4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
1COYA 1GTEA 3GDNA 3R9UA 5KOXA 5EB5A 3UKHA 4H50A 1ONFA 3SFDA 1GTHA 4U8PA 4YSYA 3NKSA 3KU9A 4BV6A 2BABA 1K0LA 4Z24A 4C3YA 4YTPA 3ALJA 4H4XA 1RYIA 4WCTA 1K0JA 3C4AA 1GREA 2BC1A 2QCUA 3AEBA 3QSSA 2YM1A 3NYCA 1DOBA 3SGLA 3ITJA 2APGA 3LZWA 4H4VA 4JY2A 3NYEA 4EIPA 3T37A 3DA1A 4O5QA 3P4SA 2B9WA 3GMCA 3CIRA 4GUVA 4B1BA 1CC4A 4X4JA 1CJ2A 4H4ZA 4K22A 3FBSA 2VOUA 4K7ZA 2C70A 5FS9A 4EQWA 2Q7VA 3AE1A 1F6MA 2WDQA 3WE0A 1GRAA 4UP3A 3RHAA 2GR3A 3L1RA 3NTDA 1D7YA 2A8XA 3VR8A 2EQ6A 4YKGA 4X9MA 1H81A 3Q6JA 3QVRA 4I58A 2YVGA 4Z25A 1IUWA 4YSHA 1IUTA 3UOYA 1N4UA 1M64A 2B76A 2YR6A 3UKQA 3CTYA 1CJCA 1ELIA 1XANA 2EQ9A 3NHOX 4H7UA 4IA6A 5EOWA 1LQTA 3DJDA 4N9XA 3F8RA 5EB4A 1GRBA 1L9CA 1H7XA 2C7GA 3AD9B 4NZHA 1H82A 4GR1A 1YQ3A 1KSSA 1KNRA 2YR5A 4EMJA 2WPFA 4H4YA 2WPCA 3AXBA 1S3EA 1ZMDA 2CULA 3NK1X 2X3NA 4K5SA 1PBCA 2XVJA 3EF6A 1CL0A 3M12A 4WX1A 1FECA 2JB3A 5LV9A 4XWRA 1PJ5A 1GOSA 1FCDA 4ICYA 3QFAA 4A6NA 4LIIA 2HQMA 2YQUA 1KFYA 1CHUA 1NHRA 3AECA 5IPYA 4AT0A 2Q6UA 4D04A 3AB1A 4CY8A 1E1NA 2CFYA 2AQJA 2RABA 4BJZA 3OZ2A 1ZX9A 2X99A 4U8LA 4DSHA 1YKJA 4H4PA 2WHDA 4OCGA 4USRA 2VVMA 2XVEA 1GPEA 2YLSA 3M13A 3NIXA 4Z2RA 2B9YA 3K7TA 4Z43A 1RSGA 1P2EA 2PYXA 3BI2A 4IVMB 2R4JA 2Q0KA 4YT0A 3DH9A 1JOAA 5C3JA 2BK5A 2BS4A 4DGKA 3UKPA 3H4KA 3ABVA 3P1WA 5EBKA 2JB2A 5U1OA 1E7PA 2YG6A 2B7RA 4JY3A 1E1MA 4AOXA 4J56A 2C67A 2XLSA 3UOXA 1ZMCA 2B9XA 2BCGG 3L8KA 5ER0A 2XCGA 3H8LA 3K7QX 2R0GA 1H86A 1PS9A 1GERA 4BK3A 3KKJA 1CF3A 3ZDNA 4CY6A 4U8IA 4BK2A 4CRTA 1IUSA 4JNAA 1KDGA 2BS3A 3F8PA 5BULA 4BURA 1F8SA 3P4PA 5KVHA 1GRTA 1X31B 3KPFA 4RG4A 2GAHB 3Q9TA 5KWFA 2Q0LA 3BI4A 2YVJA 4NEVA 5JCNA 1JRXA 2GEWA 3EPTA 2XLPA 2R4EA 1S2QA 3AEGA 3FMWA 1PHHA 3RNMA 4EM4A 3DMEA 1EL5A 4KPRA 1QLBA 3I6DA 3BNMA 1PDHA 1GSNA 4H4RA 1ZKQA 4U8OA 1PJ6A 3FG2P 3DJJA 4RG3A 2WU2A 1H83A 3NRNA 3ALLA 1H6VA 1DXLA 3UKKA 1NDAA 1OJTA 4Z26A 4TM0A 1PJ7A 2R9ZA 1D7LA 4HB9A 2BACA 1LPFA 3K30A 3G5SA 3BI5A 1PXBA 2ZZ0A 4A7AA 5JCMA 1PXCA 1NAAA 4U8KA 1PN0A 4NTCA 3NG7X 3CN8A 3CNDA 1S2YA 3GYIA 2GRTA 3LB8A 2XVIA 5BRTA 1GNDA 3PS9A 3DJGX 4OPIA 4H2PA 4A5LA 3RP7A 4A79A 2C64A 5KVIA 3VQRA 2WETA 1JRZA 1OJ9A 2FBWA 4PABA 1EL9A 1BF3A 2IVEA 1E6EA 3LXDA 4U8JA 4TM3A 2OA1A 3PVCA 4YTMA 1Y0PA 2C66A 3GYJA 1V59A 3RP6A 2A87A 4IA5A 4PAAA 1F8RA 3E1TA 1N4VA 1O94A 4H4TA 4EQXA 2GR2A 4JQ9A 3D1CA 3UTHA 2X8GA 4DSGA 5L46A 1TYPA 2V60A 2EQ7A 3D8XA 4UDRA 4YXDA 1N4WA 1F3PA 4A65A 2YLTA 3G5QA 2C75A 2YVFA 2R46A 1ZOVA 4JNQA 2WBAA 2FJEA 3AE8A 4AP3A 1DJQA 2WOWA 3AEFA 3GDPA 1H7WA 2GF3A 4J36A 4MJWA 2CDUA 2CVJA 3QFBA 4GCMA 1ZK7A 1XPQA 2VZ2A 1QJDA 1OJDA 1VG9A 2BXSA 2O9ZA 2Z5YA 3ICRA 3VRDB 4D03A 3AE9A 1DODA 2R0PA 3AYIA 1ZOYA 1H84A 4AT2A 3GSIA 4P9SA 5KRQA 4J57A 1LJ1A 4U2SA 4NTDA 2JB1A 3F8DA 3LADA 4O5UA 3OC4A 1DOEA 4IVOB 4C5OA 2AAQA 5M0ZA 4CBQA 3AE4A 1ZY8A 3I3LA 1GRHA 2WU5A 3GD4A 3UKAA 3V76A 1B37A 4H2NA 1MO9A 4TLXA 3UTGA 4H4QA 2XVHA 3KVEA 4YKFA 1CC2A 2V6OA 4M52A 2WOIA 3P4RA 3IWAA 3VR9A 1K0IA 1Y56A 5J7XA 1QO8A 1IUVA 1GALA 1AOGA 4H2RA 3ALMA 4OPUA 3P4QA 1REOA 4J33A 4REKA 3IC9A 1TDOA 2ARDA 4C3XA 1L9DA 2EQ8A 1CBOA 2GQWA 2RGOA 2TMDA 5CKUA 1P2HA 3KA7A 1TRBA 2NPXA 3NNEA 4TM1A 4USQA 3ICTA 3CNPA 1YQ4A 2X8HA 3BHFA 2C65A 1DNCA 1B5QA 1DOCA 1D4DA 2BXRA 3ATRA 3UKLA 4HA6A 4A6NB 2WP5A 3KLJA 5FS6A 4X9NA 2IIDA 1GV4A 4UDPA 4B69A 4K2XA 3IHGA 2WESA 1HYUA 4FDCB 3B3RA 4J34A 3FIMB 1O95A 1Q1RA 1BZLA 1GEUA 1PBBA 5FS7A 2GB0A 1Q9IA 3NH3X 3UP4A 2W0HA 3DGHA 2YAUA 3ICSA 5GRTA 4CCRA 4LU6A 1E1KA 3AE5A 4A99A 2QA1A 2FJAA 2XLRA 3CPJG 2E4GA 1BGNA 2WOVA 2C3DA 4KX6A 3BNUA 4OPTA 3UTEA 3VRAA 4K8DA 2WDRA 5TR3A 1O5WA 2GV8A 3LZXA 3NGCX 3CNTA 4LA1A 2F5ZA 4APNA 2XYOA 2YG3A 2VVLA 3CGCA 3CPIG 1BGJA 1CJ4A 2WP9A 1PBFA 1UKVG 4ZCDA 2VQBA 4U8NA 2GVCA 3COXA 2GQFA 3LOVA 4OPCA 2V3AA 1D5TA 2R45A 2J3NA 4B64A 4XWZA 2BA9A 3ATQA 2OALA 4U2LA 5U63A 2H89A 4CCQA 2UZZA 4I59A 3GMBA 4YWOA 1EBDA 3NN0X 3REDA 2QA2A 2XLUA 4C74A 1D4EA 5BUKA 4OPLA 3G5RA 1L9EA 3GRTA 4FK1C 3AEAA 1GESA 4CNJA 2YLWA 5BVAA 3GD3A 3C4NA 3NN6X 3V3NA 5DBJA 4Z2TA 1TDEA 3LJPA 4YSZA 4U2TA 1KSUA 2YG7A 3AEEA 3NK2X 1KNPA 1PBDA 2XFPA 4ZCCA 4H4SA 4Z44A 3K7MX 4TM4A 3S61A 4ZN0A 4ECHA 2R0CA 1M6IA 1VDCA 1RP0A 3M0OA 5HXIA 1JEHA 2XFOA 3DK8A 2BK4A 2YG5A 2FJDA 4EIQA 4AP1A 4A9WA 3URHA 1CJ3A 3JSKA 3SM8A 3IF9A 4B67A 4EQSA 3P9UA 4Y4LA 2DKHA 2XFQA 1JRYA 3CGDA 5J60A 5HHFA 5U25A 5JCLA 4K5RA 2X8CA 3DK4A 4JDRA 1DJNA 2RGHA 4Y4MA 2YG4A 3VRBA 4EM3A 1GXFA 1NG4A 2V3BA 2V61A 1ZP0A 5HYMA 3IHMA 3AYJA 1OJAA 3QVPA 1KF6A 1PBEA 2Y6RA 3H8IA 5CQFA 1IUUA 1FEBA 4B65A 2C76A 1GRFA 1N1PA 2BYBA 3AWIA 3DGZA 1LV0A 4J2WA 4C77A 1W4XA 1NPXA 2AR8A 2WS3A 3CNSA 3CPHG 3UOVA 1Z6LA 4OPDA 5IQ4A 4H2QA 1TDNA 4E0VA 3EAOA 3S5WA 4FK1A 4BK1A 2WEUA 3NLCA 3UP5A 5JCIA 1XHCA 2V5ZA 2VRMA 2GR1A 3AE2A 2FJBA 1JNRA 3AD7B 3EANA 5GSNA 2A89A 3RP8A 2BCPA 1LQUA 1GT8A 2NVKX 1D4CA 4EMWA 3HZLA 3ADAB 2H88A 2C72A 1VQWA 3AEDA 2XFUA 2E1MA 3II4A 4IV9A 4OVIA 4BJYA 1K4QA 4OPGA 3AE3A 1VRQB 4EMIA 1FL2A 4YTNA 2YWLA 4RSLA 3AE7A 3PO7A 2GMJA 2BK3A 1YQZA 2JBVA 4JN9A 3AE6A 2RGJA 5M10A 4NEWA 4NTEA 2JKCA 2VVLG 4DNAA 1B8SA 1NG3A 2XVFA 1CC6A 2YM2A 2ZZBA 4UDQA 5IQ1A 3UCLA 2ZZCA 3UOZA 5KXJA 4FX9A 3UKFA 4GRTA 4GDEA 2TPRA 3AYLA 2WP6A 1TYTA 3QSMA 4Z2UA 2XDOA 5FMHA 3CNJA 1E1LA 3GRSA 2IVDA 5C2TA 3CGBA 2YLRA 1LTXR 3ISHA 5FS8A 5JCKA 1GRGA 1XDIA 5HY5A 3GWDA 3O0HA 3UTFA 4B63A 1SEZA 1Y56B 2BS2A 2ACZA 1Q1WA 1BWCA 4U8MA 1JNZA 1NHPA 4EQRA 2DKIA 4H4WA 3KD9A 1TDFA 3NT6A 2GMHA 1EL7A 2PHHA 2WQYA 3C96A 1YY5A 3DK9A 4CNKA 2OLNA 3SQPA 1NEKA 1EL8A 4J31A 4AOSA 3NTAA 2OLOA 3GWFA 3QSEA 4GF7A 2BC0A 3V3OA 2VRLA 3ZYXA 2YLXA 2VQ7A 4H4UA 2Z5XA 4B68A 1BKWA 1IUXA 1PXAA 5KOWA 2WPEA 2XFNA 2YR4A 1VG0A 1NHSA 1ZDLA 3NK0X 2GR0A 1OJCA 2C73A 1E39A 2WDVA 1NENA 1JU2A 1MXTA 3BHKA 3CGEA 1FEAA 1LVLA 1S3BA 2C3CA 1B4VA 2GAGB 4YSXA 1L0VA 1IJHA 2OAMA 4Y4NA 2I0ZA 3AD8B 4TLZA 3SFEA 3NYFA 1GETA 2YLZA 2XLTA 4ADWA 1F8WA 2QAEA 1FOHA 3DJEA 2ZBWA 2Y6QA 2B7SA 1TDKA 3FPZA 2GH5A 2X50A 3QJ4A 4XXGA 1NHQA 2JAEA 4GDPA 1MOKA 2E5VA 3B6DA 4B66A 2JK6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VAFA 1COYA 1GTEA 3R9UA 5KOXA 2K9FA 5EB5A 3Q74A 1GTHA 2GZZA 2BABA 2YZHA 2GZPA 4HJ2A 3GIXA 1ZYEA 3HYVA 1K0JA 1PGTA 2O8VB 4HQSA 1OKTA 1DOBA 4BVXB 1HD2A 3TJBA 2BJXA 5IQYA 2NTOA 3T37A 3NYEA 4EIPA 3SX6A 3CRUA 1K0NA 2O7KA 4TR1A 4X4JA 1DBYA 2AJQB 4K7ZA 2C70A 1Z6MA 2CA8A 2Z9SA 1XBSA 1F6MA 1Z5YE 3MSZA 4UP3A 1GNEA 2KHPA 1X0RA 5G5EA 4AJ8A 1K3LA 1TOFA 1YEXA 3D22A 3E3EA 4YKGA 2EQ6A 2ZCTA 1GTAA 1H81A 3Q6JA 3RDWA 4I58A 5DQYA 4KE3A 1A0RP 1M64A 2B76A 2YR6A 1W89A 4HI7A 3NHOX 1XANA 4IP1A 4H7UA 5EOWA 1JZRA 4N9XA 5IIZA 5EB4A 2VD0A 1L9CA 4F9ZA 1GULA 1HNCA 1O8WA 3ERWA 4LMWA 3AD9B 1TW9A 3KD0A 4NZHA 1H82A 2H19A 4MNNA 2H30A 2C0DA 2C4JA 4H4YA 2CULA 4K5SA 3BJ5A 3M12A 3QOUA 5DALB 4XWRA 5AISA 2QGVA 1GOSA 1FCDA 4ICYA 3QFAA 5D96A 2DJ0A 5CNWA 4BVYB 2CAQA 1QMVA 3OZ2A 1AQWA 1YKJA 2WHDA 4XS4B 3KEBA 2JL4A 2XVEA 3CMMA 4Z2RA 2B9YA 4MP4A 5E59A 1S3CA 2AHEA 2G2QA 1TDIA 4V2NA 2YOIA 2PYXA 4IVMB 2R4JA 2Q0KA 4YT0A 3W8JA 1JOAA 3DH9A 5C3JA 1XG8A 2L5OA 2BS4A 3WT1A 3UKPA 1YF0A 2JB2A 1E7PA 1X9WB 2C67A 2WDUA 1EGRA 3DYRA 3TKSC 3H8LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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