 4OVIA 2WP9A 1E1MA 2GMJA 2VQ7A 3EANA 2YVJA 4C3XA 2E1MA 4EMIA 1S3BA 3CNJA 3SGLA 2BYBA 3KPFA 4BV6A 3NG7X 4IA5A 4K5RA 3NH3X 2RABA 4J33A 1ZX9A 2FBWA 2V5ZA 2BA9A 3AD9B 1MXTA 2R4EA 1JRYA 1ZK7A 1V59A 5J7XA 1FCDA 2H88A 2JB1A 1GRFA 3Q6JA 1TYPA 2VRLA 4NTEA 1GEUA 1NENA 2BCGG 3RP6A 2R0PA 4D04A 1IUUA 4Z26A 3P1WA 2YG5A 2QA1A 1GOSA 1OJCA 3GWFA 2ZZ0A 1PHHA 2CDUA 3VR9A 4RSLA 3K7MX 4CY6A 3CIRA 2BS2A 3NYCA 5FS9A 4B69A 3UOZA 2A89A 3NRNA 3COXA 2WETA 4WCTA 4CRTA 4AOSA 2GVCA 1KNPA 3LZXA 4LIIA 2WOWA 4Z24A 1H82A 5CKUA 3AEBA 2PYXA 1XANA 2R46A 5HY5A 1D7YA 1TDFA 2GQFA 2YG4A 3DGZA 4X4JA 2RGJA 5ER0A 3T37A 2YG7A 1JEHA 4ECHA 3AE5A 5HYMA 1E1KA 2OAMA 3NTAA 5BULA 4CY8A 1TDEA 1KNRA 2WP5A 3NHOX 3PVCA 3QSEA 3CGEA 1F8WA 4K2XA 3BNMA 4U2LA 1F3PA 4O5UA 4BJYA 4YTPA 1B4VA 3II4A 4IV9A 1EL7A 2VOUA 3LADA 4GDEA 4IA6A 4Y4LA 5HHFA 1GTHA 3L8KA 1Q9IA 4JNAA 1EL9A 3JSKA 3NTDA 4BK3A 1JNZA 5TR3A 3ZYXA 1QO8A 2F5ZA 1Y0PA 2R4JA 3RP8A 4FK1C 3R9UA 3KU9A 1GRAA 1KF6A 1YY5A 2HQMA 1ZMDA 1Q1WA 3IHMA 3LJPA 3GMBA 4Z2TA 1GREA 3QSMA 2DKHA 1IUTA 4K22A 3CGDA 1EL8A 1GSNA 1CHUA 1JNRA 2B7RA 2XDOA 3FBSA 3NK1X 2JBVA 3Q9TA 4AT2A 2BK4A 3CPHG 1GTEA 3PO7A 2GB0A 2B7SA 3NN6X 3NLCA 2H89A 3UKQA 4K5SA 1PJ6A 2B9YA 3S5WA 1REOA 4KPRA 1CC4A 4B67A 2DKIA 4RG3A 1H84A 4YKGA 2FJAA 3KD9A 2YLXA 4A65A 3DA1A 2YG3A 2X99A 3AYJA 3SM8A 5HXIA 2GRTA 2XVFA 3IWAA 5IPYA 5LV9A 4C77A 1IUWA 4TLXA 4I59A 2EQ7A 2GV8A 1LTXR 3UP5A 4YKFA 1YQ4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1U6TA 2IIYA 4C3YA 4G9HA 3VI7A 1XW9A 2CZ3A 3OC4A 5BMUA 3LXZA 4RG4A 2OJLA 3IHQA 1OE7A 3O3TA 1GETA 2NVLA 3P4QA 2OE3A 3RHCA 4AP1A 19GSA 1AUCA 3EWLA 3IK9A 5KMPA 3FG2P 1PDHA 3P9UA 3I3LA 1C0KA 2ZBWA 3GSTA 4A6NA 1GP1A 1SK2A 5D96A 1U3IA 2GAGB 3ZYWA 1PN0A 4K8MA 2V41A 3F0IA 1OVNA 5J4UA 4G10A 5GZZB 2O8VB 4X1UA 3DVXA 2IMIA 2LQOA 1EGOA 4B65A 2V2GA 3QVRA 3GKKA 1PKZA 2XHFA 4ULXA 4POLA 4AOXA 1PL2A 3CNDA 5B6NA 5EB4A 4LA1A 5B6MA 2C0GA 2IWTA 3WGXA 3OR5A 5ECKB 3UOYA 1V2AA 3W4IA 3ZVJD 1B9YC 4H4UA 2CZ2A 1PKWA 3WYWA 5F06A 2YQUA 5A5KA 1PS9A 3FR6A 2G0FA 3CNSA 3QFAA 2KOKA 2LNTA 2WFCA 2L4QA 3ZIJA 2AQJA 2K8SA 1GUKA 4CNKA 1CC6A 4IW9A 4TXOB 4U8PA 1SKSB 1SJZA 1ERUA 2WPCA 4U8KA 2CQ9A 5E4WA 1S3DA 4NZHA 3CYNA 4JR4A 1E1LA 4EIPA 3GH6A 4BPYA 4KH7A 2QCUA 3F6DA 3UKFA 1GRGA 3W8SA 1TK5B 4H2PA 3NYEA 1HNCA 4GSSA 1S2QA 4C74A 4H50A 2GLRA 4TLZA 1YEPA 5IMFA 4ZILA 5ECQB 1EZKA 3M13A 4KDUA 2Z5YA 3EYTA 4JE1A 1X0RA 2C0DA 3M8NA 4OCEA 1TDOA 4DSQA 1WWJA 3CNPA 3TJBA 3BCKA 2X8CA 4H2QA 1HYUA 2GMHA 2NPBA 1BJXA 2WOVA 2E49A 3NOFA 4WEYA 4E0VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4EIQA

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