5BRT | Genus

Total Genus 188

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	188
sequence length	581
structure length	554
Chain Sequence	AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title	A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism. pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus	188
structure length	554
sequence length	581
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-06-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5brtA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	5brtA01

2YG4A 4YSXA 1ZP0A 3R9UA 1OJTA 1GV4A 4Y4NA 2XVIA 3NYFA 3JSKA 2XCGA 2VZ2A 2X3NA 3COXA 1E1LA 3G5RA 1LQUA 1VQWA 1EL7A 2R0CA 3DK8A 1ZOYA 2QA1A 1DOCA 3ATQA 1H7WA 1NENA 2R46A 2C7GA 3H8IA 3LOVA 3NK0X 1TDFA 1F8SA 1YQZA 4B63A 4OPDA 3EANA 4CRTA 3CNDA 5IQ1A 2C66A 2BACA 1YQ3A 2XFOA 4H2PA 3T37A 4GDPA 4EIQA 4LA1A 4B1BA 2RABA 3AE7A 4EIPA 3BI2A 3EF6A 3ABVA 2A89A 3NTDA 3M0OA 4OPGA 3CPJG 3C4AA 2B9WA 4APNA 2VQ7A 5ER0A 3AYLA 3AECA 3S61A 1PXBA 2JB2A 3Q6JA 3AWIA 5BULA 2IVEA 3GD3A 1GEUA 2FBWA 1N1PA 2E4GA 1GREA 1KSSA 1ONFA 1GSNA 1IUWA 1CJ2A 3AEAA 3KPFA 2X8CA 4E0VA 3KU9A 3ALMA 3FG2P 2VQBA 1F8WA 3AE2A 1IJHA 1GRGA 4K5SA 1GRAA 2V5ZA 2WU5A 3KKJA 3RP7A 2IIDA 3CGCA 4XXGA 4TM0A 3UOXA 1CF3A 1VRQB 2YR4A 3IHMA 2XLSA 4RSLA 2R0GA 4USRA 3GMCA 5LV9A 2XFPA 2CULA 4IVOB 4A65A 2GB0A 1L9CA 1OJDA 3AXBA 4EMJA 2WOIA 2YLSA 1FEAA 2I0ZA 4AP3A 5IQ4A 3GMBA 2WOWA 1Q9IA 2C76A 2GV8A 4A5LA 2FJBA 3DJGX 5HHFA 5L46A 4ZCCA 3ALJA 2C75A 3UKQA 3P4SA 4JNQA 2BCGG 4HB9A 1XDIA 3AE4A 1FOHA 3FBSA 3DMEA 1OJ9A 4CCRA 1D5TA 1EBDA 3QVPA 4N9XA 3F8PA 3QSEA 2FJDA 4I59A 2YLWA 3S5WA 4C74A 3FIMB 4B67A 2GH5A 3DK4A 3AEEA 1GNDA 4OPCA 4CBQA 4YKGA 4Z2RA 2BA9A 1LPFA 5JCKA 2FJAA 3F8RA 2WBAA 1NHQA 4O5QA 5EBKA 2JB1A 4NEWA 3UKFA 4C3YA 4O5UA 3ATRA 1KNPA 3P1WA 1UKVG 1DNCA 1JNZA 3IC9A 4B64A 3V3NA 2C72A 2YVFA 3GRSA 3KLJA 4X9NA 4WCTA 1GTHA 3GDNA 2RGJA 4GUVA 4J2WA 2APGA 4A6NB 2JAEA 2Z5YA 2BC0A 3IHGA 2H89A 1OJAA 3UKHA 1QJDA 4IVMB 1NHSA 1QO8A 1F3PA 2GR2A 3BI5A 2YG5A 2QA2A 2WDRA 3QFAA 4LU6A 1YY5A 4NTEA 3AD9B 4K22A 1LTXR 4YT0A 2WETA 3KD9A 1W4XA 4U8KA 3NK2X 4P9SA 4EQXA 4A79A 2C70A 1JRZA 1PJ7A 5U63A 1P2HA 2OAMA 1JNRA 5JCMA 2WP5A 3H8LA 5JCLA 3NHOX 1IUVA 1IUXA 1L9DA 1REOA 2OLOA 4KPRA 4MJWA 2EQ8A 4Z25A 5KRQA 1GTEA 4UDRA 4Y4MA 3UKAA 3AE3A 3SM8A 1JRXA 2H88A 3CGDA 2ZZCA 1V59A 4GRTA 3BHKA 1BGJA 3CNSA 3URHA 3BNUA 1PBFA 1ZDLA 3I6DA 3GD4A 5J60A 1K0JA 3DJDA 4GCMA 4ZCDA 4GR1A 5FS7A 1PDHA 2W0HA 2BXSA 1Y0PA 1NDAA 3UP5A 4B66A 1CC2A 3UTHA 4J33A 4UDQA 3II4A 4Z44A 4CNKA 4H4QA 4RG3A 1PBCA 2A8XA 2V3BA 2VVMA 4K7ZA 3K7TA 1Q1WA 3EPTA 3ICRA 2XLRA 1H84A 3NYCA 3AE6A 4H50A 4H7UA 2JK6A 4JN9A 4LIIA 2R0PA 4YTMA 1TDEA 3ZDNA 1O94A 1IUUA 2XVHA 3PVCA 1CC6A 4JY3A 4BK1A 3C4NA 1GRHA 2BXRA 3QFBA 5EB5A 3P9UA 1K0IA 3CPIG 3DH9A 3NH3X 4C5OA 3CGEA 3DJEA 3GWDA 3G5QA 3SGLA 4XWZA 4GDEA 1L0VA 1FECA 2YLRA 2BYBA 3DGZA 1VG0A 5JCIA 3CNJA 4D04A 3CIRA 1PXCA 3NK1X 1Y56B 1KFYA 4K5RA 2DKIA 4TM1A 2EQ7A 1GRFA 3NTAA 4U2LA 4UDPA 4WX1A 4H4PA 4OCGA 5KOXA 4JDRA 2ZZ0A 3QVRA 2WDQA 2B9YA 4Z2TA 1GRTA 4PAAA 5KXJA 3BNMA 2XVFA 5GSNA 2GVCA 4GF7A 3CPHG 3ICSA 4H4UA 3E1TA 2Q6UA 3GYJA 2C64A 4BK2A 4NZHA 2B76A 1FL2A 2A87A 2B7RA 4U8JA 4U8OA 1MOKA 1E6EA 3RP6A 1CJ4A 2XLTA 5GRTA 3DA1A 1PS9A 3P4PA 4JY2A 4D03A 4ECHA 3UCLA 4X9MA 5EOWA 4HA6A 1EL9A 3LADA 1ZX9A 2XFNA 2VRMA 4FK1A 3I3LA 1ZY8A 1JU2A 2X50A 1S2QA 1PN0A 5TR3A 4FDCB 2ZZBA 3UOVA 2C3CA 1IUSA 1GESA 1DJQA 4BJZA 3AB1A 2ZBWA 1F6MA 4NTDA 4USQA 2V61A 2UZZA 1D4DA 5C2TA 1EL5A 2GR0A 4U2TA 3UP4A 4J34A 2YG7A 3CTYA 3CN8A 4CCQA 1NAAA 1OJCA 2JBVA 2WESA 1PBBA 3H4KA 5HY5A 2BABA 5JCNA 1RSGA 4C77A 1H86A 3AEGA 1E1NA 2R45A 4YTNA 2BS2A 3RNMA 4YSZA 3F8DA 3HZLA 5KWFA 1E1KA 3LZXA 3NT6A 3L1RA 1NEKA 1Z6LA 1TYPA 3K7QX 3LJPA 3OC4A 3SFEA 5CQFA 1B4VA 2C73A 1H81A 4H4WA 5U25A 1ZKQA 3L8KA 2XFUA 2V3AA 1LQTA 2XLUA 3UKKA 3GYIA 1VG9A 4KX6A 1CC4A 2AQJA 4H4SA 4B65A 4Z26A 2GR1A 4IA5A 2VRLA 1KDGA 4Z43A 2R9ZA 3P4QA 4EM4A 2WDVA 4I58A 1S2YA 2WS3A 3LZWA 3VRAA 3BI4A 4UP3A 2F5ZA 4Y4LA 5KVHA 4XWRA 1S3EA 4ICYA 2YG6A 3ITJA 3D1CA 2XDOA 3NLCA 4EQRA 3NN6X 3AE9A 3ALLA 5HYMA 2O9ZA 4EM3A 1F8RA 4BURA 1D4EA 1NHPA 1TYTA 4YTPA 3C96A 5IPYA 2YR6A 1CL0A 3QJ4A 5BUKA 3G5SA 1BF3A 4B68A 4A7AA 2BS4A 1GT8A 1YQ4A 4IV9A 1CJ3A 2WPEA 5KVIA 3UOYA 4BK3A 4CNJA 5C3JA 2YLTA 4FX9A 2OALA 2GR3A 3GRTA 1LJ1A 1DOEA 4JNAA 5M0ZA 3KVEA 3AE8A 2RGOA 5FS6A 3UTGA 2WQYA 2BK3A 2QCUA 1DODA 3O0HA 5EB4A 4X4JA 3UKLA 2GF3A 4A99A 1KNRA 1SEZA 2PYXA 1VDCA 2YWLA 2C3DA 5U1OA 1TRBA 2B9XA 4H2QA 3LXDA 4J31A 1DOBA 4EQSA 4YXDA 4YWOA 2IVDA 3NYEA 4H2RA 2VVLA 2R4EA 4CY6A 1ZK7A 3AD8B 1PBDA 2V6OA 2JKCA 2GAGB 2BK5A 3AE5A 4NEVA 1B37A 3FMWA 3DJJA 4H4ZA 4EMWA 4YSHA 5BVAA 2WPFA 2YR5A 4U8NA 1JOAA 1ZOVA 1ZMCA 1KF6A 1AOGA 2NPXA 3RP8A 3VRBA 4U8IA 4H4VA 2CDUA 2WP6A 2WHDA 4IA6A 4K2XA 4H4TA 1EL8A 4DGKA 1MO9A 1CHUA 1TDNA 1COYA 2YLZA 1GALA 1DJNA 1GPEA 2AAQA 3K7MX 2J3NA 3AEDA 4OPLA 3OZ2A 2GMHA 5HXIA 3M12A 2BS3A 1GERA 1IUTA 3DGHA 1S3BA 3VRDB 2WPCA 1H6VA 4BJYA 2E1MA 2VOUA 3AYJA 4U2SA 1H7XA 4AP1A 1RYIA 2ARDA 1RP0A 2YAUA 3V3OA 4H4RA 4Z2UA 2BC1A 4EMIA 4DNAA 2XVEA 2YLXA 1PXAA 1XANA 2YVJA 4REKA 2AR8A 3UKPA 3KA7A 3V76A 1MXTA 2WEUA 2Y6RA 1FCDA 1NG4A 2GQFA 4TLZA 1JEHA 3K30A 2JB3A 4A6NA 1H82A 3IWAA 3QSMA 1K4QA 4EQWA 3ISHA 1GETA 2X8HA 5FS8A 3VR8A 2DKHA 4OPIA 3EAOA 3PS9A 3BHFA 4CY8A 2BCPA 4FK1C 2TMDA 4Z24A 2V60A 4H4XA 4M52A 2YG3A 4AOXA 3CNPA 2Y6QA 3P4RA 1NPXA 4TM4A 4U8PA 3NIXA 1JRYA 1P2EA 3AEBA 3AE1A 3B3RA 2CFYA 2GMJA 3IF9A 3LB8A 4NTCA 2X8GA 2Z5XA 4DSGA 3NKSA 3SQPA 5M10A 5DBJA 4RG4A 1H83A 1XPQA 2YM1A 4ADWA 1B8SA 4U8MA 4H2NA 1ZMDA 2EQ6A 1N4WA 2E5VA 1CBOA 1M64A 1YKJA 2XFQA 2C65A 3Q9TA 4J36A 3AD7B 1O5WA 1NG3A 1TDOA 2GEWA 1HYUA 1O95A 2YM2A 3RHAA 3CNTA 1XHCA 4H4YA 1K0LA 2OA1A 2WOVA 1FEBA 2YQUA 5KOWA 2QAEA 5CKUA 4OPUA 5FMHA 2Q0LA 3SFDA 3UTEA 1X31B 3GSIA 1KSUA 2TPRA 4AT2A 4YSYA 2R4JA 1GRBA 1D7LA 3NGCX 4PABA 1E39A 1E7PA 1PJ5A 1QLBA 2NVKX 2OLNA 4AT0A 2YVGA 5J7XA 2FJEA 1N4VA 4C3XA 3GWFA 2EQ9A 1GXFA 3ICTA 2GRTA 4OVIA 5FS9A 4A9WA 4AOSA 1CJCA 1PJ6A 2WP9A 2BK4A 4TM3A 3UTFA 2C67A 3PO7A 3B6DA 1BKWA 3M13A 5BRTA 2XLPA 2VVLG 3GDPA 3ZYXA 4TLXA 1ELIA 3QSSA 2HQMA 3NNEA 2B7SA 4OPTA 1B5QA 2XVJA 4U8LA 3REDA 4ZN0A 3FPZA 3VQRA 2XYOA 3D8XA 1M6IA 1N4UA 2WU2A 1Y56A 1LVLA 4J56A 3AEFA 3NRNA 1D7YA 3CGBA 2X99A 2Q7VA 3ADAB 3WE0A 4J57A 3NG7X 1TDKA 4YKFA 3UOZA 4DSHA 4K8DA 3VR9A 1NHRA 2Q0KA 1BGNA 1BWCA 2RGHA 1LV0A 1E1MA 4JQ9A 4B69A 1BZLA 1D4CA 2CVJA 1DXLA 1PBEA 1PHHA 2PHHA 3NN0X 1L9EA 4BV6A 1Q1RA 2ACZA 3DK9A 1GOSA 2GAHB 3AYIA 2GQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2C1YA 4LL1B 2YN1A 2VCTA 5DVBA 3GKKA 4Q5FA 4YSXA 1ZP0A 1OJTA 1WP0A 4Y4NA 3JSKA 4Z7XA 4K9ZA 3HJPA 1E1LA 2X3NA 3GUSA 3PINA 2B7KA 1VQWA 4HZ2A 1EL7A 1ZOYA 2ALBA 5EVOA 5JCUA 1FVJA 1TDFA 1SKRB 4L0UA 6GSVA 5IQ1A 4ECIA 2XFOA 3FK8A 2VM1A 4OPGA 2N5BA 5GSSA 2B9WA 4APNA 5IMAA 1OVNA 2VQ7A 3KEBA 1PXBA 2VD1A 2LQQA 3AWIA 3US3A 2MMZA 1TI3A 3N9JA 2E4GA 1ONFA 4IBPA 2C4JA 1GSNA 2X8CA 2WDUA 2H30A 3UJ1A 2VQBA 1ON4A 1XZOA 4MJCA 1F8WA 3TJJA 2GSRA 3F63A 4K5SA 4GRFA 2IIDA 3CGCA 3KP9A 4TM0A 4PQIA 4QL9A 3IHMA 3GYKA 2PERA 1Q4JA 3E3EA 2WS2A 2QSIA 1OJDA 2OE3A 3D4TA 2I0ZA 1GUMA 2H72A 4MJAA 4TR1A 5IQ4A 2CVDA 5ENUA 1M9AA 2C76A 3GTUA 2GV8A 1SJZA 2BCGG 5DJLA 3EINA 3TRQA 3IK7A 3QAWA 2DLXA 3P8WA 4WBRD 2KUCA 4L5OA 1GL8A 1M3IA 3UL3A 1EBDA 3QVPA 3F8PA 1PX6A 4I59A 2JSZA 2YLWA 2GTUA 2V41A 1OC9A 2LS5A 3AEEA 1GNDA 4OPCA 3JCML 4Z2RA 2BA9A 1V98A 2FJAA 2WBAA 4FH8A 4O5UA 3LJRA 2I1UA 19GSA 5EPFA 1GTHA 3GDNA 2GZZA 2RGJA 4EL1A 2FY6A 4MZBA 4F0BA 2VCZA 2Z5YA 3G9BA 2P0GA 3IA1A 4IELA 4G0LA 1QO8A 2OBIA 4FYUA 2DJ2A 2QA2A 4LU6A 1H75A 4BIKA 3KD9A 1ERUA 1GNWA 4EQXA 5U63A 5DDLA 4TR1B 3H8LA 2OLOA 4KPRA 2EQ8A 1YEPA 1JRXA 4EKZA 3FZ9A 5ELGA 2H88A 4BA7A 4N10A 3CGDA 1V59A 4TKYA 3KGKA 2WRTA 1R26A 3KJYA 4GRTA 3F8UA 3HXSA 5J9CA 3DGQA 3GKMA 4GCMA 3MWHA 4TR0A 5HR3A 2BXSA 3EWLA 3ZLPA 3UP5A 1CC2A 2YWNA 4Z44A 4CNKA 4H4QA 1JZWA 1H4OA 2HRAA 2V3BA 4XS6A 3K7TA 3EPTA 3NYCA 1H84A 4H7UA 1GNEA 1TDEA 3PVCA 1QFNA 3GA4A 2VM2A 2FA8A 3ERWA 3P9UA 3L9UA 2VIMA 1GRXA 3DJEA 3CQFA 3G5QA 3SGLA 4GDEA 3EU3A 5DBQA 5DALB 3CNJA 4D04A 1G0TA 3NK1X 4TM1A 3PGTA 4WR5A 3A2WA 4G6GA 3QVRA 2WDQA 4G9KA 4Z2TA 1ZMAA 5GSNA 3IAM2 2XVFA 1MDJA 1A8YA 1OE7A 2C0GA 4H4UA 4BVXA 5IQYA 3GYJA 2C64A 2B76A 1FL2A 4YQUA 1EP7A 1XWGA 2B7RA 2FA4A 1E6EA 2NDOA 1XW6A 4NV2A 3HD5A 4D03A 4ECHA 3A3TA 3LORA 4HA6A 4YQVA 3SY4A 4MJBA 1WWJA 2XFNA 5HQPA 4N11A 3O3TA 4HQZA 1PN0A 1X5CA 2IMEA 2H70A 3UOVA 2O85A 4NMUA 2V61A 2UZZA 2GR0A 4U2TA 3CN8A 4CCQA 4JBBA 4MZCA 1FAAA 5LCZA 5ECIB 1BJXA 2GT6A 3MDKA 2BABA 1GSFA 1F3AA 3AEGA 5IM9A 3GYXA 1ZL9A 3NT6A 2RM6A 5CQFA 1B4VA 22GSA 3HVVA 2DIYA 5KMPA 1MD4A 3UKKA 3GYIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5BRTA

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