The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
119
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sequence length |
355
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structure length |
355
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Chain Sequence |
LPEGHPLKTLYQENKEIMKDAEMLNLYAKTLATTKDERMREEILGVLEEIVSSLRMVGFTHYNREEMLIFPYIERRGLTVIATVLWTKHDEIRAMIKQLAELLRKREEMPWEEFVEKFKAKAGEVAFALSDMVFRENNIFYPTLKALLSEGEWKAIKMQEDEIGYYKVKPPEWDPGEDVKPLHPWEINPELNVEQLLTLPKEVQQALRGQPLEFDKTQLKREEDIDLGTGYLNIEELKAIFEALPVDVTFIDKDDRVRFFSPGERIFTRTPSVLGRPVQLCHPPKSVYVVNKILKAFKEGRKKEATFWLRLREKYVYIKYVPLFNEKGEYIGTLEMTMDIAPYKKIEGEKRLLDW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Crystal structure of uncharacterized protein PF0695.
rcsb |
molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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source organism |
Pyrococcus furiosus dsm 3638
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molecule keywords |
Uncharacterized protein PF0695
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total genus |
119
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structure length |
355
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sequence length |
355
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2008-02-20 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF01814 | Hemerythrin | Hemerythrin HHE cation binding domain |
A | PF13596 | PAS_10 | PAS domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | nmb1532 protein domain like | ||
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BYW A; 3UME A; 3HJK A; 2ZOI A; 5HDS A; 4HY8 A; 3F1O A; 4F3L A; 3H82 B; 4R3A A; 2PYP A; 2JN7 A; 2OOL A; 1XJ6 A; 3NHQ A; 1MZU A; 2VEA A; 3MQO A; 3LIE A; 5TBM B; 1OT6 A; 5HWV A; 5F69 A; 5HWT A; 3NOT C; 4I3J A; 5HWW A; 2BAS A; 3LI9 A; 4EQ1 A; 4HNB A; 5IS1 A; 4H6J A; 1LSV A; 4F3L B; 3FC7 A; 1N9L A; 2VV8 A; 2JHE A; 2D01 A; 1DP8 A; 5HSQ A; 4WF0 A; 3NOP C; 2OWJ A; 4HP9 A; 4LLO B; 1V9Y A; 1S66 L; 3MQQ A; 3ULF A; 1D7E A; 3K3C A; 2M1C A; 3MJQ A; 4H6J B; 2V1A A; 2QWS A; 4MN5 A; 5IU1 A; 4HH2 A; 4NXB A; 3UE6 A; 1LL8 A; 1OTB A; 4R70 A; 2A24 A; 3LIC A; 1S4R A; 3CLO A; 4HH3 A; 3GDI A; 4LPZ A; 2Z6D A; 3MR0 A; 3P7N A; 1S1Y A; 2V9A A; 2L0W A; 4GS9 A; 3BWL A; 4L9G A; 3VE4 A; 4E04 A; 2GJ3 A; 2B02 A; 5HZH A; 3F1N A; 1XJ3 A; 2PDR A; 3RTY A; 2KDK A; 3EWK A; 2R78 A; 2A24 B; 4BBV A; 4EEP A; 2PR6 A; 5A8B A; 3SW1 A; 5G4Y A; 1LT0 A; 4LRY C; 1GSX A; 4DJ3 A; 4GS9 B; 4NXF A; 3PYP A; 5DJU A; 4JGR A; 3UB9 A; 4I3A A; 3ZQ5 A; 3H7W B; 4JGQ A; 2PHY A; 2HV1 A; 3B33 A; 2V1B A; 2W27 A; 4HJ6 A; 1D06 A; 2VLG A; 5J3W A; 4EET B; 1T1B A; 3C8C A; 4I38 A; 3HJI A; 1DRM A; 5F5Y A; 4I3I A; 4NXE A; 3MFX A; 5AVF A; 2K7S A; 3C2W A; 2V0W A; 4HP4 A; 3F1O B; 4NXG A; 2VV6 A; 1OTD A; 4R38 A; 1KOU A; 3E4P A; 4EXO A; 4WUJ A; 2QJ5 A; 1F9I A; 1TS7 A; 3MXQ A; 3A0S A; 1OTE A; 1TS6 A; 3IS2 A; 3UB6 A; 2WKQ A; 4L9E A; 1OJ5 A; 2WKP A; 4HJ3 A; 5KIZ A; 2P0N A; 3BY8 A; 4EES A; 4PKY G; 5F68 A; 2H28 A; 2INW A; 5DJT A; 3LUQ A; 3G6O A; 1XFQ A; 3OLO A; 2YKH A; 3UMD A; 1T1A A; 4PKY A; 4DJ2 A; 3IS2 B; 5HD5 A; 5J4E A; 1WA9 A; 1UWN X; 2PR5 A; 3V5X A; 1XJ4 A; 1OTA A; 1VB6 A; 1XJ2 A; 4KQD A; 1DP9 A; 3D72 A; 4WN5 A; 4EW7 A; 4HQA A; 1LSX A; 3LIA A; 2I9V A; 3U9M A; 3E4O A; 3LYX A; 5HDD A; 4LRX C; 4HIA A; 2QKP A; 4YWZ A; 4GW9 A; 3A0R A; 3BY9 A; 3LIF A; 4GCZ A; 3VOL A; 4HJ4 A; 3LID A; 3PHY A; 4RQ9 A; 3V5Z A; 1JNU A; 4EEU A; 1NWZ A; 5J7E A; 1N9N A; 1OJG A; 3A0V A; 3LIB A; 4K08 A; 2VV7 A; 4BBU A; 4M4X A; 1GSV A; 3H82 A; 2PD7 A; 2WKR A; 3GEC A; 2D02 A; 2KX6 A; 5F6A A; 3F1N B; 1S67 L; 1P0Z A; 4JGP A; 1DP6 A; 5DKL A; 5TBM A; 1S4S A; 2ZOH A; 4HHD A; 3CWF A; 4KUO A; 1OT9 A; 3T50 A; 3UB8 A; 3NOU C; 2CMN A; 5HDC A; 4XT2 A; 3F1P A; 1T19 A; 4JGO A; 3H9W A; 5EFW A; 2PYR A; 1G28 A; 3LI8 A; 4EER A; 5HD3 A; 3KX0 X; 1N9O A; 2EA9 A; 1X0O A; 4KUK A; 2QJ7 A; 2L4R A; 1TS0 A; 2P7J A; 1F98 A; 1XFN A; 4XT2 B; 3F1P B; 3VE3 A; 4WLA A; 5DKK A; 1S1Z A; 2ZBB A; 4MN6 A; 3K3D A; 4BBT A; 1UWP X; 2V0U A; 4HI4 A; 4I39 A; 5I5L A; 2QHK A; 2YKF A; 2OWH A; 3V5Y A; 4B9O A; 2Z6C A; 1GSW A; 5AVE A; 1ODV A; 1T1C A; 1Y28 A; 3IBR A; 4GHI A; 2PD8 A; 3NJA A; 3UB7 A; 2L1M A; 1P97 A; 1V9Z A; 4I5S A; 3CAX A; 4L9F A; 1TS8 A; 4HOI A; 4WL9 A; 3U9J A; 3H7W A; 1EW0 A; 2J80 A; 4LRZ E; 5G4Z A; 1OTI A; 3E4Q A; 3EEH A; 4GHI B; 3ICY A; 3FG8 A; 1LSW A; 4R6L A; 3RH8 B; 1T18 A; 2W0N A; 1UGU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FZ0 A; 4UA7 A; 1BYW A; 3PBT A; 1SDE A; 3HUN A; 2A69 F; 3T1X A; 5DVA A; 4AE4 A; 2IXM A; 1K55 A; 2IWB A; 3N2Z B; 5CI8 A; 3AGT A; 1TQG A; 2XA7 S; 2R7X A; 5GHZ A; 1QLE C; 4KNW A; 4BG0 A; 2Y55 A; 3F1O A; 2OOC A; 3T4S A; 1ZHX A; 2M7V A; 3BFD A; 1K40 A; 4R3A A; 1FFT C; 2Y59 A; 4U5F E; 3Q07 A; 1XJ6 A; 5HW3 A; 2OEV A; 1MZU A; 4OKP A; 3UDF A; 3LNR A; 2KK1 A; 1YAX A; 1K6R A; 3W2Z A; 3LIE A; 3WG7 C; 2ZQC A; 3T4J A; 3PR6 A; 3NMJ A; 4ONS A; 2ZC3 B; 3VP3 A; 5HWV A; 1XZQ A; 2Y3D A; 5FDS A; 1FR0 A; 4S2L A; 3G34 A; 3KYZ A; 1SHV A; 2R7R A; 4Y3I A; 1S7Z A; 4AE4 B; 4I3J A; 2Y91 A; 3JTL O; 4LLE A; 1BUL A; 1JPN A; 2BAS A; 3M2K A; 1G5Z A; 3IH8 A; 2WB7 A; 3OEO A; 5IS1 A; 1EI7 A; 3GTC A; 2W3D A; 4S2M A; 4DBQ A; 2M64 A; 4O0P A; 2Q00 A; 1BLP A; 2Y2J A; 1YLJ A; 4GJ4 A; 4ULV A; 2VV8 A; 3U5S A; 1VET B; 3RFB A; 1MC0 A; 2WAD A; 5D92 A; 1O87 A; 3EQL F; 5A6K A; 2I15 A; 1DP8 A; 2VGL S; 3ZVW A; 1BZA A; 5HSQ A; 2Y8H A; 4EBJ A; 2CCY A; 2P7V A; 1TEM A; 3QP5 A; 1KNY A; 1PI4 A; 2JC7 A; 1DY6 A; 3JYI A; 1YA9 A; 1V9Y A; 3VP0 A; 3QNB A; 2CYD A; 1YLT A; 2ZLY A; 3IXB A; 1OQC A; 1KU2 A; 1E3U D; 1IKG A; 4D4N A; 4ZDX A; 4YL0 A; 2M1C A; 1B68 A; 1L2S A; 2R7S A; 1Y4C A; 4JVS A; 3VOZ A; 3K1I C; 1ZHY A; 1HMD A; 2IM8 A; 2IYL D; 1M6K A; 2R25 A; 3UDX A; 1L0F A; 1LIH A; 3K1I A; 1OTB A; 1Q2P A; 5A93 A; 1BLC A; 5JVE A; 4KBL A; 4RD9 A; 3G2Y A; 2CNW A; 4XXR A; 3G50 A; 3HNJ A; 4I1M A; 3S22 A; 4DVZ A; 4HH3 A; 3GDI A; 4LPZ A; 3NY4 A; 2Z6D A; 3RKO F; 2WVQ A; 3U4L P; 3JVV A; 3U8P A; 5MC7 A; 4UDV A; 4GS9 A; 4O7G A; 3K7D A; 5FQM A; 4EV4 A; 3EPV A; 2AVK A; 2EPM X; 2Q9M A; 4ZJ2 A; 2ZXR A; 1RP5 A; 3BLM A; 4E04 A; 3PTE A; 4ZLC A; 1HMO A; 2GJ3 A; 4U5D E; 1OXK A; 2B02 A; 2OLU A; 3ZNT A; 3Q82 A; 4FX5 A; 5KYW B; 4DE2 A; 1RJ9 B; 1BLH A; 4FH2 A; 2Y2G A; 3S28 A; 4N6C A; 4DXB A; 1GA9 A; 2W9Y A; 3VAY A; 4ESP A; 3SW1 A; 5G4Y A; 1YYX A; 3BFC A; 3G4X A; 5HAP A; 3Q1F A; 4LRY C; 2QZ6 A; 1K25 A; 1W79 A; 3GM2 A; 3NC8 A; 4GS9 B; 1PZO A; 5DLJ A; 5CTN A; 1MWR A; 3HLD A; 5DTS A; 3E9V A; 4I3A A; 4OQ0 A; 1H8Y A; 3NMK A; 3BLS A; 4MVZ A; 2E8I A; 3H7W B; 2JCH A; 3ZSU A; 1T6U A; 3OA1 A; 2PHY A; 4IWB A; 1D1B A; 2OLV A; 3LR5 A; 2HDU A; 2P04 A; 3N7W A; 4JTD B; 1CGN A; 1QQ3 A; 4KZ3 A; 5DF7 A; 4XEF A; 4JUR I; 2UUH A; 2CC1 A; 1JWV A; 3LEZ A; 2CNW D; 1TWG A; 4WJ0 A; 4I38 A; 5CHU A; 4MVU A; 1H9T A; 1DRM A; 2JX0 A; 5COM A; 4J32 B; 1RMV A; 3GR2 A; 3QW1 A; 1YAR O; 3HRE A; 4YIN A; 1IOU A; 3AQB A; 3J06 A; 3FAJ A; 1I4Y A; 3JSZ A; 2Z15 A; 4XWJ A; 4LCM A; 1TWH A; 2YWA A; 4JLF A; 1STZ A; 3SYN A; 2MWQ A; 1OTD A; 1HLU P; 3HUO A; 4JF5 A; 4RYE A; 4G0H A; 4WMC A; 3Q7G A; 2DYR C; 2QJ5 A; 4WEK A; 4X25 A; 3L9K A; 5CEC A; 5DFY A; 4HEF A; 2KOI A; 4HJ3 A; 4MND A; 2WKI A; 4G3W A; 5A91 A; 5B3S C; 5J8X A; 2P0N A; 5F68 A; 1LLB A; 1M6T A; 3I5P A; 4MEZ A; 5CGW A; 2INW A; 3KSI A; 4QWO A; 1UFB A; 4X1M A; 1MWU A; 4FES A; 3ZHH A; 3TK0 A; 3DWK A; 3KSG A; 1GA0 A; 5AQ9 A; 2OG2 A; 1H9G A; 3NI9 A; 3IF5 A; 1GGQ A; 1VK5 A; 1UG7 A; 3O88 A; 2VA0 A; 4S2K A; 4PK4 A; 2XS8 A; 1MY8 A; 2CDQ A; 1HE9 A; 4EBN A; 3ASO C; 1ORY A; 1CPR A; 2C03 A; 4N4W A; 4Q0H A; 2PR5 A; 2XFS A; 4ZJ3 A; 3V5X A; 3DM9 B; 2FFY A; 5GLC A; 4XLP F; 4KZ5 A; 4MBK A; 1SF8 A; 2WGW B; 4WN5 A; 1K56 A; 1KE3 A; 1PWG A; 2BE5 F; 3EHM A; 2HP6 A; 1SKO B; 1VYK A; 3ABL C; 5FAS A; 1ZVZ A; 1TDL A; 4AL0 A; 1XA7 A; 3A3D A; 3LYX A; 3C8G A; 4HIA A; 1E25 A; 4LV2 A; 1NLZ A; 1CPQ A; 1ACF A; 4WMC D; 5EM1 A; 2AWY A; 4N9K A; 5KZH A; 2EFU A; 3QP1 A; 2X51 A; 2H7O A; 3LID A; 4WBG A; 4ER9 A; 3PHY A; 1PW8 A; 2BTF P; 3IWI A; 1T01 A; 1ERQ A; 4MTO A; 1N9N A; 5EV0 A; 3U2A A; 3A0V A; 1XPB A; 3LIB A; 4K08 A; 5CTM A; 1SR2 A; 4DRJ B; 4BBU A; 4M4X A; 1C17 M; 2HKV A; 3X1O A; 2R03 A; 3ZTM A; 1GSV A; 4KZ9 A; 1U0B B; 2R7Q A; 4E0I A; 1PFL A; 3CMZ A; 3ECS A; 1OCZ C; 3UDI A; 1F2K A; 4Z9H A; 2VCA A; 3C8G B; 3S84 A; 2VH3 A; 3SOI A; 1U6H A; 2EPL X; 3F1N B; 1S67 L; 4YL3 A; 2R9R B; 1DP6 A; 3L34 A; 3F47 A; 4KZ8 A; 4WM9 A; 1BDJ B; 2H7B A; 3NKE A; 4D4X A; 5FAT A; 3GQZ A; 2P74 A; 1K05 A; 1O07 A; 2R7T A; 3TJ6 A; 4KUO A; 2LD6 A; 4DRH B; 1OCC C; 3UB8 A; 4LGW A; 3HLZ A; 2XEP A; 3CZD A; 4JCH A; 4ZLD A; 2CMN A; 3E2L A; 3EQV A; 4IED A; 4LV3 A; 2ASR A; 4X55 A; 5HDC A; 1N9B A; 5F5H A; 1EWZ A; 3PBO A; 4EBL A; 4CDY A; 1K56 D; 3IWQ A; 4II7 A; 1T19 A; 2EX2 A; 2MYS A; 4D2O A; 5EFW A; 2D4U A; 3NG1 A; 2ZM0 A; 3S90 A; 1ZW3 A; 2JKT M; 1I2W A; 4B4X A; 2L6H A; 3WS4 A; 1ORS C; 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3ZG7 B; 1W63 Q; 2W0N A; 5AQ7 A; 2MHR A; 2G2U A; 3V7O A; 4OQI A; 5T3T A; 5D3O A; 3HKK A; 3PDM P; 4PJL A; 3UME A; 4OPQ A; 2L81 A; 2O0Y A; 1IYO A; 3QTH A; 2LB9 A; 4HBT A; 2NG1 A; 3R4K A; 5E2F A; 5EM0 A; 3ZCZ A; 3N4I A; 5IY5 C; 5FAQ A; 4QDL A; 1J8M F; 3AOU A; 5L0I A; 1BTL A; 2FFH A; 1MXO A; 4G3K A; 4L0L A; 2Q9N A; 2W1T A; 1MBL A; 3DJN B; 1GQA A; 5G18 A; 3H82 B; 4LLC A; 1BLS A; 4UA6 A; 2WKH A; 5CGS A; 4CLC B; 2JN7 A; 5FEF A; 4PFP A; 3G32 A; 3T9O A; 3T1S A; 4EUK B; 4P87 A; 2R05 A; 2H5S A; 2YRF A; 1LS4 A; 1C3B A; 1JOG A; 1L0D A; 3MQO A; 3T4O A; 3TW8 A; 5BOH A; 2ZXP A; 1OT6 A; 4NG2 A; 1YQS A; 5M18 A; 3ABK C; 1M2V B; 3NOT C; 3C4P A; 2A6H F; 1O7E A; 4YK5 A; 5HWW A; 4CDV A; 2HMZ A; 3SP1 A; 4OLG A; 4HNB A; 3VRC A; 4RBN A; 1AEP A; 4R3J A; 3SEO A; 1CGM E; 2W1T B; 4GD6 A; 4H6J A; 1LSV A; 1FSW A; 3FC7 A; 1N9L A; 4BWI A; 2YZS A; 2OCC C; 4UA9 A; 4K7B A; 2XL4 A; 2ZD8 A; 5FAP A; 3VFH A; 2YL0 A; 2D01 A; 1L3L A; 3E98 A; 4Z9J A; 3HVF A; 2A6E F; 3VP1 A; 2R7V A; 3HBR A; 5L3V A; 3IT9 A; 4KQO A; 4WF0 A; 3NOP C; 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