4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
1FCDA 1FEBA 2TPRA 1OJDA 2WDRA 2A89A 3I3LA 1XANA 4MJWA 4B63A 3DMEA 1DJQA 4N9XA 3D8XA 4H4YA 3VQRA 2XVEA 3SGLA 2TMDA 2C70A 2V60A 2VVMA 2AR8A 1CJCA 3DJGX 1FECA 1S3EA 3HZLA 3UOZA 1K0LA 1K4QA 3BHFA 4TM4A 5KWFA 3UKHA 1L9CA 3P4QA 3URHA 3DA1A 2CULA 4FK1C 1OJ9A 3NIXA 1YKJA 3ABVA 1PXCA 3AE9A 1YQZA 1D4DA 2BK3A 4RG3A 2GR3A 2WQYA 4WCTA 2BC0A 4TM0A 2WHDA 2YG5A 3P9UA 2C73A 1GOSA 3AEFA 4AOSA 4APNA 1ZKQA 1CBOA 3GYJA 4NEWA 2Y6RA 4BK2A 2YQUA 3FG2P 4U8NA 1W4XA 2Q7VA 2Z5YA 2OLOA 1GREA 4U8MA 3DK4A 2BK4A 3K7QX 2Q6UA 2YG3A 5LV9A 2WESA 4UDRA 5FS9A 2WETA 3AB1A 5KRQA 2BYBA 4EMWA 1GRTA 5IQ1A 1P2EA 2EQ7A 3NYCA 4GDEA 1FL2A 3QSSA 1QLBA 3K7MX 1IUWA 5KVIA 3DJDA 3NKSA 2YVJA 1NG4A 4BK3A 2CVJA 2XFUA 1CC4A 3ALLA 2WOVA 3BHKA 3UKFA 4ZCDA 4IA6A 3QFAA 5EB4A 4H2QA 5U63A 1CJ3A 2GF3A 3VRDB 4A7AA 4NTCA 1D4EA 4ZCCA 3GMBA 4J57A 1IJHA 3CNSA 3RP6A 4B66A 2X3NA 1EL7A 1IUVA 5CQFA 4ZN0A 2F5ZA 2X8HA 4LIIA 4Y4LA 4YXDA 2E1MA 1PBBA 3ADAB 4H4UA 2R0PA 2QCUA 2DKIA 3CNJA 4CNJA 1ZOYA 1PHHA 2V3BA 2XLUA 5ER0A 1PBFA 5FS8A 2A8XA 3VR9A 2ZZCA 1NHSA 5JCMA 1QJDA 1KNRA 2XVJA 2XFQA 5HYMA 1IUTA 2YLRA 3ALMA 2WDQA 1E1MA 5C2TA 4FX9A 1F8WA 1GTEA 3B6DA 2WOWA 2JBVA 5KOWA 5JCLA 3I6DA 3AE1A 1OJCA 2IVEA 1E1KA 2FJBA 4CNKA 1GRBA 1F8SA 2BC1A 4B64A 1CF3A 4Z25A 3LXDA 1NHPA 1DJNA 1H82A 4J33A 4EQXA 1GESA 2RABA 2E5VA 1GNDA 1PS9A 4EM4A 1GEUA 3CPJG 2YR4A 2GAHB 3AEEA 1JNZA 1LV0A 4YKGA 4BJYA 1CHUA 2CFYA 3NK0X 2YAUA 4Z44A 4DGKA 2E4GA 2JAEA 4U8JA 3KKJA 4A6NB 4HB9A 5IQ4A 4GR1A 5JCNA 1H81A 4USQA 5FS7A 4Z2TA 3CGEA 3IF9A 4OPUA 3UCLA 4H2PA 4YSZA 4U8OA 4D04A 2FJEA 1Y56B 3UOVA 3NK2X 2IVDA 3CNDA 3UOXA 1E1NA 3M0OA 5M0ZA 3CNPA 1Q1WA 4EIPA 3B3RA 3P1WA 2X8CA 4YSHA 1TDEA 3UOYA 4RG4A 1CJ4A 3NLCA 3SFDA 2YG4A 2BABA 3C4AA 2OA1A 3ITJA 2BK5A 4BK1A 3F8PA 1TRBA 1Y56A 2WOIA 1PDHA 4USRA 3AE2A 3DH9A 3GD3A 4JQ9A 1E1LA 2R9ZA 2XLRA 4KPRA 4OPTA 4TLXA 3RP7A 1GRFA 1PXAA 3GWFA 3NGCX 2BS3A 2GH5A 2HQMA 2YG7A 3P4PA 4XWZA 1ZY8A 3NNEA 2ARDA 2NVKX 4EIQA 2NPXA 4H4TA 1E7PA 4O5QA 1ZMDA 2JB3A 1S2QA 3IHMA 4CRTA 4P9SA 1PJ7A 2Z5XA 4FDCB 3KLJA 2VRMA 1OJTA 3PVCA 4YSYA 3S61A 1GSNA 1L9DA 4K22A 3BI5A 3L1RA 1Q9IA 1K0JA 2XFNA 3V76A 4GUVA 4IVMB 4C3YA 1DODA 2WPCA 2ZBWA 3GWDA 3NTDA 1JRYA 4AOXA 2C76A 4AT2A 1MO9A 1VQWA 3AD9B 1B5QA 1NG3A 4J36A 2XYOA 4JN9A 2WPFA 5GSNA 3S5WA 1CJ2A 2WPEA 3NG7X 1VRQB 1NHRA 2GQFA 4EMJA 2WU2A 1EL8A 3CPIG 3D1CA 1VDCA 3ICSA 2JB2A 4OPIA 3P4SA 2QA2A 4IV9A 1B4VA 1YY5A 3AE7A 4JY3A 3SM8A 2WU5A 2VZ2A 3UTFA 3ICRA 1BZLA 4NTEA 1FOHA 2YLTA 3REDA 3ATQA 4UDQA 1TDOA 1ZMCA 4C77A 1FEAA 2FBWA 3EPTA 1Y0PA 3VRAA 2GRTA 3C96A 3NHOX 3CNTA 3AD8B 1NEKA 3H8LA 1XDIA 4YKFA 3V3NA 1O5WA 4Y4MA 1LVLA 2PYXA 3KU9A 4H50A 4U8LA 4Y4NA 4YTMA 1D7LA 4H4PA 2J3NA 4BV6A 2JK6A 3AECA 1JU2A 1DXLA 1H7XA 1L9EA 2QAEA 4U2LA 2XFPA 3NYEA 3NYFA 2GR2A 3EANA 3AEAA 1Q1RA 2R46A 1N4VA 1JRZA 2IIDA 3AEDA 3RNMA 2BS4A 4YWOA 3IHGA 1PXBA 3GYIA 3QSEA 5EBKA 4NZHA 4J31A 3CGDA 1BGJA 3QVPA 1EBDA 4LA1A 5C3JA 3AEGA 3LJPA 4XWRA 2YWLA 3GDPA 4HA6A 4JNAA 3LZWA 3M12A 4BJZA 1BF3A 1ZDLA 4YSXA 4O5UA 3KPFA 3AE3A 2XLSA 2GQWA 2A87A 2AAQA 1RYIA 2YLSA 1P2HA 4JY2A 4B68A 4FK1A 1TYPA 2YVFA 2H88A 1ZP0A 3BI2A 2XVIA 4Z43A 1GERA 4C74A 3ALJA 4IVOB 2XCGA 1F3PA 4TM3A 2B7RA 3RHAA 3RP8A 1E39A 2DKHA 2ZZBA 2XFOA 3QSMA 2VVLG 3T37A 2OALA 2WP9A 3Q6JA 5CKUA 3UTGA 2B9WA 2UZZA 4WX1A 3UTHA 4CY8A 1GTHA 5HXIA 1EL5A 5BULA 2YG6A 3F8RA 3UP5A 1CC6A 2YLXA 2H89A 1RP0A 1V59A 2GMJA 1H83A 3GMCA 5HHFA 4U2SA 2GAGB 3H8IA 1IUXA 1JNRA 4JNQA 4TM1A 1N1PA 4CY6A 1GALA 2B9XA 2WBAA 2RGJA 3SQPA 4EQSA 4Z26A 2JKCA 1VG9A 4PAAA 1PJ5A 2YM2A 1GRHA 1GXFA 4H4VA 4I59A 3AXBA 3CPHG 4A99A 2QA1A 3FMWA 3UKKA 5KOXA 2VQBA 3LZXA 2X50A 4U8IA 3VRBA 4EQWA 1ZK7A 3AD7B 3CN8A 1PN0A 1PBEA 1H6VA 2XDOA 3JSKA 3FBSA 1JRXA 3AE8A 5HY5A 3BNUA 3CGCA 4ECHA 5JCIA 5EOWA 2YR5A 1IUUA 5JCKA 3O0HA 2XLPA 3UKAA 2YLZA 4A65A 4B1BA 4K5SA 4U2TA 1O95A 3II4A 4GF7A 2BS2A 2GR1A 2VQ7A 2WP6A 3Q9TA 4OPLA 2GMHA 1NDAA 1MOKA 4AT0A 3CTYA 3AYIA 2B9YA 1JOAA 3NTAA 4NTDA 5IPYA 3NH3X 1H7WA 1EL9A 4A9WA 2X99A 3R9UA 1DOCA 5U25A 3ISHA 2B76A 3ZYXA 2C3DA 2RGOA 1DNCA 3K7TA 4U8KA 3AWIA 3UKLA 1BWCA 1N4UA 5DBJA 1KF6A 4H4WA 3G5SA 4D03A 3DJJA 4B69A 4C5OA 5KXJA 2GEWA 2R4EA 5J60A 3SFEA 4CCRA 5BRTA 4E0VA 2C66A 2C75A 3KD9A 3AE6A 1KNPA 2C7GA 2VVLA 1LTXR 4H4ZA 1VG0A 2BACA 3H4KA 4DSHA 2XVHA 4X9MA 5TR3A 4DSGA 2R0GA 3NN0X 4J2WA 1KSSA 1YQ4A 3AYLA 3DK8A 2WP5A 3PO7A 1N4WA 1Z6LA 3AE5A 3GRSA 2C64A 3PS9A 3FIMB 1KSUA 2OAMA 3E1TA 3ZDNA 5FMHA 5KVHA 3OC4A 3DK9A 3BI4A 1D7YA 1ONFA 4ADWA 1HYUA 4K7ZA 4AP3A 3DJEA 3BNMA 1IUSA 1QO8A 1H86A 4Z2RA 2AQJA 3KVEA 4OCGA 3ATRA 2BA9A 3IWAA 4A5LA 4PABA 4IA5A 4XXGA 3NN6X 2GR0A 1TYTA 1B8SA 1LPFA 4JDRA 3V3OA 2X8GA 4B67A 1PJ6A 2GVCA 3QJ4A 3QFBA 2WS3A 4OPDA 2FJAA 4H2NA 1BKWA 2Q0LA 4H2RA 1UKVG 4OPCA 2BCPA 1S3BA 2C67A 2O9ZA 4K8DA 3P4RA 3LB8A 5GRTA 4YTNA 4RSLA 2BXRA 4Z2UA 1JEHA 3DGHA 2EQ6A 4NEVA 4KX6A 1ZX9A 1PBDA 1RSGA 4GRTA 4AP1A 1GV4A 3COXA 2YM1A 5BUKA 3GD4A 4Z24A 2R0CA 1M64A 4A79A 4TLZA 2V6OA 4CCQA 4GDPA 3QVRA 1LQTA 3FPZA 2XLTA 5J7XA 3K30A 3F8DA 2Q0KA 2R45A 2I0ZA 3M13A 4REKA 5BVAA 3AE4A 2C3CA 1KDGA 4M52A 2JB1A 2EQ8A 2GV8A 3ICTA 1D4CA 5M10A 2ZZ0A 4I58A 2CDUA 4OPGA 4YTPA 4EM3A 1YQ3A 1GPEA 3OZ2A 4H7UA 1KFYA 1S2YA 1LQUA 1ELIA 2V61A 1BGNA 3LADA 4X9NA 1OJAA 3NRNA 2BCGG 1PBCA 4ICYA 1NHQA 4J34A 5EB5A 4K5RA 2C72A 2YLWA 3CGBA 1X31B 1TDFA 4U8PA 4EQRA 4C3XA 2V5ZA 3EF6A 4UDPA 3VR8A 1TDNA 1L0VA 2BXSA 5U1OA 1GRAA 1GT8A 2YR6A 2WEUA 1B37A 1F6MA 1GETA 1NPXA 2C65A 2RGHA 2V3AA 1XPQA 4H4RA 4X4JA 3NK1X 4BURA 1GRGA 1DOBA 2APGA 2FJDA 4H4QA 1DOEA 4LU6A 4CBQA 1H84A 2ACZA 4EMIA 3AYJA 1M6IA 3LOVA 1E6EA 1TDKA 3CIRA 3WE0A 2W0HA 3DGZA 3GRTA 2Y6QA 3UP4A 1LJ1A 3KA7A 4J56A 1SEZA 2R4JA 4H4XA 4UP3A 3UKPA 3GSIA 2WDVA 4YT0A 1MXTA 3IC9A 2B7SA 4GCMA 4A6NA 1F8RA 1ZOVA 2EQ9A 2GB0A 4H4SA 1D5TA 3UKQA 1K0IA 3G5QA 4B65A 2OLNA 1NAAA 2VRLA 3L8KA 3AEBA 1COYA 2VOUA 3UTEA 4K2XA 1O94A 3EAOA 1REOA 1CC2A 1CL0A 2YVGA 2PHHA 5FS6A 4DNAA 3NT6A 3G5RA 1XHCA 3C4NA 4OVIA 5L46A 1AOGA 3GDNA 1NENA 2XVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2TPRA 2LRTA 2A89A 2V1MA 3AY8A 2HRKA 4PQ1A 1ERVA 4TR0A 3D8XA 4PTSA 2TMDA 2B7JA 4FIWA 20GSA 3PPUA 3UOZA 1K4QA 3BHFA 3RBTA 3E0UA 1G7EA 2MYGA 2CULA 3ZIJA 1AAZA 1YKJA 1SKRB 1PXCA 1YQZA 3ZTLA 3GSTA 2YG5A 1GP1A 2CZ2A 4AOSA 4PX1A 1CBOA 2H6YA 1W4XA 3DK4A 3FYGA 2BK4A 2Q6UA 1AW9A 2O87A 3TRQA 3WD6A 2WETA 1UA5A 3F3RA 2EQ7A 4GDEA 1RW1A 1FL2A 1OC3A 1ERTA 1K0CA 3DJDA 3NKSA 1NG4A 1CC4A 3ALLA 3ZITA 5HR1A 1JZRA 5EB4A 3M3MA 1CJ3A 2FUG2 2H0IA 2PMTA 1PD21 2X3NA 4MZCA 2EIOA 2F5ZA 3G7YA 4YXDA 3IXRA 2E1MA 1PBBA 3ADAB 1XOAA 1K3YA 1AQVA 2KP1A 1ZOYA 3GRXA 1WIKA 4BVYA 1NHSA 1QJDA 2YLRA 4N10A 3IR4A 1F8WA 4XIHA 1PA3A 5B8AA 4IQAA 5G5FA 2VUPA 3AE1A 3OR5A 2JZTA 2IVEA 2FJBA 1T7PB 1GRBA 3LXDA 3W8JA 3QDNA 2MZCA 4CDOA 3F3QA 4EQXA 3U6VA 2RABA 2WS2A 4BWQA 1GNDA 3GFKA 3RPPA 1O8XA 2X49A 2BRAA 2LNSA 3QAVA 4BJYA 1KNGA 3NK0X 4DGKA 1O8WA 4MJCA 4HB9A 1H81A 4G74A 4Z2TA 1R7HA 2GZYA 4YSZA 4U8OA 2IFQA 1QUWA 4EDZA 2IVDA 3T0KA 3CNDA 5DQSA 4K7NA 3CNPA 3M0FA 3P1WA 2K18A 2RM5A 3UOYA 4RG4A 1EOHA 3SFDA 2BABA 4PNFA 1G6YA 5ECKB 3FR9A 3NIVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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