4EIPA

Native and k252c bound rebc-10x
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
526
structure length
521
Chain Sequence
PIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDGTITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative FAD-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 163
structure length 521
sequence length 526
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 4eipA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4eipA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4eipA01
1D7LA 2ACZA 4OCGA 4CRTA 3QVRA 1OJDA 3UKQA 3ITJA 1H81A 4JY3A 2XFPA 4JN9A 2ZZ0A 1PBFA 2J3NA 1H86A 1CJ2A 1PJ5A 3EF6A 3HZLA 2B9XA 4YSZA 3CGBA 1TYTA 3DK8A 3CPIG 1PJ7A 1PXBA 1RYIA 5FS6A 3GMCA 4GR1A 1ONFA 1JOAA 4I58A 3V76A 4B64A 3S5WA 3B6DA 2GF3A 2BYBA 2FBWA 2YG4A 3OC4A 4CNJA 3AB1A 4B63A 4EIPA 3K30A 2BS2A 4K22A 1MO9A 4FDCB 2AAQA 4H4ZA 2RGHA 3SFEA 3LOVA 1F3PA 4PAAA 1IUSA 5IPYA 4O5QA 3UP5A 4Z44A 3ZDNA 2R4EA 2XLUA 2YVFA 1JU2A 1Q1RA 2WU2A 1NHQA 3Q6JA 1JEHA 2QA2A 5U25A 1PXAA 4EM3A 4H2NA 1YY5A 1E1MA 3ALLA 1ZOYA 3AEAA 4AP1A 4CNKA 4EIQA 2BCGG 1IUXA 3AWIA 3DGHA 2XFOA 1JNZA 3LZXA 1K0JA 2PHHA 1IJHA 3CGDA 3H8IA 5KXJA 4NTDA 3SFDA 4UDPA 3GDPA 3NT6A 4H4WA 1GALA 1S2YA 3GYIA 2X8CA 1VDCA 2V3AA 4YTMA 3BNMA 2NVKX 1F8RA 2RGJA 2XFUA 3AEGA 3KVEA 3GYJA 2WEUA 3CNSA 1CC4A 4JNQA 4LA1A 2WQYA 3GRSA 1KSSA 2OLOA 4K5SA 4K5RA 1JRXA 2JK6A 1IUUA 2WDQA 2WOWA 4Z26A 3B3RA 4BK1A 4YSXA 1FEBA 1GETA 3BI4A 1CC2A 4B67A 2YG5A 2XLTA 2XDOA 2JKCA 2WP9A 2VRLA 4TM0A 3RHAA 1VG0A 3SGLA 1FECA 4C3XA 3QVPA 4K2XA 3BI5A 1EL5A 1O94A 2YG7A 1CJCA 5ER0A 1Q1WA 4ZCDA 3D8XA 2R46A 4JNAA 4EMWA 3ZYXA 1ZY8A 4B68A 2JB3A 4USRA 5KVIA 1YQZA 2YVJA 2VQBA 4B65A 2GMHA 3NN6X 2BACA 2GR1A 3RP6A 4K8DA 1E7PA 3CGEA 3SQPA 4H4PA 4AT2A 1H84A 3C96A 4A6NA 1TDFA 1CF3A 2GR2A 5TR3A 1ZP0A 4H4XA 4DSHA 1VQWA 1ZMDA 3AE5A 2C7GA 2X8HA 1IUVA 1B8SA 1W4XA 4XWZA 2C75A 3UP4A 1D4DA 1GTHA 5FS7A 3GD4A 1LJ1A 3DGZA 1GESA 1BKWA 1YKJA 2V60A 2X99A 1PHHA 2XFQA 3ABVA 2Z5XA 1SEZA 3I6DA 4RSLA 3S61A 4IV9A 4Z25A 1H82A 3KD9A 1H7XA 3FBSA 3UKPA 1GSNA 2WOVA 3AE8A 3CGCA 4J33A 4XXGA 4AP3A 4YKGA 4GDPA 3KU9A 4A6NB 4DGKA 2Y6RA 3R9UA 1GERA 2XVHA 2R0GA 4OPGA 2YM2A 1VRQB 3ADAB 4Y4MA 4C74A 2GR3A 2GVCA 5M0ZA 1TDNA 4REKA 2YWLA 4H4YA 3P4RA 1E39A 1FCDA 1XDIA 3BHFA 1QLBA 4C77A 3ALJA 3H4KA 3CN8A 2XVJA 2WHDA 3H8LA 5EBKA 4OPTA 1AOGA 4JQ9A 2C3DA 2A8XA 1RP0A 3IC9A 2XLRA 1N4UA 4PABA 4WX1A 2VQ7A 2VRMA 2XLPA 3EANA 4OPCA 1PBDA 1COYA 4D04A 1CJ4A 3VQRA 4A7AA 2DKHA 2FJDA 2YM1A 3DK4A 4O5UA 2Q0KA 4A65A 2I0ZA 1PJ6A 1O95A 2NPXA 2VOUA 3JSKA 4U8MA 1F8WA 2BCPA 2BXRA 1S2QA 3UKHA 1OJAA 4Y4LA 4J56A 2FJEA 3P4PA 5JCNA 1GOSA 1YQ3A 4U2LA 1NHPA 2PYXA 3NYEA 4H4QA 1B37A 3VRAA 5BULA 2EQ9A 2JAEA 2Q0LA 1OJTA 2H88A 1TDOA 3O0HA 4YSYA 1GT8A 4NTCA 4GF7A 1KNRA 1XANA 2GEWA 2O9ZA 4LU6A 4EQRA 5KRQA 1LQTA 1Z6LA 2CFYA 2WDRA 4CY8A 3NIXA 4H2QA 1GNDA 3NGCX 2B9WA 5BVAA 3QJ4A 1NENA 4J2WA 2YVGA 4K7ZA 1ELIA 1GRTA 4U2TA 1M6IA 5BRTA 2WOIA 3OZ2A 4YKFA 4EQSA 1L9DA 2CVJA 4H4UA 3BI2A 3CTYA 3II4A 4OPIA 3NTDA 2TPRA 1P2HA 3G5SA 4IVMB 4J57A 4TM3A 2BK3A 2C72A 2X8GA 2C76A 1JRZA 3V3OA 3RNMA 3P1WA 3PO7A 2E5VA 4U8LA 1HYUA 3M12A 4OPLA 1TDKA 2BA9A 2FJBA 5JCMA 1CBOA 3G5RA 1CC6A 2C65A 3EPTA 4YXDA 1GPEA 3AEEA 1BF3A 2GQFA 3AD9B 3SM8A 3G5QA 4YSHA 4A5LA 4JY2A 4H50A 3D1CA 2RGOA 1DOCA 4H4TA 1LPFA 2ZBWA 3PS9A 3FIMB 3AE1A 4IVOB 5HYMA 2C67A 3ICTA 1E1LA 3AXBA 3GWDA 3V3NA 2YLZA 2B7SA 1K4QA 3NTAA 1Y56A 5KVHA 1M64A 2YAUA 3WE0A 5FMHA 3UKLA 1F8SA 2E1MA 1ZX9A 5HY5A 2CDUA 1BZLA 1D5TA 2WPEA 2XVIA 1MXTA 3CNJA 4Z2RA 3IWAA 3CIRA 3QSMA 4TM1A 1K0LA 4OPUA 4C5OA 1NHSA 3DJJA 2H89A 3L1RA 3UTGA 4KPRA 1O5WA 4UDRA 1NG4A 3UTFA 2BXSA 1L9EA 3COXA 3E1TA 1X31B 1GEUA 2C73A 5J7XA 1Y56B 5CQFA 3DMEA 4IA6A 3AE3A 4LIIA 4E0VA 3KKJA 2GQWA 2WP5A 1MOKA 4FX9A 2R0CA 2WP6A 4A99A 1TRBA 2IVEA 1GRGA 4CCQA 3REDA 1GREA 2B9YA 3NN0X 4GRTA 3GRTA 1EBDA 2GAHB 2YG3A 3GDNA 2YQUA 4U8IA 2YLWA 2GV8A 1F6MA 4YWOA 3K7TA 4OVIA 4B69A 1QJDA 1ZKQA 4BV6A 3NYFA 2OA1A 4EM4A 1L0VA 3AD7B 1QO8A 4TLXA 1CJ3A 1OJ9A 4U8JA 1YQ4A 2BS4A 5C3JA 2GB0A 5U63A 1TDEA 5HXIA 4EQXA 1E6EA 2W0HA 3NK2X 3NK1X 4Z24A 1D7YA 2C66A 3ATQA 5GSNA 4NEVA 1PBBA 4U2SA 1S3BA 1DNCA 1XHCA 2XLSA 3GWFA 4C3YA 4H2RA 4U8KA 1EL8A 1NAAA 3AE7A 3KPFA 2GR0A 3VR8A 1GRAA 2WBAA 2WU5A 2ZZBA 4I59A 3C4AA 4JDRA 2QCUA 2Z5YA 2YG6A 4HB9A 2CULA 3VRBA 3DJDA 2FJAA 1UKVG 2EQ7A 4TM4A 3I3LA 1VG9A 4BURA 2DKIA 2GMJA 4OPDA 3T37A 2JB1A 1NHRA 2C70A 2OLNA 3UOZA 4XWRA 2WS3A 2WESA 4UP3A 2VVMA 4H4RA 5FS8A 1PXCA 1FEAA 2R4JA 3RP7A 5KOWA 1XPQA 3BNUA 2JBVA 4USQA 2BK5A 3K7MX 1NDAA 2AR8A 5CKUA 3QSEA 3DJGX 2F5ZA 3URHA 4BJYA 1LV0A 5EB5A 3F8RA 1JNRA 1KFYA 1ZMCA 2BC1A 1KNPA 4P9SA 5KWFA 2WPCA 3NH3X 3UKFA 1LTXR 3AE9A 4ICYA 1B5QA 2V61A 2BK4A 5KOXA 5LV9A 2BABA 3GSIA 3LXDA 5M10A 3F8PA 1D4CA 4ADWA 4ZN0A 4CCRA 1OJCA 2Y6QA 3AE6A 1LVLA 4FK1C 5IQ4A 3DA1A 3IF9A 2VVLA 2C3CA 4HA6A 1DJQA 3NYCA 2WDVA 1N4WA 2XCGA 3M0OA 3PVCA 2V6OA 1DXLA 4YTPA 4YT0A 2Q6UA 2WPFA 3P9UA 4X4JA 2GH5A 2EQ8A 3AD8B 1PDHA 4NTEA 3UKKA 3IHMA 1DODA 1ZK7A 2XVEA 4U8NA 3VR9A 4BK2A 4NEWA 3CPJG 1KF6A 2HQMA 2X50A 4AT0A 2QA1A 2YR5A 2VVLG 1KDGA 3QFBA 4H4SA 5L46A 2OAMA 3ALMA 5C2TA 1ZDLA 1DJNA 1H83A 1H7WA 1CL0A 2B7RA 3AE4A 5JCKA 1P2EA 2YLSA 4RG4A 4EMIA 1LQUA 4U8OA 5GRTA 3CPHG 4ZCCA 4GCMA 4YTNA 1S3EA 5IQ1A 2C64A 2RABA 3CNTA 1PS9A 3F8DA 3AYLA 3AEDA 1PBCA 3AEBA 3LB8A 3NLCA 2ARDA 1H6VA 1REOA 3ATRA 4H4VA 3FMWA 2A87A 3NNEA 4ECHA 1CHUA 2TMDA 3GMBA 3UOYA 4AOSA 3NRNA 1BWCA 1TYPA 4TLZA 3RP8A 2XFNA 1NG3A 2UZZA 3DH9A 3L8KA 5JCIA 1BGNA 3DK9A 2V3BA 4WCTA 3DJEA 4MJWA 1ZOVA 2WETA 4Z2TA 1NPXA 3ISHA 4AOXA 5U1OA 2VZ2A 1GRBA 2Q7VA 4DNAA 3UOXA 4NZHA 2B76A 2X3NA 4A9WA 4J31A 3LZWA 4Z43A 1DOEA 4X9NA 3AECA 2YR4A 4GDEA 1EL7A 2R9ZA 2APGA 3AYJA 2JB2A 3M13A 2IVDA 4CBQA 2YLTA 1KSUA 1JRYA 1IUTA 3LADA 1D4EA 3K7QX 3BHKA 4Y4NA 4APNA 4EMJA 1PBEA 3ICRA 3UCLA 3KA7A 1V59A 4BK3A 4H2PA 4IA5A 3KLJA 3QFAA 5EOWA 1Q9IA 4A79A 3P4QA 4D03A 2BC0A 1GTEA 1PN0A 4UDQA 1BGJA 2GRTA 3LJPA 3UKAA 1B4VA 2XYOA 3AE2A 3Q9TA 2OALA 4EQWA 2V5ZA 4FK1A 4B1BA 1GRFA 3EAOA 3NHOX 3P4SA 2YLRA 3CNPA 3ICSA 4M52A 4J34A 1E1KA 1NEKA 5DBJA 3NKSA 5J60A 1E1NA 3C4NA 2AQJA 4H7UA 1GV4A 5FS9A 4Z2UA 1FOHA 2EQ6A 1IUWA 2YLXA 4CY6A 2R0PA 1FL2A 2ZZCA 4DSGA 5JCLA 3VRDB 5BUKA 1N4VA 1EL9A 1N1PA 2YR6A 3QSSA 2GAGB 4BJZA 4RG3A 1GXFA 4KX6A 4U8PA 3FG2P 3CNDA 1GRHA 4J36A 4GUVA 1K0IA 3AEFA 1DOBA 3GD3A 5EB4A 4B66A 2E4GA 2R45A 3UOVA 4X9MA 3IHGA 2QAEA 1L9CA 1RSGA 3AYIA 1Y0PA 5HHFA 4N9XA 3UTEA 3NK0X 3UTHA 2IIDA 3FPZA 2XVFA 3NG7X 2BS3A 2A89A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SL2B 3QVRA 5DCHA 1FHEA 2VCZA 5F05A 5DBQA 1PJ5A 3EF6A 1ILOA 4OD7A 4CDOA 5ECSA 8GSSA 4YSZA 1TYTA 2CX4A 5JWRB 1F9MA 2KP2A 1PJ7A 2LEGA 1LBKA 2VLTA 5DAKA 1JOAA 2IPAA 4I58A 3M9KA 1C0LA 4TRXA 4HQSA 4MABA 1AN9A 3I43A 3SFEA 2A2SA 2V2GA 3RPPA 2IMIA 1X5CA 3CBUA 1K0AA 1GSYA 4Z7XA 3WD6A 2A4VA 4AJ6A 2C0FA 1Q1RA 3Q6JA 4GWRA 1HNCA 1PXAA 4OFTA 4H2NA 2LRTA 3M1GA 3GSSA 1YY5A 1ZOYA 6GSTA 5HFIA 5KMSA 2BCGG 1IUXA 1AC1A 1JNZA 1NSWA 3LZXA 3CRTA 3IE3A 3KMNA 3H8IA 5KXJA 2H6XA 1QGVA 1WIKA 2X8CA 4D73B 3LQ7A 2V3AA 4YTMA 2G2QA 4DSSB 2NVKX 2RGJA 2XFUA 2KUCA 3PH9A 5KN3A 2X64A 3LG6A 3CNSA 1CC4A 3D22A 4LA1A 4JNQA 5EPFA 4AGSA 5CRHA 1JRXA 1HNBA 2O85A 3VWUA 4EE0A 1GETA 3KD0A 5CRDA 1CC2A 4B67A 3EYTA 1N8JA 4Q5QA 2YG5A 2XLTA 3LFLA 3RHAA 1FECA 4K2XA 1USBA 1CJCA 5ER0A 1Q1WA 1GP1A 4B68A 2JB3A 5A5KA 2CVDA 5C04A 9GSSA 2BACA 2GR1A 2A4HA 3G7YA 3CGEA 3SQPA 5F0GA 6GSYA 3IHQA 1H84A 1W89A 1TDFA 5TR3A 1ZP0A 3VFIA 1VQWA 2IMKA 2MMZA 2C7GA 3AE5A 2GTUA 3SY4A 1O73A 5FS7A 2B5YA 2M72A 1SK1A 3I6DA 2Z5XA 4XIHA 1ZYNA 4Q5FA 5DALB 1H7XA 1GLPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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