4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
3P9UA 1B5QA 2C65A 1ZMDA 2WPEA 3KD9A 2WHDA 2XVJA 3Q9TA 1M64A 4A6NB 1OJCA 2B9XA 4AOSA 4BV6A 4A99A 4XXGA 4UDRA 1LTXR 2Z5YA 3NG7X 2I0ZA 3PO7A 1CHUA 1N4WA 4EM4A 5DBJA 2BS3A 4YTNA 4H4PA 2EQ7A 4B63A 4EIPA 2Q7VA 4I59A 3UOZA 2W0HA 1F6MA 4Y4LA 1PXCA 1F8WA 3PS9A 1JRYA 2BCPA 3AEAA 4Z2UA 4CBQA 3QVPA 3BI4A 4H50A 3CGEA 4K7ZA 4U8PA 3I3LA 3KVEA 1GNDA 1S3BA 1F3PA 4UP3A 1IUWA 4K2XA 4NEWA 3EF6A 2R45A 1IUXA 3AYJA 4B64A 3AE2A 5JCLA 3R9UA 2XLTA 4GRTA 4J57A 2C70A 4AOXA 2FJAA 2C67A 4Z43A 4NTDA 1GTHA 4EMJA 3NTDA 4U8JA 1FOHA 1GALA 1MO9A 4UDPA 4OCGA 2ZBWA 2C3CA 1GXFA 2YG3A 3E1TA 4EMWA 4U8LA 4NEVA 4X9MA 2QA1A 4YSXA 2YLXA 3AWIA 4REKA 2GB0A 4PABA 3ATQA 2BC0A 1O94A 3NH3X 3AYLA 4B68A 3LZWA 2XLUA 2GVCA 2NPXA 3GMBA 3UKKA 4CCQA 3D8XA 1OJDA 1TDEA 1QO8A 1YKJA 3M12A 4EQRA 4YTPA 4H4XA 3AECA 2IVDA 5BUKA 5HY5A 1D5TA 1H81A 1IUTA 2QAEA 2WDQA 3CIRA 3KLJA 1PBBA 3ICTA 5EOWA 3ZYXA 3G5SA 2R9ZA 1DJNA 1REOA 2YAUA 1YQ4A 1V59A 4C74A 4YT0A 2XLRA 1JRXA 2C76A 1F8RA 3ADAB 1KDGA 4USRA 3K30A 3L1RA 5GRTA 4LIIA 4K5SA 1P2HA 2E4GA 2B9YA 4NZHA 4U2TA 4CRTA 2NVKX 4U2SA 2R4EA 3UOYA 2GR3A 3LADA 4TLZA 2BXSA 3KA7A 1LJ1A 5M0ZA 1L0VA 5KOWA 3VQRA 3EAOA 4YWOA 3AE8A 4YSHA 1NHSA 5EB4A 4CY8A 1B37A 5KOXA 2BACA 3GSIA 4H2NA 3SM8A 2YG7A 1FL2A 4PAAA 1BKWA 1MOKA 4TM1A 2GMJA 4JNQA 4OPGA 5U25A 3AEGA 5KRQA 3AEBA 2XVEA 2WU2A 1FECA 3KPFA 2AQJA 2GQFA 3IWAA 4WX1A 1VG9A 4C3XA 1YQ3A 2ZZ0A 1HYUA 4ICYA 3I6DA 3SQPA 1UKVG 1DNCA 3QVRA 3HZLA 1Y0PA 1NENA 1H82A 4USQA 3EPTA 2HQMA 3AE1A 2F5ZA 4J34A 4NTCA 3VRDB 3NK2X 4OPCA 3DJDA 3ALJA 3DGHA 4JY2A 1CJ3A 5TR3A 3V3OA 2XFQA 2V3BA 3AE7A 1PBFA 4Z2TA 1MXTA 1RP0A 1CJ4A 1D4CA 3DK4A 1CC6A 2WU5A 4FDCB 5JCMA 1PJ6A 2X8HA 1YY5A 1TYPA 2YM2A 1ZOVA 3FBSA 5U63A 2EQ6A 2GR1A 3NYCA 3CPHG 2XFNA 4AP1A 1ELIA 2WP6A 1ZY8A 2AAQA 2BK3A 3CPIG 1L9CA 2XVIA 1YQZA 3AB1A 2VOUA 1GPEA 2JAEA 4DGKA 3CGDA 3GRSA 3RNMA 3UKAA 2XFOA 2WOVA 1GRAA 2OLOA 3KU9A 1KNPA 3P4RA 4H4YA 4TM0A 1GOSA 3ISHA 1RYIA 1KSUA 2R0GA 1NAAA 4H4UA 4HB9A 3FG2P 2WOIA 2X99A 3COXA 4KX6A 3RP7A 4GR1A 4A9WA 1BGNA 2V61A 4BJZA 2GH5A 4D04A 2OLNA 3GD3A 3CTYA 1JU2A 1IUVA 2VQ7A 2CFYA 2Y6RA 3DJEA 1PJ5A 3REDA 2PHHA 2BA9A 4D03A 1N1PA 2VRLA 3GWDA 3SFDA 2VVLG 3BI2A 3LZXA 4RG3A 2WBAA 5FS6A 4ZCCA 4IVMB 4X9NA 2JB2A 1COYA 2IIDA 5C3JA 4U8IA 4Z25A 3GRTA 4K5RA 3K7TA 1Z6LA 2BC1A 2WPCA 3SGLA 5KVHA 3AEFA 3CNTA 2YR5A 4TLXA 2YLWA 2OAMA 2CDUA 2R4JA 1GV4A 3URHA 4UDQA 1ZDLA 2OALA 4XWRA 5KVIA 4Y4NA 1GT8A 4J33A 1M6IA 2X8CA 5M10A 2BK5A 5IPYA 1JRZA 3UKFA 3UKHA 3ICRA 4A79A 3GYIA 3ALMA 4DSHA 1L9DA 3UKLA 2V3AA 4J2WA 4OPTA 3CGCA 2TMDA 3RP6A 5FMHA 3NYFA 4H4ZA 1KSSA 2BS4A 3RP8A 3DGZA 1GRFA 2YWLA 2WP9A 3UKQA 4GF7A 2B7SA 3NN0X 2H89A 2Q6UA 2QA2A 2X8GA 2YG5A 3G5QA 3H4KA 2A87A 4AP3A 1F8SA 1CL0A 1GSNA 3CGBA 5HXIA 2YLSA 2YLTA 1GRGA 1BF3A 1ZX9A 2VVLA 5IQ4A 1BGJA 1JNZA 1XANA 1N4VA 3UTEA 3VRAA 1OJTA 3AEDA 3D1CA 4ECHA 3VR9A 1CJCA 1NDAA 3FIMB 5ER0A 1TDNA 1DJQA 3RHAA 2WESA 1S3EA 1KNRA 3T37A 1ZKQA 1GERA 1K0IA 2JK6A 4P9SA 4X4JA 2JB1A 2C64A 2QCUA 4ADWA 1O95A 4DNAA 1GETA 3NRNA 3NN6X 1EL5A 3QSMA 1H6VA 1S2YA 2WS3A 2GV8A 4GCMA 3VR8A 4EIQA 1GEUA 2XLPA 1ZOYA 2WDVA 4B65A 4XWZA 3QFAA 1GTEA 1E1LA 2R46A 5BULA 3AE6A 2ACZA 4J31A 3IC9A 2JBVA 3UTHA 2X50A 3CNSA 3F8DA 3UTFA 3AYIA 4A7AA 4O5QA 3LB8A 2XDOA 3GYJA 1E1KA 5L46A 1E1NA 1LV0A 1RSGA 2Y6QA 1DODA 2XVHA 4O5UA 1D7YA 2RGHA 4YKFA 2A8XA 3II4A 2XVFA 4CNKA 2APGA 3IF9A 1CC4A 1H7XA 3AE9A 1EBDA 3AE4A 3CNJA 2GF3A 4H2RA 1O5WA 2WQYA 4OPLA 4RSLA 4BK3A 5C2TA 4YTMA 3DMEA 4U8KA 2Z5XA 3GD4A 3H8IA 1S2QA 2YVJA 1IUUA 2BYBA 1PHHA 3UOXA 1CF3A 1NHPA 2YVFA 2ZZBA 2R0CA 1JEHA 3F8RA 3LXDA 4Z26A 1B8SA 1OJ9A 4FK1C 4TM4A 3C4NA 1EL9A 3NT6A 4BURA 2WPFA 2WDRA 1K4QA 4CCRA 5JCNA 3UP4A 1QJDA 3CPJG 2C75A 5FS9A 2EQ9A 5KWFA 2YVGA 3AD9B 4IA6A 4BK2A 3PVCA 1VRQB 1X31B 2YQUA 3S5WA 2R0PA 2C7GA 2BCGG 3BI5A 3EANA 3V3NA 1FCDA 4KPRA 4OPUA 2JB3A 4EQSA 4E0VA 4C3YA 3P4SA 3BNMA 4B1BA 1K0LA 4U2LA 2YR4A 3FPZA 3P1WA 2GQWA 1PJ7A 3GDPA 5HHFA 1PXBA 3NTAA 3DA1A 2RGOA 2GR2A 2YM1A 1B4VA 3NNEA 3IHGA 4Z24A 1PBEA 3C4AA 1PBDA 4A65A 4JQ9A 4WCTA 2YR6A 2VVMA 1VQWA 2E1MA 3AE5A 4H4WA 1NEKA 1PXAA 3BHFA 4ZN0A 4U8NA 1EL7A 4CNJA 2A89A 2Q0LA 3K7MX 1ZP0A 3GDNA 2BXRA 2VRMA 1GRTA 2RABA 2WEUA 4K22A 1VG0A 2VZ2A 5GSNA 3UKPA 1AOGA 2O9ZA 4IA5A 5LV9A 4N9XA 1E1MA 1NG3A 5EBKA 3FMWA 3F8PA 4BK1A 5JCKA 2E5VA 2C3DA 5EB5A 2BABA 3QSEA 3JSKA 3UP5A 1H83A 1NHRA 4LA1A 4YKGA 2UZZA 1N4UA 1W4XA 5BVAA 3DK8A 2DKIA 2XFPA 2XYOA 3CNDA 3H8LA 2WP5A 2BK4A 4H4SA 4EM3A 1K0JA 1P2EA 1FEBA 2XFUA 2ARDA 2DKHA 3DK9A 4H4RA 1JNRA 2CULA 2GAHB 3AD7B 3LOVA 4U8OA 3BNUA 4J56A 2YG6A 4EQXA 1LVLA 1TRBA 3DJJA 2WOWA 4B69A 1FEAA 1GRBA 3NYEA 3Q6JA 2IVEA 1TDFA 3M13A 3ICSA 1NG4A 3P4QA 3K7QX 3UTGA 2GAGB 3AD8B 4ZCDA 1ZMCA 1CBOA 1ZK7A 2V5ZA 5IQ1A 1LPFA 1D4EA 3AXBA 3S61A 1KFYA 1XDIA 3V76A 2C73A 2FJEA 2FJDA 4GDPA 4DSGA 3AEEA 2C66A 3UCLA 4H4QA 1GREA 3NHOX 2WETA 1DOEA 2CVJA 3NKSA 1BWCA 3O0HA 1Q1WA 4J36A 4IVOB 1GRHA 4JN9A 3G5RA 2YLRA 5HYMA 2H88A 3ALLA 2RGJA 1PN0A 3B3RA 3DJGX 4GDEA 4H7UA 3NK0X 3WE0A 4A5LA 1Y56A 5FS8A 1LQTA 4FX9A 1OJAA 5FS7A 1IUSA 2B76A 1EL8A 1E7PA 1ONFA 4OVIA 1PBCA 4HA6A 4B67A 2ZZCA 1Q1RA 4CY6A 4C77A 1TDOA 4YSZA 3CNPA 5KXJA 1Y56B 4FK1A 1IJHA 3BHKA 3VRBA 1GESA 2YLZA 3GMCA 4I58A 1XPQA 2JKCA 5U1OA 3NGCX 4YSYA 3NLCA 4Z44A 2BS2A 4YXDA 4Z2RA 2J3NA 1BZLA 4JY3A 2B9WA 3CN8A 3OZ2A 1CC2A 2B7RA 4H4VA 1DXLA 4AT2A 4OPIA 3SFEA 2FJBA 3ZDNA 1H7WA 1QLBA 1SEZA 4MJWA 3OC4A 1NPXA 4OPDA 5J7XA 3QJ4A 3AE3A 1JOAA 5J60A 5BRTA 4AT0A 2X3NA 4RG4A 1CJ2A 1LQUA 2GMHA 4GUVA 4LU6A 2GRTA 1KF6A 1VDCA 3NK1X 1PS9A 4EQWA 2XCGA 4B66A 4JNAA 4NTEA 5JCIA 4APNA 2XLSA 2PYXA 1DOBA 3ABVA 2GEWA 1TYTA 2AR8A 2YG4A 3ATRA 3DH9A 4H2PA 4H4TA 1TDKA 3B6DA 3QSSA 1XHCA 5CQFA 4M52A 1D7LA 1D4DA 2OA1A 4TM3A 2V6OA 2V60A 4IV9A 2Q0KA 1PDHA 3P4PA 3QFBA 1Q9IA 4JDRA 3C96A 3GWFA 4K8DA 2GR0A 3LJPA 4EMIA 2EQ8A 4C5OA 1L9EA 4Y4MA 1DOCA 3M0OA 2FBWA 3NIXA 5CKUA 3ITJA 2TPRA 4U8MA 1E39A 3UOVA 2C72A 4A6NA 4BJYA 3KKJA 3L8KA 3IHMA 1H84A 2VQBA 1NHQA 1H86A 4H2QA 1E6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZTLA 2AUVA 2VL2C 4NAXA 3KD9A 2XVJA 4AOSA 3FKFA 2FLSA 3US3A 3TRXA 3F4TA 4UDRA 1GNEA 4WF4A 3GN3A 3PO7A 1N4WA 3I69A 5G31A 2BS3A 4H4PA 5KMSA 1XW6A 3UOZA 2W0HA 4POBA 5C00A 2DMLA 1XWBA 5B7CA 2C4JA 3QVPA 3BI4A 2B1KA 1FVJA 4K7ZA 1GWCA 1OC8A 1GNDA 4Z7XA 3VI5A 4UP3A 3R3EA 1TI3A 1U6TA 1XWCA 4NEWA 5B6MA 5JCLA 3FW2A 1YZXA 1SL0B 4GRTA 3F0IA 2FJAA 5GAND 2C67A 4NTDA 1GTHA 1FOHA 1GALA 4GLTA 4K1FA 1GXFA 4EMWA 3E1TA 1EOGA 1TU8A 2LJRA 4XS6A 1WPIA 5CREA 1NHQA 4ZB9A 5EPFA 1Q98A 4PABA 2BC0A 3CXGA 3AYLA 1R5PA 4ZXGA 2GVCA 2JSYA 3I43A 4OFTA 1OJDA 1YKJA 1YDKA 4G73A 2D2ZA 4WBJA 5HY5A 1H81A 3KLJA 3UOMA 4KA0A 1Y25A 5IIZA 4HDEA 1REOA 2A2RA 1V59A 4C74A 3PINA 2XLRA 1JRXA 2C76A 4OD7A 2B5XA 1KDGA 1X5CA 1U3AA 1TK8B 2B9YA 2NVKX 4MF7A 3KA7A 1LJ1A 2I9HA 2HRFA 1YF1A 4LL4B 3DGQA 3AE8A 4V1Ap 5D9VA 4TR1A 1NHSA 3TCOA 2BACA 6GSYA 2GMJA 5IPHA 3N9JA 3AEBA 2OACA 4KH7A 5AIVA 1S3DA 3D21A 2YJHA 2L5LA 1PL2A 2YWNA 1VG9A 3HCZA 2AHEA 3SQPA 4BWSA 3ZZXA 1UKVG 1M9AA 1Y0PA 3QPMA 4EKZA 3VRDB 3NK2X 3LYPA 4TR0A 3DJDA 4Q5RA 1CJ3A 5TR3A 4Z2TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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