4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

1H6VA 4ADWA 3DH9A 3AD7B 4B67A 3NN0X 2Q7VA 4BK1A 4CRTA 2QAEA 3UP5A 2APGA 1Q9IA 4BK3A 1K0LA 2FJBA 1H7WA 4C74A 1H81A 1LPFA 1H83A 1S2QA 4YTPA 1VRQB 2WPFA 4Z43A 1EL7A 2BA9A 3KVEA 2Y6RA 2OALA 3VQRA 2B76A 4JNAA 4ICYA 2QA1A 1FOHA 3ATQA 2FJAA 2GAHB 3UKPA 2BK4A 3BI5A 5IQ1A 1TDFA 4RG3A 5FS6A 4K2XA 1D5TA 1DOBA 1PJ7A 1Z6LA 2BXSA 2YLRA 1GEUA 1XDIA 3AEEA 3LZXA 3KA7A 2R0PA 2XVIA 2YG6A 4IV9A 3CNTA 3QFBA 3OC4A 4H4QA 4TM0A 2YR4A 2WDRA 2YQUA 1ZX9A 1BGJA 2ZZ0A 4USQA 2X50A 4TM1A 3VR9A 2Q6UA 4U2LA 1M64A 1N4WA 1E1LA 1PBEA 1P2EA 2XFUA 2JAEA 3NHOX 1F3PA 3P9UA 4GCMA 5C2TA 3AWIA 4IA6A 1IUWA 3BNUA 1NDAA 4LU6A 1TDNA 4FDCB 4OPUA 3BHFA 4U8PA 2FBWA 3RHAA 3CNPA 4H4UA 3DJJA 4JY3A 3PO7A 1L9EA 4EQWA 4ZCCA 2V3AA 2GB0A 2FJEA 1ZMDA 1EL8A 3LXDA 2BCGG 2JBVA 3QSSA 4H4XA 5CQFA 4U8JA 2WQYA 1GRAA 1ONFA 2I0ZA 4EQSA 1D7LA 3UKQA 3UP4A 3GSIA 4ZN0A 4BK2A 3NYCA 3GDPA 3IC9A 3NRNA 3ICRA 1E1KA 2C3DA 2VRLA 3NK1X 3DJGX 4UDRA 3ITJA 4USRA 3ALMA 2IIDA 5JCKA 1IUSA 3B3RA 4H2NA 1GRBA 2XLSA 5FS8A 2YG7A 1GRFA 2EQ6A 1GXFA 2VVLA 4B66A 4A6NA 2XVFA 2IVDA 5IQ4A 2QA2A 2AAQA 1DNCA 2C3CA 1VG0A 5BULA 1BWCA 2XLTA 1L9CA 1PXCA 1CJ3A 3UOXA 1PHHA 1IUXA 5GSNA 1FEAA 4U2SA 1SEZA 3NG7X 4CY6A 1GTEA 1CC6A 2JK6A 4TLZA 3RP6A 3DJEA 1JRXA 2C7GA 1FEBA 2C64A 2JB2A 4H4VA 2TMDA 2WPCA 3AYIA 4CBQA 1EL5A 2DKIA 3UTFA 4REKA 4M52A 4DSHA 3CNSA 3H4KA 1TDOA 1PJ6A 2YVFA 3Q6JA 3AE4A 4H4TA 3AB1A 1E6EA 3PVCA 2X8CA 3VRDB 1GPEA 2R0GA 4JN9A 4U8LA 1NPXA 2ACZA 4J36A 2GR3A 2BACA 3ISHA 3T37A 3AYLA 5HXIA 3P4SA 5U1OA 4HB9A 4ECHA 1O94A 4GDPA 3M0OA 3K7QX 3FIMB 1COYA 5EB4A 2AQJA 3CN8A 4JNQA 4U8IA 4UDQA 1E1MA 1YQ4A 1MXTA 1CBOA 1DOCA 3GD3A 2R46A 2OA1A 3L1RA 1VQWA 4Y4MA 3CGDA 4NZHA 2YWLA 5C3JA 4LA1A 2C67A 1KDGA 3P4PA 2QCUA 2WOIA 2GV8A 3ZDNA 1H86A 4K8DA 1NHRA 3UKFA 4A5LA 1LQUA 4X4JA 4A7AA 3UOYA 4NTEA 5BUKA 1NG3A 5LV9A 5KOXA 3KPFA 4H50A 1Q1RA 5EOWA 1L0VA 2B7SA 1L9DA 1RSGA 2YM2A 3AEGA 3K7TA 5U25A 1KNRA 4EM3A 3CPJG 1B4VA 1M6IA 1OJAA 3G5SA 5KVHA 4OPLA 5JCNA 1LQTA 4XWZA 3AE5A 1CJ4A 1KF6A 4C5OA 1GOSA 2WU2A 3CGEA 4OCGA 1GREA 1Y0PA 3UTHA 4YTMA 3AEFA 1FECA 4YKFA 1YQ3A 4EIPA 2WBAA 3QJ4A 1D7YA 2BS2A 3D1CA 3G5RA 3NIXA 3ABVA 3CIRA 1BKWA 4XWRA 4AT2A 1N4VA 4UP3A 4EM4A 1B5QA 2YLSA 3UKKA 2PYXA 2WETA 5HYMA 2YLWA 1DJNA 5FS9A 4K7ZA 4B69A 4C3XA 3OZ2A 4H4SA 1IJHA 2BS3A 3BI4A 4PAAA 2C66A 3LOVA 1KFYA 4U8MA 3R9UA 3GD4A 4U8OA 1FCDA 1F8RA 4X9NA 4Y4LA 4CNJA 2B7RA 1H82A 2WDQA 4H4RA 5FS7A 3UKHA 4O5UA 1V59A 2Y6QA 4EMIA 1TDKA 4E0VA 3ALJA 3LJPA 4H7UA 2WS3A 3CGCA 2YG4A 3EPTA 1O5WA 1XHCA 1EBDA 1S3BA 3SFEA 4RSLA 2YM1A 4YXDA 3QFAA 1Y56B 2H88A 4DGKA 2XYOA 2YVGA 4H4YA 3CNDA 3NNEA 4N9XA 4BJYA 2RGHA 1B37A 2WU5A 1GESA 3BNMA 3UOZA 4CCRA 1MOKA 3NN6X 1KNPA 1BF3A 1VG9A 1E7PA 1NENA 2B9WA 1QJDA 2OAMA 4K5RA 1OJ9A 2EQ9A 3H8IA 2ZZBA 4H4WA 1H84A 1YKJA 3AYJA 5FMHA 4AT0A 3UTEA 4DNAA 2DKHA 1QLBA 2BCPA 1GRTA 4NEVA 2ARDA 5ER0A 1DOEA 1RP0A 5CKUA 5J7XA 2OLNA 3DMEA 4NTDA 1LVLA 1PBDA 2YR5A 1ZOVA 3DGZA 1CC2A 5HHFA 4OPTA 1O95A 4AOXA 2GR2A 1PJ5A 4ZCDA 3H8LA 1DJQA 3AE1A 5KVIA 1TYTA 3AECA 1K0IA 2RABA 2WHDA 2C75A 4J31A 2YLZA 3IHMA 3L8KA 4IA5A 2HQMA 2WEUA 2YLTA 2Z5YA 3UKLA 4YSYA 4PABA 2GR0A 1YY5A 4K22A 4U2TA 2R45A 4OPDA 5JCIA 2BABA 3AEBA 2VRMA 3LZWA 3M13A 3M12A 1QO8A 4JY2A 2CFYA 3C4NA 1ZY8A 2CVJA 1P2HA 3CGBA 4BJZA 4MJWA 4O5QA 4YSZA 5KWFA 3P4QA 2E4GA 2VQBA 3GRTA 2NPXA 1JOAA 4NEWA 2W0HA 4YT0A 3GDNA 4EMWA 1F8SA 1FL2A 1TDEA 2V61A 4A9WA 4GDEA 3V3OA 1D4EA 2GF3A 2V6OA 2WOWA 2VZ2A 3II4A 4CY8A 4B65A 4H2QA 3IF9A 2FJDA 4EMJA 2VVLG 1NHPA 3C96A 3S61A 1CJ2A 4EQXA 2X8GA 1GALA 2E5VA 4BURA 4YSXA 2IVEA 4IVOB 3F8DA 4Z24A 2X99A 3ADAB 1LTXR 1REOA 3VR8A 5KRQA 2AR8A 1Y56A 4OPCA 1PDHA 2VVMA 4A79A 4Z2UA 1ZKQA 4OPIA 2XCGA 1KSSA 3AE6A 1IUTA 1CJCA 1ZOYA 3LADA 4APNA 3V76A 2F5ZA 1GERA 2GMJA 4EQRA 5M10A 1GRHA 2A87A 3COXA 1JRYA 2CDUA 2H89A 1EL9A 4J57A 4GF7A 2XVEA 3AE8A 1Q1WA 2R4JA 1TRBA 4P9SA 3G5QA 4X9MA 2ZBWA 4Y4NA 3SGLA 1GRGA 3JSKA 3REDA 1GT8A 2CULA 4EIQA 2GEWA 4NTCA 4TM3A 4J56A 1LJ1A 2Q0LA 4Z44A 5IPYA 5JCLA 2XFNA 2BK5A 1CL0A 2YLXA 4A6NB 2R9ZA 3DK9A 1UKVG 2XLPA 2WDVA 1DODA 2XFPA 1K0JA 2YG5A 3AXBA 3NK2X 5J60A 1VDCA 2B9YA 3GYJA 3QSEA 1GTHA 3ICTA 4RG4A 1W4XA 3NTDA 2JKCA 2GH5A 3P4RA 4YKGA 4AOSA 1CC4A 3NT6A 2YAUA 1PBCA 3SFDA 1E1NA 5EB5A 4BV6A 2BC0A 1F6MA 2VQ7A 1K4QA 3DK8A 2GMHA 2V60A 1LV0A 4GUVA 3BI2A 4LIIA 4YTNA 3O0HA 4Z25A 1ELIA 1ZP0A 2Z5XA 2C73A 3LB8A 3UKAA 3V3NA 4Z2TA 3BHKA 3CNJA 3GWDA 3K30A 3AEDA 2R0CA 4C77A 3ICSA 4XXGA 2XFQA 1NAAA 3GMCA 4KX6A 3RP7A 1JEHA 2WP6A 3NK0X 2V3BA 3KD9A 4A65A 1KSUA 1D4DA 1XPQA 1BGNA 1RYIA 1PXAA 2GQFA 5EBKA 5L46A 3QVRA 2RGOA 3GWFA 1IUVA 1TYPA 4J33A 1NHQA 1S3EA 3FPZA 2XVHA 3F8PA 2C70A 1GSNA 4A99A 3EAOA 4J34A 4H2RA 1CHUA 1S2YA 4JDRA 2GRTA 4D03A 4TM4A 5KOWA 4GR1A 1PXBA 3KKJA 1OJTA 5U63A 4JQ9A 1E39A 2X3NA 3NTAA 4C3YA 2JB3A 3NYEA 3WE0A 2ZZCA 3ZYXA 4H4PA 3EANA 3NGCX 4DSGA 3DGHA 1JU2A 4WCTA 2EQ7A 2EQ8A 1B8SA 3CTYA 4OVIA 3K7MX 2B9XA 4B64A 3DK4A 1DXLA 1CF3A 4CNKA 3P1WA 2O9ZA 1PBBA 2GQWA 3VRBA 1JNRA 4YWOA 1PBFA 2YVJA 3KLJA 4OPGA 5HY5A 3VRAA 2OLOA 2YG3A 1NHSA 2Q0KA 1XANA 3NLCA 1ZMCA 4I58A 3ALLA 4TLXA 1JNZA 3PS9A 4U8NA 2GVCA 2PHHA 4FK1A 2XLRA 2GR1A 3AE3A 3GMBA 2XDOA 4KPRA 1H7XA 3GRSA 3CPIG 4I59A 2VOUA 1IUUA 3IHGA 4FX9A 3C4AA 5DBJA 3D8XA 3DA1A 1GV4A 3I3LA 3GYIA 3AD8B 4Z26A 1NG4A 3QSMA 3S5WA 1OJCA 1JRZA 3NKSA 2R4EA 2WP5A 1YQZA 4J2WA 1HYUA 1N1PA 3DJDA 1D4CA 2GAGB 4H2PA 4D04A 2BYBA 2BK3A 3SQPA 4B68A 2XVJA 3UOVA 1BZLA 4CCQA 4B63A 2C72A 1OJDA 3AEAA 2JB1A 2WP9A 4B1BA 3QVPA 1AOGA 1F8WA 1GNDA 3FBSA 3ATRA 3NYFA 4AP1A 2BC1A 3FG2P 2RGJA 1N4UA 2WOVA 3IWAA 4K5SA 1PN0A 4IVMB 1ZDLA 3UCLA 2C76A 2BS4A 2WESA 3SM8A 2X8HA 2A89A 2BXRA 3Q9TA 4YSHA 3FMWA 5M0ZA 2XFOA 4UDPA 4U8KA 3URHA 1GETA 2C65A 2WPEA 2A8XA 2UZZA 2YR6A 3E1TA 4FK1C 1PS9A 2E1MA 4GRTA 5BRTA 3B6DA 3EF6A 3AE7A 1MO9A 5GRTA 2J3NA 1X31B 4H4ZA 3RP8A 1NEKA 3CPHG 3HZLA 3NH3X 5JCMA 5BVAA 1ZK7A 3UTGA 5TR3A 2XLUA 4WX1A 3I6DA 4Z2RA 3AE9A 5KXJA 2V5ZA 3RNMA 2NVKX 3KU9A 3F8RA 4AP3A 3AE2A 2TPRA 4HA6A 3AD9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3DH9A 4B67A 4V1Ag 2AB6A 2H75A 1TRSA 4XRDA 3EC3A 4BK3A 1K0LA 4C74A 4HQZA 4IW9A 1EL7A 4HSCX 2LEGA 3AY8A 2N5BA 4K0GA 2Y6RA 2B76A 4JNAA 4ICYA 4IELA 2FJAA 2BK4A 1DOBA 1D5TA 2AHEA 4XHMA 2R5GA 3TCOA 5B6NA 2YLRA 3KA7A 2V41A 3KCMA 1PMTA 3CNTA 2JZSA 4PX1A 2WDRA 4PNFA 1BGJA 4USQA 5AGYA 2N5AA 3VR9A 4OFNA 1PBEA 2B6MA 1E1LA 1K0AA 5C2TA 2HRKA 4GF0A 4LU6A 3DXBA 2FUG2 3DYRA 1TDNA 4FDCB 1PA3A 3CNPA 4JZQA 3DJJA 1FG4A 2R2JA 4ZCCA 5B8BA 2V3AA 1B48A 3QMXA 2VCQA 4KDUA 3W8SA 2K8SA 2BCGG 5CQFA 4HJ2A 2WQYA 1SK0A 1DE1A 4EQSA 3IRAA 3UKQA 4AGSA 4HDEA 2L4QA 3IC9A 3NRNA 3D22A 3T2YA 3HZ8A 1E1KA 2C3DA 3IV4A 5JCUA 3ALMA 1NM3A 4H2NA 2MBSA 4FYBA 5FS8A 1V57A 1XWAA 3MNGA 1GULA 2V1MA 5IQ4A 4WF5A 1MEKA 2HRAA 2XLTA 1PHHA 1IUXA 3FR9A 3TDGA 2JK6A 1ZZYA 3DJEA 3KXOA 2FWFA 4QL9A 4V2MA 2C7GA 4MLYA 2DKIA 2L5OA 2VO4A 3UTFA 5DQSA 2E2MA 2PBJA 16GSA 3Q74A 3AB1A 3APOA 3F4SA 3VRDB 4JN9A 4U8LA 1NPXA 3T37A 1T7PB 3ISHA 3KP8A 2A4HA 1XCCA 4NHZA 3IK9A 3AYLA 3QD9A 3P4SA 4V2LA 1SL2B 1O94A 4GDPA 3FIMB 1FB6A 2LNSA 1MXTA 3GD3A 1TK8B 2P31A 3QAGA 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2OBKA 1V2AA 4HS1A 4GDEA 4O5RA 3ZNPA 4TVEA 4GSNA 3ZIVA 3ZVJD 1X9SB 2WOWA 4XS4A 4H2QA 2OE1A 1N8JA 3C96A 3S61A 4MPGA 2NPBA 1XVWA 4EQXA 1Z7RA 3L9VA 4BURA 4YSXA 2IVEA 4USSA 3F8DA 4FH8A 4JBBA 3ADAB 3VR8A 4KAEA 1Y56A 3GUSA 4OMVA 1PDHA 2VVMA 5J9BA 3LYPA 2H71A 1TI3A 1AC1A 1ZKQA 5HFIA 4NV2A 4N30A 1CJCA 4L5OA 1GRXA 1ZOYA 3LADA 2GMJA 3V76A 3M8NA 2HSMA 2H89A 3D4TA 1TRBA 2FWHA 2MMAA 4P9SA 1SL0B 3TRXA 5DCGA 3W4IA 2ZBWA 2X49A 3H79A 2IN3A 4X43A 3VWXA 1GT8A 5GZZB 4NTCA 1M3JA 4ML1A 1LJ1A 6GSXA 4KF9A 3BCIA 4L0WA 4GCIA 5IPYA 5JCLA 2XFNA 2BK5A 2H6YA 2PVQA 3T14A 1GSSA 1WMJA 1DUGA 3DK9A 3F63A 1X5CA 2FA4A 5ECPB 4I5QA 2XFPA 3O6TA 3IE3A 4QL7A 3AXBA 5J60A 1VDCA 2O8VB 3H93A 1ZYEA 2AUVA 3P4RA 3V1WA 5EVOA 4RI6A 3R2QA 1PGTA 2BC0A 5EPFA 3ZNNA 3A3TA 4Q5RA 4ZL7A 1LV0A 5BVAA 3BI2A 3IBHA 1Z6NA 4JU5A 1AN9A 3UKAA 3V3NA 4C77A 2R0CA 3ICSA 4O32A 2XFQA 5AIXA 3CRTA 1NAAA 1EGRA 4KX6A 1T3BA 3KM6A 1KSUA 5GAND 1EP7A 1D4DA 1RYIA 5L46A 1MDJA 3QVRA 2RGOA 3NIVA 3GWFA 1IUVA 1TYPA 1BEDA 4GXZA 3CTFA 3U5RE 4ECIA 3FPZA 3QOUA 1ILOA 5KMRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3DH9 A;  4B67 A;  4V1A g;  2AB6 A;  2H75 A;  1TRS A;  4XRD A;  3EC3 A;  4BK3 A;  1K0L A;  4C74 A;  4HQZ A;  4IW9 A;  1EL7 A;  2LEG A;  3AY8 A;  2N5B A;  4K0G A;  2Y6R A;  2B76 A;  4JNA A;  4ICY A;  4IEL A;  2FJA A;  2BK4 A;  1DOB A;  1D5T A;  2AHE A;  4XHM A;  2R5G A;  3TCO A;  5B6N A;  2YLR A;  3KA7 A;  2V41 A;  3KCM A;  1PMT A;  3CNT A;  2JZS A;  4PX1 A;  2WDR A;  4PNF A;  1BGJ A;  4USQ A;  5AGY A;  2N5A A;  3VR9 A;  4OFN A;  1PBE A;  2B6M A;  1E1L A;  1K0A A;  5C2T A;  2HRK A;  4GF0 A;  4LU6 A;  3DXB A;  2FUG 2;  3DYR A;  1TDN A;  4FDC B;  1PA3 A;  3CNP A;  4JZQ A;  3DJJ A;  1FG4 A;  2R2J A;  4ZCC A;  5B8B A;  2V3A A;  1B48 A;  3QMX A;  2VCQ A;  4KDU A;  3W8S A;  2K8S A;  2BCG G;  5CQF A;  4HJ2 A;  2WQY A;  1SK0 A;  1DE1 A;  4EQS A;  3IRA A;  3UKQ A;  4AGS A;  4HDE A;  2L4Q A;  3IC9 A;  3NRN A;  3D22 A;  3T2Y A;  3HZ8 A;  1E1K A;  2C3D A;  3IV4 A;  5JCU A;  3ALM A;  1NM3 A;  4H2N A;  2MBS A;  4FYB A;  5FS8 A;  1V57 A;  1XWA A;  3MNG A;  1GUL A;  2V1M A;  5IQ4 A;  4WF5 A;  1MEK A;  2HRA A; 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4EIQA

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