4EIPA

Native and k252c bound rebc-10x
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
526
structure length
521
Chain Sequence
PIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDGTITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative FAD-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 163
structure length 521
sequence length 526
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 4eipA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4eipA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4eipA01
2DKHA 4RSLA 1GRGA 1TDNA 3NNEA 4XXGA 2YR6A 3V3NA 2YG3A 4C77A 1GRFA 1JRYA 1OJ9A 2PYXA 4ADWA 4EIPA 2XLRA 1GSNA 2BA9A 2E4GA 2FJDA 3ICSA 3NYCA 3P1WA 4U8OA 1H7WA 1GTHA 2BK5A 2AAQA 2BXRA 4OVIA 3FG2P 2BCGG 2WU2A 4BURA 3AEDA 3CNTA 1MO9A 1CC4A 2XVHA 3P4PA 1JNRA 1F8WA 1CC6A 1IUWA 5ER0A 3NTDA 1FEAA 2FJBA 3AEBA 1VQWA 4NTEA 1GOSA 4GR1A 1PHHA 3K7QX 4J31A 1GEUA 2YVJA 2E5VA 3CNPA 2GV8A 3VRBA 2WPCA 4Y4NA 4YTPA 5J7XA 3RP8A 1IJHA 4D03A 3WE0A 3NK2X 1Q1RA 1ELIA 1D7YA 1Z6LA 2R4JA 2VOUA 3P4SA 1LJ1A 3GRTA 4U8MA 2X8HA 1RSGA 1GRBA 2YLZA 2B9XA 4J2WA 1ZMDA 1XDIA 2C73A 3NRNA 4KPRA 4DSGA 5LV9A 4RG4A 4UP3A 1EL5A 4B1BA 1GV4A 1NHQA 5U25A 4K22A 2WBAA 4Y4MA 3RP6A 2GAHB 5KVIA 1LQTA 4PABA 3NIXA 4LU6A 4Z2RA 2JB3A 2V5ZA 1KNRA 3NYFA 4CY6A 1HYUA 2J3NA 2VRMA 1E1NA 1RYIA 1YY5A 3VR9A 4B66A 5FMHA 2Y6QA 4M52A 3L1RA 3NGCX 4DGKA 4LA1A 1NENA 4J56A 4C5OA 4CBQA 5JCMA 1ZX9A 2ARDA 2BCPA 2QA2A 1CJCA 4ECHA 4FK1C 1LTXR 1PJ5A 2B7RA 3LB8A 1ZOVA 2CULA 2UZZA 4MJWA 3DK4A 4B67A 2WEUA 2YG7A 3D1CA 4E0VA 1JRZA 1TDKA 2XLUA 3AYLA 2TPRA 3DK8A 2GR0A 4H4ZA 1UKVG 1FEBA 4P9SA 4ZCCA 2V3BA 2B7SA 2JB1A 2PHHA 3DGHA 3GD4A 3ZDNA 3E1TA 2GR3A 3UTFA 2C3DA 3ABVA 3C96A 2VZ2A 4B68A 4YTNA 3NKSA 1NDAA 4YTMA 1K0LA 4IA5A 4PAAA 4BV6A 3M13A 4IVMB 5CQFA 3VRDB 3UTEA 2XVJA 4EQSA 2Q0LA 4BK3A 3QJ4A 5EBKA 2XLSA 1EL8A 3QVRA 5HYMA 2QA1A 2BABA 2C65A 2R9ZA 1KSSA 1ONFA 1KSUA 2WDQA 3KKJA 4U8PA 2RGJA 3OC4A 1VRQB 5M0ZA 1ZY8A 3DJDA 1GNDA 2C66A 1GALA 1TRBA 2BYBA 3GYIA 4X9MA 2GEWA 1DJQA 3REDA 1XPQA 4U8JA 1XANA 2OLNA 3AE4A 2OLOA 2WPFA 3BI2A 3BI5A 3UKLA 1IUVA 3AE6A 4YT0A 1DOBA 2JKCA 2F5ZA 2JK6A 3NYEA 3ISHA 5KVHA 1M64A 5M10A 3ALMA 1H7XA 2YM2A 5FS6A 2WETA 4GRTA 1BF3A 4NEWA 4A5LA 4O5UA 4K5RA 4EQWA 2R45A 2R0PA 3IC9A 4Z43A 3UTGA 3CNJA 4DNAA 1H84A 3B6DA 3FIMB 2WP9A 1GPEA 2Q7VA 4XWRA 3LZWA 1K4QA 1KNPA 2VVLA 4H4YA 5HY5A 3AEEA 3DH9A 3K7MX 5EB5A 3KA7A 2XFOA 2YR5A 3GMCA 1PXAA 3LJPA 3AEGA 5JCLA 3C4NA 1PJ7A 1YKJA 2A87A 5GSNA 3CGDA 4TLZA 4UDPA 4CCQA 4YSHA 4IA6A 3PVCA 1BWCA 1H82A 2NVKX 2X8GA 2WPEA 1Y0PA 3Q6JA 3ALLA 2EQ8A 1Q1WA 3QFAA 2GAGB 2XDOA 2WU5A 1V59A 1YQ4A 1F3PA 2QCUA 3AD7B 4H4UA 1ZKQA 4I59A 4U8KA 2VVLG 4AP3A 2BC0A 4D04A 3AEAA 3CGCA 4OPDA 2R0GA 4AT2A 3IHMA 4NTCA 1W4XA 2GMJA 1X31B 4RG3A 4FK1A 2YLTA 3CNDA 4U8LA 5HHFA 1MOKA 2YG5A 4APNA 3II4A 1VDCA 1PBFA 2BK3A 4EQXA 1CC2A 1QJDA 4YWOA 4CRTA 2ZZ0A 3AYIA 4YSXA 2WESA 4Z44A 1TDEA 3AEFA 1D4EA 3BHKA 2V61A 3DJGX 2Q0KA 2V60A 5CKUA 2XYOA 2GMHA 3AD8B 2A89A 3NHOX 2WDRA 3GYJA 4H2NA 4AT0A 4TM3A 3AE5A 1XHCA 3UKKA 4IVOB 3AECA 3DJJA 2E1MA 3S5WA 4J36A 2JAEA 1NHRA 1LQUA 4OPCA 2XVEA 4JNQA 3ADAB 3ATRA 4H7UA 3O0HA 1H6VA 3OZ2A 2C7GA 4YSZA 4EM3A 1NPXA 2GR1A 1NG4A 2WOIA 4ICYA 4NZHA 3UKQA 5L46A 4UDQA 1F8RA 2ZBWA 3BHFA 3BNUA 3KLJA 4USQA 1JRXA 3AE1A 5U1OA 4B69A 2WP5A 1F8SA 4B63A 4Y4LA 1GRHA 3H4KA 3I6DA 4JQ9A 4ZCDA 2VQBA 2ZZCA 3NTAA 4NEVA 1DOEA 5JCIA 5FS7A 1N4UA 2JBVA 2O9ZA 1YQ3A 1B4VA 1IUXA 2EQ7A 3P9UA 4TM1A 1GXFA 3SFDA 1GESA 4Z2TA 2XLPA 2YLSA 3FPZA 3NK1X 3LADA 1E39A 1GRTA 1GERA 1D4DA 3AE7A 4Z24A 3V76A 4H4RA 2Z5YA 3P4RA 4H50A 2YLWA 4J33A 5JCNA 1E1LA 3NT6A 4EIQA 5FS9A 2H89A 3M0OA 4C74A 1P2HA 3UKHA 3QVPA 3LOVA 2FBWA 1QLBA 1TDOA 4XWZA 3UCLA 4A65A 5IPYA 1K0JA 4FDCB 2WS3A 2GR2A 2Y6RA 2YG4A 3CTYA 1PBCA 3CPHG 4GCMA 4OPUA 4TM4A 1O94A 1TDFA 4EQRA 4YKFA 2HQMA 5FS8A 4YXDA 2GRTA 2ACZA 3UOYA 1E6EA 1FECA 1GREA 3DMEA 4H2PA 5DBJA 3V3OA 1MXTA 4H2QA 4IV9A 1FCDA 1E1MA 2YLXA 3FBSA 1IUTA 3UP4A 4Z26A 4GF7A 3CGBA 2CVJA 4LIIA 3D8XA 4CNJA 3G5QA 3K7TA 4UDRA 3UTHA 2R4EA 3ITJA 1QO8A 2WHDA 1OJDA 1GETA 1ZDLA 3G5RA 1FOHA 2X3NA 3AE2A 3QFBA 1KF6A 1AOGA 3SQPA 4K5SA 1E7PA 4AP1A 4K8DA 1NEKA 2I0ZA 4CY8A 4EMJA 1PN0A 2VVMA 4YKGA 3NN0X 4REKA 3I3LA 4EMIA 3ALJA 1B37A 4BJYA 1BKWA 1H86A 4BK2A 3KU9A 2XFUA 3ICRA 2CFYA 3GWFA 1B5QA 2WQYA 3C4AA 1LPFA 2AQJA 2V6OA 2WOVA 3B3RA 2FJEA 3DA1A 2C75A 4H2RA 3COXA 2XFPA 2WP6A 2BXSA 4H4QA 4USRA 3T37A 4WX1A 4C3XA 3AE9A 5BVAA 1S3EA 3NLCA 3H8IA 1DNCA 1ZMCA 3S61A 2GF3A 4OPIA 3QSEA 3JSKA 2C72A 1CJ4A 4JN9A 3VQRA 4A6NA 2C64A 3NK0X 2C76A 1CF3A 2GQWA 3P4QA 1PBDA 2RGHA 2AR8A 3KD9A 2IIDA 1JOAA 2V3AA 3SGLA 3AYJA 5IQ1A 1P2EA 1TYTA 3F8DA 2IVDA 3F8RA 2BS2A 1NHPA 4JY2A 1RP0A 4AOXA 4BK1A 2BK4A 3EAOA 1TYPA 4A9WA 4FX9A 3GMBA 3GD3A 1PXBA 1KFYA 2QAEA 3BI4A 2R46A 2DKIA 1O95A 5KOWA 3VRAA 1D4CA 2WOWA 3BNMA 5KXJA 1H83A 3GDNA 1CJ2A 2YAUA 1DOCA 1PXCA 3IF9A 4H4TA 3L8KA 1CL0A 3CIRA 3K30A 1PBBA 1DJNA 4K2XA 3VR8A 3EPTA 5J60A 3H8LA 5KRQA 2VQ7A 1OJAA 1Q9IA 3CGEA 1PBEA 4A7AA 3IHGA 1M6IA 1D7LA 3R9UA 2ZZBA 4B64A 5HXIA 1L9EA 3NH3X 2X8CA 2X99A 4KX6A 3URHA 4DSHA 2EQ6A 4WCTA 2B9YA 3CPIG 3M12A 2XCGA 1JU2A 1CHUA 2R0CA 5IQ4A 4K7ZA 1IUUA 4O5QA 3SFEA 1L9DA 2BS4A 3QSSA 1BZLA 3QSMA 3Q9TA 2RGOA 4A6NB 3KPFA 1NHSA 1DXLA 1FL2A 3UOVA 1JEHA 3UKFA 4HA6A 4H4XA 5EB4A 2GVCA 4OPLA 3ATQA 5BRTA 3UP5A 3RP7A 2IVEA 1BGNA 2XFQA 1GTEA 1CBOA 2TMDA 1EBDA 2OA1A 2YVFA 4A99A 2XVFA 3KVEA 2YLRA 1BGJA 1Y56A 1PJ6A 4OPTA 4Z2UA 3UKAA 1LVLA 1OJCA 2W0HA 4N9XA 3UKPA 1S3BA 4U2LA 1EL7A 1L9CA 1B8SA 1DODA 2BACA 1YQZA 1VG0A 4TLXA 3UOXA 4TM0A 3PS9A 1N4VA 3ZYXA 1SEZA 4CCRA 3ICTA 1IUSA 1VG9A 2GH5A 4U8NA 2GQFA 4Z25A 1F6MA 1OJTA 1JNZA 3GWDA 3SM8A 3IWAA 3AWIA 1S2QA 2BC1A 3AXBA 3CNSA 1K0IA 2JB2A 2VRLA 2YR4A 4ZN0A 1H81A 5BUKA 3AB1A 4H4PA 1N4WA 1KDGA 3F8PA 2A8XA 1REOA 4H4SA 1EL9A 2BS3A 2FJAA 1O5WA 3NN6X 4EMWA 3AD9B 1GT8A 4JY3A 2OALA 2GB0A 1LV0A 4OPGA 5JCKA 2B9WA 4GUVA 4GDEA 2YWLA 4U2TA 4C3YA 3DGZA 2EQ9A 3EANA 2Q6UA 2YM1A 2H88A 3NG7X 4X4JA 2NPXA 2WDVA 2XLTA 3PO7A 3RNMA 3G5SA 1E1KA 4NTDA 5TR3A 1PDHA 2XFNA 5KOXA 2B76A 4GDPA 4X9NA 3AE3A 4A79A 4YSYA 5C2TA 5KWFA 5U63A 1ZOYA 1L0VA 1CJ3A 4BJZA 4CNKA 3EF6A 3FMWA 1PS9A 4H4VA 1Y56B 4U8IA 1ZK7A 1GRAA 2CDUA 4B65A 1NG3A 4EM4A 2XVIA 2Z5XA 4U2SA 5C3JA 3CPJG 1N1PA 3RHAA 2C70A 1NAAA 4I58A 5BULA 1COYA 4OCGA 3AE8A 5GRTA 1D5TA 3DK9A 3GSIA 1ZP0A 4J57A 5EOWA 2RABA 2X50A 3GRSA 4JNAA 1S2YA 3LZXA 2C67A 4HB9A 4J34A 3UOZA 3HZLA 2YQUA 4H4WA 4JDRA 2APGA 3GDPA 2YVGA 2C3CA 2YG6A 3CN8A 3LXDA 4AOSA 2OAMA 3DJEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W4IA 3GYKA 4RSLA 5HR1A 4YQVA 4F0BA 2K9FA 2PYXA 4TXOA 1TRWA 4EIPA 2H1AA 2XLRA 3RHCA 2BA9A 2FJDA 3P1WA 2R6KA 4MDCA 1H7WA 1H4OA 3APSA 3IC4A 4LMWA 5C04A 2AAQA 2BXRA 2BCGG 3VWVA 4HDEA 1BG5A 1MO9A 3P4PA 3FRCA 3C1RA 2EIOA 3AEBA 4RI6A 3F6FA 4MF7A 2H71A 3K7QX 2GQLA 1GEUA 3CNPA 1FG4A 1XVWA 2WPCA 4POMA 4Y4NA 5J7XA 3NK2X 1GL8A 3QCPA 1LJ1A 3GRTA 2YJ7A 2O7KA 2LRNA 1RSGA 1B9XC 3TKRA 5IMVA 1WJKA 3MYDA 1SL2B 3G7JA 4O7HA 3NIVA 3D4TA 4HU7A 4Y4MA 1MTCA 3NIXA 4XIHA 2V5ZA 5CRHA 2MMAA 4CY6A 1OAZA 2OBKA 1RYIA 4B66A 4YH2A 3VR9A 4M52A 3NGCX 1NENA 4BVYB 4I97A 4E8HA 4ILFA 4MJEA 3D4MA 2BCPA 1CJCA 4IN0A 2DSAA 4FK1C 3HKRA 2B7RA 1U3AA 3D1CA 1JRZA 2XLUA 3AYLA 3TKSE 3UIWA 3L0HA 3DK8A 4L5LA 2GR0A 4H4ZA 1FEBA 2CQ9A 2MMNA 3E3EA 2B3SA 2V3BA 4PX1A 2B7SA 3GD4A 1OE7A 3CSJA 3E1TA 3IC8A 2C3DA 2DJ0A 2OE0A 3ABVA 2KOKA 3M9JA 1B48A 4KE3A 3KCMA 4YTMA 4PAAA 1H75A 1TJDA 2VL9A 5CQFA 4EL1A 3LG6A 3QJ4A 5ECLB 5GAPD 4WBJA 2CX3A 1KSSA 4U8PA 5IQYA 1UA5A 4EF0A 4II3A 4X9MA 3VI5A 1M3JA 4U8JA 2R37A 1XIYA 2OLOA 5DCGA 3WGTA 1SK2A 5KN3A 4YT0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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