4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
4X9MA 2BS4A 1DOBA 2XFQA 1AOGA 4IVOB 2XFNA 2EQ7A 1XPQA 1NHSA 3GDNA 2C64A 3AE5A 3NKSA 2V61A 2ZZBA 4UDQA 3B6DA 4H2RA 1NEKA 2YVFA 1PJ6A 4OPCA 3RP6A 1E1LA 4UDPA 3UKPA 3CGEA 5KRQA 1QO8A 1PDHA 1GRTA 5FS7A 2X8CA 1H7WA 1CC6A 2XLTA 2YG5A 4OPGA 3AYLA 2WEUA 3UKLA 1DJNA 3UOZA 3QSSA 3G5RA 4XXGA 1DOEA 3ICTA 2H88A 4LIIA 5CQFA 1GXFA 3B3RA 4GCMA 1KSSA 1O94A 3G5SA 4J31A 2IVEA 1PXAA 4A5LA 3DMEA 1H81A 2BC0A 2V3BA 3BI2A 3CNSA 2XVEA 3GD3A 1D5TA 3QSEA 4H2NA 1LVLA 4K8DA 3SGLA 1MOKA 4Z44A 2GRTA 4BJYA 2YR6A 4H4TA 1E1KA 2BYBA 1SEZA 3ITJA 4RG4A 3REDA 4B67A 4AOSA 3CNTA 4HA6A 4USQA 3AYJA 3Q6JA 2BCGG 3C4AA 4H4VA 1TYTA 1D4CA 4ZCDA 2RGJA 3NK1X 1CL0A 4BURA 1VG0A 3BNUA 2R46A 3VR8A 2XVFA 2XFOA 3VQRA 4C5OA 1FCDA 4NZHA 2JB3A 4YWOA 2JB1A 3CGCA 3QSMA 3SFDA 1NHQA 4WCTA 4B68A 1K0LA 1PBEA 4U8NA 2CVJA 1GTEA 2OAMA 3NGCX 3UKQA 1TDKA 2YLZA 3UKAA 5IPYA 1GESA 3SFEA 1Q1RA 4CY8A 3AE8A 2WPCA 2XCGA 1L9DA 4A65A 3GRTA 4EQWA 5KOXA 3UOYA 3AWIA 2W0HA 2Q0KA 1DNCA 1IUWA 2IIDA 3AYIA 5IQ4A 4YTPA 2WP6A 1RP0A 1H6VA 3SQPA 5FS6A 2ARDA 3GYJA 4ECHA 3BI5A 1JOAA 3CNDA 4O5QA 4PABA 5BULA 3GDPA 4BJZA 3RNMA 4H4ZA 1L9EA 4YKFA 1ONFA 1KFYA 3GMBA 1D7LA 4Z43A 4H4XA 5JCIA 1FECA 3AB1A 3CTYA 3OC4A 3UOXA 5L46A 3FIMB 2BK4A 4C3YA 4GUVA 3UTFA 1D7YA 2Y6RA 4UDRA 1E1MA 3AEBA 3D1CA 2QAEA 3C4NA 2CULA 4CNJA 3P4QA 1CC4A 3LZWA 4Z26A 4K5RA 1Y56A 5ER0A 3ADAB 4B64A 2YAUA 3QVRA 1MXTA 2YM1A 4J36A 3FPZA 2NPXA 4CY6A 1QLBA 2JAEA 1GV4A 4Z24A 4ZN0A 1ZMDA 3UCLA 2X99A 4OPIA 3PS9A 2YLRA 1Y56B 3KLJA 3V3OA 3V3NA 3ALMA 4K2XA 2WPFA 1OJCA 4B1BA 2WU2A 3ALJA 3ZDNA 1GRFA 1RSGA 4IA6A 3GSIA 3IWAA 3FMWA 1NAAA 4Z2UA 1TDEA 2YG6A 3E1TA 4LU6A 3GWDA 1XDIA 2XLSA 1NHPA 1ZK7A 2J3NA 2VQ7A 1P2EA 3COXA 1E39A 4U8LA 2FJAA 3IC9A 1PXCA 2C3DA 2V6OA 1F8RA 2EQ6A 3CPHG 2QA2A 2YR4A 1FEBA 1JRXA 3DJGX 1PBCA 3QJ4A 2FJDA 2GAGB 4U2SA 3UTEA 4C74A 1GRGA 3NYEA 2WP9A 5JCMA 1YKJA 4Y4NA 1K4QA 3GMCA 3K7QX 2ZZ0A 4NEVA 2RGOA 3NIXA 4H7UA 1KDGA 5C2TA 4JQ9A 2TMDA 3NN6X 3OZ2A 2WDQA 2AR8A 2VZ2A 2YLWA 2OLOA 2YM2A 3NYCA 2V5ZA 1O95A 4A6NA 3F8RA 4H4PA 4E0VA 2UZZA 3EF6A 5DBJA 5CKUA 4EIQA 5EOWA 2VQBA 1NDAA 4GRTA 1KSUA 1F8WA 1EBDA 5KVIA 2YVGA 5KVHA 4EQXA 4H2PA 2O9ZA 2C76A 4RSLA 3D8XA 4A6NB 4D03A 3ABVA 1IUSA 4DSHA 1TDNA 5FMHA 4H4UA 1PBDA 5HXIA 1DJQA 2JB2A 3NN0X 1LV0A 3EAOA 4J2WA 3AD8B 1GOSA 1YY5A 4HB9A 5KXJA 4JNQA 2A87A 5EB5A 3UP4A 1X31B 1N4UA 5FS8A 4JN9A 3KKJA 5J60A 5JCLA 2WP5A 2GB0A 4YSYA 5BVAA 1ZDLA 1PJ7A 3DK8A 1IUTA 3AEGA 4J57A 1ZY8A 2YG3A 4C3XA 4H4WA 3NNEA 4ZCCA 4EQRA 3F8PA 1CJ2A 2QCUA 5KOWA 4NEWA 5KWFA 1E7PA 3BHFA 2VVLA 4Y4MA 3NK0X 1JNRA 1VQWA 2AQJA 1ZOVA 3O0HA 3UTHA 3KD9A 4REKA 4K7ZA 3VR9A 1BKWA 3CGDA 4TM3A 3AE7A 4BK1A 3LJPA 3AEDA 1GALA 2RABA 4Z2TA 1REOA 4Z25A 3DJJA 1M64A 2BACA 1H7XA 1LTXR 1NG3A 2B9WA 4FK1A 2TPRA 2YVJA 4AP3A 2BXRA 3URHA 1IJHA 4I58A 1GNDA 3AE6A 2AAQA 3I3LA 5HHFA 1K0IA 5M0ZA 3ATQA 1CJCA 2FJEA 4U8OA 1JNZA 4K5SA 1LQUA 4OPUA 3GD4A 3BI4A 3L1RA 1XANA 4H4YA 3SM8A 4RG3A 3NT6A 3NH3X 4OPDA 3Q9TA 2CDUA 2V60A 2C65A 4I59A 4J33A 2WHDA 3LOVA 4XWZA 3FG2P 1JRZA 3IHGA 3AECA 2WOVA 3IHMA 5JCNA 3EANA 4A9WA 1PBFA 3L8KA 4FX9A 3S5WA 1OJTA 2BCPA 4EMIA 2BC1A 4OVIA 1S3EA 2XVIA 3LB8A 3P4PA 2V3AA 2R45A 2FBWA 3K7MX 1N4WA 2WS3A 2YLXA 1OJAA 3NK2X 2YLTA 2IVDA 3CNPA 4EIPA 2Y6QA 3AD9B 1KNRA 2C66A 2GMJA 2XLPA 1HYUA 2BK3A 4K22A 5U25A 4H4SA 2VOUA 2VVLG 3H8IA 4EM3A 3NRNA 4Z2RA 3BNMA 1W4XA 3DJEA 3EPTA 3K30A 4U2TA 2XFUA 3JSKA 1N4VA 1QJDA 3KVEA 3M0OA 3CGBA 3RHAA 3UKFA 1VRQB 2NVKX 4LA1A 3GWFA 1VG9A 1NG4A 3ALLA 2WBAA 2GR2A 2XVHA 1MO9A 4ICYA 4U8MA 2BK5A 4CNKA 2BABA 2R4JA 3QVPA 3NLCA 1EL8A 2XFPA 2XDOA 4FK1C 1UKVG 1PJ5A 3I6DA 4H4QA 2BA9A 2GAHB 2E5VA 2YG4A 4AT0A 2ACZA 4XWRA 4JNAA 2YG7A 3DH9A 1XHCA 3UTGA 1L9CA 1PBBA 1EL9A 3IF9A 3NYFA 1CF3A 3UP5A 4TM4A 1CJ4A 4EQSA 1BGNA 4JDRA 4EMWA 1F8SA 3P9UA 4TLXA 2JBVA 4D04A 2R9ZA 3M12A 1PXBA 1BWCA 1FL2A 4H50A 5EBKA 5BRTA 4AP1A 1BGJA 3P4SA 1CC2A 1GREA 2E1MA 2BS3A 4DNAA 1IUUA 1CBOA 4GDEA 1EL5A 4KPRA 1B4VA 2Q7VA 2VVMA 2XVJA 1NENA 2XYOA 3RP8A 3UKHA 3CPIG 4TM0A 3VRDB 2C73A 2X50A 2WESA 4C77A 4GR1A 4M52A 3NHOX 2DKHA 4OCGA 3CPJG 3AE4A 4X9NA 3DGZA 1JU2A 2GF3A 4B63A 3ICSA 1YQ3A 1GRAA 1NPXA 2XLUA 2BS2A 4Y4LA 3GRSA 2GQFA 4BK2A 1PHHA 2GR0A 1GEUA 2YR5A 3AE9A 4CCRA 1GTHA 3C96A 1K0JA 2X3NA 3UOVA 2WQYA 1L0VA 2GEWA 3ZYXA 1Y0PA 1YQZA 3DA1A 1BZLA 2VRMA 4IVMB 3ATRA 4WX1A 5TR3A 3RP7A 4A7AA 3CNJA 1RYIA 2WOWA 2BXSA 3P4RA 3LXDA 2XLRA 5GRTA 4A99A 1TDFA 1H82A 1GPEA 3PVCA 4B65A 2GQWA 2YLSA 4MJWA 3LZXA 3R9UA 1H86A 1NHRA 1DXLA 1ZP0A 4P9SA 4BV6A 4YSXA 3QFBA 4H2QA 1FOHA 1D4EA 3H8LA 3QFAA 2B9YA 3FBSA 4H4RA 4FDCB 3M13A 2WPEA 4J56A 3LADA 4BK3A 1O5WA 1ZKQA 4APNA 3F8DA 4YT0A 1VDCA 1IUXA 2EQ8A 4YSHA 3KPFA 1B8SA 1KNPA 1BF3A 1JRYA 1S3BA 2C72A 3T37A 2JKCA 2R4EA 3AD7B 3S61A 3PO7A 2R0PA 1F6MA 3WE0A 1H83A 5JCKA 2I0ZA 1GRBA 1Q9IA 1B37A 2QA1A 3AXBA 3DGHA 2C67A 2JK6A 5C3JA 4UP3A 5M10A 1TDOA 5BUKA 4ADWA 1V59A 1S2YA 2PYXA 3KU9A 1GRHA 2Q6UA 2Z5YA 5LV9A 1GERA 2A8XA 2WU5A 4NTCA 1ZOYA 2GMHA 4JY2A 4U8PA 4CRTA 2GH5A 2WOIA 1GSNA 4B69A 1P2HA 4YTMA 4O5UA 3G5QA 3KA7A 1DODA 3NTDA 4YSZA 2FJBA 3AE2A 4CCQA 2OLNA 2VRLA 2R0CA 1LPFA 4U8JA 4U8IA 5IQ1A 1PS9A 3UKKA 2C3CA 4EMJA 5HY5A 4N9XA 2R0GA 1GT8A 2E4GA 2B7RA 3AEEA 1S2QA 3ISHA 2OA1A 1CJ3A 3P1WA 4AOXA 2ZZCA 5U63A 4YTNA 3AEAA 1KF6A 1OJ9A 4PAAA 3ICRA 3II4A 3V76A 2C7GA 3NG7X 2B76A 4GF7A 2CFYA 2H89A 4USRA 4NTDA 2APGA 1CHUA 1FEAA 5GSNA 1F3PA 4DGKA 4DSGA 2C70A 2GR3A 3GYIA 4B66A 1LQTA 4JY3A 1TRBA 1ELIA 2B7SA 3VRAA 4J34A 2WETA 4EM4A 3AEFA 1ZX9A 1DOCA 3H4KA 1B5QA 5FS9A 4AT2A 4X4JA 3DK9A 4OPTA 2GVCA 1D4DA 3DJDA 1TYPA 5HYMA 1M6IA 1E6EA 4CBQA 4A79A 3VRBA 1N1PA 2X8HA 2YQUA 3AE3A 1Q1WA 5J7XA 2C75A 2WDRA 1COYA 2HQMA 1JEHA 3CN8A 4OPLA 2PHHA 3AE1A 2A89A 2GR1A 2YWLA 3NTAA 4GDPA 3DK4A 3K7TA 5U1OA 4YKGA 1PN0A 3BHKA 5EB4A 2WDVA 1YQ4A 1H84A 2DKIA 4TM1A 2ZBWA 4IA5A 1LJ1A 4NTEA 1EL7A 2B9XA 2X8GA 2Q0LA 2EQ9A 4U2LA 4IV9A 4YXDA 2RGHA 4KX6A 1Z6LA 1OJDA 1GETA 2F5ZA 3CIRA 4U8KA 2GV8A 2OALA 1E1NA 4TLZA 2Z5XA 1IUVA 3HZLA 1ZMCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JU5A 2ON5A 3KGKA 4X9MA 1O8XA 5HFGA 1ML6A 2XFNA 1TRSA 2YANA 2KP1A 2YVFA 1PJ6A 3QMXA 2X49A 1E1LA 4I2UA 1ZOFA 4UDPA 3V1WA 3CGEA 5KRQA 2GZPA 1PD21 4PX1A 4BPYA 1GRTA 4CHSA 2H72A 3C1RA 1TU7A 4OPGA 4EUYA 3AYLA 3T14A 3UKLA 3QSSA 3N9JA 4NV2A 4LIIA 2H01A 3B3RA 1O94A 3ZRDA 3TOTA 1PXAA 3TKRA 3PR8A 1YEPA 5DALB 3GD3A 3QSEA 4H2NA 4K8DA 3SGLA 2YR6A 4H4TA 1E1KA 2GVPA 5B7CA 4I6XA 4AOSA 3CNTA 2HI7A 4USQA 3Q6JA 1V58A 4H4VA 3U6VA 4JEDA 4BIKA 2RGJA 5B8BA 2R46A 2XFOA 1GNEA 3QR6A 2IMIA 2VUPA 3SFDA 1NHQA 1PBEA 4U8NA 3IA1A 4BWQA 3ERGA 2K6VA 3UKQA 5IPYA 4EE0A 2WPCA 4A65A 3UOYA 5AGYA 3UEMA 2Q0KA 3QAGA 4OWYA 2IIDA 1Y6EA 3GRXA 1GNWA 3SQPA 5FS6A 2JSZA 3A5IA 3I9V2 1OVNA 4PABA 5BULA 4XS1A 1GTIA 4FQUA 4H4ZA 1Y25A 4KF9A 3TRQA 1M2DA 18GSA 2VCQA 4F9ZA 2DSAA 4YQVA 4PTSA 1ONFA 1KFYA 1D7LA 4H4XA 5JCIA 3CTYA 5L46A 3FIMB 4POBA 1E1MA 5G5FA 5GAPD 2QAEA 2C0DA 2H70A 2FWGA 3IV4A 1ERVA 4Z26A 4D73B 1WJKA 2YAUA 1ZCPA 3GH6A 4J36A 1U87A 3FPZA 2NPXA 2JAEA 1GV4A 4Z24A 4ZN0A 1TI1A 1ZMDA 3UCLA 2X99A 4OPIA 3PS9A 5ECNB 1Y56B 4EL1A 3V3NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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