5BRT | Genus

Total Genus 188

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	188
sequence length	581
structure length	554
Chain Sequence	AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus	188
structure length	554
sequence length	581
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-06-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5brtA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	5brtA01

4REKA 3VRDB 1X31B 2BS4A 3I6DA 3IC9A 4OPIA 1N4WA 3PVCA 5EB4A 3V3NA 5FS6A 1EL9A 3QJ4A 3R9UA 3AE1A 2XVHA 3UKFA 2YG4A 3BI5A 3CNDA 2C7GA 5IQ4A 4Z2TA 2C73A 2RGOA 1NHPA 5GSNA 2CFYA 3NHOX 1EBDA 4JDRA 3RHAA 4H4ZA 4YSXA 4UP3A 4YXDA 1PJ7A 2OLNA 2GR2A 2V5ZA 2XCGA 4UDRA 1KSSA 3QVRA 1P2EA 1Y56B 1ZOVA 3EAOA 3GMBA 3NIXA 1NG3A 4JNQA 3UOVA 4CCQA 3G5SA 4CNKA 4NEVA 1PBCA 3AD9B 1YKJA 2OALA 1REOA 2A87A 5M10A 4B63A 3H8IA 2BK4A 3NN6X 3F8PA 1PJ6A 3BI2A 2C66A 1PDHA 1ZDLA 1JNRA 3UOZA 1MOKA 3F8DA 4RG3A 1H82A 2WOVA 4GF7A 4O5UA 5KXJA 1AOGA 2X8HA 3AEBA 5FS8A 5KVHA 2PHHA 3ISHA 4A9WA 4O5QA 4OPCA 2BA9A 1TYPA 3LOVA 3AECA 1E6EA 1Q1WA 3ABVA 3P4QA 4WCTA 5BRTA 2A8XA 3K7QX 1VG0A 2X3NA 5JCIA 2JB1A 1Y0PA 2RGJA 3P9UA 4I59A 1PBFA 1B8SA 3G5QA 4N9XA 4TM0A 1W4XA 2VRMA 2GR1A 2H89A 5CQFA 1Y56A 3AE8A 3AE3A 3S61A 1L9DA 2Z5XA 3WE0A 2QA2A 1N1PA 2BC0A 3P4RA 1CHUA 1GALA 2OAMA 3AD8B 1PBDA 3NG7X 4YSZA 1GV4A 2GRTA 2DKHA 2GF3A 5FS7A 1FOHA 1CC2A 1QO8A 3NK0X 1LJ1A 2I0ZA 3P4SA 4B67A 3DGHA 3KVEA 1NDAA 1GSNA 4OPTA 2TMDA 2Y6RA 2R45A 2IVEA 4XXGA 1PJ5A 1TYTA 5BUKA 2YLXA 1GPEA 4A65A 4H4PA 1D7YA 2IIDA 1JNZA 3NYFA 4GCMA 4BK3A 3ATRA 2B7RA 1GRAA 2R0PA 2JK6A 4H2PA 4U8PA 1H7WA 1ZY8A 2EQ7A 1NHRA 1F8RA 3NK2X 4TM1A 5HY5A 1F3PA 3HZLA 2WOWA 2WPCA 1Q1RA 2EQ8A 2YQUA 3KD9A 3FBSA 1S2QA 1SEZA 3D1CA 3ZDNA 5EBKA 3CNSA 1H83A 5BVAA 3AWIA 2WEUA 1EL7A 2JB3A 4FDCB 1DOEA 2XLSA 3AYLA 2YG5A 1D7LA 4TLZA 2WDVA 1OJTA 3DJDA 1DJQA 1S2YA 4Z24A 3UKAA 4C77A 2QCUA 2YG7A 3ALLA 5FS9A 4X9MA 1CF3A 4U8KA 4H7UA 5C2TA 4CCRA 4IVOB 4EQSA 4K8DA 4YKFA 4K5SA 1EL8A 2C75A 5EB5A 1D4DA 3CPJG 3RP6A 4ICYA 1LTXR 3AEDA 3C4NA 4NEWA 4J2WA 4H2NA 3UTFA 5KOWA 4EMJA 2BACA 5U63A 3M12A 2W0HA 4LIIA 4OPGA 4A79A 1H6VA 1E1MA 1P2HA 2JBVA 4Y4NA 3S5WA 3KA7A 1DNCA 2AR8A 1QJDA 2XVJA 1CC6A 1LVLA 4YT0A 2Q0LA 4ZCCA 1FL2A 1PXBA 4U2LA 5GRTA 2GB0A 3NGCX 2WHDA 1FEAA 2C70A 2GEWA 5U25A 1E39A 2YLRA 4JQ9A 2YR5A 2JKCA 4TLXA 3UKKA 2ZZ0A 2V60A 4OVIA 1OJAA 1V59A 5C3JA 2WDQA 2XFPA 1VQWA 1GT8A 3DA1A 2WBAA 2GR0A 3LADA 4ZN0A 2ARDA 4ECHA 3I3LA 2V3AA 1TDKA 3B3RA 3GRSA 3GWDA 2YVGA 4DSGA 1BGJA 1E1LA 2AAQA 1GRFA 1NHSA 2XFNA 4GDEA 3UKHA 1FEBA 1PBEA 2VVLG 1VRQB 3KKJA 1GNDA 4H4XA 4B64A 3AB1A 3ALJA 3VRBA 2BYBA 3LXDA 5KOXA 4A7AA 2B9WA 4EQXA 1TDOA 1CBOA 5L46A 2NPXA 4EM3A 3ICTA 2R0CA 3AE7A 5CKUA 2XFOA 3REDA 1H84A 1GXFA 3UTHA 2X50A 1PN0A 3IHMA 2X99A 2HQMA 2Y6QA 3BHFA 4I58A 3AYJA 1GREA 3LB8A 2VVMA 4X9NA 3VR8A 3II4A 1JRXA 2APGA 3GSIA 3NT6A 2V6OA 2YG3A 2GH5A 2BK5A 4K5RA 4HA6A 4OCGA 1IJHA 2QAEA 1BZLA 4EIQA 5M0ZA 3FIMB 4BK2A 2Q0KA 2E4GA 2YLZA 2XDOA 1K4QA 2YR4A 1DOCA 4AP1A 1O94A 4AOXA 3LJPA 4KX6A 4AT0A 4BJZA 1GTHA 4JY2A 4DGKA 4JY3A 3VQRA 4NZHA 2GV8A 4U8OA 4PAAA 3AEAA 3C4AA 3RP8A 1B4VA 2YM2A 2B7SA 3BNUA 3UCLA 2C65A 1GEUA 3D8XA 3P4PA 1GESA 1YQZA 3LZXA 1RP0A 1OJCA 1Q9IA 1GRGA 2BC1A 4MJWA 1LV0A 1PBBA 1Z6LA 3OZ2A 3UP5A 4A5LA 3CGDA 1JRYA 1M6IA 1QLBA 1JU2A 2FJDA 2WS3A 2WP6A 1E7PA 1DODA 3VR9A 4NTEA 3Q9TA 3RP7A 4CNJA 4Z26A 4CBQA 4RSLA 4H4SA 3RNMA 3UP4A 4Z2RA 3P1WA 3BI4A 4UDPA 3K30A 4LA1A 4HB9A 4U8MA 4BK1A 2VQBA 3LZWA 1IUSA 1CJ3A 3ADAB 3DK4A 2WQYA 1ONFA 3DMEA 3QSSA 3DK9A 1GOSA 3ATQA 3QFAA 2YLWA 4FK1C 2XVFA 5ER0A 3GDNA 2VRLA 3GWFA 4D03A 5HHFA 1UKVG 4J36A 4IA6A 4XWZA 4EQRA 4EM4A 2H88A 5J60A 1TDNA 2OA1A 4K2XA 1JRZA 2YG6A 3EF6A 3NNEA 3GYIA 4H4QA 3NYEA 2VZ2A 2XVEA 2XFUA 1PHHA 3NTDA 2GAGB 4IA5A 1IUWA 4EMIA 1CJ4A 1XHCA 1IUUA 2B76A 2R9ZA 4GRTA 4H4RA 2X8GA 4U2SA 1KSUA 1ZKQA 2GQWA 4AP3A 2EQ9A 2X8CA 4FK1A 4H4TA 3CNJA 1VG9A 2BS3A 5U1OA 3DH9A 1K0IA 3NRNA 3AE4A 3EPTA 3F8RA 5IPYA 3KPFA 4K7ZA 2C67A 1IUVA 4CY8A 2BXSA 4Z2UA 1FCDA 2BABA 5KRQA 3IHGA 3DJEA 1KF6A 3KLJA 2WU2A 4D04A 1D4EA 5LV9A 2WESA 2YR6A 4YWOA 2XLUA 4DSHA 4Z43A 5JCNA 3CGEA 1O95A 4WX1A 2RGHA 4YTNA 1K0LA 1YQ4A 3CPHG 4RG4A 4C74A 2PYXA 4CY6A 4BJYA 2WU5A 4B69A 2Q6UA 3AYIA 3FPZA 4UDQA 4AT2A 1CJCA 4J33A 5JCKA 2GAHB 3NTAA 1BKWA 1VDCA 4USRA 5JCMA 3AXBA 2C3CA 4PABA 3SGLA 4ZCDA 5JCLA 1K0JA 3CGCA 3AEGA 1PS9A 2BK3A 1ZP0A 2YLSA 1TDFA 1ZK7A 2CVJA 4E0VA 1TRBA 4EQWA 3AEEA 3AE6A 1BGNA 1OJDA 2VOUA 3E1TA 4YTMA 3UKLA 3V76A 1D5TA 5KVIA 3JSKA 3O0HA 1FECA 2O9ZA 2Q7VA 4EMWA 4YKGA 1L0VA 3H8LA 3BHKA 3Q6JA 2QA1A 4IVMB 3CTYA 4YSHA 3ALMA 2YWLA 4A6NB 1JOAA 1ZMDA 4Z25A 4XWRA 4EIPA 5IQ1A 3EANA 2NVKX 4P9SA 2FBWA 3DK8A 4NTCA 4YSYA 2GMJA 1GRBA 3SFEA 2VQ7A 2XLTA 3OC4A 4BV6A 2R4EA 1HYUA 1L9CA 5TR3A 1MXTA 3GD3A 3AE5A 4X4JA 1DOBA 1GRHA 3DJGX 2WP9A 1B37A 3UOXA 1NAAA 4J34A 1GERA 1CL0A 3IWAA 1BWCA 1JEHA 1KFYA 1N4VA 3KU9A 2JB2A 3UOYA 3BNMA 2WDRA 5FMHA 1PXCA 3GRTA 4J31A 4A99A 4K22A 2GVCA 3NKSA 2UZZA 2RABA 3AEFA 4KPRA 1OJ9A 1D4CA 5BULA 1H86A 2BXRA 2WETA 3NH3X 5DBJA 1B5QA 1GTEA 1NG4A 4USQA 4ADWA 4U2TA 4M52A 2ZBWA 4H2RA 3AD7B 3K7MX 1L9EA 3UKQA 3QFBA 4A6NA 1NENA 1PXAA 3COXA 1IUTA 2VVLA 3VRAA 3ICRA 4C3YA 2EQ6A 4LU6A 2CULA 1IUXA 4GR1A 2C72A 3SFDA 3CGBA 4DNAA 2YVFA 3B6DA 3PO7A 2J3NA 2CDUA 2IVDA 4YTPA 4BURA 2XLRA 1E1KA 1TDEA 4GDPA 1KNPA 1F8SA 3AE9A 3QVPA 4J57A 2ACZA 3URHA 4H4VA 1MO9A 2C64A 2YAUA 1NPXA 3IF9A 3FMWA 1ZMCA 2DKIA 3GDPA 4APNA 1LQUA 4U8IA 3UKPA 2E1MA 3FG2P 1RYIA 4TM4A 2WOIA 3PS9A 2B9YA 3L1RA 1XANA 3CIRA 4JNAA 2XYOA 3DGZA 2XLPA 1ZX9A 1ZOYA 2YLTA 4Y4MA 2AQJA 4J56A 2YVJA 3ITJA 4OPUA 2C76A 4CRTA 3CNPA 4H4UA 2Z5YA 3K7TA 3SM8A 3CNTA 2ZZCA 1YQ3A 3UTEA 1H7XA 3M13A 4OPDA 1KNRA 1DJNA 2GQFA 1N4UA 4U8LA 1F6MA 4U8JA 1RSGA 2FJBA 2GR3A 4H4YA 1YY5A 2FJEA 2BCGG 3QSEA 2V61A 3NYCA 2C3DA 5J7XA 5HXIA 4B1BA 2XVIA 1CJ2A 4AOSA 2WPFA 4H50A 2R0GA 3AE2A 3NLCA 3M0OA 4B68A 2XFQA 4IV9A 3CPIG 3L8KA 5HYMA 1LQTA 1BF3A 1GETA 1LPFA 4OPLA 2FJAA 4B65A 3G5RA 1O5WA 1XPQA 2F5ZA 3QSMA 4H4WA 1M64A 3UTGA 1EL5A 1GRTA 1ELIA 3C96A 1COYA 1F8WA 1KDGA 2JAEA 2A89A 2B9XA 4GUVA 2E5VA 2GMHA 2WP5A 3NN0X 1H81A 4H2QA 4Z44A 1S3EA 4C5OA 1NHQA 4JN9A 2TPRA 3CN8A 4B66A 4U8NA 1XDIA 4NTDA 3V3OA 3NK1X 3GYJA 2R4JA 2WPEA 4Y4LA 3SQPA 2YM1A 1S3BA 3GMCA 3T37A 3DJJA 1DXLA 4FX9A 2BCPA 2BS2A 2ZZBA 5KWFA 3GD4A 1CC4A 2R46A 1E1NA 4TM3A 3ICSA 5EOWA 3ZYXA 2OLOA 3H4KA 4C3XA 2V3BA 1NEKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3VWWA 4REKA 2LRTA 4PXOA 3I6DA 3IC9A 4OPIA 5EB4A 1N4WA 2HRNA 3PVCA 4YSZA 2C3NA 1EL9A 1SU9A 2OKAA 3EC3A 3AE1A 2VO4A 2HYXA 1PL2A 3CNDA 3SZWA 4MZCA 1R26A 5GSNA 2CFYA 5DCGA 3HYXA 2AUVA 1ZOVA 2K9FA 4CCQA 3G5SA 2GGTA 1PBCA 4JBBA 1YKJA 1GSSA 4KCEA 1TRSA 1XBSA 3LGCA 5M10A 1UVZA 3T2YA 2OA7A 3EINA 1QQ2A 2DJKA 3BI2A 3UOZA 4EO3A 3F8DA 1GTUA 1O6JA 1U6TA 2VD0A 1H82A 5ENUA 3CSIA 4MK3A 5L71A 2HT9A 2N5AA 2PHHA 3DXBA 5J3RA 4OPCA 3TRQA 2XC2A 4Q5RA 3CTGA 2NBSA 3K7QX 2X3NA 2RGJA 4RQRA 4N9XA 4V1Ag 3GMFA 4NPBA 1R4WA 3TRXA 2GR1A 2H89A 3AE8A 4ZILA 2GQMA 5KMRA 1OAZA 3HJMA 1I5GA 4BA7A 1GALA 2CAQA 2AJQB 3IK7A 3U6VA 1QO8A 17GSA 3P90A 3DGHA 3ME7A 4TR1B 2HLSA 3D4TA 1NDAA 1UA5A 4WF5A 4XXGA 3FR6A 2LQQA 1PJ5A 3HXSA 1TYTA 5BUKA 1X9SB 1BYEA 4A65A 1D7YA 4KB3A 3PH9A 3NYFA 1XW9A 1GTAA 1PN9A 5AIXA 1AC1A 4L5OA 4QL9A 4ISDA 5J41A 1H7WA 4XTSA 2EQ7A 1F8RA 4IBPA 3HZLA 5A4WA 2YQUA 4DSSB 3FBSA 1SYXA 3KMNA 2PBJA 5D93A 4LMVA 4DVCA 5EBKA 2VL2C 1SKRB 3C7MA 5BVAA 3DD3A 1AW9A 3PGTA 1A0RP 2HSYA 1BJXA 2YG5A 1D7LA 2LQOA 4RI7A 3MSZA 4X9MA 4TR1A 1NSWA 1CF3A 5KEJA 4CCRA 1AXDA 4RUVA 4EQSA 4K8DA 2GLRA 3GKMA 1D4DA 4MH3A 2RIIA 3F3RA 4V1Ap 1AQXA 4NEWA 4MF5A 5KOWA 1X9MB 4OMVA 4EMJA 4KUNA 2BACA 5FHIA 5U63A 2DIZA 4K7NA 4A79A 4G6HA 1H6VA 2JBVA 2AR8A 2C8UA 4YT0A 3C1RA 2WHDA 2GEWA 2C70A 5U25A 2NDOA 1YDKA 2YR5A 2H70A 2ZZ0A 1EZKA 2L6DA 3F8UA 1C72A 5ECLB 4PQIA 2GR0A 3EYTA 2ARDA 3I3LA 1TOFA 5AISA 2GT5A 1NHSA 2LSTA 3TRPA 4H4XA 3I43A 4WXTA 4B64A 2H76A 5JCWA 3VRBA 2BYBA 3LXDA 5KOXA 4EQXA 5L46A 2NPXA 2FWFA 3A2VA 3ICTA 2R0CA 1AIUA 5CKUA 2XFOA 1ZMAA 1H84A 2X50A 1X0RA 1FW1A 2Y6QA 3BHFA 4GAVA 1M3JA 3LB8A 4O32A 5A5KA 3II4A 3H1NA 3GSIA 1EP8A 5IO2A 2GH5A 4IHUA 2L5LA 2R4VA 4HA6A 4IS0A 2FY6A 1BZLA 3KM6A 4BK2A 2E4GA 2XDOA 3MNGA 2EIQA 1FO5A 1DOCA 3N5OA 3HKRA 4MJBA 4KH7A 4V2LA 2FGXA 4I8BA 2B5XA 4AP1A 3L9UA 1HNCA 1XWCA 4KX6A 4AT0A 3CRUA 1E2YA 3ZIVA 4JY3A 1K0BA 1KTEA 3QFAC 4ZB9A 3RP8A 5IMCA 3GH6A 1B4VA 1W89A 2I3YA 4FO5A 4XCSA 5B7CA 3DGQA 3LYKA 3P4PA 3LXTA 1OJCA 3APQA 1T4ZA 2BC1A 2B7JA 5B6MA 1LV0A 4MJWA 5KMQA 1JRYA 1MEKA 1XVQA 2WP6A 1TW9A 1VRSD 1E7PA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5BRTA

Total Genus

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