5BRTA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica with 2-hydroxybiphenyl in the active site
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
581
structure length
554
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 188
structure length 554
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5brtA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 5brtA01
2JK6A 4NZHA 3NG7X 1Y56A 2GV8A 4H4WA 1CL0A 2WU2A 1SEZA 3KA7A 1QJDA 4Z2TA 5J7XA 2GRTA 1E1LA 2C7GA 3NK2X 2I0ZA 3UOXA 1TDOA 1NHPA 1OJCA 3AWIA 3RP8A 4H4XA 3ZDNA 2FBWA 4U2SA 1B4VA 1GRBA 4OCGA 4FX9A 3E1TA 5M10A 3GD3A 1OJDA 1H81A 5CQFA 2EQ8A 1TDKA 4BV6A 1PBDA 2RGJA 4J34A 1FL2A 2IVEA 3IF9A 4TM0A 4M52A 1PN0A 3SFDA 1OJTA 1F3PA 2YG3A 4CNJA 3CGEA 3Q9TA 2R45A 5J60A 1ZKQA 4UDPA 3AE9A 3CPJG 1E39A 3DJDA 2E5VA 1GT8A 5FS6A 3IHMA 2X99A 4A6NA 2RGHA 4H4QA 3F8PA 3F8RA 1IUSA 3DK9A 4NTDA 5EB4A 1RSGA 4K22A 3ATRA 2YVJA 3COXA 1H84A 5IQ1A 3ICSA 5JCIA 2C3CA 4EMIA 1FEBA 2CVJA 3GRTA 5ER0A 5KWFA 2CULA 2WDRA 3K7MX 1JNZA 2BCGG 2X8CA 2ZZ0A 3K30A 3V3NA 4YSZA 5JCNA 3SFEA 4JQ9A 3VRDB 4ZCDA 2XLTA 2YR5A 4Z43A 3LZWA 1K0JA 2YLRA 3NN0X 1VDCA 2ARDA 2R4JA 3AEBA 3AE3A 4YTPA 1VQWA 3CPIG 4RG3A 1FECA 4B68A 3AE1A 1BGNA 5DBJA 2EQ6A 2VQ7A 3RHAA 5C3JA 3M12A 2VZ2A 2VVMA 2XVFA 2OAMA 4H2QA 4E0VA 3AEFA 3IHGA 2GVCA 1CC2A 1ONFA 2QA1A 1DXLA 4U8NA 2R0PA 4BK1A 1XDIA 1ZMCA 4U8PA 4XWZA 2YQUA 2PHHA 3VRBA 4YXDA 2AAQA 3NIXA 4O5UA 3DMEA 2BS3A 1EBDA 3KU9A 1TDEA 2BK3A 4TM1A 4CBQA 4EMWA 1PBCA 2BXRA 3EAOA 3QFAA 4U8IA 1H82A 4GF7A 3CNDA 4NTEA 3D1CA 4OVIA 2X8HA 1P2EA 2OA1A 1YY5A 2UZZA 4YT0A 3NH3X 2FJEA 1PJ5A 1KNRA 3NK1X 5U63A 1JEHA 1TDNA 1S3BA 3NHOX 3B6DA 2GR3A 4B66A 4BK3A 4H4VA 4YKGA 3M0OA 1KSSA 4H4RA 3K7QX 1FOHA 4O5QA 4LU6A 3LJPA 2E4GA 1PS9A 1NEKA 2XLRA 4USQA 1XHCA 3I6DA 3SM8A 4C74A 1GRGA 2NPXA 3BI5A 3LZXA 1N4UA 2GMHA 1KDGA 1GXFA 5KRQA 4EIQA 2JB1A 3GWDA 4DSHA 4TLZA 3ICRA 2YG5A 3DA1A 4IVOB 3AYLA 1GRFA 1PXCA 2V61A 2XCGA 1NAAA 4GUVA 1EL9A 2OLNA 1GRTA 2C66A 1AOGA 3UKPA 1CHUA 3OZ2A 2BK4A 2V60A 3EF6A 4HB9A 4EQXA 2JBVA 2X8GA 4D04A 3P4RA 1IJHA 3UP4A 1D4EA 3AB1A 3AE8A 1JNRA 3CIRA 4EM4A 2J3NA 3NTDA 3NRNA 1KFYA 3KLJA 4U8KA 4YWOA 4YSXA 2B9XA 4PAAA 2A89A 1ZY8A 2XLPA 4XXGA 3H8LA 4U2LA 5IPYA 3GDPA 2ZZCA 4IA6A 1GETA 3CNSA 1X31B 3BHKA 2BC0A 4FK1C 5GRTA 3CNJA 4EIPA 4ADWA 3AD9B 4IA5A 2WPFA 1GEUA 1M6IA 4ECHA 1P2HA 1PBBA 2Y6QA 3IC9A 2APGA 2YVGA 3M13A 3NLCA 4Z44A 4DNAA 1NHRA 1JU2A 1F6MA 2GR1A 1M64A 2WDQA 2Q0LA 3ADAB 1CJ3A 4UDQA 4XWRA 2R4EA 3ALLA 5KOXA 1K0LA 4B64A 3BHFA 4J2WA 5JCLA 2YG7A 1RYIA 3BNUA 1BKWA 2H89A 3PO7A 3FPZA 3BNMA 2WOVA 4JNQA 2YLWA 1UKVG 4GRTA 3G5RA 2C73A 4Z26A 3UKAA 3DJEA 3CTYA 1H7XA 3NT6A 1E6EA 1H7WA 2GMJA 3S5WA 3QSMA 4GDPA 4CY6A 4CCRA 2YWLA 1GRHA 2C75A 3UTEA 2QCUA 1TRBA 1JOAA 1F8WA 3L1RA 2WP6A 4K2XA 1IUVA 2ACZA 3G5SA 1E1NA 4YTNA 3DGZA 3ZYXA 2XFUA 4JY3A 2GQFA 3F8DA 2YLXA 5BUKA 3QVRA 1NENA 2E1MA 3UCLA 1BF3A 1GNDA 3CGDA 2YAUA 4K7ZA 1LV0A 3NN6X 5TR3A 2YLZA 1ZDLA 3WE0A 1VG9A 1DOBA 3P4QA 4GCMA 2BC1A 4H4ZA 1H86A 2EQ7A 3CNTA 4N9XA 1TYTA 4IV9A 3AECA 4EQSA 1EL8A 2GQWA 3EPTA 2QAEA 4Y4MA 4B67A 3RP6A 1DOCA 2V3BA 3AYJA 1BZLA 1L9CA 3LOVA 2O9ZA 4DSGA 4APNA 4FDCB 1IUXA 1QLBA 2C65A 2XDOA 3UOYA 4A65A 5HXIA 2Z5YA 3DH9A 3URHA 4BJYA 3C4AA 2QA2A 2WBAA 3KPFA 4KX6A 4BJZA 3NTAA 4U8OA 1FEAA 3CPHG 3GRSA 4U8JA 2WEUA 4REKA 2YM2A 4J56A 1IUTA 3JSKA 3ABVA 3VR9A 1VRQB 4H4SA 4B69A 2XFOA 3V3OA 1GV4A 2OALA 2WU5A 1D4DA 3FBSA 3H8IA 3AXBA 4A7AA 1NDAA 5M0ZA 3AYIA 4U2TA 2WOIA 4OPDA 2Z5XA 2WDVA 1XANA 4IVMB 4Y4NA 2GR2A 4PABA 5JCMA 3AEDA 1K4QA 1HYUA 2C67A 4OPTA 3ALJA 2RABA 2XVEA 4C77A 3G5QA 1NPXA 2NVKX 1Y56B 3GYIA 4NEWA 2BS4A 2JB2A 1GERA 3NYCA 4GDEA 2BABA 3OC4A 3GDNA 3SGLA 3BI4A 2PYXA 1EL7A 4JDRA 3UKHA 4LA1A 4A99A 1MO9A 2GEWA 3L8KA 2GB0A 1ZP0A 4H7UA 1KNPA 1K0IA 1ZOYA 2Q7VA 4RSLA 5HY5A 3QFBA 3R9UA 5L46A 4H4YA 2IIDA 1YQ3A 3NYFA 4LIIA 1VG0A 2BS2A 2GAGB 1LQTA 3AD7B 2OLOA 4H4TA 4U8LA 2BACA 1LVLA 3GMBA 5GSNA 4J31A 4YSHA 1Z6LA 1ZOVA 4YKFA 4TM3A 2R0GA 2WPEA 1LPFA 3B3RA 1Q1WA 2XVJA 2WP9A 2XFPA 5BULA 3KVEA 2XVHA 1BWCA 3PVCA 1B5QA 2IVDA 4ZCCA 1NHSA 3LB8A 1L0VA 1PBEA 1D7YA 1CJ2A 3UKLA 2B76A 3I3LA 4A79A 1MXTA 1O94A 4A6NB 4AT2A 1DODA 4DGKA 2FJBA 4AP3A 2B9YA 2R9ZA 4Y4LA 2FJAA 3AE5A 1D7LA 3LADA 4OPLA 3UOVA 3QSSA 4A9WA 5C2TA 1KF6A 1D5TA 1N4WA 3P1WA 2GF3A 3P4SA 1GREA 1S2YA 4P9SA 4EM3A 1CC4A 2VRLA 3NK0X 3CGBA 4J33A 4U8MA 3RP7A 1GTHA 1IUUA 1JRXA 4Z2UA 4ZN0A 1GRAA 1JRYA 1ZK7A 2WQYA 2WETA 5JCKA 1CJCA 4GR1A 2Y6RA 1CBOA 5FS7A 1H6VA 1PDHA 4OPIA 2YG6A 1PJ7A 2EQ9A 2CFYA 4HA6A 4BURA 2AQJA 4D03A 1COYA 5HYMA 3RNMA 2XFQA 3Q6JA 3ALMA 2WESA 3VRAA 3NGCX 4TM4A 5KVIA 3SQPA 2GR0A 3GSIA 4OPUA 3UKFA 2C72A 1E7PA 1NHQA 1KSUA 1GOSA 2BK5A 1S3EA 2H88A 3AD8B 1O5WA 3O0HA 2XYOA 2XFNA 3DJJA 1NG3A 3QVPA 1YQZA 5FMHA 4X4JA 1Y0PA 3UKQA 4H2PA 2BYBA 5BVAA 2JB3A 1OJAA 3UTGA 4YSYA 1B8SA 1PBFA 2HQMA 2XLUA 4J57A 5IQ4A 3BI2A 1EL5A 3GYJA 2YR4A 5FS9A 4OPGA 2C76A 4C3XA 2X3NA 4AOSA 2JAEA 3AEGA 4B65A 1DJNA 3FG2P 4EQWA 3GMCA 2YVFA 1FCDA 2CDUA 1ZMDA 1REOA 4H4UA 1E1MA 4JY2A 2XVIA 2YG4A 4AOXA 3NYEA 4KPRA 1L9EA 2WPCA 3UOZA 1MOKA 2GH5A 2Q0KA 3GD4A 2Q6UA 4CY8A 3CN8A 2ZZBA 3NKSA 4UDRA 4AP1A 1H83A 2ZBWA 3P9UA 3AE4A 2TPRA 1GESA 4JN9A 1PHHA 3DK4A 2YLTA 2XLSA 2VVLA 4FK1A 5CKUA 4CCQA 4K5SA 3DJGX 3AE7A 5EOWA 5KVHA 1CC6A 3S61A 4Z25A 3DK8A 1OJ9A 1IUWA 2C70A 4B63A 3VR8A 5U25A 1RP0A 3HZLA 4EMJA 3CNPA 3II4A 1DNCA 2V5ZA 3PS9A 1F8RA 4USRA 3QSEA 3DGHA 1CF3A 2W0HA 1V59A 1S2QA 5EBKA 4NEVA 4TLXA 2RGOA 2WHDA 4H2NA 1TYPA 2VOUA 4AT0A 3AE2A 4OPCA 4CRTA 3UKKA 1Q1RA 2B7RA 2DKIA 1LQUA 4Z24A 4Z2RA 2C64A 2FJDA 3ITJA 4JNAA 1PXAA 2VRMA 3KKJA 3KD9A 5KXJA 3GWFA 4WX1A 4C5OA 2BCPA 4I59A 1ZX9A 4EQRA 1YQ4A 2C3DA 2X50A 3D8XA 2VQBA 5HHFA 4B1BA 3FMWA 2A87A 3QJ4A 2B7SA 1GALA 1DOEA 2GAHB 4WCTA 3UTFA 4BK2A 5U1OA 1B37A 2WP5A 2YLSA 2R46A 4X9MA 2DKHA 1F8SA 1QO8A 3C4NA 3REDA 3K7TA 3T37A 1PJ6A 1BGJA 1DJQA 3FIMB 4CNKA 3AEEA 2YM1A 2A8XA 5KOWA 1NG4A 1JRZA 4K8DA 2WOWA 3AEAA 3EANA 4NTCA 2AR8A 1N4VA 1LTXR 2WS3A 3UTHA 1PXBA 1TDFA 4J36A 2VVLG 4UP3A 4C3YA 3P4PA 4H2RA 3CGCA 2V3AA 4MJWA 2R0CA 3ATQA 3H4KA 4H50A 4I58A 1GTEA 3IWAA 1GSNA 2B9WA 2V6OA 1L9DA 2F5ZA 4RG4A 1YKJA 3ISHA 5LV9A 1O95A 3LXDA 1ELIA 1N1PA 4YTMA 5BRTA 1Q9IA 5FS8A 2YR6A 2BXSA 4H4PA 3VQRA 1GPEA 3UP5A 1CJ4A 2BA9A 2TMDA 1W4XA 2JKCA 1E1KA 5EB5A 4ICYA 4A5LA 4K5RA 1D4CA 1XPQA 3C96A 3ICTA 1LJ1A 3AE6A 4X9NA 3V76A 3NNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2M80A 4MMMA 1SEZA 4Z2TA 4ILFA 5J7XA 3UIWA 1E1LA 1SKWB 1M99A 3EWLA 5GSSA 3VWVA 2GVPA 1Z7PA 4HI7A 1WRYA 2H1BA 2YJ7A 1B4VA 1GRBA 4EUYA 1F37A 3PGTA 5CP1A 3FR9A 3GD3A 2F8AA 4J57E 5CQFA 2EQ8A 4XCSA 3U6VA 1A8LA 5JCWA 2DJJA 1PBDA 3S9FA 3GRXA 1GTIA 3F9UA 4KNDA 3LG6A 3IOSA 3SFDA 2RLIA 3H79A 4CNJA 2R45A 1BG5A 5KN0A 4K2DA 3AE9A 1RK4A 3CPJG 3DJDA 4MJEA 5FS6A 2DJ3A 2TIRA 3IE3A 5KN1A 4NWZA 2J9HA 2BRYA 4BVXA 2TRXA 5IMAA 3F63A 4NTDA 1K3YA 3ATRA 2YVJA 1EEMA 4NPBA 3GRTA 5ER0A 5KWFA 2BCGG 1SJIA 3QR6A 4BVYB 4YSZA 4Z43A 4PQHA 2YLRA 2OKAA 3WGEA 1VQWA 4PXOA 3FZ5A 4RG3A 2PBJA 1FECA 1PSQA 3AE1A 1K0DA 1HQOA 2VLVA 2DJ0A 4P3YB 3M12A 2VZ2A 2VVMA 2OAMA 4E0VA 4MF6A 3JCML 3UEMA 2LRNA 3IHGA 2GVCA 1DXLA 2IFQB 1FVJA 2OA7A 1XDIA 1M0UA 1YF0A 1OKTA 3W6GA 2BK3A 3L4NA 1PBCA 1A0FA 3QFAA 3D1CA 2FD3A 1YY5A 1HNCA 2FJEA 3NK1X 4O5RA 3FYGA 4OCEA 3GH6A 2X4AA 5J4UA 1QQ2A 1OC9B 4D73A 2E7PA 2PVQA 1TRUA 3K7QX 3ZMKA 5LNKe 4LU6A 3LEFA 4USQA 4DSSA 2NPXA 3EC3A 3QAVA 1YEXA 5B8BA 2AB6A 3ICRA 3AYLA 2R2JA 2LQOA 2LKUA 3G7YA 3LGCA 2C66A 2P0GA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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