4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
1PHHA 2XVHA 4DSHA 2BCGG 4B66A 4OPDA 1D4EA 2YM1A 1B5QA 2GF3A 1N4WA 2ZBWA 1KDGA 4TM4A 5U63A 1LQTA 2YLZA 1PXCA 2AAQA 3KLJA 2BS4A 3P4SA 4IA6A 4KX6A 5EB4A 4ZCCA 2WESA 4A79A 1B8SA 4H4ZA 4X4JA 4TM1A 3UKFA 1VDCA 3DK4A 1PJ7A 5KXJA 2GQFA 3D8XA 4C74A 1JRZA 1GEUA 3HZLA 1FECA 4JY2A 3UCLA 2YWLA 1GRHA 1OJDA 2XLUA 3BHKA 4BJZA 5M10A 2WPCA 1MXTA 3NIXA 5EBKA 2R9ZA 3VR8A 1ZX9A 3VRAA 3UKHA 3DK9A 3F8RA 4U8MA 1GOSA 2GRTA 2VQBA 2FBWA 4C3YA 3QJ4A 2A87A 3QSMA 4K22A 1ELIA 2E1MA 4APNA 3L8KA 1H84A 1VG0A 3UOVA 3AEDA 3VQRA 3CNTA 1S2QA 1NDAA 2AR8A 3RP7A 3GDPA 4H4SA 1E6EA 3B3RA 1DOEA 1F8WA 2XYOA 3DJEA 3NK1X 4LU6A 1EL7A 1KF6A 3UTHA 1ZDLA 3GMCA 4H4VA 3NKSA 3AYIA 4NZHA 5EB5A 2XLSA 3NH3X 2B9XA 2VQ7A 2XDOA 4UDQA 1S3BA 2CDUA 4J31A 5FMHA 3L1RA 2PYXA 3SFEA 2J3NA 4BK3A 5BVAA 3KPFA 4Z24A 4K5SA 3BNMA 1DODA 3DMEA 4A65A 3M12A 4GRTA 2C3DA 1DOBA 4UDRA 2XCGA 3ICTA 4H4QA 1TDOA 3CNSA 2WDQA 3NNEA 3DJDA 3QVRA 3UOYA 1H82A 3LZWA 1EL5A 3ICSA 3KA7A 2DKHA 1F8SA 1KSSA 3NYFA 4ADWA 1NG4A 3UTGA 1CJ2A 2WOVA 4ZCDA 1QLBA 2ZZBA 1TDFA 2C3CA 3LOVA 1O5WA 1GRAA 1JU2A 1IUVA 3AEGA 1LTXR 3H8IA 3FIMB 4H4WA 4B1BA 2JBVA 4A99A 2OLNA 3DH9A 3NTAA 3P9UA 4Z44A 3P1WA 2YLXA 1D4CA 4NEVA 5JCIA 1DXLA 2YVJA 1ZP0A 1OJAA 3GSIA 4A6NA 4CY8A 1TRBA 3AECA 5C3JA 4A9WA 5HYMA 3UTEA 4J2WA 3Q6JA 2YG4A 3V3OA 3V76A 2OALA 1BZLA 3K7MX 1Q1WA 4B65A 1H7XA 3T37A 3GD4A 2VRMA 3P4QA 1L9DA 3CIRA 4XWZA 2BS2A 4REKA 4B67A 2BK5A 1E39A 1LQUA 2V60A 4B64A 5L46A 3EANA 1DJNA 4PAAA 3H8LA 2V6OA 4IVMB 1ZK7A 3I3LA 3BHFA 3NT6A 2WDRA 4JNQA 3II4A 4OPLA 1AOGA 1JOAA 2BCPA 4GDPA 4I59A 2XFUA 1BWCA 3DGHA 2IIDA 2Y6RA 4JDRA 3CGCA 4LA1A 4U2LA 5FS6A 3UOZA 4FDCB 1NHSA 2YLWA 3P4PA 4AP1A 4PABA 2CVJA 2QA2A 1H7WA 3UP5A 2JK6A 3CPIG 3S5WA 1ZOVA 1VG9A 4XXGA 2Z5XA 2B7SA 1LJ1A 2H88A 4IVOB 4U8LA 1D5TA 3UP4A 3LXDA 2VRLA 2OLOA 3GRSA 2JKCA 2XLTA 4EM3A 4DNAA 2WP6A 3REDA 3FMWA 1E7PA 1V59A 5IQ4A 4TM3A 1GRGA 2WOWA 4H4TA 4RG4A 2YG5A 3FBSA 3NN6X 2C76A 5FS8A 3GWDA 1ZY8A 1MO9A 1L0VA 3CGDA 1Q1RA 2F5ZA 2I0ZA 2GVCA 3NGCX 2BA9A 3BI2A 1NG3A 2QCUA 2BXSA 3EPTA 1PBCA 4TM0A 4BJYA 1PJ5A 4X9MA 3GYIA 5C2TA 1D4DA 4EM4A 5J60A 3ALMA 1IJHA 1B4VA 1OJTA 2GR0A 3LJPA 4YTNA 2YG3A 1GTHA 1K0JA 2XFPA 1OJCA 3R9UA 3RP8A 1D7LA 1EL8A 1CC4A 4C5OA 2EQ9A 1M64A 2OA1A 2WP5A 3AWIA 4MJWA 3DJJA 5J7XA 1NAAA 4K2XA 1W4XA 2X3NA 4H4UA 4X9NA 1ZMDA 1F3PA 1FCDA 3FG2P 4AP3A 4AT0A 5CQFA 3FPZA 4Z25A 4OPTA 3SM8A 2EQ6A 4Z2TA 3AEFA 4AOSA 4D04A 3ATRA 2FJAA 3CGEA 3PVCA 4A6NB 2WHDA 4CRTA 3P4RA 4YSXA 4GUVA 3NTDA 5FS7A 3CTYA 3DA1A 1GREA 2C64A 3AE7A 1HYUA 2GR3A 2YLRA 4GR1A 4U8IA 1COYA 1FEBA 2V3BA 2WETA 4J36A 1N4UA 4CY6A 1ZOYA 2BC1A 2C75A 3E1TA 2UZZA 3AB1A 3IHMA 4BV6A 3ZDNA 5KRQA 3UKKA 1K0LA 2YG6A 2ZZ0A 1XHCA 1PBEA 2XFQA 4ICYA 1O95A 1NPXA 2FJEA 3IHGA 4OCGA 3SQPA 2QAEA 1BF3A 3M0OA 1JEHA 4JQ9A 3G5QA 1K4QA 2C72A 4Z2UA 2YQUA 5KVHA 3AE2A 1YQ4A 3BNUA 4N9XA 3QFAA 4YTMA 3AE8A 2DKIA 1IUWA 5JCKA 4K5RA 1E1KA 4RSLA 2B9YA 1UKVG 3IF9A 1Y56A 2RGOA 4IA5A 1TDKA 2WU5A 1CBOA 2B76A 4H4PA 2X50A 2C66A 4U8KA 3B6DA 3KKJA 2X99A 1XPQA 4U8JA 3Q9TA 1XANA 3AEBA 3AYLA 5CKUA 4A5LA 3URHA 2R4JA 3K7TA 1JNRA 4LIIA 4A7AA 3CNJA 3DJGX 3KD9A 3C4NA 1QO8A 2YLSA 4Z2RA 1DOCA 4EQRA 3S61A 2X8HA 4O5QA 3NYCA 2GMHA 1KSUA 4TLXA 1PBFA 4U8PA 2C73A 3NLCA 3AEAA 1O94A 2NPXA 4H4YA 1ZKQA 4K8DA 4UP3A 1RP0A 3GYJA 1IUXA 1GNDA 3VRDB 2YAUA 2WU2A 2R0PA 3ALJA 2YG7A 4J34A 1TDNA 2QA1A 1ZMCA 1P2EA 2XLPA 2WP9A 1JRYA 1NHPA 2C7GA 3WE0A 4CCRA 3F8DA 4B68A 1REOA 2C65A 3NG7X 2OAMA 2NVKX 4D03A 2Q0KA 3ISHA 4EIQA 3AD9B 1BGJA 2GR1A 4HB9A 1E1NA 2BACA 4USQA 4EQSA 1GETA 3VR9A 4Z43A 1NEKA 2FJDA 3KVEA 4YT0A 4WCTA 3QSSA 2XVIA 3F8PA 3NK2X 1VQWA 4H50A 5GSNA 2EQ7A 2RGJA 4DSGA 2YM2A 4B63A 5KVIA 3AEEA 1GERA 4OPIA 3GD3A 1GRTA 5LV9A 3BI5A 4OPUA 4BK2A 3ALLA 5BULA 1IUSA 4IV9A 1GTEA 2Y6QA 4EIPA 4BURA 2VVMA 1D7YA 1L9CA 2B9WA 2XFOA 2Q0LA 1FEAA 3ICRA 2VZ2A 3M13A 4NEWA 2E5VA 4J56A 4NTEA 4YSHA 1PS9A 4P9SA 3OC4A 4YTPA 4Z26A 1RYIA 1M6IA 3AE9A 3CNPA 3K30A 2ARDA 5KOXA 1GALA 1Z6LA 3AD8B 4AOXA 5KWFA 4JNAA 3AE1A 2GH5A 3COXA 4H2NA 2WEUA 2A89A 1PBBA 2ZZCA 1RSGA 2C70A 2WQYA 3K7QX 4C3XA 4ECHA 1OJ9A 3NN0X 3EF6A 1LV0A 1N4VA 1X31B 1Y56B 2VVLA 1LPFA 3EAOA 1CJ4A 3UTFA 2YR5A 4U8NA 3QSEA 5DBJA 4NTCA 3GMBA 5HHFA 2YVGA 2W0HA 5U25A 4RG3A 2B7RA 1IUTA 4DGKA 1CF3A 1FOHA 1S3EA 3H4KA 5FS9A 5BRTA 1F8RA 2GR2A 1BKWA 4H4XA 4YWOA 4YXDA 2GAGB 4XWRA 3RHAA 1Q9IA 5JCLA 4J57A 1H83A 4WX1A 4YKGA 1JRXA 1L9EA 3GDNA 2A8XA 1EL9A 3PO7A 1E1LA 4EMJA 4GCMA 3SGLA 1GRFA 2ACZA 4CNKA 1CJ3A 3CGBA 4JY3A 4OVIA 3OZ2A 2R45A 2WS3A 4C77A 2APGA 4YKFA 2YR6A 4KPRA 1CL0A 1XDIA 2XVFA 3BI4A 3NYEA 4AT2A 3LZXA 1PBDA 4EMIA 5KOWA 1TYPA 3UKLA 1GRBA 5HY5A 1PXBA 1S2YA 4EMWA 3UKQA 1PDHA 3DK8A 3ZYXA 3RP6A 1TYTA 2EQ8A 2VVLG 4OPGA 2JB1A 2YLTA 1GPEA 1LVLA 2IVDA 1PN0A 4M52A 1H86A 1NHRA 1ONFA 3UOXA 3AD7B 2C67A 4U8OA 1TDEA 1P2HA 2VOUA 2GMJA 5EOWA 3VRBA 2Z5YA 3RNMA 2R0GA 1SEZA 1YY5A 2JB3A 5ER0A 3CPHG 4H4RA 4USRA 3NHOX 1QJDA 3PS9A 3SFDA 2R4EA 3UKPA 4CCQA 1YKJA 1PXAA 3AYJA 3GRTA 3ADAB 1GSNA 3KU9A 3LB8A 2BK3A 2XVJA 2WBAA 4I58A 1BGNA 1IUUA 2JB2A 4FK1C 3AXBA 4BK1A 1KNPA 4GF7A 5BUKA 2BK4A 2YVFA 3C4AA 4J33A 2CULA 3CPJG 5IQ1A 1KNRA 4JN9A 5U1OA 2BS3A 2V61A 4H2RA 3GWFA 1NHQA 3AE5A 2XLRA 3ABVA 3JSKA 2BABA 3NRNA 2PHHA 4FK1A 2GEWA 1H6VA 1NENA 3AE3A 2HQMA 3AE4A 4NTDA 2R46A 2TPRA 4Y4LA 4TLZA 4FX9A 2GB0A 1H81A 1VRQB 4U2SA 5TR3A 1FL2A 2GQWA 3IWAA 2XFNA 4UDPA 1DNCA 1JNZA 2Q6UA 3D1CA 1GT8A 2V3AA 2BXRA 3DGZA 1GV4A 2RABA 1CHUA 2AQJA 5JCMA 2CFYA 2WDVA 3ATQA 2YR4A 2JAEA 3CN8A 3O0HA 1YQ3A 5HXIA 2GAHB 4O5UA 1EBDA 1YQZA 1K0IA 2V5ZA 3QFBA 4EQXA 3NK0X 4CBQA 4U2TA 4YSZA 2WOIA 3C96A 1Y0PA 4H7UA 2O9ZA 4H2QA 4Y4NA 1GXFA 1KFYA 2TMDA 2XVEA 3CNDA 3QVPA 1DJQA 4CNJA 4HA6A 5GRTA 4ZN0A 4E0VA 2IVEA 3V3NA 5JCNA 3UKAA 4H2PA 3LADA 1MOKA 4OPCA 4GDEA 4YSYA 2H89A 2Q7VA 1GESA 1N1PA 4Y4MA 2RGHA 2BYBA 3G5SA 2R0CA 2WPEA 4EQWA 1F6MA 1CC2A 3G5RA 4K7ZA 2WPFA 2BC0A 2X8CA 5M0ZA 3I6DA 4B69A 1PJ6A 5IPYA 1B37A 3ITJA 2X8GA 2GV8A 3IC9A 1CJCA 2E4GA 2FJBA 1CC6A 3AE6A 1E1MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GH6A 2AJQB 4DSHA 2DSAA 1D4EA 1B5QA 2QGVA 2GF3A 2GGTA 1KDGA 6GSWA 1QFNA 3KMOA 3QCPA 3TGZA 4B69A 2BS4A 4ZCCA 4KX6A 2NBSA 4MF7A 1B4QA 5DJLA 2B5EA 3DK4A 2JSYA 3D8XA 4C74A 5CO3A 2KHPA 1FECA 1GP1A 5M10A 1MXTA 1ZX9A 3HVVA 3VRAA 3DK9A 4U8MA 4ZXGA 4WF4A 4F2IA 4C3YA 2H66A 3ZVJA 2E1MA 1H84A 1VG0A 2AR8A 4AJ7A 4CDOA 1SKWB 2IL3A 3NOFA 1F3AA 3HZ8A 3DJEA 4LU6A 3P7XA 2CA8A 2DIZA 1S3AA 1ZDLA 3GMCA 1SL1B 4EKZA 2YP6A 4J31A 5FMHA 4BK3A 2RIIA 2J3NA 5BVAA 4NXIA 3KPFA 4Z24A 4K5SA 4EDYA 3AY8A 3M12A 4GRTA 2C3DA 4UDRA 3ICTA 3NNEA 1T4ZA 1ZZYA 1EL5A 3ICSA 1SJ6A 2R5GA 1F8SA 4O92A 1KSSA 4ADWA 1NG4A 1CJ2A 4MPGA 1EOGA 1WJKA 2HFDA 2OE1A 2WDUA 4MPFA 2DMMA 1GRAA 3HCZA 1IUVA 4WETA 3ME7A 4A99A 4KB3A 2OLNA 4POKA 5E59A 4ECCA 1D4CA 3P1WA 5HR1A 4G0IA 4OFMA 1DXLA 1B48A 3GSIA 1K0MA 1A2MA 5C3JA 1M7TA 3UTEA 2HZEA 3V76A 2OALA 4X1UA 1ERUA 1Q1WA 4B65A 2VM2A 1VF2A 3SZWA 2BK5A 4V2MA 2OBIA 1E39A 5L46A 3O3TA 4O32A 4FH8A 4IVMB 1A8LA 1PX6A 5JCWA 3Q19A 1JFUA 4JNQA 1HNAA 4BVYB 4OPLA 1OYJA 4WKWA 5FS6A 3M9JA 2IIDA 4I5QA 4U2LA 1NHSA 4PABA 2CVJA 5B7CA 4FQUA 1DE2A 3F8UA 3S5WA 4XXGA 1LJ1A 4K2DA 4IVOB 4U8LA 1SL2B 2XLTA 2WP6A 3REDA 2VL3A 3VWXA 4WXTA 4FYBA 5FS8A 3FR9A 1WOUA 1Q1RA 1YF1A 1W89A 3A2WA 1SYRA 2F5ZA 1NG3A 1PBCA 3A5WA 4KGIA 4TR0A 3ZIJA 1PJ5A 1GUMA 1QK8A 3IK9A 4G2EA 4F0CA 2QSIA 2PBJA 3E9JB 3GYIA 2PVQA 4EM4A 5JWQB 5COHA 3LJPA 2YG3A 2XFPA 3TKQA 1EL8A 5DALA 5G30A 3GURA 1M64A 5ECMB 3DJJA 5J7XA 5AISA 1W4XA 4MJAA 4X9NA 3IC4A 3FG2P 2O7KA 3CSJA 3FPZA 3SWLA 4RI6A 2FJAA 2YZUA 3PVCA 5IMZA 20GSA 3M3MA 3DA1A 3SZFA 2C64A 3AE7A 1HYUA 4GR1A 4Z25A 1YY7A 1ZOYA 2BC1A 3TKPA 5KMSA 2UZZA 3IHMA 5IM9A 3UMAA 2YZHA 3SBCA 3ZMKA 1K0LA 2ZZ0A 2PMTA 2YNXA 1VGLA 4DSRA 1PD21 2QAEA 1ON4A 1OC8A 3G5QA 1K4QA 2YQUA 2CZ2A 1YQ4A 6GSUA 4N9XA 3QFAA 4KAEA 4ML1A 3AE8A 2M72A 1IUWA 1JZWA 3TJJA 1XWAA 1UKVG 2B9YA 2GQKA 4P3YB 2GZZA 2WU5A 5CRWA 2DJ1A 2X50A 3FRCA 3IR4A 2VCQA 3AEBA 3AYLA 2H74A 4LIIA 3HVSA 4PQHA 3KD9A 2ON5A 4HI7A 5JWRB 5ELAA 2M80A 1GSFA 5KMRA 3S61A 4NV5A 2L4QA 3NYCA 1KSUA 6GSSA 2OBKA 5DQSA 1ZKQA 1RP0A 4IHUA 5ECSA 1GSEA 1ZYQB 3VRDB 4KSMA 2XBQA 3LYPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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