4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
3E1TA 3NRNA 4GR1A 3NT6A 5J7XA 2WDVA 4WCTA 2H89A 3DJDA 2V5ZA 4TM4A 2OALA 1RSGA 1JNZA 5U25A 4J33A 5KVIA 4C3XA 1XANA 3K7TA 5CKUA 2YR5A 3M13A 4AT0A 2F5ZA 5HHFA 1GNDA 2XVIA 4DSHA 2YLTA 4IA5A 1E1LA 3UKLA 2B76A 1F8SA 2AAQA 5ER0A 3DGHA 4KPRA 4REKA 2XVFA 5JCLA 5LV9A 1F8RA 4Z25A 3ITJA 4YTPA 3BNMA 2C66A 3C96A 4NTEA 4Y4NA 2X8CA 1CC6A 1H82A 1BKWA 2JK6A 2DKIA 3BHKA 3CN8A 3SFEA 2YQUA 2WDRA 1GRAA 1NG4A 5KRQA 4TLXA 1D7LA 1KSSA 5HY5A 5C3JA 1YQ3A 1L9CA 3D8XA 4B64A 3G5QA 3CPJG 4H2RA 3B6DA 2XVEA 2BYBA 3FIMB 3SFDA 2YVFA 3CNJA 2C7GA 3R9UA 4JNQA 2R4EA 1VG9A 4USRA 3I6DA 2BCPA 4GDEA 4H4XA 4YKFA 3DA1A 1O94A 1KSUA 4O5UA 4K5SA 3ABVA 2I0ZA 3H8IA 4O5QA 2WEUA 3UOVA 4CCRA 1B5QA 4I59A 1JRZA 4AP3A 3P4QA 2XFNA 3NLCA 1AOGA 2AR8A 4IVMB 1FL2A 2FJBA 1ELIA 5KVHA 3ICRA 4A99A 4K8DA 3CNSA 3AE4A 1LVLA 2RGJA 4H4SA 4I58A 4JNAA 5KOXA 1GRBA 4CY8A 1E1KA 2C73A 5U1OA 2C3CA 2B9WA 1GETA 2EQ6A 1ZX9A 3GSIA 5CQFA 5JCMA 3I3LA 2PYXA 2FJDA 5JCKA 3IHMA 2WOVA 3QVRA 1D7YA 4U2TA 1TDEA 4OPIA 2R46A 4YTMA 4Z2RA 1TRBA 2ARDA 4OCGA 2ZBWA 1LTXR 4EQSA 2WETA 3Q9TA 1O95A 3ATRA 1H6VA 3EF6A 1JNRA 3PS9A 4J31A 4H4WA 2BACA 4H2NA 2H88A 4HB9A 4J57A 4J36A 1KFYA 3AD8B 5GSNA 1S3BA 2VRLA 3GD4A 3K7QX 2BC1A 1DXLA 1L9DA 2TMDA 2WPEA 2WS3A 4GDPA 1YY5A 2YLRA 1DOBA 1FOHA 2YLWA 2X50A 2UZZA 4H4ZA 3GWFA 4CBQA 1LV0A 4UDRA 4Z2TA 1IUWA 4MJWA 4H4YA 1ZY8A 1GREA 3UKHA 2VVMA 2WBAA 4J2WA 4U8KA 2BK3A 3AEDA 1H7XA 1PXAA 1F8WA 3GRTA 1S2QA 2GMJA 1GPEA 3NTDA 2V6OA 1IUTA 1DJQA 2JB2A 2Q6UA 4H4RA 4LA1A 4PABA 1CL0A 2BCGG 3DGZA 2YG6A 1K0LA 2R0GA 2XCGA 5BRTA 4U8OA 4X9NA 3M12A 1B4VA 1LQUA 4NEVA 3WE0A 4AOXA 2OLOA 3AWIA 2Y6QA 3C4NA 3LZWA 3S61A 3VR8A 2BXRA 2BC0A 4JDRA 3VRAA 1E1NA 3G5RA 3P4RA 4Z2UA 4OPUA 3IC9A 4YSZA 5BULA 4YT0A 2RABA 4D04A 3AD9B 1E6EA 4A6NA 2C72A 5IQ4A 1Z6LA 5FS9A 3CIRA 2E5VA 5GRTA 1PJ7A 1EL7A 4U8NA 1B8SA 4BK3A 4BK1A 4B69A 1BWCA 1KNRA 1BF3A 2YG4A 1Y0PA 2WP6A 2XLSA 3P4PA 5M10A 4N9XA 4H4PA 1N1PA 3AXBA 3KKJA 4YSYA 1XDIA 1REOA 2XFOA 2YG5A 4ZCCA 1V59A 3AEAA 4B66A 2WP5A 3NHOX 2CULA 2JB1A 3KU9A 4JY2A 3L1RA 1TDFA 2O9ZA 1COYA 2WPCA 3QVPA 3T37A 4CCQA 4M52A 1BZLA 1CBOA 3ALJA 1IUSA 5EB4A 4UP3A 2WPFA 1GERA 2YVJA 2GEWA 4TM1A 2GVCA 3UCLA 3KVEA 2E1MA 3LOVA 2Q7VA 3DJGX 1VRQB 4K22A 3HZLA 3UTEA 2GQWA 3V76A 4OPLA 3H4KA 3IF9A 1GTHA 4B65A 3AE6A 3D1CA 3V3OA 3EAOA 1NPXA 3CPIG 3KA7A 4A7AA 5L46A 1PBEA 2YG3A 1GRFA 3GYIA 3O0HA 3AEFA 4Z44A 2X8GA 2X8HA 1QLBA 2XFPA 2GRTA 3GWDA 5EOWA 3RHAA 1EBDA 4U8JA 3AYJA 3VRBA 2GR3A 1DNCA 4C74A 2CFYA 4H50A 2B7RA 3Q6JA 1NDAA 4K2XA 3AE2A 2EQ9A 4U8MA 2BABA 5FS8A 1YKJA 2XFQA 3ZYXA 4A65A 3UTHA 1K4QA 1P2EA 1CJCA 4CRTA 3NG7X 3AB1A 1FCDA 1GT8A 1TDNA 3AEEA 1ZDLA 3IHGA 2V60A 3PVCA 4TM3A 4ZN0A 1XPQA 1NHQA 3ADAB 1VQWA 4CNJA 3BI2A 4Y4MA 1CHUA 1GSNA 1NHPA 2VVLA 3K7MX 5JCNA 1N4WA 1PJ5A 2B7SA 3ALLA 1NAAA 3EPTA 1CJ2A 2YLSA 1GRGA 3NYEA 4U8LA 5HYMA 4ECHA 3F8PA 3NK1X 3UOYA 2YWLA 2EQ7A 4FX9A 4AT2A 3RP7A 5M0ZA 4YXDA 1DOCA 1ZOVA 2OLNA 2BK5A 2QCUA 4B1BA 3L8KA 2A89A 3AE8A 2WU5A 1TYTA 1DODA 2RGHA 2QA2A 1PBBA 3AECA 3M0OA 3P1WA 2C75A 2E4GA 3V3NA 1D4CA 3DK8A 3QSSA 4TLZA 1UKVG 3ISHA 3NYFA 3DH9A 5J60A 1S2YA 1EL8A 4GF7A 1IUXA 1GXFA 1ZK7A 2B9XA 1DOEA 2BXSA 2FBWA 2GV8A 3NKSA 4LU6A 5EB5A 5KWFA 4H4VA 3S5WA 4NZHA 4YSXA 1PHHA 4EMIA 1H7WA 2XFUA 2OA1A 4EMWA 1Q1WA 3II4A 1BGNA 5BVAA 3GMCA 1JU2A 1H84A 1CC4A 1IUUA 1H81A 3UKQA 3UKFA 4A5LA 1TDOA 2JKCA 3GMBA 4X4JA 4JN9A 4IVOB 2YLZA 2XLUA 2PHHA 1GEUA 2GR1A 2Q0LA 2GR2A 5FS6A 1LQTA 2WQYA 5TR3A 4YKGA 3REDA 3GDPA 5HXIA 5JCIA 1XHCA 2VRMA 1Y56A 4IV9A 2ZZCA 4RG3A 4BURA 4EQWA 2XDOA 1RYIA 2XVJA 4JQ9A 2GAGB 1YQZA 4AOSA 3H8LA 5BUKA 3LJPA 4USQA 3VR9A 3AEBA 3C4AA 1PS9A 1D5TA 1VDCA 2JBVA 4GCMA 4H4TA 3CTYA 3NIXA 1E7PA 2R0PA 4XXGA 2GMHA 2C65A 2WDQA 3UKAA 4D03A 3ICSA 4YTNA 1P2HA 3CNDA 4AP1A 4TM0A 4H2QA 2IVDA 1OJTA 2ACZA 3CGCA 1F6MA 2W0HA 3NGCX 4J34A 4A79A 1PXCA 1EL5A 2VZ2A 1JRXA 4BJZA 2FJEA 5C2TA 2XLTA 2AQJA 4XWZA 1N4UA 1SEZA 1CJ4A 4A6NB 1GRTA 1PDHA 3NH3X 3NTAA 1GALA 3NN6X 3NK0X 1ONFA 2NVKX 3DJJA 4BK2A 1H83A 2CDUA 1OJ9A 3LXDA 1NENA 4FK1A 1ZMCA 1IUVA 3LADA 2JB3A 3AE9A 4H2PA 1KF6A 2GR0A 4KX6A 1JEHA 2Z5XA 3LZXA 4DSGA 3QFBA 3UKKA 1L9EA 4E0VA 3NYCA 1Q9IA 1OJCA 1GRHA 3OC4A 4B67A 4DGKA 4LIIA 3FBSA 3URHA 2VQBA 4Y4LA 3UTGA 4FDCB 1ZMDA 1LPFA 2ZZBA 3G5SA 3SM8A 2Q0KA 2GH5A 2A8XA 2XLRA 4X9MA 1RP0A 4ADWA 2IVEA 4H4UA 2CVJA 3AEGA 1VG0A 3BNUA 4OPTA 4HA6A 1QJDA 2WU2A 2BK4A 4B68A 1K0JA 2Z5YA 1Q1RA 4EIPA 1PJ6A 4JY3A 5U63A 2WOIA 1OJAA 4OPCA 3AYLA 1JRYA 3BI4A 1ZOYA 4Z43A 1NHRA 3CNPA 2YM2A 3OZ2A 3AE1A 4BJYA 4EM4A 1NG3A 3DK9A 2C67A 1F3PA 3UTFA 2Y6RA 2APGA 3UOZA 5KXJA 3KD9A 2WHDA 1M6IA 4K5RA 3CNTA 3COXA 3P4SA 4OPDA 2C76A 2BS4A 1YQ4A 2YG7A 4PAAA 4DNAA 4U8PA 2BS2A 1CJ3A 3ICTA 4H7UA 1K0IA 4C3YA 3ATQA 4XWRA 5FMHA 3FPZA 1GOSA 2QA1A 2A87A 4UDQA 3QFAA 2IIDA 5KOWA 1D4EA 3K30A 4J56A 3QSEA 1FEAA 1M64A 4NTCA 4C77A 4YSHA 4UDPA 1PXBA 2WP9A 2VVLG 3GD3A 1H86A 4CY6A 4B63A 5IPYA 4ICYA 3UKPA 4C5OA 4CNKA 2NPXA 5EBKA 1CC2A 4H4QA 3AD7B 1OJDA 1NHSA 3BI5A 1DJNA 2BA9A 2YM1A 3P9UA 2XLPA 4Z24A 3SGLA 1W4XA 3GYJA 4EQXA 2QAEA 3LB8A 1MO9A 3AYIA 3UP4A 2V3AA 2V3BA 2ZZ0A 1ZKQA 2GB0A 1IJHA 2VOUA 4BV6A 1S3EA 4NEWA 4OPGA 3GDNA 4U2SA 2YLXA 1TDKA 3RP6A 4APNA 3NNEA 3F8DA 4OVIA 4EMJA 3AE5A 1N4VA 1GTEA 1TYPA 1BGJA 5DBJA 4Z26A 3KPFA 2OAMA 3SQPA 4K7ZA 1GESA 4NTDA 4IA6A 2J3NA 3ZDNA 3GRSA 4RG4A 2R0CA 3B3RA 4RSLA 3AE7A 2C64A 1E1MA 2WOWA 4WX1A 4YWOA 2YVGA 3KLJA 2WESA 3QJ4A 1D4DA 3ALMA 2R9ZA 1L0VA 1PBCA 2C3DA 3FMWA 3RP8A 3IWAA 4U8IA 4ZCDA 2RGOA 1JOAA 4U2LA 1X31B 2X3NA 3CGBA 2V61A 2YR6A 2DKHA 2B9YA 3UOXA 1FEBA 2R4JA 3RNMA 4EM3A 2XVHA 1PN0A 4A9WA 1KDGA 1Y56B 1E39A 2X99A 3CGDA 3DMEA 1B37A 4EIQA 1PBFA 1MXTA 3UP5A 1HYUA 3NN0X 1QO8A 3FG2P 2VQ7A 3VRDB 3EANA 4EQRA 3VQRA 3DK4A 3CPHG 5FS7A 3AE3A 1O5WA 1LJ1A 1NEKA 2BS3A 1MOKA 2JAEA 2YAUA 1ZP0A 4GUVA 1GV4A 5IQ1A 3QSMA 2XYOA 4GRTA 1CF3A 3NK2X 2GAHB 2R45A 2TPRA 2GQFA 2HQMA 2YR4A 3DJEA 1FECA 1EL9A 3BHFA 3CGEA 2EQ8A 3JSKA 3PO7A 1PBDA 2GF3A 3F8RA 2FJAA 4P9SA 2C70A 4FK1C 1KNPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E1TA 1E6BA 3NT6A 4GTUA 3GFKA 4WCTA 1VF2A 3DJDA 3KP9A 2LKUA 1R5PA 4OMVA 5U25A 3K7TA 4GWRA 4KE3A 5HHFA 5B6NA 2AAWA 2XHFA 4OWYA 1H4OA 4XS1A 2XVFA 4Z25A 4TXVA 5J4UA 3C96A 4XRAA 1U3IA 3IDVA 4ZILA 1O7UA 2JK6A 3CN8A 1PA3A 2OJLA 2WDRA 1GRAA 3L9UA 1KSSA 4JR4A 3G7IA 1JLWA 3IR4A 4B64A 3GSTA 3GX8A 1WMJA 3CTFA 3B6DA 1XVWA 1GP1A 2BYBA 3T14A 1OKTA 4PQIA 3F4RA 2C7GA 1GSUA 4KB3A 5HQPA 2AV4A 2H76A 2YWOA 4USRA 2BCPA 4RI6A 4OCEA 4YKFA 3L4NA 1M2DA 1MDIA 5G1KA 12GSA 1KSUA 3ABVA 3H8IA 2GVPA 1B5QA 4I59A 4RQRA 3DIEA 3VWXA 2HT9A 4IVMB 1GNEA 2FJBA 3CSIA 1ELIA 1QQ2A 3ICRA 4K8DA 3CNSA 4I58A 2LJAA 5KOXA 1J08A 1GTUA 2MBTA 3HVXA 1GL8A 3GSIA 5JCMA 3A2VA 2QGVA 4HDEA 3QVRA 2DLXA 1D7YA 4YTMA 4Z2RA 3ATRA 1PRXA 2BACA 4H2NA 2H88A 4J57A 1KFYA 3GD4A 2IMIA 2K8SA 2WDUA 2BC1A 2YPMA 1O73A 1L9DA 2WPEA 1OYJA 2FHEA 1TKDB 2YLWA 3ERWA 2WRTA 5CRDA 3GWFA 1LV0A 4Z2TA 2YNXA 3FKFA 4OCFA 2VVMA 3WT1A 2JL4A 1PXAA 4ECIA 2C0FA 4LA1A 1X0RA 1CL0A 2V1MA 2G0FA 2XCGA 5BRTA 4X9NA 1PX6A 1LQUA 3I43A 4AOXA 2K18A 3AWIA 3C4NA 5A4UA 3S61A 3EMPA 3TGZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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