4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
1MXTA 2WP5A 3NTAA 1E6EA 1GERA 2XVHA 1M6IA 2C70A 2UZZA 1PBDA 1NHRA 1ZMDA 2EQ9A 4JY3A 4BK1A 2VVLG 4OPDA 2XLRA 2ZZBA 5U25A 4U8IA 2C64A 3PO7A 3V3OA 1M64A 4TM0A 1REOA 2GR2A 3DGHA 4CCQA 4EMJA 1F8RA 2QA2A 3UKHA 1QLBA 2GEWA 3QSSA 2XFPA 4H4QA 4U8LA 4HB9A 2YLRA 3GMCA 2BC0A 3AE1A 2OLOA 4OPCA 1KFYA 1O95A 1GV4A 3AD7B 3D1CA 4J34A 3NIXA 2C7GA 3UCLA 3GDNA 1VG0A 2BK4A 1NG3A 2V60A 1UKVG 2VVMA 4WX1A 1EL8A 1F8WA 4WCTA 1ZMCA 3HZLA 2XDOA 3DJDA 3DGZA 1F6MA 4GF7A 1D7YA 1OJTA 1XHCA 3QSMA 2ZZ0A 1TDEA 1L0VA 2FJAA 4APNA 2RABA 5EOWA 2IVDA 1H83A 2GR1A 4B64A 1K0LA 2YG7A 3FG2P 1E39A 3LADA 2OALA 2WETA 3S5WA 3LXDA 1L9DA 4ADWA 4BURA 2Z5YA 4LIIA 2WP6A 4NTEA 1MO9A 1RSGA 2WQYA 1S3EA 4HA6A 2WU2A 4NTCA 3P9UA 4X9NA 2C67A 4TM3A 2XLTA 2JB2A 1DNCA 1Y56B 3VR9A 2XLSA 4A7AA 3CNJA 4BK3A 3CPJG 3H8LA 1CC4A 1ZDLA 4USQA 1D5TA 4J31A 2FBWA 2GRTA 1LPFA 3SM8A 4REKA 5FMHA 4U2SA 1K0IA 1DOBA 3DA1A 2C3DA 3SFDA 3REDA 2WDRA 1E1MA 1VG9A 2GR3A 4NEVA 1TDKA 5IQ4A 1CC2A 1H86A 4RSLA 1GOSA 3GWDA 4OCGA 3K7TA 1PBBA 1OJ9A 3ATQA 3NLCA 4C5OA 3F8PA 2YLSA 5BUKA 2V5ZA 3VRBA 4CBQA 5KOXA 4U8KA 1XDIA 2C66A 1NHPA 3K7QX 2XCGA 4Z24A 2JAEA 2CFYA 2WP9A 2XFUA 3QVPA 4U2TA 3URHA 1XANA 2Q7VA 1LQTA 4X4JA 3LOVA 3NN0X 4CCRA 3DK9A 1KF6A 3FPZA 3AE6A 4DSHA 4EQXA 1KSUA 2X50A 2RGJA 4YXDA 1YKJA 2YR6A 3ALJA 3NK2X 2AAQA 3UOYA 3AXBA 4FX9A 4Y4MA 3RP8A 2YVFA 3QVRA 4U8NA 2GQFA 2JBVA 2XFNA 4A6NB 5L46A 1PJ7A 1YQ4A 2B7SA 4U8JA 1FOHA 4E0VA 2GAGB 1D4CA 3AEBA 4UDQA 3H8IA 3B6DA 2YVGA 4ZCDA 4Z43A 4X9MA 1CJCA 1GRGA 3PVCA 4GR1A 3ICSA 1GRAA 3UOZA 4YSZA 1Q1WA 3AEEA 4IVMB 4N9XA 3F8DA 4O5UA 1ZOYA 2B76A 3LB8A 5HXIA 4JY2A 2WDQA 2Y6QA 3NG7X 5HHFA 2WHDA 1YQZA 3AE5A 2ZZCA 4H7UA 1TDFA 1JNRA 2QCUA 3SQPA 1PBEA 4TM4A 2VVLA 4I58A 4K22A 1NHSA 3D8XA 3KD9A 2BA9A 5U1OA 2IIDA 3P4PA 4K5SA 4YWOA 2BACA 2TPRA 3AE9A 3L1RA 5TR3A 1FCDA 1OJAA 1QJDA 2X3NA 1ONFA 3CGBA 1GEUA 3BI4A 2XVIA 2A8XA 3CGEA 3V3NA 1D7LA 3LJPA 5J7XA 1OJDA 4K8DA 2JKCA 3Q6JA 1XPQA 1PBFA 3DH9A 1DODA 4YSXA 5KRQA 1E1NA 2C76A 2WU5A 4BV6A 3CNSA 4C3YA 2BXRA 2GVCA 1DJQA 2BCGG 4EMWA 4XXGA 4YT0A 3AYIA 1SEZA 3NN6X 4H4VA 4YKFA 3GSIA 1BZLA 4IA6A 4PAAA 3ITJA 3GRTA 3NNEA 1GTHA 4FK1C 1E1KA 3AEDA 2QA1A 1PXAA 4A79A 1RYIA 4GDPA 1TYPA 4Z2TA 1CHUA 2VOUA 5KXJA 4B1BA 2YG6A 1D4DA 1GPEA 1FL2A 3IWAA 4RG3A 1GETA 3ISHA 1TRBA 1NAAA 4NTDA 3DJEA 1NHQA 1IUXA 3I6DA 4OPGA 2WOWA 2WDVA 1YY5A 1PS9A 1S3BA 3P4QA 2GQWA 4P9SA 3AYLA 2R4JA 3BI5A 5C2TA 2F5ZA 3T37A 1H6VA 1EL9A 3BNMA 1LVLA 5EBKA 4XWZA 1BGNA 3ZYXA 4AOSA 3R9UA 3G5QA 1GT8A 2PHHA 3GD4A 3UKKA 5KVHA 1ZK7A 4Z2UA 3Q9TA 4B63A 5JCMA 4TLXA 4JNQA 3FIMB 4UP3A 5KVIA 4CNKA 4OPUA 4YTMA 3B3RA 5GSNA 4OPTA 3IC9A 2YG3A 1PXBA 1BKWA 1LTXR 1ZY8A 1JEHA 4MJWA 2H88A 3ALMA 1N4UA 3UTHA 2E4GA 3UKQA 1CC6A 5JCLA 2YLWA 3BI2A 1CBOA 5CQFA 4AP3A 3OC4A 2J3NA 3GMBA 1S2YA 1VQWA 2E1MA 4OPIA 3QJ4A 4B65A 2YLZA 1EBDA 1B37A 2VRLA 1E7PA 1DOEA 4C74A 2YG5A 4Z44A 3UKPA 3CGDA 1W4XA 3AYJA 3VQRA 2XVEA 3UP4A 5IQ1A 4D04A 4YTNA 3DK4A 1QO8A 1DXLA 2ARDA 3S61A 4U8PA 1O5WA 2YG4A 2WOVA 3VR8A 3II4A 4AOXA 1L9CA 2R46A 2X8HA 2WOIA 2A87A 1AOGA 1JOAA 3M13A 1GSNA 1ZP0A 4J33A 2WPFA 3NHOX 1S2QA 4ZN0A 3NRNA 1B4VA 3UKFA 2APGA 2JK6A 2B7RA 2WEUA 5FS7A 3CTYA 4LA1A 2YAUA 2BK3A 3LZWA 4TLZA 5GRTA 3AB1A 1NG4A 1FEAA 2B9WA 3CN8A 2VZ2A 2YM2A 3NTDA 3SFEA 2X8GA 1PJ6A 2Q6UA 4CY8A 2PYXA 3AE4A 3KPFA 3NGCX 5M0ZA 4FDCB 4RG4A 3GYIA 3RP6A 4EQSA 5EB4A 3L8KA 4U8MA 1OJCA 3V76A 3NK0X 3ICTA 1PJ5A 2EQ8A 2NVKX 3K7MX 1CL0A 1ZKQA 4J57A 1IUWA 3IHGA 1GNDA 2B9YA 3LZXA 4USRA 1H84A 2O9ZA 2RGOA 1GESA 4O5QA 1IUUA 4A65A 4BK2A 2AR8A 1NDAA 3EF6A 5KOWA 2C65A 1DOCA 4EMIA 2C73A 2FJEA 2R0PA 1N4WA 4BJZA 3C96A 2YWLA 5JCIA 5J60A 2BCPA 3CGCA 1H82A 2XFOA 5BVAA 1PHHA 1H7WA 1KDGA 1Q9IA 2NPXA 2OLNA 2OA1A 4KPRA 4H4WA 2V6OA 3CNTA 2GH5A 4H4ZA 2V3AA 4H2QA 4Z2RA 2R9ZA 1NPXA 3AE8A 3FBSA 1GXFA 3IHMA 3GYJA 3COXA 2ZBWA 3G5SA 2CDUA 4IA5A 3ALLA 2BK5A 4EIPA 2H89A 1ELIA 4KX6A 2GMJA 1LQUA 3NYFA 4H2PA 3G5RA 1KSSA 3PS9A 4DSGA 2DKIA 1N4VA 4J36A 3CPHG 2EQ6A 3UTGA 3KU9A 2Q0KA 2E5VA 4J2WA 1VRQB 3VRAA 3SGLA 4H4RA 3DMEA 4UDRA 5FS9A 2YR5A 3QFAA 1GREA 4BJYA 2YVJA 3F8RA 3AD8B 1P2HA 2YR4A 4LU6A 4J56A 4GUVA 4AT0A 2DKHA 3AE3A 4H2RA 4DGKA 3DJGX 2WPCA 4JN9A 4JNAA 4U2LA 3CIRA 3ATRA 1H81A 5FS8A 1NEKA 3UTEA 4GDEA 2XYOA 2YLXA 3KKJA 4JDRA 4PABA 5C3JA 3H4KA 1BWCA 3GRSA 1IUVA 2R0CA 1TYTA 2AQJA 5JCNA 5JCKA 1LV0A 2GAHB 4NZHA 3ICRA 3UOVA 2XVJA 1IUSA 3QSEA 5BRTA 4AP1A 4YSHA 5M10A 2V61A 2XLUA 4XWRA 3M0OA 2JB1A 2R0GA 2QAEA 2X8CA 1GRBA 1HYUA 3UTFA 4H4SA 1H7XA 1K4QA 1CF3A 1VDCA 3IF9A 3VRDB 2EQ7A 3WE0A 3NK1X 4JQ9A 1CJ2A 2Q0LA 4C77A 2HQMA 4U8OA 1Z6LA 4D03A 1N1PA 3NKSA 3P1WA 1Q1RA 2GV8A 1PDHA 3NYCA 5DBJA 1DJNA 1LJ1A 4FK1A 3GWFA 1Y56A 3AWIA 3BNUA 4H4TA 1IJHA 2BXSA 5HYMA 3K30A 1CJ3A 3UOXA 1JRZA 2TMDA 3UKAA 1BGJA 1JNZA 4B68A 2BABA 1PN0A 3KA7A 3E1TA 3UKLA 2GR0A 3CPIG 1F8SA 1FEBA 3I3LA 3AE2A 1PBCA 1V59A 3C4NA 1E1LA 2BS4A 3M12A 1B8SA 1KNPA 3FMWA 3UP5A 5FS6A 4Z25A 4IVOB 4YKGA 5HY5A 2X99A 2B9XA 2WBAA 4GCMA 1GRHA 2WS3A 4H4XA 2OAMA 1ZOVA 3ABVA 1TDOA 4H50A 3CNPA 2Z5XA 1GTEA 1BF3A 5ER0A 2YQUA 1F3PA 4H2NA 4Z26A 3QFBA 2VQ7A 1JRXA 4OVIA 1P2EA 4B66A 4B69A 1D4EA 3BHFA 3O0HA 1IUTA 4K7ZA 4EIQA 2YM1A 5CKUA 3EAOA 3GD3A 2GB0A 4K5RA 3CNDA 4M52A 4CNJA 3NT6A 2WESA 4I59A 1KNRA 2GF3A 2A89A 5BULA 2WPEA 2I0ZA 3DJJA 3EPTA 4A5LA 1YQ3A 2BS3A 4A6NA 3AD9B 1K0JA 3NH3X 4DNAA 4H4PA 4IV9A 4C3XA 1TDNA 1NENA 2Y6RA 5EB5A 1O94A 4EM4A 4Y4NA 3RNMA 2CVJA 3AECA 1X31B 4A9WA 3DK8A 4YSYA 3ADAB 2VRMA 2XFQA 4ZCCA 4ECHA 4EQWA 3KLJA 4YTPA 1B5QA 4CY6A 2XLPA 4K2XA 3GDPA 4H4YA 4EQRA 1GRTA 2W0HA 2CULA 5LV9A 1EL7A 3AE7A 2BYBA 4H4UA 4NEWA 2BC1A 2R45A 3JSKA 3P4SA 2FJBA 2V3BA 3RP7A 2C3CA 3OZ2A 1Y0PA 1ZX9A 4UDPA 2GMHA 2R4EA 5IPYA 3AEAA 2C75A 1GALA 2ACZA 2C72A 4TM1A 4Y4LA 2FJDA 1GRFA 4GRTA 4AT2A 4EM3A 1JU2A 2RGHA 3NYEA 3AEFA 3P4RA 1FECA 4CRTA 3BHKA 3RHAA 1CJ4A 5KWFA 1COYA 4ICYA 3C4AA 2VQBA 1EL5A 1L9EA 1RP0A 3KVEA 1PXCA 1MOKA 2JB3A 5U63A 2IVEA 2YLTA 3EANA 4A99A 2XVFA 2BS2A 3ZDNA 4OPLA 1JRYA 3AEGA 4B67A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VPQA 1GUMA 1MXTA 3KZQA 1E6EA 2IFQA 2XVHA 2C70A 1DE2A 2HZEA 2KP2A 2OBIA 4TKYA 2LNSA 3TJJA 4BK1A 1SD8A 5U25A 4U8IA 2C64A 3UJ1A 3V3OA 3F3RA 4KDXA 4OFTA 4K0GA 2WB9A 3L9SA 2XBIA 4F82A 1F8RA 2QA2A 3GFKA 3QSSA 4HB9A 2GZZA 3DEXA 2WCIA 3IC4A 4HQSA 3DYRA 4PQHA 1NG3A 2V60A 4TRXA 4WX1A 1EL8A 1JLVA 3TRPA 2XDOA 3Q18A 4YQMA 4ECIA 1OJTA 1DUGA 1B9XC 3GHAA 1B4QA 1L0VA 5EOWA 2IVDA 13GSA 5HR3A 2OJLA 4B64A 2A4HA 2YG7A 3FG2P 1E39A 3LXDA 1Q98A 4DVCA 1MO9A 4FQUA 3US3A 4BWQA 1S3EA 4NV2A 4NTCA 2L59A 2FCHA 5DBQA 2C67A 4G10A 3G7YA 1A2MA 1QGVA 1DNCA 2XLSA 3CNJA 2VCVA 4WKWA 1CC4A 2MBTA 4L8EA 4USQA 2WDUA 4JR4A 4REKA 5FMHA 1ERUA 4U2SA 5ECHB 4IBPA 3SFDA 1T4YA 2WDRA 1E1MA 4NEVA 5IQ4A 4BIKA 2M72A 4KAEA 1FOVA 1PBBA 5BUKA 1AIUA 3F8PA 1YZXA 2FWFA 2GQLA 2LQOA 5E4WA 4CBQA 1OC3A 1XDIA 3K7QX 2HSMA 3FY7A 2CAQA 2JAEA 1SD9A 2WP9A 4NWZA 2OA7A 1LQTA 1AXDA 2OE1A 4X4JA 2XBQA 4F0CA 3LOVA 2OACA 3SX6A 1QMVA 1TTZA 3AE6A 3DWVA 4EQXA 3PINA 3UBLA 2RGJA 1CQHA 3HYXA 1PX6A 1YKJA 1XVWA 3KTLA 4FX9A 2YVFA 2A4VA 2FA8A 1BQ7A 2AHEA 4J57E 3EMPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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