4CY6 | Genus

Total Genus 181

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	181
sequence length	582
structure length	561
Chain Sequence	SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus	181
structure length	561
sequence length	582
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date	2014-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4cy6A03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4cy6A01

4OVIA 2OA1A 2XDOA 2ZZCA 4APNA 4IA6A 2GR3A 4K2XA 3ICSA 1CC4A 1GRBA 2WOVA 3KLJA 2X99A 2YG4A 4YTPA 5HYMA 4C74A 4CRTA 4H4TA 4BK2A 4U2LA 4DSGA 1PJ6A 4IVOB 1IUUA 3M12A 4WCTA 5JCKA 4X9MA 4Y4LA 4NZHA 3UKKA 2CFYA 1CHUA 1H86A 1K0LA 3D8XA 3NN6X 1S3BA 1YKJA 1O5WA 2A87A 2E1MA 1GRHA 2IVDA 4D04A 4U8IA 2WU5A 3CNSA 3HZLA 1OJTA 1BGNA 1D4CA 3NK2X 1FEAA 3NTAA 3AE7A 3IC9A 1EL8A 3DJEA 4GCMA 4H50A 3G5RA 1NHQA 3CNPA 2CDUA 1E1NA 1N4UA 4TM3A 3V3NA 5JCNA 3IHGA 1GRTA 3AEAA 3BHFA 1PXCA 1XANA 4TLZA 1S3EA 2YVFA 4EMWA 1ELIA 1GRGA 2OLNA 1D7YA 2PHHA 4OPCA 4H4SA 2ARDA 4C3XA 2WDQA 1DXLA 3SQPA 5HY5A 1M6IA 2C3DA 2VRLA 2WOIA 2VVMA 2A8XA 3AYJA 2GH5A 1ZP0A 2C7GA 1B37A 3FPZA 3SGLA 1E1MA 1JU2A 2V6OA 1D4DA 1Y0PA 2Y6QA 2XFUA 1D4EA 3ADAB 3DK9A 4AOSA 4ADWA 3I6DA 3R9UA 2DKIA 3H4KA 3M13A 1GRAA 4YKGA 1IUSA 3IWAA 2BA9A 4IA5A 4TM4A 4I58A 1PHHA 4ZCCA 2AR8A 3AE9A 1FOHA 1CJ3A 5KOXA 3UCLA 2GEWA 3UTEA 5J60A 3T37A 4OPGA 5J7XA 1AOGA 1GPEA 2YLWA 3I3LA 2VOUA 2X8CA 2YG6A 3QVRA 2XFNA 3S5WA 2B9WA 1NG3A 3KVEA 2TMDA 5U1OA 1O95A 4YKFA 1RYIA 1LJ1A 1Z6LA 3DJDA 2B76A 4H4ZA 2RGOA 3RP7A 3DJGX 4CNJA 1YQZA 1RSGA 1TYPA 4TM1A 3L1RA 5FS9A 2RGJA 4H4QA 1REOA 3ATRA 1NHSA 3BI2A 2R45A 2XLPA 3DGZA 1X31B 1GTHA 3FIMB 4Z2RA 1N1PA 3P9UA 2YLTA 1ZY8A 2YLXA 1JOAA 3O0HA 2BXRA 5U25A 2C72A 5BRTA 1GESA 3GWDA 4EQXA 5EOWA 4RSLA 3CGDA 3CNTA 2WETA 1TDFA 1BWCA 3CPJG 1FL2A 2PYXA 1NDAA 3UP4A 3AEDA 3BHKA 3NYCA 2C76A 3CGBA 3KA7A 4H2RA 1CF3A 1F3PA 1LTXR 4JNQA 3KD9A 1JNZA 3PO7A 1B5QA 3ALJA 3SM8A 4OPUA 5FMHA 2BK3A 2JKCA 4C77A 4J34A 4A7AA 4LU6A 2YG3A 4X4JA 2YQUA 1GNDA 3C4NA 3DMEA 3UOZA 1L0VA 3VRAA 4B66A 4UDPA 2WOWA 3P4PA 1IUTA 2C3CA 1E39A 3GMBA 3LOVA 3UOXA 3ITJA 3LXDA 1GTEA 2C64A 2XYOA 1GT8A 5FS6A 3SFEA 3QFAA 4D03A 2WHDA 1Q9IA 3AE4A 5BUKA 1GETA 3E1TA 1JRZA 3NRNA 3WE0A 1GREA 2XLUA 1Y56B 4DNAA 1MOKA 5JCIA 1LPFA 4LA1A 4E0VA 1BF3A 4P9SA 2YVGA 3JSKA 2Z5XA 1PBBA 4EM4A 3GDNA 2GB0A 1GALA 2VRMA 1FCDA 4YTMA 2QCUA 5BULA 2V60A 1K0IA 1JEHA 1COYA 3EAOA 4A9WA 3AYIA 2UZZA 3DK4A 1GERA 2GQFA 1VDCA 1E1KA 2WQYA 4H2PA 1EL5A 3M0OA 1OJDA 1E7PA 3RP8A 3LADA 3ALLA 3AE3A 1BKWA 4Z26A 4C5OA 2CULA 4BV6A 3DK8A 2WPCA 4H2NA 4B69A 3PS9A 1JNRA 4ICYA 1MXTA 2E4GA 1OJAA 1B4VA 2YR5A 2W0HA 4YXDA 1P2EA 2WP9A 3GD3A 2H89A 3F8PA 2VZ2A 1Y56A 2QAEA 4EMJA 3ABVA 2WS3A 1LQTA 2JAEA 4IV9A 4KX6A 1TRBA 5IQ1A 4EMIA 2YR6A 3RNMA 2GRTA 4FX9A 5TR3A 4A79A 2C65A 4B67A 1BGJA 1DOCA 4GUVA 1H83A 4PABA 1O94A 1Q1WA 4UDRA 2XFQA 4NTCA 3IF9A 4H4WA 3P1WA 5EB5A 1EL9A 3QJ4A 4BJYA 1FECA 1L9DA 4FDCB 4Z2UA 4ZN0A 3V3OA 1NHPA 4XWRA 2IVEA 3AEEA 1D7LA 2XVEA 4U2SA 4CCRA 1GXFA 5GSNA 3DH9A 1NEKA 1PXAA 1SEZA 3K7QX 3NTDA 4MJWA 4EIPA 4GDEA 3UKHA 2Q0LA 3COXA 4A5LA 1RP0A 3ISHA 4CY8A 4Y4MA 2FBWA 4JNAA 1CJCA 3AD8B 4GRTA 3Q9TA 2FJAA 3UKAA 4H4YA 4I59A 2XVIA 3B6DA 2R0PA 3CPIG 1QLBA 4BJZA 2BC1A 3AWIA 2BS2A 4XXGA 5KWFA 2R0CA 3NYEA 5M0ZA 3SFDA 3LB8A 2VVLA 4X9NA 1VRQB 2RABA 2R0GA 3FG2P 3CIRA 2APGA 4XWZA 5U63A 2XVFA 1IUVA 4CBQA 3CNDA 4YSXA 2VQ7A 1PBFA 3RHAA 4O5QA 3FBSA 2Q6UA 1TDOA 2WPEA 1H84A 2GMJA 1LV0A 2F5ZA 4B1BA 2YAUA 1D5TA 3NG7X 3UOVA 4EQSA 4Z2TA 2JBVA 1M64A 4B63A 3K7TA 4H4VA 5CQFA 4YTNA 5BVAA 1XHCA 1ZK7A 3BI4A 3EANA 4UP3A 1VG0A 1JRYA 1ZX9A 2BK5A 4AP1A 1N4WA 3VRDB 2YLSA 3ICTA 4U8MA 4DSHA 3G5SA 3F8RA 1HYUA 2C75A 1GOSA 5GRTA 2EQ9A 1CBOA 2I0ZA 1CC2A 1ZMCA 3BNMA 3VR8A 1MO9A 2ACZA 1UKVG 3QVPA 4LIIA 1DOBA 4AP3A 3FMWA 1KF6A 1PXBA 2GMHA 3AYLA 1F8SA 3GRSA 3CPHG 1ZDLA 4WX1A 3EF6A 4H4RA 2GAGB 3K30A 4REKA 3DGHA 3AEGA 1PBEA 2JK6A 1ZKQA 3CN8A 4DGKA 1H7XA 4Y4NA 1YQ3A 2TPRA 1K4QA 3CNJA 3GRTA 4IVMB 3V76A 4NTEA 3LZWA 4U8OA 3EPTA 2X8GA 2H88A 1PBCA 2WBAA 4B65A 2BABA 1TDKA 3NH3X 1CL0A 1GRFA 1IUXA 3CGCA 4OPDA 1TDEA 2BK4A 1XPQA 4HA6A 1ZOYA 1PJ5A 2FJEA 3F8DA 3AE6A 3GYIA 3H8LA 1PDHA 1KSSA 3L8KA 2O9ZA 4AT0A 4RG4A 3QSSA 1L9CA 4JN9A 1E1LA 2BC0A 4U8NA 4USRA 3NKSA 3B3RA 4A6NA 1NENA 1ZMDA 2BYBA 2V3AA 4A99A 4USQA 2WPFA 4K8DA 1PBDA 3OZ2A 1KSUA 3UTFA 3KKJA 2XLRA 2XVHA 1W4XA 5IQ4A 3AD7B 3AE5A 1E6EA 4K7ZA 4CNKA 4H7UA 4Z24A 2B7RA 4GR1A 4YT0A 2WDRA 3H8IA 2GVCA 1H7WA 2B9YA 2ZZ0A 3NLCA 4U8KA 2OAMA 2V5ZA 3NK1X 2JB2A 1CJ2A 5M10A 2XFOA 3CTYA 2WP6A 3NT6A 3QFBA 4TM0A 1L9EA 2R9ZA 5DBJA 3RP6A 4RG3A 3AEBA 2A89A 1VG9A 2OLOA 3UKLA 5C2TA 2GAHB 4TLXA 2XLSA 3NGCX 3KPFA 3PVCA 5IPYA 3BNUA 4Z44A 5HXIA 1S2YA 1EBDA 2YM2A 3REDA 4U2TA 1PJ7A 3C4AA 2C73A 4JQ9A 3BI5A 4OPIA 1IJHA 4AT2A 4UDQA 3P4RA 4CCQA 4YSZA 2OALA 2Z5YA 1ZOVA 4Z43A 3UKFA 3S61A 3ZDNA 3GWFA 1JRXA 4KPRA 1F6MA 4OPTA 1NHRA 2V3BA 4U8JA 3VQRA 3NHOX 1GV4A 3UTHA 2WDVA 3OC4A 2R4EA 1KFYA 2B9XA 5KRQA 3NK0X 5C3JA 5HHFA 2B7SA 1S2QA 4JY2A 1TYTA 5FS8A 2Q7VA 3AD9B 3LJPA 2RGHA 1F8WA 2C67A 1F8RA 3C96A 2YLRA 3NNEA 4J36A 4O5UA 4A65A 2FJBA 4FK1C 1LVLA 2JB1A 4M52A 3UOYA 4N9XA 2EQ6A 1VQWA 1LQUA 3DA1A 4GF7A 3CGEA 2AQJA 1OJ9A 1NPXA 2GR2A 4YSHA 5CKUA 5KVHA 5LV9A 4YWOA 4B68A 1DJQA 3LZXA 2EQ8A 3NN0X 3ICRA 1YQ4A 1CC6A 2BS4A 3ALMA 4BURA 1PN0A 1CJ4A 1NAAA 2YWLA 4K22A 2FJDA 4HB9A 4U8PA 1FEBA 4NTDA 4EM3A 2E5VA 2GV8A 2YVJA 3NYFA 2VQBA 2HQMA 4H4PA 1B8SA 4AOXA 4EQRA 2YM1A 1DJNA 2J3NA 4OPLA 4J33A 3UKQA 2YLZA 2X3NA 1DNCA 1BZLA 1GSNA 4NEWA 2WEUA 1OJCA 1KNRA 2XLTA 3AXBA 3GYJA 4C3YA 3GSIA 1EL7A 4K5RA 1V59A 3GMCA 4FK1A 4J57A 4Z25A 1PS9A 2QA1A 4JDRA 2NPXA 1Q1RA 1H6VA 2BACA 1KDGA 4ZCDA 4EQWA 3AE1A 5L46A 1H82A 2XCGA 4A6NB 3II4A 1GEUA 2VVLG 2IIDA 1IUWA 4J56A 2BCPA 4K5SA 2GF3A 3NIXA 2YR4A 4BK3A 4J2WA 5EB4A 2V61A 4EIQA 3VR9A 5KOWA 3AEFA 4H4XA 1DODA 2WP5A 5ER0A 2EQ7A 3VRBA 3G5QA 4U8LA 2XVJA 2R46A 2BXSA 5KXJA 3D1CA 4ECHA 4YSYA 4B64A 1P2HA 2NVKX 3KU9A 2ZZBA 2X50A 2YG5A 1H81A 3AE8A 1NG4A 3DJJA 4BK1A 2QA2A 2JB3A 4GDPA 4CY6A 4H4UA 1TDNA 3GD4A 5JCLA 1DOEA 2BS3A 3QSEA 5EBKA 2ZBWA 3K7MX 1YY5A 2DKHA 1KNPA 1QJDA 2GR1A 2R4JA 4NEVA 5KVIA 2C66A 2CVJA 3UP5A 3ZYXA 3AE2A 3UKPA 1QO8A 1ONFA 2WESA 2BCGG 2YG7A 2GR0A 2X8HA 4J31A 2XFPA 2Q0KA 1N4VA 5FS7A 4JY3A 3QSMA 4H2QA 4PAAA 3P4QA 4OCGA 2C70A 3ATQA 3GDPA 1K0JA 5JCMA 2AAQA 3Q6JA 3UTGA 3AB1A 3AECA 2GQWA 2Y6RA 3IHMA 3P4SA 1XDIA 3URHA 2WU2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1H75A 3F4SA 3EC3A 1QXHA 1WRYA 1NHOA 3FR6A 1GRBA 3KLJA 2IIYA 2GSRA 1YQ1A 5A5KA 4KDXA 5ID2B 7GSSA 4ACSA 4BK2A 6GSTA 5A4UA 3M12A 3Q6OA 3IDVA 2YV9A 1H86A 3F3RA 3LJRA 1S3BA 5CRWA 1ML6A 1YKJA 1GRHA 3HZLA 1YF1A 1CQGA 1FEAA 2AHEA 3DJEA 4K0GA 1E1NA 1N4UA 3V3NA 5JCNA 5E59A 2HZEB 5HR3A 1PXCA 1XANA 2VCQA 4TLZA 2P5RA 4GSSA 4EMWA 3QPMA 4NWZA 2NDOA 3FZ9A 2ARDA 1DXLA 1NM3A 2H70A 5KN2A 3DVWA 3I6AA 1EP8A 3GSSA 4PX1A 4RUVA 4O92A 5ID2A 2CZ2A 3M0FA 2C7GA 4WBJA 2A2SA 3SGLA 3KTLA 1D4DA 3D4TA 6GSVA 3ZITA 3LXZA 4AOSA 3CRTA 4EO3A 3MYDA 1GLPA 3GTUB 5DQYA 2LRCA 5HFIA 4YKGA 1IUSA 3T2YA 3AE9A 4V1Ag 2KUCA 4WKWA 5L71A 3T37A 1XBSA 4USSA 2HZEA 1AOGA 2VOUA 1YEPA 2XFNA 1ZYQB 5EVOA 2TMDA 1GUMA 1O95A 1A8YA 1KBNA 4H4ZA 1O8WA 3RP7A 1TYPA 3HA9A 1OC9A 2RGJA 1AAZA 1NHSA 1Y25A 3BI2A 1TOFA 4WEYA 3DGZA 2NPBA 1MDKA 1X31B 1IYIA 1SYRA 2GS3A 3CSIA 4BL7A 2YLTA 3GTUA 1JOAA 2YLXA 3MAKA 3L9VA 3GN3A 4PNGA 4EQXA 1XW9A 1A24A 5EOWA 4TR1B 4I8BA 4N0ZA 1FG4A 3KMOA 1X5DA 2WETA 3EWLA 2L5OA 3CPJG 2B1KA 3UP4A 4J2FA 3AEDA 3BHKA 2FWFA 2C76A 2FHEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CY6A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

pfam database annotations