4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
2GAHB 1EL5A 3CNTA 1Y56A 2VRMA 2TMDA 5EOWA 2IVDA 1OJAA 1Q1WA 3ICTA 1NG3A 2X3NA 4ZCDA 3IF9A 1BWCA 1S3EA 2X99A 1CHUA 5JCIA 1ZP0A 3RHAA 1L9DA 2WDRA 3NIXA 3RNMA 1F8SA 1ZKQA 1FCDA 3AXBA 2C72A 1DOBA 2APGA 2Q0KA 2YWLA 2C66A 2C65A 2FJBA 2YG7A 1JRZA 1GSNA 3QJ4A 3VRDB 4AT2A 1N1PA 2XLSA 2PHHA 1OJCA 2GRTA 1PHHA 2DKHA 2WDQA 3DMEA 3NK0X 2TPRA 4REKA 2OALA 1P2HA 5CQFA 4NEVA 2WP5A 1BZLA 3QVPA 3VRBA 4IVOB 3BHKA 1E7PA 3AE4A 3NYEA 4OCGA 2XVEA 2YAUA 1ZK7A 4H4VA 4J2WA 2WHDA 4NTEA 1KF6A 1QLBA 2AR8A 3UKKA 3LZWA 4BK2A 5KWFA 1GRBA 1YQ3A 1GT8A 3ABVA 5DBJA 3P9UA 1K0IA 3H4KA 2GB0A 1PDHA 3ADAB 1YQZA 2YVFA 5M10A 1B8SA 1F3PA 2YG3A 2YLWA 1EL8A 2R0PA 2OLOA 2BS4A 2ZZ0A 1GV4A 2BK5A 4FK1C 4J33A 4BV6A 2BCPA 4D03A 1COYA 4CBQA 1JEHA 2YG5A 2YQUA 5HHFA 3CGCA 1RYIA 1TDKA 1XHCA 3AWIA 4JDRA 3UOVA 5JCLA 1E1MA 1H7WA 3ISHA 3AD8B 4GRTA 1E39A 1KSSA 2E5VA 1GOSA 1IUTA 3FIMB 3ICRA 3GMCA 4J31A 4JNAA 5J60A 3GYJA 2CFYA 1CJ4A 1JRXA 1LQUA 3CGBA 3IC9A 4Z2RA 1KSUA 4USQA 2NPXA 3UKPA 2R4EA 2QA2A 4FDCB 1VG0A 3V3NA 1TRBA 4ICYA 3CNDA 4TM3A 4YWOA 5J7XA 2YR4A 3V3OA 3UTEA 4OPUA 5EB4A 3AEGA 3QVRA 3GRSA 4OVIA 1LTXR 3K30A 3P4PA 4J34A 4GUVA 1DJQA 1PBCA 1OJTA 4Z24A 1B37A 5ER0A 2Q6UA 1LVLA 3ALMA 1NPXA 1BKWA 4J57A 3CN8A 2GF3A 2Z5XA 4OPTA 5EBKA 1K0JA 1KNRA 4OPIA 4B69A 4BJZA 2B9WA 2OA1A 3S61A 5LV9A 1F8RA 2GAGB 3C4AA 3DH9A 3V76A 1BGJA 4Z2UA 2GV8A 4J56A 3I6DA 3AYJA 2YVGA 1LV0A 2XCGA 3K7MX 4X9MA 1S3BA 1HYUA 2XLUA 2B76A 3NYFA 2A89A 4H2NA 1ZOVA 3AD7B 1CBOA 3EF6A 2UZZA 4Z2TA 3NNEA 4TLXA 4CY6A 2R45A 3AEFA 1GALA 1RP0A 1CJ2A 4HB9A 1FL2A 2WOWA 2BCGG 3UP5A 5FMHA 1X31B 4A9WA 2C70A 4EMWA 4H4UA 3QFBA 2C64A 4C3XA 3GSIA 3P4QA 3EAOA 1GESA 4XWZA 3T37A 1ZX9A 3AEDA 3RP7A 3VR8A 4B64A 1OJ9A 1N4VA 4H4QA 1H86A 4Z44A 4OPGA 2PYXA 3CPJG 3D1CA 4B68A 4DNAA 1PXBA 1PBDA 3LXDA 3UCLA 1JRYA 3LADA 1IUVA 4U8OA 1NEKA 2C75A 5FS9A 4X4JA 3AYIA 4YXDA 4H4TA 2WPCA 3UKHA 3VR9A 5JCNA 1H7XA 3GWDA 3NYCA 4GDPA 3F8DA 4H2QA 3KLJA 1B5QA 1FEAA 4EQRA 1Q1RA 3PVCA 3AE9A 4JQ9A 4J36A 5FS6A 1GEUA 1M64A 3DJGX 2FBWA 3FG2P 4IA6A 1ELIA 2WDVA 3GMBA 4EQSA 4XXGA 4H4YA 1DOEA 4Z26A 5HY5A 2JB3A 4GF7A 4IV9A 5JCMA 1IUWA 1VQWA 2YG4A 3P4SA 4TM1A 2BXRA 4YSZA 1OJDA 3QFAA 4YKFA 2WETA 5KOXA 5BULA 3AE5A 3S5WA 2DKIA 3G5QA 3GDNA 5EB5A 5TR3A 2WP9A 4A99A 4YKGA 3UOZA 1W4XA 5KXJA 3G5RA 2VOUA 1IUUA 3ALLA 3L1RA 1NENA 1IJHA 1YKJA 2JKCA 2RGJA 4U8IA 4RG3A 4EQWA 2YLSA 4UDPA 1XPQA 2A87A 1NDAA 4A79A 4RSLA 2XLTA 3CPHG 3D8XA 3FPZA 4NZHA 3UTHA 2XFQA 3DGZA 4YTPA 3AB1A 3JSKA 1H6VA 4O5UA 3F8PA 2X50A 1NG4A 3NK2X 3UTGA 1VRQB 1GXFA 2B7SA 3IHGA 1ZY8A 2ZZCA 5GSNA 1ONFA 4MJWA 3GWFA 3DK9A 4A65A 2V5ZA 4YSHA 2I0ZA 3ATRA 5GRTA 1CJ3A 4NEWA 2F5ZA 2VVMA 1PJ5A 2EQ9A 2EQ8A 3WE0A 1VDCA 3ALJA 2Y6RA 1SEZA 1Z6LA 4AOXA 3AEBA 1CL0A 3C96A 5HYMA 4H7UA 4Y4LA 5HXIA 3UTFA 2Q0LA 4UDRA 1GETA 1GRAA 3CGDA 2BACA 2OAMA 5JCKA 3DK4A 3QSSA 3GD4A 4Y4NA 2YR6A 3COXA 3E1TA 1L9CA 4I58A 3SFEA 3UKFA 4DGKA 2YLZA 3AE8A 1GRTA 2ARDA 5M0ZA 1JNZA 4LIIA 2XFNA 4C74A 4BK3A 2GQFA 2C67A 2X8GA 2GR1A 1PBFA 3CNSA 3ZYXA 1NHSA 1DJNA 3EANA 3FMWA 2JAEA 4A5LA 1H82A 4WX1A 3RP8A 1AOGA 3BHFA 1NAAA 1O94A 2CDUA 4UDQA 2WESA 3DGHA 1K0LA 4A6NB 4EM4A 4EMIA 2GVCA 2WOVA 2J3NA 1P2EA 2B9YA 1D5TA 1D7LA 3I3LA 3M13A 4WCTA 3BNUA 4KPRA 3ICSA 2Z5YA 4K8DA 4B66A 1N4UA 2GQWA 3AE3A 4JY2A 3ITJA 1O95A 2YVJA 3LJPA 2H89A 3VRAA 4AOSA 1H83A 3AEEA 4PAAA 3OZ2A 2R46A 2IIDA 4H50A 2WPFA 2WU5A 3NLCA 3KPFA 3P4RA 4YTMA 3ZDNA 3GD3A 1ZMCA 2VQ7A 2QAEA 5KVHA 2VRLA 4YSYA 1H81A 4FK1A 2XVFA 2JB1A 2V3AA 3CIRA 3KKJA 4H4ZA 4B63A 3NH3X 2GH5A 3GDPA 4CRTA 1UKVG 2GMHA 2XFPA 2YM1A 3NK1X 3IHMA 4PABA 4USRA 4OPDA 4CCQA 4LA1A 4H4SA 4U8MA 4GR1A 4BJYA 2WQYA 2BS3A 3DJEA 1BGNA 3M12A 5KVIA 2BC0A 1TDOA 3Q9TA 4ZN0A 3DJJA 4GCMA 4AP1A 2YLTA 1YQ4A 2BS2A 4CNJA 4ECHA 4K2XA 3H8IA 4Z25A 4C3YA 1M6IA 1Y0PA 1IUSA 1REOA 1D4CA 1TYTA 2Q7VA 4U2SA 2XVJA 2E1MA 1DNCA 3P1WA 3LB8A 5U25A 4U8NA 5CKUA 4C77A 4O5QA 1JNRA 4TM0A 4YTNA 1EBDA 4NTDA 2BK3A 1NHPA 1Q9IA 1PJ7A 2EQ7A 2RGHA 1S2QA 4UP3A 2WBAA 2Y6QA 4HA6A 1F8WA 1LJ1A 1B4VA 2AQJA 3PO7A 2V60A 1GPEA 3CTYA 3II4A 3VQRA 3NRNA 1PBBA 2C76A 1GTHA 2JK6A 2XFOA 1CC4A 2R0GA 3CGEA 3F8RA 1FOHA 4P9SA 4U8LA 5KRQA 4YSXA 2C7GA 3NN0X 2BA9A 4IA5A 3SM8A 1GNDA 3AE6A 3DK8A 4GDEA 1DXLA 4EMJA 2GMJA 4H4RA 4OPLA 1TDNA 3AYLA 4APNA 3B3RA 1CC2A 1N4WA 1V59A 1GTEA 2XVHA 1XANA 2AAQA 2FJEA 4AT0A 3AE7A 3KD9A 3H8LA 2WS3A 2YR5A 3DJDA 1LQTA 5IPYA 3GYIA 5FS8A 3NN6X 3K7QX 1EL7A 2YG6A 4A6NA 4A7AA 1D4EA 1E1KA 2IVEA 4X9NA 3B6DA 2BXSA 1MOKA 2BK4A 4JNQA 2GR3A 4YT0A 4XWRA 3QSMA 2WPEA 3REDA 4M52A 2CVJA 4ZCCA 3AE1A 2JBVA 1CF3A 4H2PA 4OPCA 5KOWA 4Y4MA 3RP6A 2OLNA 4C5OA 4U8JA 3KA7A 1PXAA 3NKSA 2R9ZA 3ATQA 4H4XA 1DOCA 2B7RA 5U1OA 4JN9A 1XDIA 4DSHA 2XVIA 4TM4A 1MO9A 3M0OA 3NG7X 3BI4A 5C3JA 4IVMB 2R4JA 5BUKA 1MXTA 2XFUA 4K5SA 2BABA 3NHOX 3SFDA 2X8HA 1FECA 3NGCX 1Y56B 3AECA 4K22A 1E1NA 5BVAA 5FS7A 2C3DA 2VVLA 3KU9A 1PBEA 3CPIG 4H4PA 2BYBA 2CULA 2V3BA 4E0VA 2HQMA 4B67A 3LOVA 1QO8A 2YLRA 4U8PA 4K5RA 4EM3A 3NT6A 2XYOA 5IQ1A 1JOAA 1E1LA 1PS9A 2B9XA 4DSGA 5L46A 1D7YA 3AE2A 1IUXA 3IWAA 5IQ4A 3UKLA 2WP6A 1H84A 2ACZA 2WEUA 1GRHA 3CNPA 1PJ6A 1ZMDA 4LU6A 1ZOYA 1PN0A 4H2RA 1VG9A 2V6OA 1DODA 4Z43A 3CNJA 3KVEA 3BI5A 3EPTA 2GR0A 3QSEA 2BC1A 1QJDA 3SQPA 4BURA 1CJCA 2QA1A 2JB2A 3C4NA 2XLPA 3FBSA 1L0VA 3SGLA 3UKQA 2X8CA 2FJDA 1ZDLA 1RSGA 2XDOA 1KFYA 1KNPA 2R0CA 1EL9A 2FJAA 3DA1A 3K7TA 1K4QA 5BRTA 3BNMA 2GR2A 4FX9A 4D04A 4JY3A 4AP3A 5C2TA 2C3CA 1GRFA 4H4WA 3LZXA 4EIPA 2WU2A 3NTDA 2NVKX 1TDFA 1FEBA 3PS9A 1TYPA 1JU2A 1NHQA 2YM2A 2C73A 2ZZBA 4B65A 1NHRA 4U2TA 4EIQA 1KDGA 1TDEA 3AD9B 4CY8A 3UP4A 4CCRA 4K7ZA 1YY5A 2V61A 4RG4A 2A8XA 3HZLA 1PXCA 2H88A 4B1BA 1GERA 3L8KA 1O5WA 2W0HA 2E4GA 4ADWA 3UOXA 2QCUA 2RGOA 2VVLG 4EQXA 2VZ2A 1GREA 1S2YA 3OC4A 4U2LA 3NTAA 3UKAA 2EQ6A 4KX6A 3Q6JA 2GEWA 4CNKA 2VQBA 3G5SA 4TLZA 1L9EA 1BF3A 2RABA 2YLXA 2XLRA 1F6MA 2ZBWA 3AEAA 1GRGA 3BI2A 3GRTA 1CC6A 4I59A 3R9UA 4BK1A 3UOYA 4U8KA 3URHA 4NTCA 1E6EA 4N9XA 1LPFA 3O0HA 1D4DA 5U63A 2O9ZA 2WOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CNTA 1Q1WA 3ICTA 4II3A 1BWCA 1S3EA 3NIXA 4WR5A 5ECRB 3EYTA 1FCDA 1TDIA 3J7Yb 1DOBA 14GSA 2YWLA 4TR4A 2C65A 1FVJA 4EF0A 4HQZA 2HZFA 4MJCA 5DVBA 2GRTA 2WDQA 2E7PA 4I2UA 4JZQA 1J08A 3DMEA 1WMJA 4PUAA 3F6FA 3DKSA 4OCGA 4IVFA 1YY7A 2XVEA 2YAUA 5CP1A 1ZK7A 1T4ZA 2A4VA 2WHDA 1KF6A 2AR8A 2J9HA 3P8WA 5KWFA 4MH3A 5KEJA 1GRBA 3ABVA 5DBJA 3P9UA 1AQWA 4ML1A 4NMUA 3GX8A 1PA3A 5HQPA 1EOHA 2R0PA 4J33A 1V58A 5HHFA 3CGCA 1RYIA 1XHCA 3UOVA 3AWIA 5JCLA 1H7WA 3ISHA 3WGXA 1E39A 1PX6A 1IUTA 3ICRA 2YCDA 3VWVA 3GYJA 2CFYA 3HYXA 1XVQA 2AV4A 3CGBA 1SKSB 1ZCPA 2NPXA 2R4EA 2QA2A 4PURA 4FDCB 3CNDA 5AN1A 1TU7A 3QOUA 3NIVA 4KF9A 6GSUA 4OPUA 3Q74A 3QVRA 4OVIA 1M9AA 1IYIA 4TXOA 4GUVA 3LORA 1OJTA 4X43A 2DSAA 4YQMA 5JCGA 4DSQA 4B69A 2B9WA 1U6TA 2OA1A 2GAGB 4IJ3A 3ZIVA 4G73A 3K7MX 1LV0A 2V6KA 2XCGA 2MMAA 3NYFA 1J9BA 4H2NA 2YWMA 1TKDB 1K0CA 4OCFA 1GALA 3GKXA 4IQ1A 2ALBA 3GTUA 1NM3A 2WOWA 5FMHA 4A9WA 1J0FA 2VLVA 3P7XA 3GYKA 4C3XA 2OACA 1XW6A 4OWYA 5ELAA 4XWZA 2IN3A 4WEYA 2YJ7A 3C73A 4H4QA 1MTCA 3EURA 4OPGA 2PYXA 4ACSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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