4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
3NTAA 4WCTA 1H7WA 2WU2A 4P9SA 2YG4A 1L9EA 3BI5A 1D5TA 1XDIA 4H2NA 2NVKX 2EQ7A 4USRA 3UCLA 4WX1A 4EQWA 2QA1A 4HB9A 5JCKA 2BS2A 2VVLA 5ER0A 3URHA 1XANA 5L46A 4GDEA 3QSSA 2R4JA 1H84A 2Q7VA 2VOUA 2BK3A 3NTDA 3NT6A 5U1OA 2BS4A 1GXFA 2O9ZA 2R0PA 4CCRA 2PHHA 3GYJA 2WDVA 4H4WA 4O5UA 4D04A 1GPEA 1XHCA 2GR2A 3O0HA 2C66A 1E7PA 1KNRA 1TRBA 2BABA 3NHOX 1O5WA 4H2PA 4YSXA 4TM0A 3ICTA 4U2TA 1TYPA 4OPTA 5KVIA 2BXRA 2YWLA 2JKCA 3DMEA 5FS7A 2YG7A 4CRTA 1Q1RA 2VQBA 3QSMA 4Y4NA 1D4DA 2JAEA 2ZZ0A 3BHFA 3UKHA 4TLZA 1IUSA 2C72A 4NZHA 5EBKA 3NN0X 4B68A 1H83A 4Z25A 1KF6A 5GSNA 1NHPA 2YLXA 3QSEA 4KPRA 2B7SA 1LVLA 2F5ZA 2X50A 2X99A 2B76A 3ABVA 5KOWA 4J31A 5M0ZA 2YG3A 3Q6JA 4I59A 4AP1A 3DJDA 1GRTA 4EQSA 4EM4A 1PDHA 1FECA 3AB1A 1H81A 1ZK7A 4MJWA 2Y6QA 3ITJA 5CKUA 4TM4A 1BKWA 5HYMA 3QVPA 2CULA 3H8LA 1ZMDA 4YKFA 5HXIA 3Q9TA 5JCIA 3RP6A 2WOWA 1F8RA 2Z5YA 2ZZCA 3OZ2A 3AE4A 3K7TA 5JCMA 3ICRA 4TM1A 4OPIA 2X8HA 2E4GA 4AOSA 5FS9A 1GERA 2C73A 3I6DA 3IF9A 2GR3A 1L0VA 3T37A 3EF6A 3ALMA 3M12A 4OPLA 4C74A 1Q1WA 4BK3A 3F8RA 3K7MX 2C64A 4D03A 1F8WA 1PN0A 3KVEA 3CNSA 2YG6A 2WOIA 3S61A 1K4QA 3QVRA 3FG2P 4H7UA 4X9MA 4RSLA 4K5SA 1DNCA 2WP5A 4U8NA 1QLBA 2C65A 1VDCA 1ZX9A 2AQJA 3P4PA 1KSSA 2CVJA 2BS3A 4A7AA 3UKLA 5JCLA 1K0LA 2Z5XA 4H4SA 2VZ2A 4AP3A 3AD9B 2C76A 2WP9A 2XLRA 4Z43A 2GAHB 2J3NA 5M10A 1BZLA 3CNPA 5IQ1A 2XVEA 1Y0PA 1YY5A 3G5SA 4X9NA 2GQFA 1EBDA 4ZCDA 4YT0A 1CBOA 5BVAA 5TR3A 1D4EA 4Z2RA 1NAAA 3BHKA 3GD3A 3UKPA 4ADWA 3GSIA 4CY6A 1CC4A 4Z2UA 3DGHA 4B66A 3LADA 2B9XA 1GSNA 3P1WA 2WPEA 3UOXA 3VRBA 4JQ9A 4RG3A 4EMJA 3KKJA 1H7XA 2ARDA 2YLZA 3FIMB 2CFYA 3ZDNA 4K2XA 2C3CA 4U2LA 4IVOB 3VR9A 3NN6X 4USQA 3ZYXA 3AD7B 2RABA 2C67A 4H50A 4EM3A 1NHQA 1NENA 2C75A 4RG4A 3ALLA 1BGNA 1GNDA 3K30A 3UOVA 4UDQA 5KOXA 4H4QA 1ELIA 2V3BA 4Y4LA 3G5QA 2EQ9A 2DKIA 1F8SA 4JY3A 4K8DA 2XVJA 3CNTA 1K0JA 4BURA 4H4ZA 3LZWA 4NTEA 2APGA 1NG3A 3P9UA 1KNPA 1NEKA 1IUVA 1ONFA 2WEUA 3IHGA 5HHFA 3DK4A 3K7QX 2A87A 2FJDA 2GH5A 2WP6A 3FPZA 3UP4A 2Y6RA 2B9WA 3CNDA 4BK2A 3REDA 1GEUA 1LV0A 3AYIA 1CJ2A 4GF7A 1GRBA 4C3XA 2H89A 4H2QA 1ZP0A 1CHUA 2BK5A 1GT8A 1M6IA 3CPIG 2W0HA 4CY8A 4CCQA 4DNAA 4JNAA 2WS3A 4IV9A 5BRTA 1L9DA 3L8KA 4U8LA 4YTNA 1TDEA 4FDCB 2B9YA 4FX9A 3QFAA 3LZXA 1GALA 2RGJA 1PJ7A 4J2WA 2FJBA 3NK1X 3P4QA 2WPCA 4GDPA 3PS9A 1OJDA 1BWCA 1PXCA 1F6MA 4JN9A 5FS6A 2XYOA 2GAGB 2WESA 3C4NA 3G5RA 3M13A 3AXBA 3QJ4A 4J33A 4XWRA 1EL8A 3GYIA 1NPXA 1IUWA 1LPFA 2V60A 4H4PA 4IA5A 4U8IA 1E1LA 2WOVA 5EOWA 1P2EA 4OPDA 4Z24A 3L1RA 4B67A 2QA2A 5DBJA 5C2TA 1CJ4A 5J7XA 4XXGA 4YTPA 3UOZA 2IIDA 3AE2A 2GR0A 2DKHA 1JNZA 4UP3A 3EPTA 1PJ5A 2YR4A 3ICSA 1N1PA 2RGHA 3RNMA 5CQFA 1YQ3A 4AT2A 2XFNA 3AE9A 3UKQA 1B5QA 1FEBA 2JBVA 1JNRA 1PBDA 1S3EA 5GRTA 3ATRA 4A5LA 1NHSA 4H2RA 3VRAA 2YM1A 4IVMB 4J34A 3AEFA 1HYUA 1XPQA 1GRGA 2AAQA 1D7YA 1K0IA 3PVCA 4NEVA 1EL7A 3BI2A 4JDRA 1E1NA 1JRZA 1PHHA 2FJEA 5JCNA 3V3NA 1PXBA 3R9UA 4OPGA 1O94A 4H4XA 3S5WA 2WHDA 1JEHA 3KLJA 2BK4A 3NH3X 4JY2A 2V5ZA 1B8SA 4KX6A 1H86A 2VQ7A 4EIPA 3NGCX 4DSGA 1W4XA 2R45A 3KU9A 4BV6A 3COXA 1S2QA 3IHMA 4A65A 1FL2A 4YSHA 1V59A 1NG4A 4PAAA 3CGCA 2GB0A 1OJTA 2OLNA 1CJ3A 2GR1A 1E1MA 1NHRA 1LQUA 4H4YA 1OJ9A 2YG5A 3SM8A 4FK1C 2PYXA 2BCGG 1BGJA 3D8XA 1ZDLA 1ZMCA 3B3RA 4E0VA 3LOVA 2X8GA 1PBEA 2Q6UA 2YR6A 1GREA 3ATQA 2NPXA 3DJGX 3CPJG 4B63A 4NEWA 2GMHA 2WPFA 3DGZA 3F8PA 3RP8A 1UKVG 3AYLA 1GRAA 1PJ6A 1LJ1A 2YVFA 5EB5A 1YQ4A 4YTMA 1E1KA 1H82A 1BF3A 2B7RA 1VQWA 5LV9A 1GETA 5HY5A 4GCMA 3NIXA 1Y56B 3P4SA 5IPYA 1O95A 1LTXR 2X3NA 4YKGA 3KPFA 2XFQA 2V3AA 2EQ6A 2HQMA 2Q0LA 4K22A 1CF3A 4A79A 1CL0A 4ICYA 1P2HA 2I0ZA 1CC6A 4A6NB 4BK1A 2XFPA 2YM2A 1B4VA 3NK0X 1VG0A 3GDPA 1MOKA 3M0OA 3AEAA 3JSKA 4OPCA 4YSZA 4A99A 3NNEA 3GRTA 3CGBA 2BC0A 3LXDA 1D4CA 1PS9A 4LU6A 2V6OA 1N4UA 1H6VA 5BUKA 2BYBA 3I3LA 2QCUA 5IQ4A 1ZY8A 4UDRA 2R0GA 2BACA 2RGOA 2AR8A 3AWIA 1QJDA 5KRQA 3AE1A 1KSUA 4O5QA 4K5RA 3UKFA 1RP0A 2XFUA 4Z26A 1TDOA 5J60A 3P4RA 3SFDA 3EANA 2BA9A 4U8MA 3VRDB 3RHAA 4H4VA 4OCGA 1EL9A 1L9CA 2FBWA 3AEGA 3RP7A 4YXDA 4Y4MA 3AEEA 1OJAA 2H88A 2JB1A 2C3DA 4H4TA 2YR5A 4DSHA 2XLTA 3BNUA 1GRHA 5C3JA 3AEDA 2BCPA 1TDNA 3F8DA 5KXJA 2YLSA 1DJQA 3CNJA 3V76A 4AOXA 4B65A 2XVFA 4A9WA 3LJPA 1JRXA 4LIIA 1DODA 2WETA 1KDGA 4U2SA 4Z44A 2A8XA 3UTHA 4B1BA 4U8OA 2VVMA 3C4AA 1JRYA 3GMCA 1ZKQA 2VRMA 3CGDA 1KFYA 2OALA 2YLRA 3DA1A 3LB8A 1M64A 1VG9A 1FOHA 1CC2A 4CNKA 5KWFA 1Y56A 3EAOA 4K7ZA 3H8IA 3VR8A 4YSYA 4HA6A 4XWZA 2R0CA 2XVIA 2WDQA 3CIRA 1QO8A 1B37A 2JK6A 3B6DA 4DGKA 1MO9A 3AE3A 3WE0A 4A6NA 4C5OA 4GRTA 2GMJA 2BXSA 1IUTA 2R46A 2XDOA 3VQRA 1LQTA 2ZBWA 3NK2X 1RSGA 3CGEA 1GOSA 2E5VA 3D1CA 3NYFA 4OVIA 4IA6A 4EQRA 3AECA 2GV8A 4EMWA 3BNMA 3AD8B 3GRSA 1RYIA 1YKJA 4U8KA 3UTFA 3GD4A 1N4WA 2JB3A 4ECHA 1GV4A 2GQWA 2JB2A 3AE7A 4B64A 3C96A 1S2YA 1TDFA 3PO7A 2WU5A 4FK1A 3AYJA 1E39A 2R4EA 4REKA 1REOA 1DXLA 2YVGA 3ALJA 4U8PA 2OA1A 3SFEA 2GRTA 3UOYA 4PABA 2VRLA 1PBCA 1D7LA 1E6EA 4H4UA 3CTYA 3GWFA 4BJZA 4I58A 2XVHA 3II4A 3UTEA 4J57A 3AE5A 4B69A 1SEZA 2X8CA 2ACZA 4OPUA 1YQZA 3CN8A 1NDAA 2Q0KA 2YVJA 3UKAA 3UP5A 4CNJA 4X4JA 2YAUA 4J36A 1IJHA 1JOAA 1PBFA 2YQUA 3FBSA 1N4VA 3NKSA 3NLCA 3NYEA 4EQXA 1GTEA 4J56A 4C77A 3GMBA 1FEAA 1PXAA 1S3BA 2YLTA 3H4KA 3IC9A 2ZZBA 3DK9A 3NRNA 3ADAB 4M52A 2XLPA 3UTGA 2UZZA 2WQYA 1ZOVA 3DK8A 4C3YA 4TM3A 1VRQB 1TYTA 2GVCA 2OAMA 2V61A 5EB4A 3E1TA 1CJCA 3AE8A 4N9XA 1IUXA 3V3OA 3BI4A 2OLOA 2BC1A 2WDRA 4APNA 4JNQA 3AEBA 4EMIA 2C7GA 4Z2TA 2FJAA 3KA7A 3UKKA 3OC4A 4NTDA 2XCGA 2XFOA 3KD9A 4U8JA 4GR1A 3NG7X 5KVHA 1Z6LA 4NTCA 2VVLG 5BULA 1JU2A 3AE6A 2QAEA 3SGLA 4GUVA 5FMHA 2TPRA 1IUUA 2CDUA 2GEWA 4EIQA 3SQPA 4ZCCA 1DJNA 1Q9IA 1F3PA 4H4RA 1GESA 2EQ8A 3CPHG 3GDNA 2WBAA 4CBQA 2IVDA 1EL5A 1MXTA 5U63A 2GF3A 2XLSA 3DJEA 2E1MA 1DOBA 4AT0A 1FCDA 1GRFA 1X31B 3FMWA 2XLUA 3ISHA 3DJJA 3DH9A 5FS8A 1GTHA 1OJCA 2A89A 1DOEA 4YWOA 1COYA 1TDKA 2R9ZA 1DOCA 2TMDA 4TLXA 1PBBA 3HZLA 4BJYA 4ZN0A 2C70A 1AOGA 1ZOYA 2YLWA 4LA1A 3IWAA 3NYCA 3QFBA 3GWDA 5U25A 2IVEA 4UDPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2AUVA 2WU2A 3RBTA 2OKAA 3TOUA 4I8BA 1D5TA 2DIYA 3SWLA 4H2NA 4D73A 2QA1A 5ER0A 5L46A 2VOUA 2BK3A 1B8XA 5U1OA 2CAQA 2BS4A 1GXFA 2CAIA 2PHHA 4D04A 4IKHA 1DBYA 1XHCA 1TRBA 1GH2A 1O7UA 2RM5A 3ICTA 4OPTA 2YNXA 4CRTA 3GNJA 4F03A 4PUFC 5J4UA 3HA9A 3NIVA 2JAEA 3UKHA 4TLZA 2H6XA 1XWAA 4BVYA 5B7CA 1FOVA 1IUSA 3SBCA 2C72A 3HYVA 3NN0X 4NZHA 4XIHA 1KF6A 5GSNA 2F8FA 1ML6A 4KPRA 2F5ZA 2X50A 2B3SA 3APOA 2GLRA 3ABVA 4RI7A 1FB6A 1G7EA 3BJ5A 2YG3A 5KN3A 3ZZXA 4EQSA 4EM4A 1PDHA 1XWKA 4EXJA 5G31A 10GSA 2JU5A 2Y6QA 3M9JA 5HYMA 2IL3A 4XCSA 3H8LA 4NWZA 1UA5A 5HXIA 3Q9TA 3FZ9A 3RP6A 2Z5YA 3WD6A 2H01A 3K7TA 1XIYA 4WEYA 1GSDA 3EVIA 3F9UA 5COHA 1GTIA 3QAVA 2RUFA 2WFCA 3ALMA 5KNLA 4N0VA 5C04A 5B6NA 2YWOA 2H30A 1K4QA 1V9WA 3QVRA 4H7UA 4ISDA 4X9MA 2TIRA 4K5SA 1VDCA 5IIZA 2AQJA 1LBKA 1A0RP 1KSSA 3P4PA 3SZFA 3UKLA 4AGSA 1K0LA 2YANA 4Z43A 2J3NA 1ABAA 4HQZA 1B4QA 1YY5A 4HJ2A 4KA0A 1EBDA 5FHIA 3GN3A 5BVAA 5TR3A 2MMOA 1D4EA 2C3TA 3GSIA 3DGHA 2EIOA 1GSNA 1HNCA 2JSYA 5ECHB 3ZDNA 1ERVA 2C3CA 1QK8A 4U2LA 3NN6X 2RABA 3DEXA 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4TXOB 5JWQB 1K0MA 3AY8A 1SL2B 1OJ9A 2YWMA 5ENUA 1ZMCA 3B3RA 1FW1A 3LOVA 4EO3A 2YR6A 1IYIA 1TU7A 5ECPB 1AUCA 1BYEA 1EEJA 3DGZA 4JU5A 3RP8A 2AJQB 5CO3A 3PINA 3IC8A 4YTMA 2B7RA 2WJUA 1GUKA 3UIWA 3NIXA 1JZOA 2P5RA 3F6DA 3BD2A 2XFQA 1C72A 3DVWA 2EQ6A 1GLQA 4ICYA 3C8EA 4K0NA 5F0GA 2YM2A 3NK0X 1B4VA 3UL3A 5ELAA 1VG0A 1B9YC 3M0OA 3MSZA 1GTAA 3RAZA 4YAPA 4A99A 3GRTA 4TW5A 2BC0A 2GQMA 1YF0A 2HZEA 3EMPA 5BUKA 4GLTA 3I3LA 2O85A 2DLXA 4UDRA 2BACA 1G7OA 2AR8A 3TCOA 3F6FA 2GQKA 3AE1A 3RDWA 2H0GA 2OJLA 3LJRA 3Q18A 2XFUA 2HE3A 3EANA 4H4VA 1L9CA 3AEGA 1Q4JA 2IPAA 4YXDA 2H88A 4PNGA 4H4TA 2H8LA 2DIZA 2XLTA 1GRHA 3EURA 1ILOA 5F07A 3F8DA 5KXJA 2NVLA 1SENA 4B65A 1ON4A 3CSHA 1BEDA 3UTHA 3SZ0A 1K0NA 1TP9A 2VVMA 1Z6MA 3TUEA 2B1KA 1KFYA 2YLRA 1K0CA 4CNKA 1FOHA 4ZB9A 1Y56A 3EAOA 3H8IA 4GQCA 2R0CA 5ECKB 5E4WA 4RQXA 4RQRA 3HXSA 1IUTA 3VQRA 1LQTA 3FW2A 3CGEA 2E5VA 2CZ2A 1JHBA 4EQRA 1HNBA 4EMWA 1OE8A 3LW9A 3KGKA 1YJ6A 3CMIA 3QD9A 3JCML 3TKSC 1YKJA 3U5RE 5DCGA 4Q5RA 1YZXA 4B64A 3C96A 2DJJA 3IR4A 2FHEA 3M9KA 1E39A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2AUV A;  2WU2 A;  3RBT A;  2OKA A;  3TOU A;  4I8B A;  1D5T A;  2DIY A;  3SWL A;  4H2N A;  4D73 A;  2QA1 A;  5ER0 A;  5L46 A;  2VOU A;  2BK3 A;  1B8X A;  5U1O A;  2CAQ A;  2BS4 A;  1GXF A;  2CAI A;  2PHH A;  4D04 A;  4IKH A;  1DBY A;  1XHC A;  1TRB A;  1GH2 A;  1O7U A;  2RM5 A;  3ICT A;  4OPT A;  2YNX A;  4CRT A;  3GNJ A;  4F03 A;  4PUF C;  5J4U A;  3HA9 A;  3NIV A;  2JAE A;  3UKH A;  4TLZ A;  2H6X A;  1XWA A;  4BVY A;  5B7C A;  1FOV A;  1IUS A;  3SBC A;  2C72 A;  3HYV A;  3NN0 X;  4NZH A;  4XIH A;  1KF6 A;  5GSN A;  2F8F A;  1ML6 A;  4KPR A;  2F5Z A;  2X50 A;  2B3S A;  3APO A;  2GLR A;  3ABV A;  4RI7 A;  1FB6 A;  1G7E A;  3BJ5 A;  2YG3 A;  5KN3 A;  3ZZX A;  4EQS A;  4EM4 A;  1PDH A;  1XWK A;  4EXJ A;  5G31 A;  10GS A;  2JU5 A;  2Y6Q A;  3M9J A;  5HYM A;  2IL3 A;  4XCS A;  3H8L A;  4NWZ A;  1UA5 A;  5HXI A;  3Q9T A;  3FZ9 A;  3RP6 A;  2Z5Y A;  3WD6 A;  2H01 A;  3K7T A;  1XIY A;  4WEY A;  1GSD A;  3EVI A;  3F9U A;  5COH A;  1GTI A;  3QAV A;  2RUF A;  2WFC A;  3ALM A;  5KNL A;  4N0V A;  5C04 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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