4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
3EF6A 3DJDA 5CQFA 2GQFA 1JEHA 3AEBA 4KX6A 1CC2A 1KF6A 4J36A 4EQWA 2BYBA 1P2EA 1OJCA 4AOXA 3NT6A 1IUVA 4LU6A 1LPFA 2A89A 4P9SA 4FX9A 2CDUA 5KWFA 5LV9A 4Z2UA 1Z6LA 1PBCA 1YY5A 2FJAA 4OPCA 3GWFA 1ZX9A 5EBKA 2TPRA 1BF3A 1JRZA 1TYPA 3K7TA 4XXGA 1K0LA 4EMWA 1JRXA 3IC9A 2YVGA 1H84A 1CJCA 1JU2A 4B67A 1PDHA 3AE9A 4K22A 4Z2TA 3CNJA 2XCGA 4B66A 1H81A 4EQXA 4EIPA 2GMJA 2OA1A 3AE4A 4U8IA 5ER0A 2V3AA 3CNPA 4OPIA 5HXIA 1F8RA 3P9UA 1IUUA 3JSKA 3P4PA 1NENA 4OCGA 2C75A 2CULA 1FL2A 1KSSA 3V76A 4H4ZA 4H4WA 1D4EA 1IJHA 2WU2A 3II4A 3LOVA 4C5OA 3KVEA 4H4UA 1O5WA 1D5TA 1O94A 1YQ3A 2GMHA 1PJ7A 2WOVA 3LXDA 4DNAA 2XLRA 4Y4LA 2BS3A 2R0PA 4H4VA 1B5QA 2YLRA 4JNQA 3CIRA 3BNUA 4J56A 1DJNA 1M6IA 4YWOA 2JKCA 4OVIA 1FCDA 4FDCB 3D8XA 2B76A 3PO7A 3URHA 3V3OA 1GRHA 1GSNA 3UKKA 1ZDLA 3K7MX 1F8WA 4CY6A 4C77A 4UDRA 1CJ4A 3NKSA 4IVMB 4A6NB 3M12A 1S3EA 2WQYA 4A6NA 2JB3A 3T37A 4REKA 2WOIA 1FEAA 1ZMDA 3F8PA 1BKWA 1AOGA 2XVEA 4EM3A 2BCPA 2QAEA 1KNPA 1LQTA 2B7RA 2VQBA 5FS8A 3FBSA 5KVHA 3REDA 1DOCA 3AYLA 2C3CA 2Z5XA 4YSXA 1ZMCA 2YLZA 2ZZ0A 3ITJA 1MO9A 1VQWA 2XLPA 4U8MA 4UDPA 3UOVA 2GB0A 3COXA 4H2QA 1K0IA 2Q7VA 2WPCA 4ICYA 3DMEA 3AE1A 3IHMA 4TLXA 1Q1RA 1H6VA 2AQJA 5EB4A 1FEBA 2O9ZA 1D7LA 1UKVG 3VQRA 2QA2A 3KKJA 1YKJA 4BJZA 3H8IA 4NTCA 4TM4A 4A79A 2Q0LA 2YVFA 4OPDA 2X50A 3RNMA 4M52A 4GUVA 1XDIA 4NEVA 4B69A 5BUKA 2EQ7A 3SM8A 4U8PA 4I59A 3AE7A 2V5ZA 4K7ZA 1PXCA 1ZK7A 2GR0A 2C65A 3LZWA 4IVOB 3GYJA 5FMHA 3AE8A 4ZN0A 3ISHA 2H89A 3DJEA 1S2QA 4AT0A 1FECA 4J57A 4USQA 1LQUA 3VRDB 1GREA 2XFPA 3ALLA 3S61A 1O95A 1XPQA 1H7WA 4BV6A 4ZCCA 2BACA 3AEAA 4J34A 1Y0PA 3AEGA 3UTGA 1GERA 5C3JA 4BK1A 3UKLA 4CCQA 1BWCA 3DGHA 2C76A 5C2TA 3CN8A 1X31B 4U2SA 2WPFA 1OJAA 3B3RA 1H83A 4N9XA 1IUWA 1CHUA 1NG4A 3BNMA 2B9WA 4C74A 2IVEA 4UP3A 3NK0X 1KNRA 1HYUA 1RP0A 1GESA 2V60A 2XFQA 4A5LA 1DOEA 3QSSA 3GMBA 3KPFA 3Q6JA 2YLTA 2VOUA 1PHHA 1D4CA 2VRMA 4JQ9A 3AEFA 3UOZA 2YR4A 3I6DA 3F8RA 3RP8A 2XVJA 1PN0A 1GEUA 3LB8A 1IUSA 4H2NA 5IPYA 2GQWA 1PXAA 2R46A 2QCUA 3M0OA 3GDNA 2XVFA 4U2LA 3IWAA 4H2PA 4B65A 3NRNA 1E7PA 3NYEA 1BGJA 4EMJA 2I0ZA 3CPJG 1Y56B 4O5QA 1M64A 1Y56A 1GOSA 2YG6A 2YVJA 4YTNA 1ZOYA 2GAGB 5U1OA 4GDPA 4H4XA 3QSMA 4DSGA 3ICTA 2YG7A 2IVDA 3C4NA 3G5QA 3BHFA 3BHKA 3ALMA 2XFUA 4JNAA 1K4QA 4NTEA 5HYMA 1GTHA 1RYIA 4Z44A 1RSGA 4U8JA 2BA9A 2EQ9A 3QVRA 3UOXA 1LJ1A 3IHGA 2YLSA 4USRA 3UKHA 2EQ8A 2GV8A 2WBAA 4NTDA 1MXTA 3CPHG 4J2WA 2IIDA 4I58A 1ELIA 4OPLA 1EL8A 5KRQA 1H7XA 1TDKA 1QJDA 4H4SA 4UDQA 4BK2A 1FOHA 4EQSA 2YQUA 4LA1A 1L0VA 3UKAA 1XHCA 3BI2A 2JK6A 3L1RA 1TDOA 4TM0A 2RGHA 4EIQA 2XFOA 2XVHA 3ATQA 3ATRA 2FJDA 4FK1A 2E4GA 2E1MA 3H8LA 3ICRA 5JCKA 2AR8A 2J3NA 4X9MA 1ZY8A 4U8KA 3UP4A 3UTHA 4PAAA 4A7AA 4B64A 3VR9A 1KFYA 1PJ5A 3DK4A 3RP7A 5M10A 4XWZA 2XDOA 3NYFA 3O0HA 5J7XA 3GSIA 1EBDA 2WHDA 2YG4A 3CGBA 3FPZA 2R45A 1D4DA 1YQZA 2V61A 3NH3X 2WP9A 1GRFA 2R0CA 4B68A 2F5ZA 3NTAA 2HQMA 4A9WA 3NK2X 4H2RA 2VZ2A 2WOWA 2XFNA 3VR8A 4YXDA 3E1TA 4GCMA 4K2XA 2PHHA 3NK1X 1JNZA 2VVLA 1E39A 3FIMB 2XYOA 3NN6X 1TDEA 2VRLA 3B6DA 4H4QA 4EMIA 2JB2A 4Z26A 3VRAA 3AE5A 1PBBA 2C72A 2E5VA 2GR2A 2BS4A 2RGJA 1P2HA 2WPEA 3AE2A 4H4TA 5KXJA 1H82A 4B63A 4YSZA 3AYIA 5TR3A 2WS3A 2XLSA 2CFYA 1TRBA 1MOKA 4TLZA 5JCNA 3NNEA 2WDRA 3PS9A 1E1NA 1BGNA 4AP1A 1BZLA 5KVIA 2GR1A 3UKQA 2XLTA 1F8SA 2Q0KA 3QJ4A 4IV9A 4AT2A 3SFDA 3AE6A 2OALA 4Z43A 3GDPA 1NDAA 3P4RA 3LADA 1B8SA 4CNKA 2VVMA 2XLUA 2A87A 5U63A 5IQ4A 4U8LA 2XVIA 5FS6A 4WCTA 3AD9B 3AWIA 2YG3A 4K5SA 3H4KA 3NGCX 3P4SA 4H4RA 4H7UA 4C3YA 3KA7A 4YTPA 4E0VA 1ZKQA 5M0ZA 3WE0A 4D03A 1DXLA 4PABA 2R4JA 2BK3A 1EL9A 4AP3A 3P1WA 3HZLA 4CY8A 4Z2RA 1B4VA 4JN9A 1GRGA 1TDNA 2WP6A 4CNJA 4Z24A 1TDFA 2DKIA 3AB1A 3AEDA 1YQ4A 1ONFA 3C4AA 4YKGA 4YT0A 2V6OA 2YM2A 5J60A 1TYTA 3V3NA 1VG0A 4YKFA 2X3NA 3K30A 3BI4A 1CJ3A 4APNA 1NHRA 5IQ1A 4MJWA 1Q9IA 4WX1A 1L9DA 3UOYA 5KOXA 1GETA 1GALA 4X9NA 4B1BA 4DSHA 3D1CA 4IA5A 2FJEA 1NHPA 1GPEA 4J33A 1V59A 2BABA 5KOWA 3IF9A 2JB1A 3NLCA 5BRTA 4H50A 4JY3A 4K8DA 2VQ7A 3GD4A 1L9EA 2OLOA 2GH5A 3AXBA 4RSLA 3SQPA 1S3BA 3CGDA 1CC6A 2EQ6A 3CNTA 2APGA 1CF3A 1DODA 3GYIA 3I3LA 2X8HA 3M13A 4J31A 4D04A 2CVJA 1NHQA 3F8DA 2BC1A 3LJPA 1Q1WA 4IA6A 2A8XA 2RGOA 2X8GA 3C96A 3DK8A 4HB9A 4Y4MA 5GRTA 1JNRA 5BULA 4YSYA 3OZ2A 5FS7A 5U25A 3AD8B 4GF7A 2Z5YA 4H4YA 4RG4A 1GTEA 1LVLA 1CJ2A 3UTFA 4CBQA 1PS9A 3QFBA 1N4VA 2WDQA 2W0HA 3DK9A 1PJ6A 5BVAA 3AD7B 3ICSA 2GF3A 5HHFA 4HA6A 4NZHA 4ZCDA 1GRTA 1W4XA 3VRBA 3GWDA 2TMDA 4U2TA 2X8CA 1OJ9A 3UKFA 4X4JA 2OLNA 3BI5A 3S5WA 1E6EA 4U8NA 1PXBA 2UZZA 2BCGG 1VDCA 3UKPA 2YWLA 1NPXA 2BXSA 1B37A 1QO8A 3NTDA 4O5UA 1COYA 2B9XA 4JY2A 4BJYA 1ZP0A 1OJDA 3EAOA 2JBVA 3AEEA 2ZZBA 2Y6QA 3GD3A 3UP5A 4XWRA 3LZXA 3R9UA 5CKUA 1SEZA 1GV4A 3AECA 1E1MA 3AYJA 1N4WA 3QSEA 5L46A 4RG3A 1IUTA 3UTEA 1K0JA 3Q9TA 5FS9A 1D7YA 2OAMA 3NHOX 4H4PA 3NG7X 4YSHA 1NHSA 4YTMA 1PBDA 1H86A 3EPTA 2WESA 4OPTA 4Z25A 4BK3A 1DJQA 2V3BA 4GDEA 2YM1A 4GRTA 4JDRA 1PBEA 1REOA 3EANA 2ACZA 1LV0A 1JOAA 1CL0A 4K5RA 2B9YA 2NPXA 3GRSA 3UCLA 4FK1C 2R9ZA 2FBWA 2WDVA 2BC0A 1NEKA 2Y6RA 4ECHA 1NAAA 2YAUA 1N1PA 4TM1A 3CGEA 4CCRA 2C7GA 1KSUA 2GVCA 3AE3A 4KPRA 3ALJA 3SFEA 2GRTA 3ABVA 1S2YA 2WU5A 3CPIG 4TM3A 2B7SA 3RP6A 4C3XA 5JCLA 2QA1A 2H88A 3ZYXA 3ADAB 1QLBA 2WETA 3CNDA 3KD9A 4A65A 2C64A 1GRBA 2YG5A 5GSNA 2R4EA 4DGKA 1GRAA 5JCIA 4BURA 1DNCA 1L9CA 1KDGA 5HY5A 1F3PA 3PVCA 4AOSA 3FMWA 3RHAA 3QFAA 3L8KA 2FJBA 2ZBWA 4A99A 3ZDNA 3DJGX 3NN0X 4EM4A 2WP5A 1E1LA 1GT8A 2BS2A 2GAHB 1N4UA 4CRTA 2WEUA 3CGCA 3DJJA 1EL5A 3OC4A 2PYXA 3CTYA 2DKHA 3DH9A 5EOWA 1CBOA 1F6MA 2ZZCA 3CNSA 2C3DA 3GMCA 5JCMA 1OJTA 2NVKX 1IUXA 2YR6A 3GRTA 3KU9A 1ZOVA 4GR1A 2JAEA 1LTXR 2C67A 3K7QX 2C73A 3KLJA 2YLXA 1E1KA 2C70A 2BK4A 2GEWA 3QVPA 2YR5A 3G5RA 2C66A 2X99A 3NIXA 2RABA 3NYCA 1JRYA 3FG2P 4OPUA 3DGZA 4LIIA 1VRQB 2BK5A 3P4QA 1PBFA 1DOBA 1GNDA 2Q6UA 5EB5A 1EL7A 1XANA 2AAQA 2VVLG 4EQRA 1VG9A 4NEWA 3DA1A 2YLWA 3G5SA 1CC4A 4OPGA 4U8OA 4Y4NA 2R0GA 1GXFA 3SGLA 5DBJA 4ADWA 2GR3A 1NG3A 2BXRA 2ARDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SJ6A 2IMDA 4GRFA 1KF6A 2YV9A 5G5FA 2EIQA 2IN3A 1QQ2A 3FY7A 1TK5B 2A89A 4NAXA 1SJIA 5AIVA 4FX9A 2LQQA 5LV9A 1YY5A 2FJAA 5EBKA 1ZX9A 2H1AA 5G30A 1BF3A 1GNEA 1TYPA 4EMWA 2LNTA 3IC9A 1H84A 1JU2A 5CAXA 1TKDB 5IMDA 2K18A 4B67A 1PDHA 2C4CA 2XCGA 3RPPA 4JRRA 5JWOB 4IKHA 1F3AA 2GMJA 3KH7A 4BVYA 4K2DA 4LLRA 3RBTA 4OPIA 4YQUA 1F8RA 3GUSA 3P4PA 1TK0B 1NENA 3EU3A 2C75A 3TKSA 1BAYA 1IJHA 3KH9A 3GIXA 3VPTA 3D4TA 1PN9A 3KVEA 3TGZA 4OCFA 4BL7B 1O94A 2M72A 3FR6A 3F6DA 2IL3A 4TXOB 4KDXA 4Y4LA 2HE3A 2R0PA 1B5QA 4JNQA 3CIRA 2VLTA 1FB0A 1DJNA 5ID2B 1M6IA 3UOMA 2A2PA 3NZNA 4YH2A 1FCDA 2YZHA 4H86A 4FDCB 3DRNA 4MA9A 1TI1A 4MF6A 3FYGA 1A2LA 4WF5A 3UJ1A 3UKKA 4WR4A 4C77A 4IVMB 4IN0A 2IMIA 3M12A 3VK9A 3KM6A 4GXZA 1ZMDA 4K7OA 1GSQA 2XVEA 2BCPA 1KNPA 1LQTA 1WJKA 5FS8A 3FBSA 3REDA 1ZYEA 1M3JA 4K6XA 4TR3A 3U6VA 1ZMCA 1X9MB 2VLUA 1YF0A 1MO9A 2GB0A 1SYXA 2ON5A 4H2QA 1QMVA 2Q7VA 1Q1RA 5EB4A 4ZXGA 4WKWA 4F2IA 1AQVA 2QA2A 5B6NA 4A79A 2Q0LA 1A23A 3UEMA 1M2AA 3DXBA 5BUKA 1IYHA 3SM8A 4HU7A 3A5IA 4PX1A 4I59A 2GT6A 4K7ZA 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4H4TA 5HR2A 1P2HA 3GKXA 2VM2A 3HYPA 2BRAA 2F9SA 5KEJA 3PS9A 1E1NA 5KMRA 4AP1A 5KVIA 1B4QA 3UKQA 2C3QA 1F8SA 2XHFA 4IV9A 3GDPA 4IGJA 4XRAA 4ZB9A 4CNKA 5ECRB 3DGQA 5IQ4A 1ZCPA 1A2JA 4J2FA 4MZWA 3AD9B 3NGCX 3LG6A 4E0VA 1ZKQA 3UVTA 1U6TA 4D03A 1DXLA 2R4JA 3TKQA 4Z2RA 1SD8A 4L0UA 4POKA 1TDNA 4CNJA 1YQ4A 1SENA 3L4NA 3VWVA 1JZDA 4QL9A 1ZMAA 4MJWA 2B3SA 1L9DA 2GZYA 3GV1A 1C72A 4X9NA 4B1BA 2IMFA 2FJEA 1GPEA 3CQFA 4J33A 2BABA 4LL1B 2L59A 5BRTA 4H50A 3F3QA 1PL2A 2H01A 1L9EA 2O7KA 3IE3A 1S3DA 2GH5A 4Q5RA 3GHAA 1S3BA 1V40A 3G7IA 1CC6A 1DODA 4D04A 2X8HA 3T2KA 5JWQB 1NHQA 2FCHA 2IMEA 3IA1A 2CVJA 2M46A 2ZCTA 2A8XA 2X8GA 3LJPA 3DK8A 1JNRA 2DJ0A 4II2A 5FS7A 5KN2A 1OE8A 1R5AA 3R3EA 4NNJA 2B5XA 1DE1A 4CBQA 1BX9A 2CVBA 2WDQA 2RM5A 1PJ6A 5D9XA 3Q6OA 2TMDA 1K0DA 3F4RA 2X8CA 2H6YA 2OLNA 3S5WA 2CVDA 2YJ7A 2HRKA 2UZZA 3UKPA 2BXSA 4JY2A 3EAOA 2LRNA 2JBVA 3GD3A 1XIYA 2K9FA 4KSMA 2F3MA 3HVNA 3QSEA 4EF0A 1OVNA 1BG5A 1K0JA 4PQHA 3GSTA 2JU5A 3ZFLA 3IK7A 4H4PA 1OYJA 4YSHA 1NHSA 1WOUA 5EL8A 4KF9A 1GULA 2X4AA 3EPTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1SJ6 A;  2IMD A;  4GRF A;  1KF6 A;  2YV9 A;  5G5F A;  2EIQ A;  2IN3 A;  1QQ2 A;  3FY7 A;  1TK5 B;  2A89 A;  4NAX A;  1SJI A;  5AIV A;  4FX9 A;  2LQQ A;  5LV9 A;  1YY5 A;  2FJA A;  5EBK A;  1ZX9 A;  2H1A A;  5G30 A;  1BF3 A;  1GNE A;  1TYP A;  4EMW A;  2LNT A;  3IC9 A;  1H84 A;  1JU2 A;  5CAX A;  1TKD B;  5IMD A;  2K18 A;  4B67 A;  1PDH A;  2C4C A;  2XCG A;  3RPP A;  4JRR A;  5JWO B;  4IKH A;  1F3A A;  2GMJ A;  3KH7 A;  4BVY A;  4K2D A;  4LLR A;  3RBT A;  4OPI A;  4YQU A;  1F8R A;  3GUS A;  3P4P A;  1TK0 B;  1NEN A;  3EU3 A;  2C75 A;  3TKS A;  1BAY A;  1IJH A;  3KH9 A;  3GIX A;  3VPT A;  3D4T A;  1PN9 A;  3KVE A;  3TGZ A;  4OCF A;  4BL7 B;  1O94 A;  2M72 A;  3FR6 A;  3F6D A;  2IL3 A;  4TXO B;  4KDX A;  4Y4L A;  2HE3 A;  2R0P A;  1B5Q A;  4JNQ A;  3CIR A;  2VLT A;  1FB0 A;  1DJN A;  5ID2 B;  1M6I A;  3UOM A;  2A2P A;  3NZN A;  4YH2 A;  1FCD A;  2YZH A;  4H86 A;  4FDC B;  3DRN A;  4MA9 A;  1TI1 A;  4MF6 A;  3FYG A;  1A2L A;  4WF5 A;  3UJ1 A;  3UKK A;  4WR4 A;  4C77 A;  4IVM B;  4IN0 A;  2IMI A; 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