4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
1H81A 2DKHA 2UZZA 4KX6A 5KXJA 4CCQA 1OJ9A 1GT8A 1E1NA 1BZLA 3CNSA 1TDOA 2OALA 3KD9A 3NG7X 3LB8A 4JY3A 4P9SA 2XFUA 1EBDA 4HB9A 2R45A 4BK2A 1VG0A 1FCDA 2GAGB 5FS6A 4JDRA 4H4YA 2CVJA 4CY8A 1D7YA 2GR2A 4UDQA 3SGLA 4H4RA 4H4QA 1XHCA 3CIRA 3QSMA 1DXLA 2H89A 4GF7A 3SFEA 4ECHA 3NNEA 4NTDA 2XFOA 3UTHA 4CNJA 5BUKA 1GALA 1YQ4A 1N4VA 2EQ8A 2VOUA 1H84A 1LPFA 1ZDLA 3NTAA 3GDNA 3NIXA 3SFDA 3UKPA 1YKJA 3AEDA 4YSZA 2Q6UA 3PO7A 1KSSA 2QA1A 1D4CA 3IHMA 2R4EA 4DGKA 1TDFA 3KKJA 2QA2A 3ITJA 4UP3A 4C3YA 1GEUA 3BNUA 2C70A 1GSNA 1TDEA 3GWFA 5EBKA 4U8OA 1GRBA 1DOCA 1FL2A 2Q0KA 3NTDA 1XDIA 5KOXA 3AWIA 4J57A 2BK4A 2YVFA 2OLNA 3AE6A 1JRYA 1TRBA 2XFQA 1LJ1A 3OZ2A 2Y6QA 3GRSA 2YM1A 3D1CA 1K0LA 4Z44A 3VR9A 2B9YA 2WDRA 3BI4A 3ICTA 2BK5A 2E1MA 3VRAA 3K30A 5JCKA 1CC4A 1H82A 5HY5A 4NTCA 4U8JA 1QO8A 4ADWA 2VQBA 4TM3A 1ZMDA 2XLSA 2VRMA 2EQ7A 4TLZA 4U2TA 4A6NA 5U63A 2H88A 3E1TA 3NN0X 3VR8A 4E0VA 4Z25A 3AEEA 3V3OA 4EM4A 4J36A 1L9DA 2CFYA 3ATQA 4NEWA 3GD3A 1GOSA 5U25A 4EQWA 1E1KA 1JRZA 4NEVA 3F8RA 1JOAA 3NYFA 4U2LA 4TM1A 3NK2X 1NHSA 1SEZA 3ADAB 4GR1A 1K0IA 3UP5A 5HYMA 2WDVA 1ZX9A 2YM2A 3CNDA 1GTEA 2WP6A 2BXSA 1N4WA 1DJQA 4BK3A 2HQMA 1GNDA 4U8NA 3QVPA 1D4DA 4B65A 4EMWA 3P4QA 3DJEA 2V3AA 4RSLA 3M13A 3PVCA 2CULA 5EOWA 3I6DA 3CGEA 4WCTA 4ICYA 1JNRA 3Q9TA 4YTPA 2B7RA 3CNTA 1CJCA 2BXRA 1GRFA 4OPLA 4J31A 1PXAA 3AEGA 4A65A 2F5ZA 2A8XA 2A89A 1N4UA 2QAEA 1PBEA 2VQ7A 3BHKA 2FBWA 3CGCA 5HHFA 1H7XA 3UOZA 3LADA 2X99A 4I58A 4Z2TA 1PBDA 2R4JA 3GD4A 2WU5A 1IUTA 2YG6A 2WU2A 4A99A 1DJNA 4B68A 3V76A 1E6EA 1YY5A 2ARDA 2WOIA 1S2YA 4CCRA 2GEWA 2X50A 3BI2A 3UKFA 4XXGA 4OPDA 4N9XA 4U8LA 1NENA 1KNPA 2YAUA 2YG4A 3G5RA 4H2RA 2C76A 4EQXA 3EF6A 3F8PA 2WOWA 2J3NA 3EPTA 2E5VA 1F8SA 1Z6LA 3M0OA 3NRNA 4FK1A 4U8MA 4FX9A 5DBJA 5IQ1A 3RP6A 4A5LA 3AE8A 1YQ3A 3GYIA 1PDHA 5BVAA 1TYTA 1Y0PA 4LA1A 3S5WA 3NKSA 2C3DA 4CY6A 1P2HA 4Y4MA 4H2NA 2BK3A 1GERA 2JB2A 3DK9A 4YSYA 2XYOA 1OJCA 2XLPA 1IUWA 1O5WA 1NAAA 2GR0A 2WP9A 1DODA 2XLTA 2X8GA 3AEBA 1HYUA 4YKFA 1FOHA 1GV4A 1M6IA 4Z43A 3AYLA 3LOVA 4H4UA 1PXCA 3LJPA 4J2WA 1AOGA 1H83A 2VVLG 4WX1A 1PBBA 2WPFA 4LU6A 1KSUA 1XPQA 1RP0A 2BA9A 3AD8B 1EL5A 2VRLA 4BJZA 5JCLA 2R0CA 2JAEA 3SQPA 1CJ2A 2YLZA 4X4JA 3IHGA 5KWFA 3UKHA 3VQRA 1IUSA 3UP4A 3DJJA 1D7LA 4LIIA 2Q0LA 4B69A 3QJ4A 2RABA 3ZYXA 4YXDA 1EL9A 3NLCA 4TLXA 2BC0A 3UKAA 4K22A 3ALMA 2WS3A 2IVDA 2XFNA 1MO9A 3H8IA 3ATRA 2GQFA 1ZK7A 3FG2P 2GR1A 2YVGA 5L46A 4X9NA 1GPEA 2GB0A 3G5SA 3F8DA 2AQJA 1GTHA 2GAHB 3ALLA 4HA6A 5J7XA 1PS9A 2GVCA 3DH9A 5ER0A 1GREA 3T37A 2X3NA 2WPCA 2EQ6A 2FJDA 2OAMA 4H4SA 4JNAA 5BULA 2GMJA 4A9WA 5JCMA 3KLJA 1Q9IA 4DNAA 2YR4A 5HXIA 2C65A 2JBVA 1YQZA 3M12A 4J34A 4DSGA 4A6NB 3KVEA 2CDUA 3GSIA 4EMIA 1PN0A 1VRQB 2FJEA 1O94A 2ZBWA 3AB1A 3G5QA 4BURA 5JCNA 2OLOA 2BCPA 3ABVA 3HZLA 5C2TA 2VVLA 1LV0A 3LZWA 1ZP0A 1GRAA 3L1RA 4H4XA 4EMJA 4U8KA 4D04A 2FJBA 3GDPA 4ZN0A 2OA1A 1DOEA 1X31B 1TDKA 1CC2A 3AXBA 1GRGA 3I3LA 3K7QX 1IJHA 2BC1A 3II4A 3NGCX 5FS7A 2ACZA 3KA7A 4H4TA 3VRBA 2GV8A 1LVLA 2WEUA 4K5RA 3ICSA 1OJTA 1CL0A 2GMHA 1NG4A 3GMBA 2WESA 3NHOX 4Z24A 1E1MA 1FEAA 2R46A 2XVEA 4B64A 1O95A 1Y56B 2AR8A 3AD7B 4EQSA 2TMDA 1M64A 2WP5A 4APNA 2YG5A 5CKUA 4H2QA 1RSGA 4K8DA 4TM4A 4U8IA 3L8KA 3UCLA 1JRXA 4EIPA 1F8RA 3CPIG 1DNCA 1D5TA 2BYBA 2WHDA 3BHFA 5KOWA 3DK4A 2QCUA 5KRQA 2V61A 3QFBA 3AE1A 4D03A 4Z2UA 4OPGA 4AP1A 2C72A 4YTMA 1ELIA 1F3PA 1PXBA 2WBAA 1W4XA 1NHRA 2XVIA 4YT0A 3AE5A 1VDCA 3C96A 3PS9A 4Z2RA 1FEBA 2V3BA 3URHA 4CRTA 1PBFA 1NPXA 4CBQA 1S3BA 2NPXA 4U2SA 1E7PA 3AE3A 3C4NA 1VG9A 4REKA 3CPJG 4YSXA 1Q1WA 2B9WA 3UOXA 2X8HA 1VQWA 1F6MA 1TYPA 2IIDA 4J56A 1TDNA 1REOA 2YVJA 4I59A 4B67A 3LZXA 2BS4A 3SM8A 2C73A 5GRTA 1NG3A 1E1LA 5TR3A 2R0GA 2NVKX 2Z5YA 4JN9A 3H4KA 5IPYA 1K0JA 2BS3A 2V60A 1S2QA 3CPHG 1PJ7A 1H7WA 2YLRA 4RG3A 4H4PA 1GESA 3NK1X 2YR6A 3COXA 1BGNA 3UOYA 4EIQA 3P1WA 2X8CA 3REDA 3NT6A 3B6DA 2ZZ0A 2GRTA 3FMWA 1PJ6A 4Y4LA 1IUVA 2BCGG 3DGZA 3GRTA 2WOVA 4B63A 2XVFA 1CJ3A 2AAQA 2BACA 4XWZA 2TPRA 3NK0X 1DOBA 2B76A 4CNKA 3NH3X 2XVHA 2C64A 2Y6RA 3NYEA 4BK1A 4FK1C 4NZHA 3RNMA 3UKLA 4B1BA 3IWAA 3O0HA 1OJDA 1RYIA 1JU2A 2B9XA 3DJDA 4ZCCA 1MXTA 4O5UA 4USRA 4JY2A 3DK8A 1BWCA 3C4AA 2YG7A 3K7TA 4H2PA 4IA6A 3ZDNA 2JB1A 2YR5A 4OPIA 2PHHA 3DMEA 3AE7A 5FS8A 1S3EA 4X9MA 3ISHA 3NYCA 4IA5A 1F8WA 2IVEA 3CGBA 3CTYA 3B3RA 2EQ9A 3P4SA 4BJYA 1PBCA 2YWLA 3AEAA 1LQTA 3RP7A 1CJ4A 1KNRA 2A87A 2ZZCA 1V59A 4U8PA 2GR3A 4H4ZA 4M52A 4C77A 2YG3A 1IUUA 4GDEA 4YSHA 2YLXA 5FMHA 1P2EA 1CHUA 3AEFA 3AD9B 4C5OA 3UKQA 2V6OA 4PAAA 4YWOA 1LQUA 3DGHA 5CQFA 3WE0A 3S61A 4OPCA 2WDQA 2XCGA 4GCMA 1NDAA 4TM0A 3CGDA 4UDPA 5M0ZA 2FJAA 2PYXA 2XDOA 2GQWA 1ZOVA 1N1PA 1ONFA 1FECA 5FS9A 3AYJA 5LV9A 1CC6A 1EL7A 1COYA 3GWDA 3Q6JA 1CF3A 1L9EA 3GYJA 1CBOA 1D4EA 2XVJA 4KPRA 4IV9A 3CN8A 4PABA 2JKCA 3KPFA 4K5SA 3AE9A 1EL8A 1H6VA 4BV6A 3AE4A 2BABA 1B5QA 2GF3A 2B7SA 1B4VA 5J60A 5JCIA 1IUXA 4H4VA 4IVOB 4MJWA 2I0ZA 4UDRA 3UTEA 3R9UA 4AOXA 4RG4A 3DA1A 4DSHA 1OJAA 4J33A 3AYIA 1KF6A 4K7ZA 2VVMA 2XLUA 3FIMB 2E4GA 3DJGX 4H4WA 3RHAA 3IF9A 3P9UA 3CNJA 3H8LA 1NEKA 2DKIA 3AECA 2C67A 4IVMB 1PJ5A 2WQYA 4EM3A 2APGA 3CNPA 4USQA 4AP3A 1H86A 2W0HA 1ZY8A 3UTGA 2WPEA 5KVHA 1L9CA 3AE2A 1ZKQA 3KU9A 4C3XA 1BKWA 4JQ9A 1NHQA 5GSNA 1XANA 2YLWA 3IC9A 1K4QA 1MOKA 3UOVA 4GUVA 4C74A 4AT0A 5EB4A 3V3NA 2GH5A 2XLRA 4A79A 3QSSA 2R0PA 1GRTA 3P4PA 4GDPA 3EAOA 4Y4NA 3UTFA 1LTXR 4OVIA 1GRHA 3ALJA 1UKVG 2RGHA 4FDCB 5IQ4A 2O9ZA 3ICRA 3UKKA 5BRTA 4B66A 5EB5A 1KFYA 2R9ZA 1BGJA 1Y56A 3BI5A 3NN6X 1PHHA 1JEHA 2C3CA 4OPTA 1GETA 2YLSA 2ZZBA 2RGOA 2BS2A 2Q7VA 4H7UA 4GRTA 1B8SA 2JB3A 3LXDA 4K2XA 3GMCA 3QFAA 1QJDA 3FBSA 3RP8A 5C3JA 1B37A 4ZCDA 4NTEA 2JK6A 1GXFA 1BF3A 4YTNA 1JNZA 4OCGA 3OC4A 2YQUA 1E39A 2RGJA 4Z26A 2C66A 2XFPA 1L0VA 3EANA 3VRDB 2C75A 4A7AA 5M10A 5KVIA 1Q1RA 1ZMCA 2Z5XA 2V5ZA 3P4RA 3BNMA 3D8XA 4OPUA 3QVRA 2C7GA 4JNQA 1ZOYA 3K7MX 5U1OA 4EQRA 4H50A 4XWRA 4AT2A 4YKGA 4O5QA 2WETA 2VZ2A 1KDGA 1NHPA 3JSKA 3FPZA 3QSEA 4AOSA 1QLBA 2YLTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RI7A 4KX6A 1U3AA 3TKRA 3NG7X 1BZLA 3KD9A 4P9SA 2XFUA 1EBDA 4TOPA 5FS6A 4JDRA 3KH9A 3I43A 3RPPA 2GR2A 4H4QA 1EP7A 2OADA 3H8QA 2H89A 3SFEA 2O7KA 2XFOA 3UTHA 4KH7A 1YQ4A 1N4VA 2EQ8A 2VOUA 1H84A 1LPFA 5D73A 2GZYA 3SFDA 3LEFA 5EVOA 1YEXA 3KP9A 4OCEA 2Q6UA 4L0UA 4DGKA 1TDFA 2EIOA 2C70A 5EBKA 1GRBA 1DOCA 2Q0KA 3AWIA 1GL8A 1TK0B 1WPIA 4V2NA 19GSA 4GQFA 1LJ1A 3GRSA 1K0LA 10GSA 4IBPA 3ICTA 3W8SA 1PRXA 5DJLA 1V9WA 4K9ZA 4K1FA 4ADWA 2VQBA 2AB6A 4WF5A 1YY7A 4N0ZA 1EWXA 3N9JA 5B7CA 5ID2A 3IHQA 4U2TA 3F3RA 4A6NA 3HJOA 1Z6MA 1XWGA 4HQSA 3VR8A 4EM4A 5CRGA 1K3OA 3FRCA 2KLXA 1E1KA 5J5NA 1JRZA 5D9XA 1JOAA 3SZFA 1XXUA 3NK2X 4GR1A 1PGTA 3TJKA 1WP0A 3TKSC 3KGKA 2YM2A 2WP6A 2BXSA 1N4WA 1SKSB 4KSMA 1KTEA 4KDUA 4PUAA 3QVPA 5KN3A 1K0OA 3DJEA 2V3AA 3F6FA 4ZB6A 3GL3A 1A8LA 2HZEA 2I81A 3Q9TA 2OBKA 1CJCA 2BXRA 1GRFA 5CYYA 3EU4A 4EUYA 2F5ZA 2A8XA 1MTCA 3CGCA 2AYTA 1H7XA 3UOZA 3FHKA 1SENA 4BL7A 4Z2TA 3GD4A 2XC2A 3VI5A 4I58A 1IUTA 4D73B 4A99A 3D6IA 1X5CA 1YQ1A 2ARDA 2GEWA 3UKFA 2WZ9A 2NTOA 4U8LA 2PUKC 2C0FA 2FCHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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