4ICYA

Tracing the evolution of angucyclinone monooxygenases: structural determinants for c-12b hydroxylation and substrate inhibition in pgae
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
491
structure length
462
Chain Sequence
SDAAVIVVGAGPAGMMLAGELRLAGVEVVVLERLVERTGESRGLGFTARTMEVFDQRGILPRFGEVETSTQGHFGGLQFDFGVLEGAWQAAKTVPQSVTETHLEQWATGLGADIRRGHEVLSLTDDGAGVTVEVRGPEGKHTLRAAYLVGCDGGRSSVRKAAGFDFPGTAATMEMYLADIKGVEGITRIIVCERGTPPSWHEVADAWKRLTGDDIAHAEPVWVSAFGNATRQVTEYRRGRVILAGDSAHIHLPAGGQGMNTSIQDAVNLGWKLGAVVNGTATEELLDSYHSERHAVGKRLLMNTQAQGLLFLSGPEVQPLRDVLTELIQYGEVARHLAGMVSGLEITYDVGTGSHPLLGKRMPALELTTATRETSSTELLHTARGVLLDLADNPRLRARAAAWSDRVDIVTAVPGEVSATSGLRDTTAVLIRPDGHVAWAAPGSHHDLPMALERWFGAPLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Polyketide oxygenase PgaE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Streptomyces sp. pga64
total genus 153
structure length 462
sequence length 491
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4icyA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4icyA01
1VG0A 1JNZA 4RSLA 1Y56A 2JAEA 3AYIA 1GESA 4UP3A 5KXJA 4K7ZA 1ZY8A 3BI2A 5IQ4A 4XWRA 2YLTA 5JCIA 2X50A 1TDNA 1ZOVA 3DJGX 2O9ZA 2WETA 5BULA 4KX6A 2R0GA 1EBDA 5LV9A 3V76A 2QAEA 1NG3A 2GR2A 4TM4A 4BJYA 4DGKA 2YG4A 4EQXA 3CNPA 1TDEA 4NEWA 1S3BA 2GMJA 3SFEA 1DNCA 2JK6A 1H7WA 2YLSA 3COXA 3DK4A 4H4RA 1ZDLA 4Y4LA 3RNMA 1ZKQA 1H86A 2IVEA 3UOVA 3BI5A 2WPCA 4OPDA 3SFDA 1S3EA 1OJDA 1Y0PA 2VVLG 4YTMA 4KPRA 2R45A 4B68A 3NK0X 5EB4A 4OVIA 5M0ZA 2I0ZA 3ICSA 2GR0A 1GTHA 1OJAA 2V6OA 1GPEA 3QVPA 2VVLA 4EQRA 5JCMA 1PJ5A 4NTCA 1ZP0A 3CGBA 3IF9A 1S2QA 3QJ4A 3AYJA 4YSXA 2RGJA 1OJCA 1QJDA 2OA1A 5EBKA 1H6VA 2WP6A 3UKKA 4H4ZA 3AE2A 4IA5A 4A99A 5IPYA 1CHUA 4Z26A 1E1LA 4LA1A 3S5WA 3FPZA 1TDOA 2YG6A 3GRSA 2VRLA 4U8JA 3SQPA 2GQFA 4H2QA 4IV9A 5KWFA 1CBOA 3CGCA 4BJZA 2GB0A 4EIQA 1PHHA 3FIMB 2WU2A 3CPIG 3CTYA 2B7SA 2YLRA 3C4AA 2YR6A 2E4GA 4J56A 1GETA 5HYMA 3UOYA 3CIRA 3AEEA 1ZX9A 4H2NA 2B7RA 3T37A 4ZN0A 4YSYA 3NNEA 2XYOA 4OPGA 2RABA 4P9SA 2ZZBA 3AWIA 4CBQA 1JRXA 4D03A 3NTDA 4NZHA 1H7XA 1JRZA 4BK2A 4FK1A 2B9WA 4J36A 2YLXA 3DK9A 3B3RA 3AXBA 1PBEA 2YAUA 4Z2RA 3DJDA 3ICRA 3K7TA 3QFBA 4TM0A 1Z6LA 1N1PA 3ZDNA 1N4UA 4A5LA 2WS3A 3NKSA 2YQUA 2C3CA 3GDNA 2C73A 3K30A 3OZ2A 4M52A 4A6NB 4JQ9A 5JCNA 2B9XA 2APGA 1RYIA 3H8LA 3G5RA 4Z25A 4CRTA 2VOUA 4REKA 2BA9A 1GNDA 2BS3A 2R0CA 1P2EA 2PHHA 2FJEA 3NTAA 4TLZA 1NAAA 3NT6A 3GWFA 2X8CA 4IVMB 3BHKA 4APNA 5M10A 2FJBA 4A6NA 3DA1A 1F8WA 1DOCA 2YVJA 1H81A 1PS9A 2X8HA 1F6MA 4C74A 3F8PA 2RGOA 1ZK7A 3I6DA 2BABA 1GRBA 1ELIA 4N9XA 4H4QA 1BF3A 2XCGA 3K7MX 4YTNA 2ZBWA 3P4PA 3R9UA 4U8IA 4LU6A 4Y4MA 3NH3X 1NHPA 2VRMA 3AE9A 3AE5A 3GYIA 4GF7A 1E1KA 3QSMA 4OPLA 1DJQA 3CGDA 3ADAB 4J57A 4PAAA 3DK8A 4PABA 3QSSA 3NN0X 4WX1A 1N4WA 4BK3A 3JSKA 2C67A 4H2RA 2IVDA 2QCUA 4EMJA 2JB2A 5U1OA 3L8KA 1JNRA 4O5UA 4YWOA 3NLCA 3PO7A 1Y56B 4GDPA 4OPIA 4CNKA 2BC0A 1EL8A 1W4XA 3AE6A 3M13A 3ATQA 4YKGA 1YY5A 3Q6JA 2BK5A 4DSGA 1D4DA 3AD9B 2BS4A 2WPFA 2CFYA 4U8NA 3SM8A 3FMWA 1COYA 1GXFA 3DJEA 2EQ7A 2F5ZA 2QA1A 2XDOA 3AEDA 1L9DA 2AAQA 4U8MA 2WBAA 3G5SA 4U2TA 2WDRA 3AE3A 3CPHG 2PYXA 2V61A 3AEFA 3OC4A 1PXAA 2R0PA 1CJ2A 1X31B 4H7UA 4AP1A 4H4TA 3ALLA 1VG9A 1LQUA 2VVMA 1NPXA 2XVEA 3C4NA 2VQBA 4H4XA 2TPRA 1JU2A 2XVJA 3AE7A 4FDCB 4OCGA 3UTGA 4JY3A 1GALA 2BCGG 4USRA 4B64A 3CNJA 3QFAA 3NGCX 1UKVG 1RP0A 3DMEA 1SEZA 1TYTA 2XLPA 3CN8A 4USQA 3GWDA 1JOAA 1MO9A 5GRTA 3B6DA 3AD8B 1Q1WA 1OJTA 3LZXA 2V60A 2H88A 4B67A 1QLBA 1F3PA 2EQ6A 4EM4A 1D7YA 2QA2A 2C64A 2C7GA 3GMCA 4TM3A 3QSEA 4AT2A 1PBBA 2GRTA 2NVKX 5BUKA 5FS8A 2R46A 4ZCCA 2J3NA 5C3JA 4O5QA 1Q1RA 2EQ8A 3VRBA 3VR9A 2CULA 4MJWA 2Y6RA 1GRHA 4EQWA 3AE4A 1IJHA 1KNRA 1AOGA 1H84A 4ADWA 2BYBA 3AYLA 3DGHA 3UOZA 1E1NA 1PBDA 2Z5YA 4EQSA 2YLZA 1REOA 2E1MA 4K5SA 5U63A 3AEAA 1O5WA 1CJ3A 3AEGA 3NK1X 2XFQA 3S61A 3QVRA 1M64A 1EL7A 2B76A 5JCKA 4IVOB 2GH5A 5FMHA 1KFYA 3EAOA 3LZWA 3P4QA 3NN6X 4TM1A 2B9YA 1IUTA 1EL9A 2YR5A 4A65A 4JDRA 4U8LA 2GR3A 3GRTA 4OPUA 1TDFA 4C5OA 2GR1A 4X9MA 1PN0A 3F8DA 3H4KA 5IQ1A 4H4UA 2H89A 4OPTA 2YG3A 3LADA 1GT8A 2Z5XA 4E0VA 1O94A 3IHGA 3ITJA 1YKJA 5FS9A 2ZZCA 3D8XA 1BWCA 3KA7A 5DBJA 1DXLA 4J2WA 5J60A 4AOXA 4X4JA 3P9UA 1PJ6A 2C65A 2OLOA 2YLWA 1BZLA 3AB1A 4GCMA 2WHDA 2WOVA 1Q9IA 4Z2TA 1GERA 2V3AA 2W0HA 2R4JA 1GRFA 1VDCA 4FK1C 3FG2P 3REDA 1PBCA 1ZMDA 2X99A 2BS2A 2Q6UA 4H4VA 4U8PA 1P2HA 3KKJA 5JCLA 2A8XA 3ZYXA 2X3NA 2XVHA 1FOHA 2Q0KA 2WESA 2YVFA 3NYCA 3UTHA 1E39A 1D4CA 1KNPA 3EF6A 1FECA 4K22A 2WQYA 1GTEA 4JY2A 5KOWA 4DNAA 1K0IA 3DH9A 1CC2A 2XFPA 3LJPA 2Q0LA 3EPTA 5J7XA 3ATRA 1TYPA 4ICYA 3CGEA 2BCPA 3Q9TA 1LTXR 2X8GA 4U8OA 2GQWA 3VQRA 1B5QA 3RHAA 4J31A 4A7AA 5KVHA 1EL5A 1TRBA 1NG4A 2YG5A 3UP5A 2V5ZA 2R4EA 1LVLA 3GYJA 1IUWA 2A87A 3BI4A 3NK2X 3NYEA 2XLSA 3UKPA 3AE8A 4YSZA 2YM2A 1H82A 1DOEA 3CNSA 4GRTA 1K0LA 3GD4A 2GVCA 4YT0A 4GDEA 3KD9A 1LPFA 4JNQA 3VRDB 3GDPA 3LXDA 2BXRA 3F8RA 3UKQA 1B37A 2JBVA 2JKCA 1PBFA 4UDRA 3VRAA 4H4YA 2WP5A 1L9EA 1O95A 2WU5A 4Y4NA 4XXGA 2ACZA 2WDVA 1L0VA 1KDGA 3LOVA 1DOBA 4ECHA 3CNTA 2BACA 3DJJA 1XANA 1YQZA 4H2PA 1H83A 2YWLA 1LQTA 4H4WA 3GD3A 1PJ7A 1MXTA 3P4SA 1XDIA 4H4SA 3CPJG 3GMBA 4B66A 1D4EA 4YTPA 3URHA 1GRTA 4H4PA 1DODA 1F8SA 3UKLA 3ABVA 4A79A 1B4VA 2XFUA 2BK4A 3KLJA 5HY5A 1PXBA 2DKIA 1CC6A 1BGJA 1K0JA 3ICTA 5TR3A 4K2XA 4B1BA 5CQFA 3UCLA 2BXSA 3M0OA 2XLUA 1K4QA 4BK1A 2GF3A 2AQJA 5KRQA 4BURA 1FEBA 4AP3A 1ZOYA 1IUXA 1FL2A 1LJ1A 3BNMA 5CKUA 4GUVA 2GAGB 2WP9A 2C75A 1F8RA 4AOSA 1YQ3A 4EMIA 1JEHA 3IWAA 3RP8A 2XVIA 1DJNA 3RP6A 1B8SA 4A9WA 3II4A 4NTEA 2XFOA 1L9CA 2YVGA 3NG7X 1CJ4A 1FCDA 2AR8A 2C3DA 2YR4A 4YSHA 5HXIA 4TLXA 3PVCA 1PXCA 4FX9A 4UDPA 4Z24A 5HHFA 4CY8A 1M6IA 1FEAA 1NENA 2JB3A 4B63A 1RSGA 3G5QA 1NDAA 2YG7A 4EMWA 3AECA 4B69A 3UOXA 2OALA 1D7LA 2FBWA 4LIIA 4CNJA 5BVAA 3ALMA 1NHQA 2CVJA 4IA6A 4NEVA 3UTEA 1GRGA 3RP7A 3WE0A 2WOWA 1NHSA 5BRTA 1VQWA 3K7QX 4Z43A 4HB9A 4DSHA 4Z2UA 2OAMA 3P4RA 4C3YA 3FBSA 2JB1A 4X9NA 4D04A 2GV8A 5KOXA 4GR1A 4EIPA 2WPEA 1CC4A 5FS7A 4U2LA 4I58A 2BK3A 2GAHB 5EOWA 5ER0A 3C96A 3M12A 3KVEA 1V59A 1GOSA 2DKHA 3DGZA 3UKAA 4U2SA 1D5TA 1GREA 1N4VA 2Q7VA 3P1WA 4CCQA 2GMHA 3KU9A 3NYFA 5GSNA 2EQ9A 1IUSA 4XWZA 5L46A 1HYUA 3HZLA 3BHFA 1KSUA 3AEBA 3ISHA 1MOKA 4NTDA 3D1CA 1ZMCA 4OPCA 2C66A 2VQ7A 2ZZ0A 4YKFA 1BGNA 3CNDA 1QO8A 2XFNA 1GSNA 3I3LA 2RGHA 4BV6A 2WOIA 4WCTA 2TMDA 5C2TA 4JN9A 2WDQA 3UP4A 3L1RA 1GV4A 3GSIA 2VZ2A 2BC1A 3SGLA 3IC9A 2GEWA 1S2YA 4EM3A 3E1TA 2CDUA 1JRYA 2NPXA 3UKFA 2FJAA 1XPQA 3V3NA 1E6EA 2XLRA 3UKHA 4K8DA 4YXDA 2HQMA 2WEUA 1LV0A 2Y6QA 3IHMA 2ARDA 3NIXA 5U25A 1KSSA 4J33A 4C77A 4CY6A 1OJ9A 4UDQA 4J34A 1IUUA 1YQ4A 4RG4A 3V3OA 1KF6A 1BKWA 2C76A 5KVIA 3AD7B 4I59A 3PS9A 2A89A 2OLNA 3LB8A 2E5VA 2C72A 3EANA 4RG3A 4U8KA 1GEUA 4C3XA 4CCRA 5EB5A 3ALJA 2UZZA 2XLTA 1ONFA 3NHOX 4JNAA 3NRNA 3KPFA 2FJDA 3H8IA 2C70A 2V3BA 3BNUA 4ZCDA 1CJCA 3AE1A 1VRQB 2IIDA 2YM1A 4H50A 3UTFA 1CF3A 5FS6A 1TDKA 4HA6A 4AT0A 1CL0A 2R9ZA 1NEKA 1E1MA 4K5RA 1NHRA 3VR8A 1E7PA 1XHCA 1PDHA 1IUVA 3O0HA 2XVFA 4Z44A 4B65A 1GRAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J9CA 1JNZA 1ZYPA 1Y56A 1JZOA 4UP3A 4HEA2 5IQ4A 4XWRA 1ZOVA 2O85A 3QFAC 1GULA 4BJYA 4K7IA 2FGXA 3WT1A 3TKRA 4DGKA 4LMVA 3CNPA 4NEWA 1S3BA 2GMJA 4XCSA 1H7WA 5EL8A 3UOVA 2YWIA 3HZ8A 2WPCA 3SFDA 1S3EA 1Y0PA 2L5OA 2EIQA 3NK0X 2C1YA 3LWAA 2CVDA 5KN2A 5FT3A 1JFUA 4ACSA 1T4ZA 4NTCA 3HVVA 4V2MA 3QJ4A 2WULA 1K0AA 4ZBDA 4DSSA 1ERWA 2WP6A 2K8SA 1KTEA 3AE2A 5IPYA 6GSVA 4LA1A 3S5WA 2HFDA 1T7PB 2TRXA 2IFQB 3DYRA 1TDOA 2N5BA 2FCHA 1NHYA 2VRLA 2YG6A 4MH3A 3SQPA 3C8EA 1GSDA 1XOBA 4H2QA 4XRDA 2GB0A 4USSA 2VD0A 4EIQA 1PHHA 3FIMB 2WU2A 3IK7A 5CRHA 2E4GA 1EEJA 1GETA 5G1KA 1EOHA 2AV4A 3CIRA 3AEEA 2IL3A 2B7RA 4YSYA 2XYOA 3VFIA 1A2LA 2ALBA 4P9SA 2GS3A 1PRXA 3AWIA 4CBQA 1V40A 4D03A 5A5KA 3D5JA 3NTDA 2B9WA 3IE3A 3GMFA 4TXOB 4D73B 2YAUA 4Z2RA 4EQRA 3QFBA 4TM0A 2YQUA 4XS4A 3TJKA 1CQGA 2C3CA 3K30A 4JQ9A 2DJ1A 3ZFLA 3D6IA 4OWYA 4F9ZA 3DMLA 1GNDA 3VK9A 1P2EA 2PHHA 5KN3A 3NT6A 1WWJA 4IVMB 2X8CA 3BHKA 2PU9C 4A6NA 2JSYA 1DOCA 2YVJA 2WS2A 2E2MA 1H81A 3IV4A 2H1BA 1F6MA 4C74A 3P2AA 2RGOA 3I6DA 1HNCA 4NV5A 2YN1A 2FWGA 3GYKA 2ZBWA 1E2YA 4JU5A 4LLRA 3R9UA 4Y4MA 3F8UA 2FA4A 4K0GA 1NHPA 4I2TA 3GYIA 2OBKA 1DJQA 4FYUA 2I3YA 2HT9A 4WX1A 2MBSA 3CMIA 3L8KA 2HYXA 2MMZA 1Y25A 4PUAA 4GDPA 2BC0A 3M13A 3QOUA 4JE1A 1YY5A 3J7Yk 1V2AA 4AJ7A 2CFYA 3FMWA 1COYA 4RI6A 1NW2A 3ZZXA 3DJEA 4QL7A 3QMXA 3AEDA 4U8MA 4OMVA 2LUSA 4L5LA 4K6XA 1YEPA 2WDRA 2PYXA 1PXAA 19GSA 1CJ2A 9GSSA 3L0HA 3PGTA 1GLQA 2H0HA 1AQVA 2H75A 1WMJA 2LEGA 1JU2A 1ST9A 1A8LA 1GALA 3DVXA 4JY3A 1EV9A 3QFAA 3W6GA 3QCPA 2VAFA 1SEZA 2FLSA 3TCOA 1Q1WA 3LZXA 4G19A 2E0QA 4TRXA 1D7YA 5HQPA 2HZFA 4DSQA 2C7GA 2C64A 4AT2A 1PBBA 2GRTA 3ME7A 1MD3A 1S3CA 2PERA 2EQ8A 4XIHA 2H1DA 3SXIA 1H84A 4ADWA 2X49A 2YZUA 1GWCA 1KEBA 2DMMA 3GSSA 2KLXA 2YLZA 2E1MA 3FYGA 3C1RA 1EP7A 1CJ3A 1OC9A 5A4UA 3WT2A 4II2A 4K7OA 1EL7A 1Z6NA 5DBQA 2B76A 2A2RA 4BWSA 2GH5A 5ENUA 2OKAA 4IP6A 4WBRD 4MCUA 1KFYA 5IMZA 3LZWA 4TM1A 2MBTA 3MSZA 4A65A 3VWVA 4JDRA 1ZZYA 3SWLA 2IN3A 4OPUA 2ZUPA 2LNSA 1TK8B 3H4KA 1EZKA 1O94A 5ID2B 1WE0A 3KMOA 1DXLA 1MEKA 4KSOA 3KXOA 3SY4A 4IQ1A 2C65A 2OLOA 4GCMA 5A4VA 3IA1A 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