5BRT | Genus

Total Genus 188

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	188
sequence length	581
structure length	554
Chain Sequence	AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords	2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus	188
structure length	554
sequence length	581
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-06-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5brtA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	5brtA01

2XYOA 4KPRA 3ISHA 2GR2A 3DJJA 1TDOA 3DA1A 4AP1A 1IUVA 1EL7A 2BS3A 2YLZA 3H8IA 4YKGA 2IIDA 2ACZA 4OCGA 1H6VA 3ATRA 3UKLA 3GDPA 4X9NA 1CF3A 5FS9A 2W0HA 3NRNA 4B67A 4GRTA 3EF6A 1F3PA 2RABA 2FJAA 4Z43A 3K7TA 4JNAA 2WU2A 2X8CA 1PHHA 1H81A 4RG3A 3AE5A 3KKJA 4X9MA 2JB3A 1DOEA 1XHCA 3ALMA 3NG7X 3AE1A 4REKA 3UTHA 1XPQA 2ZZCA 2YLWA 4AT0A 4YXDA 1PXBA 1N4UA 1FL2A 3RHAA 2GV8A 2OLOA 3QSSA 3GYIA 1GEUA 2CFYA 2OLNA 4H2PA 3UOXA 4BK2A 4X4JA 3AE9A 2JAEA 4MJWA 4TM1A 2TPRA 2VZ2A 3K30A 3NTDA 2GAHB 4P9SA 4U8OA 4H4QA 3LZWA 3T37A 1BZLA 4B64A 5U25A 4U8IA 3S5WA 5KRQA 3F8RA 1TYPA 3UOYA 4Z2TA 1PDHA 2XLPA 3DK9A 4OPTA 5FMHA 3UKQA 4H7UA 3GMBA 4A5LA 2XLTA 1DOBA 5TR3A 5KOWA 2AQJA 2WESA 2AAQA 4FK1C 4NEVA 3ICSA 4OPDA 1XANA 2Q0LA 4GR1A 1H83A 5FS7A 2Y6RA 4TM4A 1KSSA 3SFDA 3NIXA 4O5QA 2I0ZA 2YG7A 3CGBA 4A9WA 3PS9A 4TM0A 1N4VA 2GB0A 1D4CA 1IJHA 1GRBA 1KSUA 3IF9A 2YG3A 2GH5A 2WU5A 1ZOYA 1N4WA 5BVAA 3IHGA 1KNRA 3K7MX 2XDOA 2B7RA 2YVJA 3IWAA 3EAOA 4A99A 2BABA 3UKPA 3OZ2A 1GERA 4B66A 3NNEA 4TLZA 3KPFA 1PXAA 1N1PA 1GALA 3G5QA 1IUTA 2WHDA 2NPXA 2C65A 3AECA 2XFPA 3GD4A 4J33A 4Z24A 3UCLA 2GEWA 2V5ZA 1VQWA 4U2TA 3UKFA 3UOZA 2R4EA 2YLXA 1D4DA 2XVIA 4I58A 4EMJA 3QFBA 4WX1A 2V3BA 3QSMA 1K0JA 2H89A 3VQRA 2NVKX 5JCKA 2Q6UA 4Z44A 1O95A 4BV6A 1TDEA 1Y56B 3RP7A 4C5OA 1NHQA 4J57A 3EANA 3CGEA 4EM4A 2A87A 4YKFA 4K7ZA 3GSIA 1B4VA 3SM8A 3AE6A 4OPUA 2JB2A 4JY3A 3FIMB 1CBOA 4D03A 4D04A 5JCMA 1GREA 4PABA 3FBSA 3F8PA 2BK5A 4RSLA 3G5SA 1E39A 1GOSA 2XVFA 1ZKQA 1V59A 2Q0KA 1GT8A 1EBDA 1LV0A 1GRGA 4RG4A 3CGDA 4IVMB 4C3XA 3AXBA 1NHSA 3NHOX 5BUKA 2Z5YA 2H88A 1LQUA 2B7SA 3P4RA 1GSNA 5GRTA 1DJQA 3H4KA 4H2RA 4H4SA 4LIIA 3DGZA 2BS2A 3NK2X 4A7AA 3CNSA 4J34A 1H86A 4Y4MA 3DH9A 3NN0X 2XFUA 4C74A 3E1TA 1BKWA 1CC2A 3I6DA 5CKUA 2APGA 3VR9A 4B69A 3ICRA 3JSKA 3AYJA 3NYCA 4ICYA 4H4TA 2BA9A 2YVFA 3UOVA 2WP6A 1Q1WA 3AEGA 4NTDA 4CNKA 4CNJA 1K0IA 4AOSA 1ZDLA 2ZZBA 1VG9A 1DNCA 2GVCA 4GUVA 1O5WA 2V3AA 2WBAA 1S2QA 2X8GA 3UKKA 2GRTA 4CY6A 1IUSA 3CN8A 2WOIA 4IVOB 4Y4NA 1IUUA 3ATQA 5M0ZA 3RP6A 3C96A 2V6OA 3KLJA 1JEHA 2C64A 1D5TA 3AD8B 5JCLA 3UP5A 3HZLA 1NPXA 3CGCA 1TDFA 1ZP0A 3DJDA 5U63A 1BWCA 3L8KA 4NTEA 4EQWA 2EQ8A 2C7GA 2XVEA 5IPYA 2PHHA 3AEAA 4K8DA 2YR6A 1DJNA 1QLBA 3IC9A 4U8PA 1GNDA 1PJ6A 2YLSA 2YQUA 4N9XA 4M52A 3I3LA 3CPJG 2WEUA 2JB1A 2RGHA 3CNTA 2E5VA 3LADA 1YKJA 1Y56A 2YM2A 1UKVG 2JK6A 4APNA 1GESA 3BI4A 4XWRA 3CNPA 4BJYA 1E6EA 4BURA 4OPCA 4OVIA 4U2LA 4EIPA 1H7WA 2QA2A 3KA7A 1Q9IA 2WPFA 4C3YA 1E1LA 4EMIA 2YWLA 3DMEA 2X50A 3UTFA 1BGNA 2PYXA 5IQ4A 2R4JA 3GWDA 1D7LA 5KOXA 2ARDA 3P4SA 4ZCDA 1LTXR 2WOVA 4ADWA 1H82A 3LZXA 3QJ4A 2V61A 2YM1A 1LQTA 1F8SA 1JRXA 1AOGA 2GR1A 3AE7A 1OJAA 2GF3A 1JRZA 4J56A 2YG4A 3AEFA 2IVDA 4YTNA 1COYA 1L9DA 2OA1A 4H50A 2R0GA 1DXLA 4HB9A 1O94A 3KU9A 3GMCA 2ZZ0A 3AE4A 3AEBA 3O0HA 1OJ9A 2C72A 4YWOA 4AP3A 1L9CA 1FEAA 2YVGA 1BF3A 2XFNA 3CNDA 5J60A 2Z5XA 4OPGA 1CJ3A 2EQ9A 4NEWA 2C3CA 1S3BA 4FDCB 1EL5A 4CCQA 4IV9A 4NZHA 2CULA 3BI5A 1PBCA 3ABVA 2FJBA 1B8SA 1CL0A 1P2EA 2BS4A 2O9ZA 2TMDA 3ITJA 1TDKA 4U2SA 4IA5A 2IVEA 2VVMA 4Z26A 3P1WA 1GTEA 1PJ7A 1VG0A 1ZMDA 3ADAB 3SQPA 1GTHA 2AR8A 1PN0A 3NGCX 3NYFA 4PAAA 3VR8A 2FJEA 4YSHA 1PBFA 3AE8A 2WQYA 2VVLG 1M6IA 3B6DA 4FK1A 4A6NB 2X99A 3L1RA 4H4ZA 2B9YA 1YQ3A 2GAGB 2E4GA 3CPHG 2R0CA 2BXRA 4H4UA 3V3OA 4YSZA 3FMWA 2R45A 1JNZA 1RYIA 3NYEA 5L46A 1TDNA 1NDAA 1LVLA 3NH3X 1B5QA 2OALA 3WE0A 4BK3A 3Q6JA 1LJ1A 2YLRA 1W4XA 2YG5A 3DJEA 1MOKA 5C3JA 5HYMA 4EMWA 3NK0X 2BK4A 1DOCA 2VQ7A 2OAMA 5JCIA 2FBWA 1OJCA 5KVHA 3FPZA 1PBDA 2GQFA 1GXFA 2BXSA 3K7QX 2C73A 2WP5A 2VOUA 3PO7A 4C77A 5HY5A 2GMJA 1K0LA 5EOWA 4K5RA 1X31B 3CIRA 4OPLA 4AT2A 2XVHA 4J36A 4Z2UA 2CDUA 4K22A 5M10A 1JNRA 2R9ZA 4U8NA 3NTAA 1NAAA 3BNUA 3FG2P 3NLCA 3DGHA 4BK1A 2XFQA 1ZMCA 4ZCCA 3BI2A 3QVPA 4XXGA 3AD9B 2C70A 4H4PA 4GCMA 2BYBA 2GMHA 2VRMA 4GDEA 1GV4A 3C4NA 1LPFA 5EB4A 1D4EA 3UKAA 2WDQA 1FCDA 3OC4A 5U1OA 1NHPA 1GRAA 1K4QA 4TLXA 1CJCA 3NN6X 3RNMA 3VRBA 4WCTA 4U8LA 1PXCA 5CQFA 3SFEA 3GDNA 4U8MA 3NT6A 3H8LA 1MXTA 1E1MA 4H4XA 4JY2A 4B63A 1OJDA 2WS3A 1NG3A 2VQBA 3LJPA 2YR5A 1QJDA 2UZZA 2WETA 2GR0A 2EQ7A 2XLSA 4USRA 3BHKA 4A65A 3BHFA 5HXIA 3DK8A 3SGLA 3ICTA 3NK1X 4H4WA 4Y4LA 3CPIG 2XCGA 3PVCA 4DSGA 3P4QA 1MO9A 2WPEA 3GRTA 5FS6A 2XLUA 4CBQA 2C66A 3M0OA 1E1NA 1DODA 2FJDA 1IUXA 1NG4A 4FX9A 3P4PA 4A6NA 2WDRA 2DKIA 1FECA 1CJ2A 3AE2A 1IUWA 2A8XA 2WOWA 3S61A 4J31A 4I59A 1ZOVA 4NTCA 4CRTA 2RGJA 3AD7B 2R0PA 4KX6A 1S2YA 3LXDA 4GDPA 3URHA 1NENA 3VRDB 3F8DA 5EBKA 1OJTA 1JOAA 4DGKA 4EQSA 2B9XA 2B76A 3AWIA 3Q9TA 5LV9A 1CC6A 4B68A 4YTPA 1CJ4A 2QCUA 1SEZA 2HQMA 1TYTA 2F5ZA 2YLTA 3M12A 4DSHA 3UTEA 3C4AA 1RSGA 1ZY8A 1GRTA 1E7PA 3ZYXA 1ONFA 4GF7A 3II4A 2Q7VA 4H4VA 4A79A 3ZDNA 5BRTA 1S3EA 2BCGG 3QFAA 2C76A 4JDRA 5IQ1A 1L0VA 3VRAA 4DNAA 2C67A 5JCNA 1ELIA 3GRSA 1NHRA 1Y0PA 1Z6LA 3D1CA 4YSYA 1KFYA 1RP0A 3NKSA 4B1BA 4K5SA 4UDQA 3R9UA 1EL8A 1NEKA 3AE3A 1KF6A 1H84A 4LA1A 5KWFA 2GQWA 4YTMA 1REOA 4CY8A 3QSEA 2WDVA 4Z2RA 2C75A 1BGJA 2EQ6A 3LB8A 5EB5A 1CHUA 3COXA 1L9EA 4AOXA 5KXJA 3GWFA 2XFOA 1E1KA 3EPTA 1D7YA 4ZN0A 4JN9A 3G5RA 1PBBA 2A89A 2YAUA 5ER0A 3UKHA 2WPCA 1F6MA 1JRYA 1PBEA 2CVJA 2QA1A 5GSNA 5BULA 2BC1A 3CTYA 2XVJA 3AEEA 3BNMA 1YY5A 3ALJA 3AB1A 4H2QA 1TRBA 1P2HA 2VVLA 1H7XA 3UTGA 1PJ5A 4U8KA 4EIQA 4H4RA 1GRHA 1ZX9A 4TM3A 4UDPA 4CCRA 2JBVA 2YG6A 1F8WA 3KVEA 4O5UA 4OPIA 5KVIA 2GR3A 1KNPA 2WP9A 3AYLA 5C2TA 2BCPA 2RGOA 1CC4A 1VDCA 1XDIA 3REDA 4E0VA 1HYUA 4UP3A 3D8XA 3M13A 4USQA 1EL9A 2X8HA 3LOVA 3ALLA 4J2WA 4BJZA 3QVRA 4YT0A 1KDGA 4XWZA 2DKHA 4JNQA 4UDRA 5FS8A 2BC0A 3GYJA 1FOHA 3DK4A 2XLRA 2VRLA 2E1MA 3GD3A 1FEBA 2C3DA 2J3NA 2B9WA 1QO8A 5DBJA 2YR4A 1GETA 3IHMA 2BK3A 3KD9A 3RP8A 3V76A 1F8RA 2Y6QA 4H4YA 4K2XA 1GRFA 1M64A 4EQXA 2X3NA 1GPEA 4ECHA 4U8JA 4EQRA 4YSXA 4Z25A 2R46A 1PS9A 4EM3A 1YQ4A 2BACA 1B37A 2QAEA 2V60A 1VRQB 3DJGX 4IA6A 3P9UA 4JQ9A 5J7XA 1Q1RA 5HHFA 3UP4A 3AYIA 4LU6A 4B65A 2ZBWA 1JU2A 4H2NA 3V3NA 1YQZA 3AEDA 4HA6A 3CNJA 2JKCA 1ZK7A 3B3RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4RQXA 4IS0A 1YKAA 4JBBA 3L78A 4L0WA 1EL7A 1WE0A 3M3MA 2IIDA 4OCGA 6GSTA 3ATRA 4POLA 4N11A 2FLSA 1GTIA 5JWRB 3UKLA 1CF3A 1ZZYA 4JR4A 2W0HA 2HZEA 3EF6A 1F3PA 2HLSA 4JNAA 4TRXA 2X8CA 1PHHA 4TN8A 3KD0A 4EDYA 3HZ4A 1DOEA 1BYEA 1U6TA 1V98A 3NG7X 3AE1A 4K7OA 4YXDA 1V40A 2OLOA 1GEUA 3FZAA 3UOXA 4X4JA 4MJWA 1OAZA 3GTUA 1JZRA 2C0GA 3NTDA 4DVCA 4H4QA 1ZMAA 1BZLA 4KNDA 5KRQA 1TYPA 3UOYA 4Z2TA 4G10A 3DK9A 4IGJA 5ECQB 4MJCA 4A5LA 1MTCA 5KOWA 2WESA 2AAQA 4NEVA 1GSFA 3HXSA 1ZYPA 4OPDA 3C7MA 1H83A 3IBHA 2Y6RA 3SFDA 1GSDA 3DRNA 3TKPA 3NIXA 1EWXA 4A9WA 3KMOA 1N4VA 2GB0A 1D4CA 3TOTA 4AF2A 3GSSA 4WETA 3IHGA 3UVTA 2EIQA 2XDOA 3EAOA 4A99A 2BABA 5DQYA 5D93A 5B8AA 3SX6A 4DEJA 4AJ6A 3A3TA 2VD0A 4TR1B 1GALA 5IIZA 3GKXA 1IUTA 2NPXA 1JZDA 1S3AA 3AECA 3GD4A 4J33A 5ECSA 1PKZA 3EMPA 4U2TA 4FIWA 2OBIA 2R4EA 2YLXA 2XVIA 2E7PA 1K0CA 4I58A 3QFBA 3VI5A 2V3BA 4EE0A 5LCZA 2KUCA 3L9UA 2IJYA 1K0JA 3G9BA 4ECJA 5D8IA 4D73B 2VL9A 1O8WA 5JWOB 1R5PA 1K3YA 4WBJA 5IOXA 1NHQA 3EANA 5CRDA 3CGEA 4MPFA 2JB2A 4JY3A 3RBTA 1CBOA 2ES7A 4D03A 5JCMA 2AB6A 4PABA 3TRPA 1N8JA 4F82A 3G5SA 3ZVJA 1E39A 4MNNA 1TOFA 1ZKQA 1EBDA 3LG6A 2BTOT 1NHSA 2EIOA 5BUKA 1U3AA 3GKMA 2H88A 5AIXA 5IMZA 2GLRA 1J9BA 1DJQA 2L6DA 4PXOA 3H4KA 4KW6A 4H2RA 4H4SA 1FVJA 3NK2X 3CNSA 3GL3A 1ERVA 3D5JA 4Y4MA 5KMQA 1A8LA 1JZWA 3NN0X 4C74A 2FUG2 1T7PB 1CC2A 3I6DA 4ECCA 1UC7A 3ICRA 3JSKA 2F8AA 5G5EA 1SK1A 1HQOA 3LGCA 2NBSA 2WP6A 3AEGA 5ID2B 1TRUA 4CNKA 1K0IA 3C1SA 2WB9A 1V2AA 1ZDLA 3SY4A 1DNCA 1F3AA 3IR4A 1O7UA 3LQ7A 2HT9A 1C72A 2X8GA 3DIEA 3FEUA 1VRSD 3R3EA 1S2QA 3CN8A 5CRHA 4Y4NA 1IUUA 3T31A 2HRAA 5G31A 2FD3A 2C0EA 4TR1A 3TB2A 3EWLA 4HJMA 4KDYA 2GSTA 4V2MA 4NTEA 2L6CA 4EQWA 3EMXA 4XS6A 1AC1A 1Q4JA 3ERGA 1QXHA 2DMMA 1K0AA 3DEXA 3SBCA 1PJ6A 3ME7A 5FWGA 3UBKA 4D73A 17GSA 4M52A 1Z3EA 4Z7XA 3H79A 2JACA 4FYUA 4APNA 1GESA 3BI4A 1AIUA 4V2NA 4NHZA 4YQVA 1K0DA 1H7WA 2QA2A 1E6BA 3ZREA 2R4JA 5KOXA 2ARDA 2DJ2A 1LTXR 1H82A 3LZXA 3QJ4A 4PNGA 2CVDA 3BBYA 4IP1A 2GR1A 4EKZA 1OJAA 1G0TA 1GWCA 4HB9A 3N5OA 1DXLA 3KJYA 1O94A 2H72A 3GMCA 2ZZ0A 1F3BA 3O0HA 4AP3A 2C72A 4YWOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5BRTA

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