4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
5HXIA 2BC0A 1JRZA 2VVLA 3ABVA 3DMEA 2FJEA 1RYIA 3NN0X 3K7MX 3UTEA 4TM0A 3AE6A 3JSKA 2WESA 3Q9TA 2WDRA 3AXBA 3Q6JA 5FS8A 1NHQA 4H4ZA 2OAMA 4H4PA 2ZZ0A 2R0GA 3BI4A 1SEZA 1K4QA 4EIQA 1GRBA 4O5QA 2WQYA 1BWCA 5BUKA 3ISHA 2R4JA 3NYEA 1Q9IA 2YLXA 5M10A 1B4VA 1S3BA 2X99A 2Z5YA 2XLSA 4HA6A 1O5WA 4GUVA 1KNRA 4X9MA 3REDA 3RP6A 3BHFA 3AE3A 4CNJA 1GRGA 2DKIA 2RGOA 4Z26A 4J2WA 4TLXA 1LV0A 4YKFA 3CNJA 5BRTA 4B69A 4GDPA 3KA7A 3D1CA 2QAEA 2PYXA 2R45A 3T37A 2XFUA 4K5SA 1KSUA 2YVGA 4EM3A 1LVLA 1ZY8A 2WP9A 5C3JA 4GF7A 5L46A 4D03A 4B63A 2XFQA 5KOWA 2UZZA 1CJCA 1PXCA 2CDUA 3LOVA 3RP7A 1S3EA 1PHHA 3BI2A 1BF3A 1PJ5A 4Z2TA 1M6IA 4U8MA 1H84A 2QCUA 3KKJA 1BGJA 2XVJA 1IUXA 1F3PA 4Z24A 3EPTA 4JQ9A 4IVMB 4K5RA 2XFPA 4AOXA 2V3AA 2HQMA 2OALA 4YT0A 2ZZCA 2WP5A 4YTMA 2X3NA 4J33A 1FOHA 2YVJA 4RG3A 4B68A 3P4RA 4BK1A 2JKCA 3VR8A 1YKJA 3AE7A 3CNPA 2BA9A 2GR3A 2WOIA 4Y4LA 2YLZA 3NK1X 4U8JA 4ZCCA 2V3BA 3DJDA 4ADWA 1E1MA 3F8DA 4EIPA 2E1MA 2YM1A 3DK4A 1VG9A 3ICSA 5FS6A 2O9ZA 2DKHA 4IA5A 5EB4A 2Q0KA 2ACZA 4UP3A 1GRTA 2YLSA 4H4QA 1Q1RA 1JEHA 2C75A 2YM2A 2X8HA 3AD9B 2Q0LA 3II4A 2AR8A 3NLCA 2X8GA 3V3OA 2XVEA 2XLTA 2XCGA 4I59A 2V5ZA 4O5UA 4FK1C 4CBQA 4CRTA 1PBDA 3UP4A 1NPXA 2FJDA 1JOAA 1FECA 1MOKA 1P2HA 2WBAA 3NHOX 1D5TA 3UKQA 4U8NA 4USQA 3GRTA 3SGLA 1Z6LA 1E7PA 3NN6X 4EQRA 1GALA 2IVEA 2CFYA 4K7ZA 1E1NA 4Y4NA 2Q7VA 3VRAA 1YQZA 3NT6A 1ELIA 2WP6A 3CNTA 5U1OA 4X9NA 1EL7A 1MXTA 2GB0A 2C73A 4D04A 1E6EA 3DGHA 4OPCA 4OPGA 1GRHA 3IF9A 4BK2A 1DOCA 3V76A 1NG4A 3VRDB 2X8CA 2YAUA 1LTXR 3QFAA 2XYOA 2GAHB 3CGBA 2YR5A 1GRFA 4RSLA 4J31A 4ECHA 1GRAA 2XLPA 1LQTA 3LXDA 2B7RA 3DK9A 1PS9A 2TMDA 3DJEA 4U8LA 2VZ2A 3BNMA 3VQRA 3P9UA 2EQ7A 4AT0A 1S2YA 3ALLA 4UDPA 2BACA 1E39A 3GRSA 2GRTA 1Y56A 2XLRA 1DODA 3NYCA 1CJ4A 3P1WA 1LQUA 3BI5A 2XDOA 3CPHG 4I58A 4A6NB 5FS9A 4EMIA 2YLWA 1XPQA 2WOVA 4CY8A 2C70A 4KX6A 1ZDLA 1OJAA 3ITJA 3K7TA 4UDRA 3ATRA 1B8SA 5IQ4A 4U8KA 2BC1A 3FG2P 4YWOA 1IUWA 2W0HA 4CNKA 2YG3A 3P4SA 3PO7A 5EBKA 3ICTA 1CJ2A 1PJ7A 4BURA 5JCMA 1YQ4A 1D7LA 1KSSA 2YG7A 3NRNA 2A87A 2BS2A 2XVIA 2FBWA 5LV9A 4K22A 4OCGA 3S61A 2AAQA 3IHGA 5M0ZA 4OPDA 3NTDA 2WPFA 1JNZA 3AEEA 2QA2A 4H2PA 3S5WA 2C3CA 3L8KA 3DJJA 1PXBA 3UKAA 3BNUA 2OA1A 2R0CA 4K2XA 3NK2X 4AP3A 4B67A 1OJTA 3H4KA 1S2QA 4JY3A 3EF6A 4U8PA 4JNAA 1JRXA 2YR4A 4H2RA 4EMWA 3H8LA 3EAOA 3ATQA 4C3XA 4ICYA 3HZLA 4NEWA 3RP8A 3NIXA 4J34A 2JBVA 1GT8A 4ZCDA 2BS3A 1CC2A 4A99A 1RSGA 2WU2A 4OPLA 1GETA 1KNPA 2RGJA 2VVLG 1IUTA 4CCQA 2C76A 5JCIA 3IC9A 1F8RA 2F5ZA 5FS7A 1OJDA 2R46A 4HB9A 1P2EA 4H7UA 1XDIA 3F8RA 3QFBA 3SFDA 1E1KA 4Z44A 3CGEA 4EQWA 3OZ2A 4J56A 1GXFA 2B9WA 1GEUA 3KU9A 1GERA 3UTHA 4H4YA 1TDKA 3ADAB 4A9WA 4K8DA 2I0ZA 2NVKX 3OC4A 4WX1A 3AYJA 4H4TA 4JN9A 3C96A 1PDHA 2C7GA 1H6VA 4YSZA 4FDCB 5IQ1A 3UKKA 1GOSA 1GREA 2WETA 2H89A 4U8OA 5TR3A 3GMCA 1O95A 5BVAA 1GV4A 2C64A 3AEDA 3GD4A 2BYBA 1DOEA 4H2NA 4DSHA 2E4GA 4H4UA 4A65A 3O0HA 4NTDA 1TDFA 3FIMB 1NAAA 3AEBA 1KDGA 1IUSA 3PVCA 3UKFA 4EQSA 3FMWA 4Z2UA 1Y0PA 2YG5A 4P9SA 4U8IA 5KVIA 3G5SA 4APNA 5KWFA 4J36A 1PXAA 2OLOA 1VDCA 4YSXA 5BULA 1JRYA 3UTFA 3URHA 1YY5A 4X4JA 4B64A 2B9XA 3BHKA 3WE0A 3NG7X 4LIIA 4C3YA 1H81A 3CNDA 3D8XA 3KLJA 3SM8A 4H4VA 1RP0A 2FJBA 2VVMA 4AT2A 2QA1A 2E5VA 2CULA 1ZX9A 4B65A 4DNAA 2XFNA 3GD3A 3GWDA 4BJYA 4Y4MA 4NEVA 1ONFA 2BS4A 2H88A 5JCKA 3AE1A 2JB2A 3UTGA 3NKSA 2WS3A 3SFEA 1QO8A 3QJ4A 1L9EA 3KVEA 1GTEA 2YR6A 1OJ9A 4H4RA 3NGCX 5CKUA 4YTNA 4DGKA 4ZN0A 5U63A 4RG4A 1CL0A 4U2TA 1XHCA 3I3LA 3GSIA 2Y6QA 1ZOVA 2VRMA 1TYPA 3ZDNA 3CGCA 1IJHA 4B1BA 1GESA 3QSEA 4CCRA 2AQJA 1F8WA 4OPTA 4GDEA 4H4WA 2V60A 1NHPA 5CQFA 3IWAA 4FK1A 1PBEA 1YQ3A 4XWRA 1B5QA 5HYMA 1ZKQA 3NNEA 4H4SA 2V61A 3C4AA 2IIDA 3KD9A 1GPEA 3UKHA 2A8XA 3CPJG 5HY5A 2R0PA 2ARDA 2GMHA 2YVFA 3I6DA 3IHMA 1NDAA 2BK4A 3K30A 2VOUA 3CIRA 1PBCA 3FPZA 4YTPA 4EMJA 3VR9A 4Z25A 2TPRA 1CC6A 4TLZA 2XVHA 1VG0A 3CPIG 3VRBA 3ICRA 3LJPA 3QVPA 4U2SA 1XANA 5EOWA 2WEUA 2GQFA 1ZP0A 4EM4A 1JU2A 2B76A 3NK0X 2GF3A 3F8PA 1ZMDA 3M0OA 3UOYA 4OVIA 2BCPA 4JNQA 2WPCA 4YXDA 1N4UA 5HHFA 2EQ6A 4A6NA 5FMHA 2JB3A 1KF6A 2GAGB 2BABA 2GH5A 3RHAA 5J60A 3KPFA 1D7YA 2WHDA 4UDQA 1L0VA 4PAAA 4KPRA 1NG3A 1H83A 4TM1A 3GWFA 2GR0A 2RGHA 3NYFA 1GTHA 3NH3X 1V59A 1HYUA 1VQWA 4A79A 4BV6A 2JK6A 4IV9A 2C72A 3CTYA 1X31B 1M64A 2EQ8A 5KVHA 4AOSA 1FL2A 1N4VA 1PBBA 2PHHA 2YWLA 4PABA 3DK8A 4YKGA 1D4DA 4NTEA 4M52A 3EANA 1MO9A 2GMJA 2GR1A 4GR1A 2EQ9A 2YLRA 4C5OA 3UCLA 3AE2A 4A5LA 3B6DA 5GRTA 4NTCA 3AD7B 3P4QA 1BGNA 1W4XA 1NHSA 1EBDA 3AEFA 2V6OA 1K0LA 1BZLA 2C66A 3AWIA 5EB5A 1F8SA 2VRLA 4XWZA 3LB8A 5KRQA 3LZXA 2YLTA 4EQXA 1CJ3A 2YG4A 5U25A 2OLNA 4H4XA 4MJWA 3AEAA 2RABA 3LZWA 4OPIA 2BXRA 1PJ6A 1O94A 4GRTA 3LADA 4WCTA 4LA1A 4REKA 1LPFA 3P4PA 1N1PA 2XLUA 3K7QX 4DSGA 1GSNA 3UOVA 4C77A 1COYA 3FBSA 3AEGA 1K0IA 1N4WA 1FEBA 1VRQB 4CY6A 1ZK7A 2JB1A 3DA1A 3M12A 4JY2A 3UP5A 1PBFA 1ZOYA 2WDVA 4H2QA 2APGA 3QVRA 4USRA 4JDRA 4YSYA 1E1LA 1TDEA 3ALJA 3E1TA 2Q6UA 3RNMA 3AD8B 4YSHA 2X50A 1L9CA 3NTAA 2IVDA 1UKVG 2FJAA 2XVFA 3GDNA 3CGDA 5JCLA 1H7XA 1AOGA 2A89A 2ZZBA 3AYIA 3COXA 3CNSA 5J7XA 2Y6RA 2VQBA 2Z5XA 3ZYXA 2B9YA 3L1RA 2WU5A 1H7WA 1QLBA 2XFOA 4GCMA 2C67A 3AE5A 3PS9A 4H50A 4N9XA 1DOBA 1CHUA 3CN8A 5ER0A 2WPEA 3H8IA 5IPYA 1NHRA 3AECA 1D4EA 3UOZA 1K0JA 5KXJA 3DJGX 4Z2RA 1Y56B 2GQWA 4TM3A 4TM4A 3AYLA 3UKLA 3GYIA 4LU6A 1EL9A 3AE9A 5GSNA 4U2LA 1IUUA 1KFYA 5JCNA 5DBJA 4J57A 2WOWA 1F6MA 2BK3A 3UKPA 2VQ7A 3G5QA 4IA6A 3V3NA 3ALMA 1Q1WA 1CC4A 3R9UA 2C65A 4FX9A 3UOXA 1TDNA 2R9ZA 3GDPA 2R4EA 3GMBA 1IUVA 1NEKA 1TYTA 2B7SA 4E0VA 3C4NA 3SQPA 1DJNA 1QJDA 2BK5A 1D4CA 1ZMCA 2CVJA 3QSSA 2NPXA 1DNCA 4XXGA 4BJZA 3AE8A 4AP1A 1JNRA 2C3DA 1TRBA 2GR2A 4OPUA 5C2TA 2GV8A 1DXLA 2ZBWA 2JAEA 1DJQA 1EL8A 1GNDA 5KOXA 1LJ1A 3B3RA 1OJCA 3GYJA 3QSMA 4IVOB 1FCDA 3AE4A 4Z43A 1NENA 2J3NA 3DGZA 4B66A 2WDQA 2BCGG 1EL5A 3G5RA 1REOA 3AB1A 2GEWA 1PN0A 1L9DA 4A7AA 1B37A 1H82A 2YG6A 2BXSA 1H86A 1CBOA 2GVCA 1FEAA 1TDOA 2YQUA 1CF3A 3M13A 4C74A 1BKWA 4BK3A 4NZHA 3DH9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5D96A 1JRZA 3ABVA 3DMEA 1RYIA 3UTEA 1GULA 3CMIA 3JSKA 2WESA 3CRTA 4MF7A 2WDRA 4HI7A 4H4ZA 3Q74A 1K4QA 4EIQA 4II3A 2A4VA 1BWCA 5BUKA 2FWFA 1JZDA 2R4JA 3PPUA 5M10A 4PURA 2X99A 2DIYA 4PUAA 1O5WA 3AE3A 4CNJA 2DKIA 1GRGA 2OBIA 4ZIJA 4J2WA 4RUVA 1YF0A 2VCZA 3GL5A 3KA7A 1TW9A 4DSQA 2PYXA 3FHKA 4BA7A 2CAQA 2YVGA 2KOKA 1ZY8A 1H4OA 3IK9A 2WP9A 12GSA 5B6MA 2H71A 2CDUA 3RP7A 1S3EA 4G0KA 4GLTA 4ILFA 1GTIA 1BF3A 4Z2TA 1R7HA 2FWHA 2FWEA 3A3TA 1H84A 4DSSB 4MH2A 4BVXA 14GSA 4F0BA 4OO5A 2QCUA 4Z24A 3ZFLA 4G6HA 1SD8A 4IVMB 5IOXA 3IRAA 4YTMA 2M80A 4KDYA 4WKWA 3GYKA 2YVJA 3CBUA 3CXGA 3P4RA 1V58A 1B8XA 3GKKA 5CO3A 4PQHA 4J56E 2AUVA 4KUNA 2WB9A 4Y4LA 2HSMA 2V3BA 3F8DA 1T00A 4V2MA 3DK4A 2TRXA 2O9ZA 2RIIA 2YLSA 3SZWA 5CP1A 2MZCA 1JEHA 3EMPA 1Q1RA 5DCHA 2YM2A 3FEUA 1O81A 2PPTA 3MWHA 1XXUA 3NLCA 2JZTA 3V3OA 4I59A 2XCGA 2M46A 2V5ZA 1JFUA 4HOJA 3UP4A 2E2GA 5HFGA 1GNWA 3DVXA 5HR2A 1NPXA 5EPFA 3ME8A 1OVNA 1D5TA 4E8HA 1YKAA 1T4ZA 2GZYA 3KMOA 1ZMAA 2CFYA 2V41A 3QAWA 10GSA 1ZL9A 3LEFA 1T3BA 3VRAA 3TRXA 2C3NA 1GLQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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