4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
2C3DA 4NTCA 1EBDA 3V76A 4JN9A 1GRFA 1Q9IA 2R45A 4OPTA 2ZBWA 4J36A 2C3CA 1H6VA 1DXLA 3IHMA 1PBCA 4GUVA 4J57A 3EAOA 2C7GA 3CPJG 2WQYA 3CPHG 4LU6A 3P1WA 2YLTA 4AT2A 3UP5A 4U8LA 1PJ7A 4XWZA 3AE1A 4H4TA 4Z25A 1QJDA 4BJZA 2C65A 3GDNA 1ZOVA 2APGA 3KD9A 4I59A 2XYOA 4D04A 1PXCA 3GD3A 2BACA 1CC6A 3UKPA 4TM3A 3UKAA 4IVMB 2BA9A 3WE0A 1CL0A 3UCLA 4DGKA 4OPDA 3I3LA 4O5QA 4TM4A 4NZHA 3KLJA 2YLRA 2WU2A 3AEAA 3KPFA 4K5RA 1E39A 3AEDA 3CNSA 4EMIA 4P9SA 3P4RA 3H8IA 3M13A 1S3BA 2BK5A 3RP8A 4U2SA 4H4ZA 1IJHA 3R9UA 1RYIA 4XWRA 2I0ZA 3S5WA 2Q0LA 3ADAB 3FPZA 1CJ2A 1FL2A 2BCPA 4O5UA 2JK6A 3UTFA 2VVLA 4HA6A 2YWLA 4YTNA 3SM8A 1GXFA 3AE7A 3GMBA 2XCGA 4TM1A 1GT8A 5ER0A 3AB1A 2BXSA 4BK2A 3BHKA 3UOYA 1ZK7A 2DKIA 3DK8A 2VVLG 1L9EA 4H50A 3T37A 2WPEA 2ZZBA 1L0VA 1GRTA 1PS9A 3II4A 1OJDA 2E1MA 3JSKA 4J34A 1D7YA 2V5ZA 1DODA 1MXTA 3AE4A 1JNRA 4FK1A 5BVAA 1PXBA 1YKJA 1RSGA 3CPIG 1EL7A 4E0VA 3BI4A 4YSZA 2C70A 4IVOB 1TYTA 3M12A 4ZCDA 4CRTA 2C75A 3LOVA 2R4JA 3BHFA 3H8LA 1REOA 2WDVA 1LVLA 3FMWA 4Z2TA 3NN6X 4N9XA 4OPIA 2XVEA 3I6DA 3LZWA 2J3NA 2XFQA 1H84A 3G5RA 2Q0KA 2CFYA 1NAAA 1Q1WA 5GRTA 3REDA 1BZLA 1GERA 1ONFA 2XLRA 4YTPA 3DK9A 2V60A 5JCNA 1GV4A 1RP0A 2VQBA 2YM2A 3COXA 4JY3A 4Z43A 2EQ8A 3UOVA 1TDEA 2WDQA 2XVJA 3KA7A 5KOXA 3AEBA 5KXJA 2EQ7A 1VG9A 1LPFA 3CTYA 3C4AA 4JNQA 4C3XA 1E1KA 3LB8A 4H4PA 2XVFA 4H4VA 5HYMA 2VRMA 2X3NA 4H2PA 2R0GA 4A99A 4H4UA 4KX6A 1N1PA 1GALA 1ZMCA 2R46A 3ALMA 4AT0A 2YLXA 2FBWA 2QCUA 1BKWA 2AQJA 2RABA 2W0HA 3D8XA 1IUTA 1V59A 2WOWA 2TPRA 1YQ3A 1ZOYA 2H89A 2V6OA 1ZDLA 4PABA 1DJNA 1ZMDA 3EF6A 3GDPA 3AE5A 2X8HA 3UKQA 3ALJA 1H81A 3FBSA 4BURA 4DSHA 4GRTA 4BK3A 1E1NA 1GPEA 4U2LA 4BV6A 1QLBA 3NYEA 1N4WA 2YG7A 2JB3A 4A7AA 1NHPA 2C72A 2QAEA 4IA5A 3P9UA 2C66A 2JB1A 2NVKX 1GESA 2BS3A 4GF7A 3VR8A 5JCIA 3NHOX 2WDRA 1KFYA 1GEUA 2BS4A 2O9ZA 2YR6A 5L46A 3AD7B 1BF3A 3K7QX 5C3JA 1F3PA 1F8SA 4CBQA 2GAHB 3CIRA 3PO7A 4X9MA 4EMWA 5J60A 3NGCX 2BS2A 2GRTA 2ZZCA 4REKA 1PHHA 3OC4A 2OAMA 2VZ2A 4OVIA 1DOCA 2YLWA 3DJEA 2FJEA 1B37A 5EOWA 4U8NA 2WP6A 1BGNA 4C77A 2BCGG 3FG2P 1S2QA 2AAQA 1F8RA 2Y6QA 2QA1A 3IWAA 4A9WA 4CCQA 2XVIA 2YR4A 4TLZA 1VRQB 1IUXA 1ELIA 1H7WA 2V61A 2YR5A 4B63A 1CBOA 2E5VA 3CN8A 3ZDNA 3B3RA 5KOWA 1S3EA 2YVGA 2GMHA 4Z44A 4EQWA 4YKGA 1N4UA 4YSXA 3NT6A 5U1OA 1GNDA 4K22A 5HXIA 3RNMA 2B7RA 4K2XA 3NTDA 4H4RA 4K5SA 4ECHA 1KDGA 2PHHA 4H4YA 2TMDA 4ICYA 3CNTA 3NTAA 4AP1A 3BNUA 5DBJA 4CNJA 4BK1A 3Q6JA 4CNKA 5FMHA 3AE8A 1D4DA 1K0LA 1ZY8A 4TLXA 5JCMA 2QA2A 1H83A 2XLSA 2NPXA 1YY5A 1IUSA 2WPCA 2GR2A 1TDKA 4Y4NA 2X99A 2F5ZA 1EL5A 1CC2A 5FS6A 2GF3A 3QJ4A 4B67A 2UZZA 3V3NA 3G5QA 3ICRA 4EQXA 3IF9A 1LJ1A 1P2HA 1F8WA 4EM3A 1NG3A 2CDUA 3NH3X 2YLZA 1Y56B 3ATRA 4DNAA 1NEKA 3GRSA 4GDEA 2GR0A 2ZZ0A 3AE9A 3EPTA 1YQZA 3UTEA 4IV9A 2YQUA 2JAEA 3UP4A 1E1LA 1XPQA 1TDNA 5TR3A 2YAUA 3DMEA 4XXGA 4NTDA 4AOSA 1D4CA 3OZ2A 3URHA 3GD4A 1GOSA 1CJ3A 4Z24A 3GRTA 2Q7VA 1JRZA 4A79A 3NG7X 1PBDA 3VRDB 1VQWA 2CVJA 1XANA 2GQFA 2GH5A 4WX1A 3QSSA 1DJQA 1E6EA 2JB2A 2YVFA 4APNA 1KSUA 5U63A 2CULA 2JKCA 2A89A 4JNAA 4OPUA 1K0IA 1OJCA 4RG3A 4H4SA 2Y6RA 1O5WA 2FJDA 2WP5A 2YLSA 3AEFA 3BI5A 3SFDA 1PN0A 1GTHA 4JY2A 1TDFA 3CNJA 4A65A 4D03A 3CGBA 5C2TA 2BABA 3CGEA 1Z6LA 3F8PA 2EQ9A 3Q9TA 5CQFA 1BWCA 4RSLA 4YSHA 3NLCA 3VR9A 3DGHA 4YSYA 1P2EA 2IVDA 2WS3A 1QO8A 3QVPA 4A5LA 4U2TA 1F6MA 2WOVA 3ATQA 3LXDA 4H4QA 3GSIA 3L1RA 4Z2RA 3ALLA 4H2RA 4U8OA 4UDPA 2XLPA 1JNZA 1OJ9A 1IUVA 1CC4A 2DKHA 3AECA 3KU9A 4A6NB 3IHGA 5KVIA 1H82A 4X4JA 4M52A 1O95A 1FOHA 1K4QA 5KWFA 3LJPA 5IQ1A 2IIDA 2C67A 3DK4A 2PYXA 2WETA 2OALA 2FJBA 4GDPA 2BYBA 1GRBA 2WEUA 1SEZA 1PJ6A 1LV0A 4H4XA 3AWIA 4ADWA 3UKFA 1GRGA 2AR8A 3UOZA 1XDIA 2GEWA 5HHFA 2R4EA 3DJJA 3AXBA 1FEBA 2B9YA 5CKUA 2C64A 4Z2UA 5JCLA 5M10A 4LIIA 4ZN0A 3F8RA 4WCTA 4B64A 1GRHA 3DH9A 3NN0X 4GCMA 2WOIA 4ZCCA 5KVHA 1S2YA 3AE3A 2HQMA 4B1BA 2WESA 4X9NA 3K7TA 4FK1C 4UDRA 2C73A 2GVCA 1NHRA 1GREA 4J2WA 1JRXA 4J33A 3KVEA 3ABVA 4AP3A 3PVCA 1EL8A 1MO9A 1PDHA 5FS7A 2R9ZA 2B7SA 1PBEA 4U8MA 3KKJA 2FJAA 4FDCB 2WU5A 3RP7A 1Y0PA 2BXRA 3K7MX 2YG4A 2ACZA 3QFBA 4HB9A 3UOXA 4C3YA 4YWOA 2XDOA 1NHQA 2YG3A 2XFNA 3EANA 3RP6A 4EMJA 3SQPA 1NPXA 1YQ4A 2JBVA 1CJ4A 2OLNA 3C96A 1PXAA 3VQRA 4OPLA 3VRBA 2GAGB 5J7XA 4GR1A 2YVJA 1TRBA 1X31B 3CNDA 1PJ5A 1H7XA 2ARDA 4J56A 3S61A 1CF3A 1MOKA 2WBAA 5U25A 1NHSA 3DJDA 5BUKA 2GQWA 2XVHA 2WPFA 2GV8A 1KNRA 4Y4LA 5IPYA 1COYA 3ICTA 2VVMA 1FEAA 1DOBA 4OPCA 1JOAA 4UDQA 3UTHA 2GB0A 2WHDA 1Q1RA 1IUWA 3SGLA 5EB4A 1Y56A 3V3OA 4B68A 4Y4MA 5KRQA 3IC9A 3GYIA 3ITJA 3L8KA 4EQSA 2H88A 5EB5A 3M0OA 2OA1A 3NIXA 4AOXA 4BJYA 1PBBA 1GTEA 3AD8B 3AYLA 4H2QA 3ZYXA 5LV9A 3P4QA 2XLTA 3HZLA 1B4VA 4YXDA 1NG4A 4I58A 3GWFA 2RGJA 4K8DA 1KSSA 3NYCA 3BNMA 1HYUA 3DGZA 4CCRA 5HY5A 3DJGX 3PS9A 2C76A 4FX9A 4U8PA 4LA1A 3VRAA 2YM1A 1LQTA 1M64A 1B8SA 1ZKQA 2XFPA 5EBKA 2B76A 5M0ZA 1E1MA 2X50A 4B65A 1N4VA 1AOGA 5FS9A 3C4NA 1GSNA 1W4XA 2X8CA 1UKVG 3FIMB 1FCDA 4OCGA 3E1TA 4CY6A 3NK0X 1D5TA 2BK4A 3AEGA 1JRYA 4NTEA 3LADA 5IQ4A 3F8DA 3GMCA 3NYFA 4J31A 2IVEA 2B9WA 3AYIA 4B69A 4UP3A 3O0HA 3UKLA 2RGHA 3CGCA 4USQA 4DSGA 3AD9B 2XFOA 3AYJA 1IUUA 3P4PA 3P4SA 3NRNA 1OJTA 4A6NA 2Q6UA 4B66A 2WP9A 4U8JA 2E4GA 1ZP0A 2V3AA 1BGJA 3NK1X 2BK3A 2GR3A 1K0JA 3AEEA 2A87A 3B6DA 5FS8A 4Z26A 1JEHA 3GYJA 4C5OA 4K7ZA 2EQ6A 1O94A 2R0PA 2R0CA 4EQRA 1EL9A 4H7UA 1D7LA 3UTGA 3H4KA 4H4WA 4JDRA 1GRAA 1H86A 1PBFA 2V3BA 4MJWA 5BRTA 1KNPA 3QSMA 1ZX9A 1TYPA 3ISHA 4EIPA 1VDCA 3QVRA 4OPGA 3UKHA 4H2NA 1CJCA 1GETA 4YKFA 3GWDA 2BC1A 3DA1A 2OLOA 3ICSA 3AE2A 4EM4A 5JCKA 1NDAA 3RHAA 2VOUA 1VG0A 2GMJA 2VQ7A 4YTMA 1FECA 4IA6A 3NK2X 4NEVA 5BULA 4RG4A 3QSEA 2YG5A 4PAAA 1KF6A 2XFUA 5GSNA 3BI2A 4KPRA 4TM0A 3CNPA 4CY8A 4JQ9A 1E7PA 2BC0A 3NKSA 2VRLA 1NENA 1CHUA 1LTXR 3SFEA 4YT0A 2YG6A 3K30A 2XLUA 1L9DA 3QFAA 4C74A 1D4EA 2RGOA 3LZXA 3AE6A 4EIQA 4NEWA 1M6IA 1B5QA 3D1CA 4U8IA 3CGDA 1L9CA 1LQUA 4USRA 3G5SA 1TDOA 2Z5XA 3NNEA 2Z5YA 2B9XA 1JU2A 2X8GA 2GR1A 1DOEA 1OJAA 2A8XA 1XHCA 4U8KA 1DNCA 3UKKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OCFA 3V76A 1XIYA 3CMMA 3P90A 3LORA 1YZXA 4GUVA 3LYPA 5IMAA 2C0GA 4GF0A 2GLRA 3LJRA 20GSA 4LU6A 2HZEA 2YLTA 5G5FA 3U5RE 4H4TA 1PGTA 4BJZA 3QAGA 2XBIA 4BVYB 3IHQA 3KH7A 3GDNA 5CO3A 2APGA 3GL5A 3UKAA 2BA9A 2TRXA 3WE0A 1CL0A 4DGKA 1QUWA 3I3LA 1VRSD 5D73A 5GAPD 1A8LA 4GAPA 3KLJA 2YLRA 5KMPA 3KPFA 2B1LA 3AEDA 5IMVA 1S3CA 1XOBA 3H8IA 4YAPA 1GUMA 4K7OA 3VWWA 5D9WA 2G0FA 1RYIA 4AJ7A 2JK6A 2VVLA 4HA6A 3T31A 4YTNA 1VF3A 1JFUA 2NVLA 5ECHB 4TM1A 4TVEA 2BXSA 5KN1A 4BK2A 2BMXA 2H1AA 3MAKA 1VGLA 2JACA 2VVLG 4YQVA 5JCGA 2L57A 1XWBA 1MXTA 3AE4A 2LKUA 4FK1A 2LV3A 2TIRA 1XXUA 1PXBA 1X5CA 1RSGA 1YKJA 4YSZA 2X4AA 4E8HA 1TYTA 2OBKA 3LOVA 1K3YA 3BHFA 3DIEA 4Z2TA 3NN6X 4N9XA 4OPIA 2XVEA 3I6DA 4GXZA 2J3NA 2Q0KA 2VM2A 3IR4A 3EU3A 3QFBC 3NZNA 2X49A 1Q1WA 1GSEA 1GUHA 4YTPA 1GV4A 2VQBA 3M3MA 1M9BA 2VL2A 2EQ8A 4ECCA 1TDEA 3HYXA 1U6TA 4OFTA 3AEBA 5KXJA 5FHIA 4JNQA 2HSMA 4C3XA 3ZTLA 2O89A 4KDUA 2X3NA 4A99A 5ECRB 4H4UA 3ALMA 4AT0A 1YY7A 2I1UA 2FBWA 2VOCA 2AQJA 1MTCA 3F0IA 1E2YA 3TRQA 1EP8A 2V6OA 4MPGA 3CSIA 4PABA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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