5BRT | Genus

Total Genus 188

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	188
sequence length	581
structure length	554
Chain Sequence	AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords	2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus	188
structure length	554
sequence length	581
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-06-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5brtA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	5brtA01

3KA7A 2C67A 4CY6A 4I58A 1K4QA 1Q1WA 3P4QA 3GSIA 2Z5XA 4IVMB 4AOXA 4U8LA 1B5QA 3GWDA 3ICSA 2YLTA 4YWOA 1JRZA 3M12A 2Y6RA 1PJ5A 2XLUA 2B9WA 4EM3A 1KNRA 1VDCA 2B7RA 2C65A 4EIPA 2VRLA 2VZ2A 2XYOA 2GR0A 4CY8A 4C3YA 4CNJA 2BCGG 2BCPA 2XVHA 4OPUA 2R0GA 2YM2A 1E39A 1GALA 4ZN0A 1VG9A 2WESA 3NRNA 2I0ZA 3GD3A 4Z44A 1EBDA 1MO9A 1JNZA 1GETA 3BNMA 3CIRA 3GMCA 4AT0A 1CC6A 1XPQA 1ZMCA 1O5WA 1JRXA 4REKA 3F8PA 4CCQA 2GQFA 1NPXA 4OPIA 3H8LA 3BI2A 2C7GA 3PS9A 2GVCA 2XLSA 1PN0A 3FIMB 2B9YA 4TLXA 5EBKA 3FBSA 3AD7B 5U1OA 4YKGA 3NKSA 3P1WA 3OZ2A 3AE1A 2ACZA 4K5SA 2DKIA 3NYFA 4H4TA 4Y4MA 1LQTA 3BHFA 4XXGA 3AE9A 2XVFA 1FL2A 1L9CA 4BK1A 1CF3A 2FJBA 2WHDA 3ZYXA 1BGJA 4GCMA 3EAOA 2B9XA 3UKPA 4Y4LA 5TR3A 2C64A 1E1MA 3AE6A 4YSHA 2GAHB 3DJEA 3EF6A 1GSNA 2JK6A 3BI5A 3L8KA 3VR9A 4XWZA 1GRFA 1H7WA 5EB5A 1GESA 4OPCA 4JNQA 2CVJA 5FS7A 4U8NA 3URHA 3GMBA 2WDVA 4GR1A 4YSXA 4A99A 3M13A 1KSSA 3ATQA 1CBOA 1HYUA 1Z6LA 2JB3A 3P9UA 1ZMDA 3NGCX 4J57A 2XCGA 3DH9A 4U2LA 3M0OA 1GTEA 4OVIA 4Z25A 1REOA 3LB8A 2A87A 3UKLA 2XFUA 1L9EA 2WPEA 4FDCB 2WDRA 4P9SA 1EL7A 4APNA 1GV4A 3C4AA 4EMJA 5JCNA 5C3JA 4KX6A 1Y56B 1BZLA 3AE4A 1GPEA 3UKHA 4OPDA 1DXLA 4A6NB 3BHKA 4J34A 3NT6A 1K0JA 2C73A 4WX1A 3AE8A 3S61A 4U8PA 1D4DA 1RYIA 2IVEA 4GDPA 2CDUA 2HQMA 4X4JA 1E6EA 1ZOVA 3KKJA 2OLNA 4A5LA 4EMWA 1B4VA 1GREA 1ONFA 1E7PA 2WP6A 1DOBA 4Z26A 2GR3A 3QFBA 1S2YA 4FK1C 4TM3A 3UKFA 3ZDNA 4YTPA 1PJ6A 2XFPA 1GRAA 2BS3A 3UKQA 4C3XA 2YVGA 5JCLA 4ICYA 4FX9A 3NYCA 1ZK7A 2JKCA 1CJ3A 3DK9A 4JY3A 4ZCCA 1GEUA 4O5QA 4B65A 4CCRA 4OCGA 3RP6A 4DNAA 3VRAA 4EQWA 2VQBA 2VRMA 4I59A 3AD8B 1QLBA 2C70A 1GNDA 4EQXA 3AYLA 1FCDA 3E1TA 2VOUA 2XLPA 4N9XA 1EL8A 3K7QX 2YR5A 2PYXA 1F6MA 5JCIA 3P4RA 3UOVA 2BXSA 2YLXA 3DGHA 4ADWA 1VG0A 1VQWA 2A8XA 1X31B 1ZKQA 2BK5A 1KFYA 4RG4A 4GRTA 3UOXA 4B63A 4UDRA 2EQ8A 1IUTA 3QVPA 3GYJA 2X8HA 1N4UA 2RABA 1PHHA 1D4CA 4D03A 1PBFA 2GAGB 2BS4A 4IA5A 5JCMA 2OA1A 3CGCA 3UKKA 4J36A 4H4UA 3P4SA 1DJNA 1GOSA 2QAEA 4JY2A 2YM1A 2YG7A 5FS9A 4Z43A 1LJ1A 2ZZCA 3QSEA 3S5WA 2C76A 2QCUA 1FEBA 3G5QA 2YAUA 3AYJA 4H4RA 3C96A 3R9UA 4JQ9A 1H7XA 1OJAA 4BV6A 5IQ4A 2ZZBA 2BACA 3F8RA 4X9MA 1DODA 1L0VA 2AQJA 2CULA 2XFNA 2WDQA 1S2QA 3P4PA 2B76A 5J60A 1P2HA 1JNRA 4Z24A 3WE0A 2BABA 3LOVA 3D8XA 2WEUA 4AOSA 4USQA 5C2TA 4BJZA 2Q6UA 4K8DA 1JU2A 4H4XA 1NEKA 5FS8A 2GMJA 1PBDA 2WPCA 1RP0A 1EL9A 1ZOYA 2R4JA 3DJGX 3CNDA 2JBVA 2YR6A 2DKHA 2YG5A 2YVFA 1H6VA 1O95A 2TPRA 4JN9A 4LA1A 4LU6A 2B7SA 4H2QA 1NHQA 1YQZA 2TMDA 3NLCA 4A7AA 3NTAA 1GRBA 3CGEA 5CQFA 1FECA 2GB0A 3AEAA 3H8IA 3LJPA 5IPYA 3NN6X 5HHFA 4EIQA 2YWLA 4JNAA 1K0IA 2GF3A 4KPRA 1LPFA 1LV0A 3AEDA 4X9NA 1KF6A 2R9ZA 3CNJA 1IUXA 5KOWA 2ARDA 2R46A 1Y0PA 4H2NA 2GH5A 2WP9A 3L1RA 4EMIA 3I6DA 2C72A 1GT8A 1M64A 1TRBA 2YLWA 4J31A 2OLOA 1QO8A 2VQ7A 4PAAA 1YKJA 2X99A 5GSNA 4D04A 1UKVG 3UTGA 4C74A 2X50A 2VVLA 2CFYA 3IHGA 2UZZA 5LV9A 3LADA 3KD9A 1ELIA 4A65A 2GV8A 3LXDA 1CHUA 1N1PA 3AEGA 3ALLA 3UP5A 3AECA 3GDPA 2F5ZA 2WU5A 1CC2A 2WPFA 4YT0A 1ZY8A 2YG4A 3ICTA 3SM8A 4B1BA 2NPXA 1NDAA 1XDIA 3AD9B 4DSHA 5BRTA 1H81A 5U25A 3EPTA 2RGHA 1NG3A 1PBCA 2BC1A 3NG7X 4RG3A 3SFEA 2V3BA 2RGOA 2ZZ0A 2GMHA 2BXRA 2R45A 2XLTA 3BNUA 4B68A 2GQWA 4U2TA 4EQSA 3RP7A 1GRHA 4YSYA 1OJTA 5IQ1A 1BF3A 4BK3A 1JRYA 1KNPA 1KDGA 1PS9A 4J56A 2Q0KA 4A9WA 1BKWA 1F8SA 2V6OA 3KVEA 4Z2TA 3ICRA 1CL0A 3ALJA 1ZDLA 3NK1X 1NHRA 5M0ZA 3AWIA 3V76A 2BK4A 2YLRA 2PHHA 1F8RA 4H2RA 1YY5A 5ER0A 3II4A 2WP5A 3GD4A 3H4KA 4NTEA 3PVCA 1PBBA 4H4YA 3VQRA 5L46A 4PABA 3NK2X 3PO7A 4M52A 4YTNA 5KVHA 1CJ4A 1LVLA 3BI4A 4IA6A 1L9DA 5CKUA 4U8IA 1F8WA 1NHPA 1NAAA 3ALMA 4HB9A 1TDOA 1KSUA 1XHCA 4J33A 1O94A 4U2SA 2A89A 1AOGA 5FS6A 1NHSA 2XVEA 2O9ZA 1CC4A 5EOWA 2VVMA 1BGNA 2XVJA 3UKAA 4DSGA 2W0HA 2YR4A 4ECHA 1TDKA 1H83A 2V5ZA 3QSSA 2BS2A 2WOVA 5KRQA 3ISHA 3ITJA 3QSMA 5KXJA 2XVIA 3K30A 2WU2A 1PXCA 1N4WA 1IJHA 1PXAA 3NNEA 1N4VA 2BYBA 3GRSA 3VR8A 2WETA 5KVIA 3CNTA 2C3DA 2R0CA 3FG2P 5HXIA 4K2XA 4J2WA 4O5UA 3REDA 1GRTA 3VRBA 4YKFA 1DOCA 1D7LA 4U8MA 4ZCDA 4OPGA 1NG4A 4WCTA 3SQPA 1H86A 4C5OA 2YLZA 4MJWA 4Y4NA 3CNSA 3AXBA 4Z2UA 2QA1A 3HZLA 4C77A 2GR2A 2WS3A 1M6IA 3ATRA 3JSKA 1NENA 1LTXR 4BJYA 4NTCA 3B6DA 1JOAA 3UOZA 4YSZA 1B8SA 1Q9IA 3NK0X 4AP3A 5KOXA 3UTEA 2XFOA 3IWAA 3D1CA 1GXFA 2BC0A 2JB2A 1QJDA 2YLSA 4H4VA 4XWRA 3NH3X 2YQUA 4NZHA 4IVOB 4U8KA 1W4XA 3CNPA 2XDOA 2R0PA 3IHMA 2YG6A 4H4ZA 4H4SA 1E1NA 3AE5A 3GDNA 2X8GA 4AT2A 1D7YA 3IF9A 3QVRA 3SFDA 3UOYA 1CJCA 3NIXA 4TM4A 1ZP0A 1IUUA 2WBAA 4TM1A 4A79A 4TM0A 4H4PA 3UCLA 4E0VA 2X8CA 4YTMA 1IUVA 2Y6QA 5J7XA 5BUKA 1VRQB 3IC9A 1B37A 3NN0X 1Q1RA 3AEEA 4CNKA 2C66A 4EQRA 2J3NA 1V59A 2V60A 3AE3A 4H7UA 3DGZA 2QA2A 1K0LA 1RSGA 4NTDA 1YQ4A 1GRGA 5BULA 3LZXA 4U8OA 2JB1A 2RGJA 3CN8A 1OJCA 3DMEA 2EQ6A 1FEAA 2C3CA 1TDNA 3LZWA 4FK1A 4OPTA 4K5RA 1FOHA 4IV9A 3CTYA 4RSLA 1BWCA 3AE2A 2XFQA 1S3EA 3RNMA 3V3NA 5DBJA 3ABVA 1ZX9A 3FPZA 2WOWA 2FJEA 2ZBWA 3G5RA 3RP8A 2IVDA 2Q0LA 4GDEA 4CRTA 4NEWA 3O0HA 4AP1A 4BK2A 2C75A 3EANA 3NHOX 1D5TA 3I3LA 1TDFA 3CGDA 4YXDA 4GUVA 1YQ3A 2X3NA 3QJ4A 1IUWA 3KPFA 1LQUA 3C4NA 4H50A 2EQ7A 2Z5YA 1PDHA 3V3OA 1COYA 3AEBA 1H82A 1DJQA 5BVAA 4H4WA 1P2EA 4CBQA 2E5VA 3DK8A 1EL5A 3K7MX 3CPIG 4H2PA 2E4GA 5EB4A 2H89A 4GF7A 1CJ2A 3UTFA 4B67A 1MOKA 2JAEA 2BA9A 1SEZA 4UDPA 1TYTA 3DJDA 3G5SA 3KU9A 3CGBA 4DGKA 2WOIA 2YG3A 2VVLG 1E1KA 1PXBA 1XANA 2OAMA 2AR8A 3UP4A 2FBWA 4Z2RA 3AYIA 5HYMA 2NVKX 1OJDA 3COXA 2IIDA 3DK4A 3AB1A 3GRTA 3CPHG 3K7TA 1E1LA 2GRTA 3OC4A 4JDRA 4K22A 2EQ9A 2XLRA 1H84A 5U63A 3ADAB 3Q6JA 1GERA 3AEFA 2GEWA 3DA1A 1PJ7A 4B69A 4BURA 4H4QA 1D4EA 5JCKA 1IUSA 1F3PA 1S3BA 2V3AA 5KWFA 5M10A 3B3RA 1TYPA 4B66A 4NEVA 3FMWA 2R4EA 3GYIA 2H88A 3KLJA 2YVJA 4HA6A 3T37A 4USRA 1MXTA 5FMHA 1DOEA 1OJ9A 2FJDA 2V61A 3Q9TA 3NTDA 3F8DA 3SGLA 1Y56A 2Q7VA 4UP3A 2E1MA 1JEHA 2BK3A 2OALA 4K7ZA 3CPJG 1DNCA 4LIIA 4UDQA 3NYEA 4U8JA 2WQYA 3DJJA 4OPLA 3RHAA 3VRDB 4A6NA 5GRTA 4B64A 1PBEA 2GR1A 1GTHA 5HY5A 1TDEA 3QFAA 3UTHA 4EM4A 4TLZA 3GWFA 2FJAA 3AE7A 2APGA 2AAQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2C67A 4KCAA 1Q1WA 4AOXA 3GSIA 2Z5XA 3F0IA 5BMUA 1B5QA 2LQOA 2OBIA 3KP9A 2WGRA 3MSZA 2Y6RA 1PJ5A 2BTOT 2B9WA 2XLUA 2B7RA 1HQOA 3IA1A 2VRLA 1JZOA 4OPUA 3A2WA 1GLPA 3QMXA 2E7PA 4EO3A 2GZZA 2YOIA 3UVHA 2WESA 4MK3A 3GD3A 1AQVA 1XIYA 4ML1A 3BNMA 1I9DA 4AT0A 1CC6A 5ECSA 2GQFA 1PMTA 2FA4A 3TRQA 3PS9A 1SD8A 2GVCA 4YKGA 2B9YA 4TLXA 4WF4A 4BL7A 5EBKA 3DGQA 3HYVA 5E59A 3AE1A 1GP1A 3Q6OA 4IKHA 2DKIA 4K5SA 1B4PA 3CQFA 4H4TA 2H72A 2C3QA 1GUMA 4N0ZA 4KE3A 1V57A 4XTSA 2VIMA 3H93A 3H1NA 3RHBA 3FZ4A 3DYRA 2ON7A 4IP1A 1SL0B 5A4VA 1GSNA 2JK6A 3EF6A 4KDYA 4MPFA 4KB3A 3GH9A 5J41A 4PQHA 4EXJA 5IMVA 4A99A 3E9JB 1VF3A 4MDCA 1Z6LA 1ZMDA 3NGCX 3DH9A 3M0OA 1GTEA 4OVIA 3D6IA 1L9EA 3J7Yb 2QKEA 5GZZB 6GSWA 5JCNA 3TCOA 4KX6A 2FY6A 1YY7A 1GPEA 3TDGA 3VWVA 1Y6EA 4OFNA 5JCWA 3HZ8A 4G73A 1K0JA 2C73A 4TR3A 3AE8A 3S61A 1RYIA 3I9V2 5ECIB 2CDUA 2IMEA 4V2NA 4A5LA 4EMWA 1DOBA 2VM1A 3QFBA 2JADA 1PSQA 5G1KA 1PD21 3UKFA 3MAKA 2XFPA 3LSZA 3UKQA 1USBA 4TRXA 4ICYA 4GSTA 1RK4A 4RI6A 4ZCCA 1GEUA 4B65A 4OCGA 4ZL9A 4O5RA 3FR6A 3ZL5A 4IHUA 3S9FA 3AD8B 4YQVA 4GQCA 3AYLA 3GUSA 1FCDA 3L78A 1XW6A 2LJKA 3FR3A 3KMNA 1WJKA 1QFNA 1ZYQB 4LMWA 2R37A 3WGEA 1VQWA 5D96A 1S3DA 1SKRB 4GRTA 1B9YC 1U3AA 3CSIA 1D4CA 3K8NA 5DDLA 1ERTA 1SYXA 6GSXA 2ALBA 1DJNA 1GOSA 5CP1A 2LSTA 2YG7A 5FS9A 4FO5A 2XBQA 5AIVA 1EV4A 2QCUA 5HR1A 3UAPA 4IBPA 5IMCA 1FEBA 4DSSA 2HRAA 4BV6A 4WETA 1OJAA 5IQ4A 2PBJA 1GH2A 1Z7PA 4N30A 5B8BA 3C71A 5J60A 1P2HA 3WD6A 4Z24A 3LOVA 12GSA 1OAZA 4USQA 1Y25A 1JU2A 2PPTA 1NEKA 2AB6A 3T2YA 1RP0A 1EL9A 1ZOYA 2YR6A 1O8WA 5D9VA 2YVFA 2XC2A 4LA1A 1M2BA 1EV9A 2FNOA 2X4AA 1YQZA 5KMQA 3LG6A 4TR1B 4A7AA 1XPVA 2H1GA 2H1AA 1F37A 2DJ1A 3AEAA 3KMOA 4EIQA 2YWLA 2GF3A 1DSBA 3CNJA 3TB2A 1JLVA 1M99A 1J08A 5CAXA 2DLXA 4EMIA 2C72A 2IPAA 1TRBA 4D73A 11GSA 4BPYA 3VWUA 1YKJA 1E2YA 2GSQA 4CDOA 4K7NA 2HSHA 4AF2A 2VVLA 1ON4A 3NOFA 4PURA 1TP9A 4WXTA 2UZZA 5LV9A 2HZFA 1ZYNA 4IELA 4V2MA 3AEGA 3UP5A 5COHA 3GDPA 5KMRA 2F5ZA 1QK8A 4WKWA 2YG4A 2HLSA 1NDAA 4EKZA 4JE1A 4NAXA 5U25A 2BC1A 1PBCA 3NG7X 2V3BA 3I69A 1PX6A 4PX1A 2RGOA 2GMHA 2R45A 2XLTA 4U2TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5BRTA

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