4X4JA

Structural and functional studies of bexe: insights into oxidation during be-7585a biosynthesis
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
486
structure length
482
Chain Sequence
DAPVVIAGAGPAGLMLAGELRLAGIGVVVLERLPARTGESRGLGFTARTMEVFDQRGLLRRFGEVQTSDQGHFGGIPVDFGLLDGAHQAAKTIPQSATEAVLEAWAGELGADIRRGHELTGVRDDGDGVAVTVRGPAGEHVLRAGWLVGCDGGRSAVRKAVGFDFPGTAATREMFLADLRGVELEPRMSLPGGMVMVGPLPGGVTRIIVCERDAPPRRRTGPPPFHEVADAWKRITGIDISAAEPVWLSAFGDATRQVTEYRRGRVLLAGDAAHVHLPAGGQGMNAGIQDAVNLGWKLAAVVRGTARADLLDTYHGERHPVGVRLLMNTRAQGLLFLNGAEMQPLRDVLAELTGYPDVARHLAAMVSGLEIAYDVGGGSHPWLGRRLPRLELDRGGRPSSTAELLRPARGLLLDFAGNAALRDRAAPWAGRIDVVTARPAGRVPGATTAVLVRPDGHVAWAAPGTHADLPMALERWFGPAPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Amycolatopsis orientalis subsp. vinearia
publication title Structural and Functional Studies of BexE: Insights into Oxidation During BE-7585A Biosynthesis
rcsb
molecule keywords Putative oxygenase
total genus 134
structure length 482
sequence length 486
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4x4jA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4x4jA01
4AOXA 4EQSA 2Q0LA 2A89A 4NZHA 1DJNA 4U8JA 3ZYXA 4HB9A 2H89A 4EQWA 2WOIA 1ZOVA 2EQ6A 1QO8A 3RNMA 3IHMA 1YKJA 3SM8A 5GSNA 5EOWA 3CNPA 4A79A 2ARDA 4OPDA 4RG3A 3CTYA 1Q1RA 2YG6A 1PJ5A 1ZK7A 1NDAA 4B68A 1QJDA 5HXIA 4K2XA 1GXFA 4YTNA 4YXDA 1CJCA 5KVIA 1CC6A 2PYXA 1CC4A 1Q1WA 2WU5A 4YSHA 2FJDA 3LXDA 1YQ4A 1D4EA 1CBOA 2YG5A 2AR8A 1DOBA 2BCPA 2HQMA 2Y6RA 1B5QA 3KD9A 3OC4A 2R0PA 2E1MA 1NEKA 3IWAA 3AEAA 4C5OA 5JCKA 1GRTA 3AYJA 1D4CA 2VVLA 2XLRA 1VDCA 1V59A 4Y4NA 1MOKA 5DBJA 1PS9A 3UOVA 2OALA 3EPTA 3I6DA 3KLJA 4EQRA 1N4UA 2QA1A 4N9XA 4DGKA 4U8PA 2YR5A 3AWIA 2XLSA 2XLPA 3D1CA 2GVCA 2R4EA 3D8XA 4OPIA 2XFUA 3GYJA 3AE5A 2W0HA 4C77A 5KOWA 5FS7A 3IF9A 2GMJA 2WPFA 3QFBA 3NNEA 2Q6UA 2BCGG 1N4VA 1TRBA 4OPUA 1FEBA 3VRBA 3CPJG 4DSHA 4EMJA 1CJ4A 1COYA 3UP4A 2YWLA 4EM4A 2WDRA 2GF3A 4C74A 4YT0A 3GRSA 2H88A 2BS2A 2C76A 1RYIA 1UKVG 4YSZA 3AXBA 3H4KA 2A8XA 1E7PA 3AE9A 3GRTA 4YSXA 1CJ3A 4J57A 3ICTA 4CCRA 3DJDA 4JQ9A 1P2EA 3UKQA 1JEHA 1S2YA 1CF3A 3QSSA 4H4UA 5HYMA 2VRMA 4H4ZA 1LV0A 1F3PA 2X8HA 4J2WA 1S3EA 1B4VA 3K7TA 4RSLA 1DODA 4H2PA 4USRA 3NH3X 1GRFA 2IIDA 1GEUA 2XFQA 4C3YA 1BGNA 3LJPA 4JDRA 3DGHA 3QFAA 2WQYA 4J31A 3ALLA 1PDHA 2Q0KA 2XDOA 3GWDA 3KVEA 1ZX9A 2XFNA 2GH5A 3AEGA 3IC9A 1ZP0A 3VQRA 2ZZBA 3M0OA 1TDNA 4USQA 5KRQA 3CNTA 2WETA 4GF7A 5JCLA 1H82A 1GETA 5J60A 1JU2A 4IVMB 4FK1A 2E5VA 3UCLA 1L9CA 2GAGB 2OLOA 1LQUA 1MXTA 2Y6QA 4X9MA 1GREA 3ATRA 3CIRA 2R9ZA 3BI2A 4U2SA 5CKUA 3QSEA 3BNMA 3NIXA 1LQTA 1ONFA 3LZXA 2QCUA 3H8IA 3VRDB 4JY3A 1X31B 3O0HA 1XHCA 2WBAA 4TM1A 1XANA 1GRBA 1QLBA 2OAMA 2NPXA 2WP9A 2WP6A 1NHSA 4Z43A 4AT2A 3M12A 2VOUA 4U8LA 2A87A 4NTEA 5KVHA 1FECA 2YLRA 4I59A 1BKWA 3NK2X 4GCMA 4DNAA 2C72A 1B37A 1OJTA 3V3NA 1IUVA 2R4JA 3AYLA 1N4WA 1EL5A 5M10A 1CJ2A 3AE8A 3AE6A 5BVAA 2AAQA 3VR9A 5L46A 2FBWA 1H6VA 2XYOA 4FK1C 1ELIA 1YQZA 3UTFA 4UDRA 3UTHA 1DOEA 2CDUA 4JNAA 4H4YA 2XVFA 1H86A 2BK5A 3C4NA 3QSMA 1KNRA 4RG4A 2GV8A 1O94A 3GWFA 1IUUA 1OJAA 1OJCA 2BACA 1PJ7A 2YLWA 3UP5A 2GR3A 4UDPA 1ZKQA 2ZZCA 3AD7B 3DJGX 3NGCX 4WX1A 2VVLG 4BJZA 4DSGA 5GRTA 3NN0X 4K8DA 1XDIA 2BS4A 4H2RA 3GD3A 4LIIA 3NYEA 2WS3A 4HA6A 2VQ7A 2B9WA 2DKIA 2BC0A 2GRTA 5U63A 3F8RA 4IVOB 4U8MA 4EQXA 1REOA 2C66A 5JCIA 3SFDA 1L0VA 2JB1A 4D03A 3AEDA 2CVJA 1CL0A 1F8RA 2B76A 2C3CA 4BJYA 3AECA 1VRQB 3COXA 4UDQA 1O95A 5IQ1A 2BA9A 1VG0A 4CNKA 1SEZA 1Y56A 2TMDA 3UKLA 1XPQA 1GV4A 1DXLA 1DJQA 4XWZA 3KA7A 2FJAA 2X8GA 3AE4A 4JN9A 4ECHA 2RGHA 2XVIA 3CNDA 1HYUA 2C3DA 2IVEA 1EBDA 3LB8A 4GR1A 1L9EA 4U8KA 2BYBA 2XVEA 2J3NA 5M0ZA 4OPLA 4B65A 1K0IA 1KFYA 1LVLA 3URHA 2GAHB 2X99A 1YQ3A 3AB1A 5JCMA 2YQUA 1GESA 3NYCA 2V3AA 4Z24A 1S3BA 3LZWA 5EB5A 4E0VA 1PXBA 3DK8A 2VQBA 1ZOYA 2X3NA 1JOAA 1K0JA 3ITJA 1Y56B 2XFOA 2YR4A 2V5ZA 3P4SA 2VRLA 2VVMA 3RP6A 2JKCA 4K5RA 3GMCA 1VG9A 2C7GA 1F8WA 3H8LA 4MJWA 1D7YA 3UKKA 4GDEA 4A9WA 4APNA 3G5QA 3KU9A 4BURA 2Z5XA 5C3JA 2Q7VA 4B67A 3FIMB 1ZMCA 1ZMDA 5U1OA 3GDPA 2GQFA 4GUVA 1PBCA 1LPFA 2BK4A 5ER0A 4OPCA 4CBQA 2GQWA 4D04A 4ADWA 5HHFA 3QVPA 4J33A 3FBSA 4EMIA 1TDOA 1K4QA 3LOVA 5BRTA 3CNSA 1E6EA 3ISHA 3ZDNA 1Q9IA 3DJJA 5CQFA 4M52A 3C96A 4CCQA 2R0GA 3F8DA 1NHRA 4TM0A 4A6NA 3ALMA 4PAAA 3CGEA 5BUKA 2YLXA 4H4XA 4TM3A 3CGBA 2BS3A 4Z26A 2GR0A 1E1LA 3CNJA 3GMBA 3K30A 2WOWA 3NKSA 3VRAA 3P4RA 2JK6A 2AQJA 3I3LA 1PXCA 1FOHA 5KXJA 3S61A 1D5TA 3DMEA 4XWRA 1KSSA 2BABA 1F6MA 4GDPA 4TLZA 1Z6LA 5FS9A 4B63A 2X50A 2WESA 3B6DA 3NTAA 2WP5A 3CPHG 1PXAA 3AEBA 2OLNA 4OCGA 4A99A 1JRYA 3PO7A 1NENA 2F5ZA 2V60A 3DH9A 3NRNA 1CC2A 4A6NB 4BK1A 2VZ2A 1GT8A 3M13A 2V6OA 2YVJA 3OZ2A 4U8NA 3BHKA 3BNUA 4IA5A 1GPEA 3L8KA 1PHHA 1BWCA 3VR8A 3ICSA 2C70A 2WOVA 2XLUA 4K7ZA 2B7SA 3BI5A 2EQ9A 1D7LA 4PABA 1E1NA 1RP0A 3V76A 2E4GA 1LJ1A 3NT6A 3UOYA 1TYTA 3S5WA 3NTDA 3GD4A 3SFEA 2BXRA 4REKA 3P4PA 2B9XA 1IUTA 3G5SA 4Z25A 3DK9A 4ZCDA 1E39A 4O5QA 3II4A 4A7AA 1NG3A 1F8SA 1GALA 2ZZ0A 2GMHA 3ADAB 2YM1A 1EL7A 1PN0A 2V3BA 1VQWA 1EL8A 3HZLA 2XCGA 3BI4A 3LADA 4BV6A 2UZZA 4CY8A 4H4PA 4LU6A 1LTXR 3RHAA 2EQ8A 5FS6A 1JNZA 4IA6A 5BULA 4BK2A 2WHDA 2YVFA 1KF6A 4I58A 1H81A 4Z2TA 4J34A 4TM4A 4Y4MA 4H4QA 4AP1A 4K22A 1ZY8A 1TYPA 3NN6X 3T37A 3NYFA 3AD8B 3QVRA 2GEWA 1GOSA 3L1RA 4OVIA 4XXGA 2B7RA 2NVKX 2FJBA 2O9ZA 4YKGA 2XLTA 4YSYA 3FG2P 5C2TA 4X4JA 2IVDA 3NLCA 1BF3A 3CGDA 4CY6A 4U8OA 2EQ7A 2FJEA 1BGJA 2ACZA 1KDGA 1KSUA 3AYIA 1TDFA 3CPIG 3UKFA 2YVGA 1M64A 3Q6JA 1DNCA 3JSKA 2JAEA 3NK0X 2XVJA 4YKFA 4YTPA 4Z2UA 2RABA 4OPGA 1E1KA 5FMHA 4ICYA 1AOGA 3AE2A 1Y0PA 4AT0A 1GSNA 2C65A 3UKAA 1TDEA 2C73A 3K7QX 5KWFA 3NK1X 2TPRA 2JBVA 3G5RA 3RP7A 3REDA 2JB2A 1GNDA 1IUSA 5IPYA 5KOXA 1JNRA 4JY2A 2C75A 3AEEA 4B64A 2GR2A 2C64A 2RGJA 3DK4A 4J56A 2BXSA 1PBEA 1K0LA 2R0CA 1ZDLA 2YR6A 4KX6A 4CRTA 1CHUA 4H7UA 4A5LA 2BC1A 2YLTA 1PBFA 4EMWA 1NHPA 5IQ4A 1JRXA 1GTHA 3DGZA 2WU2A 3Q9TA 4NTDA 1JRZA 2QAEA 3NG7X 3K7MX 3WE0A 1KNPA 2R45A 3ICRA 5TR3A 1PBDA 4H4SA 2X8CA 1GERA 2WDVA 4H4TA 4Y4LA 3UOXA 3FMWA 4ZN0A 3QJ4A 4IV9A 4LA1A 1B8SA 4WCTA 4AOSA 1IUXA 2V61A 1O5WA 1PBBA 3ALJA 3UTEA 1IJHA 2B9YA 4H4RA 1NAAA 4NTCA 3AE7A 4NEVA 3GSIA 4Z2RA 2WPEA 4H4WA 3AEFA 5EB4A 3P1WA 3UOZA 1NPXA 3P9UA 2YLZA 2YG4A 3EF6A 2GR1A 3R9UA 4B1BA 1PJ6A 1N1PA 2DKHA 1MO9A 4X9NA 5J7XA 3UTGA 1H7XA 4BK3A 1FL2A 1FCDA 3P4QA 3PS9A 4B66A 4YTMA 4YWOA 3KPFA 4Z44A 3UKPA 3PVCA 1DOCA 3F8PA 3GDNA 4P9SA 3UKHA 3AD9B 1S2QA 4C3XA 1GRHA 4GRTA 4EM3A 3GYIA 3SGLA 1FEAA 4H50A 2RGOA 1E1MA 3DJEA 1GTEA 3ATQA 1OJDA 2YLSA 4O5UA 5EBKA 3FPZA 2BK3A 2YAUA 4NEWA 2ZBWA 4EIQA 5JCNA 1GRAA 1W4XA 2OA1A 2XVHA 3CN8A 4UP3A 3IHGA 2YG7A 4H2NA 5U25A 4K5SA 2WEUA 3AE1A 3EAOA 4A65A 3E1TA 2XFPA 1YY5A 3B3RA 1EL9A 1P2HA 1RSGA 2WDQA 3EANA 4JNQA 2GB0A 5FS8A 3SQPA 4FDCB 2I0ZA 2Z5YA 3KKJA 2YG3A 1M6IA 3C4AA 4B69A 2CFYA 5LV9A 4U8IA 1TDKA 1H7WA 3BHFA 1NHQA 4U2TA 2C67A 2YM2A 3NHOX 1H84A 3ABVA 2QA2A 1D4DA 4U2LA 3V3OA 2APGA 4CNJA 1OJ9A 3RP8A 1L9DA 1NG4A 2R46A 4J36A 4OPTA 4AP3A 1IUWA 1H83A 1BZLA 1GRGA 2WPCA 3CGCA 4H4VA 4EIPA 4KPRA 4TLXA 4ZCCA 4FX9A 2PHHA 4H2QA 3AE3A 5HY5A 2CULA 2JB3A 3DA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AOXA 4MABA 2Q0LA 4EQSA 2AUVA 1DJNA 1GLQA 3D4MA 3GKNA 4O32A 4ECBA 4J57E 1EEJA 4EDZA 5EOWA 3C71A 2ARDA 4RG3A 1MDJA 1Q1RA 5HR1A 4XCSA 1QJDA 5HXIA 2B7KA 1GXFA 5KVIA 1GSEA 3EURA 5LD0A 1CC6A 1CBOA 1A8YA 2H6YA 1FOVA 2BCPA 3OC4A 1B5QA 3ERGA 4Q5NA 4GRFA 3QDNA 2R0PA 3IWAA 4PNFA 5DJLA 4K6XA 1GRTA 2XLRA 4AJ6A 1U88A 1V59A 3LXZA 1VDCA 1FO5A 3A5WA 3KLJA 4EQRA 3EINA 2LRCA 1M2AA 4U8PA 2YR5A 2HSMA 2XLSA 3O6TA 5KMSA 2GVCA 3D8XA 2W0HA 5COHA 4C77A 3O3TA 5FS7A 3IF9A 2ES7A 2WPFA 12GSA 2Q6UA 4DSHA 3MDKA 1N4VA 1TRBA 1GSFA 4BA7A 2OBKA 4H86A 4ZL8A 2A2SA 3GHAA 2H0IA 13GSA 2ALBA 1E7PA 3UVTA 4YSXA 3ICTA 4X1UA 1P2EA 2IIYA 3M0FA 4H4UA 5HFIA 5J41A 1AQVA 2GSQA 3ERFA 2VCZA 4USRA 4C3YA 3LFLA 1YZXA 2WQYA 4TW5A 4J31A 5IMFA 3KVEA 1ZX9A 1SL0B 2GH5A 4FIWA 4KE3A 4XIHA 1ZP0A 1ERVA 1AUCA 1EP8A 4BWQA 4USQA 3UL3A 4LL1B 4MJEA 1JU2A 1G7EA 4PUAA 2E5VA 2OLOA 1ZCPA 2WB9A 5KMRA 2H73A 1V98A 3NIXA 1R4WA 4TM1A 3D0ZA 3FW2A 1XANA 1QLBA 5F07A 3RBTA 2IPAA 2NPXA 1V58A 5CRDA 1GUMA 4HJ2A 2WP6A 3M8NA 4U8LA 2A87A 5KVHA 4HZ2A 1FECA 4E8EA 2YLRA 2JACA 2C72A 1IUVA 2X49A 5JWRB 1XOAA 2R6KA 4MCUA 4HS1A 1XWGA 2A4VA 1YQZA 3UTHA 1DOEA 1JFUA 4YH2A 2BK5A 4V2LA 3GWFA 1Y6EA 5ECRB 1HQOA 4KUNA 3UP5A 3FR9A 2BMXA 1WOUA 2R3XA 2VL2A 3L9VA 1PN9A 1XBSA 3NN0X 3DEXA 4K8DA 1BX9A 2HZFA 4H2RA 3GKMA 3GD3A 3M3MA 6GSSA 3NYEA 2OACA 2JSZA 2DKIA 4D73A 2GRTA 5U63A 4XRAA 2YPMA 1REOA 2C66A 2DLXA 5JCIA 3LQ7A 3DMLA 4WKWA 5C00A 1F8RA 3GL5A 2CVBA 3COXA 1O95A 4UDQA 5IQ1A 2GZYA 1VG0A 2K8SA 1ST9A 1DJQA 4XWZA 3KA7A 2X8GA 4JN9A 2YJHA 11GSA 1HYUA 3LB8A 4MA9A 1Q98A 1F9MA 2F51A 3P8WA 4F0CA 4B65A 2VL2C 1K0IA 1KFYA 1LVLA 4D73B 3GSTA 2X99A 2GT5A 4K9ZA 2YQUA 3TJJA 2PVQA 3HYPA 3F4RA 4E0VA 3DK8A 1F2EA 3ZL5A 4YQUA 4YAPA 3LORA 4BL7A 1QFNA 4Z7XA 2VD1A 2C3TA 1M3IA 1PFOA 3P4SA 5DBQA 2VVMA 3RP6A 1VG9A 1TI1A 3UKKA 4GDEA 4MZBA 3KU9A 5C3JA 5ECQB 4B67A 3FIMB 2XHFA 1ZMDA 5U1OA 4NHWA 2N5BA 1XWBA 1Z7RA 3QVPA 3L9UA 4J33A 4ZBAA 3LOVA 1E6EA 3ISHA 4BL7B 2MBTA 5LCZA 2VM2A 3QR6A 2OE3A 5AIVA 3EWLA 4CCQA 3GX8A 3F8DA 4PAAA 3BCKA 2VCVA 10GSA 2LQOA 3CGBA 3NKSA 3VRAA 2WOWA 3ZFLA 1BQ7A 2DIYA 2PBJA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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