4ICYA

Tracing the evolution of angucyclinone monooxygenases: structural determinants for c-12b hydroxylation and substrate inhibition in pgae
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
491
structure length
462
Chain Sequence
SDAAVIVVGAGPAGMMLAGELRLAGVEVVVLERLVERTGESRGLGFTARTMEVFDQRGILPRFGEVETSTQGHFGGLQFDFGVLEGAWQAAKTVPQSVTETHLEQWATGLGADIRRGHEVLSLTDDGAGVTVEVRGPEGKHTLRAAYLVGCDGGRSSVRKAAGFDFPGTAATMEMYLADIKGVEGITRIIVCERGTPPSWHEVADAWKRLTGDDIAHAEPVWVSAFGNATRQVTEYRRGRVILAGDSAHIHLPAGGQGMNTSIQDAVNLGWKLGAVVNGTATEELLDSYHSERHAVGKRLLMNTQAQGLLFLSGPEVQPLRDVLTELIQYGEVARHLAGMVSGLEITYDVGTGSHPLLGKRMPALELTTATRETSSTELLHTARGVLLDLADNPRLRARAAAWSDRVDIVTAVPGEVSATSGLRDTTAVLIRPDGHVAWAAPGSHHDLPMALERWFGAPLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Streptomyces sp. pga64
molecule keywords Polyketide oxygenase PgaE
total genus 153
structure length 462
sequence length 491
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4icyA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4icyA01
2JK6A 1V59A 3FG2P 4YTMA 5GSNA 1EBDA 1PBCA 4P9SA 2B7RA 2WEUA 1VRQB 1E1KA 4H4SA 2A89A 2YLWA 4PAAA 3ITJA 5TR3A 3UOVA 1KSUA 1PJ7A 2X99A 3E1TA 4M52A 4A9WA 1IUSA 1GNDA 2EQ8A 3G5QA 2Q0LA 2R46A 2X3NA 3NK2X 1GESA 2GH5A 3V76A 4A6NB 4AT2A 2XVEA 3K7QX 3P4PA 5FS8A 2C73A 3AEGA 1CJCA 5IQ1A 4Y4LA 3CNSA 3LZWA 2YR5A 5DBJA 2UZZA 1F3PA 1K4QA 1S3EA 3BI2A 1CJ4A 3JSKA 4U8PA 3GYIA 1DOEA 1HYUA 4H2PA 4GUVA 1ZDLA 3AEBA 1GTEA 3AE5A 5HXIA 4O5UA 4YSXA 4H4VA 2BABA 1MXTA 2EQ9A 3B6DA 1X31B 1GRAA 3CIRA 1IUWA 2WU5A 2OA1A 3O0HA 4J36A 2E1MA 2BCGG 2YVGA 1S3BA 1D5TA 4J57A 4OCGA 1B4VA 3DJEA 3QFAA 1IUTA 1KNPA 4RG4A 1XPQA 4CCRA 1S2QA 3LJPA 4H2QA 5BUKA 4JY3A 4WX1A 1KSSA 3II4A 4CNKA 3RP8A 3AD8B 2YG4A 1GXFA 1TYPA 1BF3A 5EB4A 1CC2A 3S5WA 3AXBA 2BK3A 3DGZA 1H7WA 4Z2TA 4X9MA 3AECA 4JNQA 2DKHA 2FJDA 3UTEA 4U2SA 4K5RA 3P9UA 3G5RA 1EL5A 3P4RA 3QSEA 2IIDA 3H8LA 2R9ZA 4ECHA 5JCIA 2BS2A 1FECA 3DK8A 3OC4A 2GF3A 4H4QA 2V3AA 5J7XA 1FCDA 1LVLA 2GMHA 4U8OA 3AE8A 3SFEA 1H84A 3AE2A 2XVHA 2BXRA 4USQA 1UKVG 4MJWA 1FL2A 3GSIA 2X8HA 3AE9A 2Z5YA 3ICTA 1NG3A 2WP6A 4U8MA 1Y56B 4EMWA 2Q0KA 4GF7A 1S2YA 4H4YA 5M0ZA 3P4QA 4YTPA 3QJ4A 3UP4A 1GETA 3GD3A 2C7GA 4B1BA 2V61A 1ZMCA 3M13A 1PBBA 1DOBA 1OJAA 2FJAA 1KFYA 2VOUA 5CKUA 2QAEA 2FJEA 4AP1A 4YSHA 1H86A 1W4XA 5FMHA 4JDRA 2WHDA 1GERA 1H83A 1Z6LA 4J2WA 3GWFA 1ZP0A 1KNRA 3UCLA 1GRFA 3UKKA 2XLPA 1P2HA 4AOXA 4FK1A 1OJCA 1VDCA 2WQYA 3SQPA 1B5QA 3AEFA 3ALLA 3BI4A 1GSNA 3NIXA 4UDPA 2V6OA 3LADA 4AP3A 2YR4A 3CGBA 3S61A 2R0PA 3FPZA 1M64A 2DKIA 3PS9A 4D04A 2C67A 4YT0A 4E0VA 3NH3X 4X9NA 4CNJA 4OPUA 1RSGA 3IHGA 1QO8A 4J34A 3VR8A 3ATRA 2GQWA 4BJYA 3GMBA 3QSSA 3UOXA 3K7MX 2F5ZA 4PABA 4FDCB 4AT0A 2VRLA 4DNAA 2R4JA 3ZYXA 4X4JA 3C4AA 2OLOA 3NYFA 3RP6A 3G5SA 5KVHA 3D1CA 4B68A 2WS3A 3AE4A 2NVKX 4YXDA 3ICRA 2WOVA 1EL9A 4BK1A 2YM1A 5JCLA 1K0LA 4EIPA 1H6VA 3AE1A 4BV6A 1LJ1A 2TPRA 3CTYA 3GWDA 3CN8A 4HA6A 4J31A 1OJDA 4OPDA 3EAOA 3SGLA 4JQ9A 3UKAA 2VZ2A 2XLSA 2EQ6A 4GR1A 5JCNA 2XYOA 2YAUA 3AD7B 1O94A 2B9YA 4K8DA 1GRHA 2R45A 1JRXA 3AEEA 2XDOA 3CNTA 1N4WA 3K7TA 5BVAA 1EL7A 1PBEA 1TDNA 2B9XA 2OALA 3AYJA 3CNDA 3URHA 2B76A 5IQ4A 1PXCA 3AEDA 3CNPA 1CJ2A 4RG3A 4LIIA 5KOWA 1ZY8A 4LU6A 2PYXA 2XFNA 2QA1A 2FBWA 2JB3A 2YLXA 4H4TA 4A7AA 2X8GA 2YVJA 5L46A 3R9UA 4OPLA 2C70A 4IVMB 2XFUA 1CC4A 3NTDA 5IPYA 1JNZA 3NG7X 2GR0A 1RP0A 4GDPA 3NYEA 4OVIA 3NTAA 4FX9A 3LXDA 2GR2A 3CPHG 1L0VA 4C74A 5HYMA 2A8XA 2C75A 3C96A 3KLJA 2W0HA 1NHSA 3UTHA 3GRSA 2ACZA 1PBDA 5FS6A 3DJDA 5GRTA 2V5ZA 2XVIA 2R0CA 4REKA 4B69A 4ZCDA 3GRTA 3I6DA 3P1WA 1TDOA 4ADWA 2GEWA 3PO7A 4KX6A 3F8RA 2VVMA 1FEAA 1D4DA 3D8XA 3DGHA 3VRDB 2APGA 2GRTA 3NN0X 5J60A 2JBVA 1L9DA 2BS3A 3FBSA 3KA7A 2I0ZA 2ZZCA 1D7LA 4EM3A 4H4WA 4U8LA 3DK9A 1ZOVA 2NPXA 4XWRA 5U25A 2EQ7A 2YG5A 1PHHA 2YLZA 2TMDA 1GRGA 1PXAA 3NLCA 1TYTA 3AB1A 3Q9TA 5JCMA 2IVEA 2C72A 2YG6A 3FIMB 5EB5A 1GV4A 2BK4A 2BYBA 5HHFA 4EQWA 2VRMA 4B66A 1F6MA 3NN6X 3AYLA 4J56A 1D4EA 1KDGA 3EPTA 1YQ3A 4TLZA 3UTGA 1FOHA 5LV9A 1YKJA 3KKJA 4OPCA 1YQ4A 3NHOX 1ONFA 2GB0A 3UTFA 2JAEA 2BA9A 3T37A 3H8IA 4TM3A 2YQUA 3FMWA 3NYCA 4EIQA 1DNCA 1LV0A 3KD9A 2XFPA 1ELIA 3QSMA 1PBFA 2RABA 1PJ6A 2ZZBA 3HZLA 4Z25A 2H89A 3AE6A 4DSGA 4GCMA 2HQMA 4Z2UA 1BZLA 2XFOA 4H4RA 4B67A 1Y0PA 4D03A 1NENA 2GAHB 2YLSA 5KVIA 4U8IA 4IV9A 3AYIA 1DODA 4DSHA 4C3YA 2C3DA 2WOIA 2RGOA 5FS9A 1BWCA 3IWAA 1DJQA 1GPEA 4U2TA 1CL0A 1Q1RA 3RP7A 3UP5A 4UDRA 1N4VA 1BGNA 3PVCA 4H2NA 3KPFA 1OJTA 4BJZA 4H50A 2V60A 3CGEA 3GYJA 4JNAA 4TM4A 2GVCA 3VRBA 4EQXA 4YKGA 1JRYA 3P4SA 3GD4A 1GT8A 2WPCA 4K7ZA 4NTEA 3ICSA 2Z5XA 2R0GA 1NEKA 3B3RA 3BI5A 1XANA 1F8WA 3DH9A 4TM0A 1TRBA 2AQJA 4FK1C 1VG0A 1IUVA 2BC1A 4Z26A 3UKFA 4USRA 1COYA 3BNMA 3LB8A 4NTCA 2PHHA 3M12A 3ADAB 4LA1A 4YSYA 4CY8A 3F8DA 5KXJA 1CBOA 1JNRA 3LOVA 2WESA 3BNUA 4ZCCA 4EQSA 5CQFA 3BHKA 3VQRA 3CGDA 2XLRA 5C3JA 1H7XA 2CULA 3V3NA 4H4PA 2C3CA 4XWZA 4Y4MA 3IF9A 3CPJG 3AE3A 3ALJA 4H4XA 1GREA 2X50A 1B8SA 1F8SA 2BXSA 1AOGA 3NT6A 4C77A 2CFYA 1PXBA 2ZZ0A 3RNMA 4YTNA 2WBAA 3F8PA 4JN9A 3AWIA 3KVEA 2ARDA 1NHRA 1MO9A 2C64A 1TDFA 4UDQA 1KF6A 4DGKA 1JOAA 2XLTA 4ICYA 5KOXA 1JRZA 1ZK7A 2WDRA 2YG7A 3UKQA 4APNA 4BK2A 2JB1A 2YR6A 2YWLA 2VQBA 1D7YA 1P2EA 2YLTA 1GRTA 4Z2RA 1IUUA 5EBKA 4A6NA 4CCQA 1LTXR 4I59A 4A65A 2JKCA 1H82A 1TDEA 1E1MA 2E4GA 1E7PA 3ABVA 3KU9A 1K0IA 4YWOA 1GRBA 2GMJA 3H4KA 4U2LA 4C5OA 4C3XA 3UOZA 1LQTA 1GOSA 1XHCA 2JB2A 3QFBA 1H81A 3IHMA 3COXA 4IA5A 4HB9A 1DJNA 2RGHA 3QVPA 4IA6A 3SM8A 1D4CA 3NGCX 4NEWA 5U1OA 1GALA 1NHQA 2J3NA 1QLBA 2WDVA 4A5LA 3NK1X 3K30A 3I3LA 4U8JA 2C65A 1ZMDA 5BRTA 1N1PA 1PN0A 3IC9A 4I58A 1CJ3A 2H88A 1LQUA 3GDPA 1YQZA 3BHFA 2WOWA 1NAAA 4NTDA 4EM4A 1JEHA 2E5VA 2X8CA 2Q6UA 2XFQA 4CY6A 1PDHA 2GAGB 4B63A 3C4NA 4OPIA 3LZXA 2IVDA 1B37A 2AR8A 2WU2A 3AE7A 2XCGA 1VG9A 3V3OA 1GEUA 2AAQA 4NZHA 4OPTA 2GR3A 2ZBWA 2FJBA 2XLUA 3CPIG 5C2TA 4K5SA 5M10A 4GDEA 2Y6QA 4YSZA 3NK0X 4IVOB 3REDA 3M0OA 4Z43A 3VRAA 2WDQA 4Z44A 2WPEA 1ZOYA 4B64A 5JCKA 3DK4A 3QVRA 1NG4A 2VVLA 3ISHA 2XVFA 1BKWA 4N9XA 1K0JA 1CC6A 2C76A 2GR1A 4WCTA 1O5WA 3L8KA 2B7SA 4EQRA 1Y56A 3UKLA 4H4ZA 1DXLA 2O9ZA 4TM1A 1L9EA 4H7UA 4U8KA 3DJJA 5KWFA 5KRQA 2VVLG 3VR9A 4Z24A 2QA2A 4NEVA 4EMIA 2BCPA 2Y6RA 2YG3A 2CVJA 2WETA 2CDUA 1EL8A 3OZ2A 3CNJA 2R4EA 3EF6A 5HY5A 3UKPA 1RYIA 2V3BA 3EANA 1REOA 2YLRA 5U63A 1L9CA 1QJDA 4H4UA 5ER0A 4H2RA 2BK5A 3NNEA 3CGCA 3AEAA 1BGJA 1M6IA 4KPRA 1E1LA 1Q1WA 3DJGX 1N4UA 3NKSA 4BK3A 1GTHA 2BS4A 1PS9A 1VQWA 4U8NA 4XXGA 2OAMA 2WPFA 1CF3A 3Q6JA 4JY2A 4J33A 1NPXA 1CHUA 3ALMA 4CRTA 2GV8A 4O5QA 4K22A 1LPFA 4A79A 4K2XA 3UOYA 4B65A 3NRNA 1SEZA 1ZKQA 1FEBA 2WP5A 1IJHA 2VQ7A 3RHAA 3GMCA 2YVFA 3GDNA 4A99A 1ZX9A 3AD9B 5FS7A 2OLNA 1DOCA 4Y4NA 1O95A 2WP9A 3WE0A 1E6EA 2A87A 4YKFA 1YY5A 4ZN0A 2XVJA 2C66A 2QCUA 3ZDNA 4TLXA 1F8RA 5EOWA 4OPGA 1IUXA 3UKHA 2BACA 4AOSA 3SFDA 1NDAA 1MOKA 4GRTA 1PJ5A 2GQFA 3ATQA 2Q7VA 4RSLA 1JU2A 4BURA 3L1RA 1E39A 2YM2A 1NHPA 1OJ9A 2BC0A 3DA1A 1Q9IA 1XDIA 4UP3A 2B9WA 2RGJA 1TDKA 4CBQA 4EMJA 3DMEA 5BULA 1E1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BMUA 4BL7A 4YTMA 5GSNA 4P9SA 1XVWA 1ERTA 2ALBA 3G7YA 1A2MA 4BL7B 1TK8B 4M52A 3HJOA 1NHYA 4ML1A 4P3YB 4A6NB 2Q0LA 3NK2X 1GULA 4HJ2A 4NNJA 2XVEA 4K1FA 1ILOA 3CSJA 5FS8A 3LZWA 2HSHA 5DBJA 2L4CA 1K4QA 1S3EA 4GTUA 4F9ZA 3K8NA 5KNLA 3GH6A 3L9UA 1ZDLA 4O5RA 2D2ZA 4O5UA 3O0HA 1A23A 2OA1A 3FZ9A 3LG6A 1T7PB 3ZRDA 2A4VA 1S2QA 4JZQA 3LJPA 4H2QA 3UBLA 4G0IA 4BVYA 2K8SA 2B5YA 2VLTA 1CC2A 1OAZA 5B6MA 2V6KA 2VCVA 4DVCA 4X9MA 1GSYA 1K0BA 4JNQA 5LD0A 2O8VB 5DAKA 2DKHA 5EVOA 1O81A 2YWIA 4K5RA 4N0VA 5FHIA 3P9UA 3P4RA 5JCIA 1FECA 1SL2B 2DJJA 2FUG2 2OACA 5J7XA 4HQZA 1LVLA 3WGDA 5DAKB 2VUPA 5EY6A 4MH3A 1QUWA 4KAEA 4MJWA 1FL2A 2X8HA 1SKRB 1EOGA 1NG3A 4KDYA 4U8MA 4EMWA 2Q0KA 1S2YA 5ECMB 3GD3A 5A4WA 1ZMCA 5IMCA 3ZIJA 1DOBA 1GRXA 2VD1A 2QAEA 4YSHA 1JFUA 4JDRA 2WHDA 1KBNA 4HZ4A 3VURA 3UKKA 2E0QA 1GLPA 1PKZA 4KB3A 4AOXA 2VAFA 4I8BA 4HUAA 3PPUA 3QD9A 2DIYA 3ZTLA 3HYWA 4IVFA 1B5QA 3ALLA 3BI4A 1V9WA 1GL8A 1OE7A 4I2TA 3LADA 2YR4A 1NSWA 1PX6A 2R0PA 3M0FA 4OFTA 4KCAA 3ED3A 2PU9C 4MF5A 1NM3A 3SY4A 4X9NA 2RUFA 2CVKA 4OPUA 2VL3A 3SYIA 1RSGA 2DC5A 5H5SA 3R3EA 5ECQB 3ZZXA 1QO8A 5IMAA 2V41A 4XTSA 3C4AA 2OLOA 1WJKA 1WPIA 2OADA 4LMVA 2BTOT 5AIXA 4HDEA 5INYA 3G5SA 4B68A 4KCEA 3ICRA 1EGRA 2WOVA 2YM1A 1K0LA 1SENA 3AE1A 3NOFA 1LJ1A 2TPRA 4J31A 1ZL9A 1OJDA 3SGLA 1U3AA 2MMAA 4MLYA 4XS6A 3GSTA 5JCNA 3IHQA 3KMNA 2YAUA 1XFLA 2R45A 11GSA 3CXGA 3CTGA 1Z3EA 3P2AA 3LW9A 1PXCA 1CJ2A 3D0ZA 3L78A 2NVLA 4LU6A 2QA1A 4H4TA 2PMTA 2X8GA 5L46A 3IK9A 2J23A 4H86A 2XFUA 1CC4A 3WT1A 1JNZA 4OVIA 3NTAA 3DVWA 2LEGA 1OE8A 5HYMA 4HJMA 2PVOC 3UARA 1AQXA 4BWSA 3GRSA 2ACZA 3FYGA 3GRTA 3I6DA 9GSSA 1MD3A 1TDOA 4WF4A 3IBHA 2GRTA 2JBVA 5JWOB 3KA7A 4PURA 2ZCTA 5HFGA 4EM3A 2H01A 4H4WA 1ZOVA 3BBYA 2JADA 4FYBA 3RPNA 4CHSA 4O7HA 2MZCA 4HS1A 5IOXA 3EVIA 1OC8A 5JCMA 1EEJA 5EB5A 2YG6A 5HHFA 5HQPA 5A5KA 3EPTA 5G2ZA 4TLZA 1O6JA 2M80A 1YKJA 3KKJA 4OPCA 1M2AA 2HLSA 1R7HA 1GTIA 4IKHA 2UZ8A 3FMWA 3ZREA 3NYCA 1O7UA 5CRHA 1XIYA 3FZ4A 3QSMA 1PBFA 1PJ6A 2H89A 4Q5QA 3I43A 4Z2UA 4IBPA 1KEBA 4H4RA 4MPGA 2GSQA 1UC7A 4B67A 2YLSA 5KVIA 1M99A 1T4YA 3N9JA 4DSHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5BMU A;  4BL7 A;  4YTM A;  5GSN A;  4P9S A;  1XVW A;  1ERT A;  2ALB A;  3G7Y A;  1A2M A;  4BL7 B;  1TK8 B;  4M52 A;  3HJO A;  1NHY A;  4ML1 A;  4P3Y B;  4A6N B;  2Q0L A;  3NK2 X;  1GUL A;  4HJ2 A;  4NNJ A;  2XVE A;  4K1F A;  1ILO A;  3CSJ A;  5FS8 A;  3LZW A;  2HSH A;  5DBJ A;  2L4C A;  1K4Q A;  1S3E A;  4GTU A;  4F9Z A;  3K8N A;  5KNL A;  3GH6 A;  3L9U A;  1ZDL A;  4O5R A;  2D2Z A;  4O5U A;  3O0H A;  1A23 A;  2OA1 A;  3FZ9 A;  3LG6 A;  1T7P B;  3ZRD A;  2A4V A;  1S2Q A;  4JZQ A;  3LJP A;  4H2Q A;  3UBL A;  4G0I A;  4BVY A;  2K8S A;  2B5Y A;  2VLT A;  1CC2 A;  1OAZ A;  5B6M A;  2V6K A;  2VCV A;  4DVC A;  4X9M A;  1GSY A;  1K0B A;  4JNQ A;  5LD0 A;  2O8V B;  5DAK A;  2DKH A;  5EVO A;  1O81 A;  2YWI A;  4K5R A;  4N0V A;  5FHI A;  3P9U A;  3P4R A;  5JCI A;  1FEC A;  1SL2 B;  2DJJ A;  2FUG 2;  2OAC A;  5J7X A;  4HQZ A;  1LVL A;  3WGD A;  5DAK B;  2VUP A;  5EY6 A;  4MH3 A;  1QUW A;  4KAE A;  4MJW A;  1FL2 A;  2X8H A;  1SKR B;  1EOG A;  1NG3 A;  4KDY A;  4U8M A;  4EMW A;  2Q0K A;  1S2Y A;  5ECM B; 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