4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
2V3BA 3VR8A 1ZMDA 4FK1C 3VRBA 4NTEA 2HQMA 4X4JA 3NYEA 4AT0A 1LVLA 4YKFA 4Z2UA 2H89A 5U63A 2BC1A 4EQSA 2Q0LA 2XLPA 5U1OA 3ALMA 4U8NA 4PABA 1ZMCA 4ZN0A 5IQ1A 1PBBA 2YWLA 2JB1A 4JNQA 1PS9A 4HB9A 2RABA 3AYIA 4EQXA 3BNMA 5JCNA 2BCGG 4KPRA 1BWCA 1CJCA 5ER0A 1V59A 2F5ZA 3CNTA 4J34A 3DK8A 2V60A 4DSHA 2XFQA 3DA1A 3NH3X 1PXAA 2X8HA 3CGEA 1IUWA 2BK4A 4WCTA 2GQFA 3RP7A 1JU2A 1PHHA 3AE9A 1N4UA 1VQWA 4CRTA 2A8XA 2WOWA 3CNPA 4KX6A 1Y56A 5C3JA 1H86A 2C76A 2GF3A 3DJJA 1DODA 4U8JA 3PVCA 4OPDA 3QVRA 5JCLA 2EQ9A 3UP5A 1EL7A 1D4EA 2DKHA 3GRTA 1PJ5A 2VQ7A 4Z24A 2Q0KA 1NHRA 3LZWA 4EIPA 4PAAA 2BABA 1GERA 4JN9A 3Q6JA 3F8PA 4I58A 4B64A 2GMHA 4H2NA 5M10A 1CC6A 3NYFA 3NK0X 2YVGA 1GRGA 1CF3A 2OALA 1CC4A 2C70A 2YVFA 2VVLG 4X9MA 3UOZA 5BVAA 1GNDA 4FX9A 4Y4MA 1LV0A 3UOXA 4ADWA 3GDNA 3NIXA 2BXRA 4AP1A 2X3NA 1K0JA 4REKA 1YQ3A 4RG3A 1E39A 1GT8A 1CC2A 1GRTA 1QLBA 1D7YA 1K4QA 1N4WA 2YQUA 2GR3A 2X8CA 3AEFA 4Z25A 3IF9A 4Z26A 3ICRA 2Y6RA 1ONFA 3BHFA 4A9WA 4A99A 3P4QA 3SGLA 1GTEA 3H8IA 3O0HA 1AOGA 5KVIA 1JNZA 4K5RA 5TR3A 4EMJA 2R4EA 2WPFA 2YLXA 1GOSA 1ZX9A 2C3DA 4YSHA 2V6OA 2QA1A 1REOA 1PBCA 1LTXR 2Q7VA 3ATQA 4XXGA 5KRQA 2AAQA 2BK3A 3BI5A 3COXA 4IA5A 4TM0A 1OJTA 4OPGA 1NHSA 2WP6A 3UP4A 3L1RA 2B9YA 4H2QA 3QSEA 4J36A 4JDRA 4NEWA 4AOSA 4BURA 4IV9A 1M6IA 1JEHA 1BGNA 3DJDA 4C74A 1TDFA 4OPLA 4YWOA 5EB4A 4BK3A 1P2EA 2CFYA 3S5WA 2YG6A 3UCLA 5FS8A 1FECA 1DOBA 1H6VA 3II4A 4DSGA 2YLSA 3KU9A 4J57A 4U8MA 1TDNA 4C77A 1ZKQA 4NTDA 3HZLA 2BS2A 1ZK7A 3AD8B 2IVEA 4XWZA 4YTNA 3QVPA 2WDQA 3AE1A 4C3YA 2QA2A 1DJQA 5FS6A 3SM8A 1O5WA 2Z5YA 3V3OA 3DK4A 2C66A 2CVJA 1LQTA 3AE4A 1QJDA 2ZZ0A 4CY8A 3QSMA 4LU6A 1F8RA 4A7AA 2GR0A 1GXFA 4H4SA 5KVHA 3CIRA 3F8RA 3FIMB 1H82A 3S61A 2XLUA 4ECHA 2WDVA 4TM4A 1Q1RA 3GMCA 4C3XA 4I59A 4OPCA 1GETA 3I3LA 1CJ4A 4YTMA 1E6EA 2YLRA 2VVLA 3UKFA 1TDOA 2YLTA 4TLXA 1IJHA 3ALLA 4H4UA 3LZXA 2CDUA 4H4XA 3I6DA 4A79A 4AOXA 1KNRA 1Q9IA 5L46A 2R0PA 1B4VA 2OAMA 4A6NB 2XCGA 3UKQA 2TPRA 3ADAB 2ARDA 3EAOA 4B68A 1ZOYA 2VRLA 5CKUA 4EQWA 1KF6A 4IVOB 3T37A 2JB3A 1GESA 3DJEA 2YR6A 3CN8A 4DGKA 1CL0A 2WOIA 1ZY8A 4NEVA 1GREA 2CULA 4GDPA 2RGOA 4GR1A 3BHKA 2BS3A 3FG2P 1JRZA 3K7QX 5BULA 1PBEA 4H2RA 2PHHA 2C3CA 3BNUA 4IVMB 4AP3A 2VRMA 2YG7A 2YG3A 3M0OA 3UKPA 4JNAA 1RSGA 1DOEA 2VVMA 3NTAA 1L9DA 3NT6A 1GPEA 4U8OA 1EL9A 1L9EA 1PDHA 1KSSA 1TDEA 1VRQB 4RG4A 2NPXA 1FOHA 4OPTA 1XANA 3AWIA 2EQ6A 1PJ6A 3NHOX 4B65A 1BF3A 1L9CA 3IHGA 2JK6A 3K30A 3AE6A 3CGBA 2C65A 2GVCA 4J56A 1YQZA 3WE0A 3P4PA 4CNJA 2BA9A 1PBDA 4J2WA 4K22A 2GH5A 1B8SA 5GSNA 4BJYA 2B9WA 3QFBA 4ICYA 3CPIG 1EL8A 4OPUA 4D03A 1ELIA 3BI4A 3GMBA 1NG3A 2R45A 5FS7A 4H4TA 4CCRA 5KOXA 5KXJA 2XVHA 4EQRA 2V5ZA 2JB2A 2BYBA 1DJNA 1GRAA 1SEZA 3RP6A 3SFDA 4CBQA 5HXIA 4K2XA 2XVEA 5IQ4A 1K0IA 3DK9A 1OJAA 4HA6A 1F8SA 3ZDNA 3KLJA 3JSKA 4B67A 4IA6A 3V76A 4BJZA 2GRTA 2VQBA 4H4RA 1FCDA 1Q1WA 3URHA 1GTHA 3K7TA 2C7GA 2R46A 3H4KA 1FEAA 1YKJA 3DGZA 5BUKA 3QJ4A 1NAAA 2Q6UA 3M13A 2ZZCA 3RHAA 2GEWA 1JRYA 2YG4A 3UTGA 5JCKA 5KOWA 3P9UA 2JBVA 2OLOA 1NHQA 5GRTA 1E1NA 3KD9A 3NYCA 3LOVA 3AE2A 3AYJA 2DKIA 1XDIA 4GUVA 4WX1A 4APNA 1GV4A 4UDPA 2BCPA 1NHPA 3CPJG 1IUTA 2GB0A 5M0ZA 1IUVA 3AXBA 3GRSA 1NDAA 1TDKA 3R9UA 4U2SA 4U8LA 4U8PA 1PXCA 4H50A 4YXDA 1EBDA 1PJ7A 5FMHA 1D7LA 3ICSA 3REDA 3C96A 4U8IA 5EOWA 1DXLA 2ZBWA 1NENA 1LPFA 3QSSA 2YG5A 1PN0A 2A87A 1LQUA 2JAEA 3KPFA 2FJDA 2WESA 4UDRA 4BK2A 5IPYA 2C72A 4P9SA 3AD7B 3G5QA 3G5SA 3H8LA 2X99A 2X50A 1D5TA 2XFUA 2YM1A 3KA7A 2C64A 1YQ4A 2BACA 3CGDA 4H7UA 1IUUA 3E1TA 5HY5A 2YLWA 4UP3A 1L0VA 4NZHA 3GYJA 4YSYA 1FEBA 3UKLA 4O5QA 1X31B 2WPEA 3LJPA 1BKWA 4MJWA 1CHUA 4UDQA 4OVIA 1S3EA 4YT0A 5EB5A 1GEUA 2QAEA 3NLCA 3UTFA 1CJ2A 4YKGA 3GD4A 3B3RA 4YTPA 1YY5A 3ICTA 2GR1A 2WPCA 3AEBA 2GQWA 4O5UA 5J60A 3QFAA 2E5VA 1E1MA 4LA1A 2WP9A 4U2LA 2ZZBA 3D1CA 3NG7X 3FMWA 2C73A 3CPHG 4JQ9A 3L8KA 1W4XA 2IIDA 2APGA 2WU5A 4C5OA 3NRNA 1GRHA 3AE8A 2B7RA 4EMWA 1MOKA 2BS4A 3VRAA 1COYA 3OZ2A 2XVIA 3AECA 1NEKA 4H4QA 2XFNA 1GRBA 1Y56B 3NTDA 4M52A 2YR4A 3UOVA 3Q9TA 3D8XA 1KFYA 3BI2A 1N1PA 2YAUA 2QCUA 2Y6QA 3ATRA 3AYLA 3DMEA 4FK1A 1XHCA 2B76A 2O9ZA 1OJDA 2B7SA 2XVFA 3PS9A 3CGCA 1CBOA 4H4ZA 3V3NA 4H4PA 4Z2TA 1JOAA 3AEAA 3RP8A 4A5LA 2WS3A 3G5RA 1QO8A 3F8DA 1O95A 3IWAA 4JY2A 5J7XA 4CCQA 4GRTA 2W0HA 3GDPA 2XYOA 4D04A 1BZLA 1RP0A 2YLZA 3UKHA 1Z6LA 3NNEA 3P1WA 4N9XA 1LJ1A 1N4VA 3EANA 5DBJA 3GWFA 4BK1A 4U8KA 1VG0A 2GMJA 2WBAA 1BGJA 2WU2A 4USQA 2FJAA 4H2PA 1NPXA 3FPZA 2I0ZA 4DNAA 3GSIA 2RGJA 2AR8A 2E4GA 2PYXA 4CY6A 2V61A 4U2TA 3KKJA 3OC4A 2J3NA 4A6NA 1O94A 1JRXA 3AE7A 4GF7A 1F3PA 5FS9A 2JKCA 1E1LA 3CNJA 4K5SA 4K7ZA 4TM1A 1OJ9A 3GWDA 1PBFA 1VDCA 2XLRA 4J31A 3DGHA 2OA1A 5KWFA 2WQYA 2XVJA 3VR9A 1DOCA 3CTYA 1FL2A 2BK5A 3NN0X 4RSLA 2XLTA 1H83A 4J33A 2H88A 4B66A 2GV8A 2V3AA 2VZ2A 3P4SA 3IC9A 4GCMA 5EBKA 1E7PA 1KNPA 2IVDA 4CNKA 1PXBA 3AB1A 1S3BA 2A89A 4BV6A 5C2TA 2YM2A 2XFOA 3C4AA 1TYTA 3SFEA 3GYIA 3KVEA 1KDGA 2WEUA 2WETA 4H4WA 5LV9A 1HYUA 3RNMA 3EPTA 3NKSA 2BC0A 4TM3A 3AEGA 1RYIA 2FJBA 4FDCB 1B37A 1K0LA 2BXSA 1ZDLA 3UKKA 1XPQA 3CNDA 1KSUA 2B9XA 2E1MA 3LB8A 4EM4A 1GALA 3PO7A 1NG4A 4EM3A 2AQJA 3VQRA 1E1KA 1F8WA 3AE5A 2R0CA 4XWRA 1MXTA 2WDRA 3K7MX 3NK1X 4K8DA 2UZZA 3CNSA 1H7XA 3UTHA 5U25A 4B1BA 4OPIA 2XDOA 1CJ3A 2EQ8A 1UKVG 1GSNA 1H84A 1Y0PA 1M64A 2Z5XA 3C4NA 5HYMA 4LIIA 2FJEA 4OCGA 4EIQA 1OJCA 2R4JA 5HHFA 2NVKX 3P4RA 5BRTA 3DH9A 3ALJA 4AT2A 1S2YA 3B6DA 4YSXA 1D4CA 2EQ7A 4YSZA 1B5QA 4Z43A 3ABVA 3IHMA 3UTEA 4USRA 2WHDA 3NGCX 2GR2A 2TMDA 3GD3A 1TYPA 2R0GA 2FBWA 1IUXA 1F6MA 1VG9A 2XLSA 4A65A 4NTCA 3M12A 5JCIA 1ZP0A 3LADA 3ZYXA 2GAGB 4ZCDA 4B69A 4B63A 3EF6A 4GDEA 3ITJA 1DNCA 4JY3A 2XFPA 2YVJA 3FBSA 4Z2RA 4H4VA 3AEDA 4X9NA 5CQFA 3AD9B 3NK2X 1H81A 1JNRA 2VOUA 4E0VA 4Z44A 3UKAA 1ZOVA 2C75A 3AEEA 2X8GA 2RGHA 3ISHA 1MO9A 2R9ZA 3UOYA 1D4DA 2WP5A 4H4YA 2YR5A 4EMIA 3AE3A 2WOVA 1P2HA 3NN6X 3DJGX 5JCMA 4Y4LA 1H7WA 2C67A 4TLZA 4ZCCA 3VRDB 2OLNA 2ACZA 1GRFA 1TRBA 2GAHB 1IUSA 1S2QA 4Y4NA 3LXDA 3SQPA 1EL5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GH9A 4IJIA 1EP7A 2DC5A 4FK1C 2FA8A 3VRBA 4NTEA 3NYEA 4AT0A 2FA4A 6GSVA 3LW9A 4EQSA 6GSYA 4JEDA 1XWAA 4ZN0A 3R2QA 4KB3A 5EVOA 3IXRA 3HVSA 4HB9A 4PUFC 1BX9A 4BPYA 4BVXA 3ZRDA 4J34A 3DK8A 3GKKA 4DSRA 2VAFA 3NH3X 2GDRA 1JU2A 3P7XA 2VL2A 4LMVA 4ECCA 3GTUB 4OO4A 3SY4A 2C76A 3T2ZA 1DODA 3O6TA 3UP5A 1ERVA 1PJ5A 1Z7PA 2Q0KA 3T2YA 3FYGA 2CVKA 2JZTA 4AF2A 2BABA 3BOAA 2KLXA 4X1UA 5HR1A 2H01A 2C0FA 2YVGA 2OALA 1CF3A 1CC4A 2C70A 1GNDA 4FX9A 1LV0A 2BXRA 2X3NA 1E39A 4GLTA 1CC2A 1QLBA 4ML6A 2WULA 3IE3A 3C1SA 3L0HA 2JZSA 3D21A 4NHWA 3IF9A 3ZMKA 4IP1A 3CRTA 4TR1A 1PFOA 2HZFA 4A9WA 3M9KA 4G0LA 1GTEA 3H8IA 1AOGA 5TR3A 2MMNA 2R4EA 1N8JA 3IA1A 1GOSA 5IMDA 4F2IA 4YSHA 2V6OA 3QAVA 4DSQA 2Q7VA 1X0RA 2AAQA 3BI5A 4IA5A 2LRTA 3KIJA 2GSTA 2DIZA 1GWCA 2WP6A 3IAM2 4NEWA 2B9YA 4AOSA 5H5RA 3HZ8A 1M6IA 3UVHA 1JEHA 5B7CA 4C74A 1TDFA 4I97A 2IMFA 4V2LA 1PL2A 1DSBA 3O3TA 1DOBA 3I69A 4J57A 1TW9A 1TDNA 2BS2A 1ZK7A 1G0TA 1XVQA 2P31A 1SENA 1DJQA 5FS6A 3SM8A 2Z5YA 1WE0A 3AE4A 1LQTA 1QJDA 2OE3A 4CY8A 5A5KA 1F8RA 4A7AA 2GR0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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