4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
4N9XA 1GRTA 2EQ9A 5EBKA 4Z44A 1DNCA 2FJEA 1F8WA 1D4DA 4RSLA 4GF7A 4YTPA 3UCLA 1DJNA 1XPQA 4H4ZA 1ZY8A 5KVIA 2XCGA 2YWLA 3UOYA 1CC6A 2VZ2A 4I58A 1L0VA 3M13A 2BC1A 1Q1WA 2A87A 3LOVA 1IJHA 4FK1A 4JQ9A 3UKAA 3FPZA 3UP4A 3UKFA 2B9YA 3CGEA 4A6NA 3AEAA 3EF6A 1GESA 4C74A 4YSHA 2R0GA 3IF9A 3AD8B 3UKKA 2C73A 1L9CA 2C66A 1MOKA 1GV4A 2IVEA 2GAHB 2GRTA 4USQA 4BJYA 4AT0A 1QJDA 4K8DA 4RG3A 3NN0X 5IQ1A 4H4PA 1GT8A 1REOA 1VRQB 4EIQA 3KU9A 4U8PA 4LA1A 2JB3A 4A5LA 4IA6A 3KLJA 3ICRA 1COYA 2YG6A 4DSHA 2CVJA 2WDRA 3H4KA 3NKSA 2WOWA 4ZN0A 3NG7X 1D7YA 4EMIA 2B7SA 2BS4A 1ZP0A 2RGOA 4K2XA 2QAEA 1E7PA 3E1TA 3M12A 3BNMA 4U8KA 5BVAA 2YG3A 4BK3A 4WCTA 3ADAB 1MO9A 4YXDA 3BI4A 5DBJA 1VDCA 3UTHA 2XVEA 4Z26A 2OLOA 1OJDA 2XFOA 4H4UA 1K0IA 3EANA 2YM2A 3KD9A 3BHKA 4GR1A 3GSIA 2FJDA 3GD4A 4YSYA 4IVOB 1GTHA 3B6DA 3UTEA 4IVMB 3ALLA 1OJ9A 3AYLA 1PJ6A 5JCIA 2X3NA 5FS9A 4OPLA 1GRAA 1PXAA 3GYIA 4BK2A 1CJ3A 3Q6JA 2GH5A 1PBFA 3AE2A 1M64A 1Y56A 4EQSA 4DSGA 1CJCA 1RSGA 4EQXA 1LVLA 3ICSA 5IPYA 1N1PA 1IUUA 1LPFA 3NK2X 4CRTA 2H89A 2IIDA 3DMEA 2WOVA 3QJ4A 3QSMA 4H4RA 1UKVG 1ZKQA 3NYCA 3AE1A 4H2PA 2B7RA 2JKCA 3UOVA 2GR1A 2UZZA 2XVFA 1M6IA 4YT0A 1EL9A 4XWZA 4U8JA 2WPCA 4AT2A 2JAEA 4H50A 3K7TA 1GREA 1DXLA 2JK6A 3BNUA 3RNMA 3GRTA 2X99A 5U63A 1TDKA 3NK0X 3BHFA 1TDFA 1EL7A 4H4SA 4CY6A 4REKA 2O9ZA 1K0LA 2A89A 2R9ZA 3CNDA 3RP8A 2X8GA 4OPUA 2Q7VA 3CN8A 3ZYXA 1N4WA 1JRYA 4UDPA 5KWFA 1E39A 2BA9A 3UTGA 4P9SA 3P4RA 4BK1A 2PYXA 3LJPA 3SFEA 1CC4A 1BGNA 1L9EA 1ONFA 4U8LA 4DGKA 2Q0LA 4O5QA 4CNJA 1K4QA 4TLZA 1QO8A 2DKIA 3AE7A 4CCQA 1CBOA 2WPEA 1E1KA 2BXRA 4TM4A 1FEAA 1S3EA 3CIRA 3DK4A 3II4A 4JY2A 3S5WA 2WP5A 2B9WA 5KRQA 2BK4A 1OJCA 3FBSA 4GRTA 3LZXA 2OAMA 5KOXA 4XWRA 3HZLA 1Q1RA 1FEBA 3AEGA 3PO7A 2YLRA 2ZZBA 3KKJA 3K30A 5KOWA 1KSSA 3G5QA 4OPTA 1ZOYA 2CULA 3ATRA 5CKUA 2FJBA 4K5SA 1FL2A 3Q9TA 3DJJA 3NGCX 4B68A 2J3NA 1E1LA 1P2EA 2VQBA 4X9MA 4Z2UA 3AECA 5BULA 3RHAA 1NG4A 1ZMDA 2BACA 3GWFA 4A79A 1D4CA 2ZBWA 3AE5A 3D1CA 2B76A 2JB2A 3EAOA 5GRTA 2BXSA 2YVGA 2Q0KA 3IHGA 3KA7A 4LU6A 2WOIA 2OA1A 3P4SA 2Z5XA 4HB9A 1TDNA 4JNAA 4KPRA 5HXIA 3CPJG 3CNPA 1V59A 4M52A 5HHFA 4Z2RA 3NHOX 1JNZA 4H2QA 3NYEA 4H4XA 3GRSA 2WU5A 2QCUA 2EQ7A 3K7MX 2VQ7A 2WDVA 1CHUA 2YLSA 2GVCA 3H8LA 4IA5A 4GDPA 3I3LA 4A7AA 3DJGX 4AP1A 4USRA 4CY8A 4NEWA 2VRMA 3R9UA 4EMJA 2B9XA 3BI5A 1NEKA 2X8CA 3GYJA 3QSEA 3AYJA 3VR9A 1Q9IA 1NHQA 1IUVA 3COXA 3AD9B 1B37A 3CNJA 1XANA 4YKFA 1F8RA 1MXTA 5GSNA 1KNPA 1GERA 3DK8A 3IHMA 3PS9A 3DH9A 2Y6RA 4FDCB 4CBQA 1LV0A 4JN9A 3AD7B 3F8PA 2WS3A 3S61A 2E1MA 4IV9A 4U8OA 4I59A 4C5OA 2WESA 1O94A 1E1NA 2V3AA 3BI2A 1PN0A 3AE8A 1P2HA 2WQYA 2BK5A 3AE3A 4A9WA 1TYPA 1LQUA 1S2YA 2OLNA 5FMHA 2C64A 3DGHA 5M10A 2BS3A 4H7UA 4OPIA 4AOXA 3LADA 1VG9A 1GXFA 3AB1A 1PDHA 2QA1A 1PXBA 1TYTA 1PHHA 2GV8A 4D04A 1GRGA 3D8XA 1YY5A 2C7GA 1GRHA 4GUVA 3AEBA 5C3JA 1TRBA 2WEUA 3CGBA 4H4QA 4TM0A 2C76A 2YR6A 2BYBA 1JEHA 2R4JA 5U25A 4C3XA 1BWCA 2XFNA 1B5QA 4H4WA 3QSSA 4KX6A 3NYFA 4YWOA 2C3CA 3CPHG 2YM1A 4NEVA 1BF3A 5J7XA 1KFYA 2XVJA 4C77A 2BK3A 1VG0A 1QLBA 4MJWA 4J2WA 3NH3X 3NN6X 4HA6A 1ZDLA 1YKJA 1DODA 1PBEA 3UTFA 1Y0PA 2V6OA 4OCGA 4TM1A 1E1MA 5EB4A 4BV6A 4BJZA 3L1RA 4EM4A 1H84A 5EOWA 2JBVA 1FOHA 3T37A 2GR0A 4GDEA 3AE4A 2C67A 1LTXR 3OZ2A 2PHHA 3DGZA 4A99A 2ZZ0A 4AP3A 1NHSA 2GF3A 2XFQA 4JY3A 1NAAA 1JRXA 2TPRA 2AR8A 2VVLA 2XVIA 1Z6LA 2HQMA 3RP7A 4B67A 1GEUA 2YG7A 3GDNA 4RG4A 2FJAA 3B3RA 2FBWA 3IC9A 5FS7A 4CCRA 4TLXA 2VVMA 2WHDA 3ABVA 2NPXA 2GAGB 4X4JA 5J60A 3UKPA 4A6NB 4OPCA 1IUSA 1BZLA 3ATQA 2VVLG 3FIMB 3NLCA 4FX9A 4ZCCA 3UKHA 2X50A 4DNAA 1LQTA 2YG5A 1PBBA 1PBDA 1IUXA 2BABA 2BCPA 2RABA 3F8RA 1IUTA 3VRAA 1S2QA 4H4VA 3LZWA 4JDRA 5EB5A 4B64A 1KF6A 1EL8A 3KPFA 4ECHA 4J34A 4OVIA 2R45A 4Z24A 3UKQA 5JCNA 3ZDNA 4JNQA 1H7XA 1ZX9A 1L9DA 1GNDA 2RGJA 2YLXA 5CQFA 2WU2A 4CNKA 1CC2A 1NHPA 1FECA 4J36A 3QFBA 1ZOVA 2GEWA 4B63A 1N4VA 2WDQA 3VQRA 2YAUA 1NPXA 4J56A 1N4UA 4Z25A 3NNEA 1LJ1A 2R4EA 5HY5A 3DJEA 2NVKX 2XFPA 2JB1A 2YR5A 3CPIG 3AXBA 4YSXA 5L46A 2YG4A 3VRDB 1ELIA 4UDQA 1NENA 1F8SA 1JU2A 3NTAA 3V3NA 4GCMA 1HYUA 4B1BA 2V60A 4J33A 2Y6QA 3CGDA 1IUWA 4U2TA 3K7QX 3NIXA 2BCGG 2XLPA 3OC4A 4EQRA 3ALMA 1Y56B 4B65A 1SEZA 2XVHA 4OPDA 4YKGA 3ALJA 2ZZCA 4K22A 1O95A 3ISHA 1O5WA 3JSKA 2V3BA 4YTMA 3CNTA 5C2TA 1RYIA 1YQZA 5BRTA 5FS8A 3AEEA 2YVFA 1JOAA 1PJ7A 1B4VA 2XLRA 1H83A 4J57A 4K7ZA 1ZK7A 4Y4NA 1NG3A 1NHRA 4U2LA 3EPTA 5U1OA 1AOGA 3ICTA 1CJ4A 1GOSA 2XLTA 3QFAA 3G5SA 3CTYA 5JCKA 1PS9A 1DOEA 1GPEA 3C4NA 1X31B 1OJTA 2CDUA 1XHCA 2WP9A 2YQUA 3WE0A 1VQWA 4PAAA 1DJQA 3DJDA 2XDOA 2GR3A 5FS6A 3FG2P 2EQ6A 4Z43A 1JRZA 2BC0A 5JCMA 3QVPA 4X9NA 2Z5YA 1F3PA 2X8HA 3V3OA 2V5ZA 2GR2A 4H4TA 1H7WA 1W4XA 4Y4MA 1E6EA 5HYMA 3UOZA 1D4EA 2GB0A 3P4QA 4OPGA 4LIIA 4YSZA 2XFUA 1H82A 4YTNA 2R0CA 1KDGA 3AYIA 4NZHA 4H2NA 4Y4LA 1RP0A 1DOCA 2TMDA 3UOXA 1H81A 3NT6A 3GMBA 5IQ4A 1GRBA 1S3BA 4U2SA 3I6DA 4FK1C 3GDPA 2GMJA 4EIPA 4AOSA 5LV9A 2W0HA 2YLTA 4O5UA 1H6VA 3KVEA 1NDAA 3P4PA 3GMCA 3GWDA 4TM3A 1PXCA 1PJ5A 4B66A 3F8DA 4E0VA 1BGJA 3CNSA 3H8IA 2RGHA 4A65A 4ICYA 3AE9A 2YLWA 1FCDA 3AEDA 1ZMCA 2WBAA 1EBDA 2E5VA 2Q6UA 3C4AA 3CGCA 3C96A 4J31A 4XXGA 2R0PA 1DOBA 2WPFA 3URHA 5KVHA 2DKHA 1GETA 1TDOA 2C72A 4EQWA 5ER0A 2C3DA 2APGA 1D7LA 2C70A 1PBCA 2ARDA 2YLZA 2VRLA 1KNRA 2YR4A 2CFYA 4Z2TA 1YQ3A 3M0OA 4NTEA 3REDA 2BS2A 3ITJA 2EQ8A 3AE6A 2OALA 2C65A 1BKWA 2ACZA 2GMHA 3NK1X 3NRNA 3QVRA 3LXDA 2I0ZA 2VOUA 2AQJA 4U8NA 3UP5A 3PVCA 4K5RA 1YQ4A 3NTDA 3SM8A 3FMWA 2GQWA 4ZCDA 2H88A 2YVJA 1F6MA 1TDEA 4H4YA 4UP3A 3VR8A 1OJAA 1B8SA 3P9UA 1XDIA 4PABA 3G5RA 3LB8A 1CL0A 1KSUA 2R46A 1GRFA 1K0JA 2A8XA 4NTCA 4UDRA 4BURA 4ADWA 4NTDA 5TR3A 3DK9A 2F5ZA 3L8KA 4EMWA 2XYOA 3VRBA 5KXJA 3P1WA 3UKLA 4C3YA 4H2RA 4D03A 3V76A 4B69A 3SFDA 3AEFA 1H86A 1CJ2A 1GALA 3AWIA 2C75A 2XLUA 2XLSA 5M0ZA 5BUKA 1JNRA 2AAQA 1GTEA 2E4GA 2WP6A 4U8IA 4U8MA 2QA2A 1D5TA 3O0HA 2V61A 1GSNA 5JCLA 2IVDA 3GD3A 2WETA 4WX1A 3SGLA 3IWAA 4EM3A 1CF3A 4APNA 3DA1A 1EL5A 2GQFA 3SQPA 3RP6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OFNA 4N9XA 1GRTA 1U87A 3N9JA 1GSYA 1F8WA 5E4WA 1A24A 4YTPA 1TKDB 4GSNA 4JU5A 5KVIA 2MBTA 1ZY8A 3F63A 2XCGA 1CC6A 4RUVA 1B4QA 1L0VA 2JL4A 5HFKA 4FK1A 3CGEA 4A6NA 1GESA 4YSHA 3IF9A 5DVBA 2H01A 1XG8A 2C73A 4V1Ag 1MOKA 2IVEA 4USQA 4PNGA 4BJYA 1GL8A 4AT0A 2H8LA 1QJDA 1I5GA 4HUAA 2F9SA 4L0UA 4U8PA 4LA1A 1XPVA 3EC3A 4MNNA 3TCOA 2B7KA 4DSHA 4IELA 1BX9A 4ZN0A 3NG7X 2HSMA 1HNBA 2DMMA 5LCZA 1M3JA 3FHKA 2GSQA 1ZYEA 3HJOA 4K2XA 4ZXGA 3TKRA 1MEKA 1E7PA 1ZP0A 2BS4A 3M12A 5BVAA 1MD4A 4QL9A 3HCZA 2XVEA 3LW9A 1OJDA 2TRXA 4IJ3A 1K0IA 3CRUA 1R4WA 2DC5A 4GR1A 4KW6A 3ZIJA 2FJDA 3GD4A 4IVMB 3IE3A 3AYLA 4ZB6A 2LNTA 4KSOA 4OPLA 4BA7A 1AXDA 1M64A 1LVLA 2GGTA 4K9ZA 1IUUA 1T7PB 4BVXA 2H89A 3DMEA 3NYCA 3AE1A 4H2PA 1E6BA 2B7RA 3DKSA 2JKCA 3IOSA 1OAZA 3KMOA 2XVFA 4X43A 5EY6A 3GHAA 4TVEA 4YT0A 4U8JA 2WPCA 4MA9A 2JAEA 4H50A 1GREA 3RNMA 3RDWA 3QFAC 1B9XC 2X99A 1XZOA 1TDFA 3TJGA 2B1KA 2O9ZA 4KE3A 5B8AA 1BQ7A 2FUG2 4X1UA 2BJXA 2H0HA 3MSZA 5KWFA 2MYGA 2FHEA 3LJPA 2R2JA 2K18A 1L9EA 4HU9A 4PXOA 5E59A 2M46A 2QSIA 2DKIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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