4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

4FK1A 1IUXA 4Z2RA 3NYCA 3DA1A 3ADAB 1K4QA 2TMDA 1N1PA 2GQWA 2X50A 4OVIA 4YSHA 4CCRA 1O95A 2NVKX 3GDNA 3QSSA 4GRTA 2XVEA 4USQA 4EMIA 4NEWA 3O0HA 1CJ2A 2BYBA 1GEUA 1GTEA 2C3DA 4ICYA 3QFBA 1F3PA 4ZCCA 1F8RA 1IUVA 2GRTA 1QLBA 3PVCA 1CJ4A 3F8PA 4YWOA 2ZZCA 3GMCA 5U25A 3CGBA 1AOGA 3AE9A 4X9NA 2JB2A 1PBFA 3UKFA 4CBQA 3L1RA 5GRTA 3DH9A 3V76A 5KXJA 2WPCA 2QA1A 2VVLG 4IA6A 2WU2A 3KA7A 4H2RA 4J57A 3R9UA 4YT0A 3FBSA 3AEAA 2DKHA 1F8SA 2WQYA 4TM3A 4AT0A 3GYIA 4X4JA 1E1LA 1PXCA 1VG9A 3AEDA 4B67A 2XDOA 5M0ZA 1ZKQA 3ALLA 2YLSA 5BULA 2BS2A 1P2EA 2RGJA 1W4XA 2BK4A 1FL2A 3F8DA 2IIDA 2PYXA 3H4KA 4FDCB 4YKFA 3UOZA 1LPFA 1E39A 2XFOA 2CDUA 5TR3A 1GRHA 2XFPA 1PBCA 3AXBA 3KPFA 3UKLA 2XVHA 1MO9A 1TDKA 2B9WA 1ZY8A 4JNQA 4GDEA 2WEUA 3LXDA 2B9YA 2FJEA 4USRA 1CC6A 5JCKA 2Q7VA 1PHHA 1Q1WA 4PAAA 2X8CA 3B3RA 1FEBA 3AYLA 2DKIA 3LZWA 3UOVA 4DNAA 3IF9A 3CN8A 3Q9TA 1REOA 4XXGA 2YLZA 3HZLA 4H2QA 1OJDA 3NH3X 1ELIA 4K7ZA 4NTDA 4EM3A 1O5WA 4U8KA 1QO8A 4H2PA 4H4UA 4NTEA 4FX9A 4IVOB 4Y4MA 3CIRA 5C3JA 2C76A 1BZLA 3UTEA 4REKA 4U8LA 4H7UA 4B64A 3ISHA 2YVGA 4HA6A 2JB3A 1NG4A 2BC1A 3GRSA 1F8WA 4CNJA 3G5RA 1YQZA 1ZMDA 3ALMA 2XYOA 2A8XA 5EB4A 1H7WA 2WBAA 1CHUA 3AE8A 4H50A 4A9WA 3P9UA 1RP0A 3ICSA 1DOCA 3M13A 4OCGA 3KKJA 2WP5A 2XFUA 3I3LA 3UP4A 1CF3A 4XWZA 1BGNA 4EIQA 3GMBA 4C5OA 4BJZA 4X9MA 1M64A 3SM8A 1FOHA 3V3OA 4JN9A 3GWDA 3II4A 1ONFA 1MXTA 1D5TA 2IVEA 3BHFA 2QCUA 4B69A 4EMJA 2B9XA 4UP3A 5KWFA 4ZCDA 2ZZ0A 3FG2P 5CQFA 2VVMA 2E5VA 2V6OA 1JRYA 1PBDA 4U8PA 3ALJA 3S5WA 4BURA 3LJPA 1D7YA 1M6IA 1NHRA 1HYUA 5KVHA 4NEVA 3T37A 3NNEA 5FS6A 2X8GA 1B37A 2GEWA 3ABVA 3BI5A 2B7SA 2GAHB 3NHOX 3NGCX 5GSNA 3RP8A 2E1MA 5KVIA 1OJCA 4JDRA 1GRTA 3UCLA 4B68A 1P2HA 3AB1A 2R46A 3QVRA 1H6VA 2BACA 2XLPA 3GYJA 4YTNA 5KOXA 1X31B 4GF7A 2X3NA 2FBWA 2R0PA 2VQ7A 2BCGG 4I59A 3EAOA 4H4QA 4B63A 1E1KA 1H86A 2Z5YA 4J31A 2QA2A 2GB0A 4J56A 1LTXR 1GPEA 5EOWA 3CNSA 1ZMCA 4PABA 4RSLA 3RNMA 3VR8A 1NEKA 4CRTA 2WESA 4BK1A 4H4TA 2YG7A 2Y6RA 4Z24A 3EANA 2PHHA 1FECA 1OJTA 1TRBA 1XPQA 2E4GA 5IPYA 3QFAA 1Y56B 2OALA 4Z43A 3FPZA 1PBEA 1TDOA 5KRQA 5L46A 1JOAA 2R0GA 5CKUA 3DJEA 2WP6A 3FMWA 3DJGX 5JCNA 2YR6A 3E1TA 4YTMA 1VDCA 3VRBA 1DOBA 3UTFA 4AT2A 1Q1RA 5J7XA 4LA1A 4BV6A 2C64A 4K8DA 1PN0A 1IUWA 3AD9B 1E6EA 4H4RA 3AE7A 1Y56A 4J34A 4C77A 1N4UA 2WDQA 1YKJA 1JU2A 1BWCA 1VG0A 1N4WA 1PXAA 5ER0A 2C70A 3NK0X 4J36A 4UDRA 1GALA 4LIIA 2OLOA 1D4EA 3K7QX 4HB9A 4KX6A 4BK2A 4MJWA 2Q0KA 1DNCA 3VQRA 1CC4A 2OLNA 5HXIA 3CPIG 4H4SA 2WPEA 1S2QA 4RG3A 4U2LA 4GUVA 4TLZA 3UKQA 1Q9IA 3ZDNA 3BHKA 5JCIA 3H8LA 3P4PA 3ITJA 2V3AA 4UDPA 2GVCA 4OPIA 2GV8A 4EQXA 1ZOYA 2GQFA 3AE2A 3QVPA 1EL9A 4CY6A 1DOEA 5HHFA 3IHGA 2Q0LA 3QSMA 5M10A 2TPRA 3PS9A 1H7XA 3CGCA 3P4QA 2RABA 4Y4LA 4H4XA 2AR8A 4N9XA 1EL5A 1L0VA 3AWIA 2BK5A 1GESA 1DJQA 1O94A 2BS3A 1CJCA 2ZZBA 3ICRA 1DJNA 3UTGA 1BKWA 2WDVA 4H4WA 2YQUA 1NPXA 2YVJA 1JRZA 3BI4A 4A7AA 2B76A 2I0ZA 2UZZA 4IV9A 5EB5A 2BS4A 3NN6X 4U8NA 5C2TA 3BNMA 1SEZA 2V5ZA 1D4CA 1E1NA 1QJDA 1FEAA 2XLSA 1F6MA 1PXBA 2JK6A 4C74A 4DSGA 5KOWA 3SFEA 2EQ8A 2GMHA 4OPTA 4CY8A 1CC2A 1KSSA 2QAEA 2YWLA 2BABA 2BK3A 3C96A 3NT6A 1IUTA 2XVIA 5HY5A 3GRTA 3NKSA 3UKAA 4AP3A 3CGDA 1XHCA 5U63A 3SGLA 3BI2A 2BA9A 3FIMB 4EQSA 3GDPA 3LADA 2XVJA 1H83A 1L9DA 3JSKA 4FK1C 3UKKA 3UTHA 4OPDA 2VZ2A 2NPXA 1VQWA 4WX1A 4JQ9A 3AE5A 3AEFA 2JKCA 2YR4A 4Z2UA 3GSIA 2WDRA 4H4VA 3SFDA 3K7TA 1PJ6A 1NDAA 3AE3A 2GR0A 2BXSA 4AOSA 2CFYA 4NTCA 4IVMB 3AEGA 4YSZA 1GSNA 2XCGA 2XVFA 3CNTA 3NIXA 3IWAA 2BXRA 2YVFA 4NZHA 4XWRA 4K5SA 3KVEA 3NYEA 5FS7A 3NK2X 4LU6A 2WOVA 3AD7B 2C3CA 2YLWA 3CGEA 3CNDA 4O5QA 1K0IA 2R9ZA 1DXLA 3P4SA 1PS9A 4JNAA 2YM1A 1H84A 3M0OA 1COYA 2WPFA 1KNPA 4U8IA 5LV9A 3H8IA 2YG6A 5FMHA 2WHDA 2OA1A 2YG5A 3AYIA 2XLUA 4Z2TA 3LZXA 3IC9A 2R0CA 1TDNA 3KU9A 2ARDA 1OJAA 1E7PA 2CVJA 3CTYA 2IVDA 4AP1A 3DK8A 1GOSA 4IA5A 5IQ4A 1YQ3A 2C75A 4OPGA 3V3NA 4EQWA 4H2NA 1TDFA 2X99A 3C4AA 4ZN0A 1RYIA 4O5UA 3KD9A 4OPLA 1NHPA 5BRTA 4A79A 2GMJA 1D4DA 2GR1A 3F8RA 1S3EA 2EQ7A 5FS9A 1ZOVA 1DODA 3RP7A 2ZBWA 1B5QA 1KSUA 4CNKA 3DJDA 3NG7X 4BJYA 1LV0A 3I6DA 3CNPA 1ZK7A 3K30A 3DK4A 4Z25A 4D03A 2GH5A 2YAUA 4P9SA 4H4YA 1TYPA 1LQTA 3G5SA 3CPHG 1PJ7A 4EIPA 2C73A 2XLRA 5IQ1A 4DSHA 1K0JA 4JY3A 3NK1X 5EBKA 1PDHA 3REDA 2Y6QA 1NAAA 3COXA 4RG4A 4WCTA 1L9CA 2WETA 1B8SA 2AQJA 2JBVA 2YG4A 2RGHA 5DBJA 4GCMA 1GRAA 1V59A 2OAMA 2Z5XA 3C4NA 2EQ9A 1L9EA 3ATQA 2V3BA 3NRNA 4UDQA 4M52A 1MOKA 3LB8A 3UOXA 2Q6UA 2WOWA 3GD4A 3OC4A 4A99A 2WS3A 1KF6A 4Z44A 3AECA 4YSXA 1BF3A 1GRFA 2C66A 3DGZA 1GREA 1N4VA 2X8HA 3CNJA 4GDPA 4U2SA 4APNA 2WP9A 2A87A 3AE1A 1H82A 2A89A 2GAGB 3K7MX 2WOIA 3NN0X 1NENA 2EQ6A 3OZ2A 4CCQA 4U2TA 3D8XA 4KPRA 5J60A 1OJ9A 2WU5A 5JCLA 3Q6JA 4EM4A 3RP6A 2YLRA 1CJ3A 2FJBA 5BVAA 2RGOA 1LVLA 3B6DA 3P1WA 2YLXA 4EQRA 1NHSA 4OPCA 4U8JA 4YSYA 1IUSA 4GR1A 4K5RA 4TM0A 2C67A 3NTAA 1KDGA 2VRLA 4E0VA 3DGHA 1B4VA 4U8MA 4Z26A 2J3NA 3M12A 1CBOA 4TLXA 1XANA 1XDIA 4Y4NA 4DGKA 3UKHA 3VR9A 4YKGA 3AEEA 1Y0PA 2C72A 1FCDA 4YXDA 4BK3A 4TM1A 4A6NB 4JY2A 5U1OA 3URHA 2H89A 4I58A 1KNRA 4J33A 3BNUA 3G5QA 5FS8A 2BCPA 4B65A 2V61A 2GR3A 3QSEA 4U8OA 2FJAA 2XFNA 4A65A 1GT8A 2GF3A 2HQMA 3GWFA 1VRQB 1NG3A 1RSGA 1YY5A 2XFQA 1BGJA 1LQUA 1PJ5A 3UOYA 4B66A 4TM4A 1TDEA 1CL0A 1IUUA 1EL8A 2FJDA 1H81A 2APGA 3WE0A 3VRDB 2H88A 2BC0A 3DK9A 3UP5A 2C7GA 2R4JA 4EMWA 4C3YA 1PBBA 3D1CA 4A6NA 3EPTA 4ECHA 1ZX9A 2R4EA 2V60A 3RHAA 1D7LA 3AEBA 1JNRA 1JRXA 2JAEA 3EF6A 3L8KA 2YM2A 1GERA 4H4PA 2VOUA 3QJ4A 1GV4A 3AYJA 2F5ZA 2VQBA 3P4RA 3NYFA 2YLTA 2JB1A 3PO7A 3NLCA 3S61A 4OPUA 1IJHA 5HYMA 3AD8B 3ATRA 3LOVA 1TYTA 3GD3A 4B1BA 3DJJA 2C65A 3SQPA 3NTDA 4J2WA 1JEHA 4YTPA 3AE6A 4K2XA 3DMEA 3ZYXA 5BUKA 1S2YA 1GRGA 2R45A 1ZP0A 2CULA 1NHQA 4H4ZA 5JCMA 4A5LA 1ZDLA 2ACZA 3ICTA 3UKPA 4ADWA 1LJ1A 1GTHA 3CPJG 2VVLA 2XLTA 2GR2A 1GETA 3VRAA 3AE4A 1GXFA 1UKVG 1KFYA 1S3BA 1EBDA 2W0HA 1E1MA 4K22A 3IHMA 1Z6LA 4D04A 2O9ZA 1GRBA 2YG3A 1K0LA 2AAQA 3KLJA 4C3XA 2B7RA 4AOXA 2YR5A 1YQ4A 2VRMA 1EL7A 1JNZA 1GNDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1YQ1A 4FK1A 3SBCA 3DA1A 2GZZA 1K4QA 2TMDA 1C0IA 3D21A 4MLYA 4OVIA 5G30A 4NEWA 1XWGA 2JADA 1GTEA 2H8LA 2LV3A 3H93A 5ECOB 3FZAA 2M72A 2LSTA 1GUMA 3PINA 1IUVA 3HA9A 4OCFA 1SD9A 3PVCA 5ECIB 4YWOA 4TKYA 3AE9A 2JB2A 2F9SA 1PBFA 3UKFA 4CBQA 4HS1A 4MH2A 3V76A 1YEXA 5IO0A 5KXJA 1U3AA 2QA1A 4EC0A 3FZ9A 4G2EA 3KA7A 3FBSA 3AEAA 1MD4A 4TM3A 3F63A 3UARA 3GYIA 4X4JA 1E1LA 3IAS2 1JZWA 3KD0A 2V1MA 5M0ZA 3GL3A 1NM3A 4QFCA 2FA4A 2XC2A 5H5SA 4G6HA 1R5AA 4JZQA 4G73A 2IIDA 1X0RA 5HFIA 3UOZA 5ECNB 1LPFA 4HZ4A 5KMPA 4L5OA 3KPFA 2H74A 3EU4A 1MO9A 1TDKA 4IKHA 2MMZA 3IV4A 1VF2A 3ISOA 4ZILA 4USRA 1SENA 1WJKA 2K6VA 11GSA 2Q7VA 2PN8A 3ZFLA 2G2QA 2X8CA 3AYLA 2DKIA 1EGRA 4YAVA 4MF5A 4NTDA 5FT3A 1O5WA 1JHBA 4NTEA 4Y4MA 5HR1A 4FX9A 3TJGA 1WP0A 3UTEA 1ERVA 4REKA 1RK4A 1YKCA 4XS4A 2JB3A 3BCIA 4MK3A 3VFIA 2HI7A 3ALMA 3FKFA 2XYOA 2JZTA 2MZCA 5JWRB 2A8XA 3AE8A 1CHUA 2NDOA 3P9UA 2VM2A 3ICSA 1U87A 2E4AA 3M8NA 3FHKA 1GSDA 4EIQA 2P5RA 1A2MA 2PU9C 4C5OA 4ILFA 5DAKB 1USBA 4JN9A 2VL9A 3GWDA 1MXTA 3RPPA 3KH7A 4B69A 1A2JA 3GKMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4EIQA

Total Genus

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