4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
2AR8A 4NTEA 3VQRA 3C4NA 1NG3A 1NDAA 3NYCA 4YWOA 4C3XA 5C3JA 1EL7A 2C64A 4U8PA 4EQWA 2V61A 4EIQA 2J3NA 2WPCA 3NKSA 3VR9A 2Q7VA 2WU2A 4AOXA 3QSEA 2YG3A 3GMCA 4GUVA 3ALLA 1ZX9A 4J57A 3NT6A 5EB4A 3VRAA 1MXTA 1CJ4A 3CPIG 2FJAA 4Z2UA 4UDQA 3QSSA 4GRTA 1PS9A 3ALMA 5KWFA 2XYOA 1TDFA 1Y56A 3NLCA 4JQ9A 3NN6X 3AE1A 1AOGA 3AD7B 3DH9A 4U2TA 4UDRA 2H88A 4D03A 1BZLA 3BNUA 4OPLA 4YXDA 4OCGA 3CPJG 3SM8A 3UKQA 2ARDA 3EF6A 4OPGA 5BVAA 2YVJA 3NK2X 4YSZA 3AE7A 3CGDA 4IA6A 4U8IA 4C74A 2RGJA 1S2QA 5KOWA 4Z26A 2Q6UA 3D8XA 3LZXA 2WESA 1PBEA 1CF3A 3AE8A 5FS7A 4DSGA 1M64A 2ZZBA 4EMJA 1NHRA 3WE0A 1ZOYA 4A7AA 5J60A 1CJ2A 1YKJA 3CN8A 4H2PA 1PJ7A 1Q9IA 3COXA 1GOSA 1BGNA 5ER0A 3AE4A 4ZCDA 5KRQA 3SFEA 2YR4A 2B9YA 2UZZA 3F8RA 4K8DA 3DK9A 3AE6A 3RP8A 2XFQA 3ICTA 2BXRA 3UCLA 2WQYA 4RSLA 1K4QA 1JEHA 5DBJA 1L0VA 1ZOVA 4CNJA 3AE3A 2VQ7A 5BRTA 2C3DA 3AEAA 1N4WA 3I6DA 3O0HA 4C77A 4YT0A 1GRGA 1F3PA 1RSGA 2B7RA 2GEWA 3UKAA 4CCQA 3AECA 4NTDA 2RGOA 4Z2TA 2XVEA 1TYPA 1M6IA 1B37A 1GRBA 4IV9A 1CC6A 1IUXA 2IIDA 4FK1A 3DGZA 1CBOA 3CNJA 4ZN0A 2C75A 1GRFA 4PAAA 2Z5YA 2ZZCA 1YQ3A 4ECHA 1EL9A 3VRBA 4P9SA 2YLSA 4AOSA 2W0HA 4JNQA 4CBQA 1E39A 4H4XA 2GAHB 3NYEA 3QFBA 2YWLA 3M12A 3QSMA 2Q0LA 4LA1A 3P9UA 2NPXA 1ZP0A 3PO7A 4TM1A 1FEAA 3LADA 3I3LA 4JNAA 4UDPA 1KFYA 3KD9A 3K30A 2AAQA 5BUKA 2F5ZA 2VVLA 3P4PA 1H6VA 1REOA 4H4VA 2B7SA 2JB1A 4EQXA 1RP0A 1P2EA 2XLPA 2XLRA 2XVJA 2X3NA 3AEDA 3R9UA 1E7PA 1QO8A 2E1MA 2OA1A 4AP1A 2YLZA 3V3NA 4FDCB 4N9XA 3CGCA 4BK2A 3F8PA 2IVEA 4PABA 4FK1C 1OJAA 1FCDA 3AXBA 2BS3A 2PYXA 1L9DA 1BKWA 2CFYA 4U8OA 2R0CA 3NK0X 4NEVA 2GR1A 3EANA 4DNAA 3UOVA 2GRTA 1DOEA 1PXBA 2R0GA 4JN9A 2OLOA 4LIIA 4NZHA 3K7TA 2C72A 4GDEA 4IVMB 3V3OA 4Y4LA 2XLTA 1E1LA 2OLNA 3CGBA 4YSHA 1D7YA 2C66A 2FJBA 3DJDA 3FPZA 4H4PA 4E0VA 1KNRA 2A8XA 1F8RA 2C67A 3IHMA 2WU5A 3UTFA 4B67A 4Z25A 1F8SA 3KVEA 1GNDA 1H7WA 1FEBA 2CULA 1OJ9A 1SEZA 3CIRA 4C3YA 3GYJA 4GCMA 3ICRA 2DKHA 3URHA 2QA2A 1CHUA 3GMBA 4EM4A 3GSIA 2B9XA 3D1CA 2OALA 1MO9A 2GMJA 3CGEA 4A6NB 4A65A 1PBBA 4Z24A 1LJ1A 3UOXA 4J31A 4EMIA 4K2XA 3GDPA 4AT2A 1H82A 2WBAA 3L1RA 3PVCA 3ISHA 3RP6A 2VOUA 1NHQA 4B68A 2C7GA 4J2WA 1TDOA 1ZKQA 2JBVA 3VR8A 2WEUA 2A89A 4H2NA 4AT0A 4B66A 1O5WA 1CC2A 1KSSA 1ONFA 1H84A 4D04A 2C65A 2GR0A 3RNMA 1KNPA 2WP6A 2YVFA 5EBKA 1ZMCA 4JY2A 4JY3A 2C3CA 1ELIA 5FS9A 3ABVA 1GREA 2C73A 2WS3A 3AEEA 3CPHG 4Y4NA 5GRTA 2FBWA 1JOAA 1XANA 2BCGG 4B1BA 1LV0A 4Y4MA 2YM2A 2JKCA 3AEBA 3UTHA 1PN0A 4GF7A 5KXJA 5HXIA 3ICSA 2WDVA 2XVIA 1E1MA 2X99A 1P2HA 3FBSA 3GYIA 1KDGA 4WX1A 5JCLA 2BK4A 2YLWA 2XFUA 2ZZ0A 4BJYA 1CL0A 4H4ZA 3OZ2A 4OPCA 4HA6A 2BA9A 2WDQA 4EM3A 3C96A 4X4JA 2BS2A 2X8HA 4U2LA 1S3BA 1EL8A 3Q9TA 2ZBWA 1PBCA 4U8KA 2QCUA 4J34A 1DXLA 3BI4A 2X50A 2I0ZA 4WCTA 5IQ1A 3Q6JA 3S5WA 3P1WA 3S61A 1PJ6A 5U1OA 4NTCA 1VQWA 2V5ZA 3NYFA 3IHGA 3IC9A 1O95A 3KKJA 1GERA 1JRYA 1PXAA 1Y0PA 2E4GA 3K7MX 1IUUA 3AD8B 4H4WA 1Z6LA 4EIPA 3DJGX 4J33A 4CCRA 3DK8A 1K0IA 1CJ3A 2XDOA 1OJTA 1PDHA 3V76A 2GR3A 3UKKA 2R0PA 2GQFA 1TDKA 3PS9A 4IA5A 3UOYA 2V3AA 4U8LA 2Y6QA 2VZ2A 4O5UA 4RG4A 4B69A 3KLJA 3UKLA 2GVCA 2YM1A 4A5LA 3G5QA 4I59A 1JNRA 1GALA 2X8GA 2YVGA 3LJPA 1LQUA 1NAAA 2BC0A 2VVLG 4APNA 5CQFA 3GRTA 3AE5A 5FS6A 1IUTA 2YG6A 3KPFA 3BHKA 4TLZA 3NNEA 1L9CA 3REDA 1ZMDA 4K22A 5KVIA 1PBFA 3NGCX 3P4QA 5KOXA 1JU2A 3DJEA 1DOBA 4H4TA 2H89A 3EPTA 3NHOX 3GDNA 3NG7X 5FMHA 1B4VA 2JB2A 2YR5A 3AE9A 3ALJA 3AB1A 3C4AA 4LU6A 2YG7A 2VQBA 1GSNA 1EL5A 1GPEA 1LPFA 3AEGA 3NTAA 2R46A 3H8LA 4YSYA 1FOHA 2TMDA 4TM4A 5M10A 2XLUA 2JAEA 1IUVA 1KF6A 3QFAA 1VG0A 4GDPA 1YY5A 1FL2A 4OPDA 3AYIA 3UTEA 3LB8A 1BWCA 2A87A 2XFNA 1TYTA 2GV8A 2WOIA 3QVPA 4YTNA 3RHAA 3GWFA 1JNZA 5M0ZA 4J56A 2BK5A 2HQMA 1H86A 3UKHA 3UP5A 4RG3A 3CNTA 1DJNA 4U2SA 3G5SA 1IUWA 3NH3X 3DJJA 1S2YA 2WOWA 1NHSA 2B9WA 2YLXA 1ZDLA 3BI2A 3LZWA 4BV6A 3ADAB 4ZCCA 4DSHA 2NVKX 4C5OA 3RP7A 1FECA 1OJCA 2EQ6A 3UOZA 4EQSA 3II4A 4USRA 1B8SA 4H2RA 1RYIA 2EQ9A 1W4XA 3QVRA 4MJWA 2YQUA 1D4DA 3CNPA 4U8MA 1Y56B 1BF3A 3OC4A 2DKIA 3UKPA 1PXCA 3AWIA 1DJQA 2WHDA 1JRZA 3B3RA 4CY6A 1GRHA 2BXSA 1GRTA 4BURA 4OPIA 4DGKA 5JCKA 4U8JA 3FIMB 1E1NA 3L8KA 2BC1A 2GB0A 4K5RA 2EQ8A 3SGLA 1GRAA 2R4EA 1L9EA 1D7LA 2JK6A 2VRMA 1HYUA 1PBDA 1UKVG 3QJ4A 3DMEA 5JCIA 3SFDA 3KA7A 2C70A 4I58A 5FS8A 4B64A 4CNKA 1XHCA 2R45A 1QJDA 1IJHA 5GSNA 3AYJA 1GTEA 2WP9A 1Q1RA 2GF3A 3SQPA 3NRNA 1DOCA 3AE2A 1YQZA 4H2QA 1H7XA 3M13A 3CNSA 4EMWA 4A6NA 1TDEA 1NHPA 1CJCA 4XWRA 3ZDNA 1COYA 4K5SA 2BK3A 2PHHA 2OAMA 3K7QX 2YLTA 4HB9A 4AP3A 5IQ4A 3UP4A 1Q1WA 4M52A 4FX9A 2XFPA 4Z44A 3LXDA 3H4KA 1JRXA 2BACA 2VRLA 4O5QA 5TR3A 3P4RA 2TPRA 3LOVA 1GXFA 1NPXA 5HY5A 3M0OA 1QLBA 3NIXA 3VRDB 1GESA 1LQTA 3IF9A 3NTDA 5C2TA 1H83A 2BCPA 2WETA 5J7XA 3P4SA 4UP3A 1E1KA 3DGHA 3HZLA 4ADWA 5IPYA 4EQRA 2FJDA 3BNMA 3GD3A 4J36A 2VVMA 4TM3A 2BABA 1O94A 4H7UA 4U8NA 4H50A 4XWZA 2GQWA 2V60A 1OJDA 5JCNA 2E5VA 4REKA 3H8IA 1X31B 4YKGA 1LTXR 5U63A 3GD4A 3GRSA 4YSXA 2RABA 4USQA 4Z2RA 4A99A 1DODA 2GAGB 5LV9A 5EOWA 4ICYA 2V6OA 4XXGA 1DNCA 2R9ZA 2GH5A 1D4EA 2CVJA 4BK1A 5HYMA 4X9MA 3GWDA 2AQJA 2B76A 1ZY8A 2YR6A 5KVHA 1V59A 1GTHA 1ZK7A 3KU9A 1GEUA 1N4UA 1VG9A 4YKFA 2APGA 4TM0A 2YG4A 4CRTA 5JCMA 4B63A 5BULA 4H4YA 4H4RA 1XPQA 1N4VA 2RGHA 2Q0KA 4BK3A 2XCGA 3DK4A 1GT8A 2YG5A 3B6DA 2QA1A 2WDRA 2WPEA 5EB5A 2BYBA 1VRQB 4OPTA 3ITJA 3EAOA 3T37A 1N1PA 3AYLA 4YTPA 1PJ5A 3BI5A 1VDCA 4TLXA 1TRBA 2XFOA 3UKFA 2GMHA 4OPUA 4CY8A 1NG4A 2QAEA 2WOVA 1NEKA 2ACZA 4H4UA 3ZYXA 1K0LA 1PHHA 2EQ7A 1S3EA 4YTMA 4B65A 2C76A 1BGJA 3NN0X 1K0JA 2WP5A 4JDRA 4KX6A 2R4JA 3ATQA 3G5RA 1NENA 1D4CA 1XDIA 4H4SA 1IUSA 1GETA 1H81A 1YQ4A 1CC4A 2BS4A 2X8CA 3NK1X 1GV4A 2YAUA 2O9ZA 1EBDA 3AEFA 1F6MA 3F8DA 3DA1A 2CDUA 1F8WA 4K7ZA 1KSUA 5U25A 1B5QA 4H4QA 3UTGA 4NEWA 3IWAA 2Y6RA 1D5TA 2JB3A 4A9WA 4OVIA 2XVHA 2XLSA 3CNDA 3FMWA 3JSKA 4Z43A 4IVOB 2GR2A 4BJZA 1E6EA 5HHFA 3AD9B 3CTYA 1LVLA 2FJEA 2YLRA 2WPFA 4KPRA 1TDNA 4X9NA 2IVDA 1MOKA 3BHFA 5CKUA 2XVFA 4A79A 2Z5XA 2V3BA 3FG2P 3ATRA 4GR1A 5L46A 3E1TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
8GSSA 2C64A 4ZL8A 5E4WA 3IOSA 4PTSA 4AJ8A 5IQYA 3VR9A 2GSTA 3QSEA 2YG3A 4RQRA 1A0RP 5HQPA 2HXKA 4POLA 1ML6A 2AAWA 3ZFLA 4EL1A 4UDQA 4ML6A 2HZEB 1FVJA 5IO0A 4AJ7A 1F37A 2QKEA 3ALMA 2XYOA 3KCMA 3NN6X 20GSA 1PA3A 5HFKA 2H88A 4D03A 3US3A 4F9ZA 1AQWA 2BJXA 3EF6A 1QUWA 3AE7A 4C74A 1F3AA 4PUAA 2IMDA 3EYTA 2Q6UA 3TDGA 2OA7A 1PBEA 4EDYA 1LU4A 1CF3A 5FS7A 1TU7A 3G7JA 3SWLA 2H8LA 3EU4A 4A7AA 5J60A 5HR2A 3CN8A 4H2PA 3COXA 1ZGNA 2B1KA 3IXRA 1BGNA 2HI7A 2B9YA 2JZTA 2KP1A 4BPYA 2UZZA 2XFQA 1IYHA 1V98A 1K4QA 1YQ1A 2FWGA 2H6ZA 1DSBA 3CBUA 1USBA 3M0FA 2VCVA 1L0VA 4YT0A 1WP0A 3IE3A 2B7RA 5DVBA 3H93A 1X0RA 2L59A 3CRUA 3FRCA 3I9V2 2B5XA 2GGTA 1IUXA 3O3TA 2IIDA 4ZN0A 2JSYA 4LMVA 4KCAA 1UC7A 3QAVA 5DCHA 4ECHA 4TOPA 1OC8A 1EL9A 3KM6A 2YLSA 2W0HA 3CSHA 4JNQA 2HFDA 3NYEA 1F2EA 4IJ3A 5ECMB 2GLRA 4LA1A 2Q0LA 2VCZA 1UN2A 4FYUA 4JR6A 4IBPA 1FEAA 3I3LA 2E2MA 2C4JA 5G31A 4KSMA 4TXOA 1H6VA 1REOA 1RP0A 2XVJA 2OACA 2X3NA 1SK0A 3HVVA 2L5LA 2OA1A 3IAS2 1R7HA 4N9XA 3CGCA 3F4SA 2GSSA 4PABA 2QC7A 5G5EA 1L9DA 3IHQA 3EANA 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1OC9A 1B4VA 2HSYA 1PRXA 3GN3A 3BOAA 1F9MA 3EURA 4P3YB 1GSNA 1EL5A 3NTAA 2IJYA 2JACA 4Q5RA 4PQ1A 1KNGA 1KF6A 1VG0A 2FA8A 3O76A 4GDPA 3BCIA 3C1SA 4HU7A 5KN1A 3LB8A 2DJJA 2A87A 2E2GA 1R5PA 2WOIA 1MDJA 3GWFA 4L5LA 5M0ZA 4MF5A 2BK5A 4U2SA 1IUWA 3A2XA 3A2WA 2WOWA 5COHA 1ZDLA 3TJKA 3KPKA 3LZWA 5EVOA 3QFBC 2LRCA 1FECA 2IFQA 1OJCA 3UOZA 3HYVA 3DVWA 3QD9A 3KXOA 4JU5A 4USRA 3TJFA 4EQSA 5B8BA 1D4DA 3BCKA 1BF3A 4ILFA 2DKIA 4D73B 3CTFA 2LJKA 2RIIA 1GRHA 3R3EA 1GRTA 4BURA 4DGKA 3PGTA 3HVNA 2EIRA 2KHPA 5JCKA 3TJJA 4FO5A 3VWWA 3IRAA 3C73A 4X1UA 5GAPD 3ZVJA 5B8AA 3F6DA 2PPTA 3QJ4A 3DMEA 5JCIA 2GT5A 5HFIA 1XHCA 1GLPA 2FGXA 2NPBA 2R45A 1B9XC 1QJDA 5IMDA 1IJHA 5GSNA 3VWXA 1Q1RA 3SQPA 4MH2A 5LNKe 3AE2A 5GSTA 1K0BA 2V1MA 4AGSA 2ZNMA 3M13A 1G0TA 4G9HA 3CNSA 3UBLA 3F0IA 1NHPA 4XWRA 1COYA 1YDKA 2BK3A 4PGTA 3FKFA 3UP4A 2IL3A 4F0BA 5ID2B 2D2ZA 2XFPA 1PX7A 2GZYA 1NW2A 4Z44A 4MH3A 5TR3A 3VFIA 14GSA 2XC2A 3UMAA 1S3DA 1YKCA 1GSSA 1PFOA 4OMVA 3TJBA 1NPXA 3LOVA 1GESA 4I5QA 2BCPA 3WT2A 1E1KA 2DLXA 3F6FA 3ZZXA 1ZOFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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