4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
3NN0X 3CNSA 1D5TA 4TM4A 4NEVA 1VG0A 4H4QA 4U8JA 1OJAA 1Z6LA 3C4AA 1YQ3A 3FMWA 4H4YA 4YT0A 3GD4A 3URHA 2B7RA 2VRMA 3V3NA 1XHCA 1Y56B 2XCGA 2Y6QA 3P4RA 1L9CA 2A8XA 2YG5A 2C67A 3NKSA 3M0OA 4H4WA 2CFYA 2QA2A 1O94A 4IVMB 4TM1A 1PBCA 3AEDA 3BNUA 3ALLA 5LV9A 2Q0KA 3AE6A 3BHKA 2EQ7A 4CY6A 3QFBA 2GR2A 3ICSA 3K7QX 4YSHA 4YWOA 2YAUA 2C3DA 3FBSA 3H4KA 2V5ZA 4O5QA 4P9SA 1TDNA 2ZZBA 2OALA 2GQWA 3VR8A 1H81A 2BS3A 5BRTA 3KA7A 5KVIA 3ATRA 2XLUA 4Z43A 4J31A 4KPRA 1BZLA 4YXDA 2B76A 2FBWA 5FS6A 4NTEA 2Q7VA 3CNPA 3GRTA 2BXSA 3AECA 2C66A 1LQUA 2XFPA 3UCLA 3VR9A 2EQ6A 3K30A 2Y6RA 1CC6A 2R46A 1IUTA 4K8DA 3NGCX 1N4VA 4Z2TA 1AOGA 2B9YA 2WOIA 5FS7A 4Y4MA 2YLZA 2BYBA 4ZN0A 1GRBA 2R0GA 4AT0A 1FEAA 3F8PA 1GRTA 4AOXA 3DK8A 1DOBA 2GB0A 1E39A 2BACA 2BXRA 2VVMA 2YLRA 5BULA 2JB2A 4GCMA 2WESA 5BVAA 1H82A 3AE9A 3DJDA 5IPYA 2C73A 1NHRA 3IC9A 3IHMA 4WX1A 4DSGA 2XLPA 3QVRA 3GDNA 2C75A 2FJEA 2WP5A 1PJ7A 3C96A 2YLWA 3G5QA 5JCKA 2BABA 3AEEA 4USRA 1V59A 5C3JA 1SEZA 3C4NA 3LJPA 2XLRA 4CCRA 4FK1C 1P2HA 3AYJA 3GD3A 2AAQA 2WHDA 3QSEA 4H4SA 2GR3A 4C74A 2WU2A 4CNKA 2R45A 4A79A 4APNA 3NK1X 3UTFA 1BF3A 3S61A 1F3PA 3BI2A 1LVLA 1PBDA 4OVIA 1GESA 3KD9A 3ZYXA 2WBAA 2WQYA 4A6NA 4B63A 4J2WA 4Z24A 3O0HA 3H8IA 3GMBA 1RYIA 1BWCA 2YR4A 1EL7A 2V3AA 1BGNA 1D7LA 1ZP0A 2X8CA 3NN6X 2WOVA 3P1WA 3GWDA 4U8KA 3ZDNA 1IUVA 4AT2A 3G5SA 1E1MA 3CPJG 5EB4A 4ECHA 2WDQA 1S2YA 4K22A 4U8NA 3RNMA 4NZHA 1FL2A 1S2QA 2TMDA 3KPFA 4A99A 4CRTA 1F8SA 2V6OA 5FMHA 3COXA 1S3BA 1GRGA 4H4XA 1PS9A 2VQBA 4BV6A 1F6MA 2YG6A 3ATQA 4HB9A 1QO8A 2OLNA 4NTDA 3LADA 2BCGG 4NTCA 2WS3A 4OPGA 1GREA 2BS2A 3QJ4A 4YTMA 1NHPA 2WETA 2R4EA 3CNDA 4H2QA 5KVHA 5FS8A 4EMJA 4IV9A 4Z25A 3GSIA 2WP9A 3II4A 3RHAA 2JKCA 1DODA 4EIPA 3DJEA 3V76A 3JSKA 3GYIA 1D7YA 2J3NA 1L9EA 2GMJA 5CQFA 1PJ5A 3REDA 3AWIA 1B8SA 2TPRA 1E1NA 2XLSA 2PYXA 4OPDA 1XPQA 3DJGX 5JCIA 1GV4A 2YWLA 3L1RA 1LTXR 4DSHA 4BK2A 4IVOB 4J34A 4K5RA 4BK1A 2Q0LA 3UTGA 1GOSA 3NRNA 1IJHA 1LV0A 4X9MA 2BS4A 3VRBA 2RABA 3VRAA 1JEHA 4D04A 4I59A 1D4CA 1PBEA 5ER0A 4A6NB 2CDUA 4U2TA 2PHHA 2NPXA 2X3NA 1CJ3A 1YKJA 2JB3A 1LJ1A 1L9DA 2X8HA 4JNAA 1D4EA 1E6EA 1QLBA 3UKKA 3AYIA 3AE8A 1MOKA 3ICTA 1N4UA 2GAGB 3NTAA 5GRTA 2JK6A 4C77A 3AD7B 3LOVA 2WDRA 3GRSA 1JOAA 1M6IA 4GDPA 3ISHA 1BGJA 4A65A 4U8IA 2YM2A 4K7ZA 4M52A 2GAHB 2EQ9A 3CN8A 4ZCDA 2IIDA 3P4PA 3AE5A 1ONFA 2W0HA 5U1OA 3RP7A 3UKQA 1IUUA 1NHSA 1KSUA 1COYA 1M64A 2Q6UA 3KKJA 3Q9TA 1ZOYA 4UDQA 2WPCA 3GWFA 1Q1RA 4H7UA 4OPIA 4B69A 4GRTA 4JN9A 4EQXA 4I58A 1EL8A 5IQ1A 1S3EA 3FPZA 2C65A 4H4TA 5JCNA 2YLXA 1GALA 4A7AA 2C76A 3R9UA 4U2LA 2X50A 4XWRA 1Y0PA 3CTYA 1KDGA 2R9ZA 3IWAA 3F8RA 4AP1A 1JRYA 3NH3X 2YQUA 4H4UA 2DKHA 3QSSA 4J36A 2YG7A 4RG4A 3FG2P 1KNPA 1CC2A 2B7SA 3DA1A 4EMWA 5U63A 2F5ZA 2GV8A 3PO7A 4X9NA 4A9WA 4OPUA 4PAAA 3NTDA 1REOA 4XXGA 3SM8A 4H4RA 1DOCA 1ZMDA 2NVKX 5KOXA 5CKUA 1BKWA 3E1TA 4TLXA 4D03A 4JDRA 1CHUA 4E0VA 1PXBA 3ICRA 3S5WA 4YKGA 4FX9A 3SQPA 1W4XA 2GR0A 3B6DA 3NYEA 1CJ4A 3UKHA 2YG4A 2H88A 3AEBA 3M12A 3BI5A 3NNEA 2BA9A 4AP3A 4U2SA 1JRZA 1OJCA 2XDOA 5FS9A 1Q9IA 3NK0X 2X8GA 1JNZA 1KFYA 3QFAA 4MJWA 4B65A 2XLTA 4C3YA 4RG3A 2OLOA 2XVIA 3I6DA 3NG7X 1F8WA 1PXCA 1CJ2A 3G5RA 3P9UA 2RGOA 3WE0A 1E1KA 4JY3A 4BK3A 3CNJA 4TLZA 2WOWA 1ZMCA 2C7GA 3NLCA 2VQ7A 3DH9A 3AE2A 3SFEA 5HXIA 3UKPA 4J56A 1NAAA 1GERA 1K0JA 2YLTA 4FK1A 5M10A 4UDRA 3LB8A 4ZCCA 5U25A 1GXFA 3QVPA 1H86A 3EPTA 4PABA 2WPEA 3UKFA 4BJYA 5JCMA 3UOYA 1HYUA 5L46A 4EMIA 1L0VA 2Z5XA 1FECA 5DBJA 3NYCA 3UKAA 1F8RA 3AEFA 3BNMA 1OJDA 2YR6A 3AEAA 3EANA 1GT8A 3AD8B 3NYFA 3DK4A 1RP0A 1VQWA 4EQRA 3VRDB 3IHGA 2CVJA 4JY2A 1IUWA 1EL9A 3NHOX 1B5QA 4K2XA 2HQMA 2GEWA 3DMEA 1PBBA 1MO9A 2C70A 2RGHA 2A87A 4B1BA 3ITJA 2RGJA 4U8PA 1GPEA 4CNJA 3SFDA 2ACZA 3P4SA 3K7MX 4GF7A 4RSLA 3UKLA 4GDEA 1GRAA 2C3CA 2JBVA 2GVCA 3PVCA 2BK4A 4NEWA 1H6VA 1TDKA 1Q1WA 5J60A 2B9WA 4REKA 3AEGA 5TR3A 4USQA 1ZOVA 4OPCA 2GF3A 3IF9A 4BJZA 2ZZCA 5HY5A 4Y4NA 5EB5A 2E1MA 1EL5A 1YQZA 2OA1A 3CPHG 1OJTA 3ALMA 4Y4LA 4DGKA 3CGEA 4O5UA 2WPFA 3ABVA 1YY5A 1O5WA 4EIQA 2ZBWA 4TM3A 3VQRA 1K4QA 3D8XA 1GTHA 4X4JA 1P2EA 4U8MA 2IVEA 1KF6A 2WP6A 4H4PA 3CPIG 4H4VA 1D4DA 2BK5A 5KRQA 2FJDA 1DJNA 4K5SA 2GH5A 3HZLA 3EF6A 2C64A 2VVLA 2V3BA 3NK2X 2YR5A 3AYLA 4UP3A 1ZX9A 3UOVA 3RP8A 4YSZA 1CC4A 1JRXA 4OPLA 4Z44A 4C5OA 1GETA 3AB1A 1ELIA 4CBQA 4IA6A 2YVGA 1N1PA 1FOHA 1CL0A 4N9XA 1PJ6A 4H50A 1PN0A 3CGCA 1CF3A 3UOXA 1YQ4A 1VRQB 4XWZA 5GSNA 1DXLA 4Z2UA 1CBOA 4ADWA 1GNDA 4YTNA 5KOWA 1K0IA 4KX6A 1B4VA 1CJCA 2O9ZA 1NG3A 2XFUA 4LA1A 3AXBA 3I3LA 1ZY8A 4BURA 4LIIA 1OJ9A 2VVLG 2OAMA 4JQ9A 5KXJA 4EM4A 2WEUA 1K0LA 5HYMA 1VDCA 4HA6A 1B37A 2VRLA 1ZDLA 2A89A 3V3OA 4DNAA 3NT6A 1H7XA 2H89A 2JB1A 4H2NA 1EBDA 5M0ZA 4B67A 3DGZA 1PXAA 3CIRA 4Z26A 3B3RA 4YSYA 1QJDA 1H84A 1PHHA 3EAOA 2EQ8A 5EOWA 5J7XA 1O95A 2E4GA 3UP4A 3K7TA 3T37A 2QA1A 1GSNA 1JNRA 2QCUA 4IA5A 2V60A 3PS9A 1X31B 4B68A 4YTPA 4J57A 5JCLA 1LPFA 1VG9A 3OZ2A 2XFNA 2ZZ0A 4EQSA 1TYPA 4U8OA 3SGLA 3KU9A 4FDCB 4OCGA 2AR8A 1KSSA 2XVEA 1N4WA 1GRHA 1TRBA 1ZKQA 2WDVA 3M13A 1IUXA 3ALJA 5EBKA 2R4JA 4H2PA 2FJAA 4U8LA 3GDPA 4CCQA 5C2TA 2V61A 2YVJA 1GTEA 1TDFA 1PDHA 3BI4A 4UDPA 2XYOA 3FIMB 4ICYA 2BK3A 4GR1A 2YLSA 1NDAA 3UP5A 1JU2A 1NG4A 2XFOA 2E5VA 2DKIA 4H2RA 2CULA 2GR1A 1NENA 2WU5A 3AE4A 3L8KA 3AD9B 3H8LA 2XVHA 2X99A 3OC4A 3UTEA 1KNRA 2XVJA 2YM1A 1Y56A 5HHFA 4AOSA 3GMCA 4OPTA 5BUKA 4Z2RA 1MXTA 2BCPA 1XDIA 1TDOA 3QSMA 2C72A 4GUVA 2XVFA 2I0ZA 3AE3A 4B66A 2UZZA 2YVFA 3F8DA 3LZWA 2APGA 1FEBA 3LZXA 4EM3A 1TYTA 4EQWA 1GEUA 1PBFA 1XANA 2BC0A 2BC1A 3CGDA 2FJBA 3GYJA 1UKVG 1DOEA 4YSXA 3AE7A 3NIXA 4JNQA 4TM0A 1NEKA 1E7PA 3LXDA 1ZK7A 2IVDA 2B9XA 2VOUA 1E1LA 3P4QA 3UOZA 1RSGA 4B64A 4C3XA 2Z5YA 4J33A 2QAEA 4CY8A 3CNTA 2GQFA 3CGBA 3Q6JA 1TDEA 3RP6A 1IUSA 3D1CA 3KVEA 3DJJA 1NPXA 4WCTA 5KWFA 2XFQA 3DK9A 3UTHA 2YG3A 1LQTA 4A5LA 4LU6A 1DNCA 1NHQA 2GRTA 4H4ZA 2R0CA 3ADAB 1H7WA 2JAEA 2AQJA 2ARDA 3KLJA 2GMHA 2VZ2A 1GRFA 3DGHA 3AE1A 1DJQA 1H83A 5IQ4A 2R0PA 3BHFA 4YKFA 1FCDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YV9A 3ZFBA 3ZITA 2RLIA 1D5TA 4H4QA 1Z6LA 1AIUA 3FMWA 3GD4A 3URHA 1BJXA 2L6CA 5IO2A 2VRMA 1XHCA 1GLQA 2P5RA 4ZXGA 3NKSA 3M0OA 2CFYA 4F9ZA 3HY2A 2QA2A 1O94A 4IVMB 3T0KA 3GMFA 3KIJA 2Q0KA 4NPBA 2EQ7A 3GRXA 3QFBA 3NZNA 3UIWA 4YWOA 1GTBA 2YAUA 4MJAA 3FBSA 5HQPA 1EGOA 3IPZA 4IQAA 4OO4A 2GQWA 4ZL8A 3GL3A 1H81A 3VR8A 2BS3A 2P31A 5D96A 5IPGA 2OA7A 3E3EA 4KPRA 5H5QA 3CNPA 3QCPA 3GRTA 4GF0A 4EUYA 2XFPA 2VO4A 3VR9A 2GT5A 3HYXA 4GRFA 2R46A 2YZUA 5G1KA 2B9YA 1GTAA 2L5LA 5FS7A 2YLZA 3QOUA 1M99A 1GRBA 1BEDA 4WR4A 3DK8A 1DOBA 2GB0A 10GSA 5BULA 3SY4A 4GCMA 4HJMA 2WESA 1GLPA 4PTSA 2C73A 1PX6A 2C8UA 4WX1A 4DSGA 3VK9A 2C75A 3G5QA 3P90A 5JCKA 1LJRA 3UVHA 3AEEA 4USRA 2IMKA 3CXGA 3C4NA 1P2HA 3AYJA 2TRCP 3LFLA 4PQIA 3GIXA 3KJYA 4J56E 3HZ8A 3MAKA 1PBDA 4A6NA 2WBAA 3M9KA 4F2IA 1X5EA 4RI6A 2LQOA 4IQ1A 5ECLB 4XCSA 5CP1A 1RYIA 4OFNA 2PERA 2PVOC 1EL7A 2J23A 2X8CA 3W8SA 3WGEA 1BGNA 1D7LA 3KTLA 3NN6X 3G9BA 5J5NA 5LNKe 3CPJG 2WDQA 4X43A 4F03A 4HZ2A 3RNMA 4NZHA 1YJ6A 4CRTA 1DSBA 3COXA 2VQBA 1VF1A 9GSSA 3TJKA 1QO8A 3APOA 2VLUA 5CAXA 2KP1A 1SJIA 2BS2A 4YTMA 1XPVA 5D73A 5FS8A 1YY7A 4Q5QA 4IV9A 4Z25A 2XHFA 3GSIA 3HVNA 3NIVA 5DALA 1D7YA 5CQFA 3EMPA 3REDA 5KMPA 1A23A 1E1NA 2OACA 4K8MA 2DJ3A 4DSHA 3UTGA 3NRNA 1IJHA 3MNGA 3VRBA 3VRAA 3UJ1A 4GTUA 1JHBA 2PHHA 5IOXA 1PL2A 2X3NA 1CJ3A 3F3RA 1PL1A 2RIIA 1OC9A 1K0NA 2LRNA 5ECOB 1QLBA 4PGTA 1TK0B 2LRCA 3IXRA 2WDRA 3D6IA 1TOFA 3KM6A 1SKSB 1YEPA 1X0RA 4U8IA 2YM2A 3LW9A 1ZYNA 2IIDA 3P4PA 3UKQA 1ONFA 1NHSA 2A4HA 4KA0A 1ZOYA 2WPCA 1Q1RA 3WGDA 3FW2A 4KDUA 2CX3A 4JN9A 5BMUA 4I58A 5IQ1A 3QAVA 5CNWA 2H66A 1EOHA 2YLXA 3Q6OA 3F63A 2V1MA 1M3IA 1WJKA 3GURA 1ABAA 3C1SA 4TXOA 2H6ZA 2MBTA 1ZZYA 4TR3A 1XZOA 4QQ7A 3CMIA 2PPTA 5JCWA 2YG7A 4J36A 4RG4A 3FG2P 2JU5A 5F06A 3RDWA 4II3A 2GV8A 4OPUA 2FHEA 4G0KA 4YH2A 1DOCA 5DBQA 1ZMDA 1U3AA 2YJ7A 3GKKA 1PSQA 4JDRA 1CHUA 12GSA 3NYEA 2H88A 3BI5A 4YQMA 4AP3A 3TKSA 1SKRB 2A2PA 1JRZA 1OJCA 2VCXA 2D2ZA 2MMNA 2QSIA 2HYXA 3I69A 1JNZA 3CSJA 1XWGA 5D8IA 5AGYA 4MJWA 4B65A 4BIKA 4C3YA 3D21A 3IOSA 2XVIA 3P9UA 3TJBA 2WOWA 1UVZA 4K6XA 2C7GA 3NLCA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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