5BRT | Genus

Total Genus 188

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	188
sequence length	581
structure length	554
Chain Sequence	AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords	2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus	188
structure length	554
sequence length	581
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-06-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5brtA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	5brtA01

1PJ7A 1Q1RA 3SGLA 2GB0A 3ICSA 1B4VA 4H4QA 2B9XA 4GDEA 3NLCA 2XLTA 4IV9A 1JOAA 2B9YA 4H4RA 3ICTA 4DGKA 2R0CA 1OJCA 3V3NA 1VRQB 2EQ8A 1K0LA 1VG0A 2WU5A 2W0HA 1NPXA 2BC1A 4B65A 3BHFA 5KOWA 1M6IA 2JB1A 2F5ZA 3ALMA 3P4PA 3Q9TA 3NYEA 1NENA 1RYIA 2V3BA 1H83A 1E1NA 2Q6UA 3CPJG 2WPFA 3CNTA 3NIXA 1KNRA 1CL0A 2H89A 1Y56A 3L1RA 5J7XA 3PS9A 5GRTA 4K5RA 4EM4A 3QFBA 3VRDB 4HA6A 2JBVA 2XLRA 3AE5A 1S2QA 1N4WA 2WOWA 4FX9A 2YLWA 4NEVA 4U8OA 2C66A 1PN0A 1JU2A 2XLPA 1F8RA 4CRTA 4NZHA 3AEEA 3H4KA 1L0VA 4J33A 4B1BA 1K4QA 4AT2A 5KVHA 4U2TA 3M13A 4U8IA 1ZOYA 1IUVA 1PS9A 1DOCA 3LADA 4H2NA 2R4EA 3L8KA 4CY8A 1JNRA 3QSEA 4I58A 4EQXA 1FL2A 3URHA 2WU2A 4Z2RA 4BK3A 3IHMA 4K8DA 2R0PA 4BK1A 1CJ4A 3NNEA 2JKCA 3AE9A 4UDRA 4YTNA 2WQYA 4AP1A 2Z5XA 4J56A 1TDOA 1ZMDA 2BS2A 3NH3X 2OA1A 4NEWA 1Y0PA 2ZZ0A 2WOVA 1RP0A 2FJAA 1O94A 2ACZA 2Q0LA 2QCUA 3REDA 4AOXA 4B67A 1GTHA 3FMWA 1GRHA 4K5SA 2PHHA 3ATRA 4I59A 4OPDA 4OPLA 3P4SA 2EQ6A 1Q1WA 4C74A 1GESA 4DSHA 3F8RA 1CC2A 3BNMA 2YM2A 2VVLA 3DH9A 2FBWA 4H4TA 3UOVA 4P9SA 3G5RA 5DBJA 1DOEA 3DMEA 4TM0A 1IUUA 1JRYA 1NHQA 2E1MA 4LA1A 4K2XA 4FK1A 4U8MA 2BK3A 3NN0X 4Y4NA 1F6MA 4J31A 1DXLA 1H86A 1KFYA 4CBQA 2YLXA 1V59A 4H7UA 2IVDA 1B8SA 1EBDA 1FEAA 2WBAA 3ADAB 1MOKA 5FMHA 3CTYA 2C67A 4YSXA 4REKA 1E6EA 1ELIA 2GQWA 2GR2A 2WESA 3K30A 4Y4LA 4OPGA 4YKGA 3KU9A 1D7LA 5U25A 2X8CA 3R9UA 1E1MA 1K0IA 1L9CA 1RSGA 4ADWA 3AE1A 5CKUA 2VQ7A 2YLTA 3H8LA 1ONFA 1D7YA 1NHSA 1KDGA 1PBBA 2VRLA 2RGHA 3GD3A 4H4ZA 4LU6A 4A6NA 3AEGA 2ARDA 3AE7A 4H4SA 2XVFA 2IIDA 2GR0A 1N4VA 1O95A 2C65A 3AYLA 1ZOVA 4IA5A 1HYUA 2JK6A 4KX6A 3AYIA 4OVIA 1PBEA 1Y56B 3AE4A 4OPTA 1CC4A 1D5TA 1NHPA 4USRA 2QAEA 4NTDA 4CY6A 1IUSA 4IA6A 3AYJA 2WETA 3C96A 4XXGA 1PXBA 4C3XA 4BK2A 3COXA 3ALJA 3UKHA 1LTXR 1GREA 1LVLA 1NEKA 2YLRA 4Y4MA 1YQ4A 2WDQA 4IVMB 3ATQA 1H7XA 2ZZBA 4GUVA 4TM3A 4TM4A 3C4AA 5HHFA 2C72A 1TYTA 2BCGG 2RABA 4H4WA 4RG4A 1FEBA 2V3AA 3UCLA 2XFPA 3UTEA 4USQA 3P4QA 4D03A 3GYIA 5FS8A 2VVLG 1BWCA 2Q0KA 3QSSA 4CCRA 3DJJA 2FJBA 1VQWA 3VR8A 4B64A 3ALLA 2WDVA 4JNQA 1TDFA 5ER0A 3CNDA 2BK5A 3ICRA 2B7RA 3V3OA 2YG6A 3SM8A 3OC4A 3CN8A 2VQBA 1XDIA 3NTAA 4GDPA 4U8PA 5JCMA 4ICYA 2WOIA 2C73A 3NK1X 4EQSA 1F8WA 4EMWA 3FIMB 2GEWA 3EAOA 4TM1A 1GPEA 3VR9A 2C3CA 4CNKA 5CQFA 1NAAA 3CNPA 3EPTA 2EQ7A 2FJEA 3CGBA 1B5QA 2BS4A 3AE8A 3DJGX 3ZDNA 3DK4A 2DKHA 3UOZA 2CFYA 2XVJA 3RP7A 4TLXA 1BF3A 4BV6A 5KOXA 1DJQA 1PDHA 4JN9A 2E4GA 1KNPA 4J36A 1LQUA 1NG4A 1Z6LA 2R4JA 4YKFA 5JCIA 1DODA 2YG7A 4O5QA 3BI4A 1XHCA 2VOUA 3NTDA 2XLSA 1ZY8A 2XVHA 3M0OA 1E7PA 2XFQA 2C64A 3G5SA 4JQ9A 3RP8A 4CCQA 5KVIA 2WPEA 4A79A 3UTFA 3FG2P 3DA1A 2JAEA 5EB5A 4CNJA 4EIQA 2GQFA 5JCNA 1OJAA 2WP5A 4U8KA 1GT8A 3LB8A 3SQPA 1PHHA 2H88A 4U8LA 2GRTA 3DK8A 3K7MX 4Z2TA 4JDRA 5C3JA 1KSSA 3RP6A 4UDPA 3AD9B 2BCPA 2XFUA 2YVGA 1DJNA 2OAMA 4H50A 1GRGA 3AEFA 2YAUA 1EL9A 1AOGA 4UDQA 1PJ5A 3KLJA 3RNMA 4A5LA 1LPFA 3NKSA 3BI5A 5BUKA 4Z25A 2XYOA 1CBOA 1PBCA 4X9MA 3CGCA 4U8NA 2YR6A 3NGCX 2BXSA 5IQ1A 4AT0A 4J2WA 3AB1A 2R0GA 2V61A 1JRXA 1B37A 3KD9A 4JY3A 4LIIA 4RG3A 4A6NB 2YVFA 4A99A 2C7GA 3OZ2A 5M10A 3DJDA 2V6OA 2JB2A 3LOVA 4B63A 2XFOA 3K7QX 1BGNA 5BRTA 3E1TA 1YY5A 3CGDA 1GOSA 3UKQA 2X3NA 2YLZA 1JRZA 4B69A 1GTEA 2O9ZA 2RGJA 3GWFA 1GEUA 1OJTA 1XANA 3LZXA 5C2TA 1YQ3A 3D1CA 4XWZA 4H4UA 1QLBA 3GMCA 4AOSA 1IJHA 3UKLA 4YSZA 1OJDA 4ZCDA 3IWAA 3UP4A 1CC6A 1K0JA 4NTCA 1GV4A 3RHAA 1S2YA 2BACA 2Y6RA 1N1PA 2OALA 5KRQA 1E1KA 2ZBWA 2WS3A 3AE2A 4WX1A 4BJYA 4A9WA 3O0HA 4DSGA 2GR1A 4H4XA 1D4EA 2B7SA 1GXFA 5FS6A 5J60A 3IHGA 1IUTA 3NHOX 3P9UA 4EQRA 2GF3A 1GETA 4B66A 3UKAA 2NPXA 5HY5A 3AEDA 4GRTA 4U2LA 1JNZA 1UKVG 3QVPA 1GNDA 1YQZA 5JCKA 3LJPA 3GMBA 1COYA 3KVEA 5U1OA 3EF6A 5BVAA 1LJ1A 4ECHA 1CF3A 2TMDA 1D4DA 4X4JA 1O5WA 1LV0A 2I0ZA 3DJEA 3PO7A 3AWIA 4RSLA 2C76A 2YQUA 4ZCCA 1M64A 1E1LA 4Z26A 4IVOB 3BHKA 3KKJA 4J34A 4YWOA 4DNAA 1CHUA 3GRTA 2UZZA 1N4UA 3NYCA 4N9XA 2BABA 1EL5A 1MO9A 1GALA 1QO8A 1E39A 4GF7A 5FS9A 5FS7A 2Z5YA 1H81A 3UOYA 2GVCA 2GV8A 2YLSA 3AEBA 3DK9A 2A89A 3GDPA 2C3DA 3T37A 2R9ZA 1FCDA 2GH5A 4FDCB 3VRAA 1VDCA 3IF9A 4H4VA 3GRSA 3UKPA 3ZYXA 2YVJA 4WCTA 5LV9A 4C5OA 3UTHA 2QA2A 4EIPA 4EQWA 2J3NA 2VVMA 1BZLA 1F3PA 4M52A 2X8HA 3GWDA 3H8IA 3HZLA 4EM3A 1L9DA 3UKFA 4D04A 2B76A 4ZN0A 1D4CA 4OPIA 5HYMA 4YTMA 2E5VA 3GYJA 2GAHB 5KWFA 5KXJA 3AE3A 3BNUA 3CIRA 3BI2A 3PVCA 2OLOA 2XCGA 3AEAA 3NRNA 3CGEA 1L9EA 4X9NA 1LQTA 4A65A 2EQ9A 1XPQA 5TR3A 1PXAA 2R45A 4NTEA 4H2PA 2XFNA 1IUWA 1QJDA 4OPUA 1KF6A 4B68A 3WE0A 4J57A 2AAQA 1TDNA 1F8SA 4XWRA 1IUXA 1PBFA 1ZDLA 1ZK7A 3CNSA 1X31B 3EANA 2XDOA 3LZWA 3QSMA 5IQ4A 1EL8A 2RGOA 2WDRA 1DOBA 3FPZA 3D8XA 4Z24A 1GRTA 2NVKX 2ZZCA 4O5UA 3CPHG 5L46A 1NG3A 4FK1C 3KA7A 4APNA 2YWLA 4BURA 1BKWA 3QJ4A 4JNAA 1CJ3A 2GMJA 3B6DA 3IC9A 1REOA 1DNCA 2R46A 2C70A 1VG9A 4OCGA 5IPYA 5HXIA 4BJZA 3SFDA 3V76A 4EMIA 3JSKA 2AQJA 1GRFA 1P2HA 2XVEA 2YG5A 4H4YA 3UTGA 3GD4A 3VRBA 3VQRA 2YR4A 3Q6JA 2WP9A 3KPFA 3I3LA 2BYBA 1CJ2A 2V5ZA 2OLNA 2YR5A 3AECA 3P1WA 3S61A 3UP5A 4C3YA 2CULA 2FJDA 2BS3A 3I6DA 5U63A 2Q7VA 3B3RA 3UOXA 2TPRA 5EOWA 1SEZA 4AP3A 1S3BA 1P2EA 1FECA 3ITJA 1GSNA 4TLZA 1TRBA 2YM1A 1BGJA 1ZX9A 2XLUA 2XVIA 3QVRA 3F8DA 2GAGB 2CVJA 2BA9A 3G5QA 3NT6A 2APGA 3LXDA 3GSIA 3AD8B 3CNJA 3M12A 2HQMA 2WPCA 3K7TA 2X50A 4H2RA 4K22A 2VRMA 2QA1A 1PBDA 2WHDA 4EMJA 1H7WA 2C75A 1PJ6A 3NG7X 5JCLA 1GRBA 5EB4A 3NN6X 1FOHA 1S3EA 4H2QA 4YT0A 3DGZA 2GR3A 4Z44A 1W4XA 3II4A 2JB3A 5EBKA 2WP6A 4U2SA 4PAAA 1TDEA 2DKIA 4KPRA 4YSHA 2YG3A 2VZ2A 4PABA 3C4NA 1PXCA 3NYFA 3AE6A 1JEHA 1H82A 4YXDA 2WEUA 2AR8A 2BK4A 3F8PA 3UKKA 2X99A 3ABVA 3AD7B 5GSNA 3GDNA 4C77A 1KSUA 2YG4A 3ISHA 1ZKQA 2GMHA 3S5WA 1Q9IA 1TDKA 3NK0X 2A87A 3SFEA 2V60A 4K7ZA 4A7AA 3CPIG 1TYPA 2A8XA 4H4PA 4MJWA 4HB9A 3NK2X 1ZMCA 1GERA 1H84A 3QFAA 1CJCA 1OJ9A 4OPCA 4JY2A 3DGHA 1H6VA 1NDAA 3P4RA 5BULA 1ZP0A 2PYXA 1GRAA 2BXRA 3AXBA 4GCMA 2B9WA 2Y6QA 2IVEA 2BC0A 4U8JA 1MXTA 4YTPA 2X8GA 4UP3A 5M0ZA 3FBSA 4Z2UA 4E0VA 1EL7A 4Z43A 4GR1A 1YKJA 1NHRA 4YSYA 2CDUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2QKEA 3IR4A 4GSNA 3IE3A 3FZ5A 2B9XA 4N30A 4IV9A 2OJLA 1JOAA 5D9XA 4FIWA 2B9YA 4N0ZA 1T8EB 1YF1A 3I69A 2YZHA 2H6ZA 14GSA 1NPXA 4B65A 3BHFA 1V57A 5KOWA 2JADA 3KP8A 2B7JA 4KDUA 2F5ZA 3P4PA 1H83A 3ME8A 1THXA 2WPFA 3CNTA 2H89A 3L1RA 5GRTA 3ZZXA 5IMFA 3GUSA 2VL2A 1ERWA 3AEEA 2LSTA 4IKHA 4B1BA 4GCIA 2PVOC 2F9SA 1M9AA 2EC4A 1PS9A 3L8KA 2MMOA 1TOFA 4ULXA 2YP6A 4GAPA 3UMAA 1VF4A 2R0PA 4BK1A 4POKA 3NNEA 3MYDA 4J56A 1GSUA 1XWCA 1TDOA 3TKSE 2M46A 4PTSA 4OO5A 1Y0PA 2QSIA 2ZZ0A 2CZ2A 3TRXA 3MWHA 2LNTA 2H74A 2Q0LA 2CZ3A 1GTHA 1K3OA 1B9YC 4FYUA 1GRHA 3QCPA 2GTUA 7GSSA 4TR3A 3ATRA 4OPLA 2DJ3A 3PR8A 1GSEA 3BNMA 2YM2A 2FBWA 2XPDA 1SYRA 2MMAA 5F0GA 4HU7A 4TM0A 1H4OA 2JACA 2GS3A 4JRRA 1NHYA 1XBSA 2C4JA 1NHQA 3NN0X 2YV7A 5ECKB 1KFYA 1G7OA 1K0CA 5F07A 2IVDA 4JEDA 1B8SA 1FEAA 3D5JA 3ADAB 1MOKA 1OKTA 2IMDA 1A2MA 4E8HA 3HYVA 4EDZA 2GR2A 1IYIA 4IGJA 5CREA 4YKGA 3F4SA 1V9WA 4K8MA 1TXXA 3ERWA 3VWWA 5U25A 2GSQA 2H0HA 3TJJA 2A4VA 1A24A 1L9CA 3LWAA 3ZLPA 4CHSA 1GWCA 3H8LA 1YEXA 4LU6A 1V2AA 1ZMAA 2C65A 4IA5A 1JZOA 1NM3A 4L8EA 4OVIA 2J23A 1Y56B 2FHEA 3GIXA 1D5TA 1NHPA 3KMNA 1TK0B 1TJDA 4BVXB 2QAEA 1IUSA 4F0CA 3AYJA 1GNEA 1K0MA 1YKAA 3C96A 2HXKA 2JZSA 1K3LA 5KN1A 1LTXR 1LVLA 5IOWA 4Y4MA 5ECRB 3ATQA 2IMFA 2DIYA 1YJ6A 4H4WA 2CVDA 5ECNB 2V3AA 4D03A 4USQA 18GSA 2VVLG 2Q0KA 3QSSA 2H1DA 3G9BA 1FO5A 1PRXA 2FJBA 1EV4A 2WULA 1VQWA 3VR8A 3ALLA 4MF6A 3CNDA 5AGYA 4PURA 3ICRA 2FY6A 2B7RA 1GTUA 3SM8A 4GDPA 4U8PA 4ICYA 2C73A 3PH9A 1F8WA 3L4NA 2GEWA 3VR9A 4GWRA 1Z7RA 1EZKA 2FJEA 4IBPA 3ZDNA 4HJMA 2C3TA 2DKHA 3UOZA 2XVJA 1DJQA 1PDHA 2E4GA 1JLWA 5D8IA 1Z6LA 5JCIA 5GSTA 4XCSA 3BI4A 1QK8A 1XHCA 2VOUA 2DBCA 1ZY8A 2XFQA 4MH3A 2KOKA 5KN2A 3GYKA 2F8AA 3GA4A 1NHOA 1ZL9A 5EB5A 2KHPA 4MH2A 4EIQA 5B8BA 5JCNA 3LB8A 2H88A 3FHKA 4EXJA 1EGRA 2CT6A 4N10A 2P31A 3TJBA 5C00A 2OKAA 4LMVA 4OWYA 2FA4A 3CRTA 2I4AA 3GRXA 5ELGA 2OE0A 2LKUA 3SX6A 4XRAA 4Z25A 2E2MA 2ZCTA 1X9WB 3CGCA 2CVBA 1IYHA 5ID2A 1PL1A 1OC9B 2PGTA 2WJUA 4J2WA 3AB1A 2R0GA 2B3SA 1JRXA 3TRQA 3CSIA 3MSZA 4JY3A 4LIIA 4A99A 3D6IA 5J41A 4KNDA 1BGNA 4EO3A 3KD0A 2CQ9A 2CX3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5BRTA

Total Genus

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